The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
53
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sequence length |
146
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structure length |
146
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Chain Sequence |
VHLSAEEKEAVLGLWGKVNVDEVGGEALGRLLVVYPWTQRFFESFGDLSNADAVMGNPKVKAHGKKVLQSFSDGLKHLDNLKGTFAKLSELHCDQLHVDPENFRLLGNVIVVVLARRLGHDFNPDVQAAFQKVVAGVANALAHKYH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Structure determination of porcine haemoglobin.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
PORCINE HEMOGLOBIN (ALPHA SUBUNIT)
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| molecule tags |
Oxygen transport
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| total genus |
53
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| structure length |
146
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| sequence length |
146
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| chains with identical sequence |
D
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 1999-05-30 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| B | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2QMB A; 3OO5 A; 2VLX A; 3PI2 A; 4HHB B; 4L7Y B; 3BOM A; 1CH5 A; 1I3E A; 1V9Q A; 3QJC A; 1R1X A; 3W4U A; 1UFJ A; 4ESA B; 1Y5J A; 2HBC B; 3UBC A; 1FAW A; 3WHM A; 3AG0 A; 1YEU A; 2DN2 B; 3MVC A; 2IN4 A; 3ZJH A; 1XZ5 A; 1O1O B; 4ROL A; 2G0X A; 1MYH A; 3PI8 A; 4U8U A; 1V5H A; 2O5T X; 106M A; 4NS2 A; 1BZ1 A; 1NXF A; 2QFK A; 3FH9 B; 1KR7 A; 1NIH A; 3WI8 A; 2CMM A; 3A5G A; 1LA6 A; 2ZSS A; 2G10 A; 1DKE B; 1BZ6 A; 1BZZ B; 1YEO B; 1MNK A; 4ZVA A; 1MOB A; 1LH5 A; 1G9V A; 4BJA A; 1I3D A; 1Y7Z A; 1O1P B; 1FSX A; 2HCO B; 1MLU A; 2AV3 A; 3D17 B; 1RQ4 B; 3WCV B; 3HHB A; 1MLN A; 1YHR A; 1XY0 B; 3NML A; 1T1N A; 2ZSX A; 1HBR A; 5JDO E; 3LQD A; 1JPB A; 3WCT B; 2MYE A; 1O1I A; 1UX9 A; 5HLU A; 2SPL A; 1XZ7 B; 1XZ2 B; 1F5O A; 3CY5 B; 1XZ4 B; 2D2M A; 1G0A A; 1URV A; 1HAC B; 2B7H A; 3ZJN A; 2ZLV B; 1CQ2 A; 1S0H B; 2D6C A; 3IC2 A; 4GZG A; 1AJ9 B; 2VLY A; 3P5Q B; 1DUO A; 2HZ1 A; 3DUT A; 4FC3 A; 2O5Q X; 1JL6 A; 1R1Y B; 5ILM A; 1MNH A; 4XS0 B; 2OHB A; 3UHW A; 1RVW B; 1KD2 A; 2Z8A A; 1F63 A; 1HSY A; 1Y45 B; 4HSW A; 3WR1 B; 1NS9 B; 3NL7 A; 1Y22 A; 1JP6 A; 1VWT A; 112M A; 2RAO A; 3UBV A; 4N8T A; 1LFV A; 5CN8 A; 1YOH A; 2M6Z A; 3GLN A; 1ABW A; 5HLQ A; 3GQR A; 1HAB A; 1UC3 A; 5E29 B; 2ZSZ A; 2FRI X; 2VYW A; 111M A; 3UH5 A; 1MLR A; 1NPG A; 1CMY B; 3D4X A; 3ZOL A; 2D2N C; 1MWC A; 3HYU B; 1XZU A; 3G4V A; 3BJ2 B; 1A4F A; 3OO5 B; 1HBG A; 2PGH A; 1MNO A; 5HAV A; 1YVQ B; 3QJC B; 2ZS1 D; 1AZI A; 5C6E B; 1CQX A; 1R1X B; 1Y5J B; 1DXT A; 2EF2 A; 1MBD A; 2DN1 B; 3A0G B; 3WFX A; 3S65 B; 2ZSY A; 1RSE A; 1ASH A; 2O58 X; 4IRO A; 2AV0 A; 1DTI A; 1NZ5 A; 3AT5 B; 4ROL B; 2AUQ A; 1Y8W B; 2Z6S A; 2OHA A; 1Y0A B; 4U8U B; 3M38 A; 3BJ1 A; 1NEJ A; 1S5Y B; 2HBE A; 3UHV A; 1ABY A; 1N9F A; 1J7S B; 4DC7 A; 3UHC A; 1GDL A; 3QJB A; 3E5I A; 1CO9 A; 3TLD A; 1GJN A; 4QAU A; 4YU3 B; 1YZI A; 2R4Y A; 1LHT A; 1ABS A; 6HBW B; 3DHT A; 5CN6 A; 4H07 A; 2XKG A; 2MYB A; 3UHZ A; 3EOK B; 1X3K A; 1LFY A; 3WCW D; 3V2V A; 1Y4V A; 1YEQ B; 101M A; 5D5R A; 4U8U C; 1G9V B; 3GKT A; 1Y5F B; 1Y0C A; 2H8D A; 3LB1 A; 1IRD B; 2LH6 A; 1SDK A; 2ZFO A; 3LB2 A; 1YHE B; 3AQ9 A; 3UGZ A; 1X9F B; 2C0K A; 4ODC A; 2OH9 A; 1M9P B; 3ARJ A; 1MLG A; 4F68 A; 1XZV A; 1Z8U B; 2VEE A; 1Y2Z B; 3RJN B; 1V4U A; 3QQQ A; 1O1I B; 3QM5 A; 1G08 A; 5KKK A; 3GK9 A; 2BW9 M; 1HV4 A; 3UH6 A; 1SHR A; 3SDH A; 5F2A A; 2B7H B; 5CNF A; 4YU4 B; 1NWI A; 1X9F C; 1COH B; 3UHB A; 1MLS A; 1XYE A; 1THB B; 1BZP A; 2DN3 B; 2FAM A; 5EE4 C; 3EDB A; 1WVP A; 4TWV A; 5CN7 A; 1Y31 A; 4MQG B; 3MN0 A; 1KD2 B; 2ZT1 A; 2BLI A; 1GCV A; 1OUU A; 1A3O A; 3VRF A; 2D2M C; 1U7R A; 2ZT2 A; 1RTE A; 2GKN A; 3A5B A; 3OK5 A; 1YCB A; 4FWZ A; 2ZT0 A; 4PQ6 A; 2ZSQ A; 1BZR A; 2MGM A; 1UT0 A; 5EYJ A; 1HAB B; 1MWB A; 1MWD A; 1GVH A; 4HRT B; 1YEN B; 1MLJ A; 1MYZ A; 108M A; 4N7P B; 2HHE A; 1DXU B; 4HBI A; 1OUT B; 4DWT A; 5EQM A; 3EU1 A; 3GYS A; 4G51 B; 4NI1 A; 1Y4B B; 3D4X B; 1RQ3 A; 2AUR A; 103M A; 1A4F B; 1Y8K A; 2G0Z A; 1MYT A; 1YGD B; 2FRJ X; 1JF4 A; 4PQB A; 3G4R A; 2KSC A; 4SDH A; 3MYM A; 3AT6 A; 2V1F A; 1UVX A; 1MBS A; 2XKH A; 3WCP A; 1CLS B; 1K1K A; 1MYG A; 3GQG A; 1YVT A; 2ZLW A; 1A0Z A; 4C44 A; 2V1I A; 2JHO A; 1IOP A; 1ABY B; 1Y4F A; 1SI4 B; 3CIU A; 3QJB B; 1Y7C B; 1IT3 A; 1YZI B; 1CO8 A; 3LR7 A; 3U3E A; 1MBC A; 1HBS A; 2G3H A; 1V75 B; 4M4B A; 1HBH A; 4F4O B; 1PBX B; 3A9M A; 3ZJL A; 4IT8 A; 2ZS0 B; 5CN5 A; 1Y7G B; 1GBU A; 1HBI A; 2MGC A; 4ODC B; 1HJT A; 1KFR A; 1AJH A; 3ZJR A; 2R4Z A; 2MYC A; 1RPS A; 3NG6 A; 3PIA A; 1JEB A; 3OZV A; 3LB3 A; 2HHB A; 1MLL A; 1O16 A; 4H2L A; 3MJP A; 4N7N A; 1HV4 B; 1MLF A; 3QM8 A; 1SHR B; 2ZLU A; 5KER A; 2ZFO C; 3FS4 A; 1F65 A; 3KUO A; 2DXM A; 1XQ5 B; 2V1J A; 3RGK A; 1FLP A; 1NGK A; 1JZM A; 3QJE A; 3UHI A; 1C40 B; 3ZJQ A; 5ILR A; 2O5S X; 5CNC A; 1BBB B; 1YIH A; 4N7O A; 1XCH A; 3UHX A; 1BAB A; 2H8F A; 2ZLT B; 4B3W A; 4MQK B; 4VHB A; 1QPW A; 2BLJ M; 2ZSP A; 3HXN A; 2GRF A; 1GCV B; 3PI4 A; 3GOU A; 3D7O A; 1Y85 B; 2GRH A; 3M3B A; 2MB5 A; 3GQP A; 1QXE B; 110M A; 1HCO B; 2D60 A; 3WCU D; 2H35 A; 2QRW A; 4C0N A; 3K3U A; 1J3Y B; 3QM6 A; 5HBI A; 1VRF A; 1C7C B; 2AUO A; 3ZJI A; 3GYS B; 1BZ0 B; 1FN3 A; 3HF4 A; 3ECX A; 2VLZ A; 3VRG B; 5JDO C; 3MBA A; 2GTL B; 1LFT B; 3ED9 A; 4PQC A; 3NFE A; 1LFL B; 1Y0T B; 2SPM A; 1WLA A; 2ZS1 A; 1MLM A; 1CBL A; 4MPM A; 3AT6 B; 3UH3 A; 1QXD A; 3WCP B; 1S56 A; 2D5Z B; 3GQG B; 1JY7 B; 1A00 B; 2ZLW B; 1VRE A; 1NS6 A; 2YRS B; 1YG5 A; 3HEO A; 1YDZ B; 1CG8 A; 2GTL C; 1MGN A; 1Y8I B; 3WFT A; 2HBF A; 4F6G A; 1UIW B; 1GCW A; 2MHB B; 3ZHW A; 1HDA B; 2EB8 A; 3BCQ A; 3WCW A; 1DWS A; 3ODQ B; 1EWA A; 3LR9 A; 2HHD A; 3EDA A; 3MOU A; 3S66 B; 1YOG A; 1QSI A; 1QI8 A; 2BLH A; 4MAX A; 1Y4P A; 1O1K B; 2VYY A; 4M4A A; 5HU6 A; 3UHU A; 3MJU A; 2G0R A; 1GLI A; 3MKB B; 1V4X A; 1JEB B; 1XXT A; 2VM0 A; 4G1B A; 2D5X A; 2BNL A; 2W72 A; 1MYM A; 1BUW A; 3UH7 A; 5AZQ A; 1HBB B; 1ITH A; 1SPG A; 1FHJ B; 3B75 A; 3HEP A; 1Y8H A; 1DLW A; 4JYQ A; 3D1K B; 2DXM B; 3QJD A; 1FDH A; 1PMB A; 1J7W B; 3H57 A; 3PT8 A; 3ONZ B; 4UZV A; 2QSS B; 1NWN A; 2WTG A; 1S5X B; 1C7D B; 3OO4 B; 2ZSN A; 1IRC A; 1O1M A; 1YH9 B; 1YIH B; 1A9W A; 1BAB B; 1YHU B; 1YCA A; 3O89 A; 3VRE B; 1DUK A; 1HGC B; 3D7O B; 4O2G A; 3ZOM A; 4F6D A; 2Z85 A; 5CHQ A; 5CND A; 2MBW A; 2H35 B; 4MQI A; 2BKM A; 3DHR A; 3S1I A; 1CPW A; 1S6A A; 1O1N B; 5JOM A; 3PI9 A; 2QFN A; 5CNE A; 1HDS B; 2QLS A; 1MBN A; 3WCV D; 3HRW B; 4AVE A; 1YHU C; 1K0Y B; 3AQ6 A; 3QZX A; 3A2G A; 1J40 A; 2D2N B; 5HY8 A; 1G09 B; 4MQJ A; 1CG5 A; 1LJW A; 1BVC A; 4MQC B; 2ZLX B; 1FDH G; 1YFF A; 1BIJ B; 2MGA A; 1Y0W B; 3WCT D; 1SDL B; 1Y09 B; 3BJ3 B; 3ECZ A; 1CH9 A; 1MYJ A; 1VXH A; 1QSH A; 1Y35 A; 1YMA A; 2GNW A; 3QM7 A; 1G0B B; 2DC3 A; 1YGF A; 3ASE A; 1SPE A; 2ZSO A; 3AQ8 A; 1HBA B; 2XKI A; 2BWH A; 4B4Y A; 3HEN A; 3PT7 B; 1MBO A; 1WMU A; 1MTK A; 2QMB B; 1ECO A; 5EET A; 1CG8 B; 3BOM B; 4NXA A; 3W4U B; 1VXF A; 1GCW B; 1YOI A; 1FAW B; 3WHM B; 1V4W A; 1YEU B; 1IWH A; 5SW7 A; 2EB9 A; 3BCQ B; 3G4W A; 1XZ5 B; 4KMV A; 3PI8 B; 3ZJM A; 2MYA A; 1LUE A; 2ZSR A; 4O4T A; 1JF3 A; 1QSI B; 4WCH D; 5KDQ A; 1ECN A; 1BJE A; 1BZ1 B; 107M A; 1NIH B; 2GDM A; 1YE0 A; 1YEV A; 2ZT4 A; 3R5I A; 1LA6 B; 5JDO F; 3IC0 A; 1SWM A; 2OH8 A; 2G11 A; 4KMW A; 3G4Y A; 3WCW C; 2GRZ A; 1HGA A; 1DO3 A; 2MGK A; 4MBN A; 1Y7Z B; 1FSX B; 1BVD A; 4ROM A; 1DXC A; 1DO1 A; 3E4N A; 1Y46 A; 3HHB B; 5M3S A; 5E83 A; 1YHR B; 2W31 A; 3PT8 B; 4F6J A; 1T1N B; 3ZJO A; 1EBC A; 1TU9 A; 1NQP A; 1HBR B; 3LQD B; 1O1J A; 1MYF A; 2W6V A; 3SZK A; 1GZX A; 2R50 A; 7HBI A; 5MBN A; 3NMM A; 3G52 A; 1H1X A; 2EKT A; 1B86 A; 3R0G A; 5E6E A; 1OFJ A; 1MBI A; 2D2M B; 1G0A B; 1JZK A; 2E2Y A; 1IBE A; 5CNB A; 4HRR A; 1O1L A; 1ECA A; 2PEG A; 5JGG A; 3WCU A; 2ZWJ A; 3IC2 B; 5EUI A; 2HZ3 A; 3RJ6 A; 1LH6 A; 3DUT B; 4FC3 B; 3WFU A; 2RI4 A; 3ARK A; 1X9F D; 1MKO A; 5HY8 B; 2R80 A; 5D1V A; 3GDJ A; 2ZFB A; 5EE4 D; 1Y4R A; 1HHO A; 3A59 A; 3OJ1 A; 3UHR A; 3NL7 B; 1Y22 B; 3G46 A; 1MDN A; 1VWT B; 2RAO B; 4N8T B; 1LFV B; 4OF9 A; 3UI0 A; 1LFQ A; 4MQH A; 2M6Z B; 3ZJJ A; 1ABW B; 3GQR B; 1JWN A; 4X0L A; 4XDI A; 3D1A A; 2NRM A; 1CP0 A; 1LFZ A; 1VXE A; 2WY4 A; 1VXA A; 1XZU B; 4NI0 A; 2PGH B; 1Y01 B; 4HSX A; 1CH4 A; 1DXT B; 1UVY A; 4OOD A; 2Z6T A; 1TES A; 3PEL A; 1DXV A; 4IRO B; 2HBS A; 1X46 A; 3GKV A; 1Y7D A; 3KMF A; 3KUN A; 3BJ1 B; 1NEJ B; 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1Y8K B; 2MGL A; 1YIE A; 1AJ9 A; 3P5Q A; 3O7N A; 1GBV A; 1R1Y A; 4DWU A; 1RVW A; 4FH7 A; 2V1G A; 2BMM A; 3ORD A; 1K1K B; 1Y45 A; 1NZ2 A; 1YVT B; 3G4Q A; 3WR1 A; 1NS9 A; 1VXC A; 1A0Z B; 1S69 A; 3LHB A; 1Y4F B; 3CIU B; 4TWU A; 1A0U A; 1MBA A; 5CMV A; 5EOH A; 2EVP A; 1HBS B; 3OVU C; 1DTM A; 4M4B B; 3HYU A; 3QMA A; 1HBH B; 2GTL D; 3BJ2 A; 3VHB A; 3KMF C; 4DC8 A; 1YVQ A; 4MBA A; 5C6E A; 2SPN A; 1GBU B; 4NK2 A; 2DN1 A; 1M6C A; 3A0G A; 3S65 A; 1DO7 A; 2R4W A; 1DWT A; 1NPF A; 3AT5 A; 1Y8W A; 1Y0A A; 2V1E A; 2HBD A; 1RPS B; 3NG6 B; 1CBM A; 3PIA B; 1S5Y A; 1DXD A; 1BIN A; 1J7S A; 2HHB B; 2IG3 A; 2Z6N B; 4H2L B; 1C7B A; 3MJP B; 4N7N B; 4YU3 A; 3V2Z A; 2QU0 A; 2ZLU B; 6HBW A; 5KER B; 3S48 C; 3EOK A; 3FS4 B; 2LH5 A; 3M3A A; 3OGB A; 2HBG A; 2MGE A; 2FAL A; 1Y0D A; 3VAU A; 1YEQ A; 1Y4G B; 3QJE B; 3M39 A; 1LH2 A; 4F69 A; 1MZ0 A; 3K8B A; 4N7O B; 1Y5F A; 2MGF A; 4H0B A; 1IRD A; 2H8F B; 4FWX A; 1RQA B; 1QPW B; 1YHE A; 1X9F A; 3HXN B; 1JL7 A; 1JZL A; 3GOU B; 1M9P A; 2LHB A; 3GQP B; 3IA3 B; 1J3Z A; 1MTJ A; 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