The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
52
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sequence length |
141
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structure length |
141
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Chain Sequence |
VLSPADKTNVKAAWGKVGAHAGEYGAEALERMFLSFPTTKTYFPHFDLSHGSAQVKGHGKKVADALTNAVAHVDDMPNALSALSDLHAHKLRVDPVNFKLLSHCLLVTLAAHLPAEFTPAVHASLDKFLASVSTVLTSKYR
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Structures of human oxy- and deoxyhaemoglobin at different levels of humidity: variability in the T state.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Hemoglobin alpha chain
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| molecule tags |
Oxygen storage/transport
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| total genus |
52
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| structure length |
141
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| sequence length |
141
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2002-04-12 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1YOG A; 1CIK A; 2HZ1 A; 1MLJ A; 3NG6 B; 1DLY A; 2H8D A; 4NI0 B; 2SPN A; 1YDZ A; 1IWH A; 2G0S A; 1FLP A; 1Y8W A; 3NMM A; 1MTI A; 2ZFB A; 3K3U A; 3CY5 B; 1MOH A; 1O1N A; 1G9V B; 1SI4 A; 5D1V A; 1NPF A; 3AQ8 A; 2VEE A; 1EWA A; 2G14 A; 2HHB B; 3BJ2 A; 4X0L B; 1YMC A; 5HAV A; 3D4X B; 1YZI A; 1ECN A; 2ZT3 A; 4B4Y A; 5EU2 A; 2G10 A; 1LH1 A; 3AQ6 A; 5KDQ B; 4L7Y A; 1MLU A; 1O1L A; 1CBL A; 1R1Y A; 2H8D B; 4MQI B; 5CN7 A; 1YDZ B; 2MGC A; 2R4X A; 3NL7 A; 3VRG A; 2MGH A; 3A5A A; 3H58 A; 2D5Z A; 1SI4 B; 2MGF A; 1QI8 A; 5ILP A; 2ZWJ A; 2O5B X; 3BJ2 B; 3LR9 A; 5JDO E; 1A6K A; 1YZI B; 1CP0 A; 2MGK A; 3PI3 A; 4L7Y B; 1HBR B; 1O1L B; 5ILE A; 4ESA A; 1VHB A; 1Y0C A; 3QJC A; 1XXT B; 5EUI A; 3VRG B; 1YCA A; 3IXF A; 1UX8 A; 1V75 B; 1K1K B; 1VXD A; 4HSX A; 5JDO F; 2O58 X; 1AJH A; 1MWB A; 3MBA A; 1Y8K A; 2ZT4 A; 2GKM A; 1YOI A; 3DHR A; 1J7S B; 1XZV A; 3UHV A; 3ZJS A; 2HBS A; 2KSC A; 2ZSR A; 4F6G A; 4ESA B; 1JL7 A; 1HAC B; 3QJC B; 1YE2 A; 5EUI B; 1HAB A; 1Y01 B; 105M A; 1BJE A; 1MOA A; 3V2V A; 5CNG A; 1Y8I A; 3PT7 A; 1HGB A; 1DLW A; 3AT6 A; 1HDS B; 2V1E A; 4MQH A; 1IOP A; 2HBG A; 1LUE A; 1HBB A; 4NK2 A; 2AV3 A; 3DHR B; 1XZV B; 2VLY A; 2HBE A; 5JGG A; 1NZ2 A; 4FC3 A; 1OFK A; 1FDH A; 2G11 A; 1MLK A; 3ZOM A; 1A00 A; 1YE2 B; 1JY7 B; 2FRK X; 1VWT A; 1DO1 A; 4MBA A; 1EBC A; 1MYM A; 3WCW D; 3QM9 A; 1Y8I B; 1S0H A; 3GKT A; 3D1K A; 3PT7 B; 1HGB B; 1YVQ B; 2Z6T A; 3KUN A; 1I3D A; 1OUT A; 1VXB A; 1LFZ A; 3UHU A; 2ZLU A; 4N8T A; 4UZV A; 3AT5 A; 5JGG B; 3UHD A; 4VHB A; 1Y8H B; 4FC3 B; 1LH3 A; 2HHE A; 2HBC A; 1A3N A; 1JP9 A; 5CNC A; 1VWT B; 3B75 B; 3R0G A; 1YIH A; 4G1B A; 1MLN A; 3D1K B; 3KUO A; 2FAM A; 2OIF A; 1Y4R A; 1XZ5 B; 4UUR A; 109M A; 1DO4 A; 2NSR A; 3ASE A; 1MLF A; 2DHB A; 1LFZ B; 2ZS0 B; 2ZLU B; 4N8T B; 2D2M D; 5EET A; 1Y5K A; 3AT5 B; 1A6G A; 1YGF A; 2V1F A; 2HHE B; 102M A; 1COH B; 2ZFO D; 1SPE A; 1A3N B; 5JDO D; 2QMB B; 3UHY A; 2VEB A; 3EU1 B; 2ZS0 C; 4HBI A; 3S65 B; 1YIH B; 3E4N A; 5JOM A; 1FDH G; 1TU9 A; 1CP5 A; 3G52 A; 1BZ1 B; 1KD2 B; 2DHB B; 1SHR B; 3QMA A; 1HBH A; 1JL6 A; 5C6E A; 2H35 A; 3OK5 A; 1MBO A; 2XKI A; 1Y46 B; 1YGF B; 2ZST A; 2IG3 A; 1HBS A; 4IRO A; 1C7D A; 5CND A; 1UX9 A; 2W6W A; 4YU3 A; 1YVT B; 3ECL A; 2GKN A; 5MBA A; 1XZ7 A; 3QZX A; 1Y83 A; 1F63 A; 3QM7 A; 3PT8 A; 5E6E B; 2OHA A; 3WFT A; 1S5Y B; 1XZ2 A; 3HYU B; 3UHT A; 1HBH B; 2DN2 B; 2H35 B; 4NI1 A; 1Y45 A; 1Y2Z B; 3WFU A; 2RI4 B; 2V1J A; 1G08 B; 4PQ6 A; 4O1T A; 5MBN A; 4IRO B; 1Q1F A; 2R80 B; 1W92 A; 1YEV A; 4YU4 B; 4ODC A; 1XZ7 B; 2HZ2 A; 1Y83 B; 2QU0 A; 1A6N A; 1DWS A; 3PT8 B; 4MQJ A; 4MAX A; 107M A; 4QAU A; 1XZ2 B; 1RPS A; 1FN3 B; 5B85 A; 2O5S X; 3HEP A; 3WCW A; 1DKE B; 4NI1 B; 1Y45 B; 103M A; 4KN3 A; 1EMY A; 2ZLT B; 4F6F A; 2GRH A; 1YHR A; 1QPW A; 4H0B A; 2MBW A; 1S56 A; 1L2K A; 2D2N D; 6HBI A; 1MLM A; 1NXF A; 2EKT A; 2QU0 B; 3S1J A; 1YE0 B; 2LH2 A; 1A3O B; 5CHQ A; 1THB B; 3UHI A; 1CMY A; 2D60 A; 3CIU A; 3IC0 A; 4MXL A; 3QJE A; 1V9Q A; 1CG8 A; 1GLI A; 3ECZ A; 1HGA A; 2HBD A; 1YHR B; 1QPW B; 2EB9 A; 2W6V A; 1GCV A; 3MN0 A; 1CO9 A; 2ZSS A; 1NZ5 A; 2NSS A; 2D2M A; 5CN8 A; 1LFL A; 3BCQ A; 1HDA A; 1J7W A; 3OO4 A; 3E55 A; 3UHX A; 2M6Z B; 1UT0 A; 1HDB A; 3OZV A; 5KKK A; 1M9P B; 1CMY B; 3FH9 A; 3CIU B; 2WTH A; 1ABY A; 3H57 A; 5EQM A; 4B3W A; 3QJE B; 1HBG A; 5F0B A; 2MB5 A; 1CG8 B; 1DWR A; 1GLI B; 1HGA B; 1GCW A; 2HBD B; 4G1V A; 2W6V B; 4OF9 A; 1G0A B; 2C0K A; 3PI9 B; 2HCO A; 1VXG A; 1LFL B; 3BCQ B; 1J7W B; 1NS9 A; 4HRT A; 2VHB A; 1N9H A; 5AB8 A; 1HDB B; 2R4W A; 1MLO A; 1YEQ A; 1HBI A; 4MXK A; 2GNW A; 1PBX A; 2XKH A; 4O4Z A; 1ITH A; 3AQ5 A; 1O1J A; 1MNH A; 3LHB A; 5HLQ A; 3RJN B; 1YEU B; 4F6D A; 1BVC A; 1O16 A; 3DHT A; 1NIH A; 2O5T X; 1Y31 B; 2MGM A; 3QJD B; 3WCU B; 1EW6 A; 1HGC B; 1UMO A; 3HHB A; 2MYE A; 2HCO B; 2G0Z A; 3BA2 A; 3EDB A; 1XZU A; 1NS9 B; 3LB3 A; 4N7O B; 1J41 A; 4M4A B; 2ZS1 D; 4MQK A; 1YEQ B; 2LH1 A; 3G4Q A; 4DWU A; 3HEO A; 1O1J B; 1DXU B; 3HXN A; 1NIH B; 1CLS A; 2EF2 A; 1NWI A; 4NZI A; 3OZU A; 108M A; 1BZ6 A; 3HHB B; 3GQR A; 2VLX A; 1K0Y A; 1A0U A; 2ZLX A; 3GYS A; 1S61 A; 1MKO B; 3AQ7 A; 1CH9 A; 1J41 B; 1HLB A; 1RTX A; 3ZJN A; 3UHN A; 2D2N A; 4UIQ A; 1LH6 A; 1MBI A; 3A0G A; 3ZJI A; 1KFR A; 1XZ4 B; 3HXN B; 1G0B B; 3D1A A; 2QSP B; 3ODQ A; 5SW7 A; 3MJP A; 1X9F D; 1Y4G B; 5CMV A; 1HRM A; 2OLP A; 3GQP B; 4NS2 A; 2GL3 A; 5KER B; 1ECA A; 1LHT A; 1YG5 A; 3WHM B; 1Y5F A; 1MZ0 A; 1VXE A; 2Z6N B; 3GKV B; 3E5I A; 4U8U B; 1A9W E; 1X3K A; 1OUU A; 3ARK A; 1DO7 A; 3ODQ B; 1Y4V A; 2EKU A; 3MJP B; 4G51 A; 1BZ0 A; 3UHH A; 1YEN A; 5E83 A; 1IWH B; 2MGE A; 1O1K A; 1Y8W B; 1CQX A; 3NMM B; 2ZFB B; 4U8U C; 1O1N B; 1XYE A; 1MDN A; 3G46 A; 3UH3 A; 1CG5 A; 1YG5 B; 5CHR A; 1YHU D; 1VXA A; 3M3B A; 4HRR A; 2OH9 A; 2D5X A; 3UHE A; 1A01 A; 1HHO A; 1F65 A; 1JPB A; 3ZH0 A; 3HC9 A; 1BZZ A; 2E2Y A; 3S1I A; 4MPM A; 1R1Y B; 1YOH A; 4G51 B; 1YEN B; 1ECO A; 1YEO A; 5E83 B; 5HU6 A; 3UHS A; 1O1K B; 3NL7 B; 1F5P A; 1Y4Q A; 1Y09 A; 1XYE B; 5F2A A; 3PI8 A; 1DXV A; 4M4B A; 2D5Z B; 2PEG A; 1CG5 B; 1QI8 B; 3K8B A; 1N9X A; 4NK1 A; 5HLU A; 2D5X B; 3ED9 A; 1RQA A; 1RVW A; 5EE4 D; 1A01 B; 1YMB A; 2ZS1 A; 1DXT A; 1MGN A; 4ZVA A; 3ZHW A; 1BZZ B; 2LH3 A; 1SDL A; 1NS6 A; 1MCY A; 1V4W A; 3ARJ A; 5HU6 B; 1Y0C B; 3UI0 A; 1LFQ A; 1Y4Q B; 1Y09 B; 3TM3 A; 1LH2 A; 1DXV B; 4M4B B; 2PEG B; 1Y22 A; 2ZSO A; 1J7Y A; 4GZG A; 2DN1 A; 3MVC A; 1RQA B; 1Y8K B; 1NZ4 A; 2ZS1 B; 4MU5 A; 3D7O A; 2MGJ A; 2HBS B; 2BLH A; 1UVX A; 1DTM A; 3MYN A; 1MBA A; 1MLL A; 5HBI A; 1C40 A; 1G09 A; 1MLS A; 3AQ9 A; 1HAB B; 2VYY A; 3W4U A; 1Y4B A; 2ZS1 C; 2G0V A; 1YMA A; 1X9F A; 2ZLV A; 1RQ4 A; 2YRS A; 2R4Y A; 3AT6 B; 1J7Y B; 4MQH B; 2H8F A; 1M6C A; 3MOU A; 5EYS A; 3IC2 A; 1HBB B; 1YHE A; 3MJU A; 2Z85 A; 1HBA A; 2HBE B; 2VM0 A; 1MOB A; 1T1N A; 1AZI A; 1V4U A; 1MYT A; 5CNE A; 2MGI A; 3M38 A; 1G09 B; 1A00 B; 2AUP A; 3W4U B; 2BKM A; 1S0H B; 1JZL A; 2ZLV B; 2V1G A; 1RQ4 B; 4LPI A; 1VRF A; 2HBF A; 2YRS B; 1AJG A; 1Y7C A; 110M A; 3QJB A; 1OUT B; 1MBS A; 1MNI A; 5CN6 A; 2OH8 A; 3IC2 B; 4O4T A; 3U3E A; 1HBA B; 1RSE A; 1BIN A; 1YGD A; 1H97 A; 3G4W A; 4NXA A; 3SZK A; 2V1H A; 1YHU A; 3PEL A; 1V4U B; 5CNB A; 3WR1 A; 2HBC B; 1MYH A; 3ZJH A; 2MGL A; 1IRD A; 1Y4R B; 2XYK A; 1Y7C B; 2NRM A; 4DC7 A; 3S48 C; 2QFN A; 2SPO A; 3NFE A; 1GDJ A; 3QM5 A; 1YGD B; 1Y5K B; 1S5X A; 4ILZ A; 1JEB A; 1YCB A; 3PEL B; 1UIW A; 101M A; 1DM1 A; 2ZSZ A; 3M39 A; 3WFX A; 1C7C A; 4TWV A; 4MBN A; 1Y85 A; 3HEN A; 2MYC A; 1BIJ A; 1GZX A; 5D5R A; 2JHO A; 4C0N A; 3G4V A; 3IA3 B; 1ECD A; 5AZR A; 4PQC A; 3NFE B; 2VRY A; 5HLX A; 1MLR A; 5C6E B; 3G53 A; 3UHR A; 2G0R A; 1QXE A; 3G4U A; 1UIW B; 4F69 A; 1V07 A; 1BAB A; 1HBS B; 1A6M A; 1C7D B; 3M3A A; 1WLA A; 2FRI X; 4YU3 B; 1C7C B; 1UFP A; 1QSH A; 4XDI A; 3OJ1 A; 4JYQ A; 1BIJ B; 1GZX B; 1FHJ A; 1V5H A; 2ZSN A; 2QSS A; 2EB8 A; 3V2Z A; 2GTL D; 4IT8 A; 3UH7 A; 1FSL A; 1QXE B; 1MYZ A; 4TYX A; 1J52 A; 3OO5 A; 1BAB B; 1AJ9 A; 2QRW A; 2IN4 A; 4N7P A; 1YEV B; 2V1K A; 2VYZ A; 3MKB A; 4ODC B; 1HLM A; 1ABW A; 2W31 A; 3A59 A; 4MQJ B; 3WTG A; 2QSS B; 1OR6 A; 4F6B A; 1O1O A; 1RPS B; 3UH6 A; 4ROM A; 4HSW A; 4H07 A; 1FAW A; 2ZSX A; 3WCW B; 1O1M A; 1A9W A; 5EOH A; 1UFJ A; 1J3F A; 1S69 A; 2ZSP A; 1O1P A; 3OO5 B; 2W6Y A; 4XS0 A; 3UHK A; 3ZJO A; 1MTK A; 3QM8 A; 2LH7 A; 1Y7Z A; 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1NQP B; 5KDQ A; 2G3H A; 1JZM A; 1NGK A; 2D2N B; 4BJA A; 2GTL C; 1A0Z B; 3EOK B; 1EBT A; 4MQI A; 1DTI A; 3A0G B; 1MYI A; 2AV0 A; 3O89 A; 3QQQ A; 3D1A B; 3GOU A; 2ZS0 D; 1LA6 B; 3TLD A; 5SW7 B; 4HHB B; 1BZR A; 4MQG A; 2D2N C; 2V1I A; 3VRF A; 3RGK A; 2AUR A; 4PQB A; 3GK9 A; 2ZT2 A; 3UGZ A; 1BUW A; 4AVE A; 1HBR A; 1Y5F B; 1XY0 A; 4ZVB A; 3UHG A; 3DR9 A; 1CH1 A; 3GLN A; 2BW9 M; 1CPW A; 1XXT A; 4KJT A; 3GOU B; 1VRE A; 1OUU B; 1V75 A; 1K1K A; 1Y4V B; 1GBV A; 2MGG A; 3O7N A; 2G0X A; 4MQG B; 5C6Y A; 1BZ0 B; 3VRF B; 1NWN A; 1JWN A; 1S6A A; 1BUW B; 1B0B A; 2GLN A; 1J7S A; 1IT3 A; 1VXH A; 1XY0 B; 1MLH A; 4HRR B; 1SWM A; 1HAC A; 1HHO B; 3R5I A; 1Y4F A; 5B84 A; 1GBV B; 1CH7 A; 4NXC A; 1MLG A; 1GVH A; 2Z6S A; 4WJG A; 1YEO B; 4PNJ A; 1HDS A; 1NEJ A; 3LR7 A; 1H1X A; 4TWU A; 3PI8 B; 3ZOL A; 1DO3 A; 3QQR A; 3K8B B; 2QFK A; 1CH4 A; 1RVW B; 3SDH A; 2MYD A; 1DXT B; 3R5I B; 1JY7 A; 3GQG A; 3S66 A; 2NRL A; 1OBM A; 2AA1 A; 1Y4F B; 3BJ1 A; 1JF3 A; 1Y0W A; 1SDL B; 1NS6 B; 3ECX A; 1V4W B; 1YVQ A; 5AZQ A; 1XQ5 A; 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