The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
57
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sequence length |
141
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structure length |
141
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Chain Sequence |
VLSPADKTNVKAAWGKVGAHAGEYGAEALERMFLSFPTTKTYFPHFDLSHGSAQVKGHGKKVADALTNAVAHVDDMPNALSALSDLHAHKLRVDPVNFKLLSHCLLVTLAAHLPAEFTPAVHASLDKFLASVSTVLTSKYR
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
The high salt (phosphate) crystal structure of CO Hemoglobin E (Glu26Lys) at physiological pH (pH 7.35)
rcsb |
| molecule tags |
Transport protein
|
| source organism |
Homo sapiens
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| molecule keywords |
Hemoglobin alpha chain
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| total genus |
57
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| structure length |
141
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| sequence length |
141
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2005-02-16 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 4MQG B; 1ABY A; 3GKV A; 1BBB A; 1CIO A; 2HBS A; 4MQG A; 4ODC A; 1JY7 B; 1O1J B; 1S5Y B; 3ZJH A; 1A4F A; 1VXF A; 1YEO A; 3K3U A; 3WFX A; 2MGG A; 1IRD B; 1RQA A; 1S56 A; 5CN7 A; 1JY7 A; 1O1J A; 1X9F D; 1S5Y A; 4JAC A; 1BAB A; 1IRD A; 2G3H A; 2HHD A; 1OJ6 A; 6HBI A; 3D1A B; 1YMB A; 4N7O B; 4H07 A; 1JDO A; 3ZH0 A; 1MOH A; 1Y5J A; 3D1A A; 5HY8 A; 4N7O A; 2SPO A; 3LQD B; 2MGB A; 1CP5 A; 2O5B X; 111M A; 2BLJ M; 3SDN A; 2H35 B; 2VEB A; 1GDJ A; 1JL6 A; 1JEB B; 5EE4 C; 3U3E A; 4F6G A; 5EV5 A; 5HU6 B; 3QM7 A; 1OR6 A; 3E5I A; 1SPE A; 2GRF A; 1YEQ A; 1Y01 B; 1HBS B; 1DKE B; 5HLX A; 1Y4F A; 1J3F A; 1XYE B; 3DUT B; 1F5P A; 1O1O A; 3DUT A; 1J40 B; 4FC3 A; 4NI0 B; 1J7S A; 3S66 B; 112M A; 3ONZ B; 4O2G A; 3GDJ B; 1KFR A; 6HBW B; 3OZW A; 1HBG A; 1LH1 A; 2QU0 B; 4NXC A; 3GQG B; 2WY4 A; 6HBW A; 5ILR A; 3MVC A; 2AUQ A; 2QU0 A; 2H8D B; 1Y7D B; 3GQR A; 2AA1 B; 2Z85 A; 5E83 B; 1BVC A; 3ED9 A; 1SPG B; 3WCT A; 1M9P B; 2D5X A; 1YG5 B; 1LFY A; 2AA1 A; 1GCV B; 1UIW B; 5E83 A; 3MJP B; 3S65 B; 1SPG A; 2ZLU B; 1M9P A; 1YG5 A; 4NS2 A; 2QFN A; 1UIW A; 3MJP A; 3S65 A; 3OO4 B; 4NI1 A; 2DXM B; 4N7P B; 1Y7C A; 1T1N A; 2PEG B; 2DXM A; 2MHB B; 1G09 A; 2MGJ A; 3G4V A; 4N7P A; 5CHR A; 1CG5 B; 1MLN A; 2MHB A; 2ZWJ A; 5C6E B; 2NSR A; 1CG5 A; 3HYU B; 1GVH A; 3HYU A; 3UHR A; 1NQP B; 2V1E A; 1VXC A; 2QFK A; 101M A; 1UMO A; 3QMA A; 1KD2 B; 1LH2 A; 1DXU A; 2G12 A; 1KD2 A; 1O1I A; 1VXD A; 1URV A; 2PGH B; 3VHB A; 1V4U B; 1Y2Z B; 4N8T B; 1A3O B; 1O1K B; 1B86 B; 2ZFO B; 3HHB B; 1Y2Z A; 5HLU A; 1H1X A; 1Y22 A; 1AZI A; 3QJE B; 1OUU B; 3HHB A; 1A0Z B; 1LFV B; 2MGH A; 5CN5 A; 1A0Z A; 1THB B; 3BJ2 A; 1LFV A; 2IG3 A; 108M A; 4U8U C; 3WCW B; 1VXE A; 3UHV A; 3NFE A; 5JDO C; 2W6Y A; 3WCT D; 3WCW A; 1Z8U B; 2R4X A; 1DO1 A; 2QLS B; 3D1K B; 2GNW A; 3ZOL A; 1LFT B; 3IXF A; 4OF9 A; 1HRM A; 2RI4 A; 2HBC B; 2D2M C; 3UGZ A; 1Y45 A; 3TLD A; 2B7H B; 2HBC A; 5EYS A; 3VRG B; 1IWH B; 1RPS A; 1RQ4 B; 2B7H A; 4PQC A; 2LH5 A; 3WHM B; 1IWH A; 1FAW B; 2ZLV B; 1RQ4 A; 3PI2 A; 4MXK A; 1J3Y B; 1G0A B; 1NIH B; 2VM0 A; 1YGF B; 1YHU A; 106M A; 1A6K A; 1FAW A; 2ZLX B; 1QI8 B; 1XY0 B; 4L2M A; 1G0A A; 2OLP A; 1V4W A; 2GDM A; 1XY0 A; 3UBV A; 1RTX A; 4SDH A; 1MTI A; 1HLM A; 1IBE B; 2GLN A; 2VLZ A; 5EET A; 1S5X B; 1CH2 A; 1IBE A; 1HHO B; 4MU5 A; 1ASH A; 2KSC A; 1S5X A; 1C40 B; 1MBO A; 3LR7 A; 1QXD B; 1YIH B; 3LR9 A; 1GBU B; 4F4O B; 3QQR A; 1ABW A; 1QXD A; 1MZ0 A; 1YIH A; 1GBU A; 1CMY A; 1J41 A; 2Z8A A; 2OH9 A; 2LH6 A; 4FH6 A; 1YHR B; 2G0V A; 1HGB B; 2W6V A; 1O1M B; 1YHR A; 1NEJ A; 7HBI A; 2ZSN A; 5ILP A; 3AQ7 A; 1HGB A; 1OR4 A; 1O1M A; 2SPM A; 2V1K A; 1MTJ A; 2ZSY A; 1YEV A; 3AT6 B; 2LH2 A; 3UHW A; 1CQ2 A; 1S0H B; 3AT6 A; 4U8U D; 1Y0A B; 2HBG A; 2QSP B; 1MLJ A; 5JDO D; 3MKB B; 1CH3 A; 2QSP A; 1BZZ B; 3G52 A; 2ZT3 A; 5SW7 A; 4MPM A; 3MKB A; 2MGC A; 2R4Z A; 2ZLT A; 1WVP A; 4M4B A; 2MYA A; 3CY5 B; 2C0K A; 1YHU D; 2Z6T A; 4PQB A; 1EWA A; 3G53 A; 2BKM A; 2EKT A; 3MJU B; 2BWH A; 3DHR B; 4WJG A; 1JP9 A; 5CMV A; 2BK9 A; 1A6N A; 1MBI A; 3S48 C; 2IN4 A; 2G0R A; 1FDH G; 1A9W A; 1YCA A; 1Y8H B; 2OHA A; 1HV4 B; 4WCH D; 2DC3 A; 1MOC A; 3BJ1 A; 1Y8H A; 2ZS1 B; 1HV4 A; 4IRO A; 4ESA B; 3QM5 A; 1Y0T B; 1Y4R A; 1LTW A; 2W6X A; 4ESA A; 2EB9 A; 1L2K A; 1CG8 B; 3HEN A; 3MYN A; 5CNC A; 1Q1F A; 1S69 A; 1LHS A; 1GBV B; 4H2L B; 3KMF C; 2HBF B; 1CG8 A; 1O1L B; 1JF3 A; 2ZT0 A; 3UHK A; 1XZU B; 2HBF A; 1DWR A; 3ZHW A; 1X9F B; 1XZU A; 1MBA A; 3ZJS A; 1X3K A; 3NL7 A; 1MYF A; 3WCP B; 1MKO A; 107M A; 3UHQ A; 4ROL B; 1GZX B; 3GOU B; 2GTL C; 1YFF A; 3KMF A; 5E29 B; 2NRL A; 3G4Y A; 4ROL A; 1GZX A; 3GOU A; 3A5A A; 3OZU A; 1FSX B; 2V1J A; 1BVD A; 5E29 A; 1V07 A; 3P5Q B; 1NS9 A; 2HCO B; 1FSX A; 3P5Q A; 2ZS0 C; 2YRS B; 1FCS A; 3O89 A; 3LB1 A; 3WCU C; 1Y4V B; 2AUP A; 1CH5 A; 1XXT B; 1QXE B; 4KMV A; 1Y8I B; 2YRS A; 1Y0D B; 4FWY A; 5CN9 A; 5C6Y A; 2BW9 M; 1QXE A; 4WJG 1; 3AT5 A; 3WCV C; 3UHB A; 3AQ5 A; 3QZX A; 4YU4 B; 3M39 A; 2ZS0 A; 4ILZ A; 2EVK A; 1BUW B; 2O5O X; 2D60 B; 1NXF A; 1BUW A; 1DWS A; 3QJB B; 3GQP B; 2D60 A; 2GRH A; 1R1Y B; 4HRR B; 2W72 B; 3EDB A; 3GQP A; 1Y4B B; 5M3S A; 4HRR A; 5KDQ A; 1Y8K B; 3KUO A; 4O4Z A; 1ABY B; 1MOA A; 1VXH A; 3GKV B; 1C7B B; 2EKU A; 2HBS B; 3HXN B; 1LHT A; 3NML A; 4ODC B; 1C7B A; 2ZST A; 4UZV A; 1A4F B; 2HHE B; 3HXN A; 1YEO B; 1HBI A; 1N9X A; 1NPG A; 1RQA B; 3UHN A; 1BZP A; 2VRY A; 3ARJ A; 1JZL A; 4ZVA A; 1COH B; 1BAB B; 2HHE A; 1IDR A; 3UHE A; 5CN4 A; 1COH A; 2HHD B; 2HBE A; 1HBB B; 1YOH A; 1YZI A; 3VRE A; 1I3E A; 1HBB A; 1UX8 A; 1Y5J B; 1DO3 A; 5HY8 B; 1YEN A; 4C0N A; 2VYW A; 2D5Z A; 5EUI B; 5CHQ A; 4F6J A; 2M6Z A; 3UH3 A; 2HZ2 A; 2D2N C; 5EUI A; 1MLL A; 1CH1 A; 2ZS0 D; 1YEQ B; 3UHS A; 3UBC A; 3OGB A; 3WCU D; 1BZR A; 1EMY A; 1Y5K A; 1Y4F B; 1F5O A; 2ZT2 A; 1UFJ A; 2Z6N B; 3MBA A; 1LFZ B; 3WCV D; 2DN2 A; 4F6D A; 4F6I A; 1O1O B; 4G1B A; 4FC3 B; 2ZSS A; 1J7S B; 4MQI A; 2Z6N A; 1MTK A; 1LFZ A; 3UHC A; 1MYH A; 2MGA A; 1SDK B; 4QAU A; 1J3Z B; 103M A; 1SDK A; 1BZ0 A; 3K8B B; 4F69 A; 2AUR A; 1C7D A; 4PQ6 A; 1LA6 B; 1Y85 A; 1J3Z A; 4MQK B; 3GQR B; 1GDK A; 3K8B A; 2FRF A; 2NX0 A; 1LA6 A; 3WCT B; 3PIA A; 2MBW A; 2D5X B; 4MQK A; 1LFY B; 2RAO A; 4DWU A; 1XZ5 B; 4FH7 A; 1PMB A; 1Y4P A; 5EOH A; 1V4X A; 1XZ5 A; 2EVP A; 1PBX A; 4NI1 B; 3QM6 A; 5ILM A; 1UC3 A; 4NK1 A; 1SI4 A; 1Y7C B; 1T1N B; 2XKI A; 1HDB B; 1G09 B; 1HDB A; 1Y5F B; 4JYQ A; 2R4W A; 1DO4 A; 4XS0 A; 1Y5F A; 4TWU A; 1NZ5 A; 4YU3 A; 3HEP A; 4KMW A; 1OFJ A; 2SPL A; 3UHX A; 1GJN A; 4G1V A; 2V1H A; 3PT7 A; 1MBS A; 1DXU B; 1Y83 B; 3W4U B; 2ZSZ A; 1O1I B; 4HRT A; 3UH5 A; 3PI9 A; 1NS6 B; 1BJE A; 1Y83 A; 3W4U A; 2D2N D; 3V2V A; 1EBT A; 1NS6 A; 2E2Y A; 5EE4 D; 1MOB A; 1Y22 B; 3ZJM A; 4H0B A; 3UHU A; 2ZFO C; 1SHR B; 4F6B A; 2VLY A; 3BJ2 B; 1MCY A; 1GCW B; 1SHR A; 3VRF A; 1RVW A; 1XZV B; 3NFE B; 1GCW A; 3AQ9 A; 4MQC B; 1XZV A; 1YE0 A; 2O5L X; 4MQC A; 2R1H B; 1MLG A; 3GK9 A; 3RJN B; 4DC8 A; 4G51 B; 2R1H A; 1A9W E; 1HJT A; 1MWB A; 4U8U B; 2RI4 B; 1MBC A; 4G51 A; 4U8U A; 1Y45 B; 2Z6S A; 1IOP A; 1DXD A; 4UIQ A; 1LFQ B; 1QSI B; 1RPS B; 5AZQ A; 3G4R A; 3IC0 A; 1FLP A; 2ZSQ A; 3A5B A; 4AVD A; 1LFQ A; 1QSI A; 1KR7 A; 3EU1 B; 1YIE A; 3NG6 B; 1YHU B; 1VHB A; 2BLH A; 1A00 B; 3EU1 A; 3NG6 A; 2O5Q X; 1V4W B; 1ITH A; 3B75 A; 1A00 A; 2D2M A; 1CBM A; 2G0X A; 1MNO A; 1SWM A; 3PI3 A; 4UUR A; 1HGA A; 5CN6 A; 1N9H A; 1M6C A; 1ABW B; 1NZ4 A; 3ZJQ A; 3AQ6 A; 1ECN A; 1XZ4 B; 3AG0 A; 1CMY B; 1J41 B; 3VAU A; 2ZSO A; 1LUE A; 1XZ4 A; 3QQQ A; 1DUK A; 5F2A A; 3TM9 A; 5EYJ A; 2W6V B; 2G0Z A; 1JZK A; 2O5M X; 4TYX A; 1NEJ B; 1GLI A; 1A01 A; 3WFT A; 3ZJN A; 102M A; 2WTH A; 3E4N A; 5AB8 A; 1YEV B; 1R1X A; 2GRZ A; 1CH4 A; 5EQM A; 1UX9 A; 3ZJL A; 1NZ3 A; 2NSS A; 4L7Y B; 1HBR B; 1ECO A; 1MYI A; 2MB5 A; 3NMM A; 4L7Y A; 1HBR A; 1MLU A; 2HZ3 A; 1DXV A; 5SW7 B; 2ZLT B; 3MYM A; 1Y7G A; 4M4B B; 1MYT A; 3DR9 A; 4B3W A; 3ARL A; 3EOK B; 2XKG A; 1HCO B; 3PEL B; 1YE2 A; 3EOK A; 4HBI A; 4OOD A; 1HCO A; 2D2M D; 3PEL A; 1AJ9 B; 5KKK A; 3IC2 B; 4B4Y A; 5D5R A; 1AJ9 A; 2DN3 A; 3WR1 A; 2V1I A; 3IC2 A; 2GKM A; 1K1K A; 3BJ3 B; 4N7N B; 5CND A; 1MLK A; 1MBD A; 4MAX A; 3BJ3 A; 2FRI X; 3BJ1 B; 4N7N A; 2LH1 A; 1CLS B; 1S61 A; 3ASE A; 3G46 A; 3E5O A; 4IRO B; 4MQJ A; 1CLS A; 1Y4R B; 1TU9 A; 3QJD B; 1FHJ A; 2W31 A; 1BIJ A; 1IT3 A; 1OFK A; 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1HAC A; 5KER A; 3UHI A; 1YZI B; 2MGK A; 2ZSR A; 3VRE B; 1RSE A; 1YEN B; 2OH8 A; 1JZM A; 5JGG B; 1Y31 B; 3WFU A; 1DTM A; 1M6M A; 2D5Z B; 4HSX A; 2M6Z B; 5JGG A; 1Y31 A; 1BZ6 A; 2GTL D; 1GDI A; 1AJG A; 2VYZ A; 4MBA A; 2GL3 A; 2ZSP A; 3ECX A; 4O1T A; 1Y5K B; 1LH7 A; 2D2N B; 1LFL B; 3LQD A; 1Y35 B; 2DN2 B; 1U7R A; 1G0B B; 2ZT4 A; 3ZJR A; 1FSL A; 2D2N A; 2H35 A; 1LFL A; 4MQI B; 3BA2 A; 1MDN A; 5JDO E; 4PNJ A; 1Y35 A; 3LB4 A; 1RQ3 B; 1G0B A; 5B85 A; 5IKS A; 1JEB A; 3FH9 B; 5HU6 A; 1RQ3 A; 4LPI A; 3D7O B; 1MWC A; 4NXA A; 3FH9 A; 2BMM A; 1BZ0 B; 1H97 A; 1C7D B; 3D7O A; 1Y85 B; 1CQX A; 1VWT B; 2FRJ X; 1HAB B; 1MYG A; 2ZSX A; 3ARK A; 1MOD A; 3PIA B; 5CNG A; 1VWT A; 2RAO B; 1HBS A; 1DKE A; 1HAB A; 1XYE A; 1Y4P B; 3WCT C; 1IRC A; 1HBH B; 3HEO A; 1YHE B; 1V4X B; 1J40 A; 2HZ1 A; 1PBX B; 4NI0 A; 2MGI A; 3S66 A; 1HBH A; 1MLR A; 3R0G A; 1V9Q A; 1YHE A; 1A6G A; 1CH9 A; 1SI4 B; 1YCB A; 3DHT B; 3ONZ A; 2VYY A; 3GDJ A; 3H58 A; 1Y09 B; 5ILE A; 3DHT A; 1XZ2 B; 3GQG A; 1Y09 A; 3A9M A; 2H8D A; 1XZ2 A; 2OHB A; 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