The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
59
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sequence length |
153
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structure length |
153
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Chain Sequence |
VLSEGEWQLVLHVWAKVEADVAGHGQDILIRLFKSHPETLEKFDRFKHLKTEAEMKASEDLKKHGVTVLTALGAILKKKGHHEAELKPLAQSHATKHKIPIKYLEFISEAIIHVLHSRHPGDFGADAQGAMNKALELFRKDIAAKYKELGYQG
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Crystal structure and peroxidase activity of myoglobin reconstituted with iron porphycene
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Myoglobin
|
| molecule tags |
Oxygen storage/transport
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| total genus |
59
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| structure length |
153
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| sequence length |
153
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| chains with identical sequence |
B
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2005-11-11 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2MGF A; 1QSH B; 2DHB B; 1WVP A; 1CG5 A; 2O5T X; 3WCW D; 5JDO C; 1Y7Z B; 1Y5F A; 1PBX B; 5B84 A; 3PI9 B; 1GCV A; 1GBU A; 4OOD A; 3NML A; 3LB3 A; 2FRF A; 1HGB A; 2D2M A; 1OUU B; 3MJP A; 2W6X A; 1Y4P A; 3GQP B; 1OJ6 A; 2V1H A; 1FN3 B; 1FHJ B; 1UVY A; 5CNB A; 3A59 B; 1SHR A; 3PI3 A; 4HSW A; 3ODQ A; 3WR1 B; 5B85 A; 1YIE A; 4TWU A; 1CMY A; 1YEV B; 1LHT A; 1SPG A; 1Y35 B; 1UX9 A; 2W31 A; 1MNK A; 5CN6 A; 1OR4 A; 2JHO A; 2MGJ A; 1Y0W A; 3LQD B; 1Y5K A; 3U3E A; 3GKV A; 104M A; 1O1O B; 1HAB A; 4U8U D; 4MQH B; 4HRR A; 3G4W A; 1J40 B; 1LH3 A; 4NZI A; 5CND A; 1HAC B; 1AJG A; 1BZZ B; 1DO4 A; 3WHM B; 1Y45 B; 1A6N A; 5E6E A; 2BK9 A; 1YZI A; 1NS6 A; 1Y4F B; 3BJ3 B; 1LFL B; 2FRK X; 2G0X A; 1RTX A; 3ZH0 A; 1VWT B; 3QZX A; 3D1A B; 1QPW A; 1BZ0 B; 4VHB A; 3WCV D; 1Y5J B; 2ZT1 A; 1HBA B; 1JPB A; 3ZJN A; 2MGE A; 3VRF A; 1HHO B; 1Y7G B; 1FDH A; 4L7Y B; 5AZQ A; 5JDO D; 1ABW A; 2O5S X; 1M9P A; 3AG0 A; 1GCW A; 1Y4G A; 7HBI A; 1C7D B; 5KER B; 5ILP A; 2ZLU B; 2V1K A; 1LUE A; 3BA2 A; 3AT6 B; 2QMB A; 3BOM A; 2MGI A; 2D5X A; 1XZ5 B; 1Y09 A; 2ZSP A; 1K0Y A; 1LHS A; 1XZ2 B; 1AZI A; 3G4R A; 4ROM A; 2R80 B; 1ECO A; 2HHD A; 1YDZ B; 3UGY A; 2HBF B; 3BJ1 A; 2DN1 B; 2WTG A; 4AVE A; 4F68 A; 3M3A A; 3GDJ B; 2EB9 A; 1JL6 A; 2QSS A; 3LR7 A; 1CH4 A; 1FSX B; 1Z8U B; 2AUO A; 2ZSY A; 3WFX A; 1QXD B; 3M3B A; 4F6J A; 1QXE A; 5D1V A; 5HU6 A; 1MBS A; 1YHU B; 3OGB A; 2G0V A; 3HYU B; 1IBE A; 2PGH A; 5M3S A; 2G3H A; 1GZX B; 2ZWJ A; 110M A; 1JL7 A; 1VRE A; 1XCH A; 1J7S A; 3UHK A; 1S5X B; 3QJD A; 3A5B A; 1MWD A; 1LJW B; 1MGN A; 1XZV A; 3QM6 A; 1JEB B; 3NG6 B; 4YU4 B; 1V75 A; 4DWT A; 1Y4Q B; 1NWN A; 1B0B A; 5IKS A; 1LH2 A; 2GNV A; 1Y8W A; 1MBI A; 1JWN A; 1CIK A; 1MOB A; 4F6G A; 3GQR A; 1V9Q A; 2CMM A; 4IRO B; 1JY7 A; 1HV4 B; 1YE0 B; 1XXT A; 1YG5 B; 101M A; 1Y0A A; 4X0L B; 4IT8 A; 1YVT B; 2HZ2 A; 2VEB A; 4ROL B; 3UHN A; 1YMA A; 3GOU A; 3HXN A; 4NI0 B; 4M4B B; 1IWH B; 1K1K A; 3SZK A; 1YEQ A; 3ZJI A; 3CIU B; 2LH7 A; 1N9H A; 1V4X B; 2MBW A; 4LPI A; 2W72 A; 3VHB A; 3S66 B; 1GVH A; 1UC3 A; 4YU3 A; 1G0A B; 2HBE B; 1NZ5 A; 1RQ3 A; 2QLS A; 2W72 C; 1ECA A; 4FWX A; 4H2L B; 2OH9 A; 1NZ2 A; 3HF4 A; 1Y4B B; 1HRM A; 3GK9 A; 1MLO A; 2GTL A; 5EYS A; 2DXM A; 5JGG B; 2QU0 A; 4FH6 A; 1IT2 A; 1XZ7 A; 5E29 A; 1Y8K A; 1O1J A; 4KN3 A; 2GTL C; 3MJU A; 1U7S A; 1GLI A; 2VEE A; 3FH9 A; 4DC8 A; 1S0H B; 3EOK B; 1Y8I B; 3WCU B; 3IXF A; 1MBO A; 2D5Z A; 1HBH B; 1YGD A; 1HGA A; 1O1L A; 2HBD A; 1NQP B; 1FSL A; 1QSI B; 2BKM A; 2RI4 A; 1DXU B; 1YCA A; 1EW6 A; 3E5I A; 1QI8 B; 1A01 A; 1HCO A; 1Y46 A; 3M38 A; 2OLP A; 1HBR A; 3WI8 A; 2D2N B; 1Y22 A; 3AQ9 A; 3ZJR A; 1GDI A; 5JDO F; 3WCW B; 3P5Q B; 5HAV A; 3OO5 B; 3ORD A; 1O1K B; 2HBC A; 3G4U A; 1NGK A; 2AUQ A; 1MLJ A; 107M A; 1EWA A; 2R4Y A; 4F6I A; 3QZZ A; 4N7P B; 3PT8 A; 4PQ6 A; 5C6E A; 3DHT A; 4MQC B; 1O1N B; 1HBS B; 1BZP A; 2H35 A; 3FS4 A; 3ZJM A; 5HLU A; 1MZ0 A; 2R4X A; 4NXA A; 1G09 A; 1KD2 B; 3WCP A; 3ARL A; 4WCH D; 4BJA A; 1MBN A; 1MTK A; 5AB8 A; 1YEU A; 3VRG B; 1J41 A; 1MLM A; 1Y7C A; 1BBB A; 1GBV A; 3IC2 B; 1O1I A; 3TM9 A; 2AA1 A; 1RVW B; 1COH B; 1URV A; 1HGC A; 3PT7 B; 4MQK A; 5AZR A; 2H8D B; 5E83 A; 2NSR A; 1O1P B; 1C7B A; 1T1N A; 2ZLV B; 1PMB A; 2PEG B; 3AQ5 A; 2GTL D; 3ZOL A; 1MLK A; 1GJN A; 4N8T A; 3OZU A; 2ZLX A; 3A0G B; 6HBW B; 1NAZ A; 2NRM A; 4U8U B; 1DO1 A; 2DN2 B; 2IG3 A; 2OIF A; 3ONZ A; 1YIH A; 2ZFO C; 4N7N B; 3TLD A; 3WFU A; 1NPF A; 1URY A; 4ODC A; 3UHY A; 4WJG 1; 1Y2Z A; 3ECX A; 1DWS A; 2EVP A; 2MGL A; 2MHB B; 1C7C A; 4M4A A; 4ESA A; 3WCV B; 3G4Q A; 2GL3 A; 3PI8 A; 1LFZ B; 1ABY B; 1SDK A; 1G9V A; 1UT0 A; 5KDQ A; 1NIH A; 3OZW A; 1YE2 B; 4XS0 A; 3BCQ A; 3K8B A; 1BIJ B; 4B3W A; 1XZ4 B; 1C40 B; 2HCO A; 1UX8 A; 4UZV A; 3WCT B; 1S5Y A; 1YOG A; 1BAB A; 4NS2 A; 1MWC A; 1SPE A; 3K3U A; 1CG5 B; 2MB5 A; 2ZFB B; 1MBC A; 1YFF A; 3HHB A; 1R1X B; 1UFJ A; 1FAW A; 1DXD A; 2HBG A; 2MGD A; 1GBU B; 1MLH A; 1HGB B; 2O58 X; 3MJP B; 1BUW B; 4JYQ A; 1RPS B; 1MYZ A; 3G4V A; 3MYM A; 1Y0D B; 1CH2 A; 1LA6 B; 2NX0 A; 1WMU A; 1MOD A; 2R1H A; 3PEL A; 5CHR A; 2ZSO A; 1VXC A; 3VRE A; 1ITH A; 1X9F A; 2D2M C; 4FC3 A; 3QJB B; 3ODQ B; 1YIE B; 4FWY A; 3UI0 A; 1YH9 A; 1SI4 A; 1CMY B; 1SPG B; 4HBI A; 1RQA A; 2LH1 A; 3PIA B; 1H97 A; 5SW7 B; 1A9W E; 1UVX A; 1PBX A; 2O5Q X; 2DN3 A; 3UHH A; 2ZFO D; 3GKV B; 1OUU A; 1RQ4 B; 3PI1 A; 1HAB B; 1Q1F A; 4HRR B; 1M6C A; 2VLZ A; 2V1I A; 1MTJ A; 1FDH G; 1I3D A; 4G51 B; 3GYS A; 1HJT A; 1S69 A; 1HDA B; 4N7O B; 3V2Z A; 2OHA A; 1YZI B; 1NS6 B; 4KJT A; 1Y31 A; 2QRW A; 2LHB A; 2O5L X; 4F4O B; 3EDB A; 3K9Z A; 3MN0 A; 3WR1 A; 3E4N A; 1J3F A; 1QPW B; 4XDI A; 3UHX A; 1YEV A; 1JF3 A; 1Y35 A; 3QJE A; 2AV0 A; 3LHB A; 3VRF B; 2KSC A; 2GKN A; 1MLR A; 3B75 B; 2IN4 A; 1MWB A; 1AJ9 A; 3LQD A; 2G0S A; 1BVC A; 1ABW B; 1M9P B; 1GCW B; 3W4U B; 1Y4G B; 1A0U B; 2AV3 A; 4NI1 A; 4NK1 A; 2DC3 A; 3AQ6 A; 4MQH A; 3GQG A; 3ASE A; 3G46 A; 1J40 A; 4AVD A; 3TM3 A; 1Y83 A; 1MLS A; 1HDB B; 2VM0 A; 106M A; 1A0Z B; 3UHC A; 1HDS B; 3MBA A; 1HAC A; 1BZZ A; 4G1V A; 4HRT B; 1X46 A; 1CP0 A; 1K0Y B; 1Y4F A; 2NSS A; 1LFL A; 2GNW A; 2BNL A; 1YHE A; 4ROM B; 2HHD B; 3D1A A; 2D2M D; 2MYB A; 1ECD A; 2GKM A; 1Y5J A; 1HBA A; 3UHV A; 2QSS B; 1HHO A; 4KMW A; 1A9W A; 4HSX A; 4F69 A; 5KKK A; 4KMV A; 3ECL A; 1MYF A; 1FCS A; 3O7N A; 1QXE B; 1NWI A; 2ZS0 B; 5HU6 B; 1A3O A; 1IRD A; 3H58 A; 5KER A; 2QFK A; 3KUO A; 2B7H B; 1IBE B; 2ZLU A; 1CG8 B; 3AT6 A; 1V4W A; 2Z6T A; 4O4T A; 1J7S B; 1DM1 A; 3GLN A; 3QJD B; 3NFE A; 1L2K A; 3UH5 A; 2HHE A; 4ILZ A; 4G1B A; 1DXC A; 2VLX A; 2VYY A; 1J7W B; 2G10 A; 1J7Y A; 2R80 A; 1G08 A; 1V75 B; 2Z8A A; 5ILR A; 4O2G A; 2ZT3 A; 1SWM A; 3O89 A; 2HBF A; 1Y8H A; 1JDO A; 2BLJ M; 1Y85 B; 5F0B A; 3QQQ A; 1O16 A; 3GQR B; 1GDK A; 1QXD A; 1VXB A; 2ZS1 A; 3OK5 A; 1VXA A; 2W6V B; 3ZJH A; 2AUR A; 3WTG A; 1CO8 A; 1MLN A; 2ZS1 C; 3UHS A; 1GZX A; 4MXK A; 2ZT4 A; 1CLS B; 1CH9 A; 1YEQ B; 3UBV A; 3ZJS A; 1JW8 A; 1XYE B; 2W72 B; 3UHZ A; 1F65 A; 3MKB A; 3R5I A; 4MBN A; 3UHI A; 4YU3 B; 1MKO B; 1S61 A; 2G11 A; 1Y4Q A; 1DTI A; 1RQ3 B; 2QLS B; 3ZJQ A; 3HF4 B; 3G53 A; 1A3N A; 2GTL B; 2MYA A; 1YEO B; 2QU0 B; 3DHR A; 3D1K A; 1XZ7 B; 2HZ1 A; 5E29 B; 1DWR A; 1O1J B; 4IRO A; 1Y4R B; 3MJU B; 3ARJ A; 3ZJO A; 5EET A; 1YG5 A; 3FH9 B; 1MLU A; 1Y7D A; 4GZG A; 1VXG A; 5C6Y A; 1YVT A; 2XKH A; 1O1M A; 3CY5 B; 4MPM A; 4MQI B; 1DWT A; 3H57 A; 3QM9 A; 2D5Z B; 4ROL A; 1YGD B; 1YEN B; 1O1L B; 1VXD A; 3UGZ A; 2HBD B; 2EVK A; 3CIU A; 2GDM A; 1V4X A; 2ZSZ A; 3IC0 B; 5CMV A; 3G52 A; 4PNJ A; 3AQ8 A; 1ASH A; 1WLA A; 3UH7 A; 2GLN A; 4H2L A; 1HCO B; 1Y46 B; 1F63 A; 1A6G A; 1HBR B; 3OO4 A; 1Y22 B; 2D60 B; 3S48 C; 3BJ2 A; 2Z6N B; 1YGF A; 1XZU A; 1J3Z B; 2ZSQ A; 1YHR A; 2LH6 A; 1EBT A; 3LB4 A; 1V4U B; 3MOU A; 3ED9 A; 2HBC B; 3ECZ A; 1Y8I A; 1THB A; 4H07 A; 3WCU A; 1JP6 A; 3PT8 B; 5C6E B; 1R1Y B; 2D6C A; 2WY4 A; 2H35 B; 3KMF A; 2ZS1 D; 3FS4 B; 3D7O B; 1DLY A; 3WCP B; 3KMF C; 3RJ6 A; 1B86 A; 3NMM B; 1LFY B; 5MBN A; 1OBM A; 2HHB A; 1Y0C A; 3NL7 A; 2ZLT A; 2QSP A; 5CNF A; 1LFT A; 1NS9 A; 5HY8 A; 1Y7C B; 1BBB B; 1GBV B; 2MGK A; 3M39 A; 1O1I B; 3EDA A; 2AA1 B; 2D2N A; 1YVQ B; 1HGC B; 4MQK B; 2QFN A; 1NPG A; 3QM7 A; 2G0R A; 1MYJ A; 1W92 A; 1C7B B; 2W6Y A; 1NEJ A; 4SDH A; 3P5Q A; 1BIN A; 1UIW A; 2H8F A; 2MYC A; 105M A; 2ZFO B; 1CH1 A; 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1C40 A; 1GDL A; 1LH7 A; 3LB2 A; 3WCT A; 3ZJL A; 1SDL A; 1SHR B; 1RQA B; 1MYT A; 2ZFB A; 103M A; 5HBI A; 2ZLW A; 1S6A A; 3WCT C; 2HBS A; 3D4X A; 4FWZ A; 1R1X A; 2VYZ A; 2DN3 B; 2O5M X; 1RTE A; 1QSH A; 1X9F C; 3R0G A; 2DHB A; 2BLI A; 1JF4 A; 2FAL A; 1BUW A; 1Y7Z A; 1MOH A; 1Y0W B; 1RPS A; 1Y5K B; 3GYS B; 1MYI A; 3PI9 A; 1JP8 A; 1Y0D A; 1OFK A; 1KR7 A; 3QQR A; 1LA6 A; 1MTI A; 1MBD A; 1YOH A; 3GQP A; 3VAU A; 1Y31 B; 2LH3 A; 1NXF A; 1FN3 A; 1FHJ A; 3QJB A; 1BJE A; 1GDJ A; 3QJE B; 3LB1 A; 3A59 A; 5E6E B; 3QMA A; 2V1J A; 3PIA A; 5SW7 A; 1AJ9 B; 1UFP A; 2EB8 A; 5HLQ A; 4NK2 A; 4NI1 B; 1DUK A; 1RQ4 A; 3GQG B; 3AQ7 A; 1Y83 B; 2MGM A; 4G51 A; 1HLB A; 1HDA A; 1YCB A; 4N7O A; 2BLH A; 2VHB A; 1O1O A; 1LH1 A; 2G0Z A; 3PI4 A; 4F4O A; 2V1F A; 1YHE B; 2QMB B; 3BOM B; 2D5X B; 1N9I A; 3UHE A; 3PI2 A; 3WHM A; 1Y09 B; 1Y45 A; 5EE4 C; 1H1X A; 3UHQ A; 2FAM A; 1VXF A; 3UHB A; 3B75 A; 2G14 A; 3BJ3 A; 3HEO A; 1YOI A; 1VWT A; 1NZ4 A; 1BZ0 A; 2ZSX A; 3W4U A; 2FRJ X; 1A0U A; 3WCT D; 1S56 A; 3BJ1 B; 1A3O B; 1IRD B; 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