The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
61
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sequence length |
153
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structure length |
153
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Chain Sequence |
GALTESQAALVKSSWEEFNANIPKHTHRFFILVLEIAPAAKDLFSFLKGTSEVPQNNPELQAHAGKVFKLVYEAAIQLEVTGVVVTDATLKNLGSVHVSKGVADAHFPVVKEAILKTIKEVVGAKWSEELNSAWTIAYDELAIVIKKEMDDAA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
X-Ray Structural Investigation of Leghemoglobin. Vi. Structure of Acetate-Ferrileghemoglobin at a Resolution of 2.0 Angstroms (Russian)
pubmed rcsb |
| molecule keywords |
LEGHEMOGLOBIN (FLUORO MET)
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| molecule tags |
Oxygen transport
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| source organism |
Lupinus luteus
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| total genus |
61
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| structure length |
153
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| sequence length |
153
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 1982-04-23 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 4PNJ A; 1YFF A; 3AT5 B; 3FS4 B; 105M A; 3R5I B; 1YMC A; 5EE4 D; 1BIN A; 1V4W B; 2Z6N B; 1MNH A; 1WLA A; 1FAW B; 1FLP A; 3OK5 A; 5HU6 A; 1Y4R B; 3DUT A; 3D17 A; 3RJN B; 2DC3 A; 1MLO A; 3HHB B; 5F0B A; 2GTL B; 3DHT B; 2ZLT B; 3GQR A; 1GJN A; 3H57 A; 3EU1 A; 2MGD A; 2R4Z A; 1X3K A; 4NXA A; 1XZ5 A; 2D2N B; 1Y8I A; 3ARJ A; 1NEJ B; 5CHR A; 3GKV B; 1HLM A; 1YIH B; 4M4A A; 2OH8 A; 1SHR A; 1WMU A; 3A5B A; 5E6E A; 3UGZ A; 1HBA B; 1F65 A; 4MXL A; 4LPI A; 3VRE A; 1CLS B; 1FSX A; 1DO4 A; 3ZJQ A; 3NL7 A; 1QSI B; 2V1K A; 1CO8 A; 1MNJ A; 5HY8 B; 1HBB A; 1MKO B; 3S1I A; 1HBI A; 1O1P A; 3G4W A; 1DXU B; 2QFK A; 2BMM A; 3GQG B; 2XYK A; 1MLQ A; 3MVC A; 1CG8 B; 2ZSX A; 2MYC A; 2MGJ A; 3WCU C; 2MYD A; 1RPS A; 2QLS A; 5CND A; 2QFN A; 2DHB A; 3A2G A; 1YE2 A; 2MB5 A; 102M A; 1DXT B; 2FRJ X; 2GL3 A; 4MBN A; 1Y5K B; 1LHT A; 2ZLU B; 1B0B A; 1TU9 A; 2WTG A; 1XYE A; 1R1X B; 1HGC B; 3CY5 A; 4KMW A; 4NS2 A; 1G08 A; 4MPM A; 3A0G B; 2CMM A; 3OVU C; 3ORD A; 3AT5 A; 3PI2 A; 3FS4 A; 3R5I A; 2G0V A; 1V4W A; 2BK9 A; 2LH2 A; 2ZFO C; 4MQJ B; 2Z6N A; 1J3Z B; 1JF3 A; 1FAW A; 3GYS B; 2HZ2 A; 1YH9 B; 1LH3 A; 1S5Y B; 2GTL A; 3DHT A; 2ZLT A; 3HEN A; 3MJP B; 3KUN A; 2WY4 A; 1A9W A; 1LUE A; 2D2N A; 2D2M C; 1NEJ A; 1VXH A; 3GKV A; 1Y0W B; 1SDL B; 2H35 A; 3PI3 A; 1XZ7 A; 1YIH A; 1NS6 B; 5ILE A; 1JDO A; 1BVC A; 1ECO A; 1HBA A; 2IN4 A; 3MJU B; 1GDJ A; 1AJG A; 3UHR A; 1FHJ B; 4G1B A; 4C44 A; 1QXD B; 3OZW A; 3ZHW A; 1M6C A; 3UHT A; 1YEU B; 5HLX A; 1MKO A; 1HDB B; 1YHE A; 1LFQ B; 3TM3 A; 1DXU A; 3CIU A; 1G0A B; 2MGA A; 4F4O B; 3IA3 B; 3E5I A; 3MOU A; 3GQG A; 1MLJ A; 2HHD B; 1CG8 A; 5CN6 A; 3BOM B; 1XQ5 B; 1MOC A; 2Z6T A; 1DXT A; 2W31 A; 1MLL A; 3HC9 A; 3UHI A; 3LR9 A; 2ZLU A; 3UHZ A; 2SPM A; 1DUK A; 4MAX A; 1VXE A; 4ILZ A; 3EOK B; 1CH9 A; 1BBB B; 3OO4 B; 4ROL B; 1R1X A; 1HGC A; 2O5B X; 3M39 A; 2VM0 A; 3A0G A; 1O1O B; 1HAC B; 3V2Z A; 2ZSS A; 1Y01 B; 2MGB A; 2LH6 A; 1IT2 A; 4FWZ A; 3GYS A; 1NZ2 A; 1LFV A; 110M A; 1H1X A; 5EQM A; 3E4N A; 1YH9 A; 2W6V B; 1S5Y A; 3MJP A; 1GCV B; 1MTK A; 1MLK A; 1UIW B; 2YRS B; 4YU4 B; 4MQG B; 1J40 B; 5CNB A; 1YHU C; 6HBW B; 1Y0W A; 1RQ3 B; 1MYM A; 1SDL A; 2G0Z A; 2LH3 A; 1NS6 A; 3NFE B; 4WJG 1; 2OIF A; 3IC0 B; 4NZI A; 1YGD B; 2FAM A; 3MJU A; 1J7Y B; 1X9F A; 1MDN A; 1R1Y B; 3PT8 B; 1NS9 B; 1FHJ A; 3QJB B; 3E55 A; 1HLB A; 1J7W B; 1QXD A; 3M3B A; 1YEU A; 1HBR B; 2O5O X; 3OO5 B; 3WCW B; 1Y0D B; 1Y4G B; 1HDB A; 3LHB A; 1LFQ A; 3OGB A; 3HRW B; 1NWI A; 1QSH B; 5ILM A; 3LB3 A; 3A9M A; 3UH3 A; 4F4O A; 3WCW D; 2HHD A; 3R0G A; 1OR6 A; 1RQA B; 2BKM A; 3BOM A; 1XQ5 A; 2DN2 A; 108M A; 1FN3 B; 3K9Z A; 3WCV D; 3LB4 A; 1LA6 B; 3FH9 A; 1SPE A; 3SDH A; 1CMY B; 3ARK A; 1PBX B; 1JY7 B; 1Y4F B; 1JF4 A; 2D60 A; 5M3S A; 2NSS A; 3KMF A; 1DXD A; 3EOK A; 3QM6 A; 3WI8 A; 4HRT A; 1BBB A; 3OO4 A; 4ROL A; 3OJ1 A; 1YDZ B; 1A6G A; 1S5X B; 3AQ5 A; 1V07 A; 2E2Y A; 2VEE A; 3MKB B; 1O1O A; 1MBA A; 1HAC A; 2HBE B; 1MBS A; 1Z8U B; 1HGA B; 4H07 A; 3ZJJ A; 1NQP B; 1GBU B; 1NZ5 A; 4FWX A; 1V9Q A; 1MYT A; 3GQP B; 107M A; 2W6V A; 5AZQ A; 1A6K A; 1G09 B; 1GCV A; 5D1V A; 1O1J B; 3H58 A; 1Y09 B; 1LFT B; 1NGK A; 1Y7D A; 1IRD B; 1YEV B; 2YRS A; 3UHY A; 4MQG A; 1J40 A; 1RVW B; 5D5R A; 6HBW A; 1RQ4 B; 1N9I A; 1JZM A; 3RGK A; 2G0S A; 1Y5F B; 3NFE A; 3V2V A; 2MGC A; 3IC0 A; 1Y0A A; 5F2A A; 1YGD A; 1J7Y A; 1R1Y A; 3PT8 A; 1JEB B; 1NS9 A; 1XZ4 B; 3ZH0 A; 3QJB A; 101M A; 1HBR A; 3OO5 A; 3WCW A; 3UHW A; 1Y8H B; 1Y0D A; 3ZJR A; 3HRW A; 3WFU A; 1IBE B; 1V4X B; 1QSH A; 4TWU A; 5IKS A; 5EYJ A; 1CIK A; 1MTI A; 4L7Y B; 1RQA A; 3QM5 A; 3UHH A; 2HCO B; 3A5G A; 4F68 A; 1MYH A; 5EOH A; 1LA6 A; 1MLR A; 2R80 B; 2VYW A; 4N8T B; 2BLI A; 1Y4V B; 1ABS A; 1CMY A; 1PBX A; 1JY7 A; 1Y4F A; 2GTL C; 3SDN A; 3M38 A; 5HAV A; 2D2N C; 1YDZ A; 1Y0C B; 1Y7Z B; 4G51 B; 2HBE A; 3PI9 B; 1HGA A; 2ZSO A; 1NQP A; 1A9W E; 5CNE A; 1YVQ A; 2VLY A; 1VWT A; 3GQP A; 2W6W A; 1G09 A; 1Y7G B; 1YZI A; 1O1J A; 1UX9 A; 1Y09 A; 1J52 A; 1MCY A; 1MBI A; 2AUO A; 3QJE B; 1RQ4 A; 1A0Z B; 1Y5F A; 1IOP A; 3VRG B; 1Y2Z A; 4PQB A; 1MYJ A; 1EW6 A; 1H97 A; 4H2L B; 1JEB A; 1XZ4 A; 5EU2 A; 1YEO B; 1HJT A; 2EB9 A; 1I3D A; 1MYZ A; 1MBD A; 1C7B B; 2OHB A; 2XKG A; 4ODC B; 2HHB B; 2SPO A; 4HSX A; 3P5Q A; 2EB8 A; 1Y7C B; 1IBE A; 1V4X A; 2H8F B; 3HEO A; 2QRW A; 3LB2 A; 1RTX A; 1YMA A; 3GOU A; 2O5L X; 1BUW B; 3UH5 A; 1A3O A; 1UFP A; 1GBV B; 4HSW A; 4L7Y A; 2DXM B; 1RSE A; 2HCO A; 2GDM A; 3K8B B; 1VRE A; 3LQD B; 5CNG A; 2ZLW B; 4O4Z A; 1BZ1 B; 3A59 B; 3GLN A; 3W4U A; 4XS0 A; 4F69 A; 1HBH A; 3U3E A; 4PQ6 A; 4FH6 A; 3GKT A; 2MYE A; 1Y83 B; 3QM8 A; 2OLP A; 4N7N B; 1Y7Z A; 3WR1 B; 4G51 A; 1Y22 B; 1ITH A; 3AT6 B; 1Y35 B; 3PI9 A; 1HGB A; 3GDJ B; 1X9F C; 2ZS1 A; 4X0L B; 1HHO B; 1V75 B; 1S6A A; 1CO9 A; 3TM9 A; 2EKU A; 1O16 A; 1DLY A; 3ZOM A; 1C7C B; 5CN5 A; 2DN3 B; 2G11 A; 2MGL A; 1Q1F A; 3O89 A; 2H8D B; 1THB A; 2ZSP A; 3QJE A; 3UBV A; 4FH7 A; 4DC8 A; 1A0Z A; 3VRG A; 3MBA A; 2GRF A; 4B4Y A; 4H2L A; 1SDK B; 3BJ3 B; 3AQ8 A; 1Y8W B; 1YGF A; 4HRR B; 2G0R A; 2SPL A; 2D5Z B; 4F6F A; 1YEO A; 1BJE A; 3PT7 B; 1C7B A; 1BAB B; 4ODC A; 2HHB A; 3KMF C; 5HBI A; 2MGI A; 1BIJ B; 1T1N B; 1Y7C A; 2H8F A; 2AA1 B; 3WCT B; 1BUW A; 1BZZ B; 4WCH D; 1NPF A; 2DXM A; 1UMO A; 3K8B A; 1Y4R A; 5JOM A; 3LQD A; 3D4X B; 3WCT D; 1NIH B; 1LH1 A; 3HHB A; 1IRC A; 2ZLW A; 2SPN A; 1BZ1 A; 1EMY A; 3ZOL A; 3A59 A; 2MGG A; 1YMB A; 5JDO F; 2AV0 A; 1A3N B; 2MGF A; 3PIA B; 1LTW A; 2O5S X; 5JGG B; 3PEL B; 1Y83 A; 1MYF A; 2HZ1 A; 1CH2 A; 1O1L B; 4N7N A; 1CLS A; 3ZJM A; 1A00 B; 3WR1 A; 2GNV A; 4HBI A; 5ILR A; 1MWB A; 1Y22 A; 4GZG A; 1DWT A; 1FDH G; 2EVK A; 1QSI A; 1Y35 A; 3NML A; 2LH5 A; 1UFJ A; 5HY8 A; 3GDJ A; 3HYU B; 1XZ2 B; 4X0L A; 2G0X A; 1V75 A; 1DO7 A; 5KDQ B; 1GDK A; 4O2G A; 3BJ1 B; 3WCW C; 3IC2 B; 3S66 B; 1LFZ B; 1S69 A; 2DN3 A; 3ZJP A; 4H0B A; 1ECD A; 2R4W A; 1SPG B; 2H8D A; 1V4U B; 4DWU A; 1F5O A; 1K0Y B; 2ZS0 B; 2FRF A; 4M4B B; 1Y5K A; 3B75 B; 1SDK A; 3BJ3 A; 1NXF A; 3G4V A; 1Y8W A; 1MOB A; 5C6E B; 1M6M A; 1PMB A; 2R50 A; 2D5Z A; 1MNO A; 1DXC A; 3QM7 A; 2ZS0 D; 1HAB B; 4L2M A; 3WCU D; 3PT7 A; 5EUI B; 2HZ3 A; 4O4T A; 3VRF B; 1BAB A; 1LJW B; 3UHK A; 1BIJ A; 1T1N A; 2VLX A; 2VRY A; 2AV3 A; 1BZ6 A; 1IDR A; 3WCT A; 1O1I B; 1O1K B; 3UHG A; 2RI4 B; 5C6Y A; 1JZK A; 1LH2 A; 1COH B; 1JW8 A; 1CIO A; 1Y4P B; 3LR7 A; 5CN8 A; 4MQJ A; 5KER B; 1J3Z A; 3NMM B; 3DHR B; 3ZJL A; 3KUO A; 1NIH A; 1O1N B; 1Y4Q B; 2MYB A; 1A3N A; 1A6M A; 4AVD A; 5JGG A; 3S65 B; 1QPW B; 2Z6S A; 3QQR A; 1CBM A; 1HDA B; 1O1L A; 1O1M B; 3ASE A; 1A00 A; 4F6B A; 1B86 B; 6HBI A; 1VXA A; 1AJH A; 3K3U A; 1CG5 B; 1XZ2 A; 2BW9 M; 103M A; 4MQK B; 4U8U B; 1M9P B; 1F5P A; 2GKM A; 5KDQ A; 1JPB A; 3WCV B; 1Y46 B; 1G0A A; 3IC2 A; 1MLF A; 1J7S B; 3S66 A; 7HBI A; 1LFZ A; 3VAU A; 4SDH A; 1C7D B; 2R1H B; 4U8U D; 3LB1 A; 1SPG A; 3ONZ B; 1V4U A; 2O5Q X; 5CNC A; 1K0Y A; 3HXN B; 5CN4 A; 3EDA A; 4PQC A; 1JZL A; 1DO3 A; 3O7N A; 5HLQ A; 1OFK A; 5KKK A; 2ZS0 A; 1VXD A; 3B75 A; 3G46 A; 5C6E A; 2HBC B; 5CHQ A; 2G14 A; 1HAB A; 4ROM B; 1ABY B; 3BCQ B; 5EUI A; 3VRF A; 1LJW A; 1MZ0 A; 2ZLX B; 3D7O B; 2HBD B; 2JHO A; 1LH5 A; 3ED9 A; 3PI1 A; 1O1K A; 2QSP B; 2RI4 A; 4F6J A; 1CP0 A; 1GLI B; 5ILP A; 1UT0 A; 1COH A; 1Y4P A; 1MLG A; 2KSC A; 3NMM A; 3DHR A; 1ECN A; 2ZS1 C; 2ZSZ A; 1YIE B; 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1XZU B; 1RVW A; 1YCA A; 3HF4 A; 3ZJS A; 3G52 A; 1JP8 A; 2B7H A; 3UHV A; 1AZI A; 1Y0T A; 2V1I A; 1ECA A; 1Y8K B; 1YHR B; 4QAU A; 3S48 C; 4TYX A; 3UHE A; 2W72 A; 3QM9 A; 2DN1 A; 3AG0 A; 1KFR A; 1Y8H A; 2RAO B; 1J3F A; 3WTG A; 3UHQ A; 1A6N A; 3WCP B; 1LFY B; 1Y5J B; 1GCW A; 3ZJO A; 3AQ9 A; 1DM1 A; 2MGK A; 1YCB A; 2W6X A; 3WCT C; 3QZX A; 3IXF A; 2PGH B; 5E29 B; 1K1K B; 2R80 A; 1JL7 A; 4UIQ A; 4N8T A; 2ZFB B; 4YU3 A; 1Y4V A; 2GRZ A; 3NG6 A; 1Y45 B; 2LH7 A; 4NI1 B; 3ZJI A; 4MQI A; 1JP6 A; 3OZV A; 1YE0 A; 1AJ9 A; 1GDL A; 1IWH B; 1SWM A; 1IT3 A; 1J3Y B; 1MGN A; 1YG5 A; 1Y0C A; 3WHM A; 1OJ6 A; 2IG3 A; 3UHD A; 1MBN A; 1HBS A; 3ODQ B; 1CH5 A; 2H35 B; 2GTL D; 1XZ7 B; 2R4X A; 1BZ0 B; 1MOH A; 2HBS A; 1DKE B; 2D2N D; 1DWR A; 1Y7G A; 2BWH A; 1FCS A; 3D1A B; 2NRM A; 4MU5 A; 1XZU A; 4MQH B; 2ZT4 A; 1YHE B; 1MNI A; 2ZT0 A; 2FRK X; 1X46 A; 3CIU B; 1A0U B; 1URY A; 112M A; 1CPW A; 1GVH A; 1Y8K A; 1YHR A; 2ZS0 C; 4BJA A; 1DWS A; 2RAO A; 5EYS A; 3WCP A; 2Z8A A; 4N7O B; 1LFY A; 1Y5J A; 2ZSN A; 1HCO B; 1Y4B B; 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