The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
50
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sequence length |
141
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structure length |
141
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Chain Sequence |
VLSPADKTNVKAAWGKVGAHAGEYGAEALERMFLSFPTTKTYFPHFDLSHGSAQVKGHGKKVADALTNAVAHVDDMPNALSALSDLHAHKLRVDPVNFKLLSHCLLVTLAAHLPAEFTPAVHASLDKFLASVSTVLTSKYR
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Structures of human oxy- and deoxyhaemoglobin at different levels of humidity: variability in the T state.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Hemoglobin alpha chain
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| molecule tags |
Oxygen storage/transport
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| total genus |
50
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| structure length |
141
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| sequence length |
141
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2002-04-12 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3QJD B; 2SPM A; 3AQ6 A; 3QM5 A; 1VRF A; 1RVW A; 1HRM A; 1Y8K A; 4H0B A; 1YEO A; 1BBB A; 1V75 B; 3HXN B; 4XDI A; 2MBW A; 1CIK A; 3GOU B; 1CLS A; 1J3Y B; 1HBA A; 2D2N C; 1IWH B; 1DKE A; 1MBI A; 1VXF A; 2Z6N B; 5ILP A; 1YGD B; 2V1F A; 1C40 B; 4VHB A; 1Y85 A; 2H8F A; 3GDJ B; 4F6F A; 1Y7D B; 3OZU A; 1FN3 B; 3LR9 A; 2ZT3 A; 2O5S X; 1GDI A; 2ZWJ A; 3ZJN A; 3NMM B; 3UHX A; 2DN3 A; 2EB9 A; 3DHT B; 1A3N B; 2GRH A; 2RAO A; 1LJW A; 1ITH A; 4MQK A; 3VHB A; 1OBM A; 3BJ2 B; 1X46 A; 4NS2 A; 1HLM A; 1BUW A; 4NK2 A; 4N7N B; 1UVY A; 4QAU A; 1EBT A; 3E5I A; 1HBG A; 1Y4R A; 1HBI A; 4NK1 A; 1Y4G A; 1I3E A; 1A9W A; 3WCT D; 1C7C A; 2G0S A; 4HSW A; 3LQD A; 3WCV A; 1HAC A; 4JAC A; 3HF4 B; 4H07 A; 2B7H A; 1MWD A; 1VXG A; 3D7O A; 1HJT A; 1NQP A; 1MLO A; 1M6M A; 1HAB A; 1O1J A; 1SDK A; 3ZH0 A; 1YVQ A; 1Y4Q B; 5JDO F; 2NX0 A; 4BJA A; 3UHB A; 4F4O B; 1ECN A; 1Y0T A; 5ILM A; 2ZSQ A; 3A5A A; 1ABW B; 2ZS1 B; 2AUR A; 3UI0 A; 1LH1 A; 2MGD A; 3HYU B; 2O58 X; 1ABY B; 1LFT A; 2W72 A; 3GLN A; 1LA6 B; 1HBB B; 1V4W A; 3OJ1 A; 1C7B A; 5EUI A; 2HBD A; 1A0Z A; 1ABS A; 1HDB A; 3G52 A; 1G09 B; 1ECD A; 4MQH A; 1G9V B; 3LB4 A; 2BW9 M; 5M3S A; 1LFV A; 3WCV D; 3G4W A; 1MBN A; 4MQG A; 1Y8K B; 1BIJ A; 1YG5 B; 1UIW A; 1MNK A; 1BBB B; 1Y46 A; 2QSP B; 1OUU A; 3A5G A; 1BZP A; 4F6B A; 3WFW A; 1YHE A; 3ARK A; 1J7Y B; 5CNC A; 1CLS B; 1YMB A; 1YE0 A; 1FHJ A; 3AG0 A; 1A01 B; 2Z85 A; 1NWN A; 3S1I A; 1Y7C B; 1BAB B; 3HEN A; 2QLS B; 2H8F B; 1Y0W A; 4MQJ A; 4NZI A; 4AVE A; 3LB3 A; 1UVX A; 1DXU A; 1QI8 B; 2BMM A; 3MJP A; 1A4F A; 2DN3 B; 3UH3 A; 2ZLX A; 4C44 A; 1K0Y A; 1JP9 A; 2WY4 A; 1K1K A; 1LJW B; 1JZM A; 3GQG B; 4TWV A; 5IKS A; 3GQP A; 3GYS B; 1BZ6 A; 1Y0A A; 1HDA A; 1JF3 A; 2E2Y A; 3A0G A; 1VWT A; 1CQ2 A; 5AZR A; 2LH6 A; 4MPM A; 3ARL A; 3M3A A; 2W31 A; 3MN0 A; 4M4A A; 2AV0 A; 1Y4F A; 3PI9 B; 3QM9 A; 1NXF A; 1XY0 B; 1GZX A; 5C6E B; 1MLK A; 3MOU A; 1UX9 A; 1MNO A; 1CP5 A; 1XYE A; 4HHB B; 4H2L B; 1SPG B; 3GK9 A; 2MGJ A; 1VRE A; 2VLZ A; 1R1Y A; 3WCU B; 3ORD A; 3D7O B; 1R1X A; 1Y22 A; 1HAB B; 1J3Z B; 1RPS B; 3PI3 A; 2H8D A; 4MQC A; 1MOH A; 4DWU A; 1KFR A; 3ZOL A; 3ONZ B; 1IRC A; 1OUT A; 3D1A B; 2R4X A; 3UHS A; 3ODQ A; 3S48 C; 2ZS0 C; 3VRF A; 3UHY A; 1Y83 B; 1LFT B; 1CH2 A; 105M A; 1S5Y A; 2O5Q X; 2V1J A; 1S0H B; 2M6Z A; 1HBR A; 2ZSS A; 1CH5 A; 1QXE B; 1BZZ B; 3QJB A; 2QRW A; 1GBU B; 1YDZ B; 1O1N B; 3O7N A; 1HV4 B; 1Y01 B; 2ZFB A; 2FRF A; 1LFV B; 4MXL A; 3EU1 B; 4FC3 A; 1FSX A; 4HRR A; 1BIJ B; 3KUN A; 1HGC A; 2G0V A; 2ZSP A; 1FDH A; 4GZG A; 1Y8W B; 5CMV A; 3QQQ A; 3GKT A; 3E55 A; 2DXM B; 3HRW A; 2AUQ A; 1FHJ B; 1CH9 A; 3WCT C; 4ZVA A; 2W6Y A; 4L7Y A; 1NZ4 A; 3G4U A; 2EB8 A; 2H35 A; 1YCA A; 2QU0 A; 3CIU A; 2VHB A; 1DXU B; 1DO7 A; 1CH3 A; 3AQ5 A; 4KMV A; 1QSI B; 1HHO B; 3WHM A; 1CO8 A; 1MYJ A; 3M39 A; 3FH9 A; 5E29 B; 1GDJ A; 2OH9 A; 2DHB B; 3UHG A; 2GTL C; 5CHQ A; 1OFK A; 1MYH A; 2MHB A; 2ZLU A; 3QJC A; 2AUP A; 5CN5 A; 3W4U B; 3BJ1 A; 1MTJ A; 3OO4 B; 1WMU B; 3AQ9 A; 3O89 A; 1MOC A; 1IBE A; 1GCW B; 4ODC B; 1KD2 A; 1HLB A; 1OJ6 A; 3VRG A; 2O5O X; 1CG5 B; 1Y0A B; 3D17 B; 2NSR A; 4MQI B; 1HBH A; 1HGB A; 3E5O A; 3K8B A; 1NEJ B; 3S65 B; 1UT0 A; 2SPN A; 1WLA A; 1XZ7 A; 3OO5 B; 5HY8 A; 3OZV A; 3NL7 B; 5JDO C; 2FRJ X; 2ZLV A; 1CPW A; 1UFP A; 2D2N B; 1MWC A; 1JW8 A; 5CNB A; 2D5Z A; 4N7P B; 4WCH D; 2G10 A; 1VXE A; 1COH A; 3RJ6 A; 3AT5 B; 2SPO A; 2MGA A; 4NI0 B; 2W72 C; 2HHD A; 2G12 A; 2HZ3 A; 1X9F B; 3WTG B; 3TM9 A; 3R0G A; 1OUT B; 1JZK A; 1LFQ B; 4U8U B; 3LHB A; 1ASH A; 2AV3 A; 1TES A; 3NG6 A; 1H97 A; 5EV5 A; 3ZJM A; 3ODQ B; 2EKT A; 2ZT4 A; 5HLQ A; 1DXC A; 2ZSX A; 1HBR B; 1Y5K A; 4G51 B; 3R5I B; 2EVK A; 1Y4B A; 4MXK A; 1A00 B; 2MGF A; 1DLW A; 1Y5J A; 3PT8 A; 1YEQ A; 4UUR A; 2HBC B; 2ZSR A; 4XS0 A; 2D60 A; 3IC0 A; 4PQC A; 1FSX B; 5D5R A; 1O1K A; 112M A; 3SDN A; 2MYC A; 2NSS A; 1SHR B; 1Y31 A; 1Y09 A; 3BCQ A; 3UHE A; 1GLI B; 2D5X B; 1N9H A; 6HBW B; 1O1I A; 1DTM A; 1MKO A; 1CBM A; 1G0B B; 3HRW B; 2NRM A; 1MNI A; 2MGI A; 2G0X A; 2G0Z A; 2HZ2 A; 1CQX A; 4YU4 B; 2R4Y A; 2HBF B; 2HBG A; 1B86 B; 2GRF A; 3OVU C; 4NI1 A; 4O4T A; 5C6Y A; 1VXD A; 1LH3 A; 1G0A A; 1MLR A; 4N7O A; 1LH5 A; 4IT8 A; 2QFK A; 4IRO B; 1GDL A; 1A3O A; 1WVP A; 4JYQ A; 1UX8 A; 1DUO A; 3K9Z A; 1J52 A; 1YVT B; 1Y45 B; 2ZS0 A; 4UZV A; 5B84 A; 4PQ6 A; 1O1M A; 2FRI X; 1LFZ B; 5EYJ A; 3ECZ A; 3GQR A; 2EVP A; 1Y8H B; 1NS6 A; 3B75 A; 3VRG B; 3IC2 A; 2W6V B; 5CN7 A; 1XZ2 A; 3A2G A; 1GDK A; 3EDB A; 4G1B A; 4ILZ A; 3OZW A; 3PI8 B; 1YE2 A; 1YEN B; 1HGB B; 2ZFO C; 3WR1 B; 1JY7 A; 1XZ4 A; 1GBV A; 1QPW B; 1AJG A; 2HHB B; 1YIE A; 3AT6 A; 3PT7 A; 3WCT A; 3ECX A; 2D5Z B; 1DUK A; 1B0B A; 2AA1 A; 4KMW A; 1COH B; 1JPB A; 1O1L A; 2ZS0 D; 1S56 A; 3BJ3 A; 1AJH A; 1GVH A; 2C0K A; 3H58 A; 1OFJ A; 1AJ9 B; 1YOH A; 2PEG A; 4F6J A; 1XZV A; 1YGF B; 4HRT A; 1YZI B; 2DN2 B; 1LFY B; 3UHQ A; 1DLY A; 5JOM A; 1Y0D B; 2GTL A; 5F0B A; 1CMY A; 4ROM B; 1G08 A; 1A0U B; 4MBA A; 1Y2Z A; 1YH9 B; 3M38 A; 3DHR B; 3CY5 A; 1YEU B; 2GKM A; 1YEV A; 1DXT B; 3WCW B; 3DUT A; 1MLS A; 1MGN A; 1YIH B; 3AQ8 A; 3A59 B; 1NGK A; 4X0L A; 2D60 B; 1NIH B; 1XXT A; 2BLJ M; 3TLD A; 1LTW A; 3OK5 A; 3QM6 A; 5KDQ A; 4ESA B; 3UGZ A; 4M4B B; 108M A; 1MLL A; 1Y09 B; 5CN6 A; 2R4Z A; 1X3K A; 1MKO B; 2ZLW A; 1MZ0 A; 1CG8 B; 2HHE B; 1FAW A; 2O5M X; 2VLY A; 1RQ3 A; 4FWX A; 5ILR A; 3D1K B; 2GTL D; 4PNJ A; 1XQ5 B; 3P5Q B; 1BZR A; 1YHU B; 2LH7 A; 2MGC A; 1QXD B; 2BWH A; 4N7O B; 3GKV B; 1HDS A; 1A9W E; 5CNG A; 1A3O B; 1L2K A; 110M A; 5HBI A; 3BOM A; 1QSH A; 2OH8 A; 1O1M B; 1DWT A; 1RVW B; 4ROL A; 5CHR A; 1V4U A; 1YEO B; 2LH1 A; 1NS6 B; 1BJE A; 1EWA A; 1LFL A; 4O4Z A; 1GCV A; 5JDO D; 1RQA A; 2SPL A; 3S66 A; 1MYF A; 3LB2 A; 1NZ3 A; 4HSX A; 1HBA B; 2PGH A; 1BZ0 A; 1DKE B; 1V07 A; 3NFE A; 4C0N A; 2R80 A; 1JY7 B; 1XZ4 B; 1DXV A; 1YFF A; 2BKM A; 1MBC A; 1Y85 B; 1F65 A; 4DWT A; 1CP0 A; 1HGA A; 1S61 A; 2MGB A; 1IOP A; 1MLG A; 1LHT A; 3G4R A; 1O1L B; 2VEB A; 3VRE A; 1GJN A; 2RAO B; 1M9P A; 4MQK B; 2QSS A; 2PEG B; 3UHR A; 2V1I A; 1BZ1 A; 2EKU A; 1VXC A; 4WJG A; 1RTX A; 1NS9 A; 1BUW B; 1IRD A; 1UC3 A; 2GNV A; 1Y7Z A; 3QJE A; 1YHR A; 4OF9 A; 5CNE A; 1Y7G A; 2MGG A; 1Y4R B; 3DUT B; 1T1N A; 1Y4G B; 2GNW A; 3UBC A; 1SI4 A; 3PIA A; 3ZHW A; 1HCO A; 3RJN B; 1C7C B; 1XXT B; 2ZFO A; 3LQD B; 3WCV B; 1HAC B; 2B7H B; 5CND A; 1BVC A; 2ZT0 A; 2W6X A; 4N8T A; 1NQP B; 1O1J B; 1SDK B; 3QMA A; 1MLJ A; 1YVQ B; 3KMF C; 1J40 A; 4G1V A; 5E83 A; 1JP6 A; 2GRZ A; 2ZLW B; 3ARJ A; 4WJG 1; 3LB1 A; 1Y0T B; 1AZI A; 1IT3 A; 1Y5F A; 2O5B X; 2QMB A; 3KUO A; 3M3B A; 2W6W A; 3ZJI A; 2MB5 A; 2W72 B; 3EOK A; 5MBN A; 3MJU A; 3ZJJ A; 4FWZ A; 1V4W B; 1HDS B; 1IT2 A; 3A9M A; 1LH2 A; 1C7B B; 5EUI B; 2HBD B; 1XZU A; 1ECA A; 1A0Z B; 1HDB B; 2CMM A; 1V4X A; 1QSH B; 2HBS A; 4MQH B; 2ZFO D; 1NPF A; 1Y4P A; 4MQG B; 1LH7 A; 2WTG A; 1UIW B; 4YU3 A; 1Y46 B; 1CO9 A; 1MBS A; 1OUU B; 1URV A; 2BLI A; 1PBX A; 1THB A; 1YHE B; 1YE0 B; 1YOG A; 3PI1 A; 2PGH B; 1J7S A; 3MKB A; 2RI4 A; 1XCH A; 1OR6 A; 3FS4 A; 2BK9 A; 2V1K A; 5AB8 A; 4DC8 A; 1Y8I A; 3D4X A; 1J7W A; 1Y0W B; 4MQJ B; 1J41 A; 4OOD A; 3WCP A; 3PEL A; 1HGA B; 1RQ4 A; 4ZVB A; 2D2M D; 2HCO A; 3MJP B; 1A4F B; 2ZLX B; 1DXD A; 2EF2 A; 1K0Y B; 2ZT2 A; 1U7R A; 5HU6 A; 1CH4 A; 1K1K B; 1Y35 A; 3GQP B; 2VLX A; 1BZ1 B; 104M A; 3QJD A; 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2ZLU B; 3QJC B; 3ED9 A; 2V1G A; 1LA6 A; 3BJ1 B; 1HBB A; 2VYZ A; 1IBE B; 2Z8A A; 1Y35 B; 2GLN A; 5B85 A; 2XKG A; 3WI8 A; 1KD2 B; 2FAL A; 1FSL A; 3PI2 A; 2ZSZ A; 3ZJP A; 1C7D A; 3DR9 A; 1SDL B; 1G09 A; 1G9V A; 1HBH B; 109M A; 3K8B B; 1YG5 A; 3IXF A; 3NML A; 1JWN A; 2QSP A; 2NRL A; 3WFU A; 1XZ7 B; 5HY8 B; 1SWM A; 3MYM A; 1J7Y A; 2ZLV B; 3ZJH A; 1MLN A; 1A01 A; 1MLU A; 5ILE A; 1XZ5 B; 2ZS1 D; 1Y7C A; 1BAB A; 111M A; 2AUO A; 5D1V A; 2JHO A; 1KR7 A; 4HBI A; 2QLS A; 4O2G A; 1YHU D; 1MLF A; 1RTE A; 5CNF A; 1VXH A; 2HHD B; 2ZSY A; 1JL7 A; 1X9F C; 1S5X A; 1QI8 A; 4U8U C; 2D2M C; 3NG6 B; 1Y0C A; 1MYZ A; 5E6E B; 1FDH G; 2MGL A; 3HHB A; 4MU5 A; 2VM0 A; 3GQG A; 1Y5K B; 3GYS A; 1Y4B B; 2LH3 A; 5EE4 C; 1Y5J B; 1Y4V A; 3PT8 B; 1YEQ B; 4XS0 B; 4FH6 A; 3IC0 B; 5HLX A; 1N9F A; 2YRS B; 1O1K B; 3PI9 A; 1UMO A; 3SDH A; 3ZJS A; 7HBI A; 1XY0 A; 3BCQ B; 1Y31 B; 3WFX A; 3ZJR A; 5C6E A; 1I3D A; 1O1I B; 3VAU A; 2FRK X; 5JGG A; 1W92 A; 4HHB A; 4H2L A; 1SPG A; 1JEB A; 3WCU A; 2VYY A; 3HC9 A; 3PI4 A; 2IG3 A; 4NI1 B; 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