The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
60
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sequence length |
153
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structure length |
153
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Chain Sequence |
GALTESQAALVKSSWEEFNANIPKHTHRFFILVLEIAPAAKDLFSFLKGTSEVPQNNPELQAHAGKVFKLVYEAAIQLEVTGVVVTDATLKNLGSVHVSKGVADAHFPVVKEAILKTIKEVVGAKWSEELNSAWTIAYDELAIVIKKEMDDAA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
X-Ray Structural Investigation of Leghemoglobin. Vi. Structure of Acetate-Ferrileghemoglobin at a Resolution of 2.0 Angstroms (Russian)
pubmed rcsb |
| molecule keywords |
LEGHEMOGLOBIN (AQUO MET)
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| molecule tags |
Oxygen transport
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| source organism |
Lupinus luteus
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| total genus |
60
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| structure length |
153
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| sequence length |
153
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 1982-04-23 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1AJG A; 3S1I A; 1OUT A; 1QSI B; 1RSE A; 1WMU B; 2HBE A; 1MBS A; 3UI0 A; 1MOC A; 1UIW A; 1SDL B; 5HU6 A; 2GLN A; 1G09 B; 1Y35 A; 1LA6 A; 1GLI A; 2MGK A; 3KUN A; 3DHT B; 1QSI A; 1WMU A; 1JF4 A; 1S69 A; 1QI8 B; 1ABY B; 2ZS0 B; 4TWU A; 2BLH A; 1LH6 A; 1SDL A; 3WR1 B; 1YCA A; 3WCU B; 1G09 A; 1DWR A; 1Y7Z B; 2QMB B; 3M3A A; 2MGJ A; 5CN5 A; 4NZI A; 3DHT A; 4MBA A; 1NAZ A; 1QI8 A; 1ABY A; 2ZS0 A; 4YU4 B; 3DR9 A; 3OK5 A; 1HDA B; 1NPG A; 1VXF A; 3WR1 A; 1JZK A; 3WCU A; 1Y7Z A; 2QMB A; 3WFW A; 3WCT D; 1LH3 A; 3BOM B; 1O1K B; 4YU4 A; 3A5B A; 1HDA A; 1DUO A; 2ZSO A; 1IBE A; 2HZ3 A; 3ZJI A; 5M3S A; 3UH3 A; 3ZOL A; 1HBB B; 1LTW A; 2BK9 A; 1UFJ A; 5CNE A; 4N7N B; 1GZX B; 1VRE A; 5EU2 A; 1FSX B; 2HHD B; 2ZWJ A; 3BOM A; 1O1K A; 1XZ2 B; 4O2G A; 1A6G A; 4MQC B; 1DKE B; 1MLG A; 1F5O A; 2D2M D; 105M A; 1HBB A; 2GDM A; 3E5I A; 2BLI A; 4N7N A; 1GZX A; 3M38 A; 3QMA A; 1FSX A; 2HHD A; 1XZ2 A; 2H8D B; 3QJE B; 2BMM A; 3ARL A; 2SPO A; 3EU1 B; 1A6N A; 4MQC A; 1DKE A; 3UHI A; 5E29 B; 2XKH A; 2ZSP A; 4MQG B; 2GKM A; 2MGD A; 3LB2 A; 2H8D A; 3QJE A; 2MGF A; 2BW9 M; 3ORD A; 3S65 B; 3O7N A; 1UMO A; 4DC7 A; 3UHS A; 5E29 A; 1IRD B; 1VXE A; 4MQG A; 3S66 B; 3HC9 A; 3WI8 A; 1X9F B; 4O4T A; 3PI1 A; 3OO4 B; 2D6C A; 2HBG A; 3S65 A; 4IT8 A; 1IRD A; 3ZOM A; 3OVU C; 3S66 A; 3FH9 B; 1X9F A; 1IDR A; 1UVY A; 1XZV B; 2YRS B; 1MOD A; 3OO4 A; 1HDS B; 3M39 A; 1MYF A; 4F6J A; 2MYC A; 2D5X B; 3QJC B; 1MLF A; 3FH9 A; 4UZV A; 1EWA A; 5CMV A; 4FWZ A; 1MYI A; 1XZV A; 2YRS A; 1GBU B; 3OGB A; 2O5O X; 1HDS A; 1HLM A; 1MGN A; 1PBX B; 2D5X A; 3QJC A; 3VRE B; 3ODQ B; 1GBU A; 4BJA A; 1DXU B; 2PGH B; 1EW6 A; 1PBX A; 4N7P B; 1J7S B; 5CHR A; 1SDK B; 1YEU B; 3VRE A; 3MKB B; 3ODQ A; 1JZL A; 1K1K B; 4VHB A; 3A59 B; 1THB B; 2VRY A; 2B7H B; 4HRT B; 1Y0C B; 1DXU A; 2PGH A; 2GKN A; 2R4X A; 3GLN A; 4N7P A; 1J7S A; 1SDK A; 1O1N B; 1O1J B; 1YEU A; 3PI4 A; 3MKB A; 4ESA B; 4FWY A; 111M A; 1K1K A; 3KUO A; 3QZX A; 1IRC A; 3A59 A; 2B7H A; 1W92 A; 4HRT A; 1Y0C A; 1Y85 B; 2ZLU B; 2LHB A; 1HBG A; 3MYM A; 1O1N A; 1O1J A; 3UHB A; 1V9Q A; 1WVP A; 1KD2 B; 4ESA A; 1MWB A; 1BZR A; 4H2L B; 1YE0 B; 1Y85 A; 1C40 B; 2ZLU A; 3NML A; 3GOU B; 1MNH A; 1Y5K B; 2MGG A; 2D2M B; 1KD2 A; 1XCH A; 2GTL C; 4YU3 B; 1CBM A; 2ZLX B; 1YOH A; 2OHA A; 4H2L A; 1YE0 A; 1VXB A; 1C40 A; 1YE2 B; 1MBN A; 1MLU A; 2GTL D; 4MAX A; 1SI4 B; 5E83 B; 1MTK A; 1GDK A; 1Y5K A; 3GQG B; 2D2M A; 1G0B B; 1BIJ B; 2MGB A; 1MLH A; 4YU3 A; 3LR7 A; 1S6A A; 2ZLX A; 1CH4 A; 4O4Z A; 3B75 B; 1O1P B; 5EOH A; 1DO3 A; 1YE2 A; 1YG5 B; 3WCW C; 3UGY A; 1SI4 A; 5E83 A; 1O1M B; 3R5I B; 3GQG A; 1G0B A; 1BIJ A; 1MYH A; 1F5P A; 1UVX A; 4X0L B; 3B75 A; 1O1P A; 1YG5 A; 4MQK B; 4F6D A; 1O1M A; 1XZU B; 1YVT B; 3R5I A; 1NZ2 A; 2GNW A; 4PNJ A; 1UC3 A; 2Z6T A; 1SWM A; 1YEQ B; 1J52 A; 1WLA A; 1Y0W B; 3HEO A; 4X0L A; 3VRF B; 3QM5 A; 1ECD A; 3ZJQ A; 1NS6 B; 4MQK A; 2EKU A; 1B86 B; 1XZU A; 1Y4B B; 1YVT A; 1DWT A; 2R1H B; 1ECA A; 3LHB A; 1LFY B; 1A00 B; 3G4R A; 2HBS B; 1HAC B; 1YEQ A; 1Y0W A; 7HBI A; 3VRF A; 4NXC A; 1NS6 A; 107M A; 3HEP A; 3MOU A; 3QM6 A; 1B86 A; 2ZS0 D; 1LFV B; 1Y4B A; 2R1H A; 1HJT A; 2ZS1 C; 1LFY A; 1A00 A; 1MLL A; 2HBS A; 2O5Q X; 2AV0 A; 101M A; 1HAC A; 5KDQ B; 2OHB A; 1MKO B; 3A5G A; 1LFV A; 3OJ1 A; 2FAM A; 3GKV B; 3VHB A; 3D4X B; 1Y0T B; 3AQ6 A; 1HGA B; 1YEN B; 2QFN A; 2LH5 A; 3BA2 A; 1CIK A; 5KDQ A; 1K0Y B; 1MKO A; 3A0G B; 1QPW B; 2HZ1 A; 1XZ5 B; 2VHB A; 1XZ4 B; 3GKV A; 1Y4R B; 3D4X A; 1Y0T A; 3K3U A; 102M A; 1HGA A; 1VHB A; 1SHR B; 1YEN A; 4B4Y A; 3S1J A; 3UHD A; 1K0Y A; 3A0G A; 1QPW A; 1XZ5 A; 3MVC A; 5F0B A; 2W72 B; 1XZ4 A; 1YHU C; 1Y4R A; 3LQD B; 1PMB A; 3D1K B; 4WJG 1; 1SHR A; 2RI4 B; 4XS0 B; 1MTI A; 1XY0 B; 1MBD A; 1YIH B; 2G11 A; 1DO1 A; 2DN2 B; 5CND A; 3UHR A; 3QQQ A; 2W72 A; 2R50 A; 3LQD A; 3D1K A; 2RI4 A; 4XS0 A; 1XY0 A; 1YIH A; 4F6G A; 2HBF B; 1MBC A; 2H8F B; 5ILR A; 2DN2 A; 1LH2 A; 1YMA A; 2GTL B; 3HEN A; 1GJN A; 3UH5 A; 3GQR B; 3V2V A; 1MOH A; 2NRL A; 3NMM B; 1JL6 A; 1NWI A; 1A0Z B; 2HBF A; 2H8F A; 2PEG B; 1EBC A; 1U7R A; 1CPW A; 2GTL A; 2IG3 A; 4HRR B; 2Z6S A; 3PT7 B; 4HSW A; 1DUK A; 3GQR A; 4O35 A; 3WCW B; 1S5X B; 3NMM A; 1A0Z A; 1Y4G B; 2PEG A; 5MBN A; 4FC3 B; 1A3O B; 4HRR A; 3PT7 A; 2V1K A; 1YIE B; 1IT3 A; 1L2K A; 3WCW A; 1S5X A; 2IN4 A; 2LH2 A; 1Y4G A; 1AJ9 B; 4FC3 A; 1MLK A; 2V1J A; 1HSY A; 1HCO B; 1JEB B; 1YIE A; 4F6B A; 1DXV B; 1A01 B; 5B84 A; 5AB8 A; 1YOG A; 1H1X A; 1HGB B; 4PQC A; 5CN6 A; 2BLJ M; 5EUI B; 1AJ9 A; 2ZFB B; 1HCO A; 1JEB A; 1NZ3 A; 1YDZ B; 1DXV A; 1A01 A; 4PQB A; 1HGB A; 5JDO C; 1UX8 A; 5EUI A; 1CG5 B; 2ZFB A; 1Y83 B; 2HHB B; 2QSS B; 2HBD B; 1XXT B; 4KN3 A; 1YDZ A; 1DXT B; 1URY A; 3ZJN A; 3AT6 B; 1CG5 A; 1A0U B; 1Y83 A; 2HHB A; 2QSS A; 4FWX A; 2HBD A; 2EKT A; 2OH8 A; 1XXT A; 1NS9 B; 2AUQ A; 2ZT0 A; 1DXT A; 2ZT1 A; 1SPE A; 3AT6 A; 1A0U A; 1YVQ B; 3M3B A; 4FH6 A; 4U8U C; 1V5H A; 4B3W A; 1NS9 A; 2FRK X; 3BJ3 B; 6HBI A; 2SPM A; 1BVC A; 3IC0 B; 1RQ4 B; 1ABW B; 5CNF A; 1MLO A; 1YVQ A; 1CO9 A; 5HLX A; 2EB8 A; 4F6I A; 3IC2 B; 3BJ3 A; 5CNG A; 4AVD A; 3GQP B; 2OLP A; 1RQ4 A; 1NPF A; 1EMY A; 1ABW A; 3UHZ A; 1JP9 A; 2XKG A; 1Y8I B; 2RAO B; 3QM7 A; 1Y22 B; 3IC2 A; 4F4O B; 1G0A B; 3EU1 A; 5HY8 B; 3MYN A; 2G0S A; 3WCP B; 3GQP A; 5HLU A; 1YMC A; 2G0X A; 5ILM A; 1Y8I A; 2RAO A; 1Y22 A; 4G51 B; 1QXE B; 4F4O A; 1G0A A; 1GDL A; 1HBI A; 5HY8 A; 1MDN A; 2ZT2 A; 1DM1 A; 1OR6 A; 1UT0 A; 3WCP A; 3AG0 A; 3OZU A; 112M A; 3G4U A; 4MU5 A; 3D1A B; 1H97 A; 3S48 C; 3UH7 A; 2DN1 B; 1MLJ A; 1Q1F A; 4G51 A; 1QXE A; 2AA1 B; 1MLQ A; 2R4Y A; 5F2A A; 3OZV A; 2AUR A; 1COH B; 1MWC A; 5EE4 C; 4C0N A; 3GDJ B; 2HCO B; 3GK9 A; 3D1A A; 5JDO F; 1LFL B; 3CIU B; 1MLN A; 4M4A B; 4L7Y B; 1C7D B; 2DN1 A; 1YGF B; 5EE4 D; 1FAW B; 1N9H A; 2AA1 A; 1MBI A; 3QJD B; 5C6Y A; 1A6M A; 1COH A; 1FSL A; 3GDJ A; 2HCO A; 3SZK B; 2MGM A; 1LFL A; 3CIU A; 3ZJS A; 4M4A A; 3PEL B; 3PT8 B; 1C7D A; 4L7Y A; 4OOD A; 3UHN A; 1YGF A; 3K9Z A; 1Y2Z B; 5JOM A; 2ZFO C; 2QU0 B; 1GDI A; 3QJD A; 4MQJ B; 2BWH A; 3SZK A; 1XYE B; 3PI2 A; 1DO7 A; 4LPI A; 3PEL A; 3PT8 A; 2ZFO D; 3D17 B; 1Y2Z A; 1DO4 A; 5CN8 A; 2QU0 A; 4MQJ A; 1CH7 A; 103M A; 1HBA B; 2OIF A; 3MN0 A; 1HDB B; 4ZVA A; 5SW7 B; 1XYE A; 3WFX A; 1M6C A; 1Y7C B; 3CY5 B; 1THB A; 2VEB A; 3D17 A; 3DHR B; 1HBA A; 1FDH A; 1HDB A; 3G4W A; 2WY4 A; 5SW7 A; 1ITH A; 2MGC A; 1Y7C A; 3CY5 A; 2V1H A; 3HXN B; 2Z8A A; 4MBN A; 2R80 B; 5CN9 A; 3UBV A; 4ROL B; 3G4Y A; 3DHR A; 2MGE A; 1ECO A; 1JY7 B; 1Y31 B; 1J3F A; 1VXG A; 4G1V A; 4WJG A; 1MOA A; 3HXN A; 1BAB B; 2C0K A; 3RJ6 A; 2R80 A; 2HZ2 A; 3BCQ B; 4ROL A; 1B0B A; 1S0H B; 2VLY A; 1DWS A; 1NWN A; 3GOU A; 2V1I A; 4C44 A; 1JY7 A; 1Y31 A; 3ZH0 A; 1QSH B; 1VXC A; 1BAB A; 1ABS A; 3UHQ A; 3BCQ A; 1S0H A; 1U7S A; 1Y5J B; 2FAL A; 1CH5 A; 1M6M A; 2XYK A; 1LUE A; 1QSH A; 3NL7 B; 3WCW D; 1X3K A; 2LH7 A; 1RTX A; 5MBA A; 1Y4V B; 1CG8 B; 1KFR A; 1Y5J A; 1OUU B; 2VEE A; 1OFK A; 2O5L X; 2VYZ A; 1Y09 B; 2AUP A; 2ZLW B; 3HRW B; 4HBI A; 3NL7 A; 1YHE B; 1CP0 A; 3E4N A; 1Y4V A; 1CG8 A; 5C6E B; 1OUU A; 4MQI B; 4KJT A; 1GDJ A; 4G1B A; 1Y09 A; 2ZLW A; 3HRW A; 2ZSX A; 2MYA A; 1DXC A; 4DWT A; 1VXH A; 1TES A; 2MGA A; 1MNJ A; 3PI9 B; 2R4Z A; 3KMF C; 1Y7D B; 5CN4 A; 3EDB A; 1YHE A; 3V2Z A; 5C6E A; 4XDI A; 4MQI A; 2JHO A; 1VXD A; 1MBA A; 1BJE A; 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1R1Y B; 2W6X A; 1FN3 B; 1HV4 A; 3OO5 B; 1JPB A; 1YEO B; 4NI1 B; 104M A; 1CMY B; 2OH9 A; 1CP5 A; 1X46 A; 2EVK A; 1N9I A; 109M A; 1R1Y A; 5ILE A; 1V4W B; 1FN3 A; 2EVP A; 3NG6 B; 3UHG A; 4NK2 A; 4QAU A; 3OO5 A; 2ZS1 B; 1YEO A; 4NI1 A; 3KMF A; 1CMY A; 5JDO D; 1CO8 A; 2HHE B; 1UFP A; 3UH6 A; 2MBW A; 2LH1 A; 4MXK A; 1V4W A; 3O89 A; 2NSR A; 3NG6 A; 3MBA A; 2SPL A; 3DUT B; 2ZS1 A; 4DWU A; 2Z85 A; 3AQ9 A; 5IKS A; 4HSX A; 1NEJ B; 2HHE A; 3ONZ B; 2O58 X; 3WCT C; 1IBE B; 1MCY A; 4L2M A; 1LFQ B; 1G9V B; 3DUT A; 1VXA A; 2NSS A; 1NEJ A; 108M A; 2NX0 A; 3ONZ A; 1D8U A; 2SPN A; 1N9X A; 3WCV B; 5EYS A; 1J3Z B; 1LFQ A; 1BIN A; 2ZSN A; 1G9V A; 1MNK A; 1CH2 A; 1BZ1 B; 1YHU B; 4U8U D; 3GKT A; 2V1E A; 1Y0D B; 5AZR A; 1NZ5 A; 3AQ5 A; 4TYX A; 2D2M C; 1MOB A; 1BZ0 B; 1GVH A; 1FCS A; 3UHX A; 2R4W A; 3WCV A; 1J3Z A; 1MYJ A; 1I3D A; 3UHT A; 2QFK A; 3IC0 A; 1BZ1 A; 1YHU A; 1Y0D A; 1MLM A; 1CH1 A; 1MZ0 A; 1HGC B; 3ZJL A; 1HLB A; 1BZ0 A; 3BJ1 B; 3QM8 A; 2E2Y A; 3AQ7 A; 1NGK A; 4N7O B; 1HGC A; 1UX9 A; 3BJ1 A; 4NXA A; 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