The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
62
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sequence length |
153
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structure length |
153
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Chain Sequence |
VLSEGEWQLVLHVWAKVEADVAGHGQDIWIRLFKSHPETLEKFDRFKHLKTEAEMKASEDLKKHGVTVLTALGAILKKKGHHEAELKPLAQSHATKHKIPIKYLEFISEAIIHVLHSRHPGNFGADAQGAMNKALELFRKDIAAKYKELGYQG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Ligand Migration and Protein Fluctuations in Myoglobin Mutant L29W
pubmed doi rcsb |
| molecule tags |
Oxygen transport
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| source organism |
Physeter catodon
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| molecule keywords |
MYOGLOBIN
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| total genus |
62
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| structure length |
153
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| sequence length |
153
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2005-03-04 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1URV A; 1HDA B; 4XDI A; 1NZ3 A; 2W72 A; 1CIO A; 2MGL A; 3MJP B; 1CH2 A; 5EE4 C; 3PI2 A; 2MYA A; 1BZZ B; 1MDN A; 2MGK A; 5JOM A; 1M6C A; 1Y0T B; 1LFT B; 1HGB A; 2OH9 A; 1XY0 B; 4O4T A; 1CP5 A; 2FRI X; 1JP8 A; 3M38 A; 1SDK B; 2MGB A; 5EOH A; 3PT7 B; 1MYI A; 3IC2 A; 1V75 A; 1MWD A; 2ZSS A; 3ZJP A; 1YEV A; 3VRG A; 3UHI A; 1YHU A; 3MJU B; 3CY5 A; 1YMC A; 4O35 A; 102M A; 3QM7 A; 4WJG 1; 4XS0 A; 4F6B A; 2D5X A; 1GBV A; 1X46 A; 1Y83 A; 2D5Z B; 3NL7 A; 1MOD A; 2G11 A; 3VRF B; 1O1I B; 3VHB A; 4LPI A; 2GRZ A; 3WR1 B; 1ASH A; 2D2M B; 1IDR A; 1NIH A; 4TYX A; 5E6E B; 2D60 B; 1Y2Z A; 4PQC A; 1J7S B; 5CN4 A; 3A5B A; 1Y7C A; 6HBW B; 4ROL B; 1MLR A; 4C44 A; 1G08 B; 1V4U A; 1HV4 B; 2HZ2 A; 1Y4Q A; 4QAU A; 2DN3 B; 3WCT A; 4PQB A; 2O5Q X; 3FH9 A; 4JAC A; 1CG5 B; 1Y46 A; 1QXE A; 1YHU D; 1IOP A; 3BOM A; 2QFK A; 3A2G A; 3QJD B; 2MB5 A; 2ZT1 A; 1Y5J A; 1Y8W B; 1AJ9 B; 1VXD A; 3DR9 A; 1MLN A; 1SI4 B; 1EBC A; 4F68 A; 1YCB A; 2EVP A; 3OO4 A; 3GKV A; 101M A; 4KMV A; 1O1J A; 1J40 B; 1Y5F B; 3HRW A; 1A0U A; 2DN1 A; 1Y09 A; 2GLN A; 1DKE A; 2ZFO B; 1FAW A; 1A3O B; 1YVQ B; 3HXN B; 2ZLV A; 3QJE A; 1GCW A; 1YEO B; 5HU6 B; 3GYS A; 5CHR A; 1CO9 A; 1GZX B; 2QLS A; 1I3D A; 1A01 B; 2ZS1 A; 3MKB B; 3W4U A; 3KUN A; 1MLM A; 2MGA A; 1G9V B; 2R1H A; 1A00 A; 3G46 A; 2EKT A; 3E5O A; 1M9P B; 1BUW A; 1IRD A; 1U7S A; 1QPW A; 3WCT D; 2GRH A; 1HCO B; 4N7P B; 2BWH A; 1QXD A; 1NZ5 A; 4F6G A; 1O1L A; 1LFZ B; 2BLJ M; 1MYG A; 1HGC A; 1C40 B; 1JDO A; 1QSH B; 3GQP A; 1A0Z B; 111M A; 1GCV A; 2LH1 A; 1NS9 A; 3R5I B; 4ROM B; 1Y8H A; 1LUE A; 5HY8 A; 1DLY A; 1KR7 A; 4O2G A; 4N7O A; 103M A; 1IT3 A; 3A9M A; 1O1P B; 4IT8 A; 1RQ4 B; 3WCP B; 3AT6 B; 1A4F A; 3WFT A; 4X0L A; 1MWC A; 2LH2 A; 3HF4 A; 2ZS1 D; 1J41 A; 1YZI A; 4F6F A; 5EUI A; 1CH7 A; 2VYZ A; 3PT8 B; 1DXT B; 1YE0 A; 1MLJ A; 4BJA A; 3WFU A; 1GBU A; 1Y8I B; 1LFY A; 5KDQ B; 1O1M A; 3S1I A; 1MTI A; 2QSS A; 1F5P A; 3RGK A; 1CQX A; 1MBC A; 1CBM A; 1UX9 A; 4MAX A; 2D2N A; 2XYK A; 1C7B B; 5EE4 D; 3G4W A; 3S65 A; 2VEB A; 1HJT A; 4FC3 A; 5JGG B; 6HBI A; 1LFV B; 1Y0A B; 5EYJ A; 2ZLW B; 2QRW A; 2VYW A; 1AJH A; 4MU5 A; 1B86 A; 3KUO A; 3ODQ B; 2LHB A; 1FSX B; 1MGN A; 2MYE A; 1YCA A; 1DTI A; 3S66 A; 1YEQ A; 1XZU A; 3FS4 B; 3UHT A; 1S5Y A; 1HBS A; 1YIH B; 2W6X A; 1ABY B; 5JDO F; 1Y22 B; 3HHB A; 1DWS A; 5CND A; 4HRT A; 3PI4 A; 3BJ3 A; 1MWB A; 2M6Z B; 3NMM A; 2ZLU B; 1XZ7 B; 1IWH B; 2HBE B; 4UUR A; 1XXT A; 3IC0 A; 4YU4 B; 1DUO A; 3VAU A; 2HBD B; 3V2V A; 1UFP A; 2D2N D; 3NFE A; 1JPB A; 2FRJ X; 3D17 A; 2ZLX A; 1MYJ A; 1W92 A; 1YHE B; 1V4W A; 1V9Q A; 2W31 A; 1HBB A; 2IG3 A; 3ZJH A; 1O1N B; 2R4X A; 4IRO B; 1DXU A; 3K8B B; 5ILM A; 1U7R A; 2V1F A; 4MXK A; 1MLQ A; 5B85 A; 1N9I A; 1UIW B; 1Y4R A; 1DXV A; 2V1H A; 3BJ1 B; 1G09 A; 1MNK A; 1MOB A; 1PBX A; 1O1O B; 2HCO A; 1G0A A; 1GDK A; 2BKM A; 107M A; 1CH4 A; 3O7N A; 1R1Y A; 5CMV A; 1HAB B; 2PEG B; 1JY7 A; 3AG0 A; 3WTG B; 1YIE B; 1MBS A; 1SPG B; 3P5Q B; 1J3Y B; 3ECX A; 1G0B A; 3CIU B; 1HDB A; 2W72 C; 2QU0 B; 1Y7Z B; 3V2Z A; 3D1A B; 1EBT A; 1K0Y B; 3PIA A; 3UHZ A; 1NEJ B; 3QQQ A; 4MQG A; 3PI9 B; 3D4X A; 4HHB B; 3IXF A; 4ESA A; 3M3A A; 1SHR A; 3OO5 B; 1A6K A; 4G51 B; 5C6E A; 5JDO E; 2MGG A; 4DC7 A; 1KD2 A; 3SDH A; 4FWY A; 1WVP A; 2AUO A; 3PI3 A; 2AUQ A; 1YHU C; 2B7H A; 1OFJ A; 3EOK A; 3A0G A; 4KJT A; 2DN2 B; 1A9W A; 1HAC A; 2R80 A; 1YE2 B; 1Y7D B; 3D7O A; 5HLX A; 3AT5 B; 1BZ0 B; 2MHB A; 2RI4 B; 4F4O B; 1Z8U B; 3QM6 A; 1LFQ A; 5CN6 A; 2W6W A; 4U8U C; 1Y4P B; 4F6D A; 4ZVB A; 3NML A; 1D8U A; 5E83 A; 2Z6T A; 2HZ3 A; 4NZI A; 1ABS A; 3SZK B; 4UIQ A; 1VHB A; 2GNV A; 1GJN A; 3LR7 A; 1DUK A; 1OFK A; 3ZH0 A; 1FN3 B; 5CNE A; 3DHT A; 1HGB B; 2EB9 A; 4O1T A; 1VWT A; 1X3K A; 1YH9 A; 1CLS B; 3UHR A; 1JL7 A; 1JL6 A; 1YEV B; 1OBM A; 3VRG B; 1YHU B; 2OHA A; 4DWU A; 2ZST A; 1HGA A; 3CY5 B; 1JZK A; 4XS0 B; 1UC3 A; 2D5X B; 1Y83 B; 4MQI A; 1OUT A; 1ABW B; 2H8D A; 5E29 A; 3HYU A; 1N9F A; 2ZSQ A; 1Y4G B; 2XKH A; 1YFF A; 1NIH B; 1J3Z A; 1JF4 A; 4PNJ A; 2OHB A; 1IBE A; 4YU3 B; 2MGI A; 1Y2Z B; 1YVT A; 4HSW A; 1Y7C B; 1YEU A; 2MYB A; 3UH3 A; 1JF3 A; 4MPM A; 5HLQ A; 2ZLT B; 1NZ4 A; 2R50 A; 3LB4 A; 1Y4Q B; 3WFW A; 3ONZ A; 2YRS A; 3WCT B; 3FH9 B; 5KER A; 2ZT0 A; 2ZS0 A; 1Y46 B; 1K1K A; 1OR6 A; 3QQR A; 3A5G A; 1VRF A; 1QXE B; 1RTE A; 3BOM B; 1J7W A; 1Y5K A; 2ZSR A; 2LH7 A; 4NXA A; 5EQM A; 3GKV B; 1O1J B; 1V4X A; 2G0Z A; 3HRW B; 1DM1 A; 3QMA A; 2DN1 B; 1Y09 B; 2HHE A; 1DXD A; 1DKE B; 1FAW B; 2ZLV B; 1NZ2 A; 3QJE B; 1F5O A; 2HBF A; 5ILP A; 3GYS B; 3G4R A; 2KSC A; 1XZV A; 4O4Z A; 1MBN A; 2ZS1 B; 4SDH A; 1MLS A; 4NXC A; 3WI8 A; 3G4V A; 1IRC A; 4JYQ A; 1SWM A; 2AUP A; 1IRD B; 4M4A A; 4DC8 A; 2ZS0 D; 5ILE A; 3UBV A; 1Y4F A; 2G3H A; 5D1V A; 1XQ5 B; 2W6V A; 1Y01 B; 1CP0 A; 1NS6 A; 4U8U A; 5M3S A; 2D2N C; 3UHW A; 2QFN A; 1KFR A; 1ITH A; 2G0R A; 1S6A A; 4MXL A; 1MKO A; 2SPO A; 2JHO A; 1ECO A; 1GCV B; 1RPS B; 4MQH A; 1NS9 B; 2HZ1 A; 1Y8H B; 5HY8 B; 4F69 A; 4NK2 A; 1HHO B; 2DHB A; 3QM5 A; 4N7O B; 1Y31 B; 3ARL A; 1HDS A; 2FAM A; 3GLN A; 1A4F B; 4X0L B; 1XZ2 A; 3GOU A; 3HF4 B; 1YZI B; 5EUI B; 1A6N A; 1Y7G A; 2GKN A; 5CN8 A; 1GLI A; 3HEO A; 2HHB A; 3PI8 B; 1QI8 A; 1YE0 B; 2G10 A; 3UH6 A; 3ZJR A; 1GBU B; 3AQ9 A; 4U8U D; 1Y35 A; 1O1M B; 1HBG A; 4HSX A; 1L2K A; 2QSS B; 1XZ4 A; 3E5I A; 1XY0 A; 3B75 B; 2GKM A; 4MQJ A; 1FDH G; 2D2N B; 3PT7 A; 3S65 B; 1YDZ A; 4FC3 B; 2VLX A; 1MYT A; 1YOI A; 3KMF A; 2GTL C; 1B86 B; 3EDB A; 1RQ3 A; 1OJ6 A; 3A59 A; 3A5A A; 2D5Z A; 1FSL A; 3UHV A; 1HSY A; 3S66 B; 1HBI A; 1S5Y B; 1HBS B; 1MNH A; 4MQK A; 1CMY A; 1OUU A; 3QJB B; 5CN7 A; 2D2M A; 4WJG A; 5E6E A; 2HHD A; 1O1K A; 4HRT B; 1ECD A; 3UHD A; 1COH A; 2OH8 A; 1J7S A; 3M39 A; 2HBC A; 3ZHW A; 1XXT B; 1LH3 A; 3G4Y A; 1Y8K A; 1MOA A; 2MYC A; 1G08 A; 4G1V A; 1HV4 A; 4F6J A; 3NFE B; 3ZJI A; 3D17 B; 3R0G A; 2ZFB B; 2ZLX B; 1V4W B; 3UH5 A; 1CQ2 A; 1MNO A; 2FRK X; 1Y8W A; 1AJ9 A; 1LHT A; 1IT2 A; 1DO1 A; 5CNB A; 3VRE B; 4ODC B; 1BAB A; 1J40 A; 5CNF A; 4M4B A; 4DWT A; 3ZOM A; 1YEN B; 2O5T X; 1YVQ A; 1Y4R B; 2D2M D; 1DXV B; 3WHM A; 1EMY A; 3BCQ B; 1PBX B; 1G0A B; 2O5B X; 1GZX A; 1H97 A; 1CIK A; 1THB B; 1DWT A; 5CHQ A; 1JY7 B; 3WCW A; 3G4U A; 1A01 A; 3AQ7 A; 1MLF A; 1S0H B; 1M9P A; 2D6C A; 3ZJS A; 1HCO A; 3DHR A; 1JW8 A; 1S56 A; 1VRE A; 3PIA B; 1CH1 A; 4MQG B; 3D4X B; 3D1K B; 1VXA A; 1LJW A; 3UHC A; 1BZR A; 4ESA B; 1SHR B; 1C40 A; 1CG8 A; 1QSH A; 1HBH A; 1C7D A; 5C6E B; 3BJ2 A; 3QM8 A; 2SPL A; 1KD2 B; 2WTH A; 1JEB A; 1LFL A; 2V1I A; 1SPE A; 2VLY A; 3UHG A; 4MBA A; 3AQ5 A; 3OGB A; 1M6M A; 1URY A; 2EKU A; 1QSI A; 3A0G B; 3QZX A; 2R4W A; 1HAC B; 1YOG A; 2R80 B; 3D7O B; 1Y0D A; 3WCW D; 2EB8 A; 2PGH A; 109M A; 1FHJ A; 2MHB B; 3GDJ B; 1BZ1 A; 2O5S X; 3OZW A; 2MGM A; 2XKG A; 1LFQ B; 2GTL A; 1JP9 A; 3M3B A; 1BIN A; 2H35 A; 1S5X A; 4MBN A; 5E83 B; 2AV0 A; 1A3N A; 4KMW A; 1WMU A; 1Y0C A; 1V07 A; 1AZI A; 2NSS A; 2VYY A; 1YGD A; 3UHH A; 5F0B A; 1C7B A; 2GDM A; 1I3E A; 2ZS0 C; 1MBI A; 1JZM A; 1UX8 A; 1TU9 A; 4ILZ A; 5AZR A; 5JGG A; 1XYE A; 3ZOL A; 1LHS A; 1O16 A; 2BW9 M; 3ORD A; 3UH7 A; 3WCV C; 1VWT B; 3NG6 A; 3ASE A; 2DXM B; 4H2L A; 4L7Y A; 1MOC A; 2GRF A; 1PMB A; 2QMB A; 3PEL A; 2O58 X; 4G1B A; 1Y4B A; 2ZSZ A; 1YG5 A; 2Z6S A; 5IKS A; 2OIF A; 2MGF A; 2GTL D; 5SW7 B; 2HBS B; 4MQI B; 2H8D B; 5E29 B; 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1Y5J B; 3WCV A; 1V5H A; 1XZ2 B; 3GOU B; 2D2M C; 1A6G A; 7HBI A; 1EWA A; 3UHB A; 112M A; 3OO4 B; 2AA1 A; 1Y7G B; 1CBL A; 2NRM A; 1A0U B; 2NX0 A; 5CN9 A; 1MLU A; 1MYH A; 1GLI B; 3SZK A; 1HLM A; 2HHB B; 1QI8 B; 1Y4V A; 2SPN A; 3ZJM A; 3QM9 A; 2E2Y A; 1YMB A; 1GCW B; 1Y35 B; 1FN3 A; 2OLP A; 1XZ4 B; 1MLG A; 2QLS B; 4B3W A; 2CMM A; 3OVU C; 1DXC A; 4HRR A; 4MQJ B; 3W4U B; 2R1H B; 1A00 B; 1BVC A; 1UVX A; 1CLS A; 5B84 A; 1YDZ B; 2QSP A; 1BUW B; 2Z6N A; 1QPW B; 3UHN A; 3UHY A; 1LA6 A; 1QXD B; 2R4Z A; 1XCH A; 1RQ3 B; 1O1L B; 3A59 B; 3WCV D; 1Y45 A; 2ZFO C; 2WY4 A; 104M A; 1SDL A; 1ABW A; 1HGC B; 1A6M A; 3GQP B; 3LQD A; 1VXH A; 1OUU B; 4MQK B; 1CMY B; 1DO7 A; 2VM0 A; 3UHU A; 1Q1F A; 1Y4G A; 3WCW C; 4C0N A; 3E4N A; 2HHD B; 1O1K B; 3OZV A; 4KN3 A; 1BZP A; 4YU3 A; 5ILR A; 3QJC A; 1COH B; 2ZT4 A; 3TM3 A; 1BZ6 A; 1RTX A; 1LH2 A; 1LH1 A; 1Y0W A; 2HBC B; 3GQG A; 1DLW A; 1Y8K B; 3HEP A; 3S48 C; 2ZLT A; 1T1N A; 2RAO A; 1J41 B; 1X9F A; 3OZU A; 1HDA A; 2HBG A; 3AQ8 A; 3MJP A; 1VXC A; 2AUR A; 1WLA A; 2G0V A; 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