The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
48
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sequence length |
146
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structure length |
146
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Chain Sequence |
VHLTPEEKSAVTALWGKVNVDEVGGEALGRLLVVYPWTQRFFESFGDLSTPDAVMGNPKVKAHGKKVLGAFSDGLAHLDNLKGTFATLSELHCDKLHVDPENFRLLGNVLVCVLAHHFGKEFTPPVQAAYQKVVAGVANALAHKYH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Structures of human oxy- and deoxyhaemoglobin at different levels of humidity: variability in the T state.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Hemoglobin alpha chain
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| molecule tags |
Oxygen storage/transport
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| total genus |
48
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| structure length |
146
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| sequence length |
146
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2002-04-12 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| B | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2G0Z A; 3WCU C; 2QSP B; 2OH8 A; 1DXV A; 1DWT A; 2ZSY A; 1UIW A; 1SDL A; 1XY0 B; 2XKH A; 3WCU B; 4N7P A; 1HCO B; 1SDK A; 2OHA A; 3B75 A; 3RJ6 A; 2DN1 A; 1UX8 A; 3IA3 B; 4N7P B; 2WTH A; 1SDK B; 1HRM A; 1RQ4 A; 1GCW A; 3D1A A; 3MJP B; 2PEG A; 2FRJ X; 1GDK A; 2LH6 A; 1YEN A; 4F6D A; 2MGI A; 1Y4F A; 1LH6 A; 2PEG B; 1BIJ A; 3GDJ B; 3PT8 A; 3G4V A; 1YEN B; 1J7W A; 1ABS A; 2FAL A; 1Y4F B; 3A2G A; 2AUR A; 1SPE A; 3PT8 B; 1LFT A; 3QJE B; 3UGZ A; 4F6J A; 3FH9 B; 1D8U A; 1DKE A; 3E55 A; 3AT6 A; 2ZS0 C; 1GBV B; 3WTG A; 2DHB A; 1QXD A; 1LFT B; 2W72 B; 1Y5K A; 3ZJQ A; 1IDR A; 1MYG A; 4F6I A; 4XS0 A; 1DKE B; 3AT6 B; 3ZHW A; 1FN3 A; 2DHB B; 2ZS0 B; 3IC0 B; 3OGB A; 1QXD B; 1Y5K B; 3UH6 A; 4DC8 A; 4ODC A; 1DXU A; 1J3F A; 1OUT A; 1FN3 B; 3V2Z A; 1DUK A; 1OR4 A; 1YEQ A; 2VYW A; 1Y7G B; 2HBS B; 4HSX A; 1L2K A; 1M6M A; 1DXU B; 3VHB A; 4TWU A; 1YEQ B; 1G09 A; 1MNO A; 4WCH D; 1HV4 B; 4IT8 A; 1CMY A; 5M3S A; 1Y4P A; 3QJD A; 5EU2 A; 1G09 B; 1JWN A; 4O35 A; 1Y31 B; 1CMY B; 3QJD B; 1HBA A; 3WCT D; 2LHB A; 1JEB A; 1UVY A; 1J3Y A; 2GTL B; 1JF4 A; 3ZJJ A; 3AT5 A; 2Z6T A; 1A0Z A; 3HC9 A; 5ILE A; 1HBA B; 4DWT A; 3A5A A; 1YZI A; 1HAB A; 3ZJP A; 1XQ5 B; 3QM5 A; 3PT7 A; 1JEB B; 5EQM A; 1YCA A; 4GZG A; 1V07 A; 3AT5 B; 4MU5 A; 1A0Z B; 1EWA A; 1MNK A; 1YIE A; 2D2M C; 1YZI B; 2QMB B; 1HAB B; 3PT7 B; 1VRE A; 1WLA A; 1YIE B; 4ROL B; 1YEV A; 3ZOM A; 2NSS A; 1HDS B; 1FDH G; 2ZLU A; 3RGK A; 3S66 A; 1VXC A; 1PBX A; 1U7S A; 4MQC A; 1CG5 B; 2ZLU B; 1RQA A; 3S66 B; 5MBN A; 2ZSN A; 1XZU A; 4JYQ A; 3DR9 A; 1BVD A; 3QM9 A; 3AQ7 A; 2FRK X; 1RQA B; 3ONZ A; 1XZU B; 3UBC A; 4FWZ A; 1DTI A; 3IC2 A; 2D60 A; 1J7Y A; 1NWN A; 1Y22 A; 1YOH A; 2R4W A; 1COH B; 2MHB B; 2VM0 A; 3IC2 B; 5CN4 A; 3ZJR A; 1Q1F A; 109M A; 2R1H A; 1O1I A; 1YEU A; 4FC3 B; 2G11 A; 1NS6 A; 1PMB A; 2H8D B; 1ABW A; 1O1I B; 3EDB A; 2GNV A; 1YFF A; 1YEU B; 3UHK A; 1NS6 B; 1Y45 B; 6HBI A; 3HYU A; 1YMA A; 2LH7 A; 1OFK A; 1RTX A; 4N8T A; 3WCW C; 1LTW A; 2RAO B; 1K1K A; 4OF9 A; 1O1M A; 1CH9 A; 5EYS A; 1JL7 A; 1G0A B; 5ILM A; 107M A; 2W6V A; 1K1K B; 1O1M B; 3R5I A; 1YHR A; 1JPB A; 2GRH A; 4ILZ A; 5HU6 A; 6HBW A; 1F5O A; 2VYY A; 2M6Z A; 1YHR B; 1IRD A; 1O16 A; 1XYE A; 3LB2 A; 5JDO C; 1CP5 A; 3K8B A; 1LFY A; 2GRF A; 3QJC B; 1LHS A; 2M6Z B; 1MTK A; 3AQ9 A; 105M A; 1IRD B; 1XYE B; 3D4X A; 3K8B B; 4FH6 A; 1X9F A; 2BW9 M; 1YVT B; 3UHQ A; 2FAM A; 1BVC A; 2OLP A; 3D4X B; 1HLM A; 2OIF A; 2V1E A; 1MTI A; 2GLN A; 2ZFB A; 1X9F B; 4HSW A; 1F63 A; 1NS9 A; 3DUT A; 5CN7 A; 2ZFB B; 1MYZ A; 1UFJ A; 1Y09 B; 3UHH A; 1NS9 B; 3DUT B; 1Y01 B; 3MOU A; 4M4B A; 3OO4 B; 1LJW B; 1O1N B; 3ODQ A; 3ZJL A; 1YHU A; 2ZSZ A; 1Y46 A; 2G10 A; 2D2N C; 2ZFO A; 3M38 A; 1ECA A; 1LFQ B; 1C40 A; 1YE0 B; 1HHO A; 1QXE B; 3QQR A; 3WFX A; 1OJ6 A; 1YHU B; 1Y46 B; 4ESA A; 2ZFO B; 1DO1 A; 1HAC B; 3WR1 A; 1YVQ B; 1MNI A; 1EMY A; 2BLJ M; 3KUO A; 3G53 A; 1JY7 B; 2G0S A; 5KER B; 2ZLT A; 3PI8 A; 1MNH A; 2DN3 B; 1LH2 A; 3MYN A; 4MQI A; 1Y0T A; 3LQD A; 2ZLT B; 1YGF A; 3PI8 B; 3QZZ A; 2HBF A; 1EBC A; 103M A; 4MQI B; 1Y0T B; 1F65 A; 1Y4Q B; 5AZQ A; 2ZS1 C; 3EOK A; 3LQD B; 1YGF B; 1Y4V A; 1FHJ B; 2HBF B; 1R1X A; 2MGG A; 3EOK B; 1M9P A; 1LFL A; 1MTJ A; 1Y4V B; 2SPO A; 2W6X A; 1CH3 A; 1M9P B; 1HGB A; 3OO5 B; 3GQG B; 1JL6 A; 4N7N B; 1FDH A; 3ECL A; 1HGB B; 2R4Y A; 1MOA A; 3WCU D; 1HBR B; 1XCH A; 5HLX A; 1YEO A; 4YU3 A; 2HZ2 A; 2SPM A; 5EET A; 1AJG A; 1DXD A; 1HBS A; 4MAX A; 3QM8 A; 3UI0 A; 1J3Z A; 1QI8 A; 1YEO B; 4O4T A; 1Y0W A; 1WMU B; 1YG5 A; 1HBS B; 4UUR A; 1VWT A; 2NRL A; 3D17 A; 3GQP B; 1Y7Z A; 2WTG A; 1JZM A; 1IBE B; 1UMO A; 1NPF A; 1QI8 B; 4TYX A; 5B84 A; 2PGH A; 1Y0W B; 1YG5 B; 1VWT B; 2DXM A; 3D17 B; 5CMV A; 3UHZ A; 2ZT2 A; 1JDO A; 5ILP A; 3NL7 A; 2PGH B; 1K0Y A; 4L7Y A; 3UHE A; 3ZJS A; 1A3O B; 1HDB A; 2NX0 A; 3ZOL A; 1LH7 A; 3NL7 B; 1Y0A A; 3WCV C; 3HXN B; 106M A; 3A59 A; 1K0Y B; 1O1O B; 2GKM A; 3UH5 A; 5D5R A; 4G51 B; 1C7C A; 3PIA A; 1DWR A; 2BWH A; 1QPW A; 1OUU A; 1MCY A; 1A6K A; 2ZS0 D; 3PIA B; 3G4Y A; 3VRF A; 1MLQ A; 2BKM A; 1XZ7 B; 1V4U A; 1NPG A; 1S56 A; 4NXC A; 1Y2Z A; 4MBA A; 1Y8H A; 1FSX B; 2ZT0 A; 3G4W A; 1G08 B; 2NRM A; 4G1V A; 1Y2Z B; 1YOI A; 2HHD A; 2WY4 A; 3VRG A; 1EBT A; 4SDH A; 1H97 A; 3CY5 A; 1GCV B; 1AJH A; 5E29 A; 1JW8 A; 4HHB A; 3M39 A; 1ITH A; 1Y5J B; 108M A; 1MWC A; 4PQ6 A; 1Y7C A; 2GTL D; 1SPG A; 5E29 B; 102M A; 1Y83 B; 3UHB A; 3SDH A; 2YRS B; 1V9Q A; 1V4X A; 1IWH A; 1MBS A; 3M3B A; 2VYZ A; 3AQ8 A; 3LB1 A; 1XY0 A; 4MQK A; 1A4F B; 3ARK A; 3WCU A; 2H8F A; 2R4Z A; 1HCO A; 1MLL A; 1VRF A; 1VHB A; 2RI4 A; 1MLJ A; 1Z8U B; 2QLS B; 4MQK B; 2H8F B; 1MWD A; 2RI4 B; 2W6W A; 5CHR A; 1JZL A; 3MJP A; 1CBL A; 3CIU A; 5EOH A; 2LH2 A; 1AJ9 A; 1LA6 A; 2O58 X; 3KUN A; 2HHB B; 3GDJ A; 5EYJ A; 3CIU B; 3OK5 A; 3H58 A; 1AJ9 B; 1SHR B; 3A0G A; 4NI1 A; 1LA6 B; 3HF4 A; 1DXC A; 2GNW A; 2AUO A; 4H07 A; 1KFR A; 3WHM A; 2MGE A; 3QJE A; 5KDQ A; 3NG6 A; 4F4O B; 3A0G B; 3RJN B; 3FH9 A; 4NI1 B; 1RSE A; 3HF4 B; 1GBV A; 4C0N A; 2D5Z A; 1X3K A; 3WHM B; 1KD2 B; 1MZ0 A; 2W72 A; 5KDQ B; 3V2V A; 3NG6 B; 4G1B A; 3DHT A; 1ABY B; 2MGH A; 2D5Z B; 1MBO A; 2ZS0 A; 1VXG A; 3IC0 A; 1Y85 B; 1HGC A; 3DHT B; 1Y7D A; 1DTM A; 2O5M X; 2HBG A; 3GK9 A; 3BJ2 A; 1Y7G A; 2HBS A; 1HGC B; 2V1I A; 1Y7D B; 5CNE A; 104M A; 2GL3 A; 1NZ3 A; 4FH7 A; 3S48 C; 3BJ2 B; 1HV4 A; 1A00 B; 3WCW D; 1S69 A; 1NGK A; 2QFK A; 3WFW A; 2GDM A; 1Y31 A; 3OZW A; 4HRR A; 1VXF A; 1JF3 A; 1LFV B; 1DO3 A; 4U8U C; 1CP0 A; 2GTL A; 4HRR B; 5JDO F; 3GKV B; 1JP9 A; 1XQ5 A; 3MJU B; 3KMF C; 3GQR B; 2ZT3 A; 2QMB A; 3WI8 A; 1M6C A; 1MKO A; 1O1K A; 3O89 A; 4ROL A; 2HBD A; 1A6G A; 3O7N A; 1MKO B; 1O1K B; 4PNJ A; 1HDS A; 3QM7 A; 1X9F D; 4O4Z A; 1MYJ A; 2HBD B; 2D2M B; 2MYA A; 1UT0 A; 1CG5 A; 3UHV A; 3UHR A; 1URV A; 4NK2 A; 3BCQ B; 2GKN A; 1JP6 A; 1V75 B; 1SI4 B; 4YU4 B; 1OBM A; 5AZR A; 3PEL A; 2AV0 A; 1COH A; 2MHB A; 2XKG A; 1CQ2 A; 3W4U A; 1YHU D; 3PEL B; 1DWS A; 2ZFO D; 5JOM A; 4FC3 A; 2V1J A; 3WFT A; 2H8D A; 1DXT A; 1NWI A; 4WJG A; 3PI2 A; 3W4U B; 1HBH A; 1HGA A; 2HBE B; 2AV3 A; 5IKS A; 1Y45 A; 3GOU A; 1DXT B; 4MQH A; 2Z6N A; 2MB5 A; 2VEB A; 1MOD A; 1HBH B; 1HGA B; 1GVH A; 3ECZ A; 2B7H A; 3R0G A; 3GOU B; 1IRC A; 4MQH B; 2Z6N B; 3UHI A; 1J52 A; 2RAO A; 2B7H B; 5EUI B; 1BZ6 A; 3ED9 A; 5E6E B; 1G0A A; 3WCW A; 1YMC A; 2XKI A; 3OZU A; 1RPS B; 3S1I A; 3G52 A; 1DM1 A; 1NQP A; 3WCW B; 1VXD A; 1S61 A; 1CPW A; 2MGK A; 3UHN A; 2KSC A; 1NQP B; 1F5P A; 5F0B A; 3PI1 A; 5HY8 B; 2BMM A; 1XXT A; 3QJC A; 2ZLW B; 4L2M A; 5C6Y A; 3UHU A; 1CH5 A; 3A9M A; 1XXT B; 1BIN A; 2AUP A; 1HSY A; 1YVT A; 3WCT C; 4KJT A; 4C44 A; 2HZ1 A; 1GLI B; 2HHE A; 1BAB A; 4NI0 B; 1NZ4 A; 5EE4 C; 4FWY A; 2HHE B; 1BAB B; 1ECD A; 1IT3 A; 1HBB B; 1Y09 A; 1BZ1 B; 1OFJ A; 101M A; 3TM9 A; 2SPN A; 3OO4 A; 1LJW A; 1O1N A; 1QSH B; 1RVW B; 3D1K B; 3WCP A; 2MYD A; 1LFQ A; 3IXF A; 1CG8 A; 1YE0 A; 1H1X A; 4AVE A; 1QXE A; 3WCP B; 1HAC A; 1NEJ A; 2D2N A; 4MQG A; 1BBB B; 1CG8 B; 1A0U B; 1YHE B; 3LHB A; 1YVQ A; 1Y8I B; 1IT2 A; 4UZV A; 3ORD A; 112M A; 1NEJ B; 2D2N B; 2R80 B; 4MQG B; 3MN0 A; 2O5O X; 1JY7 A; 1MNJ A; 5CHQ A; 1YOG A; 1NAZ A; 5KER A; 2MGJ A; 4HRT A; 3FS4 B; 2EVP A; 1B0B A; 2DN3 A; 2OHB A; 2ZSP A; 5B85 A; 4F69 A; 2FRI X; 2MYB A; 4HRT B; 1GDI A; 4DC7 A; 2AA1 A; 3UHT A; 2EB8 A; 1Y4Q A; 1MBI A; 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2YRS A; 1XZV B; 7HBI A; 3VAU A; 4U8U D; 1FAW B; 1LUE A; 1DUO A; 1O1L B; 1MYT A; 1N9X A; 3P5Q B; 2DN2 B; 2G12 A; 1J7S A; 2GRZ A; 4O2G A; 3UHW A; 1A4F A; 1Y0C A; 1A9W A; 1IOP A; 1Y4G B; 1O1J B; 2QRW A; 1J7S B; 2QLS A; 2D2M D; 3DHR A; 3UHD A; 3QQQ A; 3UHX A; 1Y0C B; 2DC3 A; 1FSL A; 5CN6 A; 3DHR B; 2G0V A; 1XZ4 A; 1C7D A; 1YH9 A; 1CLS B; 2HHB A; 1YIH A; 4BJA A; 1XZ4 B; 1SHR A; 1C7D B; 1YH9 B; 5C6E A; 1WVP A; 1CO8 A; 1DXV B; 1YIH B; 1S0H A; 4F4O A; 1UIW B; 1XZ5 A; 1SDL B; 5C6E B; 1MLK A; 1KD2 A; 1S0H B; 1LH3 A; 3B75 B; 3TM3 A; 1XZ5 B; 4MXL A; 1ABY A; 3EDA A; 2DN1 B; 3MBA A; 1YGD A; 2G3H A; 1Y0D A; 1Y85 A; 5EV5 A; 1RQ4 B; 1GCW B; 3MVC A; 3D1A B; 1YGD B; 1Y0D B; 2BK9 A; 1I3D A; 3WFU A; 2V1H A; 5E83 A; 1BIJ B; 2W72 C; 1MOC A; 110M A; 4F6G A; 1A00 A; 1J7W B; 3E5O A; 1JP8 A; 1JZK A; 1RQ3 A; 1CIO A; 5E83 B; 2O5L X; 2QU0 A; 1J40 A; 4LPI A; 2BLH A; 4M4A A; 1LFV A; 1RQ3 B; 3WTG B; 1YDZ A; 1UVX A; 2QU0 B; 2ZWJ A; 1J40 B; 2MYE A; 1G9V A; 3GKV A; 1X46 A; 4XS0 B; 4M4A B; 3MJU A; 4B4Y A; 1YDZ B; 1MLO A; 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