The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
63
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sequence length |
153
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structure length |
153
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Chain Sequence |
VLSEGEWQLVLHVWAKVEADVAGHGQDILIRLFKSHPETLEKFDRFKHLKTEAEMKASEDLKKHGVTVLTALGAILKKKGHHEAELKPLAQSHATKHKIPIKYLEFISEAIIHVLHSRHPGDFGADAQGAMNKALELFRKDIAAKYKELGYQG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
X-ray crystal structure of the ferric sperm whale myoglobin: imidazole complex at 2.0 A resolution.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
MYOGLOBIN
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| molecule tags |
Oxygen storage
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| source organism |
Physeter catodon
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| total genus |
63
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| structure length |
153
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| sequence length |
153
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 1990-06-25 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1I3E A; 4HHB A; 5EET A; 1HCO B; 2GKM A; 2G10 A; 1RQ3 A; 3GQG B; 1FHJ A; 1MLQ A; 1MLK A; 5HY8 B; 2QSP B; 1HBA A; 5D5R A; 3G53 A; 3HHB B; 4G51 B; 3QJC B; 3M3B A; 1C7B A; 2ZWJ A; 1YEO A; 2ZSY A; 3QM5 A; 1MBS A; 3D1A B; 2HHD B; 1IWH A; 1C40 A; 3LR9 A; 3OK5 A; 3WCT A; 4L7Y A; 1RQ3 B; 1FHJ B; 4O1T A; 2ZSS A; 5EV5 A; 1Y7Z A; 3V2V A; 4HRT A; 1HGC A; 1J52 A; 1MLJ A; 1MBI A; 1O1I A; 2C0K A; 3QZX A; 5EYS A; 1YH9 A; 1KFR A; 1YMC A; 3D4X A; 1IWH B; 1A0U A; 1MNO A; 1C40 B; 1AZI A; 3VHB A; 3PI3 A; 1DWS A; 4F6B A; 3WCT B; 4L7Y B; 1UMO A; 3UHD A; 2VEB A; 4KN3 A; 1XYE A; 5CNF A; 1Y7Z B; 2VYZ A; 4HRT B; 1HGC B; 2VM0 A; 1A6K A; 2ZS1 A; 3P5Q A; 1FDH A; 3PI2 A; 1O1I B; 1LH2 A; 3O89 A; 2XYK A; 1YH9 B; 1FCS A; 2ZST A; 1BZP A; 2HBG A; 1HDA A; 1ECN A; 1A0U B; 1LH6 A; 1HBH A; 3UHG A; 1Y4V A; 3WCU C; 1XCH A; 1MLN A; 1Y4F A; 3ZJJ A; 1IRC A; 1XYE B; 1Y85 A; 2QSS B; 4N7P A; 1Y0A B; 5ILR A; 3QJB A; 2ZS1 B; 3P5Q B; 1S5Y A; 2HBC A; 1LH5 A; 5HU6 A; 2RI4 A; 1G0B B; 5C6Y A; 1VXD A; 3PI8 A; 1HDA B; 3WCW A; 5CNG A; 101M A; 1MYZ A; 3A5A A; 3AQ8 A; 1IRD A; 1Y5K A; 3PI1 A; 3SDN A; 4TWU A; 3WCV C; 3GYS A; 1Y4F B; 1Y85 B; 5EQM A; 1HJT A; 4N7P B; 4PQ6 A; 3MYN A; 4H2L A; 4OF9 A; 1S5Y B; 3UHC A; 5JDO F; 2RI4 B; 3A5B A; 2V1G A; 3PI8 B; 4F4O A; 1MNH A; 3WCW B; 2AA1 A; 3UHQ A; 4JAC A; 5EUI A; 3ZHW A; 1HAB A; 1S5X A; 1IRD B; 2QFK A; 3KMF C; 1Y5K B; 2RAO A; 2R1H A; 3GYS B; 2GNW A; 1AJ9 A; 1FSX B; 1A9W E; 1SDL B; 2ZFO C; 4H2L B; 1MYM A; 2FRJ X; 1FLP A; 3VRG A; 1YEV A; 1LFY A; 4F4O B; 5CN7 A; 2AA1 B; 3OGB A; 3WCU D; 2MGF A; 2D2M C; 5EUI B; 1HAB B; 1HBR A; 3ED9 A; 1S5X B; 2G0X A; 4NXC A; 3VRF A; 2MYD A; 2R1H B; 2SPO A; 2WY4 A; 1AJ9 B; 4XS0 A; 6HBW A; 3S65 A; 3RJN B; 3VRG B; 1YEV B; 2ZLU A; 3IXF A; 2WTG A; 2Z6N A; 3A0G B; 1DLY A; 1R1X A; 2EVP A; 3S48 C; 3ODQ A; 3WCV D; 3E55 A; 1HBI A; 2O58 X; 2ZSQ A; 4XS0 B; 6HBW B; 1THB A; 3S65 B; 1YHU C; 1XQ5 A; 3UHN A; 1Y45 A; 2ZLU B; 1GDL A; 4WCH D; 2Z6N B; 2G3H A; 1R1X B; 1F5P A; 5CN4 A; 3PT8 A; 4B4Y A; 2VLX A; 3ODQ B; 5EE4 C; 1Y09 A; 1RPS A; 2ZFO D; 2MYC A; 3G4R A; 1RTX A; 4PQB A; 1THB B; 1SDK A; 1NQP A; 3BA2 A; 3QQR A; 4HSW A; 3ZJO A; 1XQ5 B; 1Y45 B; 1YGD A; 2Z6S A; 3HF4 B; 1GDK A; 1Y7C A; 5AZR A; 2D2M D; 2BLH A; 1CO9 A; 3ORD A; 2EKU A; 2ZSP A; 3PT8 B; 1LFT A; 3UH5 A; 1G0A A; 4XDI A; 1CLS B; 2R80 A; 1Y09 B; 1HRM A; 1RPS B; 3G4U A; 2G12 A; 2FRK X; 4C0N A; 3BJ1 A; 1MTK A; 1YOG A; 1SDK B; 1NQP B; 2SPN A; 3QMA A; 3ECX A; 1YGD B; 1J7Y A; 2OH8 A; 1OFJ A; 2R4W A; 5HBI A; 2VLZ A; 1Y7C B; 1U7S A; 1M9P A; 3DUT A; 1YE2 A; 1G09 A; 3UGZ A; 4MQG B; 1GDJ A; 1LFT B; 5JOM A; 3GDJ A; 3QM6 A; 1G0A B; 3UH3 A; 110M A; 1GBV A; 2R80 B; 1C7C A; 4MPM A; 5CND A; 1MWB A; 3HRW A; 3QM9 A; 1YHU D; 2AUQ A; 3BJ1 B; 5HLX A; 1CH9 A; 1HGB A; 4NZI A; 2D2M A; 3ZOM A; 2BW9 M; 1J7Y B; 2ZT4 A; 1Y2Z A; 1MLM A; 2V1F A; 1M9P B; 1YE2 B; 1G09 B; 4G1V A; 5EE4 D; 3GQP B; 1UVY A; 3GDJ B; 1JEB B; 1GBV B; 1C7C B; 1CG5 A; 1S61 A; 3UGY A; 2O5B X; 1LH1 A; 3UHI A; 1CO8 A; 2D2M B; 4NI0 B; 3KUO A; 2AUR A; 3B75 A; 5EU2 A; 2FRF A; 2BWH A; 1LFL B; 3RGK A; 1OUU A; 2W6X A; 2MB5 A; 3QJE A; 5CN5 A; 4OOD A; 1FAW A; 2ZFB A; 2R4Z A; 2GRF A; 2IG3 A; 2D5X B; 3V2Z A; 3D7O A; 2BK9 A; 3BCQ A; 1QSI A; 1YEN A; 1FDH G; 2G0Z A; 1UC3 A; 5HLU A; 1DXU A; 3MVC A; 1BJE A; 3WFW A; 1OUU B; 2AUP A; 3WCT C; 4MQJ A; 3TLD A; 4ZVA A; 3QJE B; 3PIA A; 1S69 A; 1YHE A; 1VHB A; 1ABW A; 3WFT A; 5KER A; 2ZFB B; 7HBI A; 3UHB A; 4MQI A; 2ZT0 A; 1A3O B; 1A6G A; 1MLR A; 3R0G A; 2LH6 A; 3BCQ B; 1QSI B; 1YEN B; 4MU5 A; 1DXU B; 4HSX A; 4N7O A; 4MQJ B; 1BUW A; 3S1J A; 1NIH A; 1XZ2 B; 2MGH A; 1YEQ B; 1FN3 A; 3PIA B; 1YHE B; 3ASE A; 1ABW B; 1COH A; 5B85 A; 5KER B; 2GDM A; 3LQD A; 4MQI B; 2ZS1 C; 2WTH A; 1K0Y A; 1XXT A; 2MYB A; 2W6V A; 1HDB A; 1J7S A; 2LH2 A; 1OUT A; 102M A; 3NML A; 3D17 A; 1MLF A; 1A0Z A; 3EU1 A; 1BZR A; 2G11 A; 4N7O B; 1F63 A; 2MGI A; 1NIH B; 2DN1 A; 1GZX A; 1R1Y B; 1FN3 B; 3DHR B; 1CIO A; 3ZOL A; 1COH B; 1MLG A; 3U3E A; 1CMY B; 3WCP A; 3LQD B; 2ZSX A; 3A5G A; 1IT2 A; 2W6V B; 1YDZ B; 1HDB B; 2G0S A; 1OUT B; 3E5O A; 3GKV A; 2QFN A; 3WCT D; 3D17 B; 3WCW C; 1A0Z B; 3EU1 B; 3AG0 A; 1YOI A; 2DN1 B; 1DWR A; 1UFJ A; 3PT7 A; 1HBG A; 2VLY A; 107M A; 3UHX A; 1ASH A; 4F6J A; 3WCP B; 2ZLX A; 2HHD A; 2LH1 A; 3ZJH A; 1VXG A; 1QXE A; 4AVD A; 1NZ5 A; 1RVW A; 1CQX A; 1Y0W A; 3GKV B; 1Y35 B; 1MWD A; 3PT7 B; 4ZVB A; 5E29 A; 4YU3 A; 2ZS1 D; 5B84 A; 3QM7 A; 2ZLX B; 3WR1 A; 3WI8 A; 1MNK A; 3SZK A; 1NEJ A; 1QXE B; 2W72 A; 1NXF A; 1RVW B; 2BLI A; 2QMB B; 1SWM A; 1Y0W B; 4U8U A; 1JF4 A; 1YGF A; 2VYY A; 3ECL A; 4BJA A; 1JY7 A; 2XKG A; 1MGN A; 2LH5 A; 1Y22 A; 2ZSZ A; 1A3N A; 5E29 B; 3GK9 A; 3UHH A; 4YU3 B; 4UIQ A; 1O1L A; 1DWT A; 1EBC A; 3WR1 B; 2QU0 A; 2NRM A; 2Z6T A; 3ARJ A; 3SZK B; 1NEJ B; 2W72 B; 3WCW D; 2D2N B; 1G08 B; 3TM9 A; 2V1E A; 5ILM A; 4U8U B; 1YGF B; 1CBL A; 4O4Z A; 1JY7 B; 3VRE A; 2QSS A; 1SPG A; 1Y0A A; 1Y22 B; 1XZ7 A; 4HBI A; 4JYQ A; 1A3N B; 4M4B A; 3UHW A; 1G0B A; 3OO5 A; 1O1L B; 1YZI A; 1LH7 A; 2GTL A; 2QU0 B; 2ZLT A; 4O35 A; 1MOH A; 4NI1 B; 1VXA A; 1BZZ A; 1S0H A; 3G4Y A; 1Y4G A; 3S1I A; 1DUO A; 1VXE A; 4DWT A; 1LH3 A; 2H8D B; 3VRE B; 2VYW A; 1SPG B; 2ZLW A; 1MLH A; 1XZ7 B; 5CNE A; 1ECD A; 4F6G A; 4M4B B; 3OO5 B; 1YZI B; 2GTL B; 3G46 A; 2ZLT B; 1JP9 A; 1CH2 A; 1CG8 A; 1BZZ B; 1S0H B; 1HLM A; 1Y4G B; 4MXL A; 2FAM A; 1A9W A; 4F68 A; 1MLL A; 1MNJ A; 1FSX A; 1SDL A; 3M38 A; 1MDN A; 2ZLW B; 3HEO A; 1HLB A; 4ESA B; 4UZV A; 2O5S X; 1BZ1 A; 2MHB B; 4G1B A; 2R4Y A; 2M6Z A; 1CG8 B; 1XZV A; 1S56 A; 3UHK A; 2YRS A; 3LHB A; 1LUE A; 5EYJ A; 4MAX A; 1MOC A; 1GLI A; 1BIJ A; 1YMA A; 1URY A; 3A0G A; 2BNL A; 2MGJ A; 2KSC A; 1BZ1 B; 1DXD A; 1NZ2 A; 1ECO A; 4IRO A; 3UHZ A; 2M6Z B; 3ONZ A; 1XZV B; 2DC3 A; 3VAU A; 2YRS B; 2GNV A; 1Y0T A; 1JZL A; 1JPB A; 5CHQ A; 3UHR A; 1GLI B; 1JWN A; 2FAL A; 5MBN A; 1IDR A; 4FWY A; 1K1K A; 2AUO A; 1VRE A; 3NG6 A; 1LA6 A; 1BIJ B; 1YCA A; 2EF2 A; 1CIK A; 3UHY A; 1CH4 A; 4IRO B; 4NK1 A; 1Y7G A; 3ONZ B; 1W92 A; 3OO4 A; 1DKE A; 2O5T X; 2O5O X; 1QI8 A; 1Y4Q A; 1M6C A; 1JDO A; 1Y0T B; 3MBA A; 4KJT A; 2VHB A; 2ZS0 A; 1LTW A; 1K1K B; 3BOM A; 3NG6 B; 1LA6 B; 3HF4 A; 3LB1 A; 2SPM A; 1Y8W A; 1J3Y A; 1KR7 A; 2MGA A; 1WLA A; 1G9V A; 1EWA A; 1Y7G B; 3OO4 B; 1CLS A; 1DKE B; 1YVT A; 1QI8 B; 2O5M X; 1Y4Q B; 1FSL A; 3PI9 A; 1V4X A; 111M A; 4IT8 A; 2DN3 B; 2ZS0 B; 2ZT3 A; 3BOM B; 1GDI A; 4FC3 B; 1BZ6 A; 1Y5F A; 4WJG A; 3CY5 B; 1HDS A; 1J3F A; 1Y8W B; 1J3Y B; 3ZJR A; 1CBM A; 1YVQ A; 1ECA A; 1G9V B; 4MQG A; 2XKI A; 4MBA A; 5HLQ A; 2BLJ M; 3QQQ A; 1YVT B; 3PI9 B; 5C6E A; 1A01 A; 1V4X B; 2Z85 A; 1V4U A; 1GJN A; 3FH9 A; 109M A; 1Y4R A; 2V1K A; 3LB4 A; 1UIW B; 1Y5F B; 1DO4 A; 1HDS B; 2QLS A; 3W4U A; 1LFV A; 1XZU A; 1YVQ B; 5F0B A; 1DXT A; 3GQP A; 1YE0 A; 5CMV A; 1NZ3 A; 1JEB A; 5C6E B; 1Z8U B; 2H8F B; 1A01 B; 1RQA A; 4ROL A; 1NWI A; 1V4U B; 4F6F A; 2Z8A A; 3FH9 B; 2E2Y A; 2MYA A; 1HHO A; 1Y4R B; 1BAB A; 4NI0 A; 2NSR A; 2QLS B; 4GZG A; 2LH3 A; 1JP6 A; 3R5I A; 3W4U B; 1LFL A; 1LFV B; 1XZU B; 1DXT B; 4WJG 1; 1YE0 B; 3ZJI A; 1RQA B; 4ROL B; 3DHT A; 1UVX A; 2D5X A; 1LFQ B; 2MGK A; 2R4X A; 3UH6 A; 1HHO B; 1BAB B; 2MGC A; 2ZSR A; 2CMM A; 1JL7 A; 1VXB A; 3R5I B; 2BMM A; 1Y8K A; 3FS4 B; 5IKS A; 3MOU A; 4FWX A; 1BIN A; 3UHE A; 3AT5 A; 1A3O A; 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4QAU A; 1YFF A; 5KKK A; 1Y0C B; 2ZSN A; 2VEE A; 1KD2 A; 1LFZ A; 3UHU A; 1O1N B; 3ZJN A; 3PEL B; 2QMB A; 4F69 A; 1MOB A; 1QSH B; 1PMB A; 2DN2 B; 4LPI A; 1MBA A; 1YIE B; 1TES A; 1XZ4 B; 2H35 B; 2W31 A; 3KUN A; 1YFF B; 1MBO A; 5SW7 A; 2D5Z A; 2W6Y A; 1KD2 B; 4X0L A; 2GTL D; 1LFZ B; 2D2N A; 1G08 A; 1SPE A; 1MBC A; 1Y8I B; 2GL3 A; 1OFK A; 2MGM A; 1OBM A; 4H0B A; 1LHT A; 1MOA A; 1NWN A; 3MN0 A; 3EDB A; 4HHB B; 1QXD A; 1BVC A; 1YIH A; 2ZT2 A; 4FH6 A; 4YU4 A; 1CP0 A; 1HBA B; 4VHB A; 2D5Z B; 5SW7 B; 1SI4 A; 4X0L B; 4NI1 A; 1MLS A; 1C7D A; 1B0B A; 3G4W A; 3G52 A; 1MBN A; 1NS9 A; 3MKB A; 1C7B B; 1GCW A; 3O7N A; 2H8D A; 1YEO B; 1IOP A; 2HZ2 A; 3IA3 B; 1UX9 A; 1YOH A; 1NAZ A; 1QXD B; 3AQ7 A; 1YIH B; 1OR4 A; 1O1J A; 4YU4 B; 1LHS A; 4N8T A; 2ZS0 C; 1SI4 B; 3OZW A; 1NPF A; 2DXM A; 1A00 A; 5F2A A; 1C7D B; 3MKB B; 1NS9 B; 1IBE A; 1GCW B; 1JL6 A; 1MNI A; 4MXK A; 1DM1 A; 3D4X B; 1B86 A; 4ESA A; 3K3U A; 2BKM A; 1J7W A; 1O1J B; 4N8T B; 1Y5J A; 2MHB A; 3GKT A; 3A2G A; 1Y31 A; 3OZU A; 2DXM B; 1A00 B; 3DR9 A; 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