The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
66
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sequence length |
154
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structure length |
154
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Chain Sequence |
MVLSEGEWQLVLHVWAKVEADVAGHGQDILIRLFKSHPETLEKFDRFKHLKTEAEMKASEDLKKHGVTALTALGAILKKKGHHEAELKPLAQSHATKHKIPIKYLEFISEAIIHVLHSRHPGNFGADAQGAMNKALELFRKDIAAKYKELGYQG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Structural and functional effects of apolar mutations of the distal valine in myoglobin.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
MYOGLOBIN
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| molecule tags |
Oxygen storage
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| source organism |
Physeter catodon
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| total genus |
66
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| structure length |
154
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| sequence length |
154
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 1994-06-15 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1BZ0 B; 1MLG A; 2HBS B; 2ZFO B; 2HHE A; 2HHB B; 1LH3 A; 2BWH A; 5KDQ A; 1IDR A; 2MGH A; 2EKT A; 1Y7C B; 1SPG B; 1HAB B; 3WR1 A; 4UIQ A; 4X0L A; 1SHR B; 3BJ1 A; 1JY7 B; 1GDJ A; 3G4Q A; 1B86 B; 1Y2Z B; 2EVK A; 2MGM A; 2HBF A; 2ZWJ A; 5C6E B; 1SI4 B; 1MLK A; 2H35 B; 1GLI A; 110M A; 1Y83 B; 1VXE A; 2D2N B; 5E6E B; 1YZI A; 1G09 A; 3K8B A; 2D5X B; 3DHR A; 4OOD A; 5EET A; 103M A; 3DUT A; 2ZSN A; 3IC0 B; 3GQP A; 4N7N B; 1FHJ A; 1L2K A; 4NZI A; 5E83 A; 1C7D A; 4HBI A; 1C7C A; 2ZSY A; 2DHB A; 3A59 A; 2R1H B; 1MKO B; 3HHB B; 1JP9 A; 2SPN A; 1V4W A; 3KUN A; 1BZ1 A; 2LH5 A; 3ZJH A; 1MYJ A; 3UGY A; 1DTI A; 2QSP B; 2RI4 B; 2ZSR A; 2NSS A; 1MNJ A; 2MBW A; 4G51 B; 1BIJ B; 3M3A A; 2BLJ M; 1XZ5 A; 1ABW A; 1LFQ B; 4N7P A; 3IA3 B; 1MTK A; 1NEJ A; 3A0G B; 1WVP A; 1NQP B; 1Y35 A; 3E5O A; 2HHD A; 1MLJ A; 3ODQ B; 1CMY A; 3UHI A; 4MBN A; 1T1N A; 4MU5 A; 5CNF A; 1HDA B; 1MYG A; 3BJ2 B; 1Y85 A; 2DC3 A; 2ZFB B; 3G4U A; 1SDL B; 1IT2 A; 1LFL A; 4KMV A; 1YMB A; 4F6D A; 1ABS A; 1S61 A; 5ILE A; 3AQ6 A; 1QXD A; 2RAO A; 1G9V B; 1J3Z B; 2MYE A; 1TES A; 4N8T A; 4NI0 A; 1HLB A; 1Y4F A; 3ZJL A; 1BZ0 A; 4KMW A; 1Y4Q A; 3UH3 A; 2HBS A; 3D7O B; 3UHG A; 1MBO A; 2WY4 A; 1MTI A; 3ECL A; 2HHB A; 5B85 A; 1YVT B; 1MWD A; 2ZSP A; 1K1K B; 2EKU A; 1MTJ A; 1HAB A; 5EUI A; 3EDA A; 2E2Y A; 4WCH D; 3UH7 A; 1IWH B; 2SPM A; 1DO4 A; 3WI8 A; 1B86 A; 1Y2Z A; 1Y4P B; 1JZM A; 5C6E A; 2G3H A; 1LFZ A; 1HBA B; 2H35 A; 3WCT C; 3OO4 B; 1RQA B; 1Y83 A; 3MKB B; 2VYW A; 3IXF A; 1VXD A; 1R1X B; 3K9Z A; 2D2N A; 5E6E A; 3QQR A; 1VWT B; 1LFY A; 1D8U A; 3QM7 A; 5D1V A; 1VXB A; 3OVU C; 3A5B A; 2GNW A; 1CBL A; 3QJC B; 3IC0 A; 1G08 B; 1JWN A; 1Y7Z B; 3ZJQ A; 1CIO A; 4C44 A; 4TYX A; 1XZ2 B; 4N7N A; 2AUP A; 4L7Y A; 4F68 A; 1YGF B; 5KER B; 1A3N B; 1J7W A; 3WFU A; 2JHO A; 4PNJ A; 2R1H A; 1MKO A; 1KD2 B; 3HHB A; 1Y0A B; 3M39 A; 1JL6 A; 3GQR B; 1YE2 B; 2GRH A; 1HHO B; 4F6B A; 2Z6S A; 4G51 A; 1BIJ A; 3LB3 A; 3ORD A; 3UHE A; 2PEG B; 1COH B; 4O35 A; 1XY0 A; 3PI4 A; 3HRW B; 1NQP A; 1YEU B; 2D60 B; 2ZLX A; 2GTL C; 2BW9 M; 2ZS0 C; 3WCU C; 2G10 A; 3W4U B; 1M6M A; 4TWU A; 3BJ2 A; 3UHV A; 1CH5 A; 1LFV A; 2ZFB A; 1Y0C B; 1G0B A; 4U8U C; 1Y0D B; 2LH6 A; 4SDH A; 2MGA A; 2MGB A; 5JDO C; 1IT3 A; 1G9V A; 1J3Z A; 1RTX A; 3NG6 B; 1Y45 B; 5EYS A; 1F65 A; 1GBV B; 4VHB A; 3O89 A; 1QSI B; 3ZHW A; 1NZ2 A; 3D7O A; 2G0X A; 1GCW B; 3G4W A; 1YVT A; 5EE4 C; 2Z85 A; 1DXV B; 2G14 A; 1V4U B; 2D2M C; 1S5Y A; 1BZZ B; 2NRL A; 1NZ3 A; 3MBA A; 1CH1 A; 3MJP B; 1Y4P A; 1JEB B; 4YU4 A; 1X9F C; 1HBA A; 4BJA A; 1SDK A; 2VLX A; 2QFK A; 2ZSS A; 1A6M A; 3OO4 A; 1A00 B; 1YDZ B; 2ZST A; 1EW6 A; 1J40 B; 2R50 A; 1VWT A; 2MGE A; 5JOM A; 2MYD A; 3ZJR A; 1S0H B; 3QJC A; 2VRY A; 1M9P A; 3ZJI A; 1JZK A; 1G08 A; 1Y7Z A; 1YHR B; 3S1J A; 1XZ2 A; 2IN4 A; 1MLL A; 1O1N B; 1YGF A; 4O4T A; 1A3N A; 1S6A A; 2HBE B; 4MQG A; 1BJE A; 2MYA A; 2G0V A; 1KD2 A; 3GQR A; 1VXC A; 1Y46 B; 1FDH G; 3ZH0 A; 1HHO A; 3S66 A; 1S69 A; 3B75 B; 1ECN A; 2ZT3 A; 4MXL A; 2V1G A; 102M A; 2MGC A; 1JL7 A; 3GDJ A; 1COH A; 2O5Q X; 3HRW A; 1YEU A; 1YGD B; 2HHE B; 2D60 A; 1MOB A; 3U3E A; 1BBB A; 3W4U A; 2D2M D; 3AQ8 A; 1ASH A; 3NMM B; 4ODC B; 1UT0 A; 1X3K A; 2IG3 A; 2FRJ X; 2ZFO C; 1Y0C A; 2VEE A; 3HYU B; 1U7S A; 1MYI A; 1Y0D A; 1J3F A; 3SDN A; 1X9F D; 1BVD A; 1YVQ A; 2EB9 A; 5EU2 A; 2MB5 A; 1GLI B; 2EB8 A; 1F5P A; 3PT7 B; 1Y5K B; 1Y0T B; 1GBV A; 1J41 A; 1YZI B; 3PEL A; 1MZ0 A; 4DWU A; 3AT5 B; 2XKG A; 2ZT4 A; 4MXK A; 1VXH A; 3VRG B; 1MYZ A; 3MYM A; 1GCW A; 1DUO A; 3DUT B; 1Y7G A; 1NIH A; 1CQ2 A; 2D2N C; 3QJB B; 1O1P B; 3GQP B; 1XYE B; 1V4U A; 5EQM A; 1YOH A; 3HC9 A; 1FHJ B; 5E83 B; 1HBH A; 1HV4 A; 1JEB A; 2Z6N B; 1UFP A; 1YEV B; 3A59 B; 2CMM A; 111M A; 4WJG A; 2AUO A; 3DR9 A; 1V4W B; 1A00 A; 3UI0 A; 1YDZ A; 1UVX A; 1KR7 A; 5HLX A; 3ED9 A; 2HBD B; 3QZX A; 3NML A; 2XKH A; 2ZS1 B; 3SZK A; 5B84 A; 1XZ5 B; 2ZLV B; 1RTE A; 1NEJ B; 3CY5 B; 1IBE B; 2B7H B; 1BUW A; 2BMM A; 3MJU A; 1ECD A; 1XZU B; 4ILZ A; 1O1N A; 3LB1 A; 1Y31 A; 1Y85 B; 1XXT B; 5MBA A; 1HDS A; 1LFL B; 1J7S B; 1VXG A; 5EV5 A; 1RVW A; 2HZ2 A; 1A0Z B; 3B75 A; 5IKS A; 1MOH A; 3PI3 A; 3NFE B; 4N8T B; 1HCO B; 1PBX B; 4NI0 B; 1N9H A; 1MCY A; 1AJ9 B; 1A4F B; 1DO7 A; 1Y4Q B; 4UUR A; 1YGD A; 4KN3 A; 1CG8 A; 1F63 A; 1WMU B; 3TM3 A; 1JZL A; 2D2N D; 4DC8 A; 2ZSO A; 1LH2 A; 2DN2 B; 5EUI B; 5D5R A; 5ILP A; 3NMM A; 5JDO E; 4ODC A; 4ROM B; 5HLU A; 4TWV A; 2HZ3 A; 1Y01 B; 4JAC A; 3HYU A; 3LR7 A; 109M A; 3D4X B; 1R1Y B; 1M6C A; 1G0A B; 1YH9 B; 3ZOL A; 1XZV B; 1MOC A; 1MNH A; 3R0G A; 1LFZ B; 1OFK A; 1Y8H A; 3LQD B; 1LHT A; 3OZU A; 1XZ7 A; 3PT7 A; 3D17 B; 3IC2 B; 1Y5K A; 1Y0T A; 4NXC A; 3UHB A; 1LFY B; 3AT5 A; 3G4Y A; 3QQQ A; 1HBS B; 3VRG A; 2NRM A; 3UBV A; 1NZ4 A; 3UHW A; 108M A; 4F6G A; 3EOK A; 3QJB A; 1O1P A; 1QSH B; 1XYE A; 2HZ1 A; 4L7Y B; 1MNI A; 5ILM A; 5HU6 A; 1YHU B; 1J7W B; 4LPI A; 4AVE A; 2Z6N A; 1URV A; 2G11 A; 1YEV A; 106M A; 5AB8 A; 1A9W E; 2XKI A; 4OF9 A; 1BIN A; 2HCO A; 4H2L A; 1I3D A; 2HBD A; 3ARJ A; 2OH9 A; 2ZS1 A; 2ZLV A; 1UVY A; 4HSX A; 3CY5 A; 1XY0 B; 1LH7 A; 1IBE A; 2B7H A; 3GOU A; 7HBI A; 3RGK A; 1MGN A; 1YIH B; 2ZLX B; 1LHS A; 1XZU A; 1YCB A; 2MGJ A; 4FWY A; 2VM0 A; 1LFV B; 3D1A A; 1XXT A; 3GYS A; 1G0B B; 1J7S A; 1Y22 A; 2LHB A; 1CQX A; 2AUQ A; 3UHC A; 5SW7 B; 1DWR A; 5EYJ A; 1HGB B; 2LH7 A; 1A0Z A; 2R80 A; 3AG0 A; 2W72 B; 1DO3 A; 1JDO A; 1S5X A; 3UHH A; 3NFE A; 1HCO A; 1PBX A; 1RQ3 B; 2Z8A A; 1AJ9 A; 1A4F A; 2EF2 A; 1Y4G B; 3WCV B; 1UFJ A; 1WMU A; 2ZLW B; 3LR9 A; 4MQK B; 3UHQ A; 1DXC A; 105M A; 1O1O B; 1MLF A; 2DN2 A; 1Y4B A; 4MQJ B; 5F2A A; 4ROM A; 5C6Y A; 1S5Y B; 4FH6 A; 1QXE B; 2MYC A; 3D4X A; 1R1Y A; 2O5M X; 4M4B A; 1UIW B; 1G0A A; 1YH9 A; 5CHR A; 4YU4 B; 1XZV A; 1SDK B; 3WFT A; 3LQD A; 3D17 A; 3IC2 A; 1MBC A; 3HEO A; 2Z6T A; 1I3E A; 3G46 A; 2O58 X; 1HBS A; 3G4V A; 3S1I A; 4QAU A; 3QJE B; 1A01 B; 1M9P B; 1HBR A; 1QSH A; 3OZV A; 2OH8 A; 2M6Z A; 1A0U B; 2MYB A; 2H8F B; 1Y5F B; 1QPW B; 1Y8K B; 3AQ5 A; 2ZLT B; 4XDI A; 1GDI A; 1YHU A; 4MQG B; 2O5S X; 5JGG A; 1V5H A; 1GDK A; 4IRO B; 1YIE B; 3RJN B; 3S66 B; 4MQI A; 1UX9 A; 1VRE A; 1NWN A; 3GDJ B; 2D5Z B; 1HSY A; 1YFF B; 3ZJO A; 1YIH A; 1MLS A; 5HLQ A; 1FSX B; 3WFX A; 1AZI A; 1HBB A; 1BBB B; 1MOD A; 1RSE A; 1GZX B; 1K0Y B; 1Z8U B; 2R4Y A; 2QMB A; 5HY8 B; 1YVQ B; 5SW7 A; 3GK9 A; 1NS9 B; 1HGB A; 1CO9 A; 1LFT B; 5EOH A; 2W72 A; 3BCQ A; 1OR4 A; 1FDH A; 2V1I A; 1J41 B; 1Y8W B; 3PEL B; 1RQ3 A; 4ROL A; 2G0R A; 2PGH A; 1MNK A; 1O1M A; 3HXN A; 1Y4G A; 5E29 B; 3WCV A; 1CP0 A; 1Y7G B; 2ZLW A; 1NIH B; 3V2V A; 1NS6 B; 4MQK A; 1O1O A; 1Y09 A; 4MQJ A; 1J7Y B; 1MYT A; 1HBH B; 1HV4 B; 1QXE A; 1ECA A; 1MBS A; 1UIW A; 3FS4 B; 1HBI A; 104M A; 112M A; 5CNG A; 1DWS A; 5CMV A; 2NX0 A; 2O5L X; 4B3W A; 2ZSQ A; 3WCT B; 2OIF A; 3GKT A; 1A6N A; 3WFW A; 1MOA A; 2VYZ A; 5MBN A; 3SZK B; 2QSS B; 2MGI A; 4DWT A; 1YG5 A; 3QJE A; 1A01 A; 1MLR A; 6HBW B; 1BUW B; 3MJU B; 3BOM A; 1MBD A; 1A0U A; 3M38 A; 3GQG A; 2H8F A; 1MLN A; 1Y5F A; 1QPW A; 4O2G A; 1Y8K A; 1Y31 B; 2ZLT A; 4MQC B; 1EBT A; 4L2M A; 3MOU A; 5AZR A; 3LB4 A; 1HDS B; 3A2G A; 1YMC A; 2GLN A; 1RVW B; 1F5O A; 3PI9 A; 4FH7 A; 3P5Q A; 1DM1 A; 4IRO A; 1YIE A; 1MWB A; 3UHU A; 4JYQ A; 4F4O B; 1WLA A; 5CNE A; 2D5Z A; 3ECZ A; 5CN4 A; 1CG8 B; 1YFF A; 3QM6 A; 3VAU A; 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1YHE A; 2GTL A; 3GLN A; 2W6Y A; 5M3S A; 2ZS0 A; 3PI8 A; 1DKE B; 1Y4B B; 3WCU A; 1JP6 A; 5CNC A; 1SPE A; 3D1K A; 4G1B A; 5JDO F; 4M4B B; 1ABY B; 2MGK A; 4ESA A; 1A3O A; 3BJ3 A; 4U8U A; 3PIA B; 3ASE A; 3ARL A; 2VYY A; 3PT8 A; 3CIU A; 1YHU D; 3E5I A; 3WTG A; 2AV3 A; 1HDB A; 2W6V B; 1HAC B; 4WJG 1; 4MQH A; 1S56 A; 5CN6 A; 2ZLU A; 2BKM A; 3WCW A; 1O1K B; 1Y4V B; 1HBR B; 4NK1 A; 4DC7 A; 2M6Z B; 1YEN A; 3S65 A; 1O1L A; 1LJW A; 1Y8I A; 2D2M A; 3OZW A; 1CH3 A; 3O7N A; 1X46 A; 3OO5 A; 2LH2 A; 3ECX A; 1X9F A; 4M4A B; 3NL7 B; 5JGG B; 1XZ4 A; 1C7B B; 1VXF A; 3WHM A; 1IRD A; 3UGZ A; 4MQI B; 2BLI A; 1H97 A; 1OFJ A; 1YOG A; 3DHT A; 1A9W A; 1DXD A; 4NI1 A; 3EU1 B; 3QJD A; 1THB A; 2QLS A; 2G0S A; 2C0K A; 1NAZ A; 2DN1 A; 1CG5 B; 2D6C A; 2R4W A; 1MNO A; 2DN3 A; 1LA6 B; 1HBB B; 1JF3 A; 2O5B X; 1V4X A; 3MVC A; 2W6W A; 1CH9 A; 3AT6 B; 3WCV D; 1OUU A; 1BAB A; 4IT8 A; 1Y7D A; 3S48 C; 4XS0 A; 2QMB B; 3KUO A; 1GJN A; 1RPS A; 4HRR B; 1DLW A; 4MPM A; 1CP5 A; 1MWC A; 3R5I A; 5CND A; 1C40 B; 1Y4R A; 3E4N A; 3BCQ B; 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