The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
60
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sequence length |
153
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structure length |
153
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Chain Sequence |
GALTESQAALVKSSWEEFNANIPKHTHRFFILVLEIAPAAKDLFSFLKGTSEVPQNNPELQAHAGKVFKLVYEAAIQLEVTGVVVTDATLKNLGSVHVSKGVADAHFPVVKEAILKTIKEVVGAKWSEELNSAWTIAYDELAIVIKKEMDDAA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
The binding of carbon monoxide and nitric oxide to leghaemoglobin in comparison with other haemoglobins.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
LEGHEMOGLOBIN (CARBONMONOXY)
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| molecule tags |
Oxygen transport
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| source organism |
Lupinus luteus
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| total genus |
60
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| structure length |
153
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| sequence length |
153
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 1994-09-14 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1WVP A; 5CNB A; 1X9F C; 3ZJL A; 2G10 A; 1QSI B; 1YVT B; 1IT3 A; 2HHB B; 2XKH A; 3QQQ A; 2ZSQ A; 1F5O A; 1HAB A; 2M6Z B; 1LFZ B; 5ILE A; 1Y31 B; 4NI0 A; 1MOH A; 3QJE A; 1DUO A; 1G0A B; 2WY4 A; 1V4U B; 1YHU C; 3IC0 B; 1DXV A; 5EU2 A; 1FHJ B; 5F0B A; 1H97 A; 3BJ2 B; 2DC3 A; 3PI8 B; 5EE4 C; 4NK1 A; 3HXN A; 5HLU A; 1SPG A; 1Y2Z A; 4IRO B; 1HDA A; 1LH5 A; 2MGF A; 3GKV B; 1UX8 A; 1VWT A; 1JEB A; 3MVC A; 1VXE A; 1DKE A; 1PBX A; 5JOM A; 1O1M B; 1DXC A; 3GQP A; 3NML A; 1Y35 A; 2KSC A; 4N7N B; 1NGK A; 1LJW A; 2G0S A; 5CNE A; 1Y0D A; 4MBA A; 1M6M A; 3P5Q A; 1YEU A; 4TYX A; 1HAB B; 2G11 A; 2ZLT A; 1Y8K B; 3ARK A; 3E4N A; 2FRK X; 1BZZ A; 5JDO F; 1A6G A; 1Y83 B; 2C0K A; 1DXV B; 2ZS1 D; 5HY8 A; 1BZ6 A; 2QSP A; 2D2M A; 3MYM A; 1HBI A; 3HXN B; 4F6B A; 1SPG B; 1Y2Z B; 3UHE A; 1MLU A; 2MYC A; 5KDQ A; 2LH1 A; 1MYI A; 4M4A B; 1DWT A; 1PBX B; 3WCW D; 1DO1 A; 1XZU B; 1Y45 A; 3S1I A; 2GRZ A; 1VXD A; 3UBV A; 1CG8 A; 3BJ1 B; 3GQP B; 1O1I A; 1FDH G; 1Y35 B; 1J7W A; 1RQA A; 1YGF B; 2ZT1 A; 1LJW B; 3WHM A; 1Y0D B; 5EUI A; 1SDL A; 2QMB B; 1YEU B; 2ZLT B; 1MKO B; 1N9H A; 2DN2 A; 2ZS0 A; 1LFL A; 4MQH B; 1FSX B; 2R4Z A; 2HBE B; 2ZFO A; 2PGH B; 4N8T A; 2HHE A; 1BAB A; 3KUN A; 1MOB A; 5HY8 B; 1MYG A; 3PIA A; 2QSP B; 4YU3 B; 3PI2 A; 1B86 A; 3WCP A; 1S6A A; 3ZOM A; 1EWA A; 2ZSO A; 1GDJ A; 1G09 A; 4AVD A; 3A59 A; 3QJD A; 1K0Y A; 1HLB A; 1Y45 B; 4O35 A; 1ECO A; 1HAC A; 1HGB A; 1O1I B; 1OUU A; 2AV3 A; 3UH3 A; 1MYZ A; 1R1Y A; 5HLQ A; 2FRF A; 1MNO A; 1QI8 A; 1FN3 A; 3WHM B; 5EUI B; 1SDL B; 1Y8H A; 3UHR A; 2ZLU A; 2GKN A; 4ESA A; 2ZS0 B; 1LFL B; 1RTX A; 1CO8 A; 1DWS A; 1CO9 A; 5SW7 B; 1FSL A; 3A2G A; 3G53 A; 1MBD A; 3R5I A; 2ZFO B; 2HHE B; 1DUK A; 5AZQ A; 2GRH A; 1Y7D A; 3UHK A; 3PIA B; 4MQC A; 4F6I A; 2MGA A; 5JGG A; 1B86 B; 3WCP B; 2ZS1 C; 2RI4 A; 3LR7 A; 2G14 A; 2R80 A; 1YIH A; 1MBO A; 3A59 B; 1K0Y B; 4NXC A; 2SPM A; 1CG5 A; 1HAC B; 2FAL A; 2ZT0 A; 3NFE A; 4ILZ A; 1NS9 A; 2RAO A; 1NZ2 A; 3WCW C; 1OUU B; 4G51 A; 4ODC A; 1LH6 A; 3HEN A; 1QI8 B; 1F63 A; 4MPM A; 1SDK A; 1BZ0 A; 1HLM A; 1DLY A; 2ZLU B; 4HRR A; 4ESA B; 2ZT2 A; 3HHB B; 2ZLV B; 3K8B B; 3QM8 A; 3SDN A; 3UHV A; 1AJH A; 1Y7D B; 107M A; 1GCV A; 4U8U D; 2R80 B; 3GDJ A; 1DM1 A; 2BW9 M; 2ZFB A; 1FDH A; 5CND A; 1RQ4 A; 1KR7 A; 2NRL A; 1CG5 B; 3NFE B; 2RAO B; 3M39 A; 1QXE B; 3QMA A; 2ZT3 A; 111M A; 1SDK B; 3PI3 A; 1A0U A; 2MHB A; 5AB8 A; 5B85 A; 3HC9 A; 1MTJ A; 1A6M A; 3MN0 A; 102M A; 1TES A; 3GKT A; 2YRS A; 2QU0 A; 3PI9 B; 3WCV D; 4SDH A; 2VLX A; 3VRF A; 3W4U A; 4F6J A; 2MGH A; 2GNW A; 3ONZ B; 3V2V A; 4FH7 A; 2NSR A; 1UC3 A; 1NXF A; 3RGK A; 1I3D A; 1COH A; 3GDJ B; 1MBN A; 1CH4 A; 2ZFB B; 2GRF A; 1Y46 A; 1RQ4 B; 2GTL A; 3A9M A; 1NAZ A; 1HBS A; 1YG5 B; 1CH7 A; 2FAM A; 2FRJ X; 2W31 A; 2LH6 A; 1CH5 A; 1A0U B; 2MHB B; 3UHS A; 3DUT B; 5EQM A; 1JWN A; 5D5R A; 5ILR A; 1SI4 A; 2QU0 B; 5CN5 A; 3HYU B; 1DWR A; 1KD2 A; 1A00 A; 3VRG A; 3A5G A; 1Y5F A; 3VRF B; 1XYE A; 3UGY A; 3O7N A; 3K9Z A; 1RQ3 A; 3ECL A; 3UH6 A; 1DXT A; 4B4Y A; 3WFT A; 4U8U C; 5C6E A; 3LB2 A; 5E29 B; 1NIH A; 3QJC A; 3V2Z A; 1Y46 B; 1GLI B; 1HBS B; 1XZ7 A; 1XZ4 A; 3LQD A; 3ZH0 A; 1HBA A; 3FS4 A; 1AJ9 B; 4O4Z A; 1Y4R A; 1HCO A; 1NPF A; 1ITH A; 1IBE B; 1GVH A; 2GL3 A; 1SI4 B; 3OGB A; 2QFK A; 1MNK A; 1DXU A; 4AVE A; 1Y0T A; 3VRG B; 3VHB A; 4FH6 A; 1Y5F B; 1MBC A; 1XYE B; 3HRW A; 3UHC A; 1J41 A; 1RQ3 B; 3WCV C; 1Y09 B; 1DXT B; 1H1X A; 5JDO E; 5C6E B; 1NIH B; 1ECD A; 1HDB A; 2HBC A; 2VYW A; 5CN8 A; 3TLD A; 3LB3 A; 3OZU A; 2WTH A; 1XZ7 B; 1HGA B; 1XZ4 B; 5C6Y A; 1CMY A; 3LQD B; 3FS4 B; 1IOP A; 4O2G A; 2HHD A; 1CQX A; 101M A; 3IA3 B; 1Y4R B; 2ZT4 A; 1YEN A; 3WCU D; 106M A; 4ZVA A; 1Y4G A; 4F4O A; 4KMW A; 3DHR B; 5EOH A; 1YMA A; 1Y0T B; 2V1G A; 2ZSP A; 2BLI A; 2LH5 A; 1MTK A; 3G4U A; 2MGE A; 1IWH A; 1MLH A; 3HRW B; 4NK2 A; 1YMC A; 1J41 B; 1G9V B; 1MWC A; 4KMV A; 1JP6 A; 2HBF B; 1A01 B; 1YOH A; 2HBD A; 1HHO A; 1JW8 A; 1VHB A; 2G0V A; 1NQP B; 1QXD A; 1HDB B; 1A4F A; 2VHB A; 3ZHW A; 1EMY A; 4DC7 A; 1V4X B; 2Z6S A; 3AT5 A; 2O5S X; 3CIU B; 1GCW A; 1CMY B; 3D1A A; 4LPI A; 2HHD B; 1ABY A; 3GQG A; 2R4X A; 2ZSN A; 3WCT A; 3DR9 A; 3ECZ A; 2D2N B; 5CN4 A; 1HGC A; 2W6Y A; 1Y4Q B; 1Y4G B; 2OIF A; 2Z85 A; 1LH1 A; 1YHU A; 1CBL A; 1IWH B; 3MKB B; 1DO7 A; 1O1J B; 1R1X B; 1U7R A; 3D17 A; 3G4R A; 2DXM A; 1CP5 A; 1Y0A A; 1UT0 A; 1TU9 A; 4M4B A; 1CBM A; 2ZS0 D; 2MB5 A; 1QXD B; 1A4F B; 2EB9 A; 3M3A A; 2B7H A; 4F6G A; 3AT5 B; 4KN3 A; 2ZFO D; 1GCW B; 1XXT A; 5CN6 A; 3GQG B; 4N7O A; 4FWZ A; 3WCT B; 2PEG A; 2H8F A; 1HGC B; 2R4Y A; 1MBS A; 1YOG A; 2LHB A; 3WCU C; 3PI1 A; 4NI0 B; 3QJE B; 5ILM A; 2XKG A; 104M A; 1JDO A; 3D17 B; 2DXM B; 1UX9 A; 4MQI A; 1XY0 A; 1GBV A; 4DC8 A; 1BUW A; 1C40 A; 1ECA A; 1BIN A; 1BIJ A; 2B7H B; 1MLM A; 3HEO A; 1HDA B; 3BA2 A; 2XKI A; 4N7P A; 1VWT B; 1N9X A; 3GYS A; 1JEB B; 1DKE B; 2LH2 A; 1C7B A; 1ABS A; 4N7O B; 2PEG B; 4O1T A; 2H8F B; 2IN4 A; 1MZ0 A; 3S65 A; 3WR1 A; 1J7S A; 3P5Q B; 2V1I A; 1NEJ A; 1Y7Z A; 3NL7 A; 1ECN A; 3VAU A; 1BVC A; 2O5O X; 2W6X A; 3KMF C; 3EOK A; 1BZZ B; 2DHB A; 2E2Y A; 1BJE A; 1Z8U B; 3LB4 A; 1V07 A; 1YIE A; 3S1J A; 1XY0 B; 1GBV B; 2D2M B; 2D6C A; 3ZJH A; 1C40 B; 1BIJ B; 1J52 A; 1J3Y A; 1J7Y A; 1Y4P A; 1O1O A; 5KDQ B; 1M9P A; 2ZS0 C; 4N7P B; 1IRD A; 3OO5 A; 2ZFO C; 1C7B B; 3UHI A; 1CIO A; 1CG8 B; 4OF9 A; 2H8D A; 2SPL A; 1Y7C A; 1J7W B; 1AJG A; 3IC2 A; 1RQA B; 2BK9 A; 3S65 B; 1J7S B; 1OJ6 A; 1NEJ B; 1Y7Z B; 1YVQ A; 2DN2 B; 1Y0C A; 1A6K A; 3H57 A; 1EBC A; 4F6D A; 1Y01 B; 2DN3 A; 1N9F A; 3EOK B; 2DHB B; 5EYS A; 3EU1 A; 1GJN A; 4N8T B; 1BAB B; 1J40 A; 2AA1 A; 1JP8 A; 1UVX A; 1DTM A; 1YIE B; 2ZS1 A; 3ZJQ A; 2G3H A; 4F69 A; 3ZJS A; 4UUR A; 105M A; 1J3Y B; 1J7Y B; 2V1F A; 1Y4P B; 1O1O B; 1M9P B; 1MYM A; 1G09 B; 3UHZ A; 1N9I A; 3MJU A; 1O1N A; 1MYT A; 3NG6 A; 1HRM A; 3QJD B; 2O5M X; 1MLJ A; 3WCW A; 1CH1 A; 1V4W A; 1HGB B; 2H8D B; 3SZK A; 3BCQ A; 3UHY A; 1JPB A; 1Y7G A; 1Y7C B; 2O5T X; 1DO3 A; 3IC2 B; 1R1Y B; 3MJP A; 1FN3 B; 1YMB A; 3EDA A; 1Y8H B; 1YVQ B; 3AQ8 A; 4MQJ A; 1Y0C B; 1LFV A; 1MWB A; 1V5H A; 1FLP A; 4QAU A; 2DN3 B; 2EKU A; 3EU1 B; 3R5I B; 1J40 B; 3ARL A; 2AA1 B; 3M3B A; 1Y5J A; 1CLS A; 2GKM A; 4MQC B; 2GDM A; 4ROL A; 5JGG B; 3LR9 A; 2MGB A; 1FCS A; 2VEB A; 2RI4 B; 1FAW A; 1ASH A; 3TM9 A; 4FC3 A; 1HDS A; 1YOI A; 1MWD A; 4MBN A; 1YIH B; 5CN9 A; 1O1N B; 3QM5 A; 3NG6 B; 1S69 A; 109M A; 3WCW B; 1MNH A; 1NS9 B; 3PT8 A; 1O16 A; 4G51 B; 4ODC B; 3TM3 A; 2R1H A; 4H0B A; 1L2K A; 1BZ0 B; 3WI8 A; 4F6F A; 1XQ5 A; 4MQJ B; 4HRR B; 1LFV B; 1YE2 A; 1VRE A; 1NZ5 A; 1O1P A; 2GNV A; 3ODQ A; 3S66 A; 2LH7 A; 2WTG A; 2O58 X; 4BJA A; 1SHR A; 1S5Y A; 2QRW A; 4UZV A; 1S56 A; 2ZLW A; 1GCV B; 1FAW B; 1MNI A; 1C7C A; 1HDS B; 3MOU A; 1CH3 A; 1HSY A; 1BZ1 A; 1JY7 A; 5MBN A; 1BZP A; 5CNF A; 1YHR A; 1XCH A; 3PT8 B; 2LH3 A; 1W92 A; 1Y4B A; 3ASE A; 5AZR A; 4DWT A; 3OO4 A; 4MU5 A; 1GBU A; 2VEE A; 5CNC A; 5ILP A; 1YE2 B; 3QJB A; 1JZL A; 2YRS B; 1O1P B; 3ODQ B; 1MOD A; 2VYZ A; 3S66 B; 1Y4V A; 5F2A A; 2H35 A; 1SHR B; 1LTW A; 3W4U B; 1S5Y B; 1OFJ A; 2OH8 A; 2D2N D; 2MYD A; 4F68 A; 1YGD A; 5CHQ A; 1COH B; 4TWV A; 1LH3 A; 1RSE A; 2QLS A; 2W72 C; 3UGZ A; 1JY7 B; 1D8U A; 1JF4 A; 1JL6 A; 3MYN A; 2GTL B; 1Y8I A; 2XYK A; 2VLZ A; 2O5Q X; 4NXA A; 1Y4B B; 2G0X A; 3D7O A; 1QPW A; 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1X9F A; 1V75 B; 3GK9 A; 5CNG A; 4L2M A; 3A5A A; 1VXB A; 1YEN B; 1NS6 B; 4IRO A; 2GLN A; 1YDZ B; 4F4O B; 3NMM A; 1OFK A; 4NZI A; 3G4Q A; 1XZ2 A; 1O1M A; 4PQB A; 3QM6 A; 3BOM A; 1HBG A; 3AQ9 A; 1X46 A; 3KUO A; 2D5X A; 5KER A; 3WCT C; 2NSS A; 4N7N A; 1GDI A; 1MBI A; 2HBD B; 1HHO B; 2MGK A; 3AQ5 A; 3UH5 A; 1XZ5 B; 5JDO D; 1Y8K A; 5CMV A; 3GQR A; 4JAC A; 1VXF A; 4B3W A; 3AQ7 A; 3PT7 A; 1UFP A; 1LH7 A; 2D60 A; 1Y83 A; 1LHT A; 3UH7 A; 3ZJP A; 4WJG A; 2BMM A; 3D1A B; 1X9F B; 4NS2 A; 1ABY B; 2Z8A A; 3QM9 A; 2R50 A; 1C7D A; 1EW6 A; 2MGL A; 1YFF A; 5HBI A; 2AUP A; 1NWI A; 1A3O A; 3NMM B; 1EBT A; 3WCU A; 4M4A A; 1MGN A; 3UHB A; 1YHU B; 1XZU A; 1XZ2 B; 3BJ1 A; 2HZ1 A; 1WMU A; 2BLH A; 1URV A; 2BKM A; 3BOM B; 2D5X B; 2MGC A; 5KER B; 1YE0 A; 1YGF A; 3HEP A; 1Y0A B; 2QMB A; 4M4B B; 1MKO A; 3GQR B; 5EYJ A; 4MQH A; 1FSX A; 3PT7 B; 2D60 B; 2HBE A; 2PGH A; 1XXT B; 2VYY A; 1MYJ A; 4YU3 A; 2BNL A; 4MXL A; 1C7D B; 3WFU A; 1YFF B; 1CPW A; 2D2M C; 3SDH A; 1Y8W A; 1JF3 A; 1A3O B; 3WCU B; 1YEQ A; 1CH9 A; 3ZJJ A; 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