The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
57
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sequence length |
146
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structure length |
146
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Chain Sequence |
VHLTPEEKSAVTALWGKVNVDEVGGEALGRLLVVYPWTQRFFESFGDLSTPDAVMGNPKVKAHGKKVLGAFSDGLAHLDNLKGTFATLSELHCDKLHVDPENFRLLGNVLVCVLAHHFGKEFTPPVQAAYQKVVAGVANALAHKYH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
1.25 a resolution crystal structures of human haemoglobin in the oxy, deoxy and carbonmonoxy forms.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Hemoglobin alpha subunit
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| molecule tags |
Oxygen storage/transport
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| total genus |
57
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| structure length |
146
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| sequence length |
146
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2006-04-25 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| B | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3G52 A; 6HBW B; 2BK9 A; 1CG8 B; 4MQG A; 2ZLX A; 1J40 B; 3NG6 B; 2BKM A; 1GDI A; 1MLO A; 1YGD B; 4LPI A; 5JDO E; 1MOB A; 1RPS A; 4HSW A; 1Y2Z B; 1YEV B; 1A6G A; 108M A; 1LH1 A; 5B85 A; 2QRW A; 1I3E A; 1NS9 B; 1Y09 A; 3ZJQ A; 3QJD B; 2ZT3 A; 5KKK A; 2HBC A; 1YE0 A; 3EU1 A; 2WY4 A; 4YU3 B; 1MTK A; 2G0S A; 3CIU A; 3UHN A; 2XKI A; 1IRC A; 1LH2 A; 3UHR A; 5KER A; 1XQ5 A; 2MGD A; 3D17 B; 1A00 A; 1MKO A; 1Y46 A; 2XYK A; 5CND A; 4HHB A; 5KDQ B; 4QAU A; 3QM5 A; 1C7D B; 1BZZ A; 1BIJ A; 1OUU B; 1NEJ A; 1CO8 A; 4XS0 A; 4JYQ A; 1OJ6 A; 110M A; 1R1Y B; 3D7O B; 1Y45 A; 3UH7 A; 3WCW C; 3EDA A; 3UGY A; 2V1J A; 4MU5 A; 1FN3 A; 2O58 X; 1CG5 B; 3QJC B; 1Y5J A; 3WTG B; 3H58 A; 1JDO A; 1YHU B; 3WCU B; 3P5Q A; 1GZX A; 5ILM A; 1UIW B; 2DN2 A; 3KUN A; 3PI8 B; 4H2L A; 1DO4 A; 4NZI A; 1MWC A; 1A01 B; 3AG0 A; 5JDO C; 2BLJ M; 1DKE A; 5HBI A; 2MGB A; 1CH3 A; 3D1A A; 1ABY A; 4KN3 A; 3WFW A; 4YU4 A; 1RQA B; 5JDO D; 2VLZ A; 5D1V A; 1A0Z A; 1Y7Z B; 1X9F B; 2HHB B; 2DN3 B; 1COH B; 4PNJ A; 2MHB B; 1Y0A B; 1XZU B; 1BBB B; 1HGC B; 3HRW B; 1K1K B; 1Y5K A; 1J41 B; 1HDB B; 3SDN A; 4N8T B; 1XZ7 B; 2EVK A; 2VHB A; 1FLP A; 1HGB B; 1MZ0 A; 2LHB A; 4ROM A; 1G09 B; 2ZT2 A; 1XZ5 B; 2IN4 A; 3DUT A; 4F6J A; 1CP5 A; 1YMC A; 3IC0 A; 1A3N B; 1Y4G B; 2XKH A; 5C6Y A; 4F6I A; 1YEQ B; 3GOU A; 2WTH A; 1Y85 A; 2H35 B; 3S66 A; 102M A; 1UFJ A; 1MBO A; 4WJG A; 2G0X A; 1S5X A; 1XZ2 B; 1YH9 B; 3BJ3 B; 3K8B A; 2ZFB A; 4FWX A; 1CLS B; 1F5P A; 1A3O B; 3NL7 B; 1YE2 A; 5EYS A; 1V4X A; 1Y7D A; 1BZP A; 4B4Y A; 2V1H A; 3H57 A; 1MOC A; 1JL6 A; 1QSI A; 3MKB B; 1YEO B; 5ILP A; 1QXD B; 3S1J A; 1FSX B; 3UHX A; 1DUK A; 3W4U A; 1Y4B A; 2OH8 A; 1GCV A; 1M6M A; 2Z6S A; 4ROL A; 1DXU B; 2FRJ X; 3PI1 A; 3CY5 B; 3FS4 A; 4NI0 B; 1OFK A; 3VRF A; 1F5O A; 4IRO A; 4KMW A; 101M A; 3GQP A; 3GK9 A; 1BVD A; 3G4Y A; 3TLD A; 2H8D B; 3HF4 A; 1XZ4 B; 3OZU A; 1C40 B; 1DWR A; 1UVX A; 3GKV B; 1J3Y A; 1HV4 B; 1Y0C B; 1N9F A; 5CNB A; 1HGA B; 2AA1 A; 2QU0 A; 1ITH A; 3MJP B; 4N7P A; 3QQQ A; 1LA6 A; 3SZK B; 1V07 A; 1GBV A; 1G0A A; 5HU6 B; 5CNE A; 1DUO A; 1Y2Z A; 1YEV A; 2DN1 A; 1FDH G; 2QFN A; 1C7C A; 3E4N A; 1Y8K B; 2HBF B; 2W72 B; 111M A; 3ZJN A; 3QJD A; 1Y4F A; 1C7B B; 2G11 A; 1GBU B; 1Y7C A; 4U8U C; 1OR4 A; 1GJN A; 1EBT A; 4YU3 A; 3E5I A; 3WCV A; 2JHO A; 3LB1 A; 1V75 A; 1DO3 A; 1MYI A; 1CH4 A; 4U8U D; 4MQJ B; 2MGH A; 1SPE A; 1G9V A; 2D6C A; 2ZS0 A; 2O5O X; 1A6N A; 3K9Z A; 5KDQ A; 2B7H A; 5CN7 A; 2MB5 A; 1C7D A; 2HBE B; 4HRT A; 2VEB A; 4ZVB A; 3HXN B; 3HHB A; 1Y31 A; 4PQC A; 3UHB A; 2R50 A; 2RI4 A; 2G14 A; 3ZJP A; 5HLQ A; 1G08 A; 1HSY A; 1DXC A; 1YEU B; 2D60 B; 3PIA A; 1PBX B; 2O5B X; 1BAB A; 2EB9 A; 3LB3 A; 3QJC A; 3WR1 A; 2ZLT A; 3OO5 B; 1WMU B; 2M6Z A; 4NS2 A; 3PI9 A; 3ZJM A; 5M3S A; 1J7Y A; 1MLR A; 2W6V A; 3RJN B; 1UIW A; 4ZVA A; 4HSX A; 2MGJ A; 1IOP A; 2GKN A; 3PT8 B; 1Y0W A; 2OHB A; 2ZLW B; 2HBS A; 1A01 A; 1JY7 B; 3ZJI A; 1YHR A; 1LFT B; 3RGK A; 1YVQ A; 2BLH A; 2QMB A; 5E6E B; 3WCV D; 1XY0 B; 1UX8 A; 1RQA A; 1YZI B; 5AB8 A; 2GTL A; 2BNL A; 3BJ1 A; 2HHB A; 2EVP A; 3TM3 A; 2DN3 A; 4H0B A; 4X0L A; 2GL3 A; 3WCT B; 2ZS0 D; 2ZS1 B; 3MN0 A; 1OR6 A; 1HDA A; 2MHB A; 2DXM B; 4F4O B; 1Y7G A; 1BBB A; 1HGC A; 3QJE B; 1K1K A; 1U7S A; 1J41 A; 5CN9 A; 1SDK B; 3PI4 A; 1QPW B; 5CN8 A; 1NQP A; 3WCU C; 1MWB A; 4M4B A; 2VYW A; 1TES A; 1OUT B; 1LFL B; 1VWT B; 1UC3 A; 3QMA A; 3WCU D; 103M A; 1DWT A; 1NPG A; 1H1X A; 2QLS B; 1KR7 A; 4TYX A; 3EDB A; 1AJ9 B; 3VRG A; 3S65 B; 5HLX A; 3HEO A; 3ODQ A; 1MTI A; 3BCQ A; 2DHB A; 3ONZ B; 5JGG A; 1X9F C; 1JEB B; 3LQD B; 1CLS A; 1V4U B; 2NSS A; 1O1M B; 5EV5 A; 1HRM A; 3SDH A; 2MGA A; 3M38 A; 3AT5 B; 4DC7 A; 1RSE A; 5HLU A; 1GCW B; 1YEO A; 1SHR B; 1CMY B; 1Y4R B; 2AUP A; 1CQ2 A; 2EB8 A; 5E83 B; 2D2N B; 2HZ2 A; 2VYY A; 1JW8 A; 1VRF A; 1LJW A; 3NFE A; 1B86 B; 4O35 A; 1IRD B; 3A59 A; 3GQR B; 1J52 A; 2XKG A; 2QFK A; 4MQC A; 1MYM A; 2FRK X; 5HY8 A; 2ZSZ A; 1JZM A; 2MGK A; 2V1E A; 3WCW A; 4DWU A; 1ABW B; 3KMF A; 5JOM A; 4C0N A; 4NXA A; 1HBR A; 1V4W A; 1BZ1 A; 3OO4 B; 2R1H A; 1J7S A; 2ZFO B; 1Y4P B; 2KSC A; 1ABS A; 1RVW A; 1NZ4 A; 1Y8I B; 5HU6 A; 1LFZ B; 3UHI A; 2D5Z B; 3LHB A; 1Y8K A; 4AVD A; 4PQ6 A; 3O7N A; 2RAO A; 4FWZ A; 2HCO B; 3ZHW A; 5EU2 A; 1AJH A; 1XYE B; 2DC3 A; 1MLK A; 1IWH B; 1HBB B; 3O89 A; 1CQX A; 2O5T X; 1Y22 A; 2AUQ A; 1FCS A; 3QZX A; 1VRE A; 2ZSN A; 1JP6 A; 3GQG B; 1S0H A; 1NZ3 A; 1SDL B; 2SPN A; 2OHA A; 1TU9 A; 3RJ6 A; 1S69 A; 1OFJ A; 1K0Y A; 1O1N A; 1HDS B; 1NIH B; 2NX0 A; 1R1X A; 4O4T A; 1Y8H B; 1YMA A; 1DO7 A; 3UHH A; 1XCH A; 3KMF C; 3VRE B; 1MBC A; 1QSH B; 1MNI A; 1CH9 A; 3WCW D; 1SI4 B; 1PBX A; 3IC2 A; 2D5X B; 4MQI A; 1L2K A; 2MBW A; 1J3Z B; 3A0G A; 2ZSY A; 2W72 C; 1LFQ A; 4G51 B; 107M A; 1M9P B; 1YVT B; 1XXT A; 4O4Z A; 5JDO F; 3BOM A; 1QXE A; 3MJU B; 2SPM A; 4HRR B; 2PEG A; 1Y5F B; 1G0B B; 4M4A B; 1DWS A; 2GDM A; 2QSP B; 1UMO A; 3OZV A; 1HAB A; 4FC3 B; 2FAL A; 1FHJ B; 4F69 A; 3AT6 B; 1FAW B; 1XY0 A; 3UH3 A; 1MTJ A; 3EOK A; 1YZI A; 2VLY A; 1N9X A; 2Z6N B; 2MYA A; 2O5S X; 3G4V A; 4N7O A; 4UUR A; 1O1I B; 106M A; 1MOA A; 1MYJ A; 1SPG A; 1T1N B; 1MNK A; 4MPM A; 3BJ2 B; 2HZ1 A; 5CMV A; 3ZOM A; 1BZ0 A; 1LFY B; 3D1K A; 1EMY A; 2ZWJ A; 1JP8 A; 2MYD A; 1O1J A; 104M A; 1SDK A; 1BUW B; 1MBD A; 3R5I B; 4ESA B; 3AQ7 A; 4F68 A; 2R80 B; 2G0Z A; 3M3B A; 1O1K A; 3K3U A; 1CH5 A; 3KUO A; 1YIE B; 3UHK A; 2HHD B; 1LFV B; 5EUI B; 1VXF A; 3AQ9 A; 2ZLU B; 2G12 A; 1S5Y B; 2QLS A; 1ECN A; 3A5A A; 5CNG A; 1Y0T A; 1YOI A; 1DXT B; 2D2M B; 5C6E B; 1YIH A; 1XZV A; 1HCO B; 4G1V A; 2ZST A; 3S65 A; 2OIF A; 4MAX A; 2NRM A; 3HYU B; 1MWD A; 2BMM A; 3GYS B; 1YG5 A; 3IXF A; 3WCT C; 1HHO A; 2GNV A; 2ZSX A; 1YDZ B; 1AZI A; 4O2G A; 3FH9 B; 1O1M A; 2VRY A; 4WJG 1; 1O16 A; 1RQ3 B; 3ZJR A; 3UHE A; 1MCY A; 2GRF A; 3WCT D; 1LHS A; 1Y8W B; 4MQK B; 4N7N B; 1MBS A; 3D4X A; 4U8U A; 3R0G A; 4NK2 A; 4F6D A; 3UI0 A; 1YEN B; 5CNC A; 3PEL B; 5ILE A; 4AVE A; 1RQ4 B; 1YFF A; 2D2N A; 3GDJ B; 1JF4 A; 3OJ1 A; 1O1O B; 2LH6 A; 112M A; 1M6C A; 1HBA A; 1HBS B; 4NI1 B; 2ZSS A; 3GLN A; 1Y4Q B; 1IRD A; 1X46 A; 3LR7 A; 1PMB A; 1U7R A; 1JZK A; 3UHW A; 2H8F B; 1QI8 B; 1HJT A; 2Z6T A; 1KD2 B; 1THB A; 5SW7 A; 3WHM B; 1MNH A; 6HBW A; 3VAU A; 1GLI B; 3QQR A; 1CG8 A; 1J40 A; 1N9H A; 3NG6 A; 2OLP A; 1YGD A; 1YOH A; 4MQG B; 2ZLX B; 3OVU C; 1YCB A; 1RPS B; 2R4Y A; 2O5M X; 1Y4P A; 2WTG A; 1NS9 A; 5CN4 A; 5CNF A; 5EYJ A; 1NZ2 A; 3WCP B; 5HAV A; 1LFZ A; 1Y09 B; 109M A; 1HBH B; 2V1G A; 2D5Z A; 1IT3 A; 1J7W B; 1YE0 B; 2HBC B; 1MNO A; 3EU1 B; 1EWA A; 3B75 B; 1CO9 A; 1Q1F A; 4L2M A; 1ECA A; 2D2N C; 1MYT A; 3CIU B; 5EQM A; 3D17 A; 5E29 B; 3A9M A; 3UHV A; 1GVH A; 1MYZ A; 5KER B; 1XQ5 B; 3UGZ A; 1NAZ A; 1A00 B; 2GKM A; 1MKO B; 1Y46 B; 5EOH A; 4HHB B; 4F6B A; 1BZ6 A; 2D2N D; 1OUU A; 3G4U A; 4XDI A; 4MXK A; 1SDL A; 1MLF A; 1BZZ B; 1BIJ B; 1J3F A; 1NEJ B; 3MYN A; 4XS0 B; 1R1Y A; 2V1K A; 3D7O A; 2LH1 A; 2FRF A; 1F65 A; 4MQH B; 1CG5 A; 3S1I A; 3WTG A; 3UHZ A; 1FN3 B; 1YHU A; 1Y5J B; 2ZFO C; 3A2G A; 3WCU A; 5AZR A; 1MOD A; 1YMB A; 1B0B A; 3PI8 A; 3P5Q B; 1GZX B; 2ZFO D; 2DN2 B; 4H2L B; 3UHS A; 1M9P A; 1A6M A; 2ZT4 A; 2PGH B; 5MBN A; 1IBE B; 2GLN A; 2ZSO A; 1G0B A; 4WCH D; 2QSP A; 3D1A B; 1ABY B; 1Y7Z A; 1X9F A; 1S61 A; 1MLN A; 1FHJ A; 1COH A; 1DXD A; 1Y0A A; 3QM9 A; 1XZU A; 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1FSL A; 2H8D A; 3A5G A; 1XZ4 A; 1ECO A; 2H8F A; 1C40 A; 1A4F B; 2D2M C; 1QI8 A; 3HF4 B; 3GKV A; 1BJE A; 1HV4 A; 1Y0C A; 1HGA A; 1J3Y B; 4TWU A; 3MJP A; 2EF2 A; 1X3K A; 2AA1 B; 2AUO A; 3A5B A; 1HBG A; 2QU0 B; 3SZK A; 4N7P B; 1LH3 A; 2V1F A; 1LA6 B; 3G4R A; 4MBA A; 1GBV B; 1VXB A; 2MYE A; 1G0A B; 2Z8A A; 1DXV B; 1IT2 A; 2DN1 B; 2HBF A; 2W72 A; 1CPW A; 2ZLV B; 1C7C B; 3WCP A; 5MBA A; 1C7B A; 1HBH A; 1Y4F B; 1GBU A; 1BVC A; 3VHB A; 1A6K A; 1J7W A; 4TWV A; 1Y7C B; 2YRS B; 3B75 A; 3HC9 A; 4FWY A; 3WCV B; 1Y35 B; 3ZJL A; 5E29 A; 4MQJ A; 1V75 B; 1CH2 A; 3QZZ A; 3DHT B; 1DTM A; 1G9V B; 1MYH A; 2ZS0 B; 2HBE A; 2B7H B; 1V5H A; 1VXH A; 3HXN A; 4HRT B; 1DM1 A; 1CH1 A; 1OBM A; 1V9Q A; 3HHB B; 1Y31 B; 3ZH0 A; 2RI4 B; 1YEU A; 2W31 A; 4JAC A; 3NML A; 2HHE B; 1G08 B; 2D60 A; 1GDK A; 2IG3 A; 4MQH A; 3PIA B; 2MGL A; 3OO5 A; 1JPB A; 1BAB B; 1WMU A; 3WR1 B; 1N9I A; 3HEN A; 5ILR A; 2VYZ A; 2ZLT B; 2M6Z B; 3PI9 B; 1J7Y B; 3WFT A; 2W6V B; 1Y83 B; 2V1I A; 1MYF A; 2AV3 A; 3PT8 A; 2GNW A; 2ZLW A; 4ODC B; 3ED9 A; 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