The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
62
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sequence length |
152
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structure length |
152
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Chain Sequence |
GLSDGEWQQVLNVWGKVEADIAGHGQEVLIRLFTGHPETLEKFDKFKHLKTEAEMKASEDLKKHGTVVLTALGGILKKKGHHEAELKPLAQSHATKHKIPIKYLEFISDAIIHVLHSKHPGDFGADAQGAMTKALELFRNDIAAKYKELGFQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Crystal structures of the nitrite and nitric oxide complexes of horse heart myoglobin.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Myoglobin
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| molecule tags |
Oxygen storage/transport
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| total genus |
62
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| structure length |
152
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| sequence length |
152
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2006-01-19 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| X | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1CH3 A; 3MYM A; 1MYF A; 2DXM A; 5KER A; 1MLR A; 1NS6 B; 2BLJ M; 5HLU A; 1NAZ A; 4U8U D; 2FAM A; 2GRF A; 1VXH A; 3TLD A; 1J7S A; 3OZW A; 2HHD A; 2MGG A; 3PI2 A; 1CP0 A; 1Y0A A; 2D60 B; 3LR7 A; 1IRC A; 2BK9 A; 5EET A; 2D2N C; 1MYG A; 3P5Q B; 1ASH A; 1IT3 A; 1F65 A; 2MGF A; 2G11 A; 1Y4B B; 5C6E B; 3PI8 B; 1NS6 A; 1D8U A; 2W72 C; 1BZP A; 1UFP A; 1Y8K B; 2ZSQ A; 4UIQ A; 3QMA A; 1LH2 A; 1VHB A; 1IBE B; 3P5Q A; 5ILM A; 1EMY A; 1MWC A; 3MVC A; 5ILE A; 1CQ2 A; 3UHT A; 3G52 A; 1Y4B A; 5C6E A; 3PI8 A; 1SDL B; 1Y8K A; 2Z8A A; 4F6F A; 1MYZ A; 1XCH A; 1Y7C B; 2KSC A; 3D1K B; 3BJ2 B; 112M A; 1BJE A; 2ZST A; 1DXV B; 1JP6 A; 5HLX A; 1IBE A; 3UHW A; 1HJT A; 1U7R A; 1HDS B; 3UHH A; 1YGF B; 4HRT B; 4N7N B; 3ECL A; 1SDL A; 2XKG A; 2V1K A; 1CMY B; 2ZFO C; 1J40 B; 1FHJ B; 2HZ3 A; 1Y7C A; 3BJ2 A; 109M A; 2WY4 A; 1DXV A; 3RGK A; 2MGM A; 1PBX B; 1LFL B; 5EQM A; 1HDS A; 1Y09 B; 1YGF A; 2AUR A; 4HRT A; 1VXC A; 2PGH B; 1CH1 A; 4N7N A; 3UH7 A; 4M4A B; 1I3E A; 1NWN A; 1FLP A; 4HSX A; 2EKT A; 1ECO A; 1CMY A; 1A4F B; 1J40 A; 1FHJ A; 1GZX B; 3WFX A; 3G4U A; 3D1A B; 1JL6 A; 2MHB B; 2GKN A; 2GNW A; 1HBS B; 4YU4 B; 1PBX A; 1V4U B; 3E5O A; 1LFL A; 2V1H A; 2QSP B; 3GKV B; 2XYK A; 1YEQ B; 4NI0 B; 1YOG A; 1Y09 A; 5CNE A; 2PGH A; 3QQQ A; 3MKB B; 3GQG B; 3WCW B; 1MLO A; 1HBR B; 1NGK A; 4M4A A; 1A4F A; 1Y85 B; 3UHV A; 1GZX A; 3D1A A; 2MHB A; 1MBS A; 2LH6 A; 1HBA B; 1YMB A; 1HBS A; 2EVP A; 2QMB B; 1MZ0 A; 1MNO A; 4YU4 A; 1YVT B; 1V4U A; 1AJ9 B; 2QSP A; 5KKK A; 1YEQ A; 4NI0 A; 1JZM A; 1LJW B; 1DLW A; 3MKB A; 3GQG A; 3WCW A; 1CH5 A; 1HDA B; 3E5I A; 1OUT B; 1Y85 A; 1QXE B; 3MOU A; 1DXU B; 2ZLU B; 3BJ1 B; 1HBA A; 2MGA A; 2QMB A; 1YVT A; 1A9W E; 4UUR A; 1AJ9 A; 4FWZ A; 1HGB B; 1V07 A; 2FRJ X; 1R1X B; 3PEL B; 1LJW A; 1UVX A; 1HDA A; 2H35 B; 1OUT A; 1OFJ A; 1QXE A; 1YEU B; 1DXU A; 1ABS A; 4OF9 A; 2ZLU A; 1DO7 A; 4G1B A; 4U8U C; 1A3N B; 3BJ1 A; 1NZ2 A; 3R0G A; 3PI3 A; 1WMU B; 1HGB A; 111M A; 1G08 B; 5HBI A; 2LH3 A; 1YHR B; 3WCV B; 1R1X A; 3PEL A; 1QI8 B; 1Y01 B; 5EYJ A; 1XQ5 A; 2H35 A; 1J41 B; 1MLM A; 1YEU A; 4WJG A; 4L7Y B; 3KMF C; 2G0Z A; 2D5Z B; 1A3N A; 4SDH A; 1G0B B; 1MWB A; 3H58 A; 1WMU A; 2HHE B; 2DHB B; 3VAU A; 1G08 A; 6HBW B; 1YHR A; 3WCV A; 2AA1 B; 1UFJ A; 1WLA A; 2MB5 A; 1QI8 A; 2ZSX A; 1JZK A; 3ZJL A; 1MLU A; 3MBA A; 1J41 A; 3D4X B; 4M4B B; 1CBM A; 110M A; 2MBW A; 4L7Y A; 1ECA A; 2D5Z A; 1LH1 A; 1G0B A; 2BLI A; 3BOM B; 4TYX A; 3UHK A; 1YDZ B; 3WFU A; 1XXT B; 2HHE A; 3WFT A; 2BNL A; 1V5H A; 1URV A; 2DHB A; 5JGG B; 6HBW A; 2ZLT B; 2AA1 A; 1UVY A; 1DTM A; 1CP5 A; 1IWH B; 3KUO A; 1EWA A; 2ZS1 D; 2QSS B; 1CBL A; 3D4X A; 1RTX A; 4M4B A; 3UGZ A; 4JAC A; 1BVD A; 1YMC A; 2G14 A; 3QM8 A; 1VXB A; 2MYD A; 4KMV A; 2MGH A; 3BOM A; 5CND A; 1YDZ A; 3AT5 B; 1XXT A; 1T1N B; 1MTI A; 2GLN A; 3GLN A; 4N8T B; 5JGG A; 1U7S A; 3NMM B; 1IWH A; 1B86 B; 4NK2 A; 1Y7D B; 4TWV A; 2QSS A; 1C40 B; 3UHZ A; 3ZOM A; 1IT2 A; 1FSX B; 1URY A; 5CHR A; 1OJ6 A; 3K9Z A; 1Y0W B; 1BZZ B; 4GZG A; 3AT5 A; 1T1N A; 2O5Q X; 3ZH0 A; 3ZHW A; 1MCY A; 3ODQ B; 3HXN B; 2D2N B; 4MQH B; 4XS0 B; 4N8T A; 2GDM A; 5E83 B; 3NMM A; 1B86 A; 1JP9 A; 1QPW B; 2G12 A; 4O4Z A; 1Y4R B; 3QM9 A; 1Y7D A; 3G4Q A; 1C40 A; 4KN3 A; 1OUU B; 3G4V A; 1FSX A; 3OZV A; 1GVH A; 3D17 B; 1LUE A; 2W72 B; 1XZ7 B; 1Y0W A; 2R1H B; 1BZZ A; 4UZV A; 1MDN A; 1X9F D; 2MGD A; 1TU9 A; 5SW7 B; 1Y8H B; 3ODQ A; 3HXN A; 3S1I A; 1H1X A; 5JOM A; 2NSS A; 2D2N A; 4MQH A; 4XS0 A; 5E83 A; 4FC3 B; 1DWS A; 5ILP A; 2LH5 A; 2QU0 B; 2VYY A; 1K1K B; 1QPW A; 1Y4R A; 1HCO B; 2ZLX B; 1OFK A; 4O4T A; 1OUU A; 5CNG A; 1XZU B; 1HLM A; 1YCA A; 3D17 A; 2W72 A; 1XZ7 A; 1CPW A; 2R1H A; 1HGC B; 1HRM A; 5M3S A; 3MJU B; 5SW7 A; 1Y8H A; 4N7O B; 1MLF A; 2MGK A; 3UHR A; 1DWR A; 5ILR A; 2IG3 A; 4FC3 A; 1A01 B; 1HLB A; 2QU0 A; 1BZ1 B; 1K1K A; 1S5Y B; 1J7Y B; 1HCO A; 3UHQ A; 2VLY A; 1X46 A; 2ZLX A; 2GTL B; 1N9X A; 1SPE A; 1XZU A; 1Y0C B; 4HRR B; 2ZFO B; 5HLQ A; 2LHB A; 3QJB B; 1HGC A; 1IDR A; 3UHE A; 3MJU A; 2G0S A; 1O1P B; 4N7O A; 108M A; 3BJ3 B; 3PI9 B; 1CH9 A; 4PQB A; 2ZS0 D; 1A01 A; 1MYH A; 1CG8 B; 1BZ1 A; 1JDO A; 1S5Y A; 1J7Y A; 1PMB A; 4MU5 A; 2H8D B; 2GTL A; 5KDQ B; 4NS2 A; 1MYM A; 3LB3 A; 2EF2 A; 1UMO A; 1Y0C A; 3A5G A; 3WCT D; 1YHE B; 4HRR A; 2ZFO A; 3QJB A; 5HU6 B; 3E4N A; 3UBC A; 3A9M A; 1O1P A; 1Y7Z B; 1RQA B; 3BJ3 A; 3PI9 A; 3AT6 B; 1DTI A; 1BIN A; 1CG8 A; 1EW6 A; 2V1I A; 1O1J B; 5AZQ A; 2H8D A; 5KDQ A; 2MGE A; 3LB4 A; 3G4R A; 5CNF A; 2MGB A; 1MYI A; 2ZT2 A; 1LA6 B; 4NXC A; 2LH7 A; 5CNB A; 3AQ6 A; 3WI8 A; 1YHE A; 4MXK A; 5HU6 A; 3GK9 A; 3EDB A; 1F63 A; 1RVW B; 1Y7Z A; 1RQA A; 1CG5 B; 3AT6 A; 3LQD B; 1NWI A; 2BW9 M; 1O1J A; 1C7C B; 1LA6 A; 5CNC A; 3WCW D; 1YG5 A; 4PQC A; 5EE4 D; 1M9P B; 1KD2 B; 1O1N B; 2VHB A; 3HEP A; 3WR1 B; 2XKI A; 3EDA A; 2FAL A; 2R4W A; 1RVW A; 1CG5 A; 1HSY A; 1YOH A; 5HAV A; 1MLG A; 3LQD A; 2FRF A; 2SPN A; 2GTL C; 1N9F A; 2W6Y A; 5EOH A; 3A59 B; 1DXD A; 1YE0 B; 4HSW A; 3LB1 A; 1MLH A; 2W6W A; 1DXT B; 3M3B A; 1C7C A; 1HV4 B; 3G46 A; 1CO8 A; 4KJT A; 4ODC B; 1M9P A; 3HEN A; 1KD2 A; 1O1N A; 3WR1 A; 5JDO F; 3WCU D; 1MOH A; 3UBV A; 5MBN A; 3HF4 B; 1MNH A; 4U8U B; 3MN0 A; 3UHU A; 3OVU C; 2HCO B; 4NI1 B; 3A59 A; 2GNV A; 3GYS B; 3ZJJ A; 1YE0 A; 1JEB B; 1DXT A; 2OIF A; 3ZJR A; 1HV4 A; 1NQP B; 2R4X A; 1V9Q A; 3IXF A; 4ODC A; 1LH3 A; 105M A; 106M A; 1YCB A; 4OOD A; 4NZI A; 4MQK B; 1ABW B; 3RJN B; 3G53 A; 2D5X B; 2OHB A; 5D5R A; 2ZWJ A; 1VXD A; 3MYN A; 1J3Y B; 2R4Z A; 3HF4 A; 1QXD B; 1S6A A; 4U8U A; 2WTH A; 1NIH B; 2MYC A; 2FRK X; 1X9F C; 2HBG A; 2GRZ A; 4AVE A; 2HCO A; 3PI1 A; 4NI1 A; 1FSL A; 1BBB A; 1CLS B; 3GYS A; 1HAB B; 1JEB A; 4FH6 A; 2VLZ A; 2G10 A; 1NQP A; 2W6V B; 1GLI B; 1MLL A; 3ECX A; 5B84 A; 4MQK A; 1O1L A; 1ABW A; 2D5X A; 1XZ2 B; 1BVC A; 1MKO B; 1JL7 A; 1J3Y A; 2NRM A; 1BZ0 B; 2O5B X; 1QXD A; 3KMF A; 1Z8U B; 1NIH A; 1JY7 B; 3ECZ A; 3AQ8 A; 4MXL A; 4G1V A; 1CLS A; 1HAB A; 1JF3 A; 1XZ5 B; 3LHB A; 3M38 A; 1MBC A; 4ROM B; 2W6V A; 3NG6 B; 2R50 A; 1GLI A; 4FWY A; 1C7D B; 1KFR A; 2SPO A; 1Y5J B; 1GCV B; 1LFY B; 1MYT A; 1LFZ B; 4L2M A; 1XZ2 A; 1YHU D; 1MKO A; 1BZ0 A; 3B75 B; 1JY7 A; 2BLH A; 2IN4 A; 2D2M D; 1HHO B; 3A0G A; 1XZ5 A; 1CIK A; 3ZJH A; 2EKU A; 3WTG B; 1MLK A; 1XQ5 B; 4ROM A; 2ZS0 C; 3NG6 A; 1Y46 B; 2G3H A; 1J7W B; 3EU1 B; 1C7D A; 2W6X A; 5CN8 A; 1S0H B; 3UHB A; 1Y5J A; 1GCV A; 1LFY A; 1YEV B; 1A3O B; 1LFZ A; 3M39 A; 3LR9 A; 1L2K A; 1MOC A; 1Y35 B; 3B75 A; 2M6Z B; 2ZSY A; 1SHR B; 3WCT C; 3WFW A; 1MGN A; 1LFT B; 2HBE B; 3BA2 A; 1UC3 A; 1JPB A; 3QJD B; 1HHO A; 3GQR B; 1NEJ B; 1MBN A; 3WTG A; 1Y46 A; 2ZSZ A; 1J7W A; 3EU1 A; 1S0H A; 4NXA A; 1YEV A; 1A3O A; 2VLX A; 2AUP A; 1MLS A; 1Y35 A; 2M6Z A; 1SHR A; 2BWH A; 4MAX A; 4KMW A; 1LFT A; 2HBE A; 1O16 A; 3QJD A; 3GQR A; 1NEJ A; 1FDH A; 1Y31 B; 7HBI A; 4NK1 A; 1NXF A; 1N9H A; 1CH2 A; 2ZFB B; 1RQ3 B; 5E29 B; 5EE4 C; 4MBA A; 5JDO D; 1XZV B; 1YZI B; 1A9W A; 1XYE B; 2BKM A; 1RPS B; 1O1O B; 4WJG 1; 2ZSS A; 3QZX A; 1J3Z B; 4DWU A; 1Y31 A; 2YRS B; 3UHN A; 3FS4 B; 3OK5 A; 4O35 A; 1VXA A; 2ZFB A; 1SI4 B; 1RQ3 A; 3H57 A; 3ZJM A; 1GDL A; 5E29 A; 5CN4 A; 1EBC A; 3IC0 B; 2SPM A; 2NSR A; 3QQR A; 1AZI A; 1XZV A; 1YZI A; 1QSH B; 1MNJ A; 3ARJ A; 1XYE A; 1Y45 B; 2Z6N B; 1RPS A; 1O1O A; 1GBU B; 2ZSN A; 3WCU C; 1J3Z A; 1XZ4 B; 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3ARL A; 1YH9 A; 1LH5 A; 3MJP A; 1GBV A; 1Y4V B; 1GJN A; 5B85 A; 4F4O A; 4DC7 A; 1HAC A; 2ZT0 A; 1RQ4 A; 1Y4Q B; 1G9V A; 1S69 A; 3AQ9 A; 3G4W A; 2EB8 A; 1FDH G; 5CN5 A; 2H8F A; 1FAW A; 4O2G A; 3O89 A; 4LPI A; 1BUW A; 1I3D A; 3NL7 B; 4VHB A; 1LH6 A; 2DN1 A; 4MQG A; 1Y5F A; 5HY8 A; 1MTJ A; 1X9F B; 2QRW A; 1Y4V A; 5IKS A; 1HBH B; 1YG5 B; 1HBI A; 1Y4Q A; 4C0N A; 1DUK A; 3QM5 A; 5F2A A; 3IC2 B; 3NL7 A; 2E2Y A; 1QSI B; 3AQ7 A; 5JDO C; 3CY5 B; 3ED9 A; 3SZK B; 1X9F A; 3SDH A; 1IRD B; 1FN3 B; 3HHB B; 1JP8 A; 3S48 C; 2D60 A; 3UGY A; 3ZJS A; 1HBH A; 5EUI B; 1A0Z B; 4XDI A; 3QZZ A; 3LB2 A; 2ZS1 C; 3HRW B; 2ZSO A; 2ZSR A; 2W31 A; 3IC2 A; 1Y4F B; 3BCQ B; 5D1V A; 1QSI A; 1ECD A; 1JF4 A; 3CY5 A; 1YIH B; 3SZK A; 1IRD A; 1TES A; 1Y4G B; 3DHR B; 1FN3 A; 3HHB A; 1JW8 A; 3GOU B; 3K8B B; 1GDK A; 1WVP A; 1GDJ A; 5EUI A; 1A0Z A; 4B3W A; 4F6I A; 2ZLW B; 3UHX A; 3K3U A; 5F0B A; 1HDB B; 2ZS0 B; 2MGI A; 1R1Y B; 3O7N A; 3QJC B; 1HGA B; 3HRW A; 1F5P A; 3S66 B; 2V1F A; 4H0B A; 5EYS A; 1X3K A; 3QM6 A; 1Y4F A; 4PQ6 A; 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