The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
54
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sequence length |
146
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structure length |
146
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Chain Sequence |
MHLTPEEKSAVTALWGKVNVDEVGGEALGRLLVVYPWTQRFFESFGDLSTPDAVMGNPKVKAHGKKWLGAFSDGLAHLDNLKGTFATLSELHCDKLHVDPENFRLLGNVLVCVLAHHFGKEFTPPVQAAYQKVVAGVANALAHKYH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Genetically Crosslinked Hemoglobin: A Structural Study
doi rcsb |
| molecule keywords |
Hemoglobin Alpha chain
|
| molecule tags |
Oxygen storage/transport
|
| source organism |
Homo sapiens
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| total genus |
54
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| structure length |
146
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| sequence length |
146
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| chains with identical sequence |
D
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2002-11-17 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| B | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2GDM A; 3A2G A; 1CH7 A; 1J7Y B; 5CNE A; 5CN8 A; 2OH8 A; 1QSH A; 109M A; 4FC3 A; 106M A; 1YGD A; 1MBN A; 4N7O A; 2PGH A; 1RQA B; 2ZFO B; 2MGJ A; 1K1K B; 1DXV A; 1V4X B; 1MLQ A; 3LQD A; 1G0A A; 1HDS A; 3ORD A; 3HYU B; 4OOD A; 2V1H A; 3D1K B; 4NK2 A; 1V4W B; 3R0G A; 1BAB B; 1VRF A; 3WCU D; 3FS4 B; 1RPS A; 1MLO A; 1YH9 A; 2HBF B; 1JWN A; 3UHY A; 1Y2Z B; 3QJD A; 5EUI B; 2VLX A; 1UIW B; 1YEO A; 3CIU B; 2PEG B; 2ZS0 C; 1OJ6 A; 2MGB A; 2HBE B; 5ILP A; 1MDN A; 2FRF A; 4HRR A; 3AQ6 A; 1DXU A; 1CP5 A; 4C0N A; 3GOU A; 1GCW A; 3D1A A; 5E6E B; 2VRY A; 1ECA A; 1C40 B; 4F6B A; 3WCV C; 2HBS B; 104M A; 1IT3 A; 4N8T A; 1YIE A; 2D5Z A; 3NMM B; 3ARL A; 2MHB B; 1QI8 B; 1Y0A A; 2DN3 A; 2D60 A; 3ZH0 A; 1RSE A; 1O1N A; 6HBW B; 3NL7 A; 1LFV A; 1A0U A; 2QSP B; 4PQC A; 1YGF A; 1Y4F B; 3GYS A; 4ODC B; 3ARJ A; 1D8U A; 1JDO A; 2ZFO D; 1LH3 A; 2VYW A; 1ASH A; 2ZT0 A; 3NG6 A; 3GDJ A; 2G0V A; 3P5Q B; 5SW7 A; 2ZLT A; 4YU4 B; 1V9Q A; 1RTX A; 1WMU B; 2LH5 A; 1SHR A; 3PI9 B; 1BZP A; 4ROL B; 5EV5 A; 1X9F D; 3ARK A; 3UGZ A; 2MGA A; 2MB5 A; 2ZS1 C; 1Y09 A; 2HZ3 A; 1HV4 B; 1A00 B; 1Y8H B; 5HU6 A; 3BJ1 B; 2LH3 A; 3ZJL A; 4MQH B; 1S5X A; 1GBV B; 2W6W A; 1HGC A; 4F6G A; 1MLR A; 2R4Y A; 3OZW A; 3QM9 A; 1IWH B; 3W4U A; 1J41 B; 3K8B B; 2ZLW B; 2QSS B; 1AJH A; 1EMY A; 1G0B B; 1IBE B; 1MBI A; 1YIH B; 4MAX A; 3LB1 A; 1Z8U B; 1B86 A; 1FN3 B; 2SPM A; 1YHU B; 1GBU A; 1CO9 A; 1ABY B; 5EYS A; 1CIK A; 1LFL A; 2GL3 A; 1Y0T B; 1C7D B; 3PI8 B; 3HF4 A; 2R1H B; 3GQP B; 1DUO A; 2QRW A; 1JL6 A; 3CY5 A; 1YHE B; 1EBC A; 4O35 A; 3S48 C; 1Y45 A; 3BJ2 A; 1J52 A; 4FH6 A; 1H1X A; 4B3W A; 3OK5 A; 4M4A B; 1SWM A; 1NS6 A; 1NPF A; 5KER B; 1THB A; 5MBN A; 1MNK A; 1DWT A; 5C6E A; 1V75 A; 108M A; 1J3Z A; 1Y8I B; 1NWI A; 2NSS A; 2EKT A; 1Y4V B; 2HHD B; 2MGH A; 5CHQ A; 2G10 A; 4WJG A; 4B4Y A; 1XZ2 A; 4XS0 A; 3SDN A; 3HXN A; 1NEJ A; 2O5Q X; 5AB8 A; 2JHO A; 4ROM B; 4ESA B; 1YVQ A; 1HCO B; 4UIQ A; 1DXC A; 1CH9 A; 2EB8 A; 4G1V A; 2R4Z A; 1HDB A; 1A9W E; 1ECN A; 4TWV A; 1MLS A; 3IA3 B; 1YMC A; 3UHS A; 3WCV B; 1YHU D; 1A4F A; 2QLS A; 2WTG A; 1VXC A; 3VRE A; 1LA6 A; 3GK9 A; 1JF3 A; 2ZSQ A; 1NAZ A; 1LFT B; 1YZI B; 1JZL A; 2GNW A; 2ZSR A; 1BIJ A; 1XY0 B; 1SI4 A; 4IRO A; 3ZJI A; 1NZ2 A; 3OO4 A; 1DO4 A; 3WFU A; 1KR7 A; 1Y01 B; 2V1I A; 1Y7C B; 2MYA A; 3R5I A; 1DXD A; 2Z6N A; 3PT8 A; 4H2L A; 1MLU A; 2OH9 A; 1S5Y A; 4MQG B; 3LR9 A; 3TM3 A; 3PT7 A; 1HHO A; 1LFZ B; 2D2M B; 3HEN A; 1CIO A; 5E29 A; 3ODQ A; 1Y5J B; 4YU3 A; 1IRD B; 1NQP B; 2ZSN A; 4UZV A; 3E55 A; 2HZ1 A; 5AZR A; 3G4W A; 1MKO B; 1Y4G B; 3ZJP A; 1H97 A; 1YVT A; 2ZSS A; 3VRG B; 4KMV A; 5CNC A; 1RVW B; 3WI8 A; 1HBS B; 1IT2 A; 1DXT B; 3A0G B; 3NFE A; 1YMB A; 5M3S A; 1JP9 A; 1LH2 A; 4HSW A; 1A0Z A; 3G4Q A; 1CH2 A; 2ZWJ A; 5EOH A; 1BIN A; 1JF4 A; 1YDZ A; 4L7Y B; 2DN1 A; 3H57 A; 3MJU A; 1ABW B; 2OHB A; 1TES A; 3ZJQ A; 1Y4R B; 1BZ1 A; 1T1N A; 3UHW A; 4NXA A; 1OUU A; 4M4B A; 4ZVA A; 1XZ5 A; 1RQ4 A; 3UHI A; 4HHB A; 1VXH A; 2VLY A; 4N7N A; 3UHG A; 3WTG B; 2ZFO C; 1GLI A; 1Y5K A; 1HDA A; 3HRW B; 3PIA A; 3UHQ A; 1YEU B; 1VXD A; 1O1K B; 2O5L X; 3DUT B; 1BUW A; 1MBO A; 2D2N B; 1YG5 B; 2HCO B; 1LJW A; 5C6Y A; 5E83 A; 4DWU A; 3AT6 A; 3AQ5 A; 2ZLV B; 3BCQ A; 2H8D B; 1J3Y B; 1S0H B; 2BW9 M; 3SDH A; 1C7B B; 2R4W A; 3UHC A; 3EU1 B; 1MLG A; 3WCT B; 1YEQ A; 2AV3 A; 1OFJ A; 1HAC B; 4MQC A; 1IRC A; 2G0R A; 1HGA B; 1G08 B; 4NI1 B; 1UMO A; 3ED9 A; 3LB3 A; 3D17 A; 2ZT4 A; 2H35 A; 2ZSP A; 4VHB A; 1Y31 A; 1MBA A; 1YEV B; 1J7S A; 1NS9 B; 1CG5 A; 4MQI B; 3ZJJ A; 1DUK A; 1MOD A; 3ASE A; 3OZU A; 1LFY B; 2H8F A; 4MU5 A; 2BLH A; 2G3H A; 1XZU B; 2DXM A; 3BA2 A; 1FSX B; 1YHR B; 3S65 A; 3HHB A; 1O1J A; 3UH7 A; 4N7P B; 1MWC A; 1MOH A; 2RI4 B; 5JDO D; 1CMY B; 4L2M A; 3WCU B; 1A01 A; 3WHM A; 4O4Z A; 1Y4P B; 3VRF B; 5ILR A; 3WCT D; 3MJP B; 3M39 A; 3SZK A; 3QJB B; 3S1J A; 1R1X B; 1K0Y A; 4HRT A; 2R80 A; 3UHR A; 4FWX A; 2QMB A; 4WCH D; 5CNF A; 1Y7D A; 4C44 A; 4F6D A; 2HZ2 A; 3OO5 A; 1GZX A; 4MBA A; 1J7W A; 1RQ3 B; 3QM8 A; 1YCA A; 3MKB A; 2HBG A; 1DO1 A; 1HBB A; 2ZSY A; 1VXA A; 2LH6 A; 1YHU C; 1CLS A; 1J40 B; 1FHJ B; 5KKK A; 5B84 A; 2OLP A; 2VEB A; 3WCW A; 1LFQ B; 1JZK A; 1KD2 B; 1HJT A; 5D5R A; 3IC2 A; 1Y7G B; 5CNG A; 1CPW A; 3MYM A; 1VWT A; 3UHE A; 3QJC B; 2XKG A; 1MBC A; 3ONZ B; 2AUQ A; 1KFR A; 1N9I A; 1MYF A; 3WFX A; 1XQ5 A; 3PI2 A; 3QZZ A; 3A5B A; 3ZOL A; 3QQQ A; 3QJE B; 1X9F B; 2W6X A; 1L2K A; 2HBC B; 3GLN A; 1UVX A; 1O1M A; 1Y22 B; 1O1P A; 2GRH A; 4BJA A; 1N9F A; 1SDL B; 3A9M A; 1Y0C A; 3TLD A; 2YRS A; 3BOM A; 3OZV A; 1JY7 B; 3PEL A; 2G12 A; 1A9W A; 3G46 A; 4FWZ A; 4MQK A; 2M6Z A; 1JP6 A; 4NI0 B; 3D7O A; 5KDQ A; 2QFN A; 2DC3 A; 1IOP A; 1GDJ A; 1QSH B; 4FC3 B; 4FWY A; 1YGD B; 2ZLX A; 4N7O B; 2PGH B; 1G09 A; 1DXV B; 3LQD B; 1G0A B; 1HDS B; 1O1O A; 1UX9 A; 3ZJO A; 3WR1 A; 102M A; 2GTL A; 1RPS B; 4F4O A; 1YH9 B; 1GDI A; 4PNJ A; 3D4X A; 2B7H A; 2D2M C; 1UT0 A; 4H0B A; 3GQG A; 1R1Y A; 1MNJ A; 3QJD B; 1Y8W A; 2C0K A; 2MGE A; 1Y5F A; 1YOH A; 1YEO B; 1MYH A; 1YCB A; 4F6I A; 1GDK A; 1NIH A; 2Z85 A; 4HRR B; 4HSX A; 3DHR A; 1DXU B; 3UHH A; 3GOU B; 4MXK A; 1GCW B; 3D1A B; 3OGB A; 1QSI A; 1AJ9 A; 1URY A; 3UHN A; 3G53 A; 1CH4 A; 1DWS A; 2ZFB A; 4MQJ A; 1WVP A; 4N8T B; 1YIE B; 1O1L A; 2D5Z B; 1Y85 A; 3MVC A; 1DLW A; 2W6V A; 5EYJ A; 2XKH A; 3KMF C; 2XKI A; 1Y0A B; 2DN3 B; 4GZG A; 2D60 B; 1BZZ A; 3A5A A; 2G14 A; 1O1N B; 2HHE A; 1HSY A; 3NL7 B; 5JDO F; 3LHB A; 4F6J A; 1LFV B; 1A0U B; 2ZS0 A; 1YGF B; 1O1I A; 1A3O A; 1FAW A; 1M6M A; 3GYS B; 3UBC A; 1MNH A; 3G4Y A; 2G11 A; 1CBL A; 2V1J A; 3NG6 B; 3GDJ B; 2AUO A; 5SW7 B; 3AG0 A; 2ZLT B; 2EVK A; 2LHB A; 1F5O A; 2ZT3 A; 3S66 A; 1SHR B; 2BWH A; 1GJN A; 3EOK A; 3UHU A; 3UH6 A; 1Y0W A; 4NS2 A; 1HLB A; 1MLH A; 1Y09 B; 5HY8 A; 1XXT A; 5AZQ A; 5HU6 B; 3G4V A; 1NPG A; 1EW6 A; 3ECL A; 1S5X B; 1C7C A; 1QXD A; 1S69 A; 1Y35 A; 1HGC B; 3AT5 A; 1XZ4 A; 5JDO C; 1XZV A; 1CG8 A; 2BK9 A; 2D2N C; 2FRI X; 1COH A; 1Y4B A; 3W4U B; 2MYD A; 3UH5 A; 101M A; 3RGK A; 3E5I A; 3UBV A; 1U7R A; 2LH7 A; 3WCT C; 2ZS1 A; 3MBA A; 1YE2 A; 1YE0 A; 1B86 B; 1LHT A; 1VRE A; 3A59 A; 1GBU B; 1BJE A; 2AA1 A; 1W92 A; 3DHT A; 1LFL B; 1RTE A; 3HEO A; 3HF4 B; 5EQM A; 3CY5 B; 3G4U A; 1UX8 A; 2O58 X; 2HHB A; 3WCP A; 2QFK A; 1Y0D A; 1Y45 B; 3BJ2 B; 1UC3 A; 4U8U A; 1NS6 B; 1XYE A; 1THB B; 1BBB A; 1MZ0 A; 1HBH A; 5C6E B; 3FH9 A; 1V75 B; 1J3Z B; 2XYK A; 3QMA A; 1OUT A; 2VHB A; 2IG3 A; 2FRJ X; 1QPW A; 2ZLU A; 4X0L A; 1HBA A; 4OF9 A; 1XZ2 B; 2IN4 A; 1SDK A; 4SDH A; 4XS0 B; 3HXN B; 1NEJ B; 1GCV A; 1BVD A; 1Y46 A; 2DHB A; 1MYG A; 5HLX A; 3GKV A; 2V1G A; 1YVQ B; 3WCU C; 1HBR A; 2O5T X; 2MYE A; 1HDB B; 3B75 A; 3IC0 A; 1PMB A; 1F65 A; 2ZST A; 3ZJM A; 1CH1 A; 1PBX A; 1A4F B; 1YFF A; 2QLS B; 1FLP A; 1Y83 A; 3VRE B; 1LA6 B; 1MTJ A; 1DKE A; 1HGB A; 1LTW A; 5HLU A; 1J3F A; 1BIJ B; 1SI4 B; 2EKU A; 4IRO B; 2GKM A; 1JEB A; 1Y4Q A; 1JPB A; 1A3N A; 3OO4 B; 1SPG A; 3TM9 A; 1HAB A; 4MBN A; 2WTH A; 1VXB A; 3UH3 A; 3BJ3 A; 3R5I B; 5D1V A; 4NXC A; 4DC7 A; 2Z6N B; 3PT8 B; 4MPM A; 4H2L B; 1MLK A; 1S5Y B; 1LHS A; 1BZ0 A; 3PT7 B; 1HHO B; 5E29 B; 111M A; 3ODQ B; 2O5M X; 1HBI A; 3ZJS A; 3K3U A; 4YU3 B; 1YMA A; 3G52 A; 1QXE A; 1MLJ A; 4LPI A; 1S61 A; 1MYI A; 2W72 A; 1YVT B; 1Y8K A; 1X9F C; 2ZS1 D; 1AZI A; 3KUO A; 1A6K A; 1V4U A; 3QQR A; 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3S65 B; 3HHB B; 1O1J B; 2O5S X; 1A6G A; 5E6E A; 1C40 A; 1MLL A; 1JW8 A; 3V2V A; 2R4X A; 1VXE A; 2HBS A; 2W6Y A; 1I3E A; 1MLF A; 2GNV A; 1SPE A; 3NMM A; 2MHB A; 3WFT A; 4DWT A; 1QI8 A; 1A01 B; 2ZSO A; 3WHM B; 1DWR A; 1YOG A; 3S1I A; 6HBW A; 2QSP A; 3G4R A; 1Q1F A; 1MOC A; 1Y4F A; 4ODC A; 3LR7 A; 3SZK B; 1TU9 A; 2MGD A; 5CHR A; 3P5Q A; 1K0Y B; 4HRT B; 2R80 B; 3IXF A; 4QAU A; 4YU4 A; 1WMU A; 2QMB B; 3PI9 A; 1Y7D B; 4O1T A; 4ROL A; 1BZ6 A; 3OO5 B; 2V1F A; 1GZX B; 2G0S A; 1J7W B; 3M38 A; 3ECX A; 3MKB B; 3PI1 A; 5JOM A; 1CO8 A; 1HBB B; 1HV4 A; 1A00 A; 2LH2 A; 1Y8H A; 2NRL A; 5F0B A; 3BJ1 A; 4MQH A; 1CH3 A; 1CLS B; 1GBV A; 4NK1 A; 2BLI A; 4KMW A; 3WCW B; 5CN7 A; 2MGK A; 1IWH A; 1J41 A; 3K8B A; 2ZLW A; 2QSS A; 2WY4 A; 3IC2 B; 3AQ9 A; 1G0B A; 1IBE A; 1LUE A; 3UGY A; 2DN2 A; 2LH1 A; 4MXL A; 5HBI A; 1VWT B; 2AV0 A; 3QZX A; 1YIH A; 1UFJ A; 103M A; 1A6M A; 1FN3 A; 2NRM A; 1YHU A; 3LB4 A; 2V1K A; 1UVY A; 1ABY A; 1XQ5 B; 2FAM A; 2G0X A; 5EET A; 1Y0T A; 1C7D A; 3PI8 A; 2R1H A; 2GRF A; 1I3D A; 3GQP A; 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