The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
53
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sequence length |
144
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structure length |
136
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Chain Sequence |
VEWTDKERSIISDIFSHMDYDDIGPKALSRCLIVYPWTQRHFSGAIIGNANVAAHGIKVLHGLDRGVKNMDNIAATYADLSTLHSEKLHVDPDNFKLLSDCITIVLAAKMGHAFTAETQGAFQKFLAVVVSALGKQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
The oxidation process of Antarctic fish hemoglobins
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Hemoglobin alpha chain
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| molecule tags |
Oxygen storage/transport
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| total genus |
53
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| structure length |
136
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| sequence length |
144
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2004-01-22 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| B | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1HHO A; 1YOG A; 2ZSP A; 1QI8 A; 1NIH B; 1Y09 B; 1MNK A; 2HHB B; 1Y45 A; 2O58 X; 5ILE A; 3RGK A; 1LTW A; 4WCH D; 1NZ2 A; 1Y46 B; 3G4V A; 1M6C A; 5KKK A; 3OZV A; 4UUR A; 2CMM A; 4YU4 A; 3DUT B; 1Y0A B; 3BJ1 B; 4G51 B; 1HDA A; 1F65 A; 2ZS0 C; 1YHU B; 4F6G A; 2D6C A; 3MJP A; 1YGD A; 1CH3 A; 4WJG 1; 4MQJ B; 4PQC A; 4L7Y A; 4MAX A; 1NWN A; 1URY A; 5E29 A; 2ZS1 C; 3QQQ A; 5E6E B; 1Y8W B; 1HGA A; 3K3U A; 1HGA B; 4H2L A; 3ZJH A; 1U7R A; 1GCW A; 4UZV A; 4DWT A; 1GCW B; 1K1K A; 4U8U A; 1C40 A; 5CNG A; 1Y5J B; 2B7H A; 1C40 B; 1YHE A; 2B7H B; 3WCU D; 1LFL A; 3NG6 A; 1HBR A; 2ZT0 A; 4F6B A; 3NG6 B; 2DN3 B; 1HBR B; 1Y4P B; 4N7N A; 1X9F A; 2MGL A; 2BLJ M; 3GOU B; 3B75 B; 1JY7 A; 1DKE B; 3ZJP A; 1JY7 B; 1F63 A; 3OK5 A; 5CN4 A; 1MBS A; 2W72 A; 3UHC A; 5MBN A; 1RSE A; 3QJB A; 1ECN A; 3QJB B; 5E83 B; 2R4Y A; 1J40 A; 1JWN A; 2LH1 A; 3CY5 A; 3CY5 B; 1GZX B; 2ZSO A; 4HBI A; 5C6Y A; 1HBH B; 3UHN A; 2ZLU B; 107M A; 2D5Z B; 1O1L A; 2VYY A; 1NGK A; 2H8F B; 1J52 A; 1O1L B; 4MBN A; 3HYU B; 5SW7 B; 1RQ3 A; 3EOK B; 1LA6 A; 4H0B A; 1YMA A; 3A59 A; 3ZJI A; 1LHT A; 3A59 B; 3AT5 A; 4MQH B; 5F2A A; 2V1H A; 5AB8 A; 1MBA A; 2O5O X; 3UHT A; 1S5X A; 3NL7 B; 3LB4 A; 1XZ5 A; 1Y7Z B; 2D2M D; 1H97 A; 3ZJS A; 2LH6 A; 3PEL A; 3UHQ A; 1N9I A; 1FN3 B; 1PBX B; 3WTG B; 3WCU B; 3PI9 A; 4ROL A; 4ROM B; 3RJN B; 1LJW B; 4ROL B; 2OHB A; 1S5Y A; 2ZSY A; 3WFW A; 3SDH A; 1V5H A; 1A3O A; 2HBE A; 1YEQ B; 1A3O B; 1JZM A; 1GJN A; 3NML A; 1MKO B; 1OFJ A; 1Y4F B; 1T1N B; 1BZR A; 2G0S A; 3R5I B; 3FS4 A; 1CP5 A; 1YZI A; 5HU6 B; 3PI1 A; 3FS4 B; 1DXU A; 1J7W A; 3WCT D; 3LB2 A; 1HGC A; 3M3A A; 1V9Q A; 1S61 A; 1UC3 A; 3GQG B; 3PI3 A; 3GKV B; 2VRY A; 1CH7 A; 3WCP B; 2MYC A; 1IWH B; 1HGB A; 1MLN A; 1O1O A; 1Y0D A; 2YRS B; 1O1O B; 1Y0D B; 4WJG A; 1Y8H B; 1NWI A; 2D2M B; 1O1N A; 2HBC A; 1NPG A; 3UHE A; 5JGG B; 4F6J A; 4F4O A; 3H57 A; 1UVY A; 1VWT A; 2AUP A; 2HCO A; 1VWT B; 1LH6 A; 4VHB A; 5M3S A; 2ZLV B; 2R80 A; 2QSP B; 1CIK A; 1MLH A; 5KER B; 2R1H A; 3QM8 A; 2XKH A; 1O1M A; 2GTL C; 2R1H B; 3LB1 A; 1JP9 A; 1MNO A; 5AZR A; 1O1M B; 1EBC A; 1N9F A; 5EU2 A; 2RAO B; 1MGN A; 5EET A; 1A0Z A; 2EB9 A; 5CNC A; 1G0B B; 3NFE B; 2MGK A; 1O1J B; 5CNE A; 1J3Z A; 1G09 A; 1G09 B; 1HSY A; 2ZSX A; 2PEG A; 2ZSN A; 3ZJL A; 1YEN A; 1DXV A; 1YEN B; 1SHR A; 1Z8U B; 2MYE A; 1XZ4 A; 1CH5 A; 1MBC A; 1YE0 B; 1QSI A; 2ZLT A; 5EE4 D; 2Z6S A; 1SI4 B; 1GCV A; 4F6F A; 1GCV B; 2Z8A A; 1HLB A; 1YE2 A; 1YMB A; 4FWZ A; 1A4F A; 2OH8 A; 1A6G A; 1LH7 A; 3ONZ B; 4HSW A; 3QQR A; 1Y8K A; 3W4U A; 1Y8K B; 3VRG B; 3W4U B; 3KMF A; 1N9H A; 4N7O B; 3EU1 A; 1G0A A; 1J7Y A; 1HCO B; 1DO1 A; 1CMY B; 3DHR A; 1Y7C B; 2BMM A; 3S65 A; 2H8D B; 3HF4 A; 2QLS A; 1J41 A; 2D5X B; 3MKB B; 4IRO B; 2Z6N B; 2H35 A; 5CN6 A; 2H35 B; 1D8U A; 2EB8 A; 3UHX A; 2R4W A; 1V75 A; 4KJT A; 2GKM A; 1A0U B; 1WMU A; 1CPW A; 5JDO C; 2VYZ A; 1A6K A; 3ZJJ A; 1C7B A; 2PGH B; 3WCW A; 1OUT A; 1GVH A; 2QU0 A; 3AQ7 A; 1OUT B; 4N8T A; 1YIH A; 2HBF A; 2GL3 A; 1YIH B; 4NI1 B; 1AJ9 A; 5HBI A; 1RTE A; 1MYG A; 1OBM A; 3HHB A; 3BJ3 A; 3BOM B; 3IA3 B; 3UI0 A; 4PQ6 A; 3LQD B; 4NZI A; 3A0G A; 2G0V A; 3AQ8 A; 3P5Q B; 4KN3 A; 3A0G B; 4MQK A; 3OVU C; 2XKI A; 4B4Y A; 1ABY A; 2IG3 A; 3MOU A; 2W6W A; 1DLW A; 1RQ4 A; 1MLR A; 3MYM A; 2HHE B; 1O1I B; 1SDL B; 2SPO A; 1GLI A; 103M A; 2QRW A; 3KUO A; 1Y35 B; 1DUK A; 1K0Y B; 1YVQ A; 1JDO A; 4HHB B; 5KDQ B; 2QSS A; 4NI0 B; 2IN4 A; 4HRR B; 2QSS B; 2ZSS A; 1YH9 B; 2O5S X; 3E5I A; 5CND A; 3WHM B; 2R50 A; 2D2N A; 3EDB A; 2ZFO A; 1MLL A; 2ZLX B; 5EUI A; 3GQR B; 3D1K B; 1C7C B; 1FLP A; 3H58 A; 3WCV C; 1GBV B; 2Z85 A; 2VEB A; 1RTX A; 2M6Z A; 3UGY A; 1GDK A; 1OR4 A; 1BIN A; 3GDJ B; 1IRD B; 1Y5F A; 2FRI X; 1U7S A; 1GDI A; 1LH1 A; 3O7N A; 4ILZ A; 2ZS0 A; 3BA2 A; 1J7S B; 1BAB A; 1MWD A; 4MQG A; 2HZ2 A; 1Y2Z B; 3QMA A; 3WFT A; 5CN9 A; 4JAC A; 3E5O A; 2ZS1 A; 4U8U D; 1S0H A; 1SDK B; 1OFK A; 2DN1 A; 4KMW A; 2ZT4 A; 1Y85 A; 1X9F D; 3BJ2 A; 1Y4R A; 1Y4R B; 1JL6 A; 1CLS B; 4O4T A; 2EVK A; 2G3H A; 3K9Z A; 1HHO B; 2OHA A; 4O4Z A; 3MJU A; 2AV0 A; 1QI8 B; 3RJ6 A; 3TM9 A; 3MJU B; 1Y45 B; 1Y0T A; 3OO4 A; 2HBG A; 4YU3 A; 1VXH A; 4MQC A; 2V1G A; 1LFT A; 4NK2 A; 1DWT A; 4YU4 B; 2G12 A; 1HDA B; 3LR9 A; 3UHR A; 1Y0W A; 5CN7 A; 1HAB A; 4ODC A; 2DHB A; 1VXG A; 1HAB B; 3MJP B; 4ODC B; 2DHB B; 1YGD B; 4PNJ A; 1NXF A; 1HLM A; 4L7Y B; 1CBL A; 1BBB A; 3UHD A; 1G08 A; 4HRT A; 1G08 B; 5E29 B; 1MLF A; 3CIU A; 1XZ7 A; 3CIU B; 6HBI A; 3HC9 A; 1LFY A; 4KMV A; 4HSX A; 4H2L B; 2GKN A; 2LH7 A; 1K1K B; 1NZ5 A; 4U8U B; 1NS9 A; 1N9X A; 1YHE B; 3ZJN A; 1MLO A; 1DM1 A; 1NS9 B; 1LFL B; 1O1P A; 5HLU A; 1ABS A; 2ZSR A; 3IC2 A; 3PI2 A; 1RVW A; 4N7N B; 1X9F B; 2LH2 A; 5CMV A; 5ILP A; 2AUR A; 1IBE A; 1LHS A; 2BNL A; 1KFR A; 2W72 B; 1MTJ A; 1IBE B; 1V4U A; 3FH9 A; 1J40 B; 1CP0 A; 1A00 A; 1FSX A; 3UH3 A; 1MOH A; 109M A; 1NQP A; 1Q1F A; 2MYD A; 1AJH A; 106M A; 3G52 A; 1NZ3 A; 4PQB A; 1RQ3 B; 1LA6 B; 1M6M A; 2OH9 A; 2NRM A; 3D1A A; 5HLX A; 1ECD A; 1Y83 A; 3AT5 B; 1Y83 B; 1VRE A; 3UHV A; 1ITH A; 1MLM A; 1S5X B; 3G4U A; 1S69 A; 1XZ5 B; 3IXF A; 4TYX A; 2MYB A; 3ODQ A; 4ZVB A; 1JF3 A; 3PEL B; 2OLP A; 4O35 A; 4MQI A; 1XXT A; 1XXT B; 1H1X A; 2ZLW A; 3PI9 B; 1J3Y A; 3G53 A; 1Y31 A; 4F69 A; 1S5Y B; 1Y31 B; 1Y7G A; 1Y7G B; 1ECA A; 2HBE B; 2JHO A; 2D60 A; 4L2M A; 1IT2 A; 1XY0 A; 112M A; 1QPW A; 1XY0 B; 1Y8I A; 1QPW B; 1Y8I B; 2GTL A; 2G0Z A; 1YZI B; 2LHB A; 1HV4 A; 1DO4 A; 1L2K A; 1HV4 B; 2MB5 A; 1DXU B; 1J7W B; 1TU9 A; 1YEV A; 3ZJR A; 3PT8 A; 3UHW A; 3ZH0 A; 3PT8 B; 6HBW A; 1YG5 A; 1HGC B; 3ZJO A; 1HBG A; 6HBW B; 3PT7 A; 3VAU A; 1V4W A; 3PT7 B; 1A3N A; 3QM6 A; 1NPF A; 1CH4 A; 2MGH A; 2ZWJ A; 3O89 A; 5JDO D; 5MBA A; 3AT6 A; 4LPI A; 1RPS A; 1IT3 A; 1QXE A; 1SPE A; 3ECL A; 1HGB B; 1LFV A; 1YCB A; 2BLI A; 1YIE A; 4X0L A; 1MBI A; 2SPM A; 4X0L B; 102M A; 1MBO A; 1DUO A; 1JZK A; 1VXC A; 2O5T X; 3ZOM A; 3SZK A; 1B86 A; 5CHQ A; 1JF4 A; 105M A; 1O1N B; 1CIO A; 2HBC B; 4NK1 A; 2BK9 A; 4FWY A; 4ZVA A; 3A5B A; 2GRH A; 4MXK A; 2ZST A; 2SPL A; 3WCU C; 5B85 A; 4F4O B; 2HCO B; 2DXM A; 1EWA A; 1A01 A; 2R80 B; 2ZFB A; 5EV5 A; 1HDS A; 1UT0 A; 2V1K A; 2BWH A; 3D17 A; 1MLG A; 1S56 A; 4DC7 A; 1A0Z B; 1YEO A; 3UHG A; 1YEO B; 5CNB A; 5EYS A; 1J3Z B; 1ECO A; 1XZU A; 1CQ2 A; 1MLU A; 1XZU B; 1VHB A; 3WFX A; 1R1Y A; 2XKG A; 2PEG B; 1O16 A; 1XZV A; 110M A; 3ZOL A; 4GZG A; 1OR6 A; 1DXV B; 1M9P A; 1MCY A; 1MLK A; 1M9P B; 1SHR B; 3WCW D; 1XZ4 B; 1DXT A; 1A9W A; 1HDB A; 1QSI B; 2ZLT B; 1F5P A; 1GDL A; 2Z6T A; 5AZQ A; 5JDO F; 2V1I A; 1YE2 B; 2FAM A; 1V4X A; 1BZZ A; 1A6M A; 1UIW A; 4XDI A; 1BZZ B; 2QFK A; 3QJC A; 1A4F B; 2MGC A; 1KD2 A; 2D2M C; 3OJ1 A; 1MZ0 A; 1JEB A; 2AA1 A; 5D1V A; 3UH7 A; 3M3B A; 1DXD A; 1B0B A; 4M4A A; 1DTM A; 3QJE A; 4M4A B; 3EU1 B; 3QJE B; 4XS0 A; 1G0A B; 1J7Y B; 3G4Q A; 4UIQ A; 3DHR B; 4XS0 B; 4C44 A; 108M A; 1Y01 B; 3S65 B; 1S6A A; 3HF4 B; 2QLS B; 4G1V A; 1LFZ A; 3OZW A; 4O1T A; 1J41 B; 3ASE A; 3DHT A; 2G0R A; 5B84 A; 2DN2 A; 1HBB A; 2BW9 M; 1DWS A; 1XQ5 A; 4BJA A; 2D2N D; 3KUN A; 2ZFO D; 1XQ5 B; 3V2V A; 3VRF A; 1V75 B; 2BLH A; 3HXN A; 5CHR A; 1WMU B; 1MTK A; 1BZ0 A; 3HXN B; 3WCT C; 2O5M X; 1JZL A; 3M39 A; 2LH5 A; 1C7B B; 3WCW B; 2MHB A; 2QU0 B; 1HBS A; 4N8T B; 3S66 A; 2HBF B; 2ZSQ A; 2ZSZ A; 3NMM A; 1AJ9 B; 2ZS0 D; 3WCV A; 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1MOC A; 2XYK A; 3UHI A; 1Y85 B; 2C0K A; 3BJ2 B; 5CNF A; 1MNI A; 4M4B A; 1FDH G; 1YFF A; 2HHD A; 3ECZ A; 2HHD B; 1R1X A; 4NXC A; 1UFP A; 1WVP A; 4FC3 A; 1R1X B; 2W31 A; 1I3D A; 2RI4 A; 2RI4 B; 1Y0T B; 3OO4 B; 4YU3 B; 4MQC B; 1NIH A; 1Y09 A; 1LFT B; 3TLD A; 2HHB A; 3UHB A; 2O5Q X; 2E2Y A; 1Y46 A; 1NAZ A; 3AG0 A; 1YGF A; 1YGF B; 4FH6 A; 1Y0W B; 2NRL A; 2G11 A; 3DUT A; 2ZT2 A; 1XCH A; 1Y0A A; 3MN0 A; 3BJ1 A; 3UBV A; 4G51 A; 1YCA A; 1BBB B; 3QM7 A; 4HRT B; 1YHU A; 4F6D A; 2R4Z A; 1UFJ A; 2QMB A; 3MBA A; 2QMB B; 4H07 A; 4MQJ A; 2FRJ X; 1XZ7 B; 1LFY B; 5EQM A; 3E4N A; 3MYN A; 1UMO A; 1A9W E; 4FH7 A; 5E6E A; 1Y8W A; 5JDO E; 1O1P B; 1FSL A; 3IC2 B; 4MXL A; 1IDR A; 4MBA A; 1RVW B; 2GRZ A; 2NSR A; 1MNH A; 4OOD A; 1Y5J A; 3UH6 A; 2GNW A; 3ED9 A; 2R4X A; 1V4U B; 2BKM A; 1MLS A; 2DN3 A; 1Y4P A; 3FH9 B; 1VXE A; 1YOH A; 3GOU A; 3B75 A; 3DR9 A; 3S48 C; 1DKE A; 1A00 B; 1KR7 A; 2GTL D; 1FSX B; 1J3F A; 5E83 A; 1NQP B; 1QXD A; 3S1I A; 1QXD B; 1YHU C; 3GLN A; 4NS2 A; 2W6X A; 1GZX A; 1MBN A; 2MGF A; 3AQ6 A; 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