The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
57
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sequence length |
146
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structure length |
146
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Chain Sequence |
VQLSGEEKAAVLALWDKVNEEEVGGEALGRLLVVYPWTQRFFDSFGDLSNPGAVMGNPKVKAHGKKVLHSFGEGVHHLDNLKGTFAALSELHCDKLHVDPENFRLLGNVLVVVLARHFGKDFTPELQASYQKVVAGVANALAHKYH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
A new relaxed state in horse methemoglobin characterized by crystallographic studies.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Hemoglobin alpha chains
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| molecule tags |
Oxygen storage/transport
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| total genus |
57
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| structure length |
146
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| sequence length |
146
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| chains with identical sequence |
D
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2004-12-13 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| B | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3BJ2 A; 5E6E A; 3AQ5 A; 1GDK A; 3VRE B; 1HBA A; 1J7W A; 1Y0C B; 1O1N B; 1XCH A; 1YVQ B; 1MWD A; 1BIJ B; 5CN7 A; 1DO4 A; 1GVH A; 1J41 A; 2H35 B; 1PBX A; 1J7S A; 1LTW A; 107M A; 2QRW A; 3MKB B; 1V4U B; 4MXK A; 1MLM A; 1HGC B; 3KMF C; 1YEN A; 1NQP B; 1XZV B; 1C40 A; 2R4Y A; 1NEJ A; 1Y7D B; 5CN4 A; 1YHU C; 2ZLW B; 2ZS1 A; 3KUN A; 1OUT A; 3WFT A; 3PI4 A; 2D5Z A; 1LFV A; 3UHY A; 1JWN A; 1J40 A; 3NG6 B; 5JGG A; 3RJN B; 1KD2 B; 1N9H A; 1YOI A; 2SPO A; 4IT8 A; 3S65 A; 3BCQ A; 1Y4G A; 1G0A B; 1RSE A; 1Y83 B; 1JZK A; 2QU0 A; 1GBU B; 3PI9 B; 1D8U A; 3QM8 A; 1DKE B; 4F6I A; 2HZ3 A; 1AJH A; 1XYE A; 1O1K A; 1XQ5 B; 1NPF A; 2EF2 A; 2MGL A; 1O1O A; 1MTJ A; 1THB A; 2HZ2 A; 2OH9 A; 1UC3 A; 3UHZ A; 3NFE A; 3GKV A; 1VXE A; 2XKI A; 2O5B X; 3ZJP A; 3BOM A; 3QM6 A; 1DXU A; 1Y8W A; 2G0S A; 2H8F A; 5KDQ A; 1YHU A; 1X9F B; 3EOK A; 1X46 A; 1QI8 A; 5SW7 A; 1AJG A; 3GQP A; 1YHE B; 1BZ0 A; 1MBO A; 1O1M B; 3LB4 A; 1GBV B; 4ROM A; 4N7N B; 3P5Q B; 1ABS A; 1LJW B; 1PMB A; 2PEG A; 1BIN A; 1S69 A; 2B7H B; 2HBC A; 1NZ2 A; 1BVC A; 1K1K A; 1MLG A; 1XY0 A; 1V9Q A; 3QJE B; 1GLI B; 2HBS A; 2DXM B; 5MBN A; 4C0N A; 4X0L B; 1IT3 A; 3A5G A; 2W6V B; 4N7O B; 1HV4 A; 2MGG A; 3GDJ A; 1CQX A; 1YE2 A; 1UIW B; 3ZH0 A; 3SZK A; 2MGF A; 3K8B B; 1YZI B; 3EDB A; 1N9X A; 1HDA A; 1RVW B; 1HSY A; 1XXT A; 1MLQ A; 3G4W A; 3FH9 B; 4HSW A; 4HRR B; 1QXE A; 5JDO F; 2MHB A; 2QSP A; 2QSS B; 1YGD A; 1HDB B; 3QJC B; 3HXN A; 1CH4 A; 1YH9 A; 4MQK A; 1Y7Z B; 2ZLX B; 3HEO A; 4XDI A; 1V4X B; 1Y45 A; 3G4Q A; 3DUT A; 2ZS0 C; 5JDO D; 1NWN A; 2GNV A; 4PQB A; 4TWU A; 3UHT A; 1O1I B; 4NXA A; 2GKM A; 1O1L A; 1LFL B; 1CH3 A; 2ZT3 A; 2ZLV B; 1J7Y A; 1NPG A; 7HBI A; 2ZSO A; 3GQR B; 3ZJQ A; 1Y4F A; 1Y5J A; 102M A; 3SDN A; 2ZT2 A; 3UHU A; 1URY A; 2GRZ A; 3QQR A; 3QM9 A; 1OR6 A; 1HCO A; 2NSR A; 1MLF A; 2QFN A; 3D4X B; 1CG5 B; 1HBR A; 1BUW A; 2VEB A; 3MBA A; 1A6G A; 2YRS A; 1A3N B; 3WCW B; 1HRM A; 2FRK X; 4N8T B; 3MYN A; 3DHT B; 2HHB B; 2HHE A; 5AB8 A; 2W6W A; 3UHG A; 1QXD A; 4WJG A; 1MBS A; 3WCP B; 3ARL A; 1BAB B; 4XS0 B; 2ZS0 A; 4F6F A; 1S5X A; 4H2L A; 1IT2 A; 2RI4 A; 4SDH A; 1S0H B; 4JYQ A; 3WCW D; 4F4O A; 4MPM A; 1Y0D A; 1VXG A; 2G0R A; 1YOH A; 2E2Y A; 3ECX A; 1RQ3 B; 4C44 A; 4MXL A; 5KKK A; 4MQC B; 2AV3 A; 1MYF A; 1CH5 A; 3D17 B; 1HDS A; 2MYA A; 1FDH A; 1Y31 A; 1MLS A; 1C7D A; 1CLS A; 1Y0A B; 2V1J A; 2V1K A; 1BZ1 A; 3QM5 A; 3GK9 A; 109M A; 4KN3 A; 1Y09 A; 3CY5 A; 3LB2 A; 1V4W B; 3GKT A; 1FCS A; 3AT6 A; 1A9W A; 1MLU A; 1VXF A; 4M4A A; 5E83 A; 3HF4 A; 2GKN A; 3A59 A; 3WCT B; 1UFP A; 3PIA B; 1FLP A; 1GZX A; 4U8U C; 1Y7C B; 3ZHW A; 4H0B A; 3AQ9 A; 2HHD B; 2PGH A; 1F65 A; 1Y5F B; 2BKM A; 2AA1 B; 1Y35 B; 2Z8A A; 3GOU B; 3WR1 A; 5EYS A; 3LR7 A; 3GYS A; 3NML A; 1YEU A; 1CO9 A; 1SI4 B; 1RQ4 A; 3QM7 A; 1YGF B; 1VXH A; 4O2G A; 4G51 A; 3IC0 A; 1ECN A; 1UX9 A; 4HRT A; 1J3Y A; 103M A; 3IC2 B; 3PT7 B; 1YVT A; 2GTL C; 3ED9 A; 1YEQ B; 1MOA A; 2VM0 A; 3VRG A; 1QSI B; 2IG3 A; 1OUU B; 1YG5 B; 2FRF A; 2D60 B; 2LH1 A; 1RTE A; 3UI0 A; 1MCY A; 4U8U A; 3AQ7 A; 1Y7G B; 1G09 B; 3V2V A; 1CP0 A; 3QZX A; 1MBA A; 3PI8 B; 1G0B A; 1RQA B; 2CMM A; 1S5Y B; 2KSC A; 1DWT A; 5EUI B; 1MOH A; 4F6G A; 4DWU A; 1L2K A; 4ROL A; 3BJ2 B; 1G9V A; 2O58 X; 5E6E B; 2ZFB A; 4YU3 A; 1SDL A; 1J7W B; 4JAC A; 2D5X A; 5AZR A; 1YCB A; 4GZG A; 4O4Z A; 2SPM A; 1UVY A; 5F2A A; 3S66 A; 4ODC A; 1GDL A; 3PI1 A; 1XZ7 A; 3AT5 B; 1PBX B; 1R1X A; 3ASE A; 2EVP A; 1J7S B; 2D2M B; 106M A; 2EVK A; 2GTL A; 4UUR A; 3LR9 A; 3WHM A; 3VRF A; 1YEN B; 2LH3 A; 3NMM A; 4HSX A; 3UHX A; 4YU4 A; 3WCU C; 1DXT A; 1DWS A; 2GNW A; 1YOG A; 1NEJ B; 2ZS1 B; 3VAU A; 1A0U A; 1ABY A; 3QJB B; 1YIE A; 1OUT B; 3OZW A; 2D5Z B; 1J40 B; 1NIH A; 2OIF A; 1MLR A; 4PNJ A; 1DXV A; 2D2N B; 3WTG A; 1YEV A; 3HHB A; 4G1B A; 2NSS A; 1M9P A; 3WCV C; 4MQH A; 3BCQ B; 1Y4G B; 3A0G A; 4L2M A; 3S65 B; 2LH7 A; 2ZS1 D; 2QU0 B; 3TM9 A; 1ECD A; 1XYE B; 1YIH A; 3QZZ A; 1CH2 A; 2H8D A; 1O1K B; 3ZJO A; 1DO7 A; 4HHB A; 1IBE A; 4MQG A; 3OGB A; 4NXC A; 1THB B; 1Y5K A; 1Y0W A; 2JHO A; 3D7O A; 2HBE B; 3GLN A; 3E55 A; 3GKV B; 3M3B A; 1LA6 A; 1BJE A; 3G4U A; 1A01 A; 3RJ6 A; 2ZSY A; 3B75 B; 3BOM B; 2ZT1 A; 3S1J A; 3WCU A; 1DXU B; 1Y8W B; 2H8F B; 5KDQ B; 1UMO A; 1YHU B; 2MYE A; 3EOK B; 2BK9 A; 1QI8 B; 5SW7 B; 3BJ1 A; 1COH B; 3GQP B; 3V2Z A; 3ZJR A; 2BLJ M; 1I3D A; 1BZ0 B; 1ECO A; 1A00 B; 2VHB A; 4ROM B; 3W4U A; 1JDO A; 2V1H A; 2PEG B; 3WCV A; 2O5Q X; 2HBC B; 2FRI X; 1CP5 A; 3OO4 A; 1BBB A; 1K1K B; 1XY0 B; 1YHU D; 2LH2 A; 5ILP A; 1HV4 B; 3GDJ B; 3UHQ A; 1YE2 B; 3SZK B; 3UH3 A; 1FAW A; 5MBA A; 1GDI A; 1JP6 A; 2BLI A; 4NI0 B; 1HHO A; 1BZZ A; 1MNI A; 1XXT B; 1Y4Q A; 2GLN A; 1QXE B; 1UX8 A; 2MHB B; 2QSP B; 3G46 A; 5C6E A; 2LH5 A; 1YH9 B; 4MQK B; 1SPE A; 2Z6N B; 3MJP A; 3MVC A; 1VRF A; 3HRW A; 1Y45 B; 1NZ4 A; 3DUT B; 3LHB A; 1OFK A; 1JW8 A; 3WFU A; 1O1L B; 3G53 A; 2O5M X; 2G0X A; 1DLY A; 2ZFO C; 3QMA A; 3NL7 A; 1JP8 A; 1Y4F B; 1Y5J B; 1FDH G; 2V1E A; 3H58 A; 1MNK A; 1G08 A; 1HCO B; 3KUO A; 4PQ6 A; 3RGK A; 3UBV A; 1ASH A; 1BUW B; 1NS9 A; 2YRS B; 111M A; 2D6C A; 3LQD A; 4MQJ A; 4F6D A; 3ONZ B; 3KMF A; 1Y85 A; 1IRD A; 1AJ9 B; 3UGY A; 1V75 A; 1QXD B; 1S61 A; 2OLP A; 2HBD B; 1V5H A; 1XZU A; 2R1H A; 2GRF A; 3UBC A; 2ZS0 B; 1F5O A; 3E5O A; 1A0Z A; 1S5X B; 1N9I A; 1M6M A; 1QSH B; 3OZU A; 1HLM A; 2RI4 B; 3PEL A; 1MNH A; 4L7Y A; 3E5I A; 5HLX A; 4F4O B; 1DO1 A; 3QQQ A; 2DHB A; 2ZFO A; 1Y0D B; 5IKS A; 2QMB B; 1O1P A; 1W92 A; 1XZ4 B; 1A3O A; 1BZR A; 3K9Z A; 1Y8H B; 3CIU B; 2ZS0 D; 1OFJ A; 1DO3 A; 1HDS B; 5EYJ A; 1Y4R A; 4MQI A; 1C7D B; 3ZOM A; 1CLS B; 3BJ3 B; 5EE4 C; 2BLH A; 1BZ1 B; 1CO8 A; 4B4Y A; 1Y09 B; 3CY5 B; 1HBB A; 2VYW A; 1SDK B; 1NZ5 A; 1J52 A; 1EWA A; 3AT6 B; 5HLQ A; 2HBF A; 1VRE A; 1K0Y A; 3LB1 A; 1Y4V A; 2ZT4 A; 3IXF A; 1Y22 B; 2MYD A; 2HCO B; 1GZX B; 1MBD A; 1LFZ A; 3ARJ A; 4KJT A; 1NQP A; 2RAO A; 2G3H A; 3EDA A; 2O5L X; 5F0B A; 1HBH A; 1X9F C; 3PI3 A; 4M4B A; 1N9F A; 1IWH A; 1YMC A; 4TYX A; 1MWC A; 3ZJM A; 1OR4 A; 3WR1 B; 1YDZ B; 2R4Z A; 1YMB A; 3GYS B; 1Y0T B; 1YEU B; 1RQ4 B; 1A6N A; 112M A; 6HBI A; 2ZLT A; 1LFQ A; 4FH6 A; 4G51 B; 4HRT B; 1GBU A; 3ZJH A; 5HBI A; 2OHB A; 3ODQ A; 1GCW B; 3EU1 B; 2O5T X; 1YVT B; 3FS4 A; 3ZJN A; 3HEN A; 1XZ2 A; 1XQ5 A; 3UHC A; 1LUE A; 4OOD A; 3VRG B; 1QPW B; 5EU2 A; 2W31 A; 3AQ6 A; 4U8U B; 1YMA A; 3GQG A; 1MKO A; 4FC3 A; 3ZJL A; 2QFK A; 1G0B B; 1MLO A; 2MGD A; 3UHD A; 2Z85 A; 3MJU A; 1O16 A; 1X9F A; 3ECZ A; 5ILM A; 1WMU A; 1MWB A; 4ROL B; 2ZFB B; 4YU3 B; 1SDL B; 1CH1 A; 4U8U D; 1YEO A; 2D5X B; 1NGK A; 1MLH A; 4N7N A; 4ESA B; 3P5Q A; 1U7S A; 3HYU A; 4HBI A; 110M A; 1Y01 B; 2B7H A; 3S66 B; 4ODC B; 1YFF A; 1KR7 A; 1Y2Z A; 1Y4B A; 2DN3 B; 3QJE A; 5CN8 A; 1XZ7 B; 4MAX A; 1DUK A; 5CNF A; 1R1X B; 1MOC A; 2SPL A; 4N7O A; 2ZST A; 3OVU C; 2MGM A; 3R5I A; 1T1N A; 2GTL B; 1EW6 A; 1UIW A; 4IRO A; 4O4T A; 1MGN A; 1MLK A; 1MNJ A; 2W72 B; 104M A; 3WHM B; 3VRF B; 3K8B A; 1NXF A; 3NMM B; 2XYK A; 1X3K A; 4YU4 B; 1RVW A; 1DXT B; 2NRL A; 1JZM A; 1A0U B; 4KMW A; 1LH2 A; 3FH9 A; 2MBW A; 3DHR A; 3WFW A; 1YIE B; 6HBW A; 2ZSR A; 1CG8 B; 1MYZ A; 2GTL D; 5JOM A; 1MTK A; 105M A; 5HU6 A; 2G11 A; 3HHB B; 1M9P B; 4WJG 1; 4MQH B; 3A0G B; 3UHI A; 1EMY A; 1IDR A; 1LHT A; 2G0Z A; 2DN2 A; 2FRJ X; 1YIH B; 2H8D B; 3UH6 A; 5CHQ A; 4HHB B; 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1OJ6 A; 2D2M C; 1MYM A; 1XZU B; 2R1H B; 1HBG A; 2MGK A; 1A0Z B; 1A4F A; 2G14 A; 1B86 A; 2G10 A; 5KER A; 4L7Y B; 1DXD A; 2DHB B; 2ZFO B; 2V1I A; 4NI1 A; 2GL3 A; 1O1P B; 1A3O B; 2G0V A; 2HBS B; 4MU5 A; 1A6M A; 5EUI A; 2D2N C; 5CNE A; 4MQI B; 1HAC A; 1DLW A; 1YHR A; 1HDA B; 2ZFO D; 1S56 A; 1HBB B; 2FAM A; 2IN4 A; 2VEE A; 2HBF B; 3AT5 A; 1YGD B; 1CBL A; 3HXN B; 1K0Y B; 3G52 A; 4NK1 A; 1JF3 A; 5HY8 A; 1U7R A; 5CN5 A; 1F63 A; 1Y4V B; 2D2M A; 3A2G A; 3DR9 A; 1MYI A; 1VWT A; 1LFZ B; 1TES A; 2ZSX A; 1DXC A; 1ITH A; 4TWV A; 3ZJS A; 4B3W A; 3UHN A; 1Y4P A; 2RAO B; 5E29 A; 1DTI A; 1DWR A; 1J7Y B; 1HBH B; 4M4B B; 1GDJ A; 2AUO A; 3QJB A; 1R1Y A; 1IWH B; 1YE0 A; 1Y8I A; 2QLS A; 1J3Z A; 5EQM A; 4DWT A; 2ZSQ A; 1LFY A; 3M39 A; 2D2N A; 1WLA A; 5EV5 A; 1MYT A; 2ZSZ A; 2ZLT B; 1F5P A; 1LFQ B; 2R50 A; 4F6B A; 3MYM A; 1MZ0 A; 5CMV A; 3UGZ A; 1HBR B; 1HGA A; 4ZVB A; 1VXC A; 3ODQ B; 1RPS A; 1C7C A; 1VXA A; 3FS4 B; 1GCV A; 1XZ2 B; 2HHE B; 2GDM A; 2HBE A; 1YCA A; 5EE4 D; 2AUQ A; 1UT0 A; 3O89 A; 3GQG B; 1MKO B; 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