The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
55
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sequence length |
146
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structure length |
146
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Chain Sequence |
MHLTPEEKSAVTALWGKVNVDEVGGEALGRLLVVYPWTQRFFESFGDLSTPDAVMGNPKVKAHGKKVLGAFSDGLAHLDNLKGTFATLSELHCDKLHVDPENFRLWGNVLVCVLAHHFGKEFTPPVQAAYQKVVAGVANALAHKYH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Genetically Crosslinked Hemoglobin: A Structural Study
doi rcsb |
| molecule keywords |
Hemoglobin Alpha chain
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| molecule tags |
Oxygen storage/transport
|
| source organism |
Homo sapiens
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| total genus |
55
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| structure length |
146
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| sequence length |
146
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2002-11-19 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| B | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1HBG A; 3QM5 A; 2QLS B; 3BJ1 A; 1YIE A; 2PGH A; 1FSX B; 2ZLT B; 1HAB B; 3VRG B; 1YZI A; 2LHB A; 1IOP A; 3WTG A; 1G9V A; 4XDI A; 4LPI A; 1FN3 B; 3IC2 B; 4FH7 A; 1HGC B; 3KMF C; 4IT8 A; 2G0X A; 5EU2 A; 4DWT A; 2XKG A; 5EUI A; 1HCO B; 1XY0 A; 3AQ8 A; 3WCU C; 1LJW B; 3UH7 A; 1D8U A; 3UHQ A; 1URY A; 3BJ3 B; 2LH5 A; 1BIJ A; 5CN9 A; 1WVP A; 1XZ5 A; 1XZ7 B; 1ABW B; 4MQK A; 1FHJ B; 5HY8 A; 3WCV B; 1A9W E; 3EOK B; 4ESA B; 4H2L B; 4F4O A; 1UIW A; 3UI0 A; 1A00 A; 4B3W A; 1CH1 A; 3WCT D; 2ZS0 A; 1DWS A; 1YHE A; 1MBA A; 1EW6 A; 2C0K A; 1YVQ B; 3CIU B; 1G0A A; 4N7O A; 3OK5 A; 1LFQ B; 2W6X A; 1GLI A; 3GYS B; 2D2M D; 2ZST A; 3UHI A; 1GBU A; 5JDO F; 1RPS B; 4G51 B; 3WHM A; 109M A; 1AJ9 B; 1YEO B; 3IA3 B; 1H1X A; 1IWH A; 5C6E B; 3UGY A; 3PI9 B; 2FRK X; 1LH5 A; 1OUT A; 2R4Z A; 6HBW A; 1SHR A; 2DC3 A; 1YOG A; 1HBA A; 4HSX A; 1V5H A; 2GRF A; 1ITH A; 2QMB B; 3WCW B; 2YRS A; 1GDJ A; 3A2G A; 3OO4 A; 1HDB A; 2D2N B; 3DHR B; 3VAU A; 1MWB A; 1GZX A; 3BOM B; 3UHT A; 1O1P A; 1Y4R B; 2ZLW A; 1YH9 A; 3UHB A; 1EWA A; 2XKH A; 1BZ1 B; 1HBR B; 1CH2 A; 1Y0D B; 2VEE A; 2MYC A; 5E6E B; 1A0Z A; 2G0R A; 1NQP A; 1LFV A; 2PEG B; 2QFK A; 4HRR B; 3D1A A; 1Y7G B; 3FH9 B; 1HDA A; 2H8F A; 3A59 B; 2EKU A; 2ZLV B; 1OUU B; 2HBF A; 4M4A A; 4MQH A; 3ZJL A; 2ZLU B; 3KMF A; 4G1V A; 2KSC A; 1J52 A; 4TWV A; 1YHU C; 1S5X A; 2DHB A; 1JP6 A; 1Y5K B; 2GRZ A; 3WCU A; 1HBS B; 2ZS1 B; 3ZHW A; 103M A; 3ECX A; 3RJN B; 1CH5 A; 1YEU A; 3QJC B; 2QSP A; 1Y0C B; 2D60 A; 1DO7 A; 4F6I A; 3V2V A; 4UZV A; 5KKK A; 3UHG A; 1Y4Q A; 107M A; 1A01 A; 2VEB A; 3UHY A; 3PT8 A; 1A4F B; 3GQP A; 2ZWJ A; 5HLU A; 4UUR A; 1V75 B; 1BBB B; 1NS9 A; 1Y46 B; 2ZT3 A; 1IRD B; 1NZ4 A; 4PQB A; 2MYE A; 1Y4G B; 2DN1 B; 3K8B B; 1CBM A; 1YIH A; 3ECZ A; 3HF4 B; 3OZV A; 1BVD A; 5JGG B; 1XZU A; 1JP9 A; 1MTI A; 1UFP A; 1XXT A; 1HBH B; 2WY4 A; 1URV A; 4TWU A; 2G0V A; 1QSI B; 3TM9 A; 2H8D A; 1Y45 B; 4N7N B; 4MQG A; 1O1K A; 1ECA A; 3NMM B; 3BCQ A; 3E55 A; 2R80 B; 1DTI A; 3ZJM A; 1QPW B; 1BJE A; 1Y8K A; 3LR9 A; 1CH3 A; 3WCV D; 1MLH A; 1RVW A; 1OFJ A; 3UGZ A; 1YHR B; 4ZVA A; 5EE4 D; 1BZ6 A; 1M9P A; 1MYI A; 1COH A; 3KUN A; 2VM0 A; 4KJT A; 1BZZ B; 1ECN A; 1G08 A; 1YGF B; 1DUO A; 3WR1 B; 1ASH A; 2HHE B; 1Y8H A; 1YCB A; 4ROL A; 1VHB A; 1V4X B; 3QJD A; 2HZ3 A; 2ZFB B; 3HYU B; 1FCS A; 1UFJ A; 1HGB A; 3QJE B; 1A3N B; 4HHB A; 3GQR B; 1CO8 A; 2G3H A; 1J40 A; 1A3O A; 3W4U A; 1RQA B; 2GTL B; 3U3E A; 1GDL A; 1XQ5 B; 4X0L B; 2AA1 A; 7HBI A; 1R1X A; 1NXF A; 1YHU A; 1PBX A; 1SPG A; 1MOD A; 4WJG 1; 2W6W A; 1HGA A; 2ZSY A; 3WCW D; 4AVD A; 1NEJ A; 2HBS A; 1JF4 A; 2ZSQ A; 3A0G A; 2HBC B; 1CPW A; 5D1V A; 1MGN A; 1MYT A; 112M A; 4F6J A; 3G4Y A; 2MGJ A; 2OIF A; 1BAB B; 1CMY A; 1G09 A; 1JF3 A; 1HSY A; 2VYY A; 2V1K A; 1Y09 B; 2O5M X; 3LB2 A; 2D5X A; 4AVE A; 1YDZ A; 2ZSX A; 4FWZ A; 2B7H A; 3DUT B; 1MKO B; 2GKN A; 4F6B A; 1G0B B; 1GBV A; 2HZ1 A; 5CNG A; 1FSX A; 2ZS1 D; 4QAU A; 1HAB A; 1N9I A; 5IKS A; 1XZ2 A; 5CN5 A; 1HBB B; 4G1B A; 1VXE A; 1MYM A; 2VHB A; 1V4W A; 1CG5 B; 1YVT B; 1MDN A; 2RI4 B; 1HHO B; 3S65 B; 5KDQ B; 1ECO A; 1LJW A; 3PIA A; 3UHZ A; 3GK9 A; 1NZ2 A; 3D7O A; 1DXD A; 2FRJ X; 3AT6 B; 1ABW A; 2W72 C; 1FSL A; 1Y4V B; 1Y7D B; 2DN3 A; 1J3Z B; 3WCV A; 1XZV A; 4H2L A; 1DXU A; 1O1N A; 2ZSZ A; 1YEQ A; 4MQJ A; 4U8U C; 1J3Y B; 2HCO B; 4IRO B; 2OH9 A; 3DHT A; 1S0H B; 4SDH A; 1XZ4 A; 3MVC A; 3ONZ A; 1MWC A; 4F6G A; 3VRE A; 2W6V B; 4H07 A; 1LUE A; 3OVU C; 2ZT0 A; 1MLF A; 4G51 A; 1AJ9 A; 1AJG A; 1F5O A; 1LFL A; 1YMA A; 1SDK A; 1NGK A; 1Y01 B; 3PI9 A; 1J7S B; 2MHB B; 2NSS A; 2M6Z B; 1YOI A; 1YEV B; 1LFY B; 1Y4F B; 3UHS A; 1Y35 B; 1DXV B; 2MYB A; 1QXD A; 2MBW A; 1B86 A; 1HV4 B; 2D2N A; 3ORD A; 4MQC B; 2MYD A; 1C7D A; 1OR6 A; 2O5L X; 3HRW A; 2GTL D; 1A9W A; 2QFN A; 1IT3 A; 1B0B A; 3GQG B; 1PMB A; 1YE2 B; 3PI8 A; 1MYZ A; 4TYX A; 4F6F A; 1QSH B; 2MYA A; 5CND A; 3SDH A; 1OFK A; 1V07 A; 4N7P B; 5JDO E; 4FC3 A; 1AZI A; 1NS6 A; 2SPO A; 1EMY A; 1NPG A; 3FS4 B; 1XYE B; 3D1K B; 1HBS A; 2MGB A; 1Y83 B; 2WTH A; 1O1J A; 3R5I A; 4OF9 A; 1A0U A; 1DLW A; 5HBI A; 1C7B A; 3ZJH A; 2RAO A; 3GOU B; 2MGL A; 3QMA A; 5HU6 B; 3EU1 B; 1DXC A; 1Y4B B; 3UH6 A; 4U8U A; 4YU3 B; 3WFU A; 1BVC A; 1BZ0 A; 1KD2 A; 5E83 A; 1MBI A; 1CG8 A; 1O1I B; 3AT5 B; 3HF4 A; 111M A; 3NG6 A; 3LQD A; 1LH6 A; 1HAC B; 1IRC A; 1Y8W B; 4JAC A; 2ZFO B; 4PQC A; 1Y45 A; 1CIO A; 2H35 A; 2G0Z A; 3A5G A; 3OJ1 A; 5HAV A; 2HHD B; 1JEB B; 1Y85 A; 3UH5 A; 3P5Q B; 2HBE B; 1DXT A; 1MOH A; 1S5Y B; 2AV0 A; 3PI2 A; 1YOH A; 3NL7 B; 2O5T X; 1YHR A; 2VLY A; 3BJ2 A; 3UHN A; 2Z6T A; 1J3F A; 1Y0W A; 1TU9 A; 1DWT A; 2HZ2 A; 3PEL A; 1GCW B; 4MQI A; 1Y22 B; 1Y0A A; 4WJG A; 3MJP A; 3H57 A; 3QM6 A; 1Y2Z A; 1RQ3 A; 1YEN B; 1VXH A; 3UHU A; 5C6Y A; 3GDJ A; 4NS2 A; 4NI0 B; 1Y7Z B; 2G14 A; 3SZK A; 3S48 C; 3WCT C; 1DLY A; 1Y31 A; 1MLK A; 2NRM A; 1MZ0 A; 5CN4 A; 3UHD A; 2BLH A; 1XQ5 A; 3SDN A; 1MYH A; 2NRL A; 3GLN A; 1VWT B; 2D2M C; 3PI3 A; 2FAL A; 1QI8 A; 3VHB A; 3RJ6 A; 2Z8A A; 2FAM A; 4M4B A; 1ABY A; 1C40 B; 1K0Y A; 2AUO A; 1NPF A; 1YG5 A; 4HRT B; 1K1K A; 2R50 A; 1JL7 A; 3IC0 A; 3D17 A; 4NI1 B; 1MBO A; 3A5B A; 5CNF A; 2DXM A; 2ZLX B; 1BAB A; 1X9F B; 1MBD A; 4ROM B; 2SPM A; 1HLB A; 5CMV A; 2EVP A; 4O4T A; 3D4X B; 2VLX A; 1FDH A; 3ED9 A; 1HRM A; 3ECL A; 1YFF B; 1V4U A; 1MLN A; 3V2Z A; 1YE0 B; 1FAW A; 1THB A; 5B84 A; 1GCV B; 4YU4 A; 1T1N A; 3QM9 A; 2R4W A; 1O1O A; 1Y8I A; 5AZQ A; 5EYJ A; 2GNV A; 1G0B A; 1BUW B; 2EKT A; 1LH3 A; 1UX9 A; 3UHV A; 2BMM A; 3LHB A; 2O5B X; 2HHB B; 4N8T B; 1X46 A; 5SW7 A; 3OZW A; 4DC7 A; 1Y5F A; 3WCP A; 1Y4P B; 1CG5 A; 1R1Y A; 2RI4 A; 1LFZ B; 1GDK A; 2HBD A; 5CHQ A; 1J41 B; 2D5Z B; 1WLA A; 5E29 B; 3B75 B; 2VRY A; 3VRF A; 1J7Y B; 2SPN A; 1JP8 A; 1RQ4 B; 3ZJS A; 1UT0 A; 2QSS B; 2QU0 A; 1Y5J A; 1JY7 A; 4FWY A; 2NX0 A; 1CO9 A; 3WCT A; 4HBI A; 5F0B A; 2DN2 A; 2ZFO D; 4PNJ A; 1J3Y A; 1HDS A; 3LB4 A; 1MYF A; 1VXB A; 2Z6N B; 5JDO D; 3BJ1 B; 1YIE B; 2PGH B; 5EV5 A; 2D2M A; 1YZI B; 3HHB A; 3WTG B; 1X3K A; 1J7W A; 3PI1 A; 3QQQ A; 1G9V B; 2MGG A; 1UMO A; 3MKB A; 1O1L B; 3ASE A; 1LA6 A; 2ZT1 A; 1CH9 A; 1O1M A; 5EUI B; 3OO5 A; 3UHK A; 1XY0 B; 1MLU A; 1WMU A; 1BIJ B; 3UHR A; 1MLJ A; 108M A; 3NML A; 1F5P A; 1XZ5 B; 2O5Q X; 1YEV A; 3OGB A; 4MQK B; 3WCV C; 1UIW B; 3AQ7 A; 3GKT A; 1HV4 A; 1A00 B; 1L2K A; 1MNH A; 5EE4 C; 2ZS0 B; 1YHE B; 3BA2 A; 3R0G A; 4MPM A; 5ILP A; 1G0A B; 2EF2 A; 4N7O B; 2BLJ M; 4HSW A; 3ODQ A; 4ODC A; 1GBU B; 4B4Y A; 2XKI A; 1CQ2 A; 4MU5 A; 3WHM B; 1MLS A; 1SDL B; 1MTK A; 3G4U A; 1IBE A; 1NAZ A; 3KUO A; 1IWH B; 2LH7 A; 6HBI A; 1OUT B; 3HXN A; 6HBW B; 1EBC A; 1HBA B; 1NWI A; 1X9F D; 1CLS B; 3WCW C; 1V9Q A; 2YRS B; 3OO4 B; 1HDB B; 1LFT B; 2D2N C; 2AUQ A; 3WI8 A; 1NWN A; 3M38 A; 3MOU A; 1GZX B; 1ABS A; 2G10 A; 3ARL A; 1HJT A; 1O1P B; 3S66 A; 1YH9 B; 3E5I A; 3PT7 A; 5EOH A; 1JW8 A; 102M A; 3ARK A; 1A0Z B; 2R4X A; 3AG0 A; 2OH8 A; 1LFV B; 2QLS A; 1H97 A; 3D1A B; 2ZLT A; 2O58 X; 2QRW A; 2H8F B; 4OOD A; 3VRG A; 3M3B A; 2MB5 A; 5HLX A; 2GRH A; 3A5A A; 4M4A B; 1CQX A; 4MQH B; 1FN3 A; 3IC2 A; 1HGC A; 1HCO A; 2VYW A; 1S5X B; 2DHB B; 3WCU B; 2V1E A; 1JEB A; 2ZS1 C; 1LHT A; 3BJ3 A; 3UH3 A; 2VYZ A; 4NXA A; 4FWX A; 2HBE A; 3QJB B; 3RGK A; 4C44 A; 1YEU B; 1XZ7 A; 1FHJ A; 2D60 B; 1LHS A; 2V1I A; 1Y4Q B; 2O5O X; 3EOK A; 4ESA A; 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1XCH A; 1A4F A; 1SI4 B; 1CMY B; 1G09 B; 1GVH A; 1V75 A; 1BBB A; 1Y46 A; 1IRD A; 1CBL A; 3G46 A; 1Y4G A; 2DN1 A; 3K8B A; 1YDZ B; 3UHE A; 1MLQ A; 2B7H B; 5ILR A; 2R4Y A; 5JGG A; 2LH1 A; 2BK9 A; 1HBH A; 3M39 A; 5JOM A; 1NIH B; 1GBV B; 1QSI A; 2Z6N A; 2W6Y A; 4N7N A; 2BLI A; 3WCU D; 1KR7 A; 3QZX A; 3NMM A; 3QZZ A; 2WTG A; 2R80 A; 1XZ2 B; 1M6M A; 1QPW A; 3HEP A; 1V4W B; 3G4W A; 1O1L A; 3LR7 A; 1O16 A; 3PIA B; 4KMV A; 5M3S A; 1A6M A; 5ILM A; 3D7O B; 1BZZ A; 2DN3 B; 3HEO A; 1YGF A; 3WR1 A; 1LH2 A; 1S6A A; 1XZV B; 2HHE A; 1V4X A; 1DXU B; 1O1N B; 2ZFB A; 1NZ3 A; 3HYU A; 3QJE A; 1Y7C B; 1YEQ B; 1A3N A; 4MQJ B; 3GQR A; 2ZSN A; 5F2A A; 3DHT B; 1A6K A; 1XZ4 B; 5CHR A; 1RQA A; 2GTL A; 3G4V A; 3ONZ B; 5EET A; 3WFX A; 3VRE B; 4X0L A; 1RTX A; 3G53 A; 1VRE A; 5CN8 A; 5CNC A; 3MJU B; 1U7R A; 1SDL A; 3S1J A; 1S61 A; 5EQM A; 1LFL B; 1MLR A; 1DM1 A; 1DKE B; 1SDK B; 2MGA A; 4FH6 A; 2HBC A; 1FLP A; 1VXC A; 1DO4 A; 4MXK A; 106M A; 3AQ9 A; 2V1H A; 3TLD A; 3ZJO A; 1CP0 A; 1M6C A; 1CLS A; 1LTW A; 1QXD B; 4UIQ A; 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