The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
62
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sequence length |
154
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structure length |
154
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Chain Sequence |
MVLSEGEWQLVLHVWAKVEADVAGHGQDIYIRLFKSHPETLEKFDRFKHLKTEAEMKASEDLKKQGVRVLTALGAILKKKGHHEAELKPLAQSHATKHKIPIKYLEFISEAIIHVLHSRHPGNFGADAQGAMNKALELFRKDIAAKYKELGYQG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Analysis of the effect of microgravity on protein crystal quality: the case of a myoglobin triple mutant.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Myoglobin
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| molecule tags |
Oxygen storage/transport
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| source organism |
Physeter catodon
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| total genus |
62
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| structure length |
154
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| sequence length |
154
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2002-11-25 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1YVT A; 1YEQ A; 1DO3 A; 1GLI A; 3WI8 A; 1RQA B; 1Y85 B; 1ABW A; 1Y0D A; 2B7H B; 2HZ1 A; 1DO4 A; 1Y4P A; 1Y31 A; 3UHE A; 4NXA A; 3ZJP A; 1JZM A; 3A59 A; 2W6X A; 4G51 B; 1YVQ A; 2DC3 A; 3HEP A; 2ZLW A; 3H57 A; 2AV0 A; 3EU1 B; 5CNE A; 1A6N A; 2EVP A; 2ZFB A; 1GDK A; 2H8D B; 5CN5 A; 1Y7Z B; 1RSE A; 1HDA B; 1NS9 B; 3QJC A; 1J3F A; 1JP9 A; 3ZJR A; 5ILE A; 1C7C B; 2OLP A; 3VRE A; 2NRM A; 1YEO B; 1V4U B; 1F5P A; 1GVH A; 3IC0 B; 3G4W A; 1MBI A; 2VRY A; 1NQP B; 3HHB B; 1MKO A; 1NPG A; 2VLX A; 1UX8 A; 3ZJS A; 3M3A A; 1YHE A; 1YVT B; 1YEQ B; 2LH5 A; 3MKB A; 2QFN A; 1CH5 A; 3R5I B; 2MGC A; 5CNF A; 2YRS B; 3ARJ A; 1Y09 A; 107M A; 2GTL B; 2OIF A; 1Y4P B; 1MYT A; 2GRH A; 1FDH A; 1MYI A; 4HHB B; 2G0X A; 1BZ6 A; 1YVQ B; 5F2A A; 1RQ4 A; 2GDM A; 1CLS B; 1HBG A; 5F0B A; 1R1Y A; 4H0B A; 2D60 A; 2D5Z A; 1HGB A; 1L2K A; 2D2M A; 2ZFB B; 3WCT A; 1YDZ A; 4SDH A; 3QJC B; 1JY7 A; 4LPI A; 1CH3 A; 1CP0 A; 1HRM A; 3VHB A; 2ZS1 B; 2MYA A; 4ZVB A; 4PQ6 A; 5CN8 A; 5AZR A; 1LH3 A; 3WFX A; 1MBA A; 3OJ1 A; 3WCV D; 1J52 A; 3HC9 A; 1KR7 A; 1A00 A; 1CPW A; 1MKO B; 3OK5 A; 2HZ3 A; 1A9W A; 1SPG A; 1YHE B; 4NK1 A; 4TWV A; 3MKB B; 3WHM A; 3BJ2 A; 1ABY B; 3H58 A; 4MQI A; 1Y09 B; 3WCW A; 2WTG A; 1GCW A; 3ODQ A; 1BBB A; 3AQ6 A; 2XKH A; 1JW8 A; 1RQ4 B; 2EKT A; 4F6D A; 1MLQ A; 1R1Y B; 3S48 C; 1ECO A; 5E83 B; 3G4Q A; 2BLI A; 2D60 B; 4UUR A; 3MJU B; 1O1M B; 2SPM A; 3HF4 B; 1OR6 A; 3NL7 A; 1JY7 B; 1JP8 A; 4MQK B; 3AT6 A; 1Y5J A; 1O1K A; 2ZS0 D; 2V1I A; 1EW6 A; 1A00 B; 1UMO A; 3EDB A; 1J3Y A; 3QQR A; 1HHO A; 2HHD B; 3M3B A; 1SPG B; 4FWZ A; 1X46 A; 5JDO F; 2MYE A; 1MGN A; 2PEG B; 5CNB A; 3WHM B; 4MQI B; 2ZSR A; 3WCW B; 1FSX A; 1B86 A; 1U7R A; 4O1T A; 3V2V A; 3ODQ B; 2ZSX A; 1YOH A; 1N9F A; 3ECL A; 1VXF A; 3G4U A; 1Y5F A; 5EV5 A; 3B75 A; 3UHB A; 1Y4Q B; 1O1I A; 1HBR A; 4HBI A; 1AJH A; 4OF9 A; 5EUI A; 1S61 A; 2GL3 A; 3QJD A; 1HV4 A; 1QSH A; 3UHR A; 1UVY A; 1YIE A; 1Y5J B; 1EBT A; 3FH9 A; 3UHK A; 2Z8A A; 2EKU A; 2QSS A; 2LH1 A; 1A3N B; 1XZ5 A; 3ED9 A; 3PI2 A; 2QLS A; 1VXB A; 3DUT B; 3LHB A; 2ZT3 A; 1Y83 A; 108M A; 2DN1 A; 3D1K A; 3PT8 A; 1TES A; 5HU6 B; 1G0B B; 1LJW B; 1NS6 A; 2AV3 A; 3D7O A; 1OUU A; 1JZL A; 1B86 B; 1DKE B; 2G11 A; 1VRE A; 3TM9 A; 2BLH A; 3PI3 A; 2PGH A; 1Y7G A; 4KMV A; 2R4Y A; 2O5L X; 1YHR A; 2IN4 A; 1SHR A; 1Y5F B; 3BCQ A; 1Y5K A; 2DN3 A; 2NSR A; 1DTM A; 2ZLU A; 3B75 B; 1GDI A; 3ZHW A; 3G53 A; 2R1H B; 1RQ3 A; 2QMB A; 3ZJI A; 1FN3 B; 2ZT0 A; 3QJD B; 102M A; 1HV4 B; 1QSH B; 1YIE B; 4MQG A; 1LFL B; 2G12 A; 1DO1 A; 1XZ4 B; 2VYW A; 3FH9 B; 1MOB A; 1IT3 A; 1GCV A; 1I3E A; 2QSS B; 2W6V B; 1Y4F A; 1JDO A; 1UFJ A; 3BOM B; 3NFE B; 1G0A B; 2QLS B; 1Y83 B; 3OO5 B; 2DN1 B; 2OHB A; 1BZR A; 3D1K B; 1NS6 B; 3G4V A; 3D7O B; 3ECZ A; 2EB9 A; 3FS4 A; 1A6K A; 1V07 A; 1KD2 A; 2LH2 A; 1MTI A; 1MBS A; 3WCV A; 1Y2Z A; 1YHR B; 3PI1 A; 3ZJO A; 2NRL A; 2ZLU B; 4F6B A; 1C7B B; 1Y7D A; 1RQ3 B; 2FAL A; 4F4O A; 1NIH B; 3TM3 A; 1MBD A; 1MCY A; 4FH7 A; 3UHS A; 1X3K A; 1BAB A; 1MYF A; 4MQG B; 2SPN A; 1Y0T A; 3GDJ A; 4FC3 B; 3GQR A; 3K3U A; 1Z8U B; 3QM5 A; 4DC8 A; 1MLM A; 2QSP A; 2D2M D; 5EYJ A; 3WCT D; 4L2M A; 1S0H A; 5EOH A; 1YEU B; 3A9M A; 1WLA A; 2BNL A; 1LTW A; 4KN3 A; 1YE0 B; 1Y22 A; 2ZT2 A; 4MXL A; 3OGB A; 3BJ3 B; 2LH6 A; 3FS4 B; 3UHD A; 4O4Z A; 1A9W E; 2D2N C; 1KD2 B; 2W72 C; 2ZS0 A; 5CND A; 1UVX A; 3WCV B; 2AA1 A; 3ZH0 A; 3G46 A; 4N8T A; 1A0U A; 3SDN A; 3VRF A; 4PQB A; 2FAM A; 1Y7D B; 1PMB A; 3OZV A; 2KSC A; 4F4O B; 1CH7 A; 2HBD A; 1YOI A; 2R4X A; 3UHW A; 1Y0W A; 1S5X A; 1JF4 A; 3IXF A; 1Y0T B; 3GDJ B; 2HBE A; 1DLY A; 2QFK A; 1DWS A; 2HBC A; 3LR7 A; 3GQR B; 2CMM A; 2MGL A; 5CN4 A; 2QSP B; 1MYG A; 3LQD A; 4MBN A; 1IBE B; 4TWU A; 3P5Q A; 2V1J A; 1DLW A; 1CG8 A; 1Y22 B; 4M4B A; 1BIJ B; 3WCU D; 5JDO C; 3E5I A; 1O1J A; 1H1X A; 2ZS0 B; 4F68 A; 3KMF C; 3QM9 A; 3AT5 A; 2AA1 B; 5JGG A; 1HAC A; 1ABS A; 1OFJ A; 1YGF A; 4ROL A; 4M4A B; 3UH3 A; 1IT2 A; 1JPB A; 2D5X A; 1XZV A; 2DN2 A; 1YHU C; 2EVK A; 2HBD B; 3DHR A; 2VHB A; 3W4U A; 1HBS A; 1HSY A; 1NZ5 A; 2AUP A; 2HBE B; 4MXK A; 2C0K A; 1JF3 A; 1MBO A; 1F65 A; 2NX0 A; 4VHB A; 4X0L A; 1SI4 B; 1IWH B; 3QM6 A; 2V1G A; 3GKV A; 3ZJL A; 1YG5 B; 1C7D A; 1CG5 A; 1MWC A; 1XZ7 B; 1CG8 B; 1RPS A; 4NI1 B; 2M6Z A; 3OO4 B; 1UIW A; 1Y4G A; 3GOU A; 1GBU B; 1O1J B; 1SWM A; 1GZX A; 1M6M A; 3AT5 B; 5JGG B; 1HAC B; 3WFT A; 1YGF B; 4DC7 A; 1J7W A; 1MLK A; 1BZZ A; 3HEN A; 2SPL A; 4DWT A; 1EBC A; 1YEN A; 1J7Y A; 1RTX A; 1XZV B; 1GJN A; 3UHC A; 3UGY A; 3IA3 B; 1LFZ A; 3WFW A; 1S5Y A; 1HBS B; 3HYU A; 1S56 A; 2V1K A; 1VWT A; 3HXN B; 1HGC A; 1PBX B; 2EB8 A; 1MWD A; 2VYY A; 1DXU A; 106M A; 2GLN A; 1QSI A; 3ONZ A; 4L7Y A; 1GLI B; 3MVC A; 1O1L A; 1CG5 B; 3SDH A; 4N7O A; 1ABW B; 2MYD A; 1DWT A; 3ZOM A; 1RPS B; 1Y0D B; 2M6Z B; 1QXD A; 2O5M X; 1Y31 B; 1Y4G B; 3A59 B; 2D6C A; 2ZLW B; 1GBV A; 3UH6 A; 1F5O A; 4WJG A; 1DXD A; 3R0G A; 3SZK A; 1CH4 A; 1OUT A; 1J7W B; 1HLM A; 1LFQ A; 2FRF A; 1J7Y B; 5SW7 A; 2VLZ A; 3QJE A; 1XZ2 A; 1MNI A; 4KJT A; 3VRE B; 3D17 A; 1S5Y B; 5EE4 C; 1LH2 A; 1V9Q A; 3K9Z A; 3AQ5 A; 1X9F C; 3QM7 A; 3MYN A; 4MU5 A; 1O1N A; 2LHB A; 4U8U C; 1DXU B; 3ONZ B; 1N9H A; 1ASH A; 1CO8 A; 1A01 A; 4N7O B; 1MNK A; 2GRZ A; 2ZT1 A; 3UHX A; 1QXD B; 1HCO A; 2BMM A; 1LHS A; 1HJT A; 2ZFO C; 2G14 A; 1AJ9 A; 2O5S X; 1GBV B; 1OJ6 A; 1OUT B; 3LR9 A; 3KUO A; 2D5Z B; 1HGB B; 5B84 A; 1Y4V A; 3NG6 A; 4MAX A; 2HCO A; 1K1K A; 2W6W A; 1LFQ B; 2D2M B; 2HBS A; 3WCT B; 1YDZ B; 1YFF A; 2OH8 A; 4ROM A; 3MYM A; 1XZ2 B; 1MOD A; 3AQ9 A; 3ZJQ A; 2RAO A; 3D17 B; 1FAW A; 3WCU A; 1BUW A; 3UHZ A; 1Y46 A; 1C40 A; 4NS2 A; 2BLJ M; 109M A; 2W72 A; 1DM1 A; 5CN6 A; 5D5R A; 1O1N B; 2VEB A; 1BZP A; 3PT7 A; 3LB4 A; 1URY A; 1MYZ A; 1A01 B; 2Z6N A; 3BJ2 B; 4F6J A; 5E29 A; 1HCO B; 3PI9 A; 4ESA A; 1GCW B; 4IT8 A; 2QRW A; 1BBB B; 2HBF A; 3GK9 A; 1AJ9 B; 2ZFO D; 1VXH A; 2RI4 A; 1ITH A; 112M A; 1LH1 A; 1OBM A; 1DXV A; 1COH A; 5HAV A; 4HRR A; 3A5G A; 5C6Y A; 3NG6 B; 2O5T X; 4B3W A; 2HCO B; 1N9I A; 1HLB A; 3CY5 A; 3GQG A; 3NL7 B; 2GNW A; 3RJ6 A; 1YFF B; 2R80 A; 4YU3 A; 1O16 A; 4C44 A; 4ROM B; 1MTJ A; 1URV A; 2RAO B; 3ORD A; 2HHB A; 1FAW B; 3AT6 B; 3WCU B; 1WVP A; 1A6G A; 1O1K B; 5C6E A; 3MOU A; 1C40 B; 2G0Z A; 5AZQ A; 4ZVA A; 2GTL C; 5CN9 A; 1EMY A; 1J3Y B; 1QPW A; 1YGD A; 3KMF A; 1NPF A; 1HHO B; 5M3S A; 1MYJ A; 1YZI A; 3UHQ A; 1O1O A; 2Z6N B; 1MWB A; 3OZU A; 1AJG A; 4NI0 A; 5E29 B; 3CIU A; 1FSX B; 3PI9 B; 5EYS A; 1F63 A; 5ILR A; 1HBA A; 2ZS1 C; 4O2G A; 7HBI A; 1XZU A; 3UH7 A; 2ZLV A; 2MGK A; 4HRR B; 3LB2 A; 5CHR A; 1VXA A; 5EU2 A; 4F69 A; 1DO7 A; 1O1I B; 2MBW A; 1HBR B; 1M9P A; 5EUI B; 2R80 B; 4YU3 B; 2O5Q X; 4NK2 A; 2AUO A; 2HHB B; 3QJB A; 1MTK A; 2AUQ A; 1SDL A; 2ZLX A; 2LH3 A; 1HBB A; 4H07 A; 1XZ5 B; 1V75 A; 5KKK A; 1YGD B; 5D1V A; 2GTL D; 1J40 A; 1V4W A; 1AZI A; 2Z6S A; 1XQ5 A; 104M A; 1U7S A; 3D4X A; 1O1O B; 3UHI A; 3G4R A; 3WR1 A; 3PT8 B; 4NI0 B; 2LH7 A; 4XDI A; 3CIU B; 1OUU B; 2JHO A; 4KMW A; 1IRD A; 2PGH B; 1Y7G B; 1HGA A; 2BWH A; 3GQP A; 2ZSS A; 1YOG A; 1HBA B; 1Y4B A; 1SHR B; 3BCQ B; 2R50 A; 2ZLV B; 1MOH A; 1Y5K B; 2DN3 B; 1YH9 A; 3GYS A; 2E2Y A; 2FRI X; 1NEJ A; 1HDB A; 1SDK A; 2AUR A; 2QMB B; 1VXG A; 2QU0 A; 3ZJJ A; 1SDL B; 2ZLX B; 1BVC A; 4YU4 A; 4FH6 A; 2HBG A; 1GCV B; 1Y4F B; 105M A; 2G3H A; 4XS0 A; 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1C7C A; 1R1X A; 2HHE B; 1V4U A; 1XYE B; 3P5Q B; 1DXT B; 2MGB A; 4M4B B; 1NQP A; 1FLP A; 1G08 A; 3AQ8 A; 3HHB A; 1OFK A; 3E4N A; 3ECX A; 5JDO D; 1VRF A; 1MLF A; 4N7P B; 1KFR A; 4IRO A; 1Y8H B; 5ILP A; 3HEO A; 3R5I A; 2XKI A; 1XXT B; 2YRS A; 4ROL B; 2WY4 A; 2GTL A; 4O35 A; 5HLX A; 1Y4R B; 1A0Z B; 2ZSN A; 4H2L B; 3UHV A; 5IKS A; 1BZ0 A; 1VXE A; 2D5X B; 4HHB A; 1A4F B; 2DN2 B; 1Y8K A; 1CLS A; 2FRJ X; 1LFY B; 1YHU D; 3DHR B; 1J3Z A; 4NXC A; 3W4U B; 1LFV A; 1A6M A; 5CNC A; 2ZSY A; 4HSW A; 1J41 A; 3VRG A; 3UHH A; 1YE2 B; 4X0L B; 4WCH D; 2ZS1 A; 1R1X B; 3GKV B; 3V2Z A; 2BK9 A; 1C7D B; 3WCV C; 3AQ7 A; 1MOC A; 2H35 A; 1S6A A; 2HZ2 A; 3KUN A; 2MGM A; 1G08 B; 1JL7 A; 1UIW B; 1QXE A; 1UC3 A; 3GOU B; 1Y0A A; 2O5O X; 1LFT A; 1D8U A; 1SPE A; 1GZX B; 3QMA A; 110M A; 1MLU A; 4IRO B; 1TU9 A; 1ABY A; 1BZZ B; 4FWX A; 1YEN B; 1BZ0 B; 2G0R A; 1Y8K B; 3MJP A; 1VXC A; 5HY8 A; 3ASE A; 1LFZ B; 5E83 A; 1J3Z B; 1XY0 A; 3A0G A; 3MBA A; 3HYU B; 1CH1 A; 1LFV B; 3MJU A; 1O1M A; 3UGZ A; 3HF4 A; 1VWT B; 2OH9 A; 3DR9 A; 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