The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
55
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sequence length |
146
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structure length |
146
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Chain Sequence |
SLSAAEADLAGKSWAPVFANKNANGLDFLVALFEKFPDSANFFADFKGKSVADIKASPKLRDVSSRIFTRLNEFVNNAANAGKMSAMLSQFAKEHVGFGVGSAQFENVRSMFPGFVASVAAPPAGADAAWTKLFGLIIDALKAAGK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
X-ray crystal structure of ferric Aplysia limacina myoglobin in different liganded states.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
MYOGLOBIN
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| molecule tags |
Oxygen storage
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| source organism |
Aplysia limacina
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| total genus |
55
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| structure length |
146
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| sequence length |
146
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 1993-07-20 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 4U8U B; 1BZ0 B; 5EYS A; 1MBN A; 2QSS A; 3UH7 A; 2HBE B; 1MYT A; 1MWB A; 5CN7 A; 4TWU A; 1A4F B; 2IG3 A; 3IC2 A; 4F6F A; 4N8T B; 1Y2Z B; 1GCW B; 3ODQ A; 3LR7 A; 3ZJQ A; 1RQA A; 4YU3 A; 1Y5J A; 1G0A B; 3ZJN A; 2YRS B; 3HHB A; 2VLY A; 4NZI A; 2AV3 A; 2Z6S A; 1G0B A; 1O1K A; 1Y4P A; 3SDH A; 4F6J A; 2D5Z B; 5HLU A; 1LJW A; 3RJ6 A; 1JEB A; 1HDB B; 1Y4P B; 3QJE A; 1NPF A; 4H2L B; 2QSS B; 3PI4 A; 2VLX A; 3FS4 A; 6HBI A; 1YGF A; 1HLB A; 2D5X A; 1HGA A; 5AZQ A; 2R4X A; 2AUR A; 1XZ7 A; 3ZJI A; 1V4W A; 5JGG A; 1MLL A; 5ILM A; 1MNK A; 2AUP A; 3IC2 B; 3ODQ B; 2HHE A; 1HAB A; 1RQA B; 4YU3 B; 1Y5J B; 3HHB B; 3UHH A; 1LFV A; 1BUW A; 1G0B B; 1O1K B; 1S69 A; 5E6E A; 1YEQ A; 1MOA A; 2W72 A; 1LJW B; 3KMF C; 4IT8 A; 1JEB B; 4VHB A; 1Y0D B; 4DC8 A; 3HF4 B; 3QJE B; 4NXA A; 1THB A; 2G0R A; 2MGK A; 5HU6 A; 2ZFO A; 1NS9 A; 1NIH B; 2GDM A; 1YHU C; 1YGF B; 2MGC A; 2D5X B; 1HGA B; 2ZFB A; 5E29 A; 1XZ7 B; 5KDQ B; 1V4W B; 5JGG B; 1MYI A; 1VRF A; 1NAZ A; 2LHB A; 4HSX A; 2HHE B; 4PQ6 A; 1HAB B; 2NSS A; 1Y09 A; 1EBC A; 2GRF A; 1VWT A; 1FCS A; 1G09 A; 2DN1 A; 1LH6 A; 1YGD A; 1YCB A; 1BUW B; 3OJ1 A; 4UIQ A; 4O4Z A; 5E6E B; 3UH3 A; 1MKO A; 3ASE A; 1YEQ B; 2W72 B; 5JOM A; 1YCA A; 4LPI A; 2VM0 A; 3V2Z A; 1JL7 A; 4AVE A; 5HU6 B; 2ZFO B; 1NS9 B; 2MGD A; 1EWA A; 2OIF A; 3WHM A; 4FC3 A; 3G4R A; 1NZ5 A; 2G0X A; 2HHB A; 5E29 B; 1ABS A; 5SW7 A; 1A9W A; 1LA6 A; 2ZST A; 3D1K A; 4JAC A; 2MGA A; 1CG5 B; 3M3A A; 3ORD A; 4BJA A; 1Y09 B; 3B75 A; 1A00 A; 1VWT B; 3LB2 A; 1G09 B; 2DN1 B; 1CH1 A; 1OUU A; 1YGD B; 2ZSY A; 4MBA A; 1CH2 A; 3MYN A; 1O1I A; 1JZM A; 2D2M D; 1Y83 A; 1COH A; 1XCH A; 1MKO B; 3PI9 A; 1KR7 A; 2QU0 A; 2GL3 A; 3QM8 A; 1RPS A; 1GDL A; 1UT0 A; 2OHA A; 1IBE A; 1O1O A; 1NWI A; 1RQ3 A; 2ZLX A; 2ZT3 A; 2ZLW A; 1IT2 A; 3WHM B; 1DXD A; 4FC3 B; 1CH3 A; 2HHB B; 5SW7 B; 1SDL A; 2PGH A; 2XKI A; 4C0N A; 1LA6 B; 1CBL A; 3QM9 A; 3D1K B; 2ZT0 A; 1OR6 A; 2GTL A; 3B75 B; 4U8U C; 1A0U A; 1JF3 A; 1OUU B; 1Y0T A; 1YFF A; 1Y83 B; 2GNW A; 2QU0 B; 1HJT A; 3UHC A; 5D5R A; 2AUO A; 1DO3 A; 1X9F D; 1CH7 A; 1RPS B; 1HBH A; 1X3K A; 2O5M X; 1O1O B; 2R50 A; 2V1K A; 4F68 A; 1T1N A; 1RQ3 B; 1SPE A; 2HBC A; 1HBI A; 3NML A; 1DWS A; 2ZLW B; 4MXK A; 4UZV A; 1Y4R A; 2FRJ X; 2ZT2 A; 2VLZ A; 2HZ3 A; 1MLN A; 1SDL B; 2PGH B; 1MTK A; 1YIE B; 4L2M A; 1UIW A; 1NQP A; 5B84 A; 5CN4 A; 5MBA A; 1IOP A; 1A0U B; 1CBM A; 2IN4 A; 5EU2 A; 1LH3 A; 1URV A; 3RGK A; 1KD2 A; 3GK9 A; 1Y5F A; 3ARL A; 3G4U A; 4KJT A; 1Y0T B; 1YFF B; 4MQI A; 3KMF A; 2OH9 A; 3UHK A; 1Y8H A; 5HLQ A; 7HBI A; 2O5Q X; 3AT6 B; 1YVQ A; 2G0Z A; 3MJP B; 1QSI A; 1HBH B; 2MGH A; 4NI0 A; 4HRR A; 1HBR A; 2HBD A; 1T1N B; 2O5O X; 1Y4Q A; 2HBC B; 1YEU A; 1Y4R B; 1CLS A; 3H57 A; 1MLJ A; 1HAC B; 1IWH A; 1RTX A; 2D2N D; 1R1X A; 4DWU A; 1UIW B; 1NQP B; 3S66 A; 4ROL B; 1F5P A; 3EU1 A; 1KD2 B; 4HBI A; 1Y5F B; 1GCV A; 2W31 A; 1U7R A; 3BCQ A; 1OR4 A; 4G51 A; 4MQI B; 5CHQ A; 1JL6 A; 3ZJJ A; 1Y8H B; 1D8U A; 3G53 A; 1YVQ B; 1QSI B; 4F4O A; 4NI0 B; 4HRR B; 1EW6 A; 1HHO A; 1CMY A; 2MHB A; 1HBR B; 2HBD B; 2W6Y A; 1Y4Q B; 3S48 C; 2ZLV A; 2WTH A; 2ZSQ A; 3OVU C; 1CLS B; 3O89 A; 5C6Y A; 1NZ3 A; 1IWH B; 1Y8W A; 1MOD A; 2W72 C; 4O35 A; 1G9V A; 3AQ6 A; 3QZZ A; 1XY0 A; 1R1X B; 2MGB A; 3GOU A; 4F6B A; 4ESA B; 1YDZ A; 2ZT1 A; 3S66 B; 1V4X A; 1CQ2 A; 3PI8 A; 3EU1 B; 2ZFO C; 1CQX A; 1GCV B; 1MOB A; 3CIU B; 1ECN A; 3BCQ B; 5CNG A; 4G51 B; 2LH2 A; 3G4Y A; 3VRE A; 1JWN A; 4F4O B; 3WCV D; 1HHO B; 1CMY B; 1DWT A; 1UX8 A; 3UI0 A; 1DO1 A; 2ZSN A; 2V1J A; 2MHB B; 1YEO A; 2ZLV B; 1YG5 A; 1CH9 A; 4ZVA A; 3QZX A; 2LH7 A; 1NZ4 A; 4OOD A; 1Y8W B; 1YE0 A; 1G9V B; 3TLD A; 1LFL A; 1XY0 B; 1V4U A; 2Z8A A; 3GOU B; 4ZVB A; 3R0G A; 1YDZ B; 1K0Y B; 3D17 A; 3UHG A; 1V4X B; 3VAU A; 3QMA A; 3PI8 B; 1GJN A; 4XDI A; 3NL7 A; 4ILZ A; 3WCU D; 1LH7 A; 2BKM A; 5HAV A; 2GRH A; 2W6W A; 1Y46 A; 3E5O A; 3VRE B; 1CO9 A; 2MGJ A; 3HXN A; 1BZP A; 2QFN A; 1HRM A; 4XS0 A; 4ODC A; 1YEO B; 1VXD A; 3VRG A; 1YG5 B; 4FWZ A; 1Y31 A; 2DXM B; 3UHU A; 2G0S A; 5AB8 A; 3G46 A; 2ZWJ A; 1YE0 B; 1LFZ B; 1Y4G A; 1LFL B; 1V4U B; 1MOH A; 3D17 B; 1J7S A; 2ZSR A; 1CG8 A; 1RQ4 A; 2R4Y A; 2GKN A; 3NL7 B; 1A3N B; 3OZU A; 3A0G B; 4YU4 A; 3S1I A; 3S65 A; 5EV5 A; 3EDA A; 3MJU B; 4F69 A; 1O1M A; 3HXN B; 2GTL C; 4WCH D; 4ODC B; 3ZHW A; 3VRG B; 1C7C A; 1FDH G; 1XYE A; 1MBC A; 1Y31 B; 1MLG A; 1EBT A; 1SI4 B; 1LH1 A; 5E83 A; 1Y4G B; 106M A; 1B86 A; 1BZ1 A; 3WFX A; 1GZX A; 1FDH A; 5ILP A; 1J7S B; 1CG8 B; 1MDN A; 3OK5 A; 1RQ4 B; 3BJ2 A; 3K3U A; 3ZJR A; 1IRD A; 1QPW A; 1XZ2 A; 2HCO A; 1S0H A; 3S65 B; 2PEG A; 3PEL A; 5CN5 A; 1O1M B; 2ZS0 D; 2QRW A; 2EKU A; 1MCY A; 3UBC A; 1VRE A; 3DHT A; 2D6C A; 2VYY A; 3QM6 A; 1Y7C A; 3WTG A; 5HY8 A; 1C7C B; 4M4A A; 1DO7 A; 3O7N A; 4NXC A; 1OFJ A; 2FAL A; 1XYE B; 2CMM A; 3ECZ A; 4MQG A; 1ABY A; 2D2M A; 5E83 B; 5CN8 A; 1B86 B; 1BZ1 B; 2G11 A; 1MNJ A; 1GZX B; 5EYJ A; 5HBI A; 4C44 A; 3MN0 A; 1XZ5 A; 3BJ2 B; 1S61 A; 3FS4 B; 2LH1 A; 1ECO A; 1IRD B; 4M4B A; 1QPW B; 1XZ2 B; 2G3H A; 2ZSO A; 1S0H B; 2PEG B; 1M6M A; 1MYH A; 3PEL B; 3MOU A; 3A59 A; 2HBS A; 5IKS A; 5ILR A; 4B3W A; 3DHT B; 1V5H A; 3HEN A; 2O5B X; 3WCW D; 1OJ6 A; 1Y7C B; 3WTG B; 2GNV A; 5HY8 B; 4M4A B; 1LFV B; 2MBW A; 1RTE A; 4O4T A; 4MQG B; 1ABY B; 1C40 A; 2BLI A; 2LH5 A; 5EQM A; 2D2M B; 3ONZ A; 2BNL A; 6HBW A; 3AT5 A; 1GDK A; 1WLA A; 1Y8I A; 1MLK A; 2RAO A; 1THB B; 2MYD A; 3BOM A; 1X9F A; 3UH6 A; 1Y22 A; 1XZ5 B; 1VXE A; 1DLY A; 1V9Q A; 1YH9 A; 3U3E A; 4M4B B; 2ZFB B; 2H8D A; 2MYB A; 1LHS A; 1J7Y A; 3A5A A; 1J3Z A; 1C7B A; 3AQ5 A; 101M A; 1MZ0 A; 1YOG A; 3A59 B; 2HBS B; 2LH3 A; 1MYG A; 1S5Y A; 1WMU A; 1YMB A; 4KN3 A; 1UVY A; 4FWY A; 1Y85 A; 3QQQ A; 1TES A; 1C40 B; 5EUI A; 3GKV A; 3V2V A; 3DHR A; 3ONZ B; 5EOH A; 3AT5 B; 1SHR A; 2MGM A; 3UBV A; 2ZS1 D; 2RAO B; 1Y8I B; 3BOM B; 4G1B A; 3ECX A; 1X9F B; 1EMY A; 1Y22 B; 1Y0W A; 1URY A; 1A3O A; 1YH9 B; 104M A; 1ECA A; 1YHR A; 2H8D B; 1J7Y B; 1J3Z B; 1DUK A; 1C7B B; 1QI8 A; 1JZK A; 2D2N A; 107M A; 3UHN A; 1YHE A; 2EF2 A; 1S5Y B; 1A00 B; 5JDO F; 2XYK A; 1WMU B; 4DWT A; 2MYA A; 1DWR A; 3ARJ A; 3ED9 A; 1U7S A; 1LHT A; 4NS2 A; 5F2A A; 1Y85 B; 4GZG A; 1BVD A; 1O1I B; 3WCT D; 1COH B; 3PI9 B; 5EUI B; 1HBB A; 2ZT4 A; 3BJ3 A; 1SPG A; 1A01 A; 5B85 A; 1SHR B; 1HBG A; 3LB1 A; 1IBE B; 4AVD A; 5F0B A; 1HSY A; 3IC0 A; 1W92 A; 2ZLX B; 1Y0W B; 5EE4 D; 1GBU A; 1A3O B; 1FAW A; 1YHR B; 1DTM A; 3G4V A; 2MB5 A; 1JP8 A; 1Y4F A; 4N7N A; 5JDO D; 2D2N B; 1YHE B; 1S5X A; 2GTL B; 3A5G A; 2BW9 M; 2ZLU A; 1PMB A; 1TU9 A; 2XKH A; 1I3D A; 1DXU A; 1J3F A; 2ZSX A; 1YMC A; 1HBB B; 2VYZ A; 1FSL A; 1SPG B; 1A01 B; 1VXG A; 4NI1 A; 1H1X A; 3QJC A; 3IC0 B; 2MGE A; 3P5Q A; 1HV4 A; 3WCV A; 1GBU B; 1MNO A; 3H58 A; 1Z8U B; 5AZR A; 1HDS A; 1FAW B; 1N9I A; 2H35 A; 2BMM A; 4X0L A; 4F6I A; 1Y7D A; 1Y35 A; 1HCO A; 1VXC A; 1M6C A; 1Y4F B; 4N7N B; 1BAB A; 1ASH A; 1S5X B; 4HHB A; 2ZLU B; 2W6V A; 1CH5 A; 1JY7 A; 3WFT A; 5KER A; 1Y4V A; 1DXU B; 5MBN A; 4UUR A; 2NX0 A; 3QQR A; 1UX9 A; 5CND A; 5CNF A; 3WCU A; 1MBD A; 2D60 A; 3LB3 A; 3UHV A; 4NI1 B; 3QJC B; 3CY5 A; 3P5Q B; 1HV4 B; 3WCV B; 2MYE A; 1YEU B; 1HBA A; 3VRF A; 2VRY A; 1HDS B; 1NZ2 A; 5M3S A; 2H35 B; 4H0B A; 4X0L B; 1Y7D B; 1Y35 B; 1MLO A; 2HBF A; 1HCO B; 2D2M C; 3ZJM A; 1AJG A; 111M A; 1BAB B; 105M A; 1JDO A; 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3UHI A; 4XS0 B; 2DHB A; 3ZH0 A; 4HRT B; 3SZK B; 4MQK A; 3WCW A; 1R1Y B; 1Y8K B; 4O2G A; 3EOK B; 1AJ9 B; 5JDO E; 2HHD A; 3HC9 A; 3PI1 A; 4MQH A; 1A9W E; 3A2G A; 1JF4 A; 1O16 A; 1J41 B; 2QMB B; 1MLQ A; 3AQ7 A; 1XZ4 A; 4U8U D; 1JW8 A; 4YU4 B; 1Y0D A; 1GDJ A; 1S6A A; 3HF4 A; 1O1J A; 1JP6 A; 4MQJ B; 1Y7Z A; 2GLN A; 1NXF A; 4N7P B; 5EET A; 1YMA A; 4MBN A; 1Y4B B; 2V1I A; 1NIH A; 1YEV B; 1MLU A; 2DHB B; 3UGY A; 3NMM A; 3NG6 A; 4MQK B; 3WCW B; 3D1A A; 1DXC A; 1LFQ A; 1V75 A; 5KDQ A; 1GLI A; 3M3B A; 1GBV A; 2MGL A; 2BLJ M; 1J3Y A; 2HHD B; 3ZJP A; 4MQH B; 3AQ9 A; 102M A; 2VYW A; 1XZV A; 3AG0 A; 2B7H A; 2ZS1 A; 2HZ1 A; 3WCV C; 2H8F A; 2ZSZ A; 1XZ4 B; 3A9M A; 2OHB A; 3OZW A; 1NPG A; 1UVX A; 2HCO B; 1C7D A; 1O1J B; 3PT7 A; 1BIJ A; 1MYJ A; 3UHX A; 1VXB A; 4TYX A; 1Y7Z B; 3HRW A; 1HLM A; 3RJN B; 5CNE A; 1CO8 A; 3TM3 A; 1A6G A; 3LB4 A; 3NMM B; 3NG6 B; 3PIA A; 3D1A B; 1LFQ B; 1V75 B; 1GLI B; 3QJD A; 3UHT A; 1GBV B; 2WY4 A; 1CG5 A; 1UFP A; 3MKB A; 4L7Y A; 3WCT A; 3MVC A; 3WCU C; 1QXD A; 3D4X A; 1G08 A; 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