The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
63
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sequence length |
153
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structure length |
153
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Chain Sequence |
VLSEGEWQLVLHVWAKVEADVAGHGQDILIRLFKSHPETLEKFDRFKHLKTEAEMKASEDLKKHGVTVLTALGAILKKKGHHEAELKPLAQSHATKHKIPIKYLEFISEAIIHVLHSRHPGDFGADAQGAMNKALELFRKDIAAKYKELGYQG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Enhanced visibility of hydrogen atoms by neutron crystallography on fully deuterated myoglobin.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
MYOGLOBIN
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| molecule tags |
Oxygen storage/transport
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| source organism |
Physeter catodon
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| total genus |
63
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| structure length |
153
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| sequence length |
153
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 1999-08-04 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3GQG A; 1J3Z A; 1MLQ A; 1Y4Q B; 3UHI A; 2QMB B; 1S6A A; 2O5Q X; 1IDR A; 3BJ1 A; 1NXF A; 3QJC A; 1G09 B; 5HLU A; 3CY5 A; 2D2N A; 1NEJ A; 1C7D B; 1BIJ B; 2O5L X; 5E83 A; 2M6Z B; 3UHX A; 1IBE B; 1XZ2 A; 1JZK A; 1Z8U B; 2ZS1 A; 4HHB A; 1HBI A; 3ZJR A; 1HCO B; 2DN2 A; 1A00 A; 1ABW A; 1A0Z B; 5CN8 A; 1YVT B; 3BJ3 B; 1YHU C; 1MYT A; 3O89 A; 4L7Y B; 1Y4Q A; 2QMB A; 1GDK A; 1S61 A; 1URV A; 3G46 A; 1HBA B; 1G09 A; 1OUU B; 5CND A; 3BOM B; 2QLS B; 1OR4 A; 1DLW A; 1DTM A; 1C7D A; 1BIJ A; 1TES A; 3E4N A; 3S1I A; 2MYE A; 3D4X B; 1HBS B; 2W72 B; 2M6Z A; 2VYZ A; 1MOD A; 1IBE A; 3ARL A; 2ZS0 D; 2MGB A; 1MYG A; 3AG0 A; 2G0V A; 5EQM A; 2D2N D; 3WFW A; 105M A; 1HCO A; 1Y0D B; 1A0Z A; 1A9W E; 3AQ5 A; 1YVT A; 3BJ3 A; 4L7Y A; 4MQH A; 3IC0 B; 1HRM A; 3UHH A; 3HF4 B; 1CG8 B; 1BZR A; 1HBA A; 1OUU A; 3BOM A; 1GDL A; 1O1K B; 2QLS A; 3PIA B; 5EE4 D; 3A5A A; 3S1J A; 3D4X A; 5F0B A; 1MNK A; 1HBS A; 1HBG A; 1Y22 A; 2HHE B; 2W72 A; 2B7H B; 1VXG A; 1BZ0 A; 1QI8 B; 3S66 B; 3WHM B; 3WCV D; 2CMM A; 1UT0 A; 3K9Z A; 5M3S A; 1GBU B; 1Y0D A; 4VHB A; 2ZT3 A; 4ZVA A; 4MQI B; 1O1P B; 1YG5 B; 4O4Z A; 3IC0 A; 5EU2 A; 3GK9 A; 3HF4 A; 1CG8 A; 4IRO B; 2PGH B; 1O1K A; 3PIA A; 1UFP A; 3GOU B; 111M A; 1XZ4 B; 3HRW B; 3ZJL A; 4PNJ A; 2HHE A; 2B7H A; 1QI8 A; 2G11 A; 2OHB A; 1JZM A; 1JDO A; 4MQC B; 3S66 A; 3WHM A; 2VYY A; 4KMV A; 1T1N A; 5ILE A; 2EB8 A; 3EDA A; 1GBU A; 3QM7 A; 1O1P A; 3KUN A; 1MLO A; 1YG5 A; 3QM8 A; 3ZJS A; 2SPM A; 1CH4 A; 2DHB B; 2GKN A; 3UHK A; 3W4U B; 4IRO A; 1FN3 B; 1FSX B; 4OF9 A; 5CNE A; 2PGH A; 3A59 A; 4KMW A; 4HSW A; 4M4B B; 3PI8 B; 1YGD B; 1XZ4 A; 3HRW A; 1R1Y B; 4DWU A; 1RTX A; 1LH3 A; 4MXL A; 4MQC A; 2HBS B; 1YGF B; 5E6E A; 2HZ1 A; 2ZLX B; 102M A; 1MYF A; 1V5H A; 1XZ7 B; 1VXE A; 2FRJ X; 2DHB A; 1YHU D; 1A0U B; 2VYW A; 5E29 B; 3W4U A; 1FN3 A; 1FSX A; 1MWC A; 3OJ1 A; 4M4B A; 3PI8 A; 1YGD A; 1R1Y A; 4G51 B; 1QSI B; 1LFZ B; 4U8U B; 2FRF A; 2HBS A; 1YGF A; 1YMB A; 2ZLX A; 2MGF A; 1HLB A; 2MYB A; 1XZ7 A; 1JPB A; 5CNB A; 1CBM A; 1EWA A; 2PEG B; 3V2Z A; 1X9F B; 2BNL A; 3UBV A; 1Y7G B; 1H1X A; 3LR9 A; 3ARK A; 1A0U A; 5E29 A; 2OIF A; 3PI2 A; 4ESA A; 1U7S A; 1CH5 A; 3D7O B; 3GDJ B; 1DUO A; 1MTK A; 1N9H A; 4G51 A; 4NXC A; 2G0S A; 3NFE B; 4U8U A; 1AJ9 B; 2O5B X; 2HBD B; 2AV3 A; 1Q1F A; 5CNF A; 3PI1 A; 3DR9 A; 1BVD A; 2H8F B; 2PEG A; 4QAU A; 3VHB A; 4MBN A; 1DLY A; 3UHV A; 1X9F A; 1NZ3 A; 1Y7G A; 2ZSP A; 1YFF B; 1HBB B; 1LJW B; 4IT8 A; 4N7P A; 4MQK B; 3IC2 B; 2QFN A; 4H2L B; 2NRM A; 4FC3 B; 3D7O A; 2LH6 A; 3GDJ A; 1UFJ A; 4F6I A; 4MU5 A; 1WVP A; 3NFE A; 1AJ9 A; 5HLX A; 2HBD A; 1BIN A; 2SPN A; 4DC7 A; 1F65 A; 2EVK A; 3FH9 B; 2GNV A; 2OHA A; 1YFF A; 1HBB A; 1LJW A; 110M A; 1MOB A; 1SPE A; 4MQK A; 2GDM A; 3IC2 A; 1MLF A; 4H2L A; 1I3E A; 4FC3 A; 1X9F D; 1SPG B; 2LH1 A; 4DC8 A; 5AZQ A; 4FH6 A; 1CBL A; 3UH6 A; 4O1T A; 4O2G A; 3WR1 B; 3S48 C; 2ZSY A; 3PI4 A; 3FH9 A; 3LB2 A; 3G4Q A; 4AVD A; 4YU4 A; 2ZFB B; 112M A; 1Y2Z B; 1JF3 A; 1NQP B; 1SPG A; 1PMB A; 1LFQ B; 1JY7 B; 2R1H B; 5SW7 A; 2OLP A; 1HHO B; 2BLH A; 1H97 A; 3UHB A; 2D6C A; 1LH7 A; 2HZ3 A; 3ONZ B; 3VRF B; 1MTJ A; 2NSS A; 2LH2 A; 1O1L B; 3WR1 A; 1Y4R B; 3HEO A; 1CH9 A; 4HBI A; 3QM6 A; 3AQ7 A; 1CIO A; 1DXV B; 4O35 A; 3G4W A; 5HLQ A; 2ZFB A; 4XDI A; 1Y2Z A; 1NQP A; 1LFQ A; 1JY7 A; 2R1H A; 2VHB A; 1HHO A; 3DHT B; 1VHB A; 1VXH A; 1XXT B; 3ONZ A; 2OH8 A; 3PT8 B; 3VRF A; 1JL6 A; 1MDN A; 2ZSN A; 1O1L A; 1Y85 B; 1IRC A; 1DUK A; 2O5S X; 1Y4R A; 1K0Y B; 2ZS1 C; 1MWD A; 2WY4 A; 3UGZ A; 1DXV A; 3R5I B; 101M A; 1C7B B; 3LB4 A; 2W6X A; 3O7N A; 1MZ0 A; 1RPS B; 1Y8W B; 1Y4B B; 3UHZ A; 3UH5 A; 3DHT A; 1JL7 A; 1JP6 A; 1YHR B; 3UI0 A; 1XXT A; 1J40 A; 3WCW C; 3PT8 A; 3ZJI A; 1DWT A; 5IKS A; 1GCW B; 1Y85 A; 1UX9 A; 2MGL A; 1ECA A; 1K0Y A; 4N7N B; 1GVH A; 3R5I A; 1DWR A; 1MBS A; 1Y8I B; 1V4U B; 4PQC A; 4OOD A; 1C7B A; 2XYK A; 1MBA A; 3QJB B; 1BVC A; 1RPS A; 1NS6 A; 1Y8W A; 1Y4B A; 4HSX A; 1J7W B; 3CIU B; 4GZG A; 4F6D A; 2W72 C; 5CN5 A; 1YHR A; 3PT7 B; 2LHB A; 2D2M B; 1GCW A; 2XKI A; 3ORD A; 4N7N A; 2GRH A; 1G0A B; 2IG3 A; 1LHS A; 2H35 B; 4UUR A; 1Y8I A; 1V4U A; 4ROL B; 3B75 B; 3UHT A; 3QJB A; 3WCW B; 3GLN A; 3WTG B; 2QU0 B; 1NZ2 A; 3D1A B; 1J7W A; 3CIU A; 2GNW A; 5C6Y A; 2LH7 A; 2OH9 A; 1J7S B; 3HC9 A; 3PT7 A; 1ECO A; 3BJ2 B; 2ZSX A; 1MLL A; 1Y7C B; 1BJE A; 2D2M A; 3QJD B; 3UHR A; 1SI4 B; 3MYM A; 1MLG A; 3HYU B; 4ODC B; 4LPI A; 1G0A A; 1KR7 A; 1VRF A; 4F68 A; 2H35 A; 5AZR A; 3NL7 B; 4ROL A; 2G14 A; 3B75 A; 5EV5 A; 1Y4V B; 3H57 A; 2MGJ A; 1Y8H B; 1MYI A; 2D5Z B; 1MLS A; 1V07 A; 3WCW A; 3WTG A; 2QU0 A; 3D1A A; 1MKO B; 3HXN B; 1RQA B; 1LFY B; 5CNC A; 3ZH0 A; 1J7S A; 3BJ2 A; 1Y7C A; 1BZP A; 1DXD A; 3QJD A; 3LB3 A; 1SI4 A; 2MB5 A; 3ZJO A; 1YHE B; 3HYU A; 4ODC A; 4G1B A; 1DKE B; 1HGC B; 2ZS1 D; 2R4W A; 2BLI A; 1YZI B; 1SDK B; 3NL7 A; 6HBW B; 3MJP B; 3OZW A; 2MBW A; 3LQD B; 1Y4V A; 3ZJN A; 1MLR A; 1Y8H A; 1JWN A; 2D5Z A; 1MKO A; 3HXN A; 1RQA A; 2MYC A; 1LFY A; 3M3A A; 2G10 A; 1G0B B; 2ZLU B; 4XS0 B; 1XCH A; 3WCW D; 4UZV A; 3WFX A; 3NML A; 4B3W A; 2O5M X; 1YHE A; 1N9I A; 1DKE A; 1HGC A; 1O16 A; 1YZI A; 2ZSR A; 3BA2 A; 1SDK A; 2ZSQ A; 6HBW A; 2MGE A; 1OFK A; 3MJP A; 3LQD A; 3KUO A; 2V1J A; 1FDH A; 2Z6T A; 4ILZ A; 4MBA A; 1GDI A; 3UHG A; 1O1N B; 3WFT A; 1PBX B; 3DUT B; 2IN4 A; 1RVW B; 2EVP A; 2R50 A; 3HEN A; 2AA1 B; 1NWN A; 1G0B A; 4MQI A; 2ZLU A; 1J52 A; 4U8U C; 4XS0 A; 1HGB B; 4PQ6 A; 4TYX A; 1GBV B; 1YMC A; 3AQ9 A; 2GL3 A; 4WCH D; 3ZJM A; 1XZU B; 1HAB B; 2HBG A; 3UH3 A; 1X9F C; 3AT6 B; 4L2M A; 5EYS A; 1HJT A; 3GOU A; 1NPG A; 7HBI A; 3A5G A; 5AB8 A; 2XKH A; 5D5R A; 1Y5J B; 2V1G A; 1A4F B; 1GLI B; 1O1N A; 2O58 X; 1PBX A; 3DUT A; 1RVW A; 2AA1 A; 2R4Z A; 1CG5 B; 2HBC B; 4O4T A; 1DWS A; 5HU6 B; 1HGB A; 1Y8K B; 1GBV A; 4JYQ A; 2GTL C; 1Y09 B; 1XZU A; 1HAB A; 1CO9 A; 1YE2 B; 4H0B A; 1YEN B; 3EOK B; 1WLA A; 3A9M A; 3UBC A; 3AT6 A; 3RGK A; 1Y31 B; 3IXF A; 1FHJ B; 5B84 A; 1Y5J A; 1YCB A; 1A4F A; 1GLI A; 3DHR B; 1DO4 A; 1MYM A; 1YEU B; 3SZK B; 3UHU A; 1X46 A; 1LA6 B; 1CG5 A; 2HBC A; 5HU6 A; 3K8B B; 1Y8K A; 2QRW A; 1G08 B; 1Y09 A; 1RQ4 B; 4MQJ B; 1VXA A; 1YE2 A; 3A2G A; 1YEN A; 3EOK A; 2MGK A; 1Y31 A; 3UHE A; 2MGG A; 3EU1 B; 1FHJ A; 3UHC A; 1QSI A; 1LFZ A; 3DHR A; 1UMO A; 1YEU A; 1Y46 B; 3SZK A; 1A3O B; 1CP5 A; 2GTL B; 1LA6 A; 1QXD B; 104M A; 2ZSO A; 3G4U A; 2G0Z A; 106M A; 2ZST A; 3K8B A; 3UHN A; 1A6K A; 3VRE B; 1G08 A; 1RQ4 A; 1NZ5 A; 1LUE A; 3E55 A; 1MLN A; 4NI1 B; 1Y4P B; 3E5I A; 1DXU B; 1C7C B; 3VAU A; 2V1H A; 1QSH B; 3EU1 A; 2FRK X; 2D60 B; 2EKT A; 1ASH A; 2G3H A; 4F69 A; 1NS9 B; 1OBM A; 2EF2 A; 1CH7 A; 1F63 A; 1Y46 A; 1KFR A; 1A3O A; 2G0R A; 2GTL A; 2H8F A; 1IRD B; 2E2Y A; 1A3N B; 2AV0 A; 4FWZ A; 1M9P B; 1HBH B; 2QSP B; 4U8U D; 1AJG A; 3VRE A; 2C0K A; 2VRY A; 1COH B; 1HBR B; 1D8U A; 2VEE A; 4NI1 A; 1Y4P A; 3ZJQ A; 3M38 A; 1J41 B; 1SHR B; 1DXU A; 1B86 B; 2QFK A; 1QSH A; 1V75 B; 2MYA A; 2D60 A; 3U3E A; 1Y5K B; 1YEV B; 1LHT A; 1MOC A; 1NS9 A; 2Z6S A; 4N8T B; 3WCT B; 1Y35 B; 1IRD A; 5CMV A; 2MGI A; 1BAB B; 1OR6 A; 1A3N A; 1N9F A; 1J3Y B; 1M9P A; 3GYS B; 1HBH A; 1I3D A; 2QSP A; 1YEO B; 1COH A; 1HBR A; 1YOI A; 3R0G A; 2GTL D; 1J41 A; 3M39 A; 1SHR A; 3QMA A; 1B86 A; 1V75 A; 1O1J B; 1XY0 B; 1Y5K A; 2SPL A; 1W92 A; 2VLX A; 1CIK A; 4N8T A; 3PI9 B; 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1JEB A; 1Y7D A; 5CN7 A; 1GZX A; 1Y5F B; 4MXK A; 2ZFO B; 2ZS0 A; 3ZJP A; 3WCV B; 3UGY A; 4B4Y A; 2NRL A; 2YRS A; 3GQR B; 3QZZ A; 3OO5 A; 1UX8 A; 2WTG A; 2RAO B; 1K1K A; 1LFT A; 1YE0 A; 1Y83 A; 2FAL A; 3QJE B; 6HBI A; 3ODQ A; 1Y45 A; 2GRZ A; 2WTH A; 3MKB A; 5HY8 B; 4ROM A; 2D5X A; 1M6C A; 1O1M B; 4C0N A; 3OVU C; 1BBB B; 1MNH A; 1NZ4 A; 4MQH B; 5JDO D; 2XKG A; 1Y5F A; 3WCU D; 1O1O B; 2ZFO A; 4NXA A; 3WCV A; 3G4V A; 3P5Q B; 1UIW B; 3H58 A; 4KJT A; 3LR7 A; 1LH1 A; 5D1V A; 3GQR A; 1IT3 A; 2ZSS A; 1UVY A; 2ZLV B; 1Y22 B; 1BZ0 B; 2RAO A; 1EBC A; 3MJU B; 1OUT B; 3QJE A; 2ZLT B; 1YVQ B; 3OO4 B; 2D2M D; 108M A; 5HY8 A; 1O1M A; 1HSY A; 1BBB A; 1Y0A B; 1VWT B; 1O1O A; 3UHD A; 2BMM A; 3PEL B; 3P5Q A; 1UIW A; 1FAW B; 2ZT2 A; 1MBD A; 2ZLV A; 1THB B; 1MYH A; 1EBT A; 1MLH A; 3MJU A; 2ZFO D; 1OUT A; 2ZLT A; 1YHU B; 1DO7 A; 3MOU A; 1RQ3 B; 1YVQ A; 2DC3 A; 1T1N B; 3OO4 A; 5HAV A; 1LH2 A; 2O5O X; 2EB9 A; 1J3F A; 5KKK A; 4JAC A; 1AJH A; 4SDH A; 4YU3 B; 3LB1 A; 3ZOL A; 4DWT A; 2Z6N B; 2AUR A; 5MBN A; 4F4O B; 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