The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
59
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sequence length |
141
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structure length |
141
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Chain Sequence |
VLSPADKTNVKAAWGKVGAHAGEYGAEALERMFLSFPTTKTYFPHFDLSHGSAQVKGHGKKVADALTNAVAHVDDMPNALSALSDLHAHKLRVDPVNFKLLSHCLLVTLAAHLPAEFTPAVHASLDKFLASVSTVLTSKYR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Direct observation of photolysis-induced tertiary structural changes in hemoglobin
pubmed doi rcsb |
| molecule tags |
Oxygen storage/transport
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| molecule keywords |
Hemoglobin alpha Chain
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| total genus |
59
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| structure length |
141
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| sequence length |
141
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| chains with identical sequence |
C, E, G
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2003-02-21 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3D1K A; 1MTI A; 1UVY A; 2BW9 M; 1IBE A; 2ZT3 A; 3MJU A; 3HEN A; 2H8D A; 4M4B B; 1HCO A; 1YVT B; 4SDH A; 3ODQ B; 1HGA A; 3UHW A; 1IDR A; 1A6N A; 1LUE A; 3QJD B; 4HHB A; 1CMY B; 1J3Z B; 1MBC A; 3E55 A; 3S65 A; 1S5Y B; 1B86 B; 3QM9 A; 3A59 A; 3WFX A; 3UHG A; 4HRT A; 3ZH0 A; 2MYE A; 5HLU A; 3QM6 A; 1EBC A; 2Z6N A; 3HF4 B; 1XQ5 B; 1JP6 A; 1NPF A; 3UHC A; 5EQM A; 2LH1 A; 1SHR A; 3UHE A; 1Y0C B; 1GVH A; 3G4V A; 1S0H B; 1Y4R B; 1NZ5 A; 1MNI A; 2R4Y A; 2BLH A; 3WCT C; 2MGJ A; 1WLA A; 1SI4 A; 1Y7Z A; 2GRZ A; 1YE2 B; 2QU0 A; 1HAC A; 1Y7G B; 1VXH A; 1GCV A; 2W6W A; 3IXF A; 4H0B A; 2G10 A; 104M A; 1JZM A; 2D6C A; 1R1X B; 3GKV A; 2C0K A; 1FSX A; 3UHN A; 2AUQ A; 1HBS A; 4F6I A; 1JP8 A; 3V2V A; 3BOM A; 1SDK B; 1LH5 A; 3D7O B; 3WCU C; 1BAB A; 4C0N A; 2RI4 A; 2FRI X; 2ZSZ A; 3VAU A; 3AQ7 A; 2VYZ A; 1HAB A; 4MAX A; 2O5S X; 1LH3 A; 5E29 B; 1NWI A; 1NS9 B; 1O1M B; 1V75 B; 2G0V A; 1Y31 B; 1LH6 A; 1Y09 B; 1YHU A; 2ZS0 B; 3AQ6 A; 3ZJM A; 3BA2 A; 4L7Y A; 2E2Y A; 1Y85 A; 2D5X A; 2OH8 A; 1I3E A; 1LFZ B; 2GTL D; 3NFE A; 5JGG A; 3EU1 A; 3HEO A; 2EKU A; 1FAW A; 2LH7 A; 1LFV B; 2QSP A; 2XKH A; 3HHB B; 1MTK A; 3G4Y A; 2H35 A; 1MYJ A; 2R1H B; 3GQR B; 1RQ4 A; 2D2N B; 1MBA A; 3LB1 A; 4JYQ A; 4MXL A; 1HDB B; 3GQG B; 2SPM A; 3MVC A; 4B4Y A; 2MGL A; 1A3O A; 2ZST A; 2XYK A; 5EUI B; 2NRL A; 4NZI A; 1JY7 B; 1EW6 A; 2DN3 B; 2ZFB B; 3OVU C; 1GDL A; 5F0B A; 3UHU A; 1ITH A; 1JZK A; 3E5I A; 2R80 B; 3KMF C; 1A6G A; 3ZJR A; 2DN2 B; 111M A; 3PT8 A; 2MGE A; 2QFN A; 1NZ4 A; 1DWT A; 1RQ3 B; 2GKN A; 1RSE A; 2O5O X; 2W6Y A; 3BJ3 A; 3ED9 A; 110M A; 2AUO A; 2VHB A; 3HEP A; 1YEQ A; 3ZJH A; 1YVQ A; 3GKT A; 1THB B; 1Y4P B; 1GBV A; 4MQC A; 1YHR B; 2LH5 A; 1NAZ A; 4U8U A; 1Y0D A; 1YDZ B; 1YMA A; 3CY5 B; 1MBI A; 1YIH A; 3ARL A; 3WHM B; 3AT6 A; 1C7B A; 5B85 A; 1UIW A; 3FH9 A; 4YU4 B; 1GDJ A; 1YHE B; 1Y7C B; 2KSC A; 3DHR A; 1DKE B; 2MYB A; 2ZLW A; 1K0Y A; 3UHZ A; 1X9F C; 1RVW B; 1Y83 A; 1Y5J A; 3SDH A; 1ECA A; 3UBC A; 1IT3 A; 2GTL A; 1LFQ A; 1V4W B; 1XZU A; 1DO4 A; 3OZU A; 2WTH A; 3PI4 A; 4LPI A; 1J41 A; 3QJE B; 3UH7 A; 4MQJ B; 2GDM A; 1DO3 A; 3D1A B; 2PGH A; 2MYC A; 1DUK A; 1XZV A; 101M A; 3AT5 B; 3WCT B; 2VLX A; 2OHA A; 2RAO B; 2D2M A; 3SDN A; 1KFR A; 3ZOM A; 4WJG A; 1ABW A; 2ZLT B; 1HHO A; 3MN0 A; 2HZ1 A; 2V1E A; 1O1K B; 5KDQ A; 4B3W A; 4F6B A; 1XY0 A; 1XZ2 A; 2DXM A; 1DXD A; 1CG8 A; 3KUO A; 2DN1 B; 4ROL B; 1Y5K B; 4X0L B; 3PEL B; 2V1F A; 4F68 A; 3UHY A; 3WCU B; 4ESA B; 5HY8 A; 1CIO A; 3QQQ A; 1MKO A; 1G0A B; 4O4T A; 1UFJ A; 1NEJ A; 4IT8 A; 1H97 A; 1VXA A; 1FN3 B; 1BBB B; 1Y8W B; 4MQG A; 5CND A; 2MGA A; 1MNO A; 1R1Y B; 1Y5F B; 1COH B; 1O1I B; 1LHS A; 4MBA A; 5AZQ A; 5HLQ A; 1ABY A; 4ROM B; 4C44 A; 5CN5 A; 4ODC B; 2QSS A; 1BZZ B; 2MGK A; 1XYE A; 1QXD B; 1NS6 A; 3GDJ B; 2MGF A; 3QMA A; 3R0G A; 2W6V B; 1QXE A; 1YZI A; 2W31 A; 3WR1 A; 1AZI A; 1BZ6 A; 1CO8 A; 1HGC B; 2V1J A; 3MOU A; 1SDL B; 4N7N A; 2V1G A; 1WVP A; 5HU6 B; 2H8F B; 3ONZ A; 1XZ7 B; 3DR9 A; 3ZJO A; 1AJ9 A; 3WCP A; 1IWH B; 1XCH A; 4KMV A; 4F69 A; 3ASE A; 3MYM A; 1LHT A; 2ZSR A; 4YU3 B; 3WCW D; 4O4Z A; 5CN6 A; 5E83 B; 1C40 B; 1NGK A; 1U7R A; 3A0G B; 2HZ3 A; 1YMC A; 1LA6 A; 1M6M A; 1GZX B; 2YRS A; 5KKK A; 4F4O B; 1QSI B; 4HRR B; 2LH3 A; 3WI8 A; 2BK9 A; 1YEV B; 3IC0 A; 1S69 A; 1Y4Q B; 1ABS A; 3SZK B; 1A0U A; 2D5Z B; 2MHB B; 1YFF B; 1VXD A; 3GQP B; 1Y4B A; 1XZ4 A; 1DO1 A; 2ZFO B; 3VHB A; 3GLN A; 1YGF B; 3E5O A; 5EYS A; 1O1L B; 1DUO A; 2HHB B; 2ZS1 C; 4QAU A; 1T1N B; 1N9I A; 3UI0 A; 2MGG A; 2BWH A; 1Y4F B; 1FHJ B; 4BJA A; 2GKM A; 3MKB A; 1JEB A; 1YEO B; 6HBW A; 2AV0 A; 1X9F B; 3AQ8 A; 2EF2 A; 1BZ1 A; 2ZSN A; 1MLN A; 3MYN A; 2NSS A; 3RGK A; 3WCV B; 1MLG A; 1UC3 A; 1PBX B; 5CN8 A; 1OUT A; 1CH9 A; 3EOK A; 1YG5 A; 1Y8K A; 4M4A B; 1MCY A; 1JWN A; 1HGB B; 1IT2 A; 1MLU A; 1MOB A; 3S1J A; 3S66 A; 1O1N B; 1CP0 A; 1CH2 A; 1HV4 B; 3A5B A; 2DC3 A; 1DLW A; 1LFT B; 3IA3 B; 1YE0 A; 1GCW B; 1J40 A; 1TES A; 4HSX A; 1Z8U B; 2AUR A; 2XKI A; 1YH9 A; 2ZWJ A; 3HYU B; 3D4X B; 4H2L B; 1JW8 A; 1HBG A; 1LFY B; 1O1P B; 3ECL A; 3LQD A; 2M6Z A; 1HBB B; 1A00 A; 1C7C B; 1IBE B; 1Q1F A; 1CPW A; 1UX9 A; 4N7P A; 3DHT A; 2OLP A; 1J3Y A; 3QZX A; 3NML A; 3R5I B; 4WJG 1; 4XDI A; 5JOM A; 4FH6 A; 1JDO A; 2O5T X; 1OUU B; 3MJP A; 112M A; 2ZSX A; 1MLK A; 3NG6 B; 1XZ5 B; 5KER B; 1CH1 A; 3S65 B; 1CO9 A; 1YHU D; 1G09 B; 3HRW A; 1HLB A; 5HAV A; 4DC7 A; 107M A; 3A9M A; 1VWT B; 3W4U B; 1MOC A; 1DWS A; 2HBC A; 1GBU B; 4G1V A; 1Y22 A; 1NIH B; 1A01 A; 4NI1 A; 2G11 A; 2DHB B; 2HBS B; 1UX8 A; 1YIE A; 3OO5 A; 1Y45 A; 3PI9 A; 5C6E B; 1YEU A; 1I3D A; 4DC8 A; 3NMM A; 1NZ2 A; 2BNL A; 4MQI B; 4KN3 A; 1RPS A; 1OBM A; 5SW7 B; 2GL3 A; 3RJN B; 1Y8I A; 3PIA A; 1HBR A; 2D60 B; 1X3K A; 4DWU A; 4PQC A; 1NPG A; 109M A; 1SPG B; 2Z6T A; 1G9V B; 2LHB A; 2FAM A; 4M4B A; 1YVT A; 3ODQ A; 2AV3 A; 1HAB B; 3QJD A; 5CMV A; 1LJW B; 2MYD A; 2V1K A; 1S5Y A; 2O5L X; 1ASH A; 2Z8A A; 1V4U A; 1Y4G B; 1B86 A; 3QZZ A; 4L7Y B; 3K9Z A; 1Y8H B; 3NL7 B; 4U8U D; 2GRF A; 3FS4 B; 2BLJ M; 2ZS1 B; 3HF4 A; 1XQ5 A; 4IRO B; 3EDA A; 1MYT A; 4MPM A; 1IRC A; 1Y0C A; 2ZLU B; 1Y4R A; 1KD2 B; 4N7O B; 1MWD A; 3BJ2 A; 3WFW A; 4WCH D; 1MNK A; 4XS0 B; 1DXU B; 1YEN B; 1YE2 A; 3OZW A; 3UHB A; 2ZSS A; 1LFL B; 2ZLV B; 1HDA B; 1R1X A; 5CNC A; 1MOA A; 5EYJ A; 1YOG A; 1U7S A; 1SDK A; 3D7O A; 5CHQ A; 3BCQ B; 4GZG A; 1HBH B; 3O89 A; 3P5Q B; 2D2M D; 2HZ2 A; 3H58 A; 1JL7 A; 3G4R A; 3ZJN A; 5JDO E; 106M A; 3QJC B; 5E29 A; 1NS9 A; 1V75 A; 2MBW A; 1UT0 A; 1Y31 A; 1Y09 A; 2ZS0 A; 1A6M A; 1M9P B; 7HBI A; 1HDS B; 1LFZ A; 1CH7 A; 1Y2Z B; 2SPO A; 3UHV A; 1UIW B; 3GYS B; 1LFV A; 1WMU B; 3HHB A; 3IC2 B; 1L2K A; 1BZR A; 2MGD A; 2W72 B; 2OHB A; 3WTG B; 2D2N A; 3UH6 A; 1HDB A; 2ZFO C; 1Y5J B; 1XZU B; 1Y0W B; 5EUI A; 2BMM A; 1JY7 A; 3UHK A; 3VRE B; 2ZFB A; 1A0Z B; 4DWT A; 1BJE A; 3CIU B; 1MLH A; 2R80 A; 4H07 A; 3LB2 A; 3VRG B; 2DN2 A; 1MWC A; 1JPB A; 2MYA A; 1RQ3 A; 1YGD B; 6HBI A; 3WCV C; 1MYF A; 5MBN A; 3WCW C; 2CMM A; 2O5B X; 1THB A; 1A3N B; 1Y4P A; 3QJB B; 1ECO A; 1CG8 B; 1O1J B; 3G4U A; 2LH2 A; 1YDZ A; 1OR4 A; 3CY5 A; 1SWM A; 1HBA B; 3B75 B; 1Y4V B; 4MQK A; 1UFP A; 1OFK A; 4YU4 A; 1YHE A; 2HBD B; 1YCB A; 1Y7C A; 1DKE A; 1S6A A; 1VXC A; 2ZT1 A; 1RVW A; 3G52 A; 2Z85 A; 3M3B A; 1J7S B; 108M A; 1V4W A; 4NK1 A; 2QLS B; 5CNE A; 4N8T B; 1QXE B; 3HXN B; 1GDI A; 2QMB B; 2R4X A; 3G53 A; 2NSR A; 1MTJ A; 4MQJ A; 1Y35 B; 3D1A A; 3AT5 A; 3WCT A; 3OO4 B; 3UH3 A; 1MWB A; 3VRF B; 4G51 B; 1K1K A; 2RAO A; 3ORD A; 1AJG A; 2ZLT A; 3BJ1 B; 4TWU A; 1V4X B; 2ZLX B; 1VXB A; 1QSH B; 1MLS A; 2AA1 B; 2VRY A; 2DN1 A; 1FDH G; 4ROL A; 1B0B A; 1Y5K A; 4X0L A; 2VEB A; 3PEL A; 3PI8 B; 1BIJ B; 1JF3 A; 2HHD B; 2SPL A; 4MQH B; 3WCU A; 1BUW B; 4ESA A; 2R4Z A; 1NWN A; 1G0A A; 3PT7 B; 2ZSQ A; 1QI8 B; 1FN3 A; 4FH7 A; 5HLX A; 1BBB A; 1XXT B; 2B7H B; 2MB5 A; 3OGB A; 1Y8W A; 1G08 B; 3UHS A; 2LH6 A; 1CLS B; 2R50 A; 1R1Y A; 1J7W B; 1NQP B; 1X9F D; 1Y5F A; 2MGC A; 1N9F A; 1MZ0 A; 1COH A; 1O1I A; 1MLJ A; 4ODC A; 1Y0A B; 1BZZ A; 5D5R A; 3UH5 A; 1J52 A; 5EV5 A; 3GDJ A; 1RQA B; 2W6V A; 2IN4 A; 2IG3 A; 4KMW A; 1CP5 A; 1DO7 A; 3G4W A; 2GRH A; 1HGC A; 1OR6 A; 3ZJS A; 2HBF B; 1SDL A; 5HU6 A; 1A4F A; 1IOP A; 2H8F A; 1N9H A; 1XZ7 A; 1YHU C; 5AB8 A; 1QPW B; 1RTE A; 4UZV A; 3LB3 A; 1J7Y B; 2HCO A; 3QM5 A; 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2Z6N B; 1KR7 A; 1JF4 A; 3HYU A; 4AVD A; 3D4X A; 4H2L A; 1S5X A; 1LFY A; 1SHR B; 1HBB A; 1M6C A; 4TYX A; 1C7C A; 1SI4 B; 1F5O A; 1Y7Z B; 3R5I A; 2ZS1 D; 2D2M C; 2QU0 B; 1HAC B; 1OUU A; 1GCV B; 2O5Q X; 3NG6 A; 1XZ5 A; 5KER A; 2OIF A; 3ZJI A; 3GKV B; 1CH4 A; 1FSX B; 3A2G A; 1V4U B; 2ZS0 D; 1G09 A; 4ZVB A; 1HBS B; 5M3S A; 4NK2 A; 1VWT A; 3BOM B; 3W4U A; 4F6D A; 1FCS A; 1BAB B; 1GBU A; 1NIH A; 1DM1 A; 2RI4 B; 2DHB A; 2HBS A; 4MU5 A; 4OF9 A; 4TWV A; 3UHX A; 4FWZ A; 1CMY A; 1J3Z A; 3BJ2 B; 1DWR A; 1LH7 A; 3LR7 A; 1YHU B; 2D2N D; 105M A; 3AG0 A; 5C6E A; 1MBO A; 1Y85 B; 4O1T A; 2D5X B; 4MQI A; 5SW7 A; 2ZSO A; 3NFE B; 5JGG B; 2D60 A; 3EU1 B; 1FAW B; 1UVX A; 1SPG A; 2QSP B; 4PQB A; 2GNW A; 3ZJJ A; 1CBL A; 1MNJ A; 2H35 B; 1S0H A; 1RQ4 B; 1MYM A; 1LTW A; 2V1I A; 1G9V A; 1V07 A; 2ZSP A; 1F63 A; 1Y7G A; 1A3O B; 3UHT A; 2ZSY A; 3UHR A; 3GK9 A; 1HLM A; 1LJW A; 3WFT A; 3HC9 A; 2GLN A; 1VXF A; 2FRF A; 1Y4G A; 4HBI A; 5ILE A; 1Y8H A; 3NL7 A; 3PI1 A; 1MGN A; 1D8U A; 3PT8 B; 4L2M A; 3FS4 A; 4O2G A; 2ZS1 A; 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