The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
58
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sequence length |
146
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structure length |
146
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Chain Sequence |
VHLTPEEKSAVTALWGKVNVDEVGGKALGRLLVVYPWTQRFFESFGDLSTPDAVMGNPKVKAHGKKVLGAFSDGLAHLDNLKGTFATLSELHCDKLHVDPENFRLLGNVLVCVLAHHFGKEFTPPVQAAYQKVVAGVANALAHKYH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
The high salt (phosphate) crystal structure of CO Hemoglobin E (Glu26Lys) at physiological pH (pH 7.35)
rcsb |
| molecule tags |
Transport protein
|
| source organism |
Homo sapiens
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| molecule keywords |
Hemoglobin alpha chain
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| total genus |
58
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| structure length |
146
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| sequence length |
146
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2005-02-16 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| B | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1YEO B; 2Z6N B; 1J40 B; 4KJT A; 4O1T A; 1HGB B; 3TM9 A; 1JZK A; 4DWT A; 3AQ9 A; 1V9Q A; 5E83 B; 3LB4 A; 1MYM A; 2HBF B; 4C0N A; 1CG8 A; 1O1M A; 2B7H B; 1MTI A; 1MBA A; 2IN4 A; 1VXH A; 3BJ2 B; 3SDH A; 1GCW A; 1O1J A; 1HBH B; 2HHD A; 3KMF A; 2D2N D; 3WCW C; 2W72 B; 4XS0 A; 1RSE A; 3TLD A; 1HRM A; 1SPG A; 1UX9 A; 1C7D A; 2ZLX B; 1GVH A; 1RPS B; 1G0B A; 3MYM A; 3PIA A; 1J3Y B; 2XYK A; 4NI0 A; 3NFE B; 2MYA A; 1WVP A; 3UHX A; 1GZX A; 3WR1 B; 1MLJ A; 2NX0 A; 1LH5 A; 2O5S X; 1K0Y B; 2OH9 A; 4N8T B; 1YVQ B; 1G09 B; 1GCV B; 2LH5 A; 4U8U A; 4L2M A; 1YOH A; 5EQM A; 3V2V A; 1GBU B; 2QSS B; 5ILR A; 1MNI A; 3GK9 A; 1UIW A; 2GNV A; 2HCO A; 4MQH B; 1LTW A; 3HEP A; 3WFT A; 1U7R A; 1DWT A; 2ZLV A; 3O7N A; 1V4W B; 1T1N B; 3EDB A; 1NIH A; 1S6A A; 1Y7C A; 2D2N B; 3ZJR A; 2LH1 A; 2JHO A; 4G1B A; 3AT6 B; 2LHB A; 3WCT C; 1SI4 A; 2FRF A; 3HHB B; 4XDI A; 3UH3 A; 1CBM A; 1LHT A; 1G0A A; 3ZJM A; 2BLH A; 2QFN A; 3QJD B; 3OO5 A; 2OIF A; 3ARJ A; 3D1K B; 5F2A A; 3UH7 A; 2MYD A; 4MQC B; 3ZH0 A; 1LFL A; 1J41 B; 1XZ2 A; 1DUK A; 2YRS B; 1YMA A; 3BJ1 B; 3ONZ B; 3QM8 A; 2ZSQ A; 1YEQ B; 2GRZ A; 4KN3 A; 1BZP A; 3ODQ B; 2Z85 A; 4FWX A; 2HZ3 A; 1Y4P A; 1UC3 A; 2BLI A; 3UHZ A; 3GQG B; 2QSP B; 1MZ0 A; 2ZT2 A; 3AT5 B; 3BJ3 A; 4G51 A; 2HBC A; 3QQR A; 1CH3 A; 3A59 A; 3SZK B; 2ZSS A; 1Y7G A; 3TM3 A; 1CO9 A; 1RTX A; 2BMM A; 3LB2 A; 1NGK A; 4YU4 A; 1O1N A; 1QSH B; 1LJW A; 2QU0 B; 4ILZ A; 3SDN A; 1HSY A; 1WMU B; 3GQR A; 2AA1 B; 1J7Y B; 2MGH A; 1Y4G B; 2BW9 M; 1Y0A A; 1LHS A; 4N7P A; 1HV4 A; 4ESA B; 6HBW B; 3WCT A; 1A0Z A; 3HF4 B; 1Y7Z B; 1GDL A; 4F6I A; 3QJE A; 2HBS B; 1NS6 B; 1MOA A; 2ZSP A; 1MLU A; 1ABW A; 2G0S A; 1MDN A; 1LH6 A; 4NI1 B; 1FSX A; 1UT0 A; 1Y5F B; 1DXT A; 3H57 A; 1XZ4 A; 3PI2 A; 4AVE A; 2BLJ M; 3PEL B; 1G08 B; 2ZSX A; 1Y4R B; 2D2M D; 2G0V A; 4JYQ A; 1QXE B; 1V4U A; 3QM5 A; 1CIO A; 3A9M A; 1YIH A; 2ZS0 C; 1R1X B; 1C7C A; 3ECZ A; 4PNJ A; 2DN2 B; 2SPM A; 2QRW A; 2DN1 A; 4DC7 A; 4OF9 A; 1BVD A; 4M4B A; 3IC0 B; 1VWT A; 3QJC B; 2MHB A; 1A3N B; 2VHB A; 1M9P A; 1RQ3 B; 3H58 A; 1GJN A; 2W72 C; 1HDA B; 4ROL A; 2ZLT A; 1DXV B; 1JW8 A; 1Y22 A; 1HHO B; 1MYG A; 1HGC A; 2ZLU A; 3QZZ A; 4HRR A; 3FS4 A; 3MBA A; 5E29 A; 4MQG A; 1NQP B; 1O1P A; 5CNF A; 5EYJ A; 1S5Y B; 1YHE B; 1N9H A; 1IBE A; 2D60 B; 1O1K A; 1JL6 A; 4HBI A; 2OHA A; 1AJ9 B; 1YEN B; 1R1Y B; 110M A; 1LA6 A; 2D2M B; 1LFY B; 3HEO A; 1YE0 A; 1IWH B; 1VXG A; 1J40 A; 1VXE A; 1RVW B; 3ZJI A; 1MYI A; 3AQ6 A; 1MOB A; 1KD2 B; 1COH B; 3D1A A; 1MLM A; 5KER A; 4O4Z A; 4MXK A; 1GDI A; 3ZJO A; 2ZS0 A; 3ECX A; 1Y4B A; 3S1J A; 2D2N C; 2W31 A; 1CP0 A; 1DXU B; 1XZV B; 5SW7 A; 1OFJ A; 109M A; 103M A; 1Y0W B; 1RQ4 B; 1X9F A; 1Y8W A; 1VXF A; 3PI9 B; 1HAC A; 1FN3 A; 1LH2 A; 1CMY A; 3PI3 A; 2PGH A; 1MWC A; 5B85 A; 5EUI A; 1C40 B; 3S1I A; 3AQ8 A; 4N7N B; 1YIE B; 1YEU A; 3S65 B; 2MGK A; 2AUR A; 2R80 A; 1BZ1 B; 1NZ2 A; 3IA3 B; 3UHI A; 1HBB B; 3UHV A; 3ARK A; 3IXF A; 2WTH A; 1LFT B; 1K0Y A; 1MBO A; 2VEE A; 1G9V A; 1LH7 A; 1QI8 B; 2ZLW B; 1FDH A; 106M A; 3G4V A; 3KUO A; 3OZV A; 5JDO E; 1Y8I B; 1Y35 A; 5CN9 A; 3WCP B; 1CG5 B; 1AJH A; 3UI0 A; 2AV3 A; 2H35 A; 2ZS1 A; 1A4F B; 2GTL D; 3PI8 B; 1YGF A; 2CMM A; 1A01 B; 4L7Y A; 3EOK A; 3UBV A; 1Y31 A; 3NG6 B; 1MOC A; 2H8D A; 3EDA A; 1FHJ B; 1XZU B; 1YE2 A; 1BJE A; 1DLY A; 1YVT A; 4X0L B; 1YMB A; 2GDM A; 1LFQ B; 3IC2 A; 3D1K A; 3LR9 A; 2R4Z A; 2FRK X; 1VXA A; 1X3K A; 4MXL A; 1GLI A; 2LH3 A; 1NEJ A; 1XYE B; 3WTG A; 1VXC A; 2EKU A; 1HDS A; 2YRS A; 2RAO B; 1JY7 B; 5JDO D; 1BZ0 B; 1YEQ A; 2DHB A; 3B75 B; 4FC3 A; 1JP9 A; 3M39 A; 1ECN A; 1L2K A; 3GKV B; 5ILE A; 1IOP A; 3WHM B; 1LFV A; 5EE4 D; 1DLW A; 2W6W A; 1YGD A; 1XQ5 B; 1BVC A; 5JGG B; 4B3W A; 2FRJ X; 1YH9 A; 1NWI A; 2HHE B; 5HLU A; 2DN3 B; 4TWU A; 1Y4V A; 3BCQ B; 2GTL B; 1A9W E; 4HRT B; 3HXN B; 1NS9 B; 3D4X A; 5E6E B; 2O58 X; 1FAW B; 1DO3 A; 3BOM B; 3UH6 A; 2MGA A; 2XKH A; 3MJU A; 1MTK A; 1HBR B; 1SHR B; 6HBI A; 4M4A B; 4F4O A; 3MKB A; 3HF4 A; 3K3U A; 5C6E A; 1D8U A; 1B86 A; 3R5I A; 4MAX A; 3UHN A; 3W4U A; 3FH9 B; 4WCH D; 5ILM A; 4IRO B; 1JDO A; 3ZJQ A; 1XY0 B; 2XKG A; 2HBD B; 2ZT0 A; 3GDJ A; 1OR6 A; 1QXE A; 5CNB A; 1V4X B; 3HRW B; 1MLQ A; 4WJG A; 1Y4Q B; 3A5G A; 1RTE A; 3S48 C; 2ZFO D; 3CIU B; 4HSX A; 4B4Y A; 1AZI A; 1BBB B; 3O89 A; 1PBX A; 3G46 A; 5CMV A; 1Y09 A; 2V1J A; 2MYE A; 3UGY A; 3G52 A; 3WCU D; 1CLS B; 3DHT B; 4KMW A; 3LQD B; 1HLM A; 2XKI A; 1O1L B; 2DXM B; 1HHO A; 1V75 A; 1Y85 B; 1O1O B; 4IT8 A; 1UFJ A; 1A6K A; 2ZST A; 4FH7 A; 1MNO A; 2D5Z A; 3PT7 B; 5CNG A; 1XXT A; 1A3O A; 5EOH A; 1YG5 B; 2MGE A; 4G1V A; 1UMO A; 5KDQ A; 1HDB B; 1BZZ A; 2MGI A; 1QSI B; 1RQA B; 2D60 A; 1DUO A; 4N7O A; 5HLQ A; 1J7W B; 3MJP A; 3PI4 A; 4ROM A; 3GYS B; 3S66 B; 3LB3 A; 2LH7 A; 1CQ2 A; 1NWN A; 1IRC A; 1Y8K A; 1YEN A; 5CNE A; 1Y5J A; 1YCB A; 1J3Z A; 1K1K B; 3G4U A; 2V1K A; 3OO4 A; 1HGA A; 3LR7 A; 2NRM A; 2ZFO B; 1HBS A; 1GBV B; 1HCO B; 2O5L X; 4F6B A; 1QPW A; 1YZI B; 4ZVA A; 3UHK A; 1HAB A; 1M6M A; 3R0G A; 3DUT B; 4UIQ A; 1MYZ A; 1YHR B; 1ASH A; 3UHB A; 3WCU B; 3WCW A; 3MN0 A; 2QLS A; 3NMM B; 1V07 A; 3RGK A; 1JP6 A; 2H8F A; 3DHR B; 1XZ7 A; 1YDZ B; 1Y5K B; 1RQ4 A; 1MWB A; 3WCV D; 1H97 A; 1JEB B; 1ABY B; 1A0U A; 4MQK B; 2RI4 B; 3NL7 A; 3D7O B; 2D5X A; 1DO7 A; 2DC3 A; 2FAM A; 3UHS A; 4HHB A; 1OUT B; 2AUO A; 5CNC A; 2R1H B; 1MYJ A; 3OZU A; 4KMV A; 1YEV A; 4ODC B; 3LB1 A; 5JOM A; 1O1I A; 2D6C A; 1QXD A; 3VRE A; 3CY5 B; 4TYX A; 1Y83 A; 1THB B; 3D17 B; 1CH9 A; 3EU1 A; 112M A; 3VRG A; 2GTL C; 3V2Z A; 2Z6T A; 1Y8I A; 5HU6 B; 2O5Q X; 4BJA A; 1J7S B; 4LPI A; 1MLK A; 1LFZ A; 3UHR A; 1MKO B; 3VRF A; 5JDO F; 1Y0T A; 2HHB A; 4F6G A; 1ECO A; 1CH4 A; 1SDL A; 3QJB B; 3WCV B; 1BUW B; 3ECL A; 2O5M X; 1BAB B; 1J52 A; 3ZOM A; 1DKE B; 3GQP B; 3M38 A; 1A00 A; 1N9I A; 2BKM A; 4NXC A; 1C7B A; 1IRD B; 2W6V A; 3A0G A; 1YOI A; 1Y46 B; 2VRY A; 1FLP A; 4U8U D; 3VAU A; 5HY8 A; 5JDO C; 3UHD A; 1HJT A; 4O4T A; 1HLB A; 2G0Z A; 3UHQ A; 3GOU A; 4F68 A; 5EE4 C; 2SPL A; 3WFW A; 1ECD A; 3ZJS A; 1ECA A; 1XZ5 A; 1O1M B; 4MQJ A; 2O5O X; 5CN4 A; 1Z8U B; 1EWA A; 5D1V A; 1XQ5 A; 1MLF A; 1KFR A; 2MYB A; 1GCW B; 1S5X A; 3UHC A; 1O1J B; 2FAL A; 1PMB A; 1OUU A; 1UVY A; 3P5Q A; 4XS0 B; 1BIJ A; 1NXF A; 1SDK A; 1NZ3 A; 1C7D B; 1I3D A; 3HC9 A; 1A6M A; 1EBT A; 1G0B B; 3ZJJ A; 3K8B A; 3PIA B; 4MQI A; 4NI0 B; 1NS9 A; 1Y4F A; 4F69 A; 1MNJ A; 3HYU A; 1GZX B; 3VHB A; 1NPG A; 4AVD A; 2QMB B; 2OHB A; 1Y0C A; 1F63 A; 1Y45 A; 2ZFB A; 2OH8 A; 1VXD A; 2R4W A; 4U8U B; 3UHY A; 1F5O A; 4YU3 A; 1Y2Z A; 1UIW B; 2R50 A; 1YEO A; 2Z6N A; 2HCO B; 4O2G A; 2G11 A; 1HGB A; 1DO1 A; 2O5T X; 5E83 A; 5CND A; 2HBF A; 3UHG A; 1XY0 A; 2B7H A; 1CO8 A; 1UX8 A; 3G53 A; 1NIH B; 2ZFO C; 5IKS A; 1JWN A; 3UHU A; 4C44 A; 5CN6 A; 2G14 A; 4NK2 A; 3UHT A; 3ZJH A; 5B84 A; 1AJG A; 1SI4 B; 4UZV A; 3BJ2 A; 4WJG 1; 4NS2 A; 1B0B A; 1HBH A; 3UBC A; 1G0A B; 5F0B A; 1Y7D B; 3WCU C; 1MLH A; 1O16 A; 1UFP A; 1CP5 A; 2W72 A; 3OO5 B; 3MVC A; 1MBI A; 2ZLX A; 1RPS A; 3M3A A; 4FWY A; 2G0R A; 1KR7 A; 1J3Y A; 3NFE A; 1LFL B; 1XCH A; 1CLS A; 3DHT A; 3WR1 A; 1XZ2 B; 5AZR A; 1IT3 A; 1O1L A; 101M A; 1MWD A; 1Y4P B; 4N8T A; 1YVQ A; 1G09 A; 1GCV A; 1MBD A; 1S69 A; 3HEN A; 2GKM A; 3BJ3 B; 4G51 B; 2HBC B; 1VRF A; 1GBU A; 2QSS A; 2PEG B; 3A59 B; 3QM6 A; 1LUE A; 1Y7G B; 3UGZ A; 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4NI1 A; 4FH6 A; 2D2M C; 1LA6 B; 1Y5F A; 4PQ6 A; 3ARL A; 3PEL A; 1G08 A; 1YE0 B; 1EBC A; 1Y4R A; 3ZJN A; 5M3S A; 1CBL A; 3D1A B; 5MBA A; 1W92 A; 2HBG A; 5KER B; 3E5O A; 2NSS A; 4OOD A; 1R1X A; 2ZS0 B; 1Y4B B; 1DXD A; 1S56 A; 2GRF A; 4PQC A; 3G4Q A; 2DN2 A; 2VLX A; 3MOU A; 3ORD A; 5HAV A; 4PQB A; 5SW7 B; 2ZS1 D; 2AUP A; 1DWR A; 2NRL A; 3IC0 A; 3UHW A; 1DTI A; 3QJC A; 1X9F B; 1A3N A; 1EMY A; 1Y8W B; 1OFK A; 1RQ3 A; 1GDK A; 1GDJ A; 1FCS A; 2G10 A; 2IG3 A; 1HAC B; 1FN3 B; 1HDA A; 1CMY B; 3ZJP A; 1DXV A; 2PGH B; 1SWM A; 3QQQ A; 2W6X A; 5CHQ A; 5EUI B; 1DWS A; 2MBW A; 1YHU B; 1YEU B; 2R80 B; 108M A; 1NQP A; 3OJ1 A; 3OVU C; 4VHB A; 1F5P A; 5D5R A; 3K9Z A; 2QMB A; 1S5Y A; 2O5B X; 1YHE A; 1MBS A; 1G9V B; 2EKT A; 1NZ4 A; 1JP8 A; 1CQX A; 3G4Y A; 1AJ9 A; 2ZSZ A; 1R1Y A; 2D2M A; 2VLY A; 1LFY A; 1TU9 A; 3PT8 B; 2ZT1 A; 1IWH A; 2VYW A; 1MTJ A; 1RVW A; 3A2G A; 1Y35 B; 1KD2 A; 1COH A; 2H35 B; 1BZ6 A; 2ZT3 A; 2ZS1 B; 2MGC A; 2HZ1 A; 1YGF B; 2QFK A; 3QZX A; 1URY A; 4L7Y B; 2ZSY A; 3EOK B; 1DXU A; 1Y31 B; 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