The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
64
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sequence length |
152
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structure length |
152
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Chain Sequence |
AFVGLSDSEEKLVRDAWAPIHGDLQGTANTVFYNYLKKYPSNQDKFETLKGHPLDEVKDTANFKLIAGRIFTIFDNCVKNVGNDKGFQKVIADMSGPHVARPITHGSYNDLRGVIYDSMHLDSTHGAAWNKMMDNFFYVFYECLDGRCSQFS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Crystal structures of two hemoglobin components from the midge larva Propsilocerus akamusi (Orthocladiinae, Diptera).
pubmed doi rcsb |
| molecule tags |
Oxygen storage/transport
|
| molecule keywords |
hemoglobin component V
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| total genus |
64
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| structure length |
152
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| sequence length |
152
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2005-05-09 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3NMM B; 2GTL D; 1F5O A; 1HBH B; 1AJ9 B; 3LB2 A; 1HGC B; 2QFK A; 1J3F A; 3UHY A; 3BJ2 B; 1YHE A; 3MJP A; 3UHE A; 1Y09 B; 1X9F B; 1J41 B; 1HAC B; 3QJE B; 2HHE B; 5EE4 D; 3UH6 A; 1BUW A; 3ORD A; 3AG0 A; 1BZ6 A; 1S69 A; 3S66 A; 1FHJ A; 5JDO C; 1SPE A; 4ESA A; 1DXC A; 2QMB A; 2EVP A; 1S5X A; 2HBF B; 1YDZ A; 3UHH A; 2BLJ M; 2DXM B; 5AZR A; 1KR7 A; 106M A; 1Y85 B; 5CMV A; 4M4A A; 1DWS A; 5KER A; 1Y4Q A; 2LH3 A; 1NZ2 A; 1DKE A; 3KMF A; 1MNI A; 3QM9 A; 2V1I A; 1YEU B; 1Y5J B; 2VYW A; 3UHI A; 1X9F D; 3LB3 A; 1Y0A B; 1NIH A; 1NQP A; 4ODC B; 1DXV B; 1FN3 B; 1A3O B; 1Y7D A; 3MYM A; 4L7Y A; 1M9P A; 1XQ5 A; 3S65 A; 1JF3 A; 3UHU A; 2G0X A; 1IOP A; 1R1X B; 1YMA A; 3AQ7 A; 3D4X B; 3AT5 B; 4H0B A; 1EBC A; 1LFY A; 4MQJ B; 102M A; 1SHR A; 1JP6 A; 3WFW A; 1LFZ B; 2ZT4 A; 1MBN A; 3QQQ A; 6HBW A; 1MBS A; 3PT7 A; 3W4U A; 1HDA A; 2MGD A; 5F2A A; 3HHB B; 2VLZ A; 1K0Y A; 2R80 A; 3QJC B; 1MDN A; 1NWI A; 2EF2 A; 1Y8H A; 3PI9 B; 4N7N A; 4B4Y A; 1FLP A; 3PEL A; 1DO3 A; 2MGB A; 3OO4 B; 1T1N A; 3G4Y A; 2MYB A; 5CN8 A; 3PT8 B; 3ZJO A; 1HBB A; 1YEN A; 112M A; 3D7O B; 1Y5K A; 3DUT B; 3S1I A; 2ZFB A; 3BA2 A; 4FWX A; 2QSP A; 2ZLX A; 4HRR A; 1Y31 B; 1YH9 A; 2HHB B; 1RTX A; 4LPI A; 3PI4 A; 1N9F A; 2HBG A; 1QSH B; 1XZV B; 1CH2 A; 2D2M C; 5JOM A; 3UHK A; 2ZLW B; 1BJE A; 1Y7C A; 1DXU A; 3QQR A; 2ZFO A; 5HY8 B; 4N7O B; 4YU3 B; 2HHD A; 1UX9 A; 4G1V A; 1OR4 A; 5CN5 A; 1MLQ A; 4VHB A; 2ZLU B; 2DHB B; 4TWV A; 1VXD A; 1O1I A; 3A0G A; 2FRI X; 1FAW B; 2ZLT A; 3WCT A; 4FWY A; 1V75 A; 3WCV C; 3ZJH A; 2FAL A; 3K8B A; 3ECZ A; 3WFT A; 2FRK X; 2LH6 A; 2O5O X; 108M A; 2MHB B; 1CBM A; 4MAX A; 2ZT3 A; 4NXA A; 1MTI A; 4ILZ A; 3QZX A; 1YHR A; 3ZOL A; 4U8U C; 2HZ2 A; 2CMM A; 4F68 A; 1SWM A; 5SW7 B; 3H57 A; 4HRT A; 3G4Q A; 5CHQ A; 1HBI A; 4HHB B; 4NXC A; 3BJ3 B; 3DR9 A; 3RJ6 A; 4MQK A; 4MQI B; 1S5Y B; 3A5B A; 3IC2 A; 3NFE B; 1Y7Z A; 5EUI B; 3HF4 A; 1HCO B; 2RI4 B; 2ZS0 B; 3HYU B; 4F6D A; 1Y4B A; 1Y4R A; 1YEO B; 4F6I A; 3E5O A; 1OUU B; 1MKO B; 2QSS B; 3WTG B; 1VXC A; 1Y45 B; 3WCP A; 1YE2 A; 3VRF A; 3GKV B; 4QAU A; 1N9I A; 3TLD A; 2MGJ A; 5ILE A; 5C6Y A; 1CPW A; 3MJU A; 1DXT B; 2GTL C; 1OUT A; 1A00 B; 1O1J A; 1V4X B; 3GK9 A; 3UHN A; 1A0Z B; 1X3K A; 2H35 B; 2NRL A; 4ROM A; 2EB9 A; 3ARK A; 3GLN A; 1NXF A; 1MLH A; 6HBI A; 1XZ5 A; 4DC7 A; 4N8T B; 5E6E A; 3UHR A; 3DHT B; 1S6A A; 4O4T A; 3GOU A; 2V1E A; 1GZX B; 1CH7 A; 5EE4 C; 2HBS B; 2R1H B; 2QU0 B; 2MGM A; 2G0S A; 3QM8 A; 5E83 A; 2MYE A; 4G51 A; 2ZS0 D; 3FH9 A; 1O1P B; 2Z6N B; 2VEB A; 3ASE A; 109M A; 2AA1 A; 2BWH A; 3UHX A; 2XKG A; 2ZSS A; 1Q1F A; 3IA3 B; 1XXT B; 1MWD A; 2FAM A; 1DXD A; 3EU1 A; 4OOD A; 5EET A; 1NPG A; 1ECO A; 4UZV A; 1JEB A; 3MOU A; 2ZLV B; 2HCO B; 3ZJS A; 1O1O B; 3HEP A; 2D60 B; 2ZSP A; 1RQA B; 1LFL A; 1J3Z A; 1C40 B; 5EU2 A; 1RVW A; 1YZI A; 2R4X A; 1NS9 B; 1J40 A; 1KD2 B; 3EOK A; 4F4O B; 1X9F C; 1HAB B; 5EYS A; 3MN0 A; 2ZSN A; 3A5A A; 1FSX B; 1SDL A; 4MXL A; 3D1K B; 4MQG A; 1ABY B; 3BCQ A; 3D17 B; 1A6M A; 2PEG A; 1LA6 A; 1Y0T B; 1O1N B; 3K9Z A; 1Y8W A; 4MXK A; 1CG8 A; 1QXE A; 2HBE A; 4O4Z A; 2NSR A; 1THB A; 3ODQ A; 1NS6 B; 1G0A A; 1Y83 A; 3PIA B; 1YEQ A; 1QPW A; 4F6G A; 5C6E A; 4IRO B; 3A59 B; 3GQP B; 3IC0 A; 1DUK A; 3ECL A; 1HBS B; 4ROL A; 4FH6 A; 1NWN A; 1XZU B; 1NEJ B; 2BLH A; 2D2N B; 1GCV A; 1SDK A; 1VXB A; 1O1L A; 2OLP A; 5HU6 B; 4KJT A; 3WFX A; 1LFQ A; 2GRH A; 3P5Q A; 1GDL A; 1YIE B; 1WLA A; 1RQ4 A; 2LH7 A; 2HBC A; 4TYX A; 2MGE A; 1A9W A; 1OFK A; 1HJT A; 1SPG A; 1LHS A; 1BVD A; 1GCW A; 2MYC A; 2B7H B; 1YG5 A; 2AUO A; 4MBN A; 1J7W B; 3NL7 A; 1TU9 A; 1HBR A; 1VWT A; 2AUQ A; 2H8F A; 2D5X A; 3ZJL A; 5B84 A; 2O5M X; 1UFP A; 3MKB A; 1UX8 A; 3HEO A; 1YVQ B; 1Y5F A; 3VRE A; 5D1V A; 2OHB A; 2W6X A; 1GDJ A; 1B0B A; 1Y8K A; 1Y4G B; 1UVY A; 1MYF A; 1MWC A; 1MYT A; 2D2N D; 2HBD A; 1YE0 A; 3LR7 A; 1YHE B; 3MJP B; 3UHW A; 1ECN A; 1S56 A; 3OZW A; 1HHO A; 4MU5 A; 1YEV A; 1MLS A; 3OO5 B; 1G0B B; 2MGC A; 1QI8 A; 1MOB A; 2AV0 A; 4PQC A; 3AT6 A; 1JL7 A; 1QSI B; 2R4Z A; 1A0U A; 1EWA A; 1MYG A; 1EW6 A; 1K1K A; 2VHB A; 1SI4 B; 5F0B A; 5M3S A; 2FRJ X; 1Y0C A; 1FHJ B; 1O1K A; 1MLR A; 3QJB A; 1HDB A; 2HZ1 A; 3DHR B; 3VRG A; 2ZT2 A; 1LJW A; 3UHB A; 3AQ9 A; 4F6B A; 4DC8 A; 4NK2 A; 1J3Y A; 2MB5 A; 2MBW A; 1IRD A; 2Z6T A; 3BJ1 A; 1MOD A; 4KN3 A; 1Y4F B; 105M A; 1Y0D A; 1MBC A; 2D6C A; 2BKM A; 1MBA A; 1CBL A; 1HDS B; 5JGG B; 2OH9 A; 4FH7 A; 3S1J A; 1IWH B; 1C7B B; 4WCH D; 2Z8A A; 1JL6 A; 2GTL A; 5ILR A; 1RTE A; 1XYE B; 1O1M B; 2WTG A; 2H8D A; 1MLK A; 2DN1 A; 2BLI A; 3ZJI A; 2OH8 A; 1RPS B; 5KDQ A; 1A4F B; 3HRW B; 3V2Z A; 1Y35 B; 1V4W A; 3GDJ A; 1OJ6 A; 1RQ3 A; 1YIH B; 1C7C A; 2SPL A; 2ZS0 C; 3FS4 A; 3W4U B; 5IKS A; 1BBB B; 2ZSQ A; 2D5Z A; 1Y8I A; 2C0K A; 1BAB B; 3K3U A; 4FC3 B; 1UIW B; 4XS0 A; 1JDO A; 3LQD B; 1A01 A; 1ABW B; 1C7D A; 1LH2 A; 1Y8H B; 2V1J A; 2YRS B; 2WY4 A; 4IT8 A; 1LFT A; 1T1N B; 1G09 B; 3HXN B; 2ZS1 A; 3UGY A; 3NMM A; 1R1Y B; 1MCY A; 3IXF A; 1BZP A; 1HBB B; 4MQH A; 1UC3 A; 1HBH A; 1AJ9 A; 4X0L B; 1YMC A; 3UHC A; 1HGC A; 2G12 A; 3G52 A; 5CN6 A; 1QXD B; 1Y7G B; 2QSP B; 3BJ2 A; 4HRR B; 3ONZ B; 1BZ1 A; 1Y09 A; 1MYZ A; 1X9F A; 1CMY B; 2XYK A; 1VXH A; 1HBG A; 3QJE A; 2MYD A; 4FWZ A; 2HHE A; 2ZFO B; 2W6V B; 2O5L X; 2MGA A; 3QJD B; 2ZT0 A; 2NX0 A; 3WCW B; 3LHB A; 3SZK B; 2O5B X; 2VEE A; 2HBF A; 3ZJJ A; 1Y4P B; 1DUO A; 2DXM A; 2R50 A; 1Y85 A; 1MNJ A; 2VLX A; 3PI8 B; 1EBT A; 1MLF A; 2LHB A; 5B85 A; 1YHR B; 2V1G A; 1J7S B; 3QMA A; 4MPM A; 1FSL A; 2DC3 A; 2MYA A; 1S0H B; 1YEU A; 1Y5J A; 4MQC B; 4NI1 B; 1Y0A A; 4HRT B; 4ODC A; 1BZZ B; 1DXV A; 1FN3 A; 1A3O A; 1PBX B; 1IRC A; 1CQ2 A; 3V2V A; 3IC2 B; 2W72 A; 1D8U A; 1R1X A; 2ZFO D; 1GJN A; 1CO9 A; 1V4U B; 2MGF A; 3AT5 A; 3R5I B; 3WCW D; 2ZSX A; 2R4Y A; 4UUR A; 1URV A; 3MYN A; 4MQJ A; 5AB8 A; 3ZJN A; 1YE2 B; 2Z6S A; 1LH6 A; 4O35 A; 1BIJ B; 1J7Y B; 1MOH A; 1YVT B; 2BW9 M; 2ZSY A; 4SDH A; 1FCS A; 1H1X A; 1CH5 A; 2PGH B; 3HHB A; 2QRW A; 1XY0 B; 3QJC A; 1B86 B; 2D2N C; 2E2Y A; 5CNF A; 5CNC A; 2GRF A; 3OO4 A; 1YHU B; 7HBI A; 1COH B; 1VRE A; 3D7O A; 3DUT A; 2G0R A; 3ZH0 A; 1Y22 B; 1HBA B; 2V1K A; 2G0Z A; 4ZVA A; 1BZR A; 2HHB A; 5JDO E; 3NG6 A; 1QSH A; 3UI0 A; 1WMU B; 1XZV A; 1HRM A; 1V07 A; 1ITH A; 3WR1 B; 2ZLW A; 2O5S X; 1YGF B; 3ZHW A; 5HY8 A; 4N7O A; 2DN2 B; 4YU3 A; 4DWU A; 1HGB B; 4KMV A; 2VYY A; 2ZLU A; 2DHB A; 3RGK A; 1FAW A; 1DM1 A; 1YZI B; 2G3H A; 1YHU D; 1KFR A; 2MHB A; 1GVH A; 3OGB A; 2OIF A; 1Y0W A; 5CN4 A; 3U3E A; 4M4B A; 4NK1 A; 1Y01 B; 3M3A A; 1JY7 B; 3D1A A; 3GQR B; 3WCU B; 1OBM A; 3TM3 A; 1CP5 A; 1MLN A; 3OZU A; 1J52 A; 2MGK A; 4YU4 B; 2EVK A; 3G4W A; 3ODQ B; 4HHB A; 1MLL A; 3BJ3 A; 4MQI A; 1S5Y A; 3WHM B; 3NFE A; 5EUI A; 1Y46 A; 1QPW B; 3LB1 A; 1HCO A; 1Y2Z B; 2RI4 A; 2ZS0 A; 2BNL A; 3O89 A; 2JHO A; 3CIU B; 4GZG A; 2G10 A; 1OUU A; 1MKO A; 1MLO A; 2QSS A; 3WTG A; 1CO8 A; 1Y45 A; 2KSC A; 1O16 A; 3GKV A; 3GQG B; 3WI8 A; 4H07 A; 1MOC A; 1GBU B; 3OZV A; 1DXT A; 1A9W E; 1XZ4 B; 1NAZ A; 1A00 A; 1ECA A; 2BK9 A; 1A0Z A; 5HAV A; 2H35 A; 1GCW B; 1VXG A; 2W6W A; 4AVE A; 3WCU D; 1GBV B; 3R0G A; 1XZ2 B; 4O1T A; 4N8T A; 2LH2 A; 3DHT A; 2GLN A; 1HGA B; 3UBV A; 1YGD A; 1GZX A; 2BMM A; 3E4N A; 1A3N B; 2R1H A; 4JYQ A; 3BOM B; 1HV4 A; 4NI0 B; 4DWT A; 1JP8 A; 2Z6N A; 5EQM A; 2W6Y A; 2M6Z B; 1HLB A; 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1A01 B; 3G4U A; 1DKE B; 3A2G A; 1BIN A; 1JWN A; 1YOG A; 3KUO A; 1ABS A; 1YVQ A; 2ZS1 B; 1NIH B; 3G46 A; 1NQP B; 3A9M A; 4MQH B; 3UHQ A; 1Y7D B; 1MWB A; 4L7Y B; 1M9P B; 1XQ5 B; 1Y4G A; 3S65 B; 5CNE A; 4NZI A; 2ZWJ A; 1A6K A; 1AJG A; 1BZ1 B; 1M6C A; 3OO5 A; 1YHU C; 1LFY B; 1G0B A; 1SHR B; 1A6G A; 2MGH A; 2EB8 A; 6HBW B; 1QSI A; 3H58 A; 1AJH A; 2G14 A; 1LFV A; 3PT7 B; 1MBO A; 1MNH A; 1SI4 A; 1CG5 A; 1HDA B; 2GNV A; 2GRZ A; 3M3B A; 1K0Y B; 2R80 B; 110M A; 2AV3 A; 3DHR A; 1NZ5 A; 4N7N B; 1M6M A; 3PEL B; 101M A; 3MBA A; 2ZS1 D; 3G4V A; 1MYM A; 1Y4F A; 1F5P A; 5MBN A; 5CN7 A; 1YEN B; 1Y5K B; 2ZFB B; 1DWR A; 1I3E A; 1HDS A; 104M A; 2ZLX B; 1YH9 B; 5HLU A; 5JGG A; 1JZM A; 1IWH A; 1C7B A; 1J41 A; 5KKK A; 2GKM A; 1HAC A; 3G4R A; 2WTH A; 1Y7C B; 1XYE A; 1O1M A; 1DXU B; 2W72 B; 3WCU C; 2HHD B; 2VLY A; 4G1B A; 1RPS A; 3PI2 A; 1A4F A; 3HRW A; 1TES A; 1Y35 A; 1O1I B; 3A0G B; 3UH7 A; 2MGI A; 2ZLT B; 3WCT B; 1YIH A; 2LH5 A; 1V75 B; 3QZZ A; 3K8B B; 1BBB A; 3TM9 A; 5AZQ A; 1BAB A; 5D5R A; 4FC3 A; 1UIW A; 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