The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
51
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sequence length |
146
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structure length |
146
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Chain Sequence |
VHLTPEEKSAVTALWGKVNVDEVGGEALGRLLVVYPWTQRFFESFGDLSTPDAVMGNPKVKAHGKKVLGAFSDGLAHLDNLKGTFATLSELHCDKLHVDPENFRLLGNVLVCVLAHHFGKEFTPPVQAAYQKVVAGVANALAHKYH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Structures of human oxy- and deoxyhaemoglobin at different levels of humidity: variability in the T state.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Hemoglobin alpha chain
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| molecule tags |
Oxygen storage/transport
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| total genus |
51
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| structure length |
146
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| sequence length |
146
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2002-04-12 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| B | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2VYY A; 3A5B A; 1MLO A; 1JP8 A; 2Z6N A; 1Y85 B; 2BLJ M; 4NZI A; 1XY0 B; 3HRW B; 2LH5 A; 2AV3 A; 1YE2 B; 1HHO B; 3ZJN A; 3MKB A; 4MQI B; 1TU9 A; 1SDK B; 1CQ2 A; 1RQA A; 5CN8 A; 2ZT3 A; 1UX9 A; 1ECN A; 1ECD A; 1B86 A; 5JDO D; 3FS4 A; 1KD2 A; 1DXV B; 5AZR A; 3GQP A; 3NMM A; 4H2L B; 1Y0T B; 3ARL A; 3UHC A; 1VXG A; 3HHB B; 2D6C A; 2MGK A; 1F65 A; 1G9V A; 1YVT B; 3UHT A; 2ZSS A; 1LH5 A; 3WFW A; 3ASE A; 4G1B A; 1LFY B; 1YEQ B; 5EET A; 1MYF A; 3ED9 A; 1LUE A; 3KUN A; 2AUO A; 5E29 B; 1YEV A; 1YH9 B; 2QU0 B; 1A3N A; 2B7H A; 1SHR A; 4PQ6 A; 4U8U D; 1I3D A; 5C6Y A; 1MLL A; 3M39 A; 1O1N B; 2BW9 M; 5EUI A; 1V4W A; 3A5A A; 1NAZ A; 4IRO A; 1V5H A; 2NRM A; 5C6E A; 1C7C A; 1MOB A; 1HSY A; 1MOD A; 1QXE B; 5F0B A; 2HBS B; 1BIJ B; 102M A; 3QM9 A; 2YRS B; 1A9W E; 1BIN A; 1Z8U B; 2DN3 B; 4HHB B; 1S0H A; 2HBG A; 2HBE B; 1HAC B; 1SDL B; 1HBB B; 1IRD B; 3WR1 A; 5F2A A; 1X9F C; 2DN2 A; 1YHU D; 2VM0 A; 1JZK A; 1Y4P B; 2WTG A; 2ZT4 A; 5EYJ A; 3MOU A; 1NS6 A; 1O1L B; 1Y46 B; 112M A; 1A6G A; 1Y8W A; 2R80 B; 1Y7Z A; 3G4R A; 1O16 A; 3B75 A; 5HY8 B; 1SPG A; 2OIF A; 2V1F A; 1YHU B; 3ZJP A; 1JP6 A; 3OO5 A; 3SDH A; 2HBD A; 2HCO B; 1MYJ A; 1Y7D A; 1CBM A; 2EF2 A; 2R4Y A; 2MHB A; 5HU6 B; 3LB1 A; 3BJ1 B; 1IT3 A; 4WJG A; 3G4Y A; 3ODQ A; 1CO9 A; 1QPW A; 111M A; 2WY4 A; 3IC0 B; 1DWS A; 1CBL A; 4M4A B; 1Y7C B; 3TM9 A; 2D2N D; 4NXC A; 2V1H A; 1JDO A; 1JF4 A; 2VLY A; 1Y4Q B; 1GCV A; 2D2M C; 4ILZ A; 2ZSY A; 3UHK A; 1YG5 B; 3QZX A; 1YEU B; 1Y35 B; 5AB8 A; 2ZLW B; 2QSS A; 1JZL A; 4MQC A; 1WLA A; 2FRI X; 1O1O B; 1YEN B; 1A01 A; 1XZ7 A; 103M A; 3BCQ A; 1RVW B; 1YIE A; 1NXF A; 2MGB A; 1A00 B; 1NS9 B; 2QFK A; 1LFV A; 1HAB A; 2D2M A; 1Y5K A; 1O1M B; 3D4X A; 2MYA A; 2AA1 A; 4ROL A; 5IKS A; 3FH9 A; 1YE0 B; 1Y4R B; 3ZJR A; 2O5S X; 3KMF C; 2M6Z A; 1HGB B; 5CHQ A; 3QJC A; 4TWV A; 4F6B A; 1Y8H B; 1YOH A; 5JGG A; 4NK2 A; 4F6G A; 1Y09 A; 3NG6 A; 3HF4 B; 3WHM A; 110M A; 1D8U A; 2EB8 A; 2GRF A; 3G53 A; 4F69 A; 2MB5 A; 1SI4 A; 3DHT B; 1V4U A; 3WCW D; 3NFE A; 1UVX A; 1LH6 A; 3KMF A; 3V2V A; 1ASH A; 2ZLU A; 4MQH B; 4LPI A; 1MDN A; 1ABY B; 1NIH A; 2MBW A; 4F6J A; 4MQJ A; 1HBS A; 3UHN A; 1J3Y A; 5CN5 A; 1J3Z A; 1V75 B; 1NEJ B; 1J7W B; 1LFQ B; 2VRY A; 3MBA A; 3PIA A; 1CP5 A; 1MBC A; 2BLH A; 3WCW B; 3PT8 A; 6HBW B; 4JYQ A; 3UHS A; 4L7Y B; 3ZJO A; 3BJ2 B; 2D5Z A; 1XXT A; 1J52 A; 1PBX B; 4AVD A; 3P5Q B; 5KKK A; 2XKG A; 1DXU B; 1Y0C B; 3UHH A; 4YU4 A; 4O2G A; 4N8T A; 4QAU A; 1MNK A; 3VAU A; 3WCV B; 2G11 A; 5KER A; 1T1N B; 1K0Y A; 1HCO A; 2QMB A; 1VXB A; 3QQR A; 2O5Q X; 1C40 A; 2ZLV B; 1XZV A; 4FC3 A; 4FWX A; 2H8D A; 5CN6 A; 2IN4 A; 3QJE B; 1LH2 A; 1M9P B; 2QFN A; 2SPL A; 1MTI A; 1XZU A; 4OF9 A; 2LH7 A; 3A0G B; 1A4F A; 4FWY A; 1HBA A; 1LHS A; 1HBH B; 1HDB A; 1NZ5 A; 2O5B X; 1NZ3 A; 1YIH A; 3DHR B; 3GYS B; 1FHJ A; 5JDO E; 1LFL B; 1HBR A; 1Y85 A; 3R5I A; 1AJG A; 2G14 A; 3VRE A; 3LB3 A; 3GDJ A; 3SZK A; 3HRW A; 1YE2 A; 3HEP A; 3UH7 A; 2RI4 B; 3QJB A; 1GZX B; 2DXM A; 2QLS B; 1GDJ A; 3MJP B; 2AUQ A; 1Y31 A; 1RTE A; 5CN7 A; 3GQG B; 1YGD A; 3GOU A; 5E6E B; 4G1V A; 3S65 B; 1DWR A; 1A6M A; 1R1X B; 1AJ9 B; 3GKT A; 5JDO C; 2O5L X; 1NQP B; 1LH3 A; 2QSP B; 1YMA A; 1DXV A; 5EQM A; 2VYW A; 1BVD A; 3MVC A; 1A0Z B; 1C7B B; 2D5X B; 3CY5 B; 4MXK A; 4ESA A; 4F6F A; 1DXD A; 3PI9 B; 3GKV A; 1LHT A; 4ODC A; 3UHY A; 2ZWJ A; 1GJN A; 2Z6S A; 2G10 A; 1G09 B; 4X0L B; 5HAV A; 5E29 A; 3AT6 A; 4U8U C; 2Z8A A; 4DC8 A; 1BZ1 B; 3MN0 A; 4F4O B; 2LH2 A; 4NI1 B; 2HZ1 A; 5KDQ A; 1HV4 A; 2ZS0 B; 4F68 A; 2EKT A; 1MYI A; 3UHV A; 1TES A; 2V1G A; 1Y8K B; 1YZI A; 4M4B B; 1MWD A; 3D7O B; 1HGA A; 4HSX A; 1S69 A; 4GZG A; 1BZP A; 2YRS A; 2HZ3 A; 4U8U A; 2MGG A; 2FRK X; 1DXC A; 2HBC A; 3VRG B; 1N9H A; 3LQD B; 3PI2 A; 1IOP A; 1OUU B; 4PQB A; 3IC2 B; 3PEL B; 4UIQ A; 2HBE A; 1Y45 B; 1QXD A; 1HBB A; 1JZM A; 1NWI A; 1N9I A; 1GBV A; 1Y0D A; 3WCU D; 3UH3 A; 2OLP A; 1YHU C; 3O7N A; 1Y4B A; 1EWA A; 4UUR A; 3KUO A; 1MLU A; 3PT7 A; 2NRL A; 4TYX A; 4BJA A; 3NL7 B; 4G51 B; 1Y22 B; 3UBV A; 5D5R A; 3S48 C; 4TWU A; 2RAO B; 5HY8 A; 2FAL A; 1BAB A; 1LA6 B; 2V1E A; 2W6V B; 2ZSX A; 4HRT A; 1YHU A; 3A59 B; 1J7Y B; 1FDH A; 2GTL B; 4MBN A; 1GDK A; 1QI8 B; 2ZFB B; 2AV0 A; 1O1P A; 5SW7 B; 2GNW A; 3D17 A; 1BUW B; 5CNF A; 4M4A A; 1MOA A; 2R4W A; 3UI0 A; 4MBA A; 3MYM A; 2D2N C; 1Y7C A; 2ZT2 A; 1DKE B; 2G3H A; 2KSC A; 4N7O A; 2ZLT A; 3ZJJ A; 3HEN A; 1RTX A; 3GQR A; 1HDA A; 3AT5 B; 1YFF B; 1GLI A; 3K9Z A; 1K1K A; 1DM1 A; 1JEB A; 3AQ9 A; 1Y0A A; 4N7P A; 1CH3 A; 1YG5 A; 3QM7 A; 3OJ1 A; 1S5X B; 2IG3 A; 5EE4 D; 1Y35 A; 1Y7G B; 2ZLW A; 2HHD A; 5CN9 A; 1MBN A; 4MQK A; 1COH A; 3HYU B; 1Y01 B; 2D2N A; 1DTI A; 3ZJH A; 3DUT B; 5EYS A; 3UHQ A; 1EBC A; 1MLK A; 1FAW A; 2H8F A; 2FAM A; 3OZU A; 3EDA A; 1C7D A; 3WTG A; 1NGK A; 3OO4 B; 4NI0 A; 1MLN A; 1QSI B; 3MJU B; 1DXT A; 4DC7 A; 1XQ5 A; 2D60 A; 3WCT D; 1FSX B; 1HGB A; 1WVP A; 1J41 B; 1O1J B; 1VXF A; 1Y8H A; 2DN1 B; 2ZST A; 1VXC A; 1XZ5 B; 1Y4F B; 3M3B A; 1CG5 A; 5HLQ A; 1CG8 A; 1YHR B; 1CLS A; 4N7N A; 1R1Y A; 1RQ3 B; 3WCW C; 1YEO B; 2LH6 A; 3WCT B; 1JWN A; 3EU1 A; 3MYN A; 3QM8 A; 2H35 A; 1Y0W A; 4MQH A; 1CMY B; 4ROM A; 1MWC A; 1UIW A; 3EOK A; 1AZI A; 4HBI A; 3S1J A; 1CQX A; 1CIK A; 2E2Y A; 4NS2 A; 4XS0 A; 1Y5J B; 3QJD B; 4B3W A; 2ZS1 B; 1O1I B; 3WCW A; 1CPW A; 1V4X B; 1H97 A; 1JY7 B; 3LB4 A; 1S6A A; 5M3S A; 1DO4 A; 7HBI A; 101M A; 2LHB A; 3AQ6 A; 3CIU A; 5EU2 A; 1THB B; 4SDH A; 1X9F A; 3VRF B; 3E4N A; 1DUK A; 1HDS A; 1ITH A; 1JW8 A; 1BZR A; 1UMO A; 4MAX A; 3W4U A; 4KJT A; 3ZJI A; 2ZLV A; 1MBS A; 1LFZ B; 2GL3 A; 1YCB A; 1BBB B; 1G0A A; 5ILR A; 1RSE A; 2WTH A; 3QJE A; 2HBF A; 2PGH A; 2ZSQ A; 1M9P A; 1MOH A; 1MCY A; 1ABS A; 1BZ6 A; 2XKI A; 3A0G A; 1HBH A; 2Z6N B; 1XZ2 A; 3DHR A; 4DWT A; 1M6C A; 1LFL A; 1Y2Z A; 1X46 A; 2SPN A; 1S56 A; 2DHB B; 3RGK A; 2MYD A; 1MLG A; 2W72 C; 1YGF A; 1H1X A; 1IBE B; 3MKB B; 2RI4 A; 2PEG A; 1VXD A; 1VWT B; 1RQA B; 1HBI A; 5EOH A; 1MTK A; 2W6X A; 1OFJ A; 1A0U A; 1NPG A; 1Y83 A; 1R1X A; 4WJG 1; 1B86 B; 1AJ9 A; 1JPB A; 1KD2 B; 3GQP B; 2ZLX A; 3PI3 A; 1A6K A; 1G9V B; 2W72 A; 2D5X A; 2R50 A; 1Y5F B; 1Y4V B; 1CH7 A; 1HBG A; 4X0L A; 3ECL A; 1Y4G A; 1A3N B; 2B7H B; 1J7S A; 1SHR B; 1YHE A; 1MLM A; 4VHB A; 3UHB A; 1MLS A; 1IT2 A; 1GBU A; 4NI1 A; 4B4Y A; 4IRO B; 3UHW A; 1RPS A; 5HLU A; 109M A; 5C6E B; 4PQC A; 1C7C B; 1JF3 A; 1BZZ B; 3IXF A; 5B85 A; 1Y8K A; 3PI4 A; 1J3F A; 4M4B A; 2AUR A; 3D7O A; 4C0N A; 2HHE A; 1BZ0 A; 2FRF A; 1LFT A; 2O5O X; 1MBD A; 2GRH A; 108M A; 1EMY A; 3WCV D; 2ZFO D; 1DLW A; 1MLJ A; 3QM5 A; 3PEL A; 3G52 A; 1IWH A; 1GCW A; 1Y45 A; 3WR1 B; 3G4V A; 3WCU C; 1XYE A; 1WMU B; 2DN2 B; 1OBM A; 2G0S A; 1NS6 B; 1MKO B; 1UX8 A; 1EBT A; 4O4Z A; 3WCP A; 1Y8W B; 2ZFO B; 5E83 A; 1Y7Z B; 2MYB A; 1FLP A; 3NL7 A; 5MBA A; 2CMM A; 3B75 B; 3BOM A; 1LJW A; 1SPG B; 3UHD A; 4G51 A; 1URV A; 3GLN A; 5CN4 A; 3UHE A; 1DUO A; 5CNC A; 3WCU A; 3OO5 B; 1G0B B; 1LA6 A; 2HBD B; 3D1A B; 3D1K B; 3V2Z A; 2VEE A; 3A59 A; 2V1K A; 3UGY A; 4PNJ A; 1QPW B; 2HHB B; 1SWM A; 1QSH B; 2EVP A; 3ZOM A; 1DKE A; 1UC3 A; 2V1I A; 2W6W A; 3E5I A; 1MNO A; 3AT5 A; 1GCV B; 1MYZ A; 1XY0 A; 3ECX A; 3K3U A; 5JOM A; 1LH1 A; 4HRR B; 1W92 A; 1HHO A; 1UVY A; 3U3E A; 4MQI A; 1SDK A; 5EE4 C; 4MQC B; 1L2K A; 2GLN A; 3BCQ B; 3TM3 A; 4H2L A; 1Y0T A; 1HAB B; 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1A4F B; 1HBA B; 1HDB B; 1YIH B; 1FHJ B; 1HBR B; 2MGD A; 1MYH A; 2EKU A; 1YEU A; 1DO3 A; 3R5I B; 4MPM A; 3VRE B; 3WFX A; 1CH5 A; 1Y8I B; 3GDJ B; 3SZK B; 2O58 X; 1O1O A; 1YEN A; 2DHB A; 1A3O B; 3QJB B; 1IDR A; 2DXM B; 1RQ4 B; 1Y31 B; 1IBE A; 3H58 A; 1RVW A; 1HGC B; 1YGD B; 1VWT A; 3GOU B; 3S66 B; 1HRM A; 1A00 A; 1NS9 A; 1O1M A; 2GNV A; 4H07 A; 1YVQ B; 2NSS A; 1YE0 A; 1SPE A; 1Y4R A; 4ESA B; 3A2G A; 1YDZ B; 3GKV B; 4ODC B; 2V1J A; 2MGE A; 2BK9 A; 1Y5F A; 1Y4V A; 2EB9 A; 2SPM A; 3IA3 B; 5AZQ A; 1EW6 A; 5HBI A; 2JHO A; 1G08 B; 3NML A; 3AT6 B; 3HF4 A; 3OVU C; 1YMC A; 3ORD A; 5KDQ B; 1HV4 B; 2ZS1 D; 3DHT A; 2AUP A; 3ARK A; 3HEO A; 1ABY A; 2LH1 A; 1YZI B; 1MBO A; 2G12 A; 1HGA B; 1BZZ A; 3ONZ B; 4KMV A; 3UBC A; 1F5O A; 3UHG A; 2GKM A; 1FCS A; 1S5Y B; 1V75 A; 4U8U B; 1NEJ A; 2HBC B; 1J7W A; 5HLX A; 1LFQ A; 1OR4 A; 1A6N A; 3PI8 B; 3WCV C; 2ZFO C; 4F6I A; 3QMA A; 6HBW A; 2VLX A; 4L7Y A; 1QXD B; 3BJ2 A; 1F63 A; 1GBV B; 1Y0D B; 1PBX A; 2Z85 A; 3AQ7 A; 3P5Q A; 2OHA A; 1WMU A; 1DXU A; 1Y4B B; 1Y0C A; 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