The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
61
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sequence length |
146
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structure length |
146
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Chain Sequence |
SLSAAEADLAGKSWAPVFANKNANGDAFLVALFEKFPDSANFFADFKGKSVADIKASPKLRDHSSTIFTRLNEFVNNAANAGKMSAMLSQFAKEHVGFGVGSAQFENVRSMFPGFVASVAAPPAGADAAWTKLFGLIIDALKAAGK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Engineering His(E7) affects the control of heme reactivity in Aplysia limacina myoglobin.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
MYOGLOBIN
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| molecule tags |
Oxygen storage/transport
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| source organism |
Aplysia limacina
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| total genus |
61
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| structure length |
146
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| sequence length |
146
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 1999-12-13 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3A0G A; 3M3B A; 2QFK A; 1GBV A; 2DN1 B; 3BJ1 B; 3ZOM A; 3EU1 A; 3G4R A; 1A6G A; 4N7P A; 3MN0 A; 3ECX A; 4TYX A; 3PEL B; 1S61 A; 1S5X A; 1MLR A; 3UGY A; 4HHB A; 1OUU A; 1IRD B; 2FAM A; 1HRM A; 1CH4 A; 1HBB B; 1CQX A; 5C6E A; 2ZT3 A; 1RQ3 A; 4ODC B; 1DLW A; 1X9F C; 1V4W B; 3AQ9 A; 3UHB A; 3WCU D; 1Y4Q A; 2C0K A; 3BA2 A; 1LJW B; 1C7D B; 2BKM A; 1XZ7 A; 2OLP A; 4XDI A; 2DHB B; 4F68 A; 1WVP A; 3LR9 A; 3ARK A; 2HZ1 A; 1VRE A; 5AB8 A; 4NXA A; 1Y0A A; 1Y8W A; 5ILE A; 1Y4V A; 3G4Q A; 2R1H A; 1MOC A; 1NWN A; 1Y5F A; 1HHO B; 3QJC A; 2MBW A; 1Y46 A; 1NZ4 A; 1BIJ B; 1G9V B; 1CLS A; 2SPL A; 1YEU A; 1BZR A; 3UHS A; 1O1J A; 1CG8 A; 2OHA A; 3ED9 A; 3MOU A; 4NK2 A; 108M A; 3HRW B; 3ARL A; 1YHE A; 1GZX A; 1QSH A; 1V4U A; 2AV3 A; 2MGG A; 3WI8 A; 1SPE A; 5CN5 A; 3QJE B; 1DXD A; 2R80 A; 5KDQ A; 1DKE B; 1Y22 A; 3GQG A; 1ITH A; 4B4Y A; 2HZ2 A; 1GLI A; 5HAV A; 1MOB A; 2XYK A; 1BBB B; 1JL6 A; 3PI4 A; 2EVK A; 2CMM A; 2GL3 A; 2DN2 A; 2NSR A; 1V4X B; 1CQ2 A; 3ZJI A; 2V1I A; 3D4X B; 4G51 A; 3ODQ B; 1DLY A; 4FWZ A; 1CO8 A; 1MBN A; 4ILZ A; 2D2M A; 4L2M A; 1RQ4 A; 1O1O B; 3WCU C; 2ZT2 A; 1YGF A; 1I3D A; 1XZ4 A; 2HBS B; 3D17 A; 3WR1 B; 4DWT A; 1O1P A; 1YHU A; 5EE4 D; 1YZI A; 1PMB A; 1OJ6 A; 2FRK X; 2MHB A; 2ZSN A; 1B0B A; 1HAC B; 3OZW A; 1XYE B; 1Y45 B; 3LB2 A; 3WCU B; 2H35 A; 3NFE A; 4MQG A; 1S69 A; 1WLA A; 1FAW A; 1Y35 B; 2DN1 A; 3WCW C; 107M A; 1U7S A; 4KMW A; 1R1Y A; 3KMF A; 3LQD B; 3E55 A; 2KSC A; 3S66 B; 1IRD A; 1Y4G B; 3KUN A; 3BOM B; 5ILR A; 4ESA B; 1AJH A; 2DN3 A; 5SW7 B; 5JOM A; 3WCW B; 5ILP A; 1G0A B; 3VRF A; 4ODC A; 2ZLV B; 1Y0C A; 3HF4 A; 3AQ7 A; 1V4W A; 2VYW A; 3QQR A; 1LJW A; 3A59 A; 1C7D A; 1HDA A; 2DHB A; 1A00 B; 2MGI A; 1URV A; 3D1K B; 1LFL B; 2D60 B; 1HGA B; 1C7B B; 1FSL A; 1X9F A; 3UHI A; 1YEN B; 2HBG A; 1S0H B; 5E29 B; 1RVW B; 1HHO A; 1VHB A; 2Z6N A; 2ZLW B; 2EF2 A; 1MWD A; 1BIJ A; 1G9V A; 2G0V A; 1Y7Z B; 3OK5 A; 3QZZ A; 2ZS0 D; 2AV0 A; 5EE4 C; 1QPW B; 3A5A A; 3G4Y A; 1LA6 B; 3LB1 A; 1LFV B; 1A3O A; 1JF4 A; 4DC7 A; 3QJE A; 1AJ9 A; 3GQR B; 1J3F A; 2LH5 A; 1HJT A; 1YVT B; 1VXB A; 4IRO A; 2W6V B; 1MLG A; 1GCW B; 1J7S B; 1X3K A; 1LH3 A; 4H2L B; 3UHD A; 1K0Y A; 2RI4 A; 1O1K B; 2MGF A; 3MKB B; 1A4F B; 1WMU A; 3QJB B; 1MKO B; 3MJU B; 1V4X A; 4B3W A; 5KKK A; 1BIN A; 2ZFB B; 1G08 A; 2NSS A; 3CIU A; 3D4X A; 1F65 A; 1JP6 A; 1H97 A; 2ZSR A; 3M3A A; 1LH1 A; 1LFT B; 2Z85 A; 1S5Y B; 1EMY A; 1XQ5 B; 2LH2 A; 3D7O B; 2GRF A; 1CIO A; 2GDM A; 1Y8I B; 2PEG B; 3WR1 A; 3QM7 A; 1S56 A; 1NIH B; 3G53 A; 2OHB A; 1HBG A; 3UBC A; 1YH9 A; 3UHY A; 1Y5J B; 1HAC A; 4U8U D; 1Y45 A; 2HBC B; 1MYM A; 5CNF A; 3WCU A; 1Y85 B; 1Y35 A; 3HXN A; 1CP0 A; 1VRF A; 1SWM A; 2AUQ A; 3BJ3 B; 1YIH B; 3LQD A; 5CNB A; 2W6X A; 2ZS0 C; 3AT5 B; 2MGC A; 2MGD A; 3S66 A; 1YHR B; 1GDL A; 3BOM A; 4ESA A; 3FS4 A; 5F0B A; 1NAZ A; 5SW7 A; 4C0N A; 3WCW A; 1URY A; 2ZLV A; 4MAX A; 4FWY A; 1IRC A; 2ZS0 B; 3D1A B; 4FC3 B; 1YCA A; 1BUW B; 4NI0 B; 3RJ6 A; 1V07 A; 2G10 A; 2R4Y A; 1G0B B; 1LUE A; 3D1K A; 1RTE A; 3NL7 A; 1CG5 B; 3V2V A; 1XZV B; 2D60 A; 110M A; 1UFP A; 1OBM A; 1XY0 B; 2HBF B; 4DWU A; 1MLS A; 1QXD A; 1YEN A; 1S0H A; 5E29 A; 2LH3 A; 1ABS A; 4ZVB A; 1T1N B; 5IKS A; 1LH5 A; 2ZLW A; 2HHB B; 1MWB A; 1O1L B; 1J41 A; 1MYH A; 3OGB A; 3UHN A; 5HY8 A; 3HYU B; 1Y7G B; 5CND A; 1MLL A; 3BCQ A; 1LFV A; 2R50 A; 4U8U C; 3GQR A; 1YOH A; 3LB3 A; 3AQ5 A; 2ZT4 A; 1YVT A; 2O58 X; 4AVD A; 2W6V A; 1GCW A; 1J7S A; 3P5Q B; 3CY5 A; 1IT3 A; 1A4F A; 1RTX A; 4NI1 A; 3QJB A; 1JPB A; 1MKO A; 4U8U B; 1MLQ A; 2WTH A; 1IBE B; 2SPO A; 1CH5 A; 1EW6 A; 3QJD B; 1FLP A; 2ZFB A; 1BVC A; 5CN7 A; 3S1J A; 4JYQ A; 3PI9 B; 3S65 A; 3E5O A; 2VHB A; 1SDL B; 2FAL A; 2MGH A; 1LFT A; 1FHJ B; 1S5Y A; 3D7O A; 4X0L B; 3ZJQ A; 1Y8I A; 2PEG A; 1J7W B; 1COH B; 1ECN A; 4O2G A; 4O1T A; 3PIA B; 2HBC A; 1HDS A; 1O1M A; 6HBW B; 1UVX A; 1MOA A; 3GDJ A; 3ONZ B; 1QXE A; 3BJ3 A; 2MGJ A; 2QRW A; 2O5M X; 1A0Z A; 1YMA A; 1YGD B; 3ZJH A; 1L2K A; 3TM3 A; 1YHR A; 106M A; 2ZSY A; 1UMO A; 3A9M A; 3GKV B; 1MOH A; 2AUP A; 1ABW A; 1MZ0 A; 1CH3 A; 2ZS0 A; 1NZ5 A; 4FC3 A; 4YU3 B; 3GOU B; 1HV4 B; 1G0B A; 2EKU A; 2D5X B; 1G09 B; 3PI1 A; 1CG5 A; 5HBI A; 1XZV A; 1XY0 A; 2HBF A; 2VEB A; 1A9W A; 4MU5 A; 1BZZ B; 3OZU A; 1VXE A; 1O1L A; 2G11 A; 1MYG A; 1Y7C B; 5EUI B; 1J3Z B; 3HYU A; 4YU4 A; 1Y7G A; 3PT7 B; 1JZL A; 3G4V A; 2BK9 A; 2GRZ A; 1BZ0 A; 2O5S X; 1NEJ A; 1B86 A; 1OUT B; 1DO7 A; 1TU9 A; 2O5O X; 2MYD A; 1KFR A; 2OH9 A; 3R5I B; 3P5Q A; 3WCW D; 1SDK B; 1YOI A; 1YIE A; 4U8U A; 1Y0T B; 1IBE A; 4ROL B; 3QJD A; 1HBH A; 2HBD B; 1SDL A; 1N9I A; 2VLZ A; 1BVD A; 1XZU B; 1Y4R A; 2ZLU B; 1XZ5 A; 4NXC A; 1FHJ A; 2ZSZ A; 4HBI A; 1UFJ A; 2MGL A; 4X0L A; 1O1N B; 2MGE A; 1J7W A; 1COH A; 3EDA A; 3ZJL A; 2G0Z A; 1F5P A; 1MLM A; 3PIA A; 2V1H A; 2LH6 A; 2V1K A; 1YE0 B; 111M A; 2E2Y A; 3SDH A; 6HBW A; 1QSI B; 4MXK A; 1IWH B; 5EYJ A; 1MYI A; 1Y0D B; 3PI8 B; 3K9Z A; 3O89 A; 1VXA A; 1O16 A; 3VRG B; 4H0B A; 1LFZ B; 2Z6T A; 2ZSP A; 2IN4 A; 1YGD A; 2QSP B; 2GLN A; 3WFW A; 3AT6 B; 1UX8 A; 1GDJ A; 1CP5 A; 2R4Z A; 1NS9 B; 1SHR B; 3ECL A; 3V2Z A; 3BJ2 B; 3E4N A; 4PQC A; 3LB4 A; 1VXC A; 1DXV B; 4MQK B; 1VXG A; 1V75 B; 4MQI A; 4HSX A; 1DTI A; 3DUT B; 1XCH A; 3BJ1 A; 1IDR A; 2G0X A; 3QMA A; 2VRY A; 3GOU A; 1HV4 A; 3PEL A; 1Z8U B; 3QM5 A; 2D5X A; 4MQJ B; 3AG0 A; 4UIQ A; 3UHG A; 3UGZ A; 3H57 A; 1A3N B; 1IOP A; 4MQH B; 1HBB A; 5M3S A; 3FH9 B; 3SZK B; 1DO4 A; 1BZZ A; 1NPG A; 4SDH A; 1YEQ B; 2BLJ M; 2H8F B; 1FN3 B; 1JZK A; 1CMY B; 1Y7C A; 1NZ2 A; 1HBA B; 2LH1 A; 1M9P B; 3G4W A; 3NML A; 1A0U B; 3MYN A; 2G0S A; 1NS6 B; 5CN9 A; 3HEO A; 1N9F A; 4G1V A; 1HBR B; 1EBC A; 1OUT A; 2GKN A; 5CN8 A; 1NWI A; 4F6F A; 2HHE B; 1CBM A; 3TLD A; 3WFX A; 1VXH A; 1J3Y B; 2G0R A; 1SDK A; 1YMB A; 2GKM A; 3UHU A; 3UHK A; 1MBC A; 3SDN A; 2IG3 A; 1HBI A; 1Y0T A; 3WCP B; 3W4U B; 1MLO A; 4ROL A; 3HRW A; 3ZJN A; 7HBI A; 4F6I A; 2MB5 A; 1GCV B; 1DUK A; 1HLM A; 2HBD A; 3DR9 A; 3MVC A; 1LFY B; 1DKE A; 1R1X B; 1XZU A; 2HHD B; 2ZLU A; 4H07 A; 1LH6 A; 3M39 A; 1F5O A; 1MGN A; 1MNH A; 3VHB A; 1Y4B B; 3IC0 B; 1O1N A; 3GKT A; 1JWN A; 3QM6 A; 2M6Z B; 1BBB A; 2NRM A; 1LHT A; 2PGH B; 1A6K A; 5JGG B; 4OOD A; 1BZP A; 4BJA A; 4M4B B; 3ODQ A; 1JZM A; 1QSI A; 5HU6 B; 1HCO B; 1Y0D A; 1ECO A; 3PI8 A; 3DHR B; 3PI2 A; 3UHR A; 1UIW B; 1Y83 B; 4HRT B; 1H1X A; 1O1O A; 1DO1 A; 1UX9 A; 4N8T B; 1LFZ A; 2HZ3 A; 2HBS A; 2MGB A; 2QSP A; 3LR7 A; 2MGM A; 1SHR A; 3BJ2 A; 4AVE A; 1XYE A; 1DXV A; 4MQK A; 1LFQ B; 1DXU B; 1V75 A; 1XZ2 B; 1QI8 B; 3DUT A; 3QQQ A; 3GYS B; 1GVH A; 3UHZ A; 1KD2 B; 3LHB A; 2VYY A; 1KR7 A; 2R4W A; 5CNE A; 1NXF A; 4O4Z A; 4NS2 A; 3ZJS A; 1YMC A; 1Y4G A; 4L7Y B; 4MQH A; 2XKH A; 4N7O B; 3GQP B; 4KN3 A; 103M A; 1G0A A; 2BMM A; 2QMB B; 3FH9 A; 3E5I A; 3SZK A; 2GTL B; 2HBE B; 1OFJ A; 5ILM A; 1RPS B; 1YEQ A; 2H8F A; 1DUO A; 1OR4 A; 1THB B; 4MBN A; 1CMY A; 5E83 B; 3WFT A; 2QU0 B; 1HBA A; 1A00 A; 2W72 B; 3UH3 A; 1NS6 A; 1BAB B; 1LFL A; 2ZLT B; 2GNV A; 3MJP B; 3ZJR A; 3QM9 A; 1HGA A; 3GLN A; 2WTG A; 1EWA A; 1JP9 A; 1C7B A; 3WTG B; 1S6A A; 1MLH A; 1ECD A; 4N7P B; 3OZV A; 3EDB A; 4F6J A; 1CH2 A; 3UI0 A; 1RVW A; 2V1G A; 1CO9 A; 4N7N B; 1YOG A; 4HHB B; 1OUU B; 1Y7Z A; 1YEO B; 2NRL A; 4KJT A; 1PBX B; 5EV5 A; 3ZJO A; 1C40 B; 1QPW A; 1Y2Z B; 2VLY A; 1D8U A; 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1HGB B; 1FAW B; 3WTG A; 1Y4F B; 1R1Y B; 5CNG A; 2Z8A A; 1T1N A; 2HHB A; 4N7N A; 1RQA B; 2D6C A; 1MNK A; 1YEO A; 3WCT B; 1PBX A; 1A6M A; 1Q1F A; 1C40 A; 2DN3 B; 2QLS B; 1Y2Z A; 4F4O B; 1MTK A; 4LPI A; 2MYB A; 2YRS B; 5AZQ A; 3VRF B; 1Y0C B; 1Y7D B; 2DXM B; 4JAC A; 1DM1 A; 2HCO B; 3HF4 B; 1O1I B; 2MGK A; 3A59 B; 1UT0 A; 1HDA B; 1MLU A; 5CNC A; 1JY7 B; 1IT2 A; 1JP8 A; 3OO5 A; 3DHT B; 4TWU A; 3O7N A; 1MCY A; 5HLU A; 2QSS A; 4KMV A; 1X9F B; 3OO4 A; 2XKG A; 1C7C A; 3UH7 A; 2O5T X; 3ASE A; 1M6C A; 3PI9 A; 112M A; 2Z6N B; 5D5R A; 4XS0 A; 3ZHW A; 1SI4 A; 2AUR A; 2BW9 M; 3MBA A; 5B85 A; 2B7H A; 1GBU B; 1MBO A; 1K1K A; 3PI3 A; 3K3U A; 3G46 A; 1HBS A; 1A3O B; 3HC9 A; 1AJ9 B; 3EOK A; 2H8D B; 1MLN A; 3UHV A; 2QFN A; 4UZV A; 1HAB A; 1YE2 A; 1JF3 A; 2ZFO C; 2ZSQ A; 2ZT1 A; 3IA3 B; 4IRO B; 1ABY B; 2ZLX B; 2MGA A; 1K0Y B; 2RI4 B; 1WMU B; 3WHM A; 3ONZ A; 1V5H A; 1CPW A; 1G08 B; 3CIU B; 2ZFO B; 4HRR A; 3A5G A; 1MYZ A; 109M A; 1UC3 A; 3IC2 B; 3KUO A; 1FSX B; 3GKV A; 5F2A A; 3ZJM A; 1SPG A; 4MQC A; 1VWT B; 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