The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
64
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sequence length |
154
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structure length |
154
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Chain Sequence |
MVLSEGEWQLVLHVWAKVEADVAGHGQDILIRLFKSHPETLEKFDRFKHLKTEAEMKASEDLKKHGVTVLTALGAILKKKGHHEAELKPLAQSHATKHKIPIKYLEFISEAIIHVLHSRHPGNFGADAQGAMNKALELFRKDIAAKYKELGYQG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Mechanism of NO-induced oxidation of myoglobin and hemoglobin.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
MYOGLOBIN
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| molecule tags |
Myoglobin (ethyl isocyanide)
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| source organism |
Physeter catodon
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| total genus |
64
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| structure length |
154
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| sequence length |
154
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 1996-05-06 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3A59 A; 3WCV A; 4M4B A; 3EOK A; 4KJT A; 1YIE B; 2MYB A; 1IWH B; 1K1K A; 2D2N C; 4N7O A; 1IT3 A; 4MQH A; 3UHB A; 3WCP B; 3ZJJ A; 1JPB A; 2QSS A; 3UHC A; 3GKV A; 1C40 B; 1EMY A; 3IA3 B; 3GOU A; 2O5S X; 2W6Y A; 3UHW A; 3HYU B; 3QM7 A; 1HGC B; 1O1M A; 1Y0A A; 3ORD A; 2D2M C; 3EU1 A; 1G09 B; 1BZR A; 1OFJ A; 2LH2 A; 3UHY A; 1YGD B; 1XZV B; 1AJ9 B; 2QMB A; 2ZST A; 1NZ3 A; 3ECZ A; 1RQA B; 1XYE B; 2MHB B; 2Z85 A; 1WLA A; 1O16 A; 3UHS A; 2ZFO D; 1RTX A; 2HBG A; 1SDK A; 3PI8 B; 3ECL A; 4PQB A; 3RJ6 A; 2MGH A; 2VEE A; 3ZJP A; 1J7Y B; 5CMV A; 1NS6 A; 1YHU B; 3IC0 A; 4UZV A; 1J3F A; 1A4F B; 1MOH A; 1MTK A; 3NMM A; 4YU4 B; 1VXB A; 1COH A; 1LH5 A; 1BZ1 B; 2G0X A; 4BJA A; 1HBA B; 1DXD A; 2B7H B; 2DHB B; 1YIH A; 3DR9 A; 3R5I A; 3UHH A; 3ARJ A; 1N9F A; 1Y5J B; 1Y4P B; 1YVT A; 1C7D A; 4ROL B; 1NZ2 A; 5IKS A; 2DN3 B; 1O1N A; 1YVQ B; 3WTG B; 4OF9 A; 1CP5 A; 1HBB A; 3GK9 A; 2EKT A; 4F6G A; 1Y22 A; 3WFX A; 2R1H B; 2DN2 B; 1XZ7 B; 4B3W A; 2FAL A; 1R1Y B; 1GVH A; 1NIH A; 1JZK A; 1Y85 A; 1QSI A; 2GKN A; 1O1O B; 4H2L B; 1JZM A; 3ZHW A; 3W4U B; 4MQI A; 1B0B A; 2ZLX B; 1UFJ A; 1CH5 A; 2SPM A; 3DHT B; 3UHU A; 3WFU A; 1Y8H A; 1Y4B A; 1LJW A; 1HCO A; 1K0Y B; 3WCT D; 1MYJ A; 1OUT A; 1QPW A; 1RQ4 A; 1HGB A; 2MBW A; 2PEG A; 4MXK A; 4HRR A; 2G14 A; 1YHU C; 5E83 A; 2D60 A; 1BVD A; 5C6Y A; 3A0G B; 1S0H B; 2Z6N B; 4NXA A; 112M A; 1Y7C B; 1NPF A; 1FHJ B; 4MQJ B; 1DXU A; 2HBD A; 1BZZ B; 5EET A; 103M A; 3QZZ A; 2PGH A; 3FS4 B; 1SPE A; 2MB5 A; 2Z8A A; 3D1K B; 5F2A A; 3WHM A; 1XY0 A; 1YFF B; 4GZG A; 1LFL A; 4NI0 B; 3NFE B; 4F6B A; 3ZJQ A; 3IC2 A; 2MGC A; 3OO4 B; 1YE0 A; 2QSP B; 3UHX A; 5JDO F; 1MLO A; 1J7W A; 3DHR B; 2W72 A; 4IRO A; 1VWT A; 3AQ7 A; 5HY8 A; 3WI8 A; 3LR7 A; 2FRF A; 1I3D A; 1MOD A; 1KFR A; 1LFT A; 2R80 B; 1V4U B; 4KMW A; 1J3Y A; 1URY A; 1M9P B; 1ABW A; 5KER A; 1YE2 A; 2GRF A; 3QJB B; 2OH8 A; 3VRG B; 2ZS0 D; 3H57 A; 5B84 A; 1A6K A; 3GQR B; 4MQC B; 1MYG A; 2O5Q X; 1IRD A; 2BWH A; 1Y8K A; 1U7S A; 1CPW A; 1EBC A; 1M6M A; 1A9W A; 2ZLW B; 3LB4 A; 1HV4 B; 2QLS A; 2SPO A; 4MQK A; 3M3A A; 1DKE A; 1YCA A; 3BA2 A; 3WFT A; 3VRF A; 4F6I A; 1OUU A; 3KMF A; 1DO4 A; 1HSY A; 1NWN A; 2HBC A; 1Y4Q B; 1BZ0 A; 2GKM A; 3WCW C; 1G0A B; 1F5P A; 3EDB A; 3PI1 A; 3AG0 A; 1VXA A; 1MDN A; 3S65 B; 5CNB A; 1BIJ B; 1Y4G A; 2FRK X; 1Y0C B; 1UIW A; 3H58 A; 1ASH A; 2Z6T A; 1MLG A; 3V2V A; 4C0N A; 1PBX A; 4FH6 A; 4MQG A; 3NL7 A; 3WCU B; 1YEQ B; 1YOI A; 2C0K A; 1HLM A; 3D7O A; 1CG5 A; 3HRW A; 110M A; 1V4X B; 1YMA A; 1J7S B; 2GTL B; 1HLB A; 1SHR B; 1YH9 A; 5JDO E; 3TLD A; 2ZLV B; 5EUI A; 2XKH A; 2M6Z A; 1Y31 A; 4KN3 A; 4ILZ A; 3WCV D; 4ESA B; 3MKB A; 1GJN A; 4N7N A; 3WR1 B; 3GYS B; 3PI9 A; 3BCQ A; 5EOH A; 1A3N B; 2ZT4 A; 1Y46 A; 2XKG A; 3NG6 B; 1XQ5 A; 2QU0 A; 3KUN A; 3D17 A; 1A0Z A; 1MOA A; 1Y0T A; 5MBN A; 1DXT B; 1LFY B; 2G0Z A; 2HCO A; 1GCW A; 3QMA A; 1J41 A; 2H8F A; 4NI1 A; 1PMB A; 2WY4 A; 2G0R A; 2LH5 A; 3G52 A; 3DUT B; 1NQP A; 1CH1 A; 3BJ2 B; 1YHE A; 1HAB A; 3ONZ B; 1F65 A; 1DXV B; 1YCB A; 1YEV B; 4HRT A; 4ODC A; 2D6C A; 2G10 A; 1BBB B; 1Y7D B; 1HBS B; 3WCU C; 1MCY A; 3PIA B; 1Y4F A; 3QZX A; 1Y5K B; 4H0B A; 2KSC A; 2DN1 A; 3K3U A; 3ARL A; 1OFK A; 1THB B; 1DO7 A; 1FAW B; 1Y8W A; 1HGA A; 2R50 A; 3RGK A; 2GTL C; 1YDZ A; 3ZJI A; 1GZX B; 1S61 A; 3OZW A; 1SDL A; 4F4O B; 2W6X A; 3AT5 B; 1XZ5 B; 4PNJ A; 1YEU A; 1RQ3 B; 4JYQ A; 1F63 A; 4F6F A; 5B85 A; 1A6M A; 1C7C B; 2H35 B; 2MGG A; 3SZK B; 4N7P B; 5E29 A; 1MBI A; 1RPS A; 2ZLU A; 2R4W A; 2HZ3 A; 1RSE A; 1V75 B; 3ODQ B; 1O1L A; 5ILE A; 4DWU A; 1MLK A; 1VXH A; 3HHB B; 1N9I A; 2NSR A; 1CBM A; 3G4Y A; 3AQ8 A; 5MBA A; 3OK5 A; 1Y2Z B; 3R0G A; 4M4B B; 1UT0 A; 3ZJO A; 1JY7 B; 4X0L A; 2MYA A; 2EF2 A; 4MQH B; 105M A; 1GBV A; 5EYS A; 2QSS B; 3GKV B; 1AJH A; 3BJ3 A; 1MTI A; 1UX8 A; 1NXF A; 3GOU B; 4DC7 A; 4QAU A; 3ZJS A; 3GQG B; 4ZVB A; 4U8U D; 4FC3 B; 3D4X A; 1ABY A; 1QXD A; 3UHG A; 2HZ1 A; 2D2N A; 3QQR A; 1LFZ A; 1O1M B; 3ZJH A; 1Y0A B; 1Y0D B; 4HSX A; 1T1N A; 1R1X B; 2D5X A; 3ED9 A; 2QMB B; 5KDQ A; 1A01 B; 5SW7 B; 3UHT A; 1BUW A; 3QJD A; 5JGG A; 3ZOM A; 1Y35 A; 2H8D A; 1EWA A; 1I3E A; 5CNE A; 1JL6 A; 1GDJ A; 1CH9 A; 3OO5 A; 4F6D A; 1G0B A; 4G51 A; 3G4V A; 3NML A; 1GDI A; 2BNL A; 2EVP A; 2EVK A; 1YEN A; 1GBU B; 1YZI A; 2HBS A; 1UFP A; 3IC0 B; 1YHR B; 1HBI A; 1GLI B; 3ZJL A; 2AUP A; 3P5Q B; 1YEO A; 3G4R A; 1CO8 A; 4O35 A; 4TWU A; 1A3O B; 1X9F B; 1HDA A; 2MGK A; 1YVT B; 1C7D B; 3VRE A; 1HDS A; 4IT8 A; 4TYX A; 1B86 A; 1HBR B; 1UVX A; 2VRY A; 4DWT A; 4M4A B; 1HBB B; 3MN0 A; 3UGZ A; 1U7R A; 3MJU A; 1YIE A; 1JDO A; 3UHZ A; 1IOP A; 1MBD A; 4VHB A; 1DTI A; 1GDK A; 3UGY A; 2YRS B; 1MBC A; 2AUO A; 3HEO A; 1S5Y A; 3IXF A; 3WCW D; 5CN7 A; 1GDL A; 1OUT B; 2O5T X; 2BW9 M; 2W6V B; 4F69 A; 2AV3 A; 6HBI A; 5AB8 A; 2EKU A; 5EE4 D; 1YGD A; 2D60 B; 1XZV A; 3G46 A; 1AJ9 A; 5JOM A; 1JF3 A; 2O5B X; 1RQA A; 1CQ2 A; 1XYE A; 2R4X A; 2RAO B; 1MLS A; 1DO1 A; 4XS0 A; 5CNC A; 2PGH B; 1X9F C; 1YMC A; 5C6E A; 3UBV A; 3CIU B; 3MJP A; 1A0U B; 1J7Y A; 1YHU A; 3VAU A; 3K8B B; 1A4F A; 3QM5 A; 1CMY A; 1RVW A; 4U8U A; 4YU4 A; 1LFL B; 1Y0W A; 1BZ1 A; 1YE0 B; 3QJE B; 1JF4 A; 5CN9 A; 1Y5J A; 1LH7 A; 1Y4P A; 2ZT2 A; 5CND A; 1LUE A; 1UC3 A; 2W72 B; 1VWT B; 3WTG A; 2O5M X; 4L2M A; 5JDO D; 4JAC A; 2ZFB A; 3BJ1 B; 1LFT B; 1MNO A; 2G11 A; 1LH1 A; 1XZ4 A; 2ZFO B; 1ABW B; 5EV5 A; 2R1H A; 3UH5 A; 3V2Z A; 1XZ7 A; 1VXC A; 3ARK A; 1R1Y A; 1NWI A; 1Y8I A; 3FH9 A; 1IDR A; 1S56 A; 5AZQ A; 1Y01 B; 1O1O A; 3G4W A; 4H2L A; 1Y8K B; 2AA1 B; 3W4U A; 3AQ6 A; 3UH7 A; 2D5Z B; 1LA6 A; 1EBT A; 1K0Y A; 2ZS1 D; 4MQK B; 3BOM B; 1DKE B; 1MYZ A; 2MYC A; 5CN6 A; 1YG5 B; 1MYT A; 1SPG B; 1S0H A; 2Z6N A; 1V4W A; 2HHE B; 1Y7C A; 4YU3 B; 108M A; 1ECN A; 2IN4 A; 2Z6S A; 5EU2 A; 3HXN B; 1Y83 B; 1BZZ A; 1FCS A; 3A9M A; 4O4T A; 2ZT0 A; 2V1E A; 4DC8 A; 1Y09 B; 2BLI A; 1VHB A; 4O4Z A; 2W72 C; 3D1K A; 3KUO A; 4MBA A; 5CNF A; 1UIW B; 1QSH B; 1OR6 A; 1YFF A; 4NK2 A; 1HRM A; 4NI0 A; 1PBX B; 3NFE A; 3CY5 B; 3NL7 B; 3WCT B; 1SI4 B; 1HDB B; 4ROM B; 3WCW A; 2ZFO C; 3OO4 A; 1XXT B; 2QSP A; 4L7Y B; 1EW6 A; 4FWZ A; 4NS2 A; 3D7O B; 1W92 A; 2MYD A; 2DXM B; 3QJC A; 1CLS A; 5D1V A; 1CO9 A; 3UHD A; 2AUQ A; 1DTM A; 3HRW B; 4FH7 A; 1IBE A; 1UX9 A; 1HHO A; 5HLU A; 1BAB B; 1LHT A; 3S66 B; 2R80 A; 1CG8 B; 3ZOL A; 1IT2 A; 3A5B A; 2WTG A; 3MYM A; 6HBW A; 1YOG A; 4MAX A; 1M9P A; 1MYI A; 5EUI B; 1C7B A; 3VHB A; 2LH1 A; 3QJB A; 2SPL A; 3VRG A; 3GDJ B; 1NEJ B; 1LFQ A; 3PEL A; 1MKO B; 1DXC A; 3PT7 B; 3GQR A; 2RI4 A; 3MKB B; 3OZU A; 1HBG A; 1VXD A; 3EDA A; 1J3Z A; 3KMF C; 3UHE A; 1Y46 B; 2QFK A; 3SDH A; 2QU0 B; 3UH3 A; 1JW8 A; 1A0Z B; 1JP9 A; 2ZLW A; 2EB9 A; 1GCW B; 3QM9 A; 1J41 B; 2H8F B; 3HEN A; 2BKM A; 4NI1 B; 1DUO A; 1A00 B; 1JP6 A; 1MLR A; 3OZV A; 1NQP B; 5HLX A; 2D2N D; 3AT6 A; 1YHE B; 2FRI X; 1MLJ A; 3PI4 A; 1GCV B; 5CN4 A; 1UMO A; 2VM0 A; 4HRT B; 3UHR A; 3WCT C; 3B75 A; 2ZS0 B; 4NZI A; 1G0A A; 1Y4F B; 2O5O X; 1UVY A; 4B4Y A; 1QI8 B; 2GNW A; 3TM3 A; 5ILR A; 2ZLT A; 1Y7G B; 3E5I A; 3S65 A; 1DLW A; 1BIJ A; 2D2M D; 2ZWJ A; 1O1K B; 1Y0C A; 1ABS A; 1YDZ B; 1XZU B; 3D1A A; 1MBO A; 1SDL B; 3UHN A; 3PI3 A; 4O1T A; 1V9Q A; 2ZS1 A; 1YMB A; 5M3S A; 1YEQ A; 2NRM A; 2HHB B; 1G9V B; 3GQP A; 5HU6 B; 3MBA A; 1Q1F A; 1V4X A; 3LQD B; 5ILP A; 4MU5 A; 2AUR A; 1SHR A; 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2NRL A; 1LH6 A; 2D2M A; 3GLN A; 107M A; 1Y2Z A; 3MJU B; 1V07 A; 1JY7 A; 1NS6 B; 2OLP A; 2VEB A; 3NMM B; 2G12 A; 1DO3 A; 1J40 A; 1COH B; 1ITH A; 4SDH A; 4G1B A; 1M6C A; 2V1F A; 3R5I B; 1YIH B; 1HBH A; 3WCV C; 3SDN A; 1MGN A; 1J52 A; 1YGF A; 1MNK A; 2OHA A; 3GQG A; 1JEB A; 1MOB A; 4FC3 A; 1O1N B; 4G1V A; 1S5Y B; 2LH7 A; 1Y0D A; 1R1X A; 2VLZ A; 1Y22 B; 3AQ9 A; 3ZJR A; 3MYN A; 1RTE A; 4C44 A; 1A01 A; 5SW7 A; 4H07 A; 2WTH A; 1IWH A; 1OBM A; 3WCP A; 1NIH B; 2ZSO A; 2ZSX A; 3UHV A; 1Y85 B; 1QSI B; 1C40 A; 4XS0 B; 2VYW A; 1MOC A; 3U3E A; 5C6E B; 3MJP B; 101M A; 1GBU A; 4MQI B; 3HYU A; 1Y8H B; 1Y4B B; 1LJW B; 1HCO B; 1HGC A; 1CMY B; 1RVW B; 1YHR A; 4U8U B; 4MXL A; 1GLI A; 1Y0W B; 2R4Z A; 1QPW B; 3P5Q A; 1G09 A; 1MYF A; 1RQ4 B; 1HGB B; 2PEG B; 2VYY A; 1A3O A; 4HRR B; 1X9F A; 1YOH A; 5E83 B; 1HBR A; 1CBL A; 2VLY A; 2V1K A; 2MHB A; 4M4A A; 3S48 C; 2ZFB B; 1DXU B; 5EYJ A; 2HBD B; 2BMM A; 1XZ4 B; 3PI8 A; 4F68 A; 3WHM B; 1V5H A; 3LB1 A; 1Y8I B; 1XY0 B; 3FH9 B; 2NSS A; 2V1J A; 2MGE A; 3HEP A; 1MLU A; 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