The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
63
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sequence length |
153
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structure length |
153
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Chain Sequence |
VLSEGEWQLVLHVWAKVEADVAGHGQDIWIRLFKSHPETLEKFDRFKHLKTEAEMKASEDLKKHGVTVLTALGAILKKKGHHEAELKPLAQSHATKHKIPIKYLEFISEAIIHVLHSRHPGNFGADAQGAMNKALELFRKDIAAKYKELGYQG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Ligand binding and conformational motions in myoglobin.
pubmed doi rcsb |
| molecule tags |
Oxygen storage/transport
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| source organism |
Physeter catodon
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| molecule keywords |
MYOGLOBIN
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| total genus |
63
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| structure length |
153
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| sequence length |
153
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 1999-12-18 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1SPE A; 1YH9 A; 2BK9 A; 1YEO B; 1X9F B; 1CPW A; 3WCV A; 1IRD A; 1RSE A; 4ROL B; 3DUT B; 104M A; 1BZ0 B; 2VRY A; 1LH5 A; 1Y4F A; 4O2G A; 4MU5 A; 1YHU D; 1MBI A; 2ZS1 D; 2BLH A; 1LJW B; 2ZLW B; 3ECL A; 3G4U A; 1CMY B; 4N7O B; 1Z8U B; 1SWM A; 5E29 B; 1L2K A; 1Y2Z B; 2D2N B; 2OHB A; 3ZOM A; 3OZW A; 1FHJ B; 3UHW A; 5HLQ A; 4NI1 B; 3HHB A; 2FAL A; 3EU1 A; 1URY A; 1XYE A; 3M39 A; 1HDA B; 4WJG 1; 1LA6 A; 2G0S A; 4H2L B; 2BW9 M; 2ZS0 D; 2DN1 A; 1Y8H B; 2Z6N A; 2GNW A; 1G0B A; 1A9W E; 3S66 B; 2BNL A; 1ASH A; 3E5O A; 1O1O A; 1Y0T A; 1LUE A; 3ARK A; 4F6D A; 1VXH A; 3UI0 A; 1LFL B; 1GCW A; 3WCU B; 4UUR A; 1J7W B; 1Y4Q A; 2GTL C; 4N7P B; 3OO4 A; 1A3N B; 1C7D A; 2B7H B; 5D5R A; 3G52 A; 2AUQ A; 3UHS A; 1ABS A; 1JF4 A; 3GQG B; 1YEV A; 1AJ9 B; 1OFK A; 2HHD B; 3AT6 B; 110M A; 1Y01 B; 2G3H A; 2G14 A; 2LH7 A; 1CG5 A; 2NRM A; 2MGK A; 4F6I A; 1XZ5 A; 2LH3 A; 3VHB A; 1BBB A; 2QFN A; 1QPW B; 1FLP A; 1Y4B A; 1FSL A; 5F2A A; 1COH B; 1CQ2 A; 1HV4 B; 3PI9 B; 4GZG A; 5KKK A; 1A3O A; 5SW7 A; 1JP9 A; 3HYU A; 1BZ1 B; 1YHE A; 2ZT4 A; 3FS4 A; 5ILM A; 1A0Z A; 1IWH B; 4MQG A; 1DM1 A; 4F6G A; 1CQX A; 3D17 B; 3S1I A; 3GKV A; 4PNJ A; 2VYY A; 5KER A; 1OBM A; 1Y7D B; 1JZL A; 1IOP A; 1YG5 A; 5CN9 A; 3GOU B; 1MWD A; 2H35 B; 4BJA A; 5HU6 B; 1GJN A; 2ZSY A; 2AUR A; 1DXU B; 1HCO A; 1XZ2 A; 1JEB B; 2HBF B; 3IXF A; 1G0A A; 1MKO A; 3UHN A; 3NFE B; 5HLX A; 2DXM A; 1Y5K B; 2D2M D; 3ONZ B; 2QMB A; 3VRF A; 1V4U A; 4NK1 A; 3FH9 B; 1RQ4 A; 1DUK A; 1QXD A; 2G12 A; 1N9I A; 1YVQ B; 1Y7G A; 1RQA A; 1YMC A; 2SPO A; 4C44 A; 3BCQ A; 1GDL A; 1O1P B; 4XDI A; 1K1K B; 1GZX A; 2W6V A; 5CN6 A; 3ZJP A; 2V1K A; 1Y83 B; 2D2M B; 1Y4G B; 2OH8 A; 1MDN A; 3IC2 A; 5CN4 A; 1VWT A; 1A00 A; 1HSY A; 3WCW D; 2MYD A; 3BJ2 A; 1BUW A; 1KD2 B; 1LHS A; 1YHU C; 3SZK B; 2M6Z B; 1S69 A; 2XKI A; 1SDL A; 3WHM B; 3NG6 B; 4B3W A; 1HRM A; 1V4X A; 4N7N B; 3QZX A; 3BJ1 B; 1B0B A; 2FRI X; 1HHO A; 1Y5F A; 1UIW A; 1MWB A; 1GBV B; 2V1I A; 1VXD A; 1A01 B; 1LFZ B; 2FRF A; 4F6B A; 4F69 A; 4M4A A; 1FN3 B; 2VM0 A; 2HCO B; 1ABW A; 1Y8K B; 1YEN A; 2ZS0 C; 2GNV A; 1J40 A; 3UHQ A; 1SPG A; 1UT0 A; 1VXF A; 1UVY A; 5CMV A; 1XZ7 A; 1ITH A; 3H58 A; 1MYH A; 1YOH A; 3OO5 B; 1Y8I B; 3WR1 A; 1HBG A; 2W6X A; 3NL7 B; 1MOB A; 4L7Y A; 3VRG A; 1O1I B; 1WMU B; 2O58 X; 2GKN A; 1YFF B; 1BIN A; 3M38 A; 3WI8 A; 1YZI B; 2DN3 B; 2H8F A; 2VLX A; 4HRT A; 1MNK A; 1Y0A A; 2FRJ X; 1BZZ A; 4FWX A; 1HGC A; 2AA1 A; 3UHR A; 2GRZ A; 4U8U A; 1MNI A; 3CIU A; 1NIH B; 3AG0 A; 1GCV A; 4KMW A; 1Y0W A; 2VEB A; 1HGB B; 1QSI B; 2DHB B; 3PIA A; 1Y45 A; 1F5O A; 1HDB B; 1HAC B; 1CO9 A; 2BWH A; 1GBU B; 2G0R A; 3PI8 B; 2AUO A; 4WCH D; 1MYM A; 2GRH A; 2ZFO B; 1EBT A; 4PQ6 A; 1F63 A; 3W4U A; 1A4F B; 1BAB A; 4ROL A; 1J7S B; 2D60 B; 3DUT A; 1YE2 B; 5EU2 A; 1F5P A; 4F68 A; 5CN7 A; 1S61 A; 2ZLW A; 3E55 A; 1SHR A; 1CMY A; 3DHT A; 3ZJR A; 4N7O A; 3BOM B; 4G1B A; 3MYM A; 5E29 A; 1U7R A; 1Y2Z A; 3WCV C; 2R80 B; 3QM5 A; 1J41 A; 3QJE A; 2DN2 B; 2EF2 A; 3ZJJ A; 3BJ3 B; 3A59 B; 4HHB B; 4JYQ A; 1NQP B; 3PT8 B; 3UHC A; 1MCY A; 2KSC A; 3G4Y A; 4MXK A; 4NXA A; 2BLI A; 2HZ1 A; 3UBC A; 1HGA B; 3S66 A; 1YGF B; 3RGK A; 1BVC A; 1Y22 B; 3K3U A; 4LPI A; 3CY5 B; 5ILE A; 4FC3 B; 2C0K A; 3HXN B; 1NPG A; 4ZVB A; 2QLS B; 3PEL B; 2LH2 A; 3MN0 A; 1UMO A; 1LFL A; 2ZLV B; 3WCU A; 1VXE A; 1KR7 A; 1NAZ A; 3IC0 B; 3MJP A; 1LFY A; 1ABY B; 1J7W A; 1N9F A; 1LTW A; 3ECX A; 2MGE A; 3GK9 A; 2HZ2 A; 1NWN A; 4N7P A; 1MBA A; 1V4W A; 1DXT A; 3QJD B; 2SPN A; 1M9P A; 2NRL A; 5E83 A; 3VRE B; 1YIE A; 1QXE A; 3OGB A; 3BA2 A; 3AQ9 A; 4MQK B; 2HHD A; 1ECD A; 1HBA B; 2O5T X; 1H97 A; 1Y4P B; 1HBB B; 1HBR B; 3DR9 A; 3QM9 A; 3A5G A; 1YEQ B; 1RVW A; 1XY0 B; 1Y0D B; 1CP0 A; 2ZLU A; 5C6E B; 1Y35 B; 1QPW A; 1DTM A; 2ZLT A; 3ZJO A; 2QU0 B; 4U8U D; 2VYZ A; 1O1K B; 2RAO B; 2HHE B; 1COH A; 3HF4 A; 5AZR A; 1HV4 A; 4O4Z A; 2PEG A; 3D1K B; 1DXV A; 3MVC A; 1Y5J A; 3DHR A; 1DO4 A; 1XQ5 B; 1BZ1 A; 3ARL A; 1DXC A; 2YRS B; 1HDS B; 1ECN A; 3HRW B; 3ORD A; 3TLD A; 3D17 A; 3TM3 A; 6HBW B; 1IT2 A; 5B84 A; 3UHG A; 1Y7D A; 1FSX B; 5CHR A; 4G51 A; 1X9F D; 3LB1 A; 1YIH B; 1FAW A; 1O1J B; 3V2V A; 2H35 A; 3O7N A; 1DXU A; 2AV0 A; 2R1H B; 1A0U A; 1S5Y B; 1HBS A; 1YEU A; 1MYJ A; 4F6J A; 1I3D A; 3NFE A; 1GVH A; 2O5S X; 1Y5K A; 1MLS A; 1QI8 A; 3LR7 A; 3A0G A; 1NZ2 A; 5CND A; 2D2N D; 2LH5 A; 3FH9 A; 1MLN A; 3ED9 A; 3SDN A; 1JW8 A; 1YVQ A; 1J3Y B; 3LQD B; 1YE0 A; 1XZV B; 1HBH B; 1MTJ A; 1C40 B; 1VRE A; 4HSX A; 4YU4 B; 1JP6 A; 1CH9 A; 1MYF A; 3A9M A; 2MYB A; 1K1K A; 2EB9 A; 5AB8 A; 4NZI A; 2QSS B; 1YCB A; 1XZU B; 3WCT B; 5B85 A; 3PT7 A; 2D5Z A; 4OOD A; 1THB B; 1BZ6 A; 2D2M A; 2QSP B; 1Y4G A; 3V2Z A; 5E6E B; 5CNC A; 1YVT B; 1Y7Z A; 1MLG A; 4N8T B; 1Y09 B; 3KUO A; 1HLM A; 1SI4 B; 4MQJ B; 1OR4 A; 3WCU D; 1J3Z A; 3EOK B; 1B86 B; 5EE4 D; 1BIJ A; 3SZK A; 1CBL A; 2GDM A; 3S1J A; 3WHM A; 2ZST A; 111M A; 3NG6 A; 3ASE A; 2OLP A; 4MQH A; 3UHZ A; 2MGA A; 3BJ1 A; 1R1Y A; 2OH9 A; 1MLR A; 1JPB A; 2ZSN A; 3UHE A; 4H0B A; 4MAX A; 2LH6 A; 1F65 A; 1O1N B; 3MOU A; 3WFW A; 1G08 B; 3GQR B; 1MTK A; 3R0G A; 1NS6 B; 1FN3 A; 1GDI A; 3RJ6 A; 3WCW A; 1LH7 A; 1C7C B; 4M4B A; 3U3E A; 3S65 B; 1G09 B; 3ZOL A; 5CHQ A; 1O1M B; 1G9V B; 3OO5 A; 1OUT B; 1S5X B; 1TES A; 2HBE A; 3A2G A; 3GLN A; 3B75 A; 1DXD A; 3QJB B; 2MGH A; 1JDO A; 3MJU B; 105M A; 1DO3 A; 4FWY A; 2BLJ M; 2MHB A; 4FH6 A; 5HY8 A; 3AQ5 A; 1RPS B; 1C7B A; 1A6G A; 3ZJS A; 4ROM B; 2PGH A; 3QJC A; 3MKB A; 1LH6 A; 1M6C A; 4WJG A; 1KFR A; 1S0H A; 1CLS B; 3HEN A; 1QSI A; 2G0Z A; 2DHB A; 2R4Y A; 2HBD A; 2O5M X; 1NEJ B; 1HDB A; 4PQC A; 4TWV A; 1MLO A; 4U8U C; 3IA3 B; 3PI8 A; 3KUN A; 5CNF A; 5IKS A; 1ECA A; 1DWR A; 2ZFO A; 1AZI A; 1V75 B; 1QSH B; 1MOA A; 2D5X A; 3ZJM A; 1J7S A; 1Y31 B; 3M3B A; 1YE2 A; 3UHD A; 3HC9 A; 1Y8W A; 1YOG A; 2HBC A; 1FDH A; 1XXT A; 2QFK A; 1UX8 A; 2MGL A; 3BOM A; 112M A; 3ZJQ A; 3AT5 A; 4ESA A; 1EMY A; 2ZSQ A; 1S6A A; 4HHB A; 1NQP A; 1MLQ A; 2ZLX B; 3D1A B; 2W72 A; 4JAC A; 3ZHW A; 4KJT A; 1PBX B; 2HHB B; 2EKT A; 4O4T A; 5HBI A; 1LH3 A; 1YGF A; 2HBS B; 1Y85 B; 3R5I A; 1AJG A; 1YH9 B; 2WTH A; 3WCV B; 1IRD B; 4FC3 A; 3HXN A; 2OIF A; 4F4O B; 3S48 C; 1JY7 A; 5JDO E; 1Y7C A; 1IRC A; 3QQQ A; 4OF9 A; 1Y4F B; 3IC0 A; 6HBI A; 1ABY A; 2ZS1 C; 3H57 A; 5ILR A; 1UX9 A; 2GKM A; 1W92 A; 1J7Y A; 2MYC A; 3OZV A; 1S56 A; 3GQP B; 3HEO A; 3WCU C; 3EU1 B; 3WTG B; 1XYE B; 4MQK A; 1MLK A; 1MLL A; 1FCS A; 1GDK A; 1Y4P A; 5M3S A; 1HBR A; 1SDK A; 2DN1 B; 2Z6N B; 2Z8A A; 1G0B B; 5JDO D; 1V9Q A; 1Y4V A; 7HBI A; 5C6E A; 1EW6 A; 3K8B A; 1HAB B; 3AQ8 A; 2Z6S A; 1GCW B; 3D1K A; 5EUI B; 1R1X A; 1CG8 A; 2MGB A; 1MBN A; 2O5B X; 3QQR A; 2MGM A; 1YHR B; 2V1F A; 1HDS A; 3HRW A; 1VHB A; 3OO4 B; 2ZT1 A; 1MBC A; 1K0Y B; 2EKU A; 6HBW A; 2ZWJ A; 4H07 A; 2ZFO D; 2MGD A; 3LB3 A; 3ZJH A; 3GYS B; 2VLY A; 1Y46 A; 3NMM A; 3ZH0 A; 5JDO F; 1S5Y A; 1CG5 B; 3QM6 A; 2CMM A; 1LFQ B; 1XZ5 B; 1ECO A; 5KDQ B; 4HRR A; 1BZP A; 2ZFB A; 1BBB B; 1XZ4 A; 4NK2 A; 3A5A A; 1YGD A; 3G46 A; 1OUU A; 5MBA A; 1XZV A; 2LHB A; 1HBH A; 1IBE B; 3HYU B; 1YEO A; 1X9F A; 1BVD A; 3FS4 B; 2ZSR A; 1A0Z B; 4MQI B; 109M A; 2MBW A; 3UHB A; 4MQG B; 2FRK X; 4NXC A; 1BZ0 A; 5AZQ A; 2XKG A; 3WCT A; 1UFJ A; 1RTX A; 5CNG A; 3GKV B; 1MNO A; 1LJW A; 1A6N A; 1CH4 A; 1THB A; 1YMA A; 1DO1 A; 2XYK A; 2NSS A; 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3OZU A; 2O5O X; 3SDH A; 1NZ5 A; 1MWC A; 4F6F A; 1WVP A; 1MLF A; 1CH1 A; 2Z6T A; 1O1P A; 2V1E A; 4MPM A; 3WFU A; 4MBA A; 2Z85 A; 5EV5 A; 2ZSO A; 1Y83 A; 1LH1 A; 1LH2 A; 1CH3 A; 3W4U B; 4F4O A; 1BAB B; 3HEP A; 2W72 C; 3UH7 A; 3AQ7 A; 1KD2 A; 5MBN A; 1MYZ A; 1SHR B; 3DHT B; 3WCP B; 2M6Z A; 1NZ3 A; 2MGJ A; 1J41 B; 3QJE B; 3GQP A; 4N7N A; 2H8D B; 1DUO A; 2MYA A; 1NGK A; 1GBV A; 3WTG A; 1MZ0 A; 1A01 A; 2WTG A; 1LFZ A; 2ZT3 A; 2HCO A; 1Y8K A; 3OK5 A; 4UZV A; 1BJE A; 1YHU B; 2ZS1 B; 3QM8 A; 4MQC B; 1WLA A; 1Y8I A; 3UH5 A; 1HAB A; 2FAM A; 2RI4 B; 2ZT0 A; 3NL7 A; 3VAU A; 4TWU A; 1VXC A; 1MNH A; 1O1I A; 5EUI A; 4DWT A; 3M3A A; 1WMU A; 3MJP B; 1LFY B; 1YFF A; 3NML A; 1O1L B; 5CN8 A; 1HBI A; 1YHR A; 2EB8 A; 3TM9 A; 1DLY A; 1YZI A; 1V5H A; 2DN3 A; 5C6Y A; 2ZS0 B; 1V4W B; 4FWZ A; 1DXT B; 4TYX A; 2R4Z A; 1HJT A; 1MOC A; 1M9P B; 5E83 B; 1K0Y A; 1YIE B; 1QXE B; 4KMV A; 2G0X A; 1YDZ B; 2OHA A; 1NIH A; 1I3E A; 3GYS A; 1Y0C B; 1RQ3 B; 1HGB A; 3UHK A; 1LFQ A; 2EVP A; 1UFP A; 1Y4R B; 5KDQ A; 1MLH A; 2MGF A; 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