The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
54
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sequence length |
141
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structure length |
141
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Chain Sequence |
VLSPADKTNVKAAWGKVGAHAGEYGAEALERMFLSFPTTKTYFPHFDLSHGSAQVKGHGKKVADALTNAVAHVDDMPNALSALSDLHAHKLRVDPVNFKLLSHCLLVTLAAHLPAEFTPAVHASLDKFLASVSTVLTSKYR
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Structures of human oxy- and deoxyhaemoglobin at different levels of humidity: variability in the T state.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Hemoglobin alpha chain
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| molecule tags |
Oxygen storage/transport
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| total genus |
54
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| structure length |
141
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| sequence length |
141
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2002-04-12 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1NWN A; 2QSS B; 4F68 A; 3OO5 A; 2ZLT B; 3WCV D; 2GKN A; 1O1M A; 1KR7 A; 1Z8U B; 2R4Y A; 3UHG A; 4DC7 A; 4MQK A; 1J7Y A; 2R50 A; 5CNF A; 3WCT D; 1COH A; 1CIK A; 4C0N A; 4NI1 A; 1UMO A; 1G09 B; 3UHR A; 2G0S A; 3PI9 B; 1T1N B; 4WJG A; 1LH3 A; 1V9Q A; 2ZFO C; 4MBA A; 3MYN A; 1MLQ A; 1YHU B; 4N7O A; 1C7B B; 1LFQ B; 2O5Q X; 1JEB A; 1I3E A; 3ARJ A; 1J40 A; 4G51 A; 1DO7 A; 3DHR A; 4F6I A; 4HRT A; 2QMB B; 1MBC A; 3UHB A; 1DO3 A; 2MGM A; 3PI8 B; 3A9M A; 4XS0 A; 1URY A; 3M3B A; 1OUT B; 4U8U A; 2O5M X; 3UI0 A; 4NI0 B; 3NFE B; 5SW7 B; 3BJ2 A; 1MYM A; 1A01 B; 1NS9 B; 3QM7 A; 2DXM B; 1J7S B; 2HCO A; 1O1K A; 2QU0 B; 2WY4 A; 1JPB A; 1HCO A; 1UX9 A; 1Y7G B; 1MNI A; 1Y0T B; 1S6A A; 1GVH A; 2MGJ A; 5CND A; 3G46 A; 1H97 A; 1THB A; 5CMV A; 4F6F A; 1CH4 A; 2AUR A; 2VLY A; 3ZOM A; 1XZ4 B; 1BVC A; 1OFJ A; 1A4F B; 1FSL A; 1MNJ A; 4OF9 A; 5JGG A; 2VYZ A; 1IBE A; 2ZSP A; 2SPL A; 2BNL A; 1FHJ A; 3PEL B; 4DWU A; 1AJ9 B; 3G4R A; 1O1L B; 5EE4 D; 5D1V A; 4N7O B; 4FH7 A; 1DXU A; 2QSP A; 4FH6 A; 3MJU A; 4G1B A; 3D17 B; 2ZLU A; 4HRT B; 1NS6 B; 3WFT A; 3TM9 A; 1S5X A; 3OZV A; 1FN3 B; 1Y0W A; 3UHT A; 1Y8I B; 3NL7 B; 5CNC A; 1Y85 B; 4JAC A; 5HY8 A; 1HBS B; 1YOG A; 1BUW A; 3MN0 A; 1LFT B; 2OHA A; 1HBI A; 3KUN A; 3MJP B; 2MGK A; 3EU1 A; 2OHB A; 3BJ2 B; 1A3N A; 2D2M C; 2GDM A; 1XZ7 A; 3V2V A; 1Y09 A; 1Y4B B; 3K8B A; 1DUO A; 2WTH A; 1VXE A; 2AA1 B; 2HCO B; 1O1K B; 5HLX A; 5E6E B; 2BLH A; 2VEB A; 3S65 A; 4ODC B; 3P5Q A; 1MLU A; 109M A; 4O35 A; 2ZS1 D; 3WCP A; 1YIE A; 2ZT1 A; 2VM0 A; 2G0Z A; 1DWT A; 3WCV A; 1X9F A; 1MWC A; 2ZFO D; 1IRC A; 2PGH B; 3WCT A; 3VRE A; 1ECO A; 2BLI A; 4TWU A; 3UH3 A; 103M A; 1OUU B; 1MZ0 A; 1Y4G B; 1XZU A; 1J41 B; 4PQ6 A; 3R0G A; 1DWR A; 2QSP B; 1VXF A; 2WTG A; 1LFY A; 2R4W A; 3O89 A; 4C44 A; 2RAO A; 3TLD A; 1AJG A; 1CQ2 A; 5HU6 A; 1SDL A; 1HBR A; 4IRO B; 1MYH A; 1Q1F A; 1Y5K A; 5F0B A; 1CG5 A; 1QXD B; 2VLZ A; 2MGF A; 1PBX A; 5HY8 B; 4AVD A; 4F6B A; 1JL7 A; 1YEV A; 1HAC A; 1HBB A; 2NSR A; 3S48 C; 1PMB A; 2DN3 A; 3ZJS A; 1HDA A; 2V1G A; 2GTL C; 2R4X A; 1MOH A; 1JF4 A; 2YRS B; 1UFJ A; 2EB9 A; 1MOB A; 2M6Z B; 1BZR A; 3UBC A; 3K8B B; 1BJE A; 1GJN A; 4MQC A; 3ZJL A; 1YG5 A; 1YVT A; 1LFL B; 1YHU D; 1MTK A; 3KMF A; 2H8D A; 1A3O A; 1J3Z A; 3ORD A; 1QSH A; 2HHE A; 3R5I A; 4M4B A; 4KMW A; 3WCP B; 2GNW A; 3HYU A; 1DKE A; 1X9F B; 1Y83 A; 2ZS0 C; 1JZK A; 3VRG A; 1YEN A; 1NQP B; 4ZVA A; 5IKS A; 5ILP A; 1A9W A; 4ILZ A; 1QXE A; 3W4U B; 1SHR B; 1NZ2 A; 4B3W A; 3OO4 A; 3GQP B; 1LA6 A; 1MLL A; 2EKU A; 1Y2Z B; 1LHS A; 1EBT A; 1GBU A; 1MOC A; 1Y8W B; 1DO1 A; 3LHB A; 1Y7Z A; 4YU3 B; 2O5O X; 4XDI A; 1VWT A; 1LH5 A; 3BJ3 B; 1IT3 A; 1CG5 B; 1GZX A; 3IXF A; 1JY7 B; 1HDS A; 1F5O A; 1HDA B; 1BZZ B; 1Y4R B; 2CMM A; 1RQ4 B; 4BJA A; 3AQ8 A; 3UHI A; 1HHO A; 2Z6S A; 2MGD A; 1TES A; 2MB5 A; 3OJ1 A; 1QPW B; 1QSI B; 1Y46 B; 3WR1 B; 2IN4 A; 2HHE B; 4MPM A; 3R5I B; 2HBE B; 2E2Y A; 1U7R A; 1YGD A; 4F4O B; 3B75 B; 1AJH A; 1Y83 B; 3VRG B; 1XZV B; 1Y8K B; 3HHB B; 1Y4Q B; 2AV0 A; 1A6M A; 4NK1 A; 1QXE B; 2ZFO A; 4HSW A; 2MGA A; 3IC2 B; 3EOK B; 3UHE A; 1OJ6 A; 1NPF A; 2FAL A; 1V75 B; 1MYI A; 3GKV B; 2DHB A; 3DHT A; 1Y7D A; 1SI4 A; 1A00 A; 1C40 A; 1Y7Z B; 1O1J A; 2MGE A; 3UH5 A; 2ZSN A; 1HGB A; 1BZ1 B; 2R80 B; 1MLF A; 1Y45 B; 2QSS A; 2ZLT A; 1LH6 A; 2ZFB B; 1CQX A; 3BJ1 A; 2ZT3 A; 1W92 A; 1VXA A; 2V1F A; 4HSX A; 2R1H B; 1G09 A; 3PI9 A; 2XKH A; 1SWM A; 1M9P B; 1T1N A; 1GBV B; 3HC9 A; 1L2K A; 3QJE B; 1YHU A; 5D5R A; 1MCY A; 1R1Y B; 3QM8 A; 112M A; 1C7B A; 2GNV A; 1NXF A; 2GLN A; 3FS4 B; 1ABY B; 1MLN A; 3A59 B; 2VRY A; 2QMB A; 2LH5 A; 1YEU A; 3A2G A; 4DWT A; 1VRF A; 3MKB B; 1UT0 A; 2MGI A; 2ZSR A; 3MYM A; 2ZLW B; 3D1A B; 1Y7C B; 1BZP A; 1BAB B; 1LUE A; 2HBG A; 1OUT A; 1A00 B; 2NSS A; 1K0Y B; 3NFE A; 1HRM A; 3UHX A; 1K1K B; 2G12 A; 1A01 A; 1HGB B; 1NS9 A; 2DXM A; 1J7S A; 1Y31 B; 2NX0 A; 1CBL A; 1G9V B; 2QU0 A; 2MGC A; 2QLS A; 1HAB B; 3LR7 A; 3LB1 A; 1Y7G A; 4ESA B; 4MBN A; 1O1I B; 2D2N C; 1Y0T A; 2D2M A; 3WFU A; 3FH9 B; 1X9F D; 1XZ5 B; 1YIH B; 1H1X A; 2D5X B; 2ZT2 A; 3BJ1 B; 1XZ4 A; 1A4F A; 3E55 A; 4H07 A; 1JP8 A; 3PEL A; 1Y35 A; 4H2L A; 4N7N B; 3PI1 A; 2O5B X; 1AJ9 A; 1CH2 A; 3UGY A; 1O1L A; 1HBH B; 1JL6 A; 4FWX A; 1S56 A; 5EQM A; 1LFZ B; 1BZ0 B; 3AT6 B; 2Z8A A; 3ED9 A; 1Y8H B; 4N8T B; 3G4V A; 1YOI A; 3D17 A; 2XKI A; 3OZU A; 1NS6 A; 1YEU B; 3G53 A; 4HRR B; 4OOD A; 2PEG B; 1FN3 A; 1ECD A; 2SPM A; 1Y8I A; 3NL7 A; 1A0Z B; 3VHB A; 1Y85 A; 1V4U B; 2ZSQ A; 3OZW A; 1JF3 A; 1YMC A; 1HBS A; 5JDO C; 1J7W B; 1N9F A; 1ABS A; 3UH6 A; 1LFT A; 4MQI B; 3CIU B; 1M6C A; 4ZVB A; 5HBI A; 4MAX A; 3E5O A; 4ROM B; 3MJP A; 1HBA B; 1FDH G; 2V1E A; 1EMY A; 2LH1 A; 5E29 B; 1SPG B; 1Y4B A; 3MVC A; 1RPS B; 2AA1 A; 3PT8 B; 2QLS B; 1Y4F B; 3TM3 A; 2JHO A; 3PI2 A; 5E6E A; 2DN2 B; 3ECZ A; 2D2M B; 1MBA A; 4ODC A; 1Y0A B; 1N9X A; 2AUO A; 3GQG B; 1UVY A; 1JP9 A; 2ZWJ A; 2AV3 A; 2OH9 A; 2XYK A; 2VEE A; 2G0R A; 1B86 A; 2ZLV B; 2PGH A; 1Y5F B; 1Y35 B; 3UHQ A; 3BA2 A; 4H2L B; 1MBI A; 3BCQ B; 3VAU A; 1OUU A; 2ZS0 A; 1Y4G A; 1J41 A; 1UX8 A; 4WJG 1; 1VXB A; 1YE0 A; 5HLU A; 3D7O B; 4UZV A; 1MYT A; 4SDH A; 3AQ7 A; 2BWH A; 1CMY B; 1DXC A; 1JDO A; 1O1P B; 2H35 B; 3E5I A; 4IRO A; 5CHQ A; 1CO9 A; 2OH8 A; 1XZ2 A; 1QXD A; 1O1N B; 1EWA A; 4MQG B; 1G08 B; 2MYA A; 1MBN A; 1BZ6 A; 1GLI B; 2YRS A; 4G1V A; 1HLM A; 1F65 A; 1CPW A; 1MYF A; 2M6Z A; 1CBM A; 3PI3 A; 1RQA B; 2VLX A; 1EW6 A; 1URV A; 3WCU C; 2GTL B; 3ECL A; 2W6Y A; 2W6V B; 3OGB A; 2OLP A; 1LFL A; 1EBC A; 2GL3 A; 1VXH A; 1RTX A; 1FSX B; 3HEN A; 3ZH0 A; 1MKO B; 1NQP A; 1B86 B; 3NMM A; 1J52 A; 3ASE A; 1CH7 A; 3W4U A; 3ZJJ A; 1O16 A; 1SHR A; 2ZSZ A; 3GQP A; 3WTG B; 2BLJ M; 2ZS0 B; 2HBD B; 1M6M A; 1RVW B; 1I3D A; 1S5Y B; 1YE0 B; 111M A; 1Y2Z A; 1FCS A; 1HGA B; 5B84 A; 3S66 A; 1Y8W A; 1XXT B; 1Y4V B; 1VXG A; 1QI8 B; 3H57 A; 2W6X A; 4YU3 A; 2G14 A; 3BJ3 A; 1XZ2 B; 3QQR A; 2ZSX A; 4X0L B; 5JDO F; 5EET A; 1OR6 A; 1A0U A; 2HZ1 A; 1YEO A; 2HHD B; 1JY7 A; 4PQC A; 107M A; 4NK2 A; 1BZZ A; 1Y4R A; 5HLQ A; 4U8U C; 1RQ4 A; 3QJC A; 4MQJ B; 1DWS A; 3ONZ B; 3OVU C; 2RI4 A; 3ZJO A; 2QFN A; 2FRJ X; 3DUT A; 1XYE B; 3AT5 B; 3M38 A; 3PIA B; 2MYC A; 3NG6 B; 1QPW A; 1QSI A; 1YZI B; 1Y46 A; 3WR1 A; 3G4W A; 4VHB A; 1F5P A; 1ECN A; 1HJT A; 2HBE A; 2H8F A; 1YE2 B; 4F4O A; 3B75 A; 1XZV A; 1Y8K A; 3HXN B; 3GQR B; 3NMM B; 3HHB A; 3WHM B; 1Y4Q A; 1LJW B; 1NIH B; 3IC2 A; 3EOK A; 1DM1 A; 1Y4P B; 2FAM A; 1SPE A; 1MTJ A; 3BOM B; 1V75 A; 1YDZ B; 2QFK A; 1HV4 B; 3GKV A; 2MYB A; 2KSC A; 3CY5 B; 3S66 B; 1NGK A; 3K9Z A; 1GDI A; 2ZST A; 3S1I A; 4PNJ A; 5CN6 A; 2HBC A; 1BZ1 A; 3ZJR A; 2R80 A; 1A0U B; 1G0B B; 2D2M D; 4FWY A; 1YEO B; 1WLA A; 3EDA A; 1Y45 A; 2ZT0 A; 1YHE B; 1V4W B; 1GCW B; 3QJC B; 2DN1 B; 1DXV B; 2DC3 A; 5AZQ A; 2ZFB A; 5MBA A; 2QRW A; 4NS2 A; 1ITH A; 2D5Z B; 2RI4 B; 1S69 A; 3UHK A; 1HGC B; 2MHB A; 3DUT B; 1BIJ B; 2D2N A; 2ZT4 A; 3KUO A; 106M A; 1R1X B; 2G10 A; 2R1H A; 5CN4 A; 1MGN A; 1YMB A; 1ABW B; 1M9P A; 4HBI A; 1GBV A; 1CLS B; 1UIW A; 3ZJP A; 2H8F B; 3QJE A; 1R1Y A; 3UHU A; 3WCV C; 2V1J A; 3FS4 A; 1ABY A; 1MWB A; 5ILE A; 3A59 A; 5EV5 A; 3QZX A; 3QZZ A; 1MNO A; 3MKB A; 6HBW A; 2ZLW A; 3D1A A; 1Y7C A; 3ZJQ A; 3PI4 A; 1YVQ B; 1BAB A; 4WCH D; 1MTI A; 2GKM A; 1MLR A; 5CN7 A; 1DTI A; 3ARL A; 1C7C B; 1K0Y A; 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4F6G A; 1JWN A; 2O5T X; 2ZLV A; 1VRE A; 1Y5F A; 3UHN A; 3BCQ A; 5EYS A; 2EVP A; 3D1K B; 3O7N A; 1Y5J A; 1MOA A; 3A5G A; 3D7O A; 1HDB A; 3QJD B; 3GOU B; 2ZS1 C; 3UHH A; 1CMY A; 1O1P A; 2MGB A; 3HRW B; 3UGZ A; 3VRF B; 1MDN A; 2H35 A; 3LR9 A; 5AB8 A; 3G4U A; 1GDL A; 1O1N A; 5CHR A; 5CN5 A; 1GCV B; 1HLB A; 3PT7 B; 3SZK B; 1Y22 B; 4MQG A; 4AVE A; 1G08 A; 1IRD B; 1C7D B; 4HHB B; 4MQH B; 1GLI A; 1FDH A; 3HF4 B; 5ILM A; 2B7H A; 1RQA A; 1DXT B; 4O2G A; 2GTL A; 1KFR A; 2W6V A; 2NRM A; 4PQB A; 1NPG A; 3LB4 A; 3DR9 A; 4KMV A; 1RSE A; 1N9I A; 104M A; 2R4Z A; 1LFV B; 3UHZ A; 3WCU B; 2BK9 A; 1FSX A; 2SPN A; 2IG3 A; 1Y01 B; 1RQ3 A; 1DXD A; 1G0A B; 4F6D A; 4N7P B; 1MKO A; 3G52 A; 1VHB A; 3OO5 B; 1CH9 A; 3HEO A; 2HBS A; 1O1M B; 4IT8 A; 5C6Y A; 3WTG A; 4O4Z A; 4MQK B; 1J7Y B; 2HBD A; 5EOH A; 5MBN A; 4YU4 A; 3M39 A; 1RVW A; 1COH B; 1S5Y A; 1YHU C; 4NXA A; 1Y5J B; 2FRF A; 4NI1 B; 3LB3 A; 3GKT A; 1HGA A; 1HDB B; 1YOH A; 2BMM A; 1XXT A; 1Y4V A; 1QI8 A; 1MYG A; 1OR4 A; 5ILR A; 4FC3 A; 1MBO A; 4X0L A; 1JEB B; 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