The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
66
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sequence length |
154
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structure length |
154
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Chain Sequence |
MVLSEGEWQLVLHVWAKVEADVAGHGQDILIRLFKSHPETLEKFDRFKHLKTEAEMKASEDLKKGGVTVLTALGAILKKKGHHEAELKPLAQSHATKHKIPIKYLEFISEAIIHVLHSRHPGNFGADAQGAMNKALELFRKDIAAKYKELGYQG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
High-resolution crystal structures of distal histidine mutants of sperm whale myoglobin.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
MYOGLOBIN
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| molecule tags |
Oxygen storage
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| source organism |
Physeter catodon
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| total genus |
66
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| structure length |
154
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| sequence length |
154
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 1994-12-01 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1M6C A; 3GQG A; 2ZS1 D; 2MGL A; 1VXD A; 1XZU B; 4H2L A; 1O1O B; 1EW6 A; 1J7Y A; 1X9F A; 3OGB A; 4L2M A; 2LH6 A; 1LFV B; 3A5A A; 3HF4 B; 4FH6 A; 4TWV A; 2MGJ A; 3LQD B; 1GJN A; 3ECZ A; 5CNF A; 1LFT A; 2H8D A; 1OR4 A; 2WY4 A; 4L7Y A; 2MGG A; 1BBB A; 1CG5 B; 1AZI A; 1XZV B; 1XZU A; 1DO7 A; 3QZZ A; 3QJC B; 2R4Z A; 3BJ3 B; 5E83 A; 2MGK A; 1FSX B; 2VHB A; 2GTL C; 4ESA B; 108M A; 3HF4 A; 2R80 B; 4YU3 B; 2PEG A; 1Y5F A; 1DXT B; 2MB5 A; 2VEB A; 1MWC A; 1M6M A; 4PQB A; 3WFT A; 1XZ5 B; 2AV0 A; 2G0R A; 3PT8 B; 3GKV B; 3BJ3 A; 1O1J A; 1YH9 B; 1NZ5 A; 3M39 A; 2DN1 B; 4ESA A; 5B84 A; 3UHQ A; 4FWX A; 3S65 A; 4FWZ A; 3G53 A; 3UHH A; 1DXT A; 3AQ8 A; 4NI0 A; 2WTG A; 1WLA A; 1U7R A; 3S66 B; 3PT8 A; 3GKV A; 3UBV A; 1YCA A; 1YOI A; 1LFL A; 3OZV A; 3ODQ B; 1FDH G; 2KSC A; 1JF4 A; 1FCS A; 2DN1 A; 2QU0 B; 1JL6 A; 3MKB A; 3AT6 A; 1R1Y B; 3D7O A; 2HHB B; 3MYM A; 1X9F C; 4M4B A; 1YHE B; 3FS4 A; 1OFJ A; 3VHB A; 3ODQ A; 2HBE B; 5D5R A; 1MTK A; 2GNW A; 3E5O A; 2B7H B; 1YOH A; 2HHB A; 5KKK A; 5AZR A; 5SW7 B; 2H35 B; 1YHE A; 4N7N B; 1HBG A; 4ROL B; 1HJT A; 1Y45 B; 1BAB A; 5F2A A; 2HBE A; 3D1K B; 1HGC B; 2GRF A; 3IC2 A; 1ECO A; 1YHU B; 1HAB B; 2D2N D; 5SW7 A; 2H35 A; 2QSS A; 1A0U B; 2HBS B; 4HRT A; 4N7N A; 2MYD A; 1A00 B; 1G9V B; 3A59 B; 2BK9 A; 1W92 A; 4ROL A; 1Y45 A; 3UHS A; 1MNK A; 1HDB A; 2G10 A; 2O5L X; 3U3E A; 2DN2 B; 3D1K A; 1A6K A; 1HGC A; 4WCH D; 1CG8 A; 1Y8W A; 1CH4 A; 5AZQ A; 1G08 B; 1YHU A; 5EET A; 3AQ6 A; 2O5T X; 4O2G A; 1HAB A; 1I3D A; 5JOM A; 5E29 B; 3PI9 A; 1A0U A; 2HBS A; 1G9V A; 3A59 A; 2W6X A; 3BJ2 A; 2D5Z B; 1GCV B; 3GQP B; 106M A; 2DN2 A; 1NPF A; 1EWA A; 3UHE A; 2XKG A; 3WR1 B; 2BLI A; 1DTI A; 1BIJ A; 1LTW A; 5HU6 A; 1MBN A; 2VRY A; 3HRW A; 1MOC A; 5E29 A; 1GCW B; 2ZST A; 2D2N A; 3UHR A; 112M A; 1IT3 A; 1MTI A; 2D5Z A; 1GCV A; 3GQP A; 3ZJS A; 2ZT4 A; 1Y4Q B; 2GKN A; 3NG6 A; 2LHB A; 2MGB A; 4NK1 A; 1GCW A; 1MLL A; 2SPM A; 1YFF B; 1BZR A; 5IKS A; 1CMY A; 1J7S B; 3K3U A; 5C6E A; 1JF3 A; 3OK5 A; 1A0Z B; 1C7D B; 1Y4Q A; 3D4X B; 3PI2 A; 2FAL A; 2V1J A; 1WMU B; 2BLH A; 2PGH B; 1DUK A; 2FAM A; 105M A; 3AQ7 A; 1YEU B; 1UC3 A; 102M A; 5CND A; 1QI8 A; 1J7S A; 1CH3 A; 3LB1 A; 5EYJ A; 4X0L A; 3A0G B; 1YHU C; 3W4U B; 1RPS B; 5CNE A; 1A0Z A; 2HHD B; 1C7D A; 3G4V A; 1I3E A; 3D4X A; 3D1A B; 2ZSZ A; 1WMU A; 2O5B X; 1GZX B; 1BJE A; 3S1J A; 3BJ1 B; 1JDO A; 1YEU A; 1CPW A; 1Y0C A; 1QPW A; 2AUQ A; 3ZHW A; 1V5H A; 3O89 A; 2LH3 A; 1YE0 B; 1HBA B; 1BZ0 B; 3A0G A; 1RPS A; 2RAO B; 5EOH A; 1GZX A; 2D2M C; 2NSS A; 3BJ1 A; 4ROM B; 1C40 B; 1SI4 A; 1VXA A; 1IWH A; 1O1I B; 5ILR A; 1YGF B; 1HBA A; 1BZ0 A; 4H07 A; 3EDA A; 1MNI A; 2RAO A; 3UHI A; 4DWT A; 1VWT B; 2HBF B; 2HCO B; 1YZI B; 3WFU A; 2G0Z A; 3ZOL A; 4ROM A; 4AVE A; 2VM0 A; 4NK2 A; 3LB4 A; 1HCO B; 2QFN A; 3BA2 A; 2NX0 A; 1O1I A; 5HY8 B; 4IRO B; 1J7W B; 1LUE A; 1VXH A; 2ZSR A; 1VWT A; 1OUU B; 1YZI A; 3DHR B; 1XY0 B; 1LFZ B; 3WI8 A; 2M6Z B; 3SZK B; 2FRI X; 1HCO A; 1MOD A; 2D60 B; 3PI8 B; 1CBM A; 3SDN A; 4IRO A; 4G51 B; 1A01 B; 1Y7Z A; 1LH7 A; 1J7W A; 2OLP A; 3LR9 A; 2AUO A; 3H57 A; 1Y0W B; 1THB B; 2ZT2 A; 4O4Z A; 3ZJI A; 3DHR A; 3WCV C; 1LFZ A; 1Y4R B; 2M6Z A; 3SZK A; 3HEO A; 3MJP B; 1NZ4 A; 2GTL B; 4DC8 A; 1CLS B; 3TM3 A; 2D60 A; 1HBI A; 1OJ6 A; 1MCY A; 1A01 A; 6HBW B; 1HAC B; 1SDL B; 1JP9 A; 1Y0W A; 4UZV A; 1QSH A; 2LH1 A; 1UIW B; 3OO4 B; 4NXA A; 3MJP A; 1G0A B; 5CMV A; 2GTL A; 3QJD B; 1QSI B; 2EF2 A; 2V1G A; 2GL3 A; 2HBG A; 1JW8 A; 2V1H A; 1H1X A; 6HBW A; 1ASH A; 1K1K B; 1X9F D; 1DXU B; 1HAC A; 3WTG B; 1SDL A; 1Y22 B; 1MLN A; 3WCT B; 1CQX A; 2YRS B; 3NL7 B; 1UIW A; 1EBT A; 1YHR B; 3OO4 A; 1YEO A; 1G0A A; 2GLN A; 2DN3 B; 3QJD A; 3G4R A; 2R4W A; 1Z8U B; 4MQG B; 2MGI A; 1O1M B; 1ABY B; 1K1K A; 1LFY A; 1OUT B; 3WTG A; 1N9X A; 5JDO D; 1Y22 A; 2WTH A; 2MGE A; 3NL7 A; 1S69 A; 2YRS A; 3TLD A; 3QJE B; 2QFK A; 1SWM A; 1YHR A; 1HBH B; 2DN3 A; 3M3B A; 4O35 A; 3UHD A; 1OFK A; 4F6I A; 2BNL A; 1S56 A; 4MQG A; 1O1M A; 1FHJ B; 4MBN A; 1ABY A; 1Y0T A; 1OUT A; 1N9I A; 4G1V A; 1MOA A; 4MBA A; 3QJE A; 2XYK A; 3KUN A; 2Z6S A; 4ILZ A; 3WCW B; 1HBH A; 3AT5 A; 3NMM B; 4NI1 B; 3ZJR A; 1H97 A; 3QQR A; 4HSW A; 3OZU A; 3QM7 A; 1FHJ A; 2MYA A; 5CNG A; 1VXE A; 4ZVA A; 3S1I A; 2C0K A; 3WFW A; 1JP6 A; 1MWD A; 5M3S A; 2V1I A; 1O1O A; 3HYU B; 1VRE A; 2BKM A; 2BW9 M; 1LFV A; 4FH7 A; 3WCW A; 3RJN B; 3NMM A; 4NI1 A; 2ZS0 C; 3WHM B; 4OF9 A; 3LQD A; 1BZ1 B; 2GNV A; 3PIA B; 2ZSS A; 3LB2 A; 3OVU C; 3HEN A; 1CG5 A; 4B4Y A; 1GDL A; 1XZV A; 3QJC A; 3UGY A; 1MLQ A; 2R4Y A; 1Y31 B; 3HYU A; 1FSX A; 4MPM A; 3SDH A; 2OHB A; 1RQ3 B; 1C7C B; 1Y46 B; 3HEP A; 1MBA A; 2R80 A; 3WHM A; 4YU3 A; 3PIA A; 1A3O B; 1CIO A; 3G46 A; 4F69 A; 3GKT A; 1DTM A; 2ZFB B; 1A3N B; 3WCT C; 1XZ5 A; 4MQJ B; 1J3Z B; 1KR7 A; 1J40 B; 2W6Y A; 1YH9 A; 4MQC B; 3UH6 A; 1C7C A; 1Y46 A; 2DXM B; 1YIE B; 2EKT A; 2V1F A; 1A3O A; 1YEN B; 2H8F B; 1Y7G B; 3UHY A; 2HHE B; 1B86 B; 2QSP B; 1HGB B; 1V4X B; 3S66 A; 2ZFO B; 3ED9 A; 1MYM A; 1J3Z A; 3CY5 B; 1J40 A; 4MQC A; 1XZ4 B; 1HBB B; 4F6B A; 1QXE B; 2QU0 A; 2DXM A; 4M4A B; 1Y7D B; 2ZT1 A; 1YIE A; 4HHB B; 3G4U A; 1YHU D; 1JEB B; 1RVW B; 1DWS A; 1YEN A; 2MGD A; 3R0G A; 3UHX A; 1O1P B; 1R1Y A; 2EB9 A; 1MBD A; 3M38 A; 2ZSQ A; 1B86 A; 4HRR B; 2QSP A; 1HGB A; 1V4X A; 2CMM A; 1F65 A; 1GLI B; 3CY5 A; 5CN8 A; 3WCW C; 3ORD A; 3LB3 A; 5CNB A; 1HBB A; 1QXE A; 1LHT A; 4M4A A; 3IC0 B; 3ZJO A; 1S5X B; 1Y4P B; 4TYX A; 1G09 B; 1YG5 B; 1RVW A; 1O1P A; 5F0B A; 1DWR A; 2B7H A; 4HRR A; 3ZJQ A; 4LPI A; 1J3Y B; 3VAU A; 1URV A; 1GLI A; 1S5Y B; 5ILP A; 1KD2 B; 4N7P B; 3ZJJ A; 1J52 A; 4MQH B; 5KER B; 1JWN A; 1Y4P A; 3ZOM A; 2W72 C; 1MGN A; 1G09 A; 1YG5 A; 4O1T A; 1MLM A; 1DO1 A; 1XCH A; 1V75 B; 2ZLT B; 2D2M B; 1F5O A; 1A00 A; 1KD2 A; 4N7P A; 1QXD B; 4MQH A; 1YE2 B; 5KER A; 1N9F A; 1DXD A; 1Y01 B; 1LH1 A; 1G08 A; 5EE4 C; 1UFJ A; 1Y0A B; 2QLS B; 4XDI A; 1CH1 A; 5CHQ A; 1Y4V B; 1V75 A; 1VHB A; 2ZLT A; 1IRD B; 2D2M A; 2VYY A; 1XXT B; 1QXD A; 1GDK A; 1MLJ A; 3G4Q A; 1X3K A; 4F4O B; 3WFX A; 2IN4 A; 3WR1 A; 4DWU A; 4AVD A; 4F68 A; 2XKH A; 1A6N A; 1Y0A A; 2QLS A; 2ZFO C; 4C0N A; 1Y5J B; 1MNO A; 1O1N B; 1Y4V A; 4MXL A; 1NAZ A; 4KN3 A; 1Y7C B; 1XXT A; 1Y5K B; 5HBI A; 3MYN A; 3UH5 A; 3QJB B; 1UMO A; 4UUR A; 1JZL A; 1BVD A; 3UHW A; 5HAV A; 1SDK B; 1MYG A; 1C7B B; 4U8U B; 1O1N A; 1YFF A; 3WCV B; 1JP8 A; 1Y7C A; 1Y5K A; 2GRZ A; 5EU2 A; 1MLG A; 5KDQ B; 1MYF A; 3LHB A; 4OOD A; 1LH3 A; 3UHZ A; 2W6V B; 2PGH A; 4C44 A; 6HBI A; 1SDK A; 2VYZ A; 1C7B A; 4U8U A; 1DXC A; 3WCV A; 3ASE A; 2HBC B; 2NRL A; 1J41 B; 1CH7 A; 1NGK A; 5KDQ A; 2OHA A; 5ILE A; 110M A; 1S61 A; 3IA3 B; 3V2V A; 3W4U A; 1FSL A; 2HHD A; 1YVT B; 3D1A A; 2Z6N B; 2Z85 A; 3MVC A; 1RQ4 B; 4WJG 1; 1V4U B; 1Y8I B; 3UHT A; 1NWN A; 4NS2 A; 2DHB B; 3ECL A; 2HBC A; 4NZI A; 1N9H A; 5CN9 A; 1J41 A; 1BZZ B; 1YEQ B; 1YE0 A; 2G3H A; 4H0B A; 101M A; 1HGA B; 1XZ2 B; 5E6E B; 2GDM A; 3BOM B; 3EU1 B; 2Z8A A; 4BJA A; 1LH5 A; 1G0B B; 1D8U A; 1V4U A; 1Y8I A; 3KUO A; 4KMW A; 1MWB A; 2ZSN A; 4MQK B; 2DHB A; 1SHR B; 1JL7 A; 3QM5 A; 1C40 A; 3A5B A; 1YEQ A; 1YGF A; 1MNH A; 1XYE B; 1MLK A; 5E6E A; 3BOM A; 3DUT B; 3EU1 A; 1TES A; 1HDS B; 1NWI A; 5MBN A; 3PI3 A; 1G0B A; 2HBF A; 3O7N A; 1OBM A; 2HCO A; 2ZLX B; 3UH3 A; 2GKM A; 1MDN A; 3QM6 A; 2HZ2 A; 2GTL D; 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1J7Y B; 1RTX A; 2ZLW B; 1B0B A; 4VHB A; 1WVP A; 1NQP B; 1HBS B; 4FWY A; 1NS6 B; 1VXB A; 2O5M X; 2VLY A; 1LFT B; 2H8D B; 4L7Y B; 3HC9 A; 3AQ5 A; 3GLN A; 5CHR A; 2EVK A; 1DXV A; 3GOU A; 1AJ9 A; 4MQI A; 1F63 A; 5E83 B; 1NEJ B; 2HZ1 A; 2ZLW A; 1DM1 A; 3WCU C; 1NQP A; 1HBS A; 3E5I A; 1DLW A; 3UH7 A; 1YOG A; 1NS6 A; 3GYS B; 1MYZ A; 4F6F A; 3A9M A; 3UHN A; 2PEG B; 1Y5F B; 1Y09 B; 2MGA A; 2ZWJ A; 5ILM A; 1O16 A; 5EE4 D; 5C6Y A; 2W72 B; 2ZS1 B; 1NZ3 A; 2GRH A; 1NEJ A; 1O1J B; 1MLH A; 3QMA A; 2G14 A; 1IDR A; 3GYS A; 3S65 B; 1CQ2 A; 3DHT B; 1Y09 A; 4NI0 B; 1FN3 B; 1BZ1 A; 1MNJ A; 1EMY A; 5JDO E; 1HRM A; 1NIH B; 4O4T A; 1OR6 A; 2XKI A; 2ZFO D; 2W72 A; 2ZS1 A; 3B75 B; 1LFL B; 1RTE A; 1LJW B; 1Y31 A; 3MKB B; 5AB8 A; 1RQ3 A; 1MLO A; 3AT6 B; 3DHT A; 3A2G A; 1FN3 A; 3D7O B; 2MYB A; 1NIH A; 4M4B B; 5EUI B; 3FS4 B; 3B75 A; 2ZFB A; 2EB8 A; 1A3N A; 2MGM A; 5HLU A; 4MQJ A; 1S0H B; 1LJW A; 2BLJ M; 1Y8H B; 1ECN A; 1YVQ B; 2NRM A; 3A5G A; 1AJG A; 2H8F A; 1LH2 A; 1Y7G A; 2ZLV B; 1BZ6 A; 111M A; 1FAW B; 1DKE B; 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