The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
58
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sequence length |
141
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structure length |
141
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Chain Sequence |
VLSPADKTNVKAAWGKVGAHAGEYGAEALERMFLSFPTTKTYFPHFDLSHGSAQVKGHGKKVADALTNAVAHVDDMPNALSALSDLHAHKLRVDPVNFKLLSHCLLVTLAAHLPAEFTPAVHASLDKFLASVSTVLTSKYR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Allosteric transition intermediates modelled by crosslinked haemoglobins.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
HEMOGLOBIN A
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| molecule tags |
Oxygen transport
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| total genus |
58
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| structure length |
141
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| sequence length |
141
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| chains with identical sequence |
C
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 1996-02-26 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3KMF C; 5D1V A; 3TLD A; 1DXV B; 4H07 A; 5IKS A; 5CN4 A; 1FAW B; 1MLO A; 4HBI A; 2YRS A; 2HBF B; 3ONZ B; 2HBS A; 1URY A; 1N9F A; 1Y4P B; 1CH1 A; 3SDN A; 1N9I A; 3ZJR A; 1YVT B; 1IWH A; 2Z6T A; 3E5O A; 1J7S A; 1YMA A; 2IG3 A; 2GRZ A; 3LB4 A; 102M A; 3AQ8 A; 2MGK A; 109M A; 1YG5 B; 2NRL A; 4KJT A; 1R1X A; 1FHJ A; 2V1G A; 1VWT B; 2LH2 A; 1Y35 B; 1M6C A; 3ZOM A; 1CIO A; 2D6C A; 1G09 A; 3QJD B; 3S66 A; 1DWR A; 1QI8 A; 3D4X B; 1X3K A; 1XZV A; 2ZSN A; 2HBC B; 3PI3 A; 1RQA B; 1LFZ A; 5HU6 B; 1YDZ B; 1MYM A; 3OO5 A; 4WCH D; 3R5I A; 3GOU B; 1Y7D B; 1BZP A; 1JZK A; 2OHA A; 1YHR B; 3EU1 A; 1QSI A; 2O5Q X; 1V4X A; 3WI8 A; 1V75 A; 1MLR A; 1CP5 A; 3WCW B; 1YOI A; 4DWU A; 1Y0D B; 1LH3 A; 1LHT A; 3NMM A; 5HBI A; 1HGB B; 1Y7G A; 1T1N A; 2ZS1 C; 1HBI A; 2MYB A; 1IT3 A; 1XZ4 A; 3GDJ B; 5JGG A; 1J7Y B; 2GTL B; 1CMY B; 4GZG A; 1SDK B; 1QXE B; 1S5Y A; 1V4W B; 1IRC A; 6HBW B; 1GZX A; 1J7W A; 4ESA B; 1YH9 A; 4YU4 A; 1A6M A; 3ZJQ A; 2D60 A; 3ZJI A; 3UHX A; 3HF4 B; 1HAC B; 3WCP B; 2VEE A; 1BZ1 A; 1OR6 A; 1CH2 A; 1VXH A; 1MNK A; 2R1H B; 1O1J B; 1JZL A; 4HHB B; 1Y0W B; 1NS6 A; 1MNI A; 3UHI A; 3QJE B; 1TU9 A; 1JDO A; 1JW8 A; 4B3W A; 1OR4 A; 1Y8W B; 3MJP A; 1EWA A; 3D7O B; 1Y0T A; 5CND A; 3UHT A; 3IC0 B; 5CN8 A; 1Y4G A; 1ECO A; 3BJ2 B; 3GQR B; 3LHB A; 3PI4 A; 1Y2Z B; 4HRT A; 1XZ7 B; 3QM9 A; 3EOK A; 1CP0 A; 5E29 A; 1YFF B; 1BUW B; 1EBT A; 1Y0A A; 5MBA A; 2GNW A; 2VEB A; 2B7H B; 3RJ6 A; 1CO8 A; 1Y85 A; 3PI2 A; 1O1K A; 1CBM A; 4MQG A; 3QJB B; 1CH3 A; 2VRY A; 1FDH G; 3ZJM A; 2FRJ X; 1YIH A; 1HGC A; 1LFV A; 3P5Q A; 4NXA A; 1YE2 B; 1A01 B; 2ZFO C; 4M4A B; 1OJ6 A; 1FN3 B; 1GJN A; 1UC3 A; 5EV5 A; 3WR1 B; 2GKN A; 1ABW A; 4N7O B; 1JEB A; 1CH7 A; 4ZVB A; 1A0U B; 3FH9 B; 1JY7 B; 2SPN A; 3AT5 A; 3GKV A; 1Y7Z B; 3UHU A; 1YIE A; 1WMU B; 3PI9 B; 4TWU A; 1RQ4 A; 4FWZ A; 3HRW A; 2W6W A; 1F63 A; 2IN4 A; 1LJW A; 4PQB A; 1IT2 A; 3A0G B; 4DC8 A; 2EVK A; 1X9F A; 2FRI X; 2H8D B; 6HBI A; 1CIK A; 1EMY A; 1VXB A; 1DLY A; 2G0R A; 4MQI B; 4G51 B; 4NI0 B; 5HY8 A; 5CHR A; 5E6E B; 1O1P B; 1XY0 A; 1HLB A; 2FRK X; 3GQP B; 4FWX A; 2JHO A; 1DTI A; 1BVD A; 1J3Z A; 2V1I A; 1C7D B; 1U7S A; 4F6I A; 1A00 A; 1YHU D; 2PEG B; 3AQ6 A; 2ZS0 C; 1MYI A; 5EYS A; 1GLI B; 1A6K A; 2HHE B; 5M3S A; 2AUO A; 1MDN A; 5CNF A; 2GL3 A; 5AZQ A; 1YEV B; 4PQC A; 1HBH A; 3WCT D; 3WCU A; 4UIQ A; 2HHB B; 1BIN A; 2BLH A; 2M6Z B; 4M4B A; 5JOM A; 1A0Z B; 104M A; 1KD2 B; 1JWN A; 2BKM A; 2G3H A; 1J52 A; 1LTW A; 3BCQ A; 3UHR A; 1I3E A; 1LH5 A; 2Z6N A; 5EYJ A; 1Y4V A; 1Y7C A; 1Y46 A; 3ECZ A; 4JAC A; 2OHB A; 2HBD B; 1HBB A; 1CG8 A; 2XKI A; 3D1A A; 1EBC A; 1WLA A; 4AVE A; 2DN2 B; 3FS4 A; 1MOC A; 1W92 A; 3G4V A; 1NQP B; 3MVC A; 1ECA A; 1YE0 A; 1HRM A; 1MYJ A; 3GYS B; 1Y8K A; 2D2M A; 4MAX A; 1R1Y A; 1YGF B; 4ROL A; 1D8U A; 5F2A A; 2DN3 B; 1V9Q A; 1YHE A; 2ZSR A; 1H1X A; 1VXD A; 3E4N A; 4UZV A; 3VRE A; 3NL7 B; 3GK9 A; 4F68 A; 3K8B A; 1G9V B; 1O1I B; 2G14 A; 2FAL A; 2W6X A; 3A5B A; 2QSP B; 3EDB A; 3UHH A; 1GVH A; 3AQ9 A; 1RQ3 A; 4TYX A; 1YGD B; 4NXC A; 3AT6 A; 2DN1 B; 1MYG A; 2MGF A; 1M9P A; 3PI8 A; 2W72 C; 1HLM A; 5SW7 B; 1Y4F B; 3WCV B; 4ROM A; 3NG6 B; 4F4O A; 4N7P B; 1NZ3 A; 1YEQ B; 5EUI B; 3BOM A; 2W72 A; 1MNO A; 1UIW B; 1Y5K A; 3DUT B; 3WHM A; 1DO4 A; 5KDQ A; 4H2L B; 4H0B A; 1LFT A; 4X0L A; 5EOH A; 3ED9 A; 1YHU B; 4OOD A; 1FSX B; 1BIJ B; 1GDL A; 3TM3 A; 4WJG 1; 1XQ5 A; 3LQD B; 1RVW A; 1SPG A; 2YRS B; 4F6G A; 1QSH A; 2HBS B; 3PIA A; 3VRG A; 4ILZ A; 1HCO A; 3G46 A; 2MYA A; 2MGM A; 3OZU A; 5KER A; 1DXC A; 1IWH B; 1RPS A; 1XXT A; 4NZI A; 1DM1 A; 1GBV A; 1VXC A; 1J7S B; 1UVY A; 3ZJJ A; 3WCW D; 1F65 A; 4NK2 A; 1R1X B; 3IC2 A; 1FHJ B; 5JDO D; 3ARK A; 2O5L X; 5C6E B; 2H8F A; 1COH A; 1XZ5 A; 4AVD A; 2LH7 A; 1G09 B; 3GLN A; 3S66 B; 2HBG A; 1OFK A; 2GTL D; 4U8U C; 1XZV B; 3S1J A; 1Y09 A; 2MGJ A; 2XYK A; 5HAV A; 1LFZ B; 1X9F D; 2OH8 A; 3OO5 B; 4U8U A; 3R5I B; 1CQX A; 5HLQ A; 1XYE A; 3UHS A; 3QZZ A; 5EU2 A; 2MYD A; 1NEJ B; 3EU1 B; 1SI4 A; 1V4X B; 1V75 B; 1ABY A; 2GRF A; 1CH9 A; 2D5Z A; 101M A; 4VHB A; 1NWI A; 2QU0 A; 3WTG B; 1VHB A; 4FH6 A; 1MLK A; 1BZR A; 2RI4 A; 3NMM B; 2V1F A; 3HYU B; 1Y7G B; 1T1N B; 1XZ4 B; 1S6A A; 1J3Y A; 5JGG B; 3S65 A; 1NS9 A; 3WCU D; 1S5Y B; 2R4W A; 1GZX B; 1J7W B; 1YH9 B; 4YU4 B; 1SHR A; 3WCT C; 3A59 A; 2D60 B; 3KMF A; 3G52 A; 3K9Z A; 4KMW A; 1BZ1 B; 3ZJH A; 1BZZ A; 4JYQ A; 1DLW A; 3ZHW A; 1NS6 B; 1BAB A; 1OFJ A; 3MJP B; 4FWY A; 2LHB A; 1Y0T B; 2O58 X; 2WY4 A; 1DXT A; 3MKB A; 3QM7 A; 1Y4G B; 1NGK A; 2D2N C; 4HRT B; 3WFW A; 3EOK B; 5E29 B; 3O7N A; 1GBU A; 2QMB A; 1Y0A B; 2ZT2 A; 3QJC A; 1FDH A; 2ZSP A; 2D2N A; 4MQJ A; 3UI0 A; 1L2K A; 1UMO A; 1Y85 B; 1O1K B; 4YU3 A; 4MQG B; 1Y45 A; 3NFE A; 2SPO A; 1QXD A; 1VRF A; 1O1L A; 3MYN A; 1YIH B; 1HGC B; 1LFV B; 3DR9 A; 1ECD A; 1MOA A; 5JDO E; 3LR7 A; 1C7B A; 3U3E A; 4KN3 A; 4MQC A; 1C7C A; 4NI1 A; 1ABW B; 1AJ9 A; 1O1M A; 1J3F A; 5CNB A; 1Y4R A; 1MOB A; 2HZ3 A; 3AT5 B; 1CH5 A; 3GKV B; 3UH5 A; 1MKO B; 1YIE B; 1BJE A; 1BVC A; 1RQ4 B; 3HRW B; 2QFK A; 3UBV A; 4F6J A; 4O35 A; 2ZSZ A; 5KKK A; 1LJW B; 1CLS A; 3RGK A; 2ZS1 A; 3DHR A; 1XCH A; 1J41 A; 2ZWJ A; 1KFR A; 1GCV A; 2LH5 A; 1A3N A; 2ZLT A; 1LH7 A; 2MYE A; 1X9F B; 1SDL A; 1MLH A; 5HY8 B; 1XY0 B; 1LH2 A; 3KUO A; 3UH3 A; 1H97 A; 1J3Z B; 1A00 B; 2R50 A; 2HHD B; 1HV4 A; 2O5O X; 2ZST A; 2V1J A; 1HBH B; 4NS2 A; 1PMB A; 1MNH A; 3M3B A; 3WCU B; 2AUP A; 1MYF A; 4XS0 A; 4F6B A; 4G1V A; 4M4B B; 1YZI A; 3WFX A; 1Y35 A; 3S48 C; 3H58 A; 3LR9 A; 3A9M A; 1HHO A; 4ODC A; 2W6Y A; 3UHY A; 1XZU A; 5EE4 C; 2MGE A; 1DTM A; 2G0X A; 3ASE A; 3B75 B; 2RAO A; 1HBR A; 2Z6N B; 2G0S A; 1DKE A; 1Y4V B; 2ZFO A; 1Y7C B; 3CY5 A; 1Y46 B; 3UHW A; 5D5R A; 3UH6 A; 1A6N A; 1HBB B; 1CG8 B; 4O4T A; 3WCW C; 103M A; 1UVX A; 3D1A B; 1MBD A; 3BA2 A; 3VRF A; 1RSE A; 5JDO C; 1UX9 A; 3FS4 B; 1O1O A; 4OF9 A; 2LH6 A; 1ITH A; 2VYW A; 1K0Y A; 2MGD A; 1YE0 B; 2GTL C; 1Y8K B; 2D2M B; 1HGB A; 1AZI A; 1R1Y B; 3UHD A; 1Q1F A; 3WCV D; 1Y31 A; 4ROL B; 1C40 A; 2BMM A; 1O16 A; 1YEO A; 1G0A A; 3DHT A; 1GDJ A; 2AA1 A; 1YHE B; 2BW9 M; 1F5O A; 1HBA A; 4MU5 A; 2Z8A A; 3K8B B; 2C0K A; 3HF4 A; 1HDA A; 1DXU A; 1A3O A; 1M6M A; 1Y0W A; 1MYZ A; 1O1N A; 1RQ3 B; 3HC9 A; 1HBS A; 1LFY A; 2ZS0 A; 1MLJ A; 3HEP A; 3AT6 B; 1MGN A; 2V1E A; 2MHB A; 1M9P B; 2EB9 A; 3PI8 B; 1NIH A; 3M3A A; 2Z6S A; 3OVU C; 1Y8I A; 3ARJ A; 5HLX A; 4ROM B; 3MOU A; 3M39 A; 4F4O B; 1OUU A; 2ZLV B; 3MBA A; 2HBE A; 3A2G A; 3BOM B; 1Y5K B; 1ECN A; 3WHM B; 1A9W A; 1HBG A; 5KDQ B; 1SPE A; 2VLZ A; 1LFT B; 4X0L B; 1HDB A; 1MWD A; 1CG5 A; 4N8T B; 3IXF A; 4N7N A; 3UHB A; 4DWT A; 1A01 A; 1Y0C B; 1CPW A; 1V4U A; 1GCW A; 1XQ5 B; 1BBB A; 3WFT A; 2WTG A; 5B84 A; 1RVW B; 1SPG B; 5ILR A; 3BJ1 A; 4MQH A; 1QSH B; 3PIA B; 3VRG B; 3ZJS A; 1HCO B; 2BNL A; 2EKU A; 3ARL A; 111M A; 5E83 A; 3W4U A; 5KER B; 1XXT B; 4BJA A; 1GBV B; 2ZSS A; 2ZSY A; 2ZLW A; 3D17 A; 5F0B A; 2SPL A; 2ZLU A; 1NZ2 A; 3MYM A; 1LFL A; 3IC2 B; 2ZT0 A; 1NXF A; 1YOG A; 4MBA A; 4TWV A; 2H8F B; 1XZ5 B; 1HAB B; 3V2Z A; 2W6V A; 2Z85 A; 2MGC A; 1C7D A; 2FRF A; 1MBA A; 1HGA A; 1A4F A; 4C44 A; 4U8U B; 1CH4 A; 3K3U A; 1Y4Q A; 1XYE B; 2EKT A; 3M38 A; 2GLN A; 4LPI A; 4HRR A; 2HZ1 A; 1SI4 B; 2QLS A; 1MZ0 A; 1YMB A; 4C0N A; 2ZFB A; 4WJG A; 2D5Z B; 2QU0 B; 1G0B A; 3UHG A; 1THB A; 1QPW A; 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2ZS1 B; 1RTX A; 3DHR B; 1J41 B; 4MPM A; 1HJT A; 1GCV B; 1MLL A; 1A3N B; 2DHB A; 2ZLT B; 3WFU A; 4MBN A; 4MXK A; 3G4W A; 5EET A; 1SDL B; 1S0H A; 4KMV A; 1FCS A; 1YEU A; 4NK1 A; 1S61 A; 3WCT A; 1Y01 B; 2HCO A; 2PGH A; 5B85 A; 1XZ2 A; 5JDO F; 3MJU A; 3G4R A; 2HZ2 A; 3H57 A; 1FSL A; 3OO4 A; 3QMA A; 1HV4 B; 1MBS A; 1Y22 A; 3A5A A; 1MTI A; 3G53 A; 1V5H A; 1BZ0 A; 1JP6 A; 3SZK A; 5C6E A; 3UHZ A; 110M A; 4XS0 B; 1I3D A; 1YZI B; 2D2M D; 1NPG A; 2OH9 A; 1HHO B; 4L2M A; 4ODC B; 4F6D A; 1XZU B; 1SWM A; 2ZLX A; 3P5Q B; 2QRW A; 3TM9 A; 3QM8 A; 1Y5J A; 2MGI A; 1YVQ A; 2RAO B; 1HBR B; 2BLI A; 3CIU A; 1DKE B; 5MBN A; 2ZFO B; 3CY5 B; 1JEB B; 3EDA A; 1S5X A; 1DUK A; 1MLM A; 1IBE A; 2NSS A; 3ECX A; 1B0B A; 3VRF B; 112M A; 2G12 A; 2VLY A; 1NEJ A; 1O1O B; 1VXA A; 1K0Y B; 4FC3 A; 3PT8 A; 3WTG A; 1G08 A; 3UGY A; 3HYU A; 3HXN A; 3OZV A; 4IRO A; 1Y31 B; 1JL7 A; 1C40 B; 2G11 A; 1CQ2 A; 1YEO B; 2DXM A; 1JF4 A; 3HEN A; 1NPF A; 1J40 A; 1G0A B; 3DHT B; 2AA1 B; 1DXV A; 1HBA B; 1FAW A; 1X46 A; 2HBF A; 3ONZ A; 2AV3 A; 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