The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
59
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sequence length |
153
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structure length |
153
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Chain Sequence |
GLSDGEWQLVLNVWGKVEADVAGHGQEVLIRLFKGHPETLEKFDKFKHLKSEDEMKASEDLKKHGNTNLTALGGILKKKGHHEAELTPLAQSHATKHKIPVKYLEFISEAIIQVLQSKHPGDFGADAQGAMSKALELFRNDMAAKYKELGFQG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Stabilizing bound O2 in myoglobin by valine68 (E11) to asparagine substitution.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
PROTEIN (MYOGLOBIN)
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| molecule tags |
Oxygen storage/transport
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| source organism |
Sus scrofa
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| total genus |
59
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| structure length |
153
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| sequence length |
153
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| chains with identical sequence |
B
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 1998-08-13 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1SPE A; 2W72 A; 1YE0 B; 1Y0D B; 1HBR A; 4G51 A; 3PT8 B; 1S56 A; 1R1Y A; 1O1L A; 3S65 B; 3UHK A; 2MYE A; 1O1I B; 1G9V B; 1F63 A; 1S5Y A; 5B85 A; 1MYZ A; 3VRE A; 1C7C B; 5IKS A; 1J3Z A; 1OJ6 A; 3D4X A; 1VRF A; 3HEO A; 1Z8U B; 1GZX B; 4F6G A; 1MLK A; 3PEL B; 1AJ9 B; 4ROM A; 1CPW A; 2ZLV A; 1CG5 B; 3A0G A; 1HGB A; 5EET A; 1HAB B; 1VRE A; 4N8T B; 2YRS B; 1Y83 B; 2RAO A; 1LFV A; 1NEJ B; 1YOG A; 2RI4 B; 3IC2 A; 3GYS B; 2HBD A; 1Y8K A; 2D2N A; 1CG8 A; 3EDA A; 3P5Q A; 1Y0T A; 1EWA A; 2O58 X; 1DTI A; 3WCT C; 2BK9 A; 1LUE A; 5ILM A; 1CO8 A; 1HBS A; 4PQC A; 1HV4 B; 2D5X A; 1G0B B; 1COH A; 5EE4 D; 3GQG B; 1J7Y A; 3BCQ A; 2HHB A; 3M3B A; 2MGJ A; 2FRI X; 3GKT A; 3WCT B; 4H0B A; 4ESA A; 1AJH A; 5F0B A; 3QM7 A; 3LQD A; 4IRO B; 1ABS A; 4DWU A; 2ZST A; 3WCU D; 2PGH B; 1T1N B; 1N9H A; 1YIH A; 1NPG A; 1NAZ A; 2WY4 A; 2HCO A; 2QSS B; 2V1I A; 1IBE A; 3AT5 A; 3NMM A; 3K8B B; 1H97 A; 1HDA A; 2WTG A; 1O1P B; 4NI1 B; 1HCO A; 1ABW B; 2D6C A; 5KDQ A; 1LFT A; 2AV3 A; 3DUT B; 2GNW A; 2VRY A; 2HBS B; 2FRJ X; 1W92 A; 5HLU A; 3UHY A; 1MYH A; 2EVK A; 2W6Y A; 3A59 A; 3WCW A; 1DM1 A; 2E2Y A; 1X9F C; 2IN4 A; 3G52 A; 2ZFO C; 1THB A; 2LH5 A; 1JW8 A; 3HXN B; 1MLL A; 1Y4G A; 1A6M A; 5CN4 A; 2LH3 A; 1IOP A; 3MJU A; 1SI4 B; 1OR4 A; 1WVP A; 1YE0 A; 1YEU B; 1X9F B; 4O1T A; 1Y0D A; 1NIH B; 1UC3 A; 3HYU A; 4ODC B; 3PT8 A; 2OHA A; 3S65 A; 1JWN A; 1M6C A; 3MJP B; 1O1I A; 1Y4V B; 1CH1 A; 1G9V A; 1BAB A; 2VEE A; 1DWT A; 1CH9 A; 1C7C A; 5EYS A; 2D5Z B; 2VLZ A; 3A5B A; 2JHO A; 1ASH A; 1Y0W B; 2HBC B; 1GZX A; 1MNH A; 4F69 A; 3BJ2 B; 3PEL A; 4PQB A; 1AJ9 A; 1CG5 A; 2V1G A; 1H1X A; 1CLS B; 1MOC A; 1HAB A; 4YU4 A; 4N8T A; 1MLU A; 2YRS A; 5HLQ A; 3UGZ A; 1Y83 A; 2RI4 A; 1MCY A; 1NEJ A; 2MGL A; 3GYS A; 5CND A; 3WCV D; 2LH1 A; 1FHJ B; 5ILP A; 1XQ5 A; 2SPO A; 2VLY A; 1HV4 A; 1G0B A; 1Y46 B; 3GQG A; 3MN0 A; 1N9X A; 4KMV A; 5EE4 C; 1JF4 A; 3EU1 A; 3WCT A; 1MNK A; 3AQ5 A; 3ZJM A; 2AV0 A; 1HDB B; 3A2G A; 1DXU B; 4IRO A; 1DXV B; 5E6E A; 2PGH A; 1T1N A; 2GL3 A; 1N9F A; 3BJ3 B; 3WCU C; 2QSS A; 5E29 A; 3IC0 B; 3K8B A; 108M A; 4MQC B; 1MLQ A; 2IG3 A; 1MLN A; 2V1H A; 3WCU B; 1O1P A; 4NI0 A; 2FAM A; 2ZWJ A; 3QJC B; 4NI1 A; 1ABW A; 1G08 B; 1NZ4 A; 4WJG 1; 1VXG A; 3DUT A; 2HBS A; 1AZI A; 5B84 A; 3E5I A; 2AUP A; 1DO4 A; 1GJN A; 2HZ3 A; 1SI4 A; 2ZLX B; 2W6V B; 1YEU A; 1X9F A; 2ZSQ A; 1NIH A; 5EUI B; 1HLB A; 5F2A A; 2MGM A; 1BZZ B; 3RJ6 A; 3MJP A; 1Y4V A; 1MOH A; 1MLO A; 4MQH B; 4M4B B; 2MGB A; 3PI1 A; 4G1B A; 2D5Z A; 1MTI A; 1X46 A; 3GK9 A; 1Y0W A; 2HBC A; 1GLI B; 3BJ2 A; 5CNC A; 2ZSY A; 2R80 B; 3UH3 A; 1RQ4 B; 1CLS A; 2ZT4 A; 1MYJ A; 1LH1 A; 3UHS A; 1Y4P B; 4NXA A; 1EW6 A; 2BLI A; 2ZS0 D; 1Y0A A; 1FHJ A; 1DO1 A; 1DWR A; 3WCV C; 2MYB A; 3A5G A; 1RTE A; 3B75 B; 2SPN A; 1Y0C A; 2VYW A; 4BJA A; 1VXE A; 1KD2 B; 112M A; 1BVD A; 3WCV B; 3NFE B; 1MKO B; 1S0H B; 1M6M A; 1LFY B; 1EBT A; 1HDB A; 1DXU A; 3OVU C; 1DXV A; 1MYI A; 2HBG A; 3CIU B; 3BJ3 A; 1URY A; 4HRT B; 1YMA A; 2FRK X; 2D2M D; 3IC0 A; 3BA2 A; 1VXC A; 4MQC A; 1YOH A; 3WCU A; 1YHU A; 3GDJ B; 3ODQ A; 1A4F B; 1WLA A; 3K9Z A; 1CIK A; 110M A; 1G08 A; 3WI8 A; 1MNO A; 5ILE A; 1UX9 A; 2GRZ A; 2MGG A; 3OZV A; 3UHW A; 1HGA B; 1A6N A; 1YGF B; 1BVC A; 1O1M B; 3E55 A; 4IT8 A; 1YDZ B; 2OLP A; 3OO4 A; 3ZJJ A; 4DWT A; 1M9P B; 3H58 A; 2AUO A; 2ZLX A; 3ZH0 A; 2GDM A; 3AT6 A; 3HC9 A; 2GTL B; 2VHB A; 4N7O B; 5EUI A; 1URV A; 1LH3 A; 2EF2 A; 1MWD A; 1SPG B; 1JP6 A; 1GDI A; 3HEP A; 1YHR A; 1MLS A; 1QPW B; 4MPM A; 1GBV B; 4MQH A; 1MBS A; 2ZSZ A; 2BW9 M; 4M4B A; 2QSP B; 1J3F A; 3GOU B; 4HSW A; 2GKN A; 3VAU A; 1Y5F B; 5KER B; 2G12 A; 1V5H A; 3GQP B; 5AB8 A; 3ZJH A; 2Z85 A; 1HBI A; 1GLI A; 1ECO A; 2AA1 B; 3G53 A; 2R80 A; 4MQG B; 2R4Y A; 1RQ4 A; 2DN1 B; 3ZJQ A; 1JZM A; 1OFK A; 2ZLU B; 2ZFO D; 1QXE B; 1Y4P A; 4PQ6 A; 2DC3 A; 2MYA A; 1IT3 A; 3ORD A; 1XYE A; 1MDN A; 3DHT B; 2HHD B; 1QXD B; 1YCB A; 2ZS0 C; 1CH4 A; 3B75 A; 2V1K A; 2LH6 A; 106M A; 3WFU A; 1KD2 A; 3HHB B; 3WCV A; 3NFE A; 3UHX A; 1AJG A; 2ZS0 B; 1MKO A; 1LFY A; 1BUW B; 4FH7 A; 4NXC A; 3O89 A; 1UVY A; 1Y09 B; 5HAV A; 1RQ3 B; 3CIU A; 2GKM A; 2LH2 A; 4HRT A; 1GDJ A; 1VXB A; 2MBW A; 3MYM A; 3UHN A; 1MBD A; 2NSR A; 2D2M C; 5CN7 A; 1BZ0 B; 3GDJ A; 1HBG A; 1Y35 B; 2ZT3 A; 3PI9 B; 3GLN A; 5D5R A; 5EU2 A; 4FWX A; 1LH5 A; 2D2M B; 2PEG B; 2ZT0 A; 1MLM A; 1V75 B; 3E4N A; 2DN3 B; 1NZ2 A; 1HGA A; 1YGF A; 3ZOL A; 3WFX A; 2MGF A; 1O1M A; 1UT0 A; 4KN3 A; 1HBH B; 3AG0 A; 4M4A B; 1M9P A; 4MBN A; 2NRL A; 5CNG A; 1FLP A; 1L2K A; 2HBF B; 2GTL A; 4N7O A; 2C0K A; 3V2V A; 1HHO B; 4H2L B; 2OIF A; 1SPG A; 2DXM B; 1MBN A; 2VYZ A; 1CBM A; 2H35 B; 1GBV A; 3EOK B; 2QSP A; 3GOU A; 4AVE A; 3UI0 A; 1Y5F A; 1LFZ B; 2QLS B; 1GCV B; 3ARJ A; 1FN3 B; 2AA1 A; 1NS9 B; 4MQG A; 1J7S B; 4X0L B; 1LA6 B; 3UHG A; 3UHE A; 2VLX A; 1YFF B; 2D60 B; 2ZLU A; 3MOU A; 1RPS B; 2DHB B; 2EKT A; 4MU5 A; 4F6D A; 2OH8 A; 1BZ1 B; 3D17 B; 1QXE A; 1IWH B; 2R4X A; 4VHB A; 3R5I B; 4FH6 A; 3DHT A; 4HSX A; 2HHD A; 1HAC B; 1FSX B; 1QXD A; 1FDH G; 1MNI A; 2ZFO B; 3QM8 A; 102M A; 1HBB B; 3HHB A; 2ZS0 A; 1S61 A; 2QMB B; 3QJB B; 4H07 A; 3TLD A; 2XKI A; 1J41 B; 5HBI A; 1BUW A; 4F6I A; 3MVC A; 3AQ8 A; 2GRF A; 3FS4 B; 3ED9 A; 3D7O B; 1Y09 A; 5KKK A; 1RQ3 A; 4FC3 B; 1Y8H B; 1VXA A; 1Y5K B; 1DLW A; 2MGE A; 2QU0 B; 4XS0 B; 4U8U D; 1SWM A; 3UHC A; 1Q1F A; 1QI8 B; 1BZ0 A; 1UVX A; 1I3E A; 3G4Q A; 2MGC A; 1VXH A; 1Y35 A; 4F6F A; 3WTG B; 4KMW A; 3PI9 A; 1LHT A; 4TWU A; 3ZJI A; 2XKG A; 1JZL A; 2D2M A; 2PEG A; 3S66 B; 1WMU B; 2LH7 A; 1V75 A; 4F4O B; 1MGN A; 2O5T X; 2DN3 A; 3ZJS A; 3PIA B; 2EB9 A; 3BOM B; 1XZ5 B; 1XZU B; 4HHB B; 2Z6T A; 3AQ9 A; 1HLM A; 1CQX A; 1HBH A; 2HBE B; 4M4A A; 2MGH A; 2ZT2 A; 4HRR B; 5CN9 A; 2HBF A; 1LH6 A; 4HBI A; 3GQR B; 1DO7 A; 5JGG B; 1C7D B; 1RQA B; 1HHO A; 4H2L A; 2DXM A; 1SDL B; 2GRH A; 1EMY A; 3RJN B; 1CBL A; 3WCP B; 2H35 A; 4NK2 A; 3EOK A; 1VWT B; 2QFK A; 3MKB B; 1LFZ A; 2QLS A; 1S5X B; 2V1F A; 1GCV A; 4MQJ B; 1A3O B; 3UH6 A; 5JDO F; 1FN3 A; 1FAW B; 1O1K B; 3ECZ A; 1CP0 A; 109M A; 2BWH A; 2GLN A; 1FDH A; 1V07 A; 1IRC A; 1J7S A; 4X0L A; 1LA6 A; 1JL7 A; 2MGK A; 1YFF A; 3HRW B; 2D60 A; 1O16 A; 2DHB A; 1SHR B; 4FWZ A; 1BZ1 A; 2FRF A; 3D17 A; 1IWH A; 1F5O A; 1A9W E; 3ZJP A; 1F5P A; 1GBU B; 3R5I A; 3HXN A; 1Y7G B; 3PT7 B; 3ZJN A; 1HAC A; 5JOM A; 4MQK B; 3G4W A; 2ZFO A; 5E83 B; 1YGD B; 1HBB A; 4ODC A; 1YH9 B; 3HF4 B; 2QMB A; 3QJB A; 1GDK A; 3NG6 B; 3WR1 B; 1J41 A; 3UHU A; 1IRD B; 3D1A B; 3ARK A; 3FS4 A; 2B7H B; 4OF9 A; 111M A; 1B86 B; 2ZSX A; 3UH5 A; 4FC3 A; 1Y5K A; 4L2M A; 3UHV A; 1XCH A; 2H8F B; 4XS0 A; 2W31 A; 4WCH D; 1Y85 B; 1QI8 A; 3CY5 B; 3ZJL A; 1ECD A; 3VRF B; 4TWV A; 4U8U C; 3WFW A; 3UH7 A; 3WTG A; 1BIN A; 2V1J A; 1NQP B; 3QMA A; 4MXL A; 3S66 A; 1WMU A; 1PBX B; 3LHB A; 6HBW B; 4U8U B; 4F4O A; 3KMF C; 1MTK A; 3PIA A; 1XZ5 A; 1XZU A; 1Y7Z B; 4HHB A; 1Y31 B; 4L7Y B; 5EQM A; 3SZK B; 3LB3 A; 2EVP A; 2O5O X; 1MBC A; 1NZ3 A; 3V2Z A; 3OGB A; 3QJD B; 3LB4 A; 2HBE A; 1Y46 A; 4OOD A; 5C6Y A; 4HRR A; 1MOB A; 2EKU A; 3GQR A; 5JGG A; 1O1O B; 1MLG A; 1C7D A; 1NZ5 A; 1RQA A; 4MQI B; 1SDL A; 1QSH B; 1CMY B; 5CHQ A; 3KUO A; 3UHD A; 3WCP A; 3ONZ B; 1JL6 A; 3PI8 B; 2G0V A; 3QZZ A; 3M39 A; 3UHI A; 3UHQ A; 3MKB A; 1S5X A; 1LJW B; 4MQJ A; 1A3O A; 1K0Y B; 4ZVA A; 3D4X B; 1ECA A; 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3PI8 A; 5D1V A; 1Y2Z B; 2ZSO A; 1A6G A; 5CMV A; 1Y4Q B; 1Y4B B; 2G0Z A; 2ZSN A; 1BAB B; 1JDO A; 1V9Q A; 1QSI B; 1LFL B; 3QM5 A; 4UZV A; 2R1H B; 3PI2 A; 1LJW A; 1K0Y A; 1MYM A; 1A4F A; 5HY8 B; 1JEB A; 4LPI A; 3W4U B; 1J40 A; 1NWN A; 2G10 A; 1OUU A; 2BNL A; 1XXT B; 3S1I A; 1Y4F A; 4NK1 A; 4YU4 B; 1MYF A; 4N7P B; 5JDO C; 1YDZ A; 1SDK B; 4DC7 A; 1DO3 A; 1Y7D B; 4MXK A; 1Y4R B; 2Z6S A; 5HLX A; 1NWI A; 1XZ7 B; 1XZV A; 1BBB A; 1MTJ A; 4O2G A; 1CIO A; 1J3Y B; 1XQ5 B; 1GCW B; 1HBA B; 1YZI A; 1QPW A; 1YIE A; 1X3K A; 1YG5 A; 1YVQ B; 4MBA A; 2O5B X; 3A9M A; 1XZ4 B; 1HDS A; 1Y22 B; 3EU1 B; 2HHE A; 1BIJ A; 2BKM A; 3VRG A; 3FH9 A; 1JF3 A; 5KER A; 2MHB A; 3GQP A; 1TU9 A; 1GDL A; 1NS6 A; 1G09 B; 5E6E B; 2MYC A; 1DWS A; 1YHU D; 1YOI A; 1HGC B; 3PI4 A; 1OR6 A; 3M3A A; 4O4T A; 1YHE B; 3QM9 A; 5E29 B; 2DN1 A; 1CH3 A; 4YU3 B; 1C40 B; 1ECN A; 1A0Z A; 1RVW A; 3AQ6 A; 2BLJ M; 4NI0 B; 1PMB A; 2Z6N A; 2V1E A; 3QZX A; 4O35 A; 1NPF A; 4UUR A; 3AQ7 A; 1C7B A; 1XZ2 A; 1YEQ B; 2ZLW A; 2G11 A; 1UFJ A; 2KSC A; 3QJE B; 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