The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
63
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sequence length |
151
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structure length |
151
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Chain Sequence |
VLSEGEWQLVLHVWAKVEADVAGHGQDILIRLFKSHPETLEKFDRFKHLKTEAEMKASEDLKKHGVTVLTALGAILKKKGHHEAELKPLAQSHATKHKIPIKYLEFISEAIIHVLHSRHPGDFGADAQGAMNKALELFRKDIAAKYKELGY
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Hydrogen and deuterium in myoglobin as seen by a neutron structure determination at 1.5 A resolution.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
MYOGLOBIN
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| molecule tags |
Oxygen storage/transport
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| total genus |
63
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| structure length |
151
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| sequence length |
151
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2002-02-21 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 7HBI A; 2GNV A; 2FRK X; 4MBN A; 1Y7C B; 1IT2 A; 1FLP A; 4ODC B; 1MTJ A; 1BBB B; 4ILZ A; 5KDQ A; 3EOK B; 1MLQ A; 1HDA B; 1MLU A; 1DO3 A; 2GRH A; 1NPG A; 1OBM A; 2E2Y A; 3EU1 B; 3UHT A; 3S1I A; 2D5X A; 2AV3 A; 5ILR A; 1LJW A; 3BCQ B; 1V75 A; 3HF4 B; 1BIJ B; 2NRL A; 3OZU A; 3UGY A; 3NMM B; 2W72 B; 3D4X B; 4QAU A; 3ODQ B; 1Y5K B; 3UHN A; 1ABY B; 1DXU B; 1YEO B; 2HHE B; 1JF3 A; 1O1K A; 1OUT B; 2ZSS A; 4MQG A; 1A0Z B; 1HBS A; 1V4X B; 1CG8 A; 1Y4B A; 3G4Y A; 4PQB A; 1XZ5 B; 2MGD A; 3UHC A; 4F6G A; 3UI0 A; 2BWH A; 3QM7 A; 3ECL A; 4PQ6 A; 2GTL B; 1PBX B; 2FAM A; 2G0Z A; 3OO4 A; 1GCV B; 1NS9 A; 1IRD A; 3ZH0 A; 4C44 A; 3ASE A; 4XS0 A; 3HXN A; 3NFE B; 4H2L B; 2DN3 A; 2W6X A; 2C0K A; 2DHB B; 1QPW A; 3A2G A; 1Y7Z B; 3QJB A; 1MNJ A; 4MXK A; 4MPM A; 1T1N B; 1YE2 B; 1BJE A; 1LA6 A; 1YIE B; 5EE4 C; 1JZK A; 3R5I B; 1A3O A; 4MQH A; 1VXD A; 4HRT B; 3A59 A; 1FAW A; 1RTX A; 1MLS A; 1QXD B; 1K1K A; 3LQD A; 1YEU B; 1QSI A; 1VXE A; 2V1J A; 1MWC A; 1HHO B; 1DO1 A; 2ZT1 A; 3PEL A; 1C7B B; 2MGC A; 4MQI B; 1O1I B; 2D60 A; 2DN1 A; 1YFF B; 3PI4 A; 5D5R A; 1MLN A; 1XXT A; 1Y7G A; 3UHB A; 1YE0 B; 1LFQ A; 3TM3 A; 3P5Q A; 4PNJ A; 2NSR A; 3IA3 B; 2EVP A; 1LH3 A; 1XZV B; 2HZ3 A; 1YEQ A; 2WY4 A; 3WTG B; 2D5Z A; 1KR7 A; 3PI8 B; 1DXC A; 3W4U B; 3S66 B; 3UGZ A; 1THB B; 3WCT A; 1WLA A; 1YH9 B; 1S69 A; 4G1V A; 5AZR A; 1OUU B; 3PT7 B; 1O1O B; 3AQ8 A; 1ABS A; 1XCH A; 4ZVB A; 1HCO B; 3UHZ A; 1VWT A; 3GQR B; 2NRM A; 1EBT A; 1S5Y A; 2H8D B; 3ED9 A; 4N7P A; 2D2M D; 1HGA A; 4NI0 B; 3UH3 A; 5KKK A; 2FAL A; 2GL3 A; 4O35 A; 3M38 A; 1Y7C A; 1XZ2 B; 4N8T A; 1A01 B; 1BBB A; 4M4B B; 1QXE B; 3EOK A; 1G0A B; 1HDA A; 1YEV A; 1JP6 A; 1M9P B; 5ILE A; 2QFK A; 5EQM A; 1UC3 A; 3KMF A; 4FH6 A; 3HF4 A; 2VRY A; 2VEE A; 3FS4 B; 1HV4 B; 3NMM A; 2HCO B; 2W72 A; 1RQ4 B; 3D4X A; 1GJN A; 3ODQ A; 2BMM A; 1Y5K A; 3GK9 A; 4B3W A; 1ABY A; 1DXU A; 1XQ5 A; 1YEO A; 2HHE A; 2ZSQ A; 1OUT A; 1A0Z A; 1YZI A; 1V4X A; 2G0R A; 1AZI A; 5KER B; 1DUK A; 1DWR A; 4TWU A; 1BZR A; 5B84 A; 4WCH D; 1H1X A; 2GTL A; 1J3Z A; 4HSW A; 1MKO B; 2DXM B; 1LFT A; 2VEB A; 1GCV A; 1HLB A; 1MLL A; 3V2Z A; 3B75 B; 2SPM A; 3NFE A; 4H2L A; 3VRF B; 1LH2 A; 5M3S A; 2O5T X; 2DHB A; 3D17 B; 1FDH A; 1Y7Z A; 1Y4F B; 5CN5 A; 1YE2 A; 4OF9 A; 1YIE A; 2CMM A; 1SWM A; 1EMY A; 3R5I A; 1YMA A; 1X9F B; 4HRT A; 3MBA A; 4SDH A; 1Y4G B; 1YEU A; 3G4U A; 6HBI A; 2WTG A; 1BAB A; 2HBS B; 1HHO A; 1HSY A; 1MLF A; 2D6C A; 2MYA A; 1C7B A; 3UHS A; 5HU6 B; 2O58 X; 1UFJ A; 1YFF A; 1DTM A; 1MYM A; 4NI1 B; 1CMY B; 3OZV A; 3WR1 A; 1YCB A; 1AJ9 B; 1UVY A; 1Y0C A; 2G3H A; 3WCV C; 2OHA A; 5CMV A; 1FSX B; 1XZV A; 2QFN A; 103M A; 4L2M A; 2IG3 A; 2ZFB B; 1U7R A; 101M A; 1A6G A; 2B7H B; 2ZT3 A; 1YDZ B; 3LR7 A; 3PI8 A; 3W4U A; 3S66 A; 1TU9 A; 2ZSO A; 4N7N A; 3BJ2 B; 1MNO A; 1THB A; 2O5L X; 1Y2Z B; 2D2N B; 3MOU A; 1YH9 A; 5D1V A; 5EET A; 4VHB A; 1OUU A; 3CIU B; 2O5Q X; 3PT7 A; 1SI4 B; 2W6W A; 1HCO A; 1O1L B; 2ZSX A; 3QM6 A; 1HJT A; 3GQR A; 1LFL A; 1RPS B; 1YIH B; 2FRI X; 2XYK A; 1A4F B; 2GLN A; 2ZS0 B; 2EKT A; 1FCS A; 2OHB A; 4FC3 B; 2H8D A; 3GYS B; 3GKT A; 2V1I A; 1Y4Q A; 3WCU D; 1BZ0 B; 3WCT D; 5JDO E; 2R1H B; 1Y09 A; 1S56 A; 2AA1 B; 3PI2 A; 1XZ2 A; 109M A; 1A01 A; 4YU4 B; 1NIH B; 2G0S A; 3EDB A; 1QXE A; 1N9X A; 1G0A A; 1CH5 A; 1M9P A; 1MOD A; 3WCW B; 1COH A; 1HAC A; 1LTW A; 1Y0T A; 2ZSR A; 2DN2 A; 2M6Z B; 1YHR B; 3UHE A; 3KMF C; 3GQG B; 3FS4 A; 3HEP A; 2HCO A; 3E5O A; 2W72 C; 2Z6S A; 4FWY A; 4TYX A; 1JZM A; 2Z8A A; 3PIA A; 1RQA B; 4FH7 A; 1Y22 B; 5KER A; 3PT8 B; 1DLY A; 4C0N A; 3PI3 A; 1ECN A; 2ZSN A; 2O5M X; 2VYW A; 1A9W E; 2SPL A; 2GTL C; 3D1A B; 1CH1 A; 1UIW B; 4ROL A; 5JDO C; 2VYY A; 3VRF A; 2ZT4 A; 3D17 A; 4KJT A; 2VHB A; 1EBC A; 5SW7 B; 5AB8 A; 1Y4F A; 2SPO A; 2MGB A; 1MYH A; 1YGF B; 2QSP B; 3A5A A; 1JL6 A; 1YGD B; 1Y4G A; 1B86 B; 2ZFO D; 1IBE B; 1LFZ B; 3QMA A; 3WCU B; 1MBA A; 5HU6 A; 1NZ2 A; 3KUO A; 5CN8 A; 1LH6 A; 4NI1 A; 2RAO B; 1FHJ A; 1CG5 B; 1CMY A; 5HBI A; 1AJ9 A; 4O4Z A; 1WMU B; 1J52 A; 3GLN A; 1BVD A; 1FSX A; 4UUR A; 3LHB A; 3WHM B; 2ZFB A; 1M6C A; 2EB9 A; 3OO5 B; 3MYN A; 1X3K A; 112M A; 2B7H A; 1DXT B; 1H97 A; 3E5I A; 4ROM B; 1BZ1 B; 1S0H A; 4IT8 A; 1MOC A; 2MYE A; 1N9H A; 5EU2 A; 1SI4 A; 1JP8 A; 4LPI A; 1I3D A; 5CN7 A; 1O1L A; 1JDO A; 1RPS A; 1YIH A; 2YRS B; 1A4F A; 2ZS0 A; 1AJG A; 2HZ1 A; 2QMB B; 2R50 A; 4FC3 A; 3TM9 A; 1FN3 A; 2R1H A; 2AA1 A; 1TES A; 4ESA B; 1Y46 B; 4YU4 A; 1NIH A; 3QZZ A; 3V2V A; 1G08 B; 1Z8U B; 4X0L B; 1J7W B; 1V4U B; 3GOU B; 5E6E B; 3A9M A; 1Y8W B; 1YHR A; 2V1G A; 3HYU B; 3RGK A; 2XKI A; 1GDI A; 3GQG A; 3CY5 B; 3HRW A; 1MBO A; 1CQX A; 2BNL A; 5HLQ A; 2MHB A; 1VRE A; 2ZFO B; 4IRO B; 3ZJM A; 1K0Y A; 1BUW B; 1RQA A; 1Y22 A; 2H35 B; 3PT8 A; 1HGB B; 1CH9 A; 1MLK A; 5EUI B; 1DM1 A; 1G9V B; 3E4N A; 3S48 C; 2W6Y A; 1JZL A; 1R1X B; 1CPW A; 3D1A A; 1GCW A; 1YG5 A; 3R0G A; 1HBR B; 1SDL B; 3SZK B; 1FSL A; 2QLS B; 1J40 B; 2MYC A; 2EVK A; 1IOP A; 5SW7 A; 3IXF A; 2ZLX A; 2HBE B; 1GLI B; 3VRG B; 1J3F A; 1Y85 B; 2LH1 A; 1A0U B; 1YGF A; 3QJD B; 3M39 A; 4F6F A; 1LFY B; 2GDM A; 1A6K A; 1MBN A; 1LH1 A; 2G11 A; 1MBS A; 2QSP A; 1YGD A; 5CNF A; 1YEN B; 1B86 A; 3QM9 A; 1UMO A; 1MNI A; 1UX8 A; 1LFZ A; 2LH7 A; 1GBU B; 1BZ6 A; 1SDK B; 3WCU A; 2D2M C; 5EYS A; 3QJC B; 1Y4V B; 3AQ6 A; 3BJ1 B; 1UFP A; 3BJ3 A; 2VLZ A; 1D8U A; 1Y8I B; 3ARJ A; 1VXG A; 5CND A; 2RAO A; 1XYE B; 1YVT B; 1CG5 A; 3M3A A; 3PI1 A; 1X9F D; 4OOD A; 1WMU A; 3OZW A; 2G12 A; 2MB5 A; 1MWD A; 1NQP B; 2RI4 A; 4PQC A; 3OO5 A; 2NX0 A; 1CLS B; 3ECZ A; 1DXT A; 1XY0 B; 1VXF A; 4ROM A; 1C40 B; 4F69 A; 4ODC A; 3OJ1 A; 5E83 B; 1CP0 A; 3UHH A; 2AUO A; 1LHT A; 1MLO A; 3BOM B; 3S65 B; 3EU1 A; 3GQP B; 1YVQ B; 1G0B B; 4TWV A; 1V07 A; 3BCQ A; 2YRS A; 1GVH A; 4L7Y B; 1JY7 B; 1VXB A; 2W6V B; 3AQ7 A; 1BIJ A; 2QMB A; 1J7Y B; 2VYZ A; 1HDS B; 2MGA A; 4MQK B; 3A0G B; 2D2N D; 1R1Y B; 1V9Q A; 4F6I A; 1A6N A; 1URY A; 3IC0 B; 1O16 A; 1Y0D B; 1X46 A; 1G08 A; 1YOG A; 1XZ5 A; 1UVX A; 4X0L A; 2HZ2 A; 2ZS0 D; 1J7W A; 2G0X A; 1V4W B; 1V4U A; 3GOU A; 5E6E A; 2BLJ M; 1Y8W A; 2XKG A; 1MYG A; 5C6Y A; 1Y5J B; 1KFR A; 4JYQ A; 1PBX A; 2H8F B; 3CY5 A; 2EF2 A; 1Y83 B; 1IDR A; 1J3Y B; 3WFX A; 1C7C B; 1N9I A; 4NK2 A; 2ZFO A; 2BLH A; 4IRO A; 4XDI A; 6HBW B; 1BUW A; 3NL7 B; 2H35 A; 3WCW D; 1Y7D B; 1CH7 A; 1XZ4 B; 1NPF A; 3OGB A; 1Y0A B; 3M3B A; 1T1N A; 1YHU D; 1MYT A; 1R1X A; 1CIK A; 1SPG B; 3UH5 A; 1QXD A; 1EWA A; 5JDO F; 1RSE A; 1NZ3 A; 2LHB A; 1IT3 A; 2NSS A; 3WFT A; 1HBR A; 4DC7 A; 1CH3 A; 4ZVA A; 1SDL A; 2O5S X; 3SZK A; 4M4A B; 3PI9 B; 3HC9 A; 4MQI A; 1O1I A; 1MWB A; 3DHT B; 3UHR A; 3UHG A; 3MN0 A; 2MGI A; 2SPN A; 2ZS1 D; 4HHB B; 1URV A; 1LFV B; 1YE0 A; 2HBE A; 1RQ3 B; 1W92 A; 4HRR B; 3VRG A; 1Y85 A; 1A0U A; 3ZHW A; 3O7N A; 3QJD A; 1LFY A; 4F6B A; 3MJP B; 3UHW A; 1A3N B; 3WTG A; 3MKB B; 1JF4 A; 1YEN A; 5JOM A; 3WCP B; 2V1F A; 1O1P B; 1GBU A; 1XZU B; 1SDK A; 3WCU C; 1MBD A; 3E55 A; 3WCT C; 1Y4V A; 2ZLT B; 3QJC A; 3BJ1 A; 2ZSP A; 1MYZ A; 4H07 A; 4F6D A; 1MLM A; 3UHU A; 1Y8I A; 1O1O A; 1YVT A; 1YMC A; 1KD2 B; 2XKH A; 2R4Y A; 3MYM A; 1ECD A; 3ZJH A; 5CN9 A; 1NQP A; 1NWI A; 5F2A A; 3G4Q A; 1CLS A; 4KN3 A; 1MNH A; 1XY0 A; 1S6A A; 3OK5 A; 2OLP A; 4NI0 A; 2QU0 B; 3MJU B; 2D5X B; 5EYJ A; 2MGM A; 2WTH A; 1HBB B; 5E83 A; 1V75 B; 1B0B A; 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2BKM A; 3WCP A; 1O1P A; 1XZU A; 3G4R A; 2O5B X; 2GNW A; 3BJ2 A; 1Y2Z A; 2D2N A; 4N7O B; 105M A; 1S5Y B; 3CIU A; 3DHR B; 2QSS B; 4HSX A; 5F0B A; 1F63 A; 1KD2 A; 3RJN B; 3IC2 B; 3MVC A; 4N8T B; 1OFJ A; 4UZV A; 3GYS A; 1CP5 A; 1VRF A; 1BZ0 A; 1YEV B; 2V1E A; 1CIO A; 2QU0 A; 1JP9 A; 1MYF A; 2MGE A; 3MJU A; 4GZG A; 4G51 B; 1MGN A; 1HBB A; 2MYB A; 3H58 A; 4KMV A; 2EB8 A; 4U8U B; 3WCW A; 4WJG A; 3WFU A; 1HBI A; 3QQR A; 2HHD B; 1A00 B; 1XQ5 B; 2M6Z A; 1YZI B; 1BVC A; 1YHU A; 3NG6 B; 1BIN A; 2ZST A; 1SHR A; 3EDA A; 1O1J A; 1Y31 B; 1IWH A; 2OH8 A; 1CO9 A; 1Y4R B; 1F5O A; 1MOH A; 4MAX A; 3D1K A; 1Y35 A; 1F5P A; 3KUN A; 3QZX A; 3ZJS A; 1J3Z B; 3G52 A; 3A5G A; 1LFT B; 2ZSY A; 1NGK A; 1SPE A; 3SDN A; 1HAB B; 2ZS1 A; 3ZJR A; 1YCA A; 1Y8K B; 4KMW A; 4MQJ A; 4WJG 1; 4DC8 A; 3WI8 A; 1Y0W A; 1OFK A; 1I3E A; 3U3E A; 2R4W A; 4DWU A; 1UIW A; 2Z6N B; 3RJ6 A; 1C7D A; 1GBV A; 1MOB A; 2HBF B; 3ZJI A; 2ZLU A; 4NK1 A; 5MBN A; 2PEG A; 1QSH B; 2MYD A; 1S5X A; 4AVD A; 3HHB A; 3UBV A; 5IKS A; 3QQQ A; 3DUT B; 1DKE B; 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