The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
48
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sequence length |
146
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structure length |
146
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Chain Sequence |
VHLTPEEKSAVTALWGKVNVDEVGGEALGRLLVVYPWTQRFFESFGDLSTPDAVMGNPKVKAHGKKVLGAFSDGLAHLDNLKGTFATLSELHCDKLHVDPENFRLLGNVLVCVLAHHFGKEFTPPVQAAYQKVVAGVANALAHKYH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Structures of human oxy- and deoxyhaemoglobin at different levels of humidity: variability in the T state.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Hemoglobin alpha chain
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| molecule tags |
Oxygen storage/transport
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| total genus |
48
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| structure length |
146
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| sequence length |
146
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2002-04-12 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| B | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1DWR A; 1CQ2 A; 3PI1 A; 4AVE A; 3G4V A; 3A5G A; 3UHQ A; 1YZI A; 1YG5 A; 3V2V A; 3UH7 A; 4G51 A; 2AUR A; 1UMO A; 1BJE A; 1C40 B; 3D1K A; 1OFJ A; 3S1I A; 4FWX A; 1Y0A B; 3A0G B; 4FC3 A; 1CH3 A; 2NX0 A; 1VXH A; 2HHE A; 1X9F B; 2W72 B; 1G08 A; 1LA6 A; 1IBE B; 3PIA B; 1NS9 A; 1LFY A; 1YEO A; 2VEB A; 3BA2 A; 1A01 B; 2ZLT B; 2Z8A A; 1V4U B; 2E2Y A; 2GRZ A; 3WCT A; 1S5X B; 4UIQ A; 1MWB A; 2DN3 A; 2G3H A; 3QM5 A; 2MYC A; 3GDJ A; 5KKK A; 3M39 A; 2G10 A; 5EUI B; 2H35 B; 1ASH A; 4C44 A; 1UIW B; 2G0S A; 1QXD B; 3WCU A; 1V5H A; 1O1M A; 3E4N A; 4L7Y B; 1COH B; 3QQQ A; 4M4B B; 1XYE A; 5EYS A; 1BZZ B; 3GQP A; 4SDH A; 3FS4 A; 3HHB A; 1Y5J A; 1Y31 B; 4WJG A; 1V4W A; 3D4X A; 2MYD A; 5HU6 B; 1LH7 A; 1OJ6 A; 1DXU A; 1IRC A; 1NZ5 A; 2O5O X; 1S61 A; 1JEB B; 3R0G A; 2OH8 A; 5CN8 A; 2MHB B; 1HRM A; 1SDK A; 2D60 A; 2ZS0 A; 3ZJL A; 2VYW A; 1YHU C; 3G4Y A; 3OO4 A; 2GRH A; 1HAB A; 3BJ2 A; 1FHJ A; 2LH6 A; 2ZWJ A; 3OO5 A; 1DO7 A; 5EOH A; 2XKH A; 3K3U A; 2HHB B; 4YU4 B; 2BLJ M; 3K8B A; 1MTJ A; 2ZST A; 4G1V A; 4MQK B; 1HBH B; 1BZ1 A; 4IT8 A; 4NI0 A; 1WVP A; 4HRT B; 1Y0D A; 3WCV A; 3ARJ A; 1UVX A; 3PEL B; 2BLI A; 4N7N B; 2MYE A; 1HDS B; 2R4Z A; 1MLF A; 1MYZ A; 5CNB A; 1FDH A; 1O1K B; 1C7D A; 4X0L A; 1MKO B; 2G0V A; 3ZJQ A; 4MQG B; 1Y83 A; 2NSS A; 3ECX A; 3QJB B; 1DWS A; 2ZSS A; 1JY7 B; 3ZJN A; 2MGF A; 2W6W A; 2ZLU A; 2ZS1 C; 1OUT B; 5AZR A; 1Y22 A; 4F68 A; 1CBM A; 2QMB B; 2HBC A; 1YE0 B; 3E5I A; 3GKV A; 2GTL D; 2VHB A; 1MYG A; 3IC0 A; 3UHS A; 3WI8 A; 1YFF A; 3LB4 A; 1M9P B; 4L2M A; 1YVT A; 2HBF A; 2ZSZ A; 2QSS B; 3MJP A; 1YHR B; 5CN4 A; 1RPS B; 1NQP A; 2AUQ A; 2B7H A; 3FH9 B; 4HSX A; 3BOM B; 1G0B B; 3RJN B; 1JP8 A; 3QZZ A; 5HLX A; 3WCW D; 1YHE B; 3A59 A; 2RI4 A; 1S56 A; 4UUR A; 1V4X A; 2R4X A; 5E6E A; 1NIH B; 2VLX A; 2RAO B; 3MYM A; 3NL7 A; 2BNL A; 3ZJI A; 1X46 A; 3UH6 A; 1BIN A; 2EKU A; 5JDO D; 1K0Y B; 5JDO E; 1Y4Q A; 2QFK A; 1J41 B; 2XKI A; 1N9I A; 3S66 B; 1BAB B; 1MYF A; 4H0B A; 3WCT D; 1VHB A; 1DO4 A; 1YHU A; 2HBE B; 1XY0 A; 1YH9 A; 1BUW A; 1LFQ A; 2G0X A; 1FSX A; 3UHC A; 1YIE B; 5MBA A; 5ILE A; 2FRF A; 2O5B X; 1HBG A; 3DHR A; 2PGH A; 1MNI A; 4H2L B; 1ABS A; 3WCU D; 1QI8 B; 1YGF A; 3NFE A; 1CG8 A; 3SZK A; 1Y7Z A; 4U8U A; 2GKM A; 1SHR A; 104M A; 2LH1 A; 1HGB B; 1HV4 A; 2W6V A; 1A0Z B; 2PEG B; 2ZLV B; 1QSI B; 1ITH A; 1UT0 A; 2ZFO D; 3SDN A; 3CIU A; 2OH9 A; 1RQA A; 3UHN A; 1G09 A; 1LH1 A; 2ZS1 A; 3RJ6 A; 1K1K B; 2ZS0 D; 2LH3 A; 4HHB B; 2FRK X; 3DR9 A; 1XZ7 A; 1J7Y A; 5CNE A; 3ZHW A; 1O1N A; 1R1Y B; 3UBC A; 1YMA A; 3HF4 A; 3GYS A; 3HC9 A; 3NMM B; 2MGH A; 5ILP A; 2SPN A; 1YEV B; 3BCQ A; 3UHY A; 1Y7C B; 3PT8 A; 1A3O A; 2V1I A; 1A6N A; 3AT5 B; 1MOC A; 1MCY A; 1A4F A; 2R1H B; 1ABW B; 3ZOL A; 3ONZ A; 3WCV D; 3MBA A; 1LH2 A; 2QSP B; 1BBB B; 5HAV A; 1IWH A; 1LJW B; 4ROL B; 1S5Y B; 1A6M A; 3CY5 A; 1LFL B; 2BWH A; 1J52 A; 3TLD A; 2FRJ X; 2IN4 A; 2FAM A; 2NRL A; 1XXT B; 4O4Z A; 2VRY A; 1MLL A; 3S65 A; 3PI8 A; 2VLZ A; 2QLS A; 1A3N B; 4IRO A; 1MWD A; 3AT6 A; 1CBL A; 1Y45 B; 2OHB A; 1CH4 A; 5C6Y A; 3H57 A; 1PBX A; 3MKB B; 1Y8K B; 1FCS A; 1CG5 B; 1LFV B; 3S1J A; 1ECN A; 2ZLW B; 2D2N A; 1GVH A; 4KN3 A; 1GDL A; 2GTL B; 1XZ2 B; 3HXN B; 4MXL A; 1IRD A; 2QU0 A; 1UX9 A; 1J3Y B; 5IKS A; 3UHD A; 4N7P B; 3VHB A; 1FAW B; 1YGD B; 3R5I B; 1Y85 A; 5F0B A; 1YIH A; 4O1T A; 1DLY A; 1MLM A; 2O5T X; 2V1K A; 3LR9 A; 3ZJR A; 3WCW B; 3SDH A; 1CH7 A; 1Y0T A; 1A9W A; 5EE4 D; 2VYY A; 5E83 A; 4MQJ A; 3G46 A; 2W6X A; 1YG5 B; 3LB1 A; 3P5Q A; 1Y4B B; 3D1K B; 2MBW A; 3ZJO A; 1S0H A; 4B4Y A; 1CLS A; 2WTH A; 1G08 B; 1LA6 B; 4MQH B; 4N8T B; 1NS9 B; 2BW9 M; 3D7O B; 1XZU B; 1Y7G B; 3OZW A; 1IOP A; 3LQD B; 2MYA A; 2R50 A; 2DN3 B; 3QJD A; 3AQ5 A; 2ZSQ A; 1YHU D; 2XKG A; 4KMV A; 4F6G A; 1EBC A; 1O1O A; 1HJT A; 1YCA A; 1R1X A; 3ODQ A; 1NWN A; 2H8F A; 1XZ5 B; 4N7O A; 3WCU B; 3OVU C; 1MOB A; 2HBS A; 1GDJ A; 1QPW A; 1QXE A; 3ZJP A; 1RQ3 A; 1VRE A; 3FS4 B; 1Y5J B; 6HBI A; 3EDA A; 4O35 A; 1MOH A; 4U8U D; 2HZ1 A; 3D4X B; 1Y01 B; 1UVY A; 3GQR B; 2ZFO B; 2ZT0 A; 1SDL A; 1HBA B; 1BZ6 A; 4HRR A; 3UH3 A; 1L2K A; 5E29 B; 3A5A A; 1A0U B; 1J3Z B; 1F5P A; 3ECZ A; 1SDK B; 2LH2 A; 1CIK A; 2D60 B; 5EET A; 4F69 A; 3WFU A; 2VM0 A; 4KMW A; 2ZS1 D; 108M A; 3OO4 B; 1FHJ B; 1OBM A; 1GLI B; 1MBI A; 3K8B B; 4ILZ A; 3UGZ A; 1ECA A; 4MQI A; 1ECD A; 4XS0 A; 1BZ1 B; 1RTX A; 4NI0 B; 4MAX A; 3WCV B; 1MNK A; 1MBC A; 1O1P B; 5ILR A; 3G4R A; 4MQC B; 3A5B A; 1YOH A; 1GDI A; 1C7D B; 1GCW B; 1YEU B; 2MGG A; 5EQM A; 5SW7 A; 1CMY B; 3QJC B; 3WCP A; 3G52 A; 1O1J B; 2R80 A; 3OK5 A; 1MNJ A; 3UGY A; 1FN3 A; 3WTG A; 3UHG A; 2C0K A; 3VAU A; 1HBR A; 2D2N D; 3D1A A; 1G9V A; 1JZL A; 3DHT B; 4F6F A; 2W72 C; 1M6M A; 3G4Q A; 5KER A; 3MJP B; 1ABY A; 1M6C A; 1S6A A; 1XQ5 A; 3UHK A; 2DXM A; 1NQP B; 2B7H B; 1Y0C B; 3OJ1 A; 1OR4 A; 3D17 B; 1NWI A; 1MNO A; 1VXF A; 1IT2 A; 1MLR A; 1Y4F A; 1CH2 A; 1A9W E; 1NAZ A; 1V4X B; 2AV0 A; 1GBV B; 3NL7 B; 1HDA A; 4LPI A; 3GKT A; 1LFZ A; 3QMA A; 1A6K A; 1YMB A; 3O89 A; 2YRS B; 3HEP A; 5CHR A; 1V75 A; 3ARL A; 1RQ4 A; 1CP0 A; 1NXF A; 4NXA A; 1EW6 A; 2ZSO A; 1DXT A; 1Q1F A; 1DTM A; 2DC3 A; 1XY0 B; 1BUW B; 3ZOM A; 5JGG A; 1FSX B; 4MU5 A; 2EB9 A; 4HBI A; 2W6Y A; 3GLN A; 3VRE B; 1C7C B; 4JAC A; 1OR6 A; 2PGH B; 4PQB A; 1MOA A; 1GBU A; 2EVP A; 1EBT A; 2ZFB A; 1AJ9 B; 3UBV A; 1YGF B; 2HBD B; 1CG8 B; 1DWT A; 1O1L A; 1HDB A; 3SZK B; 3G4U A; 2D6C A; 1J7W A; 3GOU A; 4U8U B; 3QM7 A; 2MGI A; 3GQG A; 1O1I A; 4JYQ A; 2DN1 B; 4NI1 A; 1LFT A; 1Y0W A; 1Y4G B; 1Y5K A; 4DC8 A; 4DC7 A; 2V1F A; 1EWA A; 1XZV B; 1RQA B; 1BIJ B; 3E55 A; 5KDQ A; 1G09 B; 5CNG A; 1JWN A; 2VEE A; 3M3A A; 2ZS1 B; 1JF3 A; 1DKE A; 7HBI A; 3B75 A; 3G4W A; 3PI2 A; 1XZ7 B; 3A9M A; 1JZM A; 1J7Y B; 4NZI A; 1DXD A; 4H07 A; 3EDB A; 1Y0A A; 2FAL A; 3A0G A; 1JDO A; 2O5S X; 3BCQ B; 1MYI A; 2W72 A; 1DUO A; 2GDM A; 2WY4 A; 1IBE A; 3PIA A; 4GZG A; 1A4F B; 107M A; 2ZLT A; 5CND A; 2D2M B; 2MB5 A; 2GNW A; 3KMF C; 1YDZ B; 1Y35 B; 4PNJ A; 1S5X A; 1YEQ B; 3CY5 B; 1DM1 A; 1MLS A; 2G11 A; 1ECO A; 1NS6 A; 2H35 A; 1A00 B; 1UIW A; 3S65 B; 5JOM A; 1CO9 A; 4F6B A; 1MLJ A; 3AT6 B; 3NML A; 3WFX A; 5C6E A; 3DUT B; 4L7Y A; 1COH A; 1MLK A; 1PBX B; 4M4B A; 3PI4 A; 1JZK A; 3BJ3 B; 2D5X A; 3W4U B; 2HCO B; 2OLP A; 1Y31 A; 2D2N B; 1OUU A; 5HY8 B; 3EOK B; 3PI9 A; 5HU6 A; 2ZLX B; 2LH7 A; 1Y8H A; 1J3F A; 1IRD B; 1HBB A; 2G14 A; 1JEB A; 2AA1 B; 2IG3 A; 2MHB A; 1U7R A; 1HBS B; 2R4Y A; 1LHS A; 3UH5 A; 5E83 B; 4MQJ B; 1YE2 A; 2ZSP A; 4M4A B; 1B86 B; 1HAC A; 3QJE A; 1THB B; 2OIF A; 3TM3 A; 1S0H B; 4NK2 A; 4YU4 A; 3A2G A; 1VWT B; 1J7S A; 112M A; 4ROM A; 4QAU A; 3WHM A; 1CPW A; 4HRT A; 2ZT4 A; 3PEL A; 5CN9 A; 3QJD B; 3UHI A; 1O1K A; 3ZH0 A; 1O1O B; 3M3B A; 4MQG A; 3BJ1 A; 1R1X B; 3QJB A; 1UX8 A; 4F6I A; 3ODQ B; 1MZ0 A; 3AQ8 A; 4F4O B; 3ZJS A; 2QFN A; 2Z6N A; 2HBS B; 1OUT A; 1MOD A; 1QPW B; 1HLM A; 1QXE B; 3VRG A; 3KMF A; 2QMB A; 5F2A A; 3QM6 A; 1Y4R A; 1Y2Z B; 2DHB B; 1Y4P A; 1WMU B; 3H58 A; 1Y46 B; 1M9P A; 1HCO B; 1N9X A; 4ODC A; 2QSS A; 1RPS A; 1UC3 A; 2MGB A; 2BLH A; 1MNH A; 2GLN A; 1NZ2 A; 3E5O A; 5MBN A; 1MLG A; 3BOM A; 1G0B A; 1I3D A; 4AVD A; 1JP9 A; 5D1V A; 1NZ4 A; 3IC2 A; 5CHQ A; 4TYX A; 1DUK A; 1MYH A; 2GL3 A; 2VYZ A; 1BZ0 A; 1PMB A; 1Y4V A; 1NIH A; 2RAO A; 5EV5 A; 1I3E A; 2ZSR A; 1YVQ B; 1GCV A; 4XS0 B; 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1Y7D A; 2MGC A; 1JP6 A; 2GTL A; 1FDH G; 1XZ2 A; 3HXN A; 3NG6 A; 5HLQ A; 4MPM A; 4X0L B; 3UHR A; 1J3Y A; 1IDR A; 1Y83 B; 5KDQ B; 4N7P A; 1YGD A; 2H8D A; 2D5Z A; 1DKE B; 2ZLU B; 1JL6 A; 1U7S A; 3WCW A; 1Y22 B; 3UHE A; 3HRW A; 2HBC B; 1FSL A; 1N9H A; 1XCH A; 1Y4B A; 2VLY A; 2MGK A; 3GKV B; 1KFR A; 3IC0 B; 1YFF B; 4MQH A; 4N8T A; 1X9F C; 1YVT B; 1JF4 A; 2HBF B; 3MN0 A; 1DO1 A; 3D7O A; 1XZU A; 1Y7G A; 1SI4 A; 2WTG A; 3LQD A; 2M6Z A; 4DWU A; 1URV A; 3A59 B; 1BZP A; 2RI4 B; 1NS6 B; 2G0R A; 1HHO A; 5E6E B; 3ZJJ A; 3HYU A; 1XZ5 A; 1LUE A; 2CMM A; 4NK1 A; 2QRW A; 5C6E B; 1F65 A; 1Y4Q B; 6HBW A; 5EE4 C; 2D5X B; 2DN2 A; 1MLQ A; 3K9Z A; 4ZVA A; 1JPB A; 1QSH A; 1OUU B; 1KD2 A; 3PI9 B; 1Y5F A; 1Y8H B; 1YHU B; 3GQR A; 1YH9 B; 1HBB B; 2ZFO A; 1HGA A; 1LFQ B; 5ILM A; 1HBA A; 3S48 C; 2GKN A; 5E29 A; 4PQ6 A; 1A0U A; 1J3Z A; 3DHR B; 1NEJ A; 3AQ9 A; 1VXB A; 5AZQ A; 4O2G A; 3NFE B; 2Z6S A; 1MBA A; 1Y7Z B; 1RVW A; 1YE2 B; 1UFJ A; 1GLI A; 5EYJ A; 1SHR B; 5EU2 A; 2O5Q X; 1HAC B; 1MBD A; 3QJE B; 2V1J A; 1HV4 B; 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