The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
59
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sequence length |
146
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structure length |
146
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Chain Sequence |
VQLSGEEKAAVLALWDKVNEEEVGGEALGRLLVVYPWTQRFFDSFGDLSNPGAVMGNPKVKAHGKKVLHSFGEGVHHLDNLKGTFAALSELHCDKLHVDPENFRLLGNVLVVVLARHFGKDFTPELQASYQKVVAGVANALAHKYH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
A pH-Dependent Aquomet-to-Hemichrome Transition in Crystalline Horse Methemoglobin
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Hemoglobin alpha subunit
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| molecule tags |
Oxygen storage/transport
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| total genus |
59
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| structure length |
146
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| sequence length |
146
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2003-01-27 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| B | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1C40 A; 2ZS0 D; 2VYY A; 3WCT D; 2QSS B; 2IN4 A; 2V1E A; 1BBB A; 3ZOL A; 3M3B A; 2D5X A; 3MKB B; 3HRW B; 1Y22 A; 2D2N C; 1WLA A; 1XXT B; 4F6B A; 5M3S A; 3OZU A; 1Y0A B; 3GOU A; 3AQ5 A; 2LH1 A; 1TU9 A; 1MDN A; 2ZFO B; 3IC2 B; 3PI8 A; 3BJ3 A; 4YU3 A; 2HBF B; 2R50 A; 5AZR A; 2NX0 A; 1LJW B; 3CY5 A; 4NZI A; 3UHQ A; 3PIA B; 2HBS A; 1Y35 B; 2BW9 M; 4MQH A; 3WCU D; 1O1N B; 2R4Z A; 1NIH B; 2HBE A; 2E2Y A; 2ZT3 A; 1DWT A; 2HHB B; 1EBT A; 3TM9 A; 2QRW A; 1Y09 B; 1MOD A; 2FAL A; 1MYG A; 1HBA A; 1HRM A; 2G12 A; 1Y7Z A; 3GQP B; 2ZST A; 2ZT4 A; 4ILZ A; 1LH5 A; 3UI0 A; 3WR1 B; 2D2N D; 3LB4 A; 1HGA A; 1GVH A; 2GKM A; 1MKO A; 1A01 A; 1BZ0 B; 1AJH A; 1MOH A; 3A0G B; 4NXC A; 1J7S B; 1C7C B; 1Y4G A; 1Q1F A; 3A59 A; 4ZVB A; 1QSI B; 4ODC A; 1CH4 A; 3QM5 A; 1GLI A; 2DHB B; 1HGB A; 2BLJ M; 2V1G A; 2XKH A; 1GBV A; 1BIN A; 2H35 A; 1XY0 A; 3CIU A; 3FH9 A; 1MTJ A; 1PMB A; 2EKT A; 1A0U B; 3B75 B; 1Y4V B; 4M4B B; 2BLI A; 2DN3 A; 1J3Y A; 2W72 A; 1GDJ A; 2VRY A; 3FS4 B; 3G53 A; 4FH6 A; 3AG0 A; 2V1J A; 4H2L A; 1OBM A; 2ZSQ A; 1VXD A; 3VRE B; 1OFK A; 2R4X A; 1YEV B; 108M A; 1MWC A; 1N9X A; 1FDH G; 1Y46 B; 3LB2 A; 2B7H B; 3UHZ A; 1HHO B; 1Y0C B; 2O5B X; 3M38 A; 2ZFB B; 3VRG A; 3LR9 A; 1G9V A; 3NMM A; 1CP0 A; 3MYM A; 1N9I A; 3WCW A; 1RQ4 B; 3UHY A; 2QFN A; 5EYS A; 1J52 A; 1DO7 A; 4NI0 A; 1HBB A; 2H8F A; 2C0K A; 1YOG A; 3HXN B; 3OO4 A; 1Y4F B; 1Y0W B; 3DHT B; 4UUR A; 4B4Y A; 1LH1 A; 3DR9 A; 1CH9 A; 3UHI A; 1Y7G B; 2AUO A; 1Y83 A; 4C44 A; 3OK5 A; 5EV5 A; 1Y5J A; 2ZS1 A; 1YFF A; 1C7D B; 4F6I A; 4HRR A; 1QXD B; 2GRH A; 1A4F B; 1C7B B; 1YVT A; 1Y7C A; 3WFU A; 1JF4 A; 2MGL A; 3HEO A; 1HAC A; 1D8U A; 1O1K B; 2SPM A; 3HRW A; 3BA2 A; 3AT6 B; 1XZ5 B; 1XXT A; 1MOB A; 3UH7 A; 1DWS A; 1YZI A; 2MYD A; 1G0B A; 3E4N A; 2ZFO A; 1Y4B A; 2HCO A; 1HDS B; 3UHU A; 1YHR A; 3KUO A; 3UH6 A; 1LH6 A; 1AJ9 B; 3ZJP A; 3G52 A; 2KSC A; 3WCW C; 3S1J A; 3PIA A; 1RVW A; 1Y35 A; 1COH B; 4JAC A; 1O1N A; 1J3F A; 3IXF A; 4O2G A; 1HDB B; 2VYW A; 4XS0 B; 4OOD A; 1IWH B; 1NQP B; 6HBW B; 2Z6S A; 1YE2 A; 3LQD B; 3MYN A; 5HU6 A; 1Y09 A; 1CH7 A; 1V4X B; 1B0B A; 3UHG A; 1SDK A; 1LFQ A; 3WR1 A; 2FAM A; 2MGA A; 1BJE A; 2DC3 A; 4M4A A; 1Y7D A; 1CIO A; 3ECL A; 2HZ3 A; 1J7S A; 1C7C A; 3WCV C; 1Y2Z A; 1Y8H A; 1LHT A; 1LHS A; 1SHR B; 1LH2 A; 3UHE A; 4PNJ A; 3GYS B; 2D5Z B; 2MB5 A; 3ZJH A; 2ZSP A; 1JF3 A; 2JHO A; 5KDQ B; 1DKE A; 1FN3 A; 2O5M X; 1QPW B; 3D4X A; 3WCW D; 1HBH B; 4HSX A; 1YEN B; 4KJT A; 5HBI A; 2O5O X; 1LFZ A; 3B75 A; 2GNV A; 1GCV B; 4M4B A; 1THB A; 3G46 A; 3FS4 A; 1Z8U B; 4HRT B; 4SDH A; 4VHB A; 2ZSN A; 2R80 A; 4O4Z A; 3MBA A; 1NZ5 A; 2NRM A; 1JDO A; 5EE4 C; 4WJG A; 3RJN B; 3A5G A; 2HBG A; 2R1H A; 2R4Y A; 4MQC A; 1F5O A; 1MLL A; 4B3W A; 1U7S A; 2QSP B; 3DHR B; 2VEB A; 1Y46 A; 1F5P A; 3WCV D; 2G11 A; 5MBA A; 4MQK B; 3MN0 A; 3OO5 B; 1O1O B; 3WFW A; 3NFE A; 1SDL B; 1K0Y B; 1IRC A; 1VRF A; 2HHE B; 3G4V A; 1GDI A; 1XZ2 B; 1FDH A; 2BMM A; 3DHT A; 1YGF A; 3ODQ B; 2FRK X; 3E55 A; 1WMU B; 1VWT B; 3R5I B; 2ZLU B; 1YOI A; 1S5X B; 3GKV B; 111M A; 1CG8 A; 3ZHW A; 1PBX A; 1ABY B; 1FSX B; 2MBW A; 1YG5 B; 1A4F A; 3D1K B; 5EE4 D; 3PI9 B; 3UBC A; 1JWN A; 5MBN A; 1DXU A; 1O1K A; 1CH5 A; 4G1V A; 1YEQ A; 1XZ5 A; 4MQJ A; 1NPG A; 1LFV B; 3QQR A; 2G0V A; 3HEN A; 3G4Y A; 1F65 A; 1V5H A; 2CMM A; 3BCQ A; 1JL7 A; 4ESA B; 1MYF A; 2EVP A; 5ILM A; 1UC3 A; 1J40 B; 4N7N A; 1AJ9 A; 1NS9 A; 4IT8 A; 5CNC A; 1ABS A; 3NL7 A; 3QJD B; 5E6E A; 1DXD A; 1J3Z A; 2GKN A; 1IWH A; 2XKG A; 1A0Z B; 1G08 A; 4TWV A; 3A5A A; 1BUW A; 112M A; 1YHU B; 3IC0 B; 1LA6 B; 4H07 A; 4IRO B; 1NPF A; 3S48 C; 4ROM B; 2MGF A; 1SHR A; 1WVP A; 1M6M A; 1IOP A; 3GYS A; 1YE0 B; 5HLU A; 2QLS A; 5SW7 B; 3ZOM A; 1XQ5 B; 1NS6 B; 1Y8W A; 1SI4 B; 1Y0T A; 2O5T X; 1RQA B; 5B85 A; 2DXM A; 3G4U A; 2WY4 A; 1HBH A; 4MXL A; 5CNE A; 1OUU A; 1YEN A; 1ECN A; 3KMF C; 1F63 A; 1LFT B; 3UHV A; 3S66 A; 3K8B B; 1OJ6 A; 1J41 A; 1YEO A; 1B86 A; 1HCO A; 4HRT A; 1VXH A; 4G51 A; 1ECA A; 1X9F C; 3G4W A; 2FRI X; 1VRE A; 3ARJ A; 2W6X A; 5JGG B; 5CN9 A; 3D1A B; 3GQG A; 3UHN A; 3QJB B; 5CN6 A; 1S69 A; 1MBS A; 3AT5 A; 1A9W E; 5IKS A; 2V1K A; 1O1O A; 1A3N B; 1MLG A; 5HLQ A; 1MNJ A; 1SDL A; 1K0Y A; 5D1V A; 1NEJ B; 1ABW A; 1XYE B; 4FC3 B; 1Y5F A; 3H58 A; 1XZ2 A; 2Z6T A; 1YCA A; 1YEU B; 3DUT B; 4KMW A; 1O1I B; 1OR4 A; 3ODQ A; 3MOU A; 1WMU A; 5EU2 A; 2YRS B; 1I3D A; 1VWT A; 1DXV B; 3R5I A; 2ZLU A; 2D60 B; 5E83 B; 5CHQ A; 3GKV A; 2EB8 A; 4N7O B; 3K3U A; 1DXT B; 1MLK A; 2WTH A; 1LUE A; 2GRF A; 3WHM A; 4PQ6 A; 2QU0 B; 1X9F D; 3UHR A; 3OZW A; 1XZV B; 4X0L B; 2ZT0 A; 1GBU A; 2ZWJ A; 2AUR A; 3MJP B; 1MZ0 A; 2D6C A; 2DN1 B; 2G0R A; 3QJC B; 1LFV A; 1J7Y A; 1MNO A; 3GDJ B; 4YU4 B; 1OUT B; 1YHE B; 1HV4 A; 1XCH A; 3D7O B; 1MNH A; 4U8U B; 2QMB A; 2BKM A; 1H97 A; 2HBD B; 1Y8K A; 3QJD A; 2Z6N B; 2IG3 A; 2ZSO A; 1A0Z A; 1KFR A; 5JDO C; 1R1Y B; 4L7Y B; 1MBN A; 1K1K A; 1OFJ A; 1YDZ B; 1Y8I B; 1YHU A; 1X46 A; 3AQ6 A; 3GK9 A; 1DWR A; 3EOK B; 1Y85 A; 1IT2 A; 1UIW B; 1SWM A; 2GTL A; 1EMY A; 2ZLW B; 1EWA A; 2W6V B; 1MBC A; 1HAB B; 1DUO A; 1DO1 A; 5KER B; 3UHT A; 2OH8 A; 5EQM A; 2W31 A; 4DC7 A; 1HDA B; 1LFL A; 1CO8 A; 5ILR A; 1IBE B; 1KD2 A; 1XQ5 A; 5CNG A; 1NS6 A; 2MGM A; 3EU1 B; 4XDI A; 2MYB A; 1Y5K B; 2OIF A; 3W4U B; 1MNI A; 1S0H B; 1JEB B; 2D2M A; 1MBI A; 3K8B A; 2EVK A; 4PQC A; 4DWT A; 5JDO D; 1MLR A; 3GQR A; 1Y0D B; 1L2K A; 1BIJ B; 1MOA A; 3PT7 B; 3VRF B; 1CBL A; 1A3O A; 5JGG A; 2OHA A; 1JZK A; 2HZ1 A; 1URV A; 1QXE B; 3AQ7 A; 3QJB A; 2AV3 A; 3MJU B; 2QSS A; 2W72 C; 1MLS A; 3MKB A; 2VM0 A; 2GTL C; 1UX9 A; 1FSL A; 2ZSY A; 5EUI B; 1MLU A; 1LFY B; 1ECO A; 1Y0A A; 3PT8 B; 2ZS0 B; 3WCT B; 1XYE A; 2VLX A; 1MWB A; 5CN5 A; 3UBV A; 1UFP A; 4N7P B; 5C6Y A; 3DUT A; 1CLS B; 3ARK A; 3QMA A; 3IC2 A; 5ILP A; 2HBF A; 3LHB A; 2YRS A; 2NRL A; 4HHB B; 2D60 A; 5E83 A; 2NSR A; 1VXF A; 1LJW A; 1JY7 B; 3WFX A; 1Y45 B; 3S1I A; 1R1X B; 1DUK A; 1NIH A; 1HGC B; 1S5Y B; 3E5I A; 1VXG A; 2HHB A; 3OJ1 A; 1V07 A; 1GDL A; 1HBR B; 2AV0 A; 4MQI B; 3MJP A; 1UX8 A; 4FWZ A; 1YCB A; 3GQP A; 3WCU B; 2DN1 A; 2RI4 B; 4MAX A; 3QJC A; 2ZS1 C; 3GDJ A; 1BZ0 A; 2AA1 B; 4YU4 A; 3A0G A; 4DWU A; 3NG6 B; 1A6M A; 3HC9 A; 4F6G A; 1GCW B; 1YHE A; 1YGD B; 1QSI A; 3WCP B; 1BZ1 B; 1Y01 B; 2Z85 A; 1ECD A; 1MLQ A; 2D2N B; 3OZV A; 1CMY B; 1DXC A; 2DHB A; 3SZK B; 1JW8 A; 1BAB B; 3QM8 A; 2Z6N A; 4MXK A; 1JZM A; 1A00 B; 3WFT A; 2ZFO C; 103M A; 1J7W B; 3ZH0 A; 1MBA A; 1A0U A; 1Y4V A; 1A9W A; 1NAZ A; 1YDZ A; 1FAW B; 1RSE A; 2GNW A; 1DTI A; 2XKI A; 1V4W B; 3SDN A; 3VRE A; 106M A; 3LB1 A; 1YEV A; 5EYJ A; 2ZS1 D; 1M6C A; 1RPS B; 3UHH A; 1SPG B; 1Y4P B; 1CG5 B; 2MGI A; 3ONZ B; 1S6A A; 1HDA A; 2B7H A; 1O1P B; 3QZX A; 1HHO A; 3G4R A; 1IBE A; 1Y0C A; 2ZFB A; 2VYZ A; 3EU1 A; 1G09 B; 1JPB A; 1VXC A; 1CPW A; 1RQ4 A; 1QSH B; 3UHB A; 3KUN A; 3NML A; 1BBB B; 3HXN A; 1Y4F A; 2D5X B; 1Y0W A; 1MLO A; 2O5L X; 2ZFO D; 1Y7G A; 3GOU B; 2ZLT B; 3V2Z A; 3VRF A; 3ZJO A; 2MGC A; 3P5Q B; 1C7D A; 3VAU A; 3PI8 B; 4FWY A; 1QXD A; 1QXE A; 4YU3 B; 1C7B A; 1N9H A; 2LH2 A; 1CIK A; 1UMO A; 3HYU B; 2HBS B; 3AT6 A; 2Z8A A; 3PEL B; 1HBI A; 101M A; 2ZSS A; 2BLH A; 1LFY A; 5EET A; 2MGB A; 3PT8 A; 1MYH A; 4TYX A; 2BWH A; 5D5R A; 4F68 A; 4NS2 A; 1NXF A; 107M A; 3D17 B; 1Y7Z B; 1HDS A; 4HSW A; 5C6E B; 1LTW A; 1HGA B; 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2HHE A; 2W6W A; 1O1M B; 3WCV B; 1HSY A; 1HAC B; 4NXA A; 3QM9 A; 5KKK A; 3EDB A; 1W92 A; 1RTX A; 5B84 A; 1MTK A; 1S5X A; 1NZ3 A; 2ZLT A; 2MYC A; 1YZI B; 1G0B B; 3P5Q A; 1ABY A; 3ZJL A; 1FSX A; 1YG5 A; 4NK2 A; 1JZL A; 1Y4B B; 2HCO B; 1YHR B; 3D1K A; 1G0A B; 3PI9 A; 2SPN A; 1AZI A; 1XZ7 B; 1BZP A; 3HYU A; 4L2M A; 1RVW B; 3UH3 A; 3PEL A; 3ZJJ A; 2M6Z B; 3M39 A; 2BK9 A; 3RJ6 A; 4UZV A; 1YE2 B; 1KR7 A; 5HU6 B; 4ESA A; 3D17 A; 1GJN A; 4ROL B; 1J40 A; 5C6E A; 110M A; 1SDK B; 1LFQ B; 2VLY A; 2LH6 A; 1EW6 A; 3UGZ A; 1FHJ B; 4KMV A; 1HLB A; 2EF2 A; 4M4A B; 3PI2 A; 1Y7D B; 2MGH A; 3UHK A; 1Y2Z B; 1M9P A; 1Y8H B; 4MQG A; 3ECX A; 4O4T A; 1T1N B; 1XZU A; 3G4Q A; 1DKE B; 1FN3 B; 2PEG B; 3D4X B; 1DM1 A; 4KN3 A; 3IC0 A; 1LA6 A; 4O35 A; 5F0B A; 1Y4R A; 4IRO A; 2GL3 A; 1O1L A; 3HF4 B; 5HLX A; 4ROM A; 1LFZ B; 1CP5 A; 2RAO A; 2MGJ A; 1THB B; 2EB9 A; 4NI1 A; 2ZLX A; 1HBS B; 1MWD A; 4C0N A; 3QJE B; 1YE0 A; 1MLN A; 2R80 B; 2H8D B; 2ZSZ A; 5SW7 A; 3OVU C; 1SI4 A; 1RQA A; 2R1H B; 4MQC B; 2LH5 A; 2ZLV A; 1CH2 A; 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