The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
57
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sequence length |
146
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structure length |
146
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Chain Sequence |
VQLSGEEKAAVLALWDKVNEEEVGGEALGRLLVVYPWTQRFFDSFGDLSNPGAVMGNPKVKAHGKKVLHSFGEGVHHLDNLKGTFAALSELHCDKLHVDPENFRLLGNVLVVVLARHFGKDFTPELQASYQKVVAGVANALAHKYH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
A new relaxed state in horse methemoglobin characterized by crystallographic studies.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Hemoglobin alpha chains
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| molecule tags |
Oxygen storage/transport
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| total genus |
57
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| structure length |
146
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| sequence length |
146
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| chains with identical sequence |
D
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2004-12-13 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| B | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 4F6G A; 3UHS A; 1Q1F A; 1VXE A; 1V4X B; 1Y4R B; 1SPE A; 4NI0 B; 1URY A; 4U8U D; 1YCA A; 1DUK A; 1MLJ A; 2LH1 A; 1B86 A; 2ZLX A; 1O1O A; 3RGK A; 2MHB B; 5AB8 A; 2BW9 M; 2MYC A; 1CG5 B; 1Y83 A; 2H8F B; 3LR9 A; 4MQJ A; 1CH5 A; 3DHT B; 1MYG A; 2MYA A; 3BJ3 B; 1COH A; 3S65 B; 2V1I A; 1OUU A; 3A5A A; 1JF4 A; 2ZFO D; 106M A; 2VRY A; 3AQ8 A; 1DUO A; 4YU3 A; 1Y5J B; 3UHI A; 1CLS B; 1NZ5 A; 1IBE A; 2VLY A; 5C6Y A; 1Y8I B; 3UHT A; 3VRF A; 3ARK A; 2ZT1 A; 4HRT A; 112M A; 1JY7 A; 3A9M A; 4H0B A; 2GTL D; 3ZJQ A; 1MLR A; 1M9P A; 2WTG A; 1LH3 A; 3GQP B; 1J3Z B; 2QFN A; 1DWT A; 4FWX A; 4QAU A; 1MNO A; 4FC3 B; 5MBN A; 5CN8 A; 2VYZ A; 3AQ6 A; 3ED9 A; 2R4Z A; 1Y5K B; 3GQG A; 1BZ0 B; 3A5B A; 1MWC A; 1O1J A; 5AZR A; 4IT8 A; 3A59 B; 1S5Y B; 1CIO A; 2LHB A; 1MLS A; 1MLM A; 3H58 A; 2D2M A; 1MGN A; 3WHM B; 3PT7 A; 1Y7D A; 3ZJL A; 1YHU C; 2QMB B; 1F63 A; 1G0B B; 2MGM A; 4G51 A; 4IRO A; 1FN3 B; 1XZU B; 4G1B A; 2QLS A; 2DXM A; 2PEG A; 1ABY A; 1S0H B; 1EBT A; 3G4U A; 2ZSY A; 2XKI A; 5CNB A; 2ZSX A; 1F5O A; 1JDO A; 1CP0 A; 2PGH B; 2SPO A; 2W6W A; 1Y0T A; 1MLL A; 1SHR A; 1MLH A; 5F0B A; 1VXD A; 1A01 B; 3D1A B; 3WTG A; 1AJH A; 4ROM A; 3ZHW A; 1U7S A; 2HHE A; 1YVQ A; 4F6J A; 1BAB B; 1MWB A; 1QXE A; 5E29 A; 1JL6 A; 1RQ4 B; 4NI1 A; 1FDH A; 3KMF A; 2Z85 A; 1G09 B; 3P5Q B; 2R50 A; 1Y4Q A; 1MTJ A; 1O1P B; 1SDL A; 5KKK A; 3AQ7 A; 1MKO B; 3UHZ A; 1YH9 B; 3WCU C; 1MOD A; 5HAV A; 2H8D A; 3VRE B; 2MBW A; 1SDK B; 2DN1 A; 2DN3 B; 3NG6 B; 2G10 A; 3MVC A; 3OO5 A; 1YHE B; 5E6E A; 4LPI A; 1Y5F A; 1MLN A; 2GL3 A; 3IXF A; 4M4B A; 4X0L A; 1X9F B; 1GCW A; 3OJ1 A; 1YZI A; 1THB B; 2VM0 A; 2LH5 A; 2W6X A; 4KJT A; 3M3B A; 2ZT0 A; 2G3H A; 1Y31 A; 1YIE B; 1XQ5 B; 5CN7 A; 3HXN A; 1O1I A; 1B86 B; 2ZLX B; 1GJN A; 1MYH A; 2QSS B; 1MYZ A; 3ZJJ A; 2EKU A; 2D6C A; 1Y83 B; 3H57 A; 3HEO A; 1MBN A; 1XZ7 A; 1Y4G B; 4H2L A; 1COH B; 3DHR A; 1YEU A; 1CPW A; 4YU3 B; 3UH5 A; 1Y8W A; 3ZH0 A; 1VXH A; 2V1G A; 1F5P A; 1CO8 A; 1IBE B; 1YMC A; 104M A; 1DTM A; 3VRF B; 3GKT A; 5M3S A; 4HSX A; 4HRT B; 1A9W E; 1JY7 B; 2WY4 A; 109M A; 1Y09 A; 1U7R A; 3G4Q A; 1M9P B; 4MQH B; 2GRH A; 3QJC A; 3FS4 A; 5JDO C; 1ECA A; 2ZLW B; 1TU9 A; 2H35 A; 3TM9 A; 3ZOL A; 5CND A; 4AVD A; 1IDR A; 3QJE A; 1S5X B; 2BKM A; 3AQ9 A; 1NGK A; 1JEB A; 1Y85 B; 1IT3 A; 2NRM A; 1J3F A; 1XZ2 B; 1R1X B; 1NEJ B; 1YMA A; 1KFR A; 1J7S A; 1A9W A; 4ROL A; 4XS0 A; 1J40 A; 1J7Y A; 1HCO A; 1YG5 A; 3UH6 A; 3TLD A; 1SI4 A; 5C6E A; 2DN2 A; 2MGI A; 1OFJ A; 4KMV A; 3LB3 A; 2BK9 A; 2AUQ A; 3ZJI A; 3WCV C; 1Y7D B; 6HBW A; 3GK9 A; 1LA6 A; 4G51 B; 2ZLT A; 1C40 B; 1PMB A; 4IRO B; 1M6M A; 1DKE B; 2QLS B; 2DXM B; 1LHT A; 4MBA A; 2RI4 A; 3GKV A; 1ABY B; 2HHB A; 4O4Z A; 3QJD B; 3DUT B; 3QM7 A; 2MGB A; 1MTK A; 1FSX A; 1UMO A; 3CIU B; 3S1J A; 2IN4 A; 3B75 A; 1OR4 A; 1NPF A; 1SHR B; 7HBI A; 1HDA B; 3IA3 B; 1C7B A; 3EOK B; 1Y0C A; 1NIH B; 3MJU A; 4ROM B; 101M A; 1UVY A; 1YVQ B; 1LTW A; 3M38 A; 1QXE B; 5E29 B; 1O1L A; 1GCV A; 3UHE A; 1NQP B; 1X9F D; 4NI1 B; 1Y4P B; 3G4V A; 1YVT A; 1VHB A; 1QI8 A; 1CQ2 A; 1YHU A; 4PQC A; 1NZ2 A; 2ZFO B; 3MBA A; 1V4U A; 2HBC B; 4N7P A; 2MGJ A; 5CN5 A; 2ZS0 C; 3RJN B; 4ODC A; 1MLQ A; 2DN1 B; 1JWN A; 3OO5 B; 2FRI X; 1A0Z B; 4F69 A; 1SWM A; 1Y5F B; 3GYS A; 4M4B B; 1ABS A; 1HDS A; 4X0L B; 1O1M A; 2B7H B; 1GCW B; 1CG8 A; 1DXU A; 1YZI B; 4FWZ A; 3UHV A; 2G12 A; 1Y31 B; 2MGK A; 1Y0W B; 3ZJM A; 1O1I B; 1V5H A; 3WCU A; 1YGD A; 1YGF B; 3HHB A; 2FRF A; 1XZ7 B; 3KUO A; 1ECD A; 3BCQ B; 1BJE A; 2SPL A; 3UHD A; 1WMU A; 2O58 X; 4NXA A; 4H2L B; 1UFP A; 3ZJP A; 1CO9 A; 3GQR A; 2D5Z B; 2HZ1 A; 3DHR B; 2XKG A; 1BZR A; 1LJW A; 1YMB A; 4O2G A; 1A6K A; 1YEU B; 3PIA A; 1HGB A; 2EVP A; 4O1T A; 4WJG 1; 2MYE A; 1Y7Z A; 1IT2 A; 2ZST A; 2AUR A; 2D2M D; 4MQC A; 3UH3 A; 2VEB A; 3M39 A; 1Y09 B; 1VRF A; 3PI1 A; 3UHX A; 3FS4 B; 1VWT A; 1V07 A; 2R4W A; 4B3W A; 2H35 B; 2HHD A; 4ZVA A; 1DWS A; 3BOM A; 5CNC A; 1Y45 B; 1JEB B; 5JDO E; 4N7O A; 2EKT A; 5B85 A; 2Z6T A; 3D1K A; 2D2N C; 2MGH A; 1J7S B; 3ZJR A; 3HEN A; 3K3U A; 4ROL B; 2D5X A; 1J40 B; 1J7Y B; 1CQX A; 1HCO B; 3WFX A; 1YG5 B; 3PI8 A; 3QM8 A; 4MQK A; 2HBG A; 1H1X A; 1RVW A; 5C6E B; 2DN2 B; 2V1H A; 3VAU A; 3NL7 A; 1CMY A; 1H97 A; 3IC2 A; 4HHB B; 6HBW B; 2M6Z B; 2V1F A; 1KD2 B; 1YEN A; 3ZJH A; 5EE4 D; 1NPG A; 3S66 A; 1LA6 B; 3R0G A; 1HHO A; 2ZLT B; 1LH5 A; 1XZV A; 2ZS1 C; 5HLQ A; 1A00 A; 1HBG A; 2O5S X; 3GKV B; 2RI4 B; 2HHB B; 1YEV A; 1Y8K A; 1Y4V A; 1XZ5 B; 2EF2 A; 2HZ2 A; 4DWU A; 3B75 B; 1MWD A; 4MXK A; 2OIF A; 1J52 A; 1DXV B; 1Y0C B; 4F6F A; 2ZT3 A; 3MJU B; 3UHK A; 4MQG A; 4MAX A; 5MBA A; 1S6A A; 1O1L B; 2G11 A; 1A4F A; 1Y2Z B; 2FAL A; 1Y0A B; 3WCV A; 1QI8 B; 1YHU B; 3AT6 B; 5E83 B; 1V4U B; 1M6C A; 4M4A A; 1B0B A; 1MDN A; 1K0Y B; 1RSE A; 3ARJ A; 1DO3 A; 1OJ6 A; 1HJT A; 4ODC B; 1RTX A; 1SPG A; 4WCH D; 2C0K A; 1BZ1 A; 5HU6 A; 2WTH A; 3LB4 A; 1RPS A; 3LB2 A; 3VHB A; 1HDB A; 1XXT A; 2MGG A; 2NRL A; 1LFZ A; 2HCO B; 2EVK A; 3GYS B; 3UHG A; 2VYW A; 1JZK A; 1RQA A; 1S61 A; 1O1M B; 1HBH A; 1OR6 A; 1A6G A; 2ZLV A; 1DXU B; 3MKB A; 4B4Y A; 3QM6 A; 5KER A; 2EB9 A; 4DWT A; 3S48 C; 2GDM A; 1HBA B; 2HBD A; 4FH7 A; 1LFL A; 3HYU B; 2G0X A; 2DHB B; 2G0S A; 3WCU B; 1YGD B; 2V1K A; 1UX8 A; 2ZS0 A; 1A3O A; 1Y7G A; 3WFW A; 3UHU A; 3HHB B; 2R1H A; 1Y46 B; 3UGZ A; 3ZOM A; 3D4X A; 1YE0 A; 1HAB A; 1AJG A; 1O1N A; 1HBB A; 1WMU B; 2D60 B; 1NS6 A; 1R1Y A; 1CH2 A; 3ODQ B; 2VHB A; 3EDA A; 1J7W B; 1UIW A; 1F65 A; 2AA1 A; 3PIA B; 1MOB A; 1J41 B; 4C44 A; 1LFV A; 3VRG A; 1Y7Z B; 2HBS A; 1BZZ A; 2GKN A; 4MQC B; 3ECZ A; 3O7N A; 1QXD B; 1ITH A; 1VWT B; 1PBX A; 4F68 A; 1I3E A; 4AVE A; 1VXA A; 4DC7 A; 1LUE A; 4TWV A; 3BOM B; 4HBI A; 3HF4 A; 1RQ3 A; 3NML A; 5CNE A; 4MPM A; 2Z8A A; 5ILM A; 1YHR A; 3MYM A; 3PI8 B; 1O1O B; 3M3A A; 1RVW B; 2W6V A; 5HLU A; 3UHH A; 4MBN A; 4MQJ B; 1GBU A; 3NL7 B; 3IC2 B; 1YCB A; 1DLW A; 3UHR A; 1YEN B; 3SZK A; 4GZG A; 3S66 B; 1G9V A; 2O5O X; 1YHU D; 1XZV B; 1OUU B; 1Y0D A; 2OH8 A; 1A00 B; 1HBI A; 3UHW A; 1YEV B; 2HZ3 A; 1Y8K B; 1Y4V B; 2G0V A; 3D7O A; 1L2K A; 3V2Z A; 1YE2 A; 4BJA A; 1DM1 A; 2D2N A; 2VLZ A; 1O16 A; 3WFT A; 1DO7 A; 3HEP A; 4MQG B; 4JYQ A; 1X46 A; 3HRW A; 3ZJS A; 4NK2 A; 4ESA A; 1A4F B; 3ORD A; 2YRS A; 3D17 A; 1AJ9 A; 102M A; 1BBB A; 1HBS A; 3GQG B; 3WCV B; 3AQ5 A; 1IWH A; 3MJP A; 3A0G A; 1G08 A; 1O1J B; 4JAC A; 1YDZ A; 2ZS1 A; 4M4A B; 2ZFB A; 4YU4 A; 2GNV A; 3QQR A; 1OUT A; 3WCU D; 4N8T A; 2D2M B; 2ZWJ A; 1SPG B; 2BLI A; 3PT7 B; 2MGE A; 1BZ1 B; 1G0A A; 5HU6 B; 4MQI A; 3A2G A; 1HDB B; 1XXT B; 1LFZ B; 1LFT A; 2HBF A; 1DTI A; 4KMW A; 4O4T A; 2PEG B; 2MYB A; 2H8F A; 2VYY A; 3UBV A; 3W4U A; 3MKB B; 4FWY A; 3ECL A; 3QZX A; 1Y0T B; 2V1J A; 5JGG A; 2HBD B; 2QFK A; 1UVX A; 1JL7 A; 3MN0 A; 3OZV A; 3WTG B; 1Y5J A; 1HSY A; 3ZJO A; 2HHE B; 1Y8I A; 1YEQ A; 1A3O B; 2ZS0 B; 3WR1 A; 2VEE A; 1Y4F A; 3UGY A; 2IG3 A; 1YE0 B; 1HAB B; 3WCT C; 1O1N B; 1HBB B; 1R1Y B; 3OK5 A; 4H07 A; 5D1V A; 3WCW C; 1LH2 A; 1J3Z A; 1WVP A; 3O89 A; 5CMV A; 1Y4Q B; 2AV0 A; 1SDL B; 1MBD A; 1DXC A; 1UIW B; 4N7N A; 3V2V A; 2H8D B; 3VRG B; 3GOU A; 2BNL A; 1BZZ B; 2LH6 A; 4U8U C; 1GBV A; 1GLI A; 5E6E B; 2Z6N A; 1UX9 A; 1PBX B; 3ECX A; 1V4W A; 2XYK A; 3ARL A; 1DWR A; 1V9Q A; 3QMA A; 5JDO D; 2FAM A; 1ABW A; 3GLN A; 2MYD A; 3WI8 A; 2QMB A; 3K9Z A; 3OO4 A; 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1LFT B; 3U3E A; 2HBF B; 2QSS A; 5CN4 A; 1RTE A; 1VXB A; 1O1K A; 3W4U B; 3FH9 A; 1FSX B; 1Y4G A; 5ILP A; 107M A; 1CH3 A; 2QSP A; 5JGG B; 1C7B B; 1QPW A; 2EB8 A; 3AT5 A; 2MGF A; 1YEQ B; 3WR1 B; 3R5I A; 4UZV A; 1Y4F B; 1GCV B; 1A6M A; 1JPB A; 5SW7 A; 2MGL A; 1YVT B; 4MQH A; 2O5T X; 4F4O A; 1MLG A; 1MTI A; 2ZLW A; 5EET A; 1GVH A; 1MZ0 A; 3MOU A; 4N7P B; 1T1N A; 4N7N B; 1S5X A; 1OBM A; 1V75 A; 1CH9 A; 3GOU B; 1Y85 A; 1XZ2 A; 1GBV B; 2BMM A; 3AG0 A; 1GLI B; 1Y4B A; 1YIH A; 1LFQ A; 1R1X A; 1NEJ A; 1DXT A; 2Z6N B; 2CMM A; 4PNJ A; 1GDI A; 1BIJ A; 4ZVB A; 1VRE A; 1V4W B; 2ZLU A; 5EYJ A; 4G1V A; 1HDS B; 3G52 A; 1OFK A; 1ABW B; 1YEO A; 1MLF A; 3E5I A; 1CG8 B; 3OO4 B; 3WCT A; 1XY0 B; 3QJB B; 1C40 A; 1XZ4 B; 1C7C A; 3OZW A; 3WCW A; 1DKE A; 5KDQ B; 1CBL A; 3TM3 A; 1TES A; 3QJD A; 2BLH A; 3E4N A; 3K8B A; 3DUT A; 2SPM A; 2D2N D; 1XYE B; 1YOG A; 2ZSN A; 1N9F A; 1Y35 B; 3WCP B; 3CIU A; 4L7Y B; 1BIN A; 1QSI B; 3SDH A; 2SPN A; 4U8U A; 1HDA A; 1HBR A; 3PI3 A; 1NS9 B; 3EOK A; 2MGC A; 4UIQ A; 5CN6 A; 1NIH A; 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