The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
53
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sequence length |
144
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structure length |
136
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Chain Sequence |
VEWTDKERSIISDIFSHMDYDDIGPKALSRCLIVYPWTQRHFSGAIIGNANVAAHGIKVLHGLDRGVKNMDNIAATYADLSTLHSEKLHVDPDNFKLLSDCITIVLAAKMGHAFTAETQGAFQKFLAVVVSALGKQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
The oxidation process of Antarctic fish hemoglobins
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Hemoglobin alpha chain
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| molecule tags |
Oxygen storage/transport
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| total genus |
53
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| structure length |
136
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| sequence length |
144
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2004-01-22 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| B | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1VXA A; 1A3N A; 1OR6 A; 4XS0 A; 1Y0D A; 2NSR A; 2O5B X; 3G4Q A; 2QU0 A; 1O1K A; 3NMM B; 3PI1 A; 1MWB A; 3UHE A; 5AZQ A; 1RTE A; 3MN0 A; 1A9W E; 2R1H B; 2W6V A; 2W72 A; 2VLZ A; 1CG5 B; 1HBI A; 3UGZ A; 1K1K B; 3O7N A; 2D2N D; 1Y8H A; 2YRS B; 1GBU B; 3S65 A; 1YIE B; 1CQ2 A; 5B84 A; 1R1Y B; 1Y0T A; 3UHW A; 2GLN A; 3K8B B; 3ZJO A; 4NI1 A; 1Y0W A; 3AQ9 A; 4ROM B; 1HGC A; 1VHB A; 4MBA A; 3D4X B; 2MGG A; 3S66 A; 3UHU A; 1J7W B; 1XY0 A; 4N7O A; 3E5I A; 3E55 A; 1NIH A; 5CNC A; 2BK9 A; 2HZ1 A; 1M6M A; 2H35 B; 3MJU B; 4F69 A; 1NXF A; 4NS2 A; 4HSX A; 3GKV A; 5JDO E; 1NQP A; 1WMU A; 3UHR A; 1H97 A; 3D1K A; 1Y0C A; 1YEO A; 104M A; 2VLY A; 1O1J A; 1VXF A; 1SDL A; 4BJA A; 1MLJ A; 1NWI A; 4O35 A; 5CNG A; 2W6X A; 1LJW A; 3ARK A; 3G4U A; 3G4R A; 3A5G A; 1ASH A; 1GCW B; 1V4U B; 4DC7 A; 5M3S A; 2BLI A; 1MLU A; 2WY4 A; 108M A; 2O5O X; 4UUR A; 2D5Z A; 1DXU B; 1HBA A; 3LQD A; 1J7S A; 1MBA A; 2DXM B; 1CO9 A; 2SPN A; 3ZOL A; 3SZK B; 1UT0 A; 1OR4 A; 1NEJ A; 3WHM B; 1Y5F B; 2ZFO C; 2FAM A; 1QSI B; 2MYE A; 1CO8 A; 1A6N A; 4FWX A; 3VRG B; 3EU1 A; 1VRE A; 1Y4P A; 2ZSX A; 1FDH G; 5CN7 A; 5MBA A; 4X0L A; 3OO5 A; 1YVT B; 2MGM A; 1G08 B; 2LH7 A; 2BW9 M; 1PBX B; 5KER A; 3HXN A; 2MGF A; 1BVD A; 5KDQ A; 1JL7 A; 1Y09 B; 1J3Y A; 3WCU B; 1Y83 B; 1SHR A; 5EET A; 3A59 A; 1NS9 A; 1NWN A; 1WVP A; 3MKB A; 1LHT A; 1IDR A; 1V75 A; 3AQ7 A; 3D17 A; 3NL7 A; 1BZR A; 1A00 B; 1UIW B; 1YGF A; 1AZI A; 1RPS A; 4MQK B; 1C40 A; 1HBB A; 1G9V A; 4F6D A; 3VRE A; 1XZ2 B; 2QMB B; 3LR7 A; 1MOC A; 2ZLX B; 4G1B A; 1HGA B; 4AVE A; 1GCV A; 2ZLW A; 1Y31 A; 3UH7 A; 1S61 A; 1OUT B; 3OVU C; 3DHT B; 3WCT B; 4MQG A; 1LFZ A; 3UHQ A; 1JPB A; 4HHB A; 4C44 A; 3OZU A; 3WFW A; 1UFJ A; 3FH9 B; 1YZI A; 2DC3 A; 4MXL A; 3TLD A; 3PT7 B; 1NZ2 A; 1YEU A; 2ZS0 B; 2ZLT A; 1MBO A; 3AT5 B; 1J52 A; 2R4Z A; 2ZFO A; 2M6Z B; 1C7C A; 4F4O A; 4U8U A; 1FN3 A; 1MDN A; 1BIJ A; 1DM1 A; 1M9P A; 1UC3 A; 2ZSS A; 1LH5 A; 2FRF A; 3UHV A; 1MYM A; 1MYG A; 3G4W A; 2ZS1 D; 1XXT B; 1DXV A; 1J3F A; 2PGH B; 2GRZ A; 1GLI B; 2QSP B; 1JY7 A; 3V2V A; 3PT8 B; 1FLP A; 4O2G A; 2GNW A; 2ZSN A; 3OZV A; 1JF4 A; 2EKT A; 4M4B B; 2ZFO D; 3M39 A; 1LFL A; 2B7H A; 4HRT A; 1Y7Z B; 4U8U D; 3BJ3 B; 1UMO A; 2R4W A; 1JL6 A; 3HEN A; 1GDI A; 3HEO A; 1S56 A; 1J40 A; 1TU9 A; 1LFQ A; 1HAB A; 3DHR B; 1S5Y A; 1YEV B; 1VWT B; 2SPO A; 3GQG A; 3WCV C; 1CIO A; 1A6M A; 4L7Y B; 1NAZ A; 1QSH A; 3OO4 B; 1A4F A; 1FSX A; 1PMB A; 1SPE A; 2GRF A; 2GNV A; 1YEN A; 4C0N A; 1MKO B; 3OK5 A; 3WCW B; 4ZVB A; 2R4Y A; 1Y7G A; 1Y0A A; 1CLS B; 5CN8 A; 1S5X B; 1RQA B; 4YU4 B; 3W4U B; 1JEB B; 1CH2 A; 1BZ0 A; 3QJB A; 4ESA A; 3ONZ A; 1XZU B; 3ECZ A; 3HHB B; 3IC2 B; 4O1T A; 1YHR B; 1B86 A; 1H1X A; 1MLF A; 3DUT A; 1Y4B B; 4FWY A; 1CH5 A; 3PI9 A; 1DXT A; 2D2M D; 1DO3 A; 2MYB A; 3GQP B; 4G51 A; 4MQC B; 4LPI A; 1Y2Z A; 1YH9 A; 1ABW A; 1COH A; 3WFX A; 2W31 A; 3QJE A; 3UGY A; 1CMY A; 2OLP A; 2XKH A; 2VYY A; 2PEG B; 2DN2 A; 2ZLV A; 1J41 A; 2ZSR A; 3HRW A; 4ROL B; 1VXB A; 2EF2 A; 1LH2 A; 3SDH A; 2QSS B; 2VLX A; 3NG6 A; 3QM9 A; 1EBT A; 4H2L A; 2HHE A; 1Y8K B; 1LFY A; 4DWU A; 3WR1 A; 2DN1 A; 3R5I B; 5F2A A; 2HBC A; 5F0B A; 101M A; 1Y4V A; 1C7B A; 1YCB A; 2IN4 A; 1HDB A; 1UFP A; 4PQ6 A; 5HU6 A; 1MYJ A; 1NZ5 A; 4YU3 A; 1MLM A; 3HYU A; 1RQ4 B; 1MNJ A; 1FHJ A; 1YEQ A; 1DWR A; 3WCV A; 2ZST A; 1C7D A; 1Y22 A; 1IWH B; 2ZSY A; 1HV4 B; 4OOD A; 5C6Y A; 3GQR B; 1MLK A; 3BJ2 B; 1IRD A; 2ZFB A; 5HY8 B; 1NS6 A; 1XYE B; 5ILE A; 1GZX B; 4MQJ A; 1HDS A; 1HCO B; 2GKN A; 3NFE A; 1QXD A; 3KMF C; 3MVC A; 2H8F A; 2GTL A; 2D5X A; 1U7S A; 1HLB A; 4IRO A; 3PI8 B; 1MYT A; 4FWZ A; 3VRF B; 1Y5J A; 1Y4G A; 5SW7 B; 1SDK B; 1Y45 B; 1Y7D A; 2AA1 B; 1Y4R B; 2MGC A; 3WCV D; 3UHC A; 1YFF B; 1Y8W B; 3IA3 B; 3QM5 A; 6HBW A; 3G4Y A; 1T1N B; 5JGG A; 1IRC A; 2QRW A; 1YVQ B; 1DXD A; 1QXE B; 2WTH A; 3ZJS A; 4N8T A; 1XZ5 A; 1QI8 A; 2R1H A; 3BCQ B; 2GTL D; 1CG5 A; 4DWT A; 1CG8 B; 1UVY A; 2G0S A; 4KJT A; 1K1K A; 1B0B A; 2HBE A; 4AVD A; 2AV0 A; 1F5O A; 5CNF A; 1V4X B; 2CMM A; 3KUN A; 1YIE A; 1VRF A; 3ZHW A; 2V1I A; 3AT6 B; 4G1V A; 3K8B A; 4H07 A; 1EMY A; 4NI0 B; 2XKG A; 1VXG A; 3ZJP A; 1Q1F A; 1Y5K A; 5MBN A; 4MQI B; 2HZ3 A; 1HGB A; 3D4X A; 3WCU C; 5KKK A; 1X3K A; 1RTX A; 1LFT A; 1BJE A; 3UI0 A; 1MBN A; 112M A; 2JHO A; 3GYS B; 1CP5 A; 4NXA A; 3UHS A; 4PQC A; 1J3Z A; 2V1F A; 1Y35 B; 1LA6 A; 2ZT0 A; 3ZJI A; 2AUR A; 3QMA A; 1JW8 A; 1GBV B; 1DXC A; 3WFU A; 1A0U B; 1ECD A; 3ODQ B; 3G52 A; 3GOU B; 2G0R A; 2HHD B; 2IG3 A; 1MOH A; 1IBE B; 1HRM A; 1V4U A; 4M4A B; 2SPL A; 3WCT C; 2DHB A; 3WI8 A; 4PQB A; 3CIU B; 1CBL A; 3IXF A; 2D2N B; 1A3O B; 4SDH A; 3SZK A; 111M A; 2ZSZ A; 1G09 A; 2HCO A; 2HBS A; 3WHM A; 1YHU A; 5C6E B; 2FRJ X; 1QSI A; 3A5A A; 1Y46 A; 3OGB A; 1LH7 A; 5HAV A; 2BLJ M; 3ECX A; 1A3N B; 1CH9 A; 3VRG A; 5E83 B; 1Y0D B; 4MQH A; 3QM7 A; 3UBC A; 3UHK A; 1YHE B; 4UZV A; 1HBH B; 1LUE A; 1DO1 A; 1DTI A; 1YVT A; 2W72 B; 1O16 A; 2GDM A; 3O89 A; 4N7P A; 3RJN B; 5E6E A; 1Y8H B; 1Y09 A; 4QAU A; 1FCS A; 1XQ5 A; 1HHO A; 1RVW B; 3WCU A; 1O1N A; 2LH6 A; 1Y83 A; 5JOM A; 1YHU D; 1MZ0 A; 1Y0T B; 1MOA A; 2HZ2 A; 4ILZ A; 1A0Z A; 4NI1 B; 1Y0W B; 2OH9 A; 2MBW A; 4HRR B; 1ITH A; 2O5Q X; 1FAW B; 2OIF A; 3AQ8 A; 2O58 X; 1V4W B; 2BWH A; 1A00 A; 1UIW A; 4MBN A; 2ZLU A; 1XY0 B; 4MQK A; 4FC3 B; 7HBI A; 1FDH A; 1NIH B; 1I3E A; 106M A; 3GDJ B; 1NPG A; 3MOU A; 2VRY A; 3QJC B; 5CN5 A; 2O5L X; 1HBG A; 1JZK A; 1Y7C B; 3GKV B; 2ZLX A; 1HGA A; 1LH6 A; 3PI3 A; 3D1K B; 1Y0C B; 1OUT A; 1YEO B; 3WCU D; 3DHT A; 1MLS A; 1O1J B; 3HEP A; 1XZ4 A; 2RAO A; 3UH6 A; 3WCW C; 3FH9 A; 3GK9 A; 2QFK A; 3CY5 A; 2MGE A; 1ECO A; 5EYS A; 5EUI A; 3PT7 A; 2LH5 A; 1X9F B; 1N9X A; 5CHR A; 1UVX A; 1HAC B; 2M6Z A; 1HBA B; 2R80 B; 1J7S B; 4F6B A; 2OH8 A; 1JZM A; 1YMC A; 1UX9 A; 1Y8I B; 2MB5 A; 3ECL A; 1MTJ A; 1IT3 A; 1AJ9 A; 5IKS A; 1NEJ B; 3AQ6 A; 4MU5 A; 1LH1 A; 3G4V A; 1BZ1 A; 1CP0 A; 1AJH A; 1MBS A; 1MLH A; 1YE0 B; 1A01 B; 1VXD A; 1Y4P B; 2PGH A; 1GLI A; 2QSP A; 4X0L B; 3PT8 A; 3OO5 B; 3QZZ A; 3P5Q B; 1MLN A; 2HBD A; 2MYC A; 4M4B A; 3QQR A; 2W6Y A; 1KD2 B; 3BJ3 A; 3HXN B; 4OF9 A; 5KDQ B; 2ZSP A; 5CNB A; 2HBF B; 2MHB A; 3U3E A; 3LHB A; 1OUU A; 3MKB B; 1MLL A; 2ZSQ A; 1JZL A; 1L2K A; 3OJ1 A; 1VWT A; 1SI4 B; 1TES A; 5HBI A; 2O5S X; 1A6G A; 2O5T X; 1Y85 B; 1YDZ B; 3TM9 A; 2D60 A; 3OO4 A; 1GVH A; 1YG5 A; 1C40 B; 1G9V B; 2AUO A; 1MKO A; 1YOH A; 1DWS A; 1YGD B; 1GCV B; 5EOH A; 4ZVA A; 3ED9 A; 1LH3 A; 1CLS A; 3EDA A; 2ZS1 B; 4MPM A; 1CH1 A; 1RQA A; 4MQG B; 1K0Y B; 3W4U A; 1JEB A; 1DUO A; 4HHB B; 3K3U A; 3RGK A; 3BJ1 B; 1XZU A; 1MLR A; 1NGK A; 3IC2 A; 3PIA A; 3A0G A; 1GDK A; 1YE2 B; 1YEU B; 1YHR A; 2ZLT B; 2RI4 B; 5CND A; 1DLW A; 1Y4B A; 1C7C B; 3PI2 A; 1MLQ A; 1VXC A; 4N7N A; 4U8U B; 1BIJ B; 2D6C A; 1JDO A; 3GQP A; 1BZZ A; 1G0A B; 4MQC A; 5JDO F; 2DN3 A; 1HLM A; 1BUW B; 5EQM A; 2PEG A; 1BZ6 A; 2HHB B; 3BOM B; 1NZ4 A; 4MAX A; 5EU2 A; 1DXV B; 2ZT4 A; 1JY7 B; 1BAB B; 3E4N A; 3UHB A; 1BZP A; 2H8D A; 3ZJN A; 3R5I A; 3ZJQ A; 3ZH0 A; 1O1M B; 3V2Z A; 4F68 A; 1X46 A; 4HRT B; 3ZJJ A; 1HBR A; 2G14 A; 1HDA B; 4TYX A; 2FAL A; 4VHB A; 3UHD A; 3FS4 B; 1O1L A; 1J7Y B; 2GKM A; 1F65 A; 1HBS B; 1IWH A; 3GLN A; 2AV3 A; 1HV4 A; 3D7O B; 2G11 A; 1YIH B; 1ABY B; 1XYE A; 2WTG A; 1GZX A; 2EVP A; 2NSS A; 3D1A B; 3B75 A; 3IC0 B; 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1IBE A; 3K9Z A; 4ROM A; 2GTL B; 1MNO A; 3CIU A; 2VHB A; 1A3O A; 1J7W A; 1Y4G B; 1V5H A; 2H35 A; 2Z6S A; 1X9F C; 5C6E A; 3MJU A; 1XZV B; 2Z6N B; 4F6I A; 1MNI A; 2MGA A; 5E29 B; 5E83 A; 3WTG B; 1YHE A; 3KMF A; 5ILM A; 1HBH A; 5JGG B; 3MYN A; 4N8T B; 1XZ5 B; 1QI8 B; 4KMV A; 2LH3 A; 3VHB A; 3LR9 A; 1GCW A; 2HBE B; 3UHT A; 2Z6T A; 1DXU A; 1RVW A; 3LB1 A; 2DXM A; 1LFV B; 4JYQ A; 1R1X B; 4NK1 A; 1KR7 A; 4HRR A; 2MGH A; 1Y5F A; 2ZS0 C; 1IT2 A; 1Y5K B; 1FAW A; 1V4W A; 1HGB B; 3KUO A; 4XS0 B; 2QU0 B; 1O1K B; 1LFT B; 4FC3 A; 3VAU A; 1JP8 A; 3GDJ A; 2MYA A; 3QJC A; 1J3Z B; 1Y7C A; 1MBI A; 2W6V B; 1G08 A; 1LA6 B; 2QFN A; 1PBX A; 1GDL A; 2O5M X; 3UHH A; 1MYF A; 3S65 B; 1GJN A; 3BA2 A; 2OHA A; 2EB9 A; 5CNE A; 4WJG 1; 2LHB A; 1ECN A; 1MGN A; 1X9F A; 5EE4 D; 2W6W A; 1CQX A; 2ZS1 C; 3GKT A; 1HGC B; 1HAC A; 103M A; 2DHB B; 1F5P A; 2MGJ A; 2R80 A; 3S66 B; 3ZOM A; 2G12 A; 1Y8I A; 4N7O B; 1G09 B; 2HCO B; 1DO4 A; 2SPM A; 2HBS B; 1MOD A; 1BIN A; 1YHU B; 1MNH A; 5CN6 A; 1EWA A; 1XZ2 A; 2OHB A; 2QMB A; 1Y46 B; 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