The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
62
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sequence length |
153
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structure length |
153
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Chain Sequence |
GLSDGEWQQVLNVWGKVEADIAGHGQEVLIRLFTGHPETLEKFDKFKHLKTEAEMKASEDLKKHGTVVLTALGGILKKKGHHEAELKPLAQSHATKHKIPIKYLEFISDAIIHVLHSKHPGDFGADAQGAMTKALELFRNDIAAKYKELGFQG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
A myoglobin variant with a polar substitution in a conserved hydrophobic cluster in the heme binding pocket.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
MYOGLOBIN
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| molecule tags |
Oxygen transport
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| source organism |
Equus caballus
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| total genus |
62
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| structure length |
153
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| sequence length |
153
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 1997-09-24 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1LFY B; 1LUE A; 2QSP B; 5EE4 D; 1JZL A; 1Y46 A; 2QFK A; 3RGK A; 3GQP B; 1RVW B; 1XZ2 A; 1GCV B; 5CN6 A; 4M4B A; 2VLZ A; 1URY A; 3QJB B; 1FDH A; 2ZT3 A; 4B4Y A; 1FAW A; 1MYJ A; 3ZJH A; 4NI0 B; 3P5Q B; 1MYZ A; 1TES A; 3UHR A; 2ZWJ A; 1MLM A; 1BZZ B; 3MJP B; 3PI8 B; 3HHB B; 5CNF A; 1JZK A; 5JGG B; 1DXU A; 1O1N B; 1SDL A; 2HHD A; 1RQA B; 3K9Z A; 4MU5 A; 1MYI A; 1YHR B; 3UH3 A; 1Y5F B; 3WR1 A; 3A5B A; 4FC3 A; 1YOH A; 1Y46 B; 5C6E A; 3ZJI A; 1CG8 A; 1XZ2 B; 2MGA A; 3BJ2 A; 1HBA A; 3HEN A; 4FWX A; 2ZS0 C; 2AUP A; 2VM0 A; 1Y01 B; 1NWI A; 1CMY A; 2EKU A; 5HLU A; 1CQX A; 2SPN A; 1FAW B; 1X3K A; 2KSC A; 1MLR A; 2HBF A; 5HU6 A; 3A0G A; 1MOB A; 1Y5K A; 5EUI A; 4M4A B; 5CN4 A; 2ZLV A; 1NEJ A; 1SDL B; 2HHD B; 1XZV A; 2EB8 A; 6HBW A; 5C6E B; 2VRY A; 1HRM A; 1CG8 B; 3BJ2 B; 3QZZ A; 1MTI A; 3QMA A; 3ECX A; 1DLW A; 1MYT A; 2V1G A; 1CMY B; 1FDH G; 2SPM A; 2HBF B; 2MGL A; 5HU6 B; 3WCV D; 1XXT B; 3A0G B; 3A2G A; 5EUI B; 1M6C A; 3H58 A; 2D5X A; 3WCP A; 1AJG A; 2M6Z B; 2ZLV B; 2ZT0 A; 1NEJ B; 1A6G A; 1V75 A; 1MGN A; 3ARL A; 4N7P A; 1DWT A; 4F6G A; 1HGA A; 1L2K A; 4UZV A; 1MYH A; 1DO3 A; 1NS9 A; 1QI8 A; 5E83 A; 1XZV B; 4KMV A; 6HBW B; 4DWU A; 4IRO A; 1Y0C A; 1Y8K A; 1YH9 A; 1LTW A; 2ZLW A; 3UHW A; 1XZ4 A; 2G0S A; 3WCV C; 3ZJR A; 1N9F A; 3G53 A; 1Y4Q A; 2ZFO C; 2DN1 A; 2WTH A; 2W6X A; 1JF3 A; 1J52 A; 1Y0T A; 4G51 A; 2VHB A; 2D5X B; 2ZS1 B; 3WCP B; 1V75 B; 1VXF A; 4N7P B; 1HGA B; 2G0R A; 3CY5 A; 3A59 B; 4PQ6 A; 2O5L X; 1NS9 B; 1QI8 B; 2QSS A; 5E83 B; 3DR9 A; 3UHD A; 1VXC A; 1JDO A; 2BLH A; 4IRO B; 1Y0C B; 1Y8K B; 2R4Z A; 1YH9 B; 2ZLW B; 1XZ4 B; 3M38 A; 1Y4Q B; 2DN1 B; 1Y4B A; 2VEE A; 3ORD A; 1VRE A; 2ZS1 D; 3EU1 A; 1NIH A; 1Y0T B; 2D60 A; 4G51 B; 5F0B A; 3UHZ A; 1EW6 A; 1V9Q A; 4WCH D; 3AT5 A; 1HGC A; 1O16 A; 3CY5 B; 2MBW A; 1YFF B; 2QSS B; 5ILE A; 3UGZ A; 1QSH A; 2G3H A; 4MQH B; 5B84 A; 1DXT A; 1NPG A; 2ZS1 C; 3WFU A; 2MB5 A; 4O4Z A; 1Y22 A; 1X9F A; 1S0H A; 3UH5 A; 1LHT A; 4KJT A; 1A0U A; 1C40 A; 3HF4 A; 3EU1 B; 2W6Y A; 4XS0 A; 3GYS A; 1NIH B; 2D60 B; 2BMM A; 1N9X A; 1V4U A; 2GRZ A; 2HHE A; 3AT5 B; 1HGC B; 1LFV A; 1U7R A; 5CNE A; 1VXE A; 2GLN A; 5EOH A; 1EWA A; 4SDH A; 3HXN A; 2Z6N A; 3WCW D; 1HLB A; 1MLF A; 2BW9 M; 3V2Z A; 1BVD A; 4MBN A; 1LA6 A; 2LH2 A; 1B86 A; 1YGF B; 3A5G A; 1LFZ B; 4MQK A; 2D2M D; 1QSH B; 1UX8 A; 1BAB A; 1NZ2 A; 1RQ4 A; 4H07 A; 3DUT A; 1DXT B; 2NSR A; 1SDK B; 1TU9 A; 4FH7 A; 1GVH A; 4G1V A; 1X9F B; 1S0H B; 3B75 A; 2MGK A; 1MNJ A; 1OUU A; 1A0U B; 1C40 B; 3HF4 B; 2AA1 A; 4XS0 B; 3GYS B; 4MPM A; 4TWU A; 1JY7 A; 3R0G A; 3ZJJ A; 1V4U B; 3OZW A; 2HHE B; 1LFV B; 1EBC A; 2GDM A; 3ARJ A; 3WCW C; 1Y8W A; 1Y4G A; 1G0B A; 2FAL A; 3HXN B; 5HY8 A; 2Z6N B; 1YG5 A; 1MWD A; 3D7O A; 2D2M C; 2ZSO A; 1NZ5 A; 1LA6 B; 1ABY A; 1B86 B; 1QSI A; 4MQK B; 4N7O A; 5CND A; 1BAB B; 3DUT B; 3LB2 A; 1MLS A; 2QLS A; 1GBV A; 1KD2 B; 3EDA A; 1A6K A; 4MXK A; 4C0N A; 4ROM B; 1HHO A; 4ZVB A; 3B75 B; 1MYM A; 2AA1 B; 1JY7 B; 5CN8 A; 3PI4 A; 4NK1 A; 3ECZ A; 4U8U A; 4UUR A; 1AJH A; 3GQG A; 1Y0A A; 108M A; 1LH2 A; 1Y8W B; 3UHT A; 1Y4G B; 1G0B B; 3VRE A; 3S65 A; 5HY8 B; 1YG5 B; 3D7O B; 1YCB A; 1A00 A; 2NX0 A; 1ABY B; 1MLG A; 1QSI B; 3HC9 A; 1V4W A; 1M6M A; 5D5R A; 1ECN A; 1YEO A; 3VAU A; 3QJC A; 1GBV B; 2D2N A; 1HHO B; 1UIW A; 4O1T A; 1O1O A; 2ZS0 A; 1YE2 A; 4AVE A; 3OZV A; 2LH5 A; 2ZSR A; 4LPI A; 3AG0 A; 5EET A; 5AZR A; 1SPG B; 1CLS A; 3ZJO A; 1YEQ A; 1DTI A; 5HBI A; 1CG5 A; 4U8U B; 1T1N A; 1A4F A; 2HBD A; 3GQG B; 1YHU D; 1GJN A; 1B0B A; 1BIN A; 4HRR A; 1HBB A; 3E4N A; 5E6E A; 1JF4 A; 1R1Y A; 3S65 B; 1Y7D A; 2V1F A; 3OO4 A; 1WVP A; 2WY4 A; 1YEV A; 2W72 A; 1V4X A; 1V4W B; 3D1K B; 1YEO B; 3MJU A; 1Y5J A; 2ZT1 A; 1IOP A; 2R4W A; 4ODC A; 3QJC B; 2DC3 A; 1GDI A; 2VYW A; 2D2N B; 4NI1 A; 1YE2 B; 3V2V A; 1A9W E; 5CMV A; 1S5Y A; 1YHU C; 2H8D B; 1CLS B; 1YEQ B; 1CG5 B; 3ZJS A; 1LFL A; 1UT0 A; 1T1N B; 3IC0 B; 1A4F B; 2HBD B; 4BJA A; 1OR4 A; 3GK9 A; 1HCO A; 2LH3 A; 1MTK A; 1Y0D A; 3LHB A; 4HRR B; 1A0Z A; 5E6E B; 1R1Y B; 3WCT A; 1GDK A; 1Y0W A; 3KUO A; 1Y7D B; 1ABW A; 2EB9 A; 3OO4 B; 1YEV B; 1VWT A; 1Y7Z A; 2YRS A; 3UHB A; 1HBI A; 1Y8H A; 1YE0 A; 1V4X B; 1JWN A; 2FRI X; 1UVX A; 1WLA A; 5EQM A; 4H2L A; 5EV5 A; 1Y5J B; 3KMF C; 1CPW A; 2DXM B; 4MQC A; 5EE4 C; 2MGF A; 4NI1 B; 4IT8 A; 1KR7 A; 4KN3 A; 2EVK A; 3UHI A; 3M3A A; 2O5T X; 1S5Y B; 4ROL A; 2GRH A; 1NXF A; 2OLP A; 4YU4 A; 1LFL B; 4M4B B; 2DN3 A; 1LH3 A; 1HCO B; 1CH7 A; 4KMW A; 1Y0D B; 1A0Z B; 3WCT B; 1Y0W B; 3D17 A; 1CH5 A; 3ONZ A; 2V1J A; 4ZVA A; 3O89 A; 1VWT B; 3GOU A; 1RTE A; 2YRS B; 1G0A A; 1Y8H B; 1YE0 B; 3G46 A; 1MLH A; 2OIF A; 1AJ9 A; 4TWV A; 2H8F A; 1HBG A; 4H2L B; 1DXU B; 1XQ5 A; 4MQC B; 3M3B A; 1GDL A; 2OHB A; 2CMM A; 2Z6S A; 3BOM A; 2GTL A; 3WR1 B; 4FC3 B; 1O1I A; 2O5M X; 1MTJ A; 1MBI A; 1MYF A; 3AQ5 A; 4YU4 B; 1S6A A; 1MNH A; 1HBA B; 1MBD A; 3OJ1 A; 2DN3 B; 5HLX A; 3ODQ A; 3A5A A; 4F4O A; 1CIK A; 1N9I A; 3ZJM A; 3D17 B; 3ONZ B; 2QMB A; 104M A; 1R1X A; 1Y5K B; 1YMC A; 2SPL A; 5CNB A; 1FN3 A; 3UI0 A; 1J3Y A; 3GOU B; 1G0A B; 1UFP A; 3EOK A; 3LR7 A; 1MOH A; 2FRK X; 1AJ9 B; 5CN5 A; 1FHJ A; 4N8T A; 2H8F B; 3G4Q A; 1NZ4 A; 1DKE A; 2DN2 A; 2MYC A; 4HHB A; 2V1K A; 2ZSS A; 3LB1 A; 2HBE A; 1MNI A; 3BOM B; 1IRD A; 3PT8 A; 1DWS A; 5CN7 A; 1MBN A; 7HBI A; 5EU2 A; 3DHT A; 1O1I B; 2ZLT A; 2GNV A; 3UBV A; 3ED9 A; 3UHC A; 3HEP A; 3GQR A; 3QQQ A; 1MOA A; 1YGD A; 3ECL A; 3ODQ B; 105M A; 4GZG A; 4F4O B; 4PQC A; 1IWH A; 1MNK A; 1LJW A; 2ZSZ A; 1DWR A; 1YDZ A; 1H97 A; 4VHB A; 2HBC A; 1N9H A; 3G4V A; 3S66 A; 1R1X B; 1XY0 A; 1FN3 B; 1J3Y B; 2HZ3 A; 1BZ6 A; 1RSE A; 1J3Z A; 1HDS A; 4N8T B; 1DKE B; 2RAO A; 4HHB B; 4MQG A; 3WCU A; 2HBE B; 4F68 A; 1NAZ A; 1IRD B; 1QXE A; 1LH6 A; 4L7Y A; 3MYN A; 3DHT B; 2ZLT B; 2AV0 A; 1WMU A; 3UBC A; 1XZU A; 1YCA A; 2V1I A; 3GKT A; 3VRG A; 3GQR B; 3PI2 A; 1MLN A; 1MLU A; 1YGD B; 2OHA A; 1G09 A; 1UX9 A; 1MNO A; 5ILM A; 3NFE A; 1RTX A; 1IWH B; 5E29 A; 1LJW B; 3UHK A; 1YDZ B; 2D5Z A; 1YMA A; 3S66 B; 1XY0 B; 2ZT4 A; 3E5O A; 2BLI A; 3PEL A; 2Z6T A; 1J3Z B; 5D1V A; 1HDS B; 4MAX A; 3UHU A; 4XDI A; 2RAO B; 4MQG B; 4HSX A; 3WCU B; 2QFN A; 1YVT A; 1DXD A; 4NXC A; 3UHN A; 3E55 A; 1QXE B; 1THB A; 4L7Y B; 3OO5 A; 2QRW A; 1WMU B; 3K8B A; 1K0Y A; 1Y45 A; 1XZU B; 3R5I A; 3VRG B; 1OUT A; 1HBH A; 3D4X A; 1G09 B; 1HV4 A; 4ILZ A; 4FWZ A; 1CBL A; 3NFE B; 1J3F A; 3BJ1 A; 1YZI A; 3UHH A; 1MBA A; 1Y4B B; 5E29 B; 3GKV A; 2HHB A; 1SI4 A; 1OFK A; 2D5Z B; 3OK5 A; 1KFR A; 3UHY A; 3ZJL A; 2ZST A; 2PEG A; 4HBI A; 3PEL B; 3CIU A; 1JL7 A; 1IDR A; 1YVT B; 5JOM A; 2ZSX A; 1NZ3 A; 4MXL A; 4NXA A; 3WHM A; 3UGY A; 2O5O X; 3GLN A; 3IC2 A; 1QPW A; 3OO5 B; 3K8B B; 5C6Y A; 1K0Y B; 5KDQ A; 3R5I B; 3TM3 A; 1OUT B; 3HYU A; 1S5X A; 1HBH B; 2VLY A; 2W6W A; 3RJN B; 3D4X B; 1HV4 B; 1Y22 B; 1Y83 A; 3QM5 A; 1UVY A; 1YZI B; 2G0V A; 3GKV B; 2HHB B; 1SI4 B; 1F63 A; 5JDO F; 4JAC A; 3WTG A; 1MDN A; 1J41 A; 1JZM A; 1BZR A; 5F2A A; 5CNC A; 1XYE A; 3O7N A; 4NK2 A; 5JDO D; 3G52 A; 3NML A; 4OF9 A; 4QAU A; 2G0X A; 1JP8 A; 3WHM B; 3BJ3 A; 2AUR A; 2MYE A; 3UHQ A; 3IC2 B; 1QPW B; 1ASH A; 3UH6 A; 1GLI A; 4X0L A; 1JL6 A; 5ILP A; 1HJT A; 5KDQ B; 1RQ4 B; 3DHR A; 1FCS A; 1S5X B; 1X9F D; 1C7B A; 2G0Z A; 3W4U A; 4PQB A; 1HGB A; 3MKB A; 2AUO A; 1OUU B; 1OFJ A; 3WTG B; 1HAB A; 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3TM9 A; 1HDB A; 1M9P B; 1CQ2 A; 1FSX B; 1XZ5 B; 2RI4 B; 1HBB B; 1Y35 A; 3QJD B; 2ZFB A; 2W6V A; 2FRJ X; 3WFX A; 1J40 B; 3FH9 B; 4N7N B; 4MQJ B; 2O5Q X; 1AZI A; 1Y85 A; 1Y7C B; 1LHS A; 3S1I A; 1CO8 A; 1DTM A; 1RQ3 A; 6HBI A; 1PBX B; 1F5O A; 2W72 B; 3FS4 A; 3NMM A; 3ZOL A; 3UHV A; 1MBC A; 3MJU B; 1CIO A; 2D2N D; 2ZS0 D; 4ODC B; 1O1L B; 1LH5 A; 4U8U C; 5B85 A; 1MOC A; 1SHR B; 3NL7 B; 2MYD A; 1MOD A; 4M4A A; 1ITH A; 2BK9 A; 3WCV A; 2MGB A; 2ZFO A; 1MWC A; 1HBS B; 1YOI A; 1HDB B; 1VXH A; 2MGD A; 1RPS A; 2MGG A; 5M3S A; 4YU3 A; 1NWN A; 1Y35 B; 2ZFB B; 2W6V B; 3AQ6 A; 5EYJ A; 2VYY A; 3UHE A; 1S56 A; 1Y2Z A; 2O58 X; 1MZ0 A; 3HRW A; 1Y85 B; 1MKO A; 1ABW B; 2G14 A; 1RQ3 B; 1Y7Z B; 2D2N C; 3PI3 A; 3FS4 B; 3NMM B; 1MCY A; 2ZLX A; 4ESA A; 1JEB A; 3VRF A; 1VRF A; 1XXT A; 4PNJ A; 2HBS A; 3GDJ A; 2M6Z A; 3WCV B; 2ZFO B; 103M A; 1MBS A; 3LR9 A; 4ROL B; 2G11 A; 2MGM A; 3MOU A; 3LQD A; 3WCT D; 2XKG A; 1RPS B; 4WJG 1; 4YU3 B; 2W72 C; 3U3E A; 1HLM A; 5HLQ A; 3G4Y A; 1XZ7 A; 3ARK A; 4F6F A; 1Z8U B; 2R1H A; 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