2H35 | Genus

Total Genus 38

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	38
sequence length	146
structure length	146
Chain Sequence	VHLTPEEKSAVTALWGKVNVDEVGGEALGRLLVVYPWTQRFFESFGDLSTPDAVMGNPKVKAHGKKVLGAFSDGLAHLDNLKGTFATLSELHCDKLHVDPENFRLLGNVLVCVLAHHFGKEFTPPVQAAYQKVVAGVANALAHKYH

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

loadScript /static/js/j2s/core/package.js

loadScript /static/js/j2s/core/corejmol.z.js

loadScript /static/js/j2s/core/corescript.z.js

JSmol exec jmolApplet0 start applet null

Jmol JavaScript applet jmolApplet0__4969208754499044__ initializing

Jmol getValue debug null

Jmol getValue logLevel null

Jmol getValue allowjavascript null

AppletRegistry.checkIn(jmolApplet0__4969208754499044__)

vwrOptions:

{ "name":"jmolApplet0","applet":true,"documentBase":"https://genus.fuw.edu.pl/view/2H35/B/","platform":"J.awtjs2d.Platform","fullName":"jmolApplet0__4969208754499044__","codePath":"https:/static/js/j2s/","display":"jmolApplet0_canvas2d","signedApplet":"true","appletReadyCallback":"Jmol._readyCallback","statusListener":"[J.appletjs.Jmol object]","syncId":"4969208754499044","bgcolor":"white" }

setting document base to "https://genus.fuw.edu.pl/view/2H35/B/"

Jmol Version: 14.29.13 2018-04-17 17:17

java.vendor: Java2Script (HTML5)

java.version: 2018-01-28 23:38:52 (JSmol/j2s)

os.name: Mozilla/5.0 AppleWebKit/537.36 (KHTML, like Gecko; compatible; ClaudeBot/1.0; +claudebot@anthropic.com)

Access: ALL

memory: 0.0/0.0

processors available: 1

useCommandThread: false

appletId:jmolApplet0 (signed)

Jmol getValue emulate null

defaults = "Jmol"

Jmol getValue boxbgcolor null

Jmol getValue bgcolor white

backgroundColor = "white"

Jmol getValue ANIMFRAMECallback null

Jmol getValue APPLETREADYCallback Jmol._readyCallback

APPLETREADYCallback = "Jmol._readyCallback"

callback set for APPLETREADYCallback Jmol._readyCallback APPLETREADY

Jmol getValue ATOMMOVEDCallback null

Jmol getValue AUDIOCallback null

Jmol getValue CLICKCallback null

Jmol getValue DRAGDROPCallback null

Jmol getValue ECHOCallback null

Jmol getValue ERRORCallback null

Jmol getValue EVALCallback null

Jmol getValue HOVERCallback null

Jmol getValue IMAGECallback null

Jmol getValue LOADSTRUCTCallback null

Jmol getValue MEASURECallback null

Jmol getValue MESSAGECallback null

Jmol getValue MINIMIZATIONCallback null

Jmol getValue SERVICECallback null

Jmol getValue PICKCallback null

Jmol getValue RESIZECallback null

Jmol getValue SCRIPTCallback null

Jmol getValue SYNCCallback null

Jmol getValue STRUCTUREMODIFIEDCallback null

Jmol getValue doTranslate null

language=en_US

Jmol getValue popupMenu null

Jmol getValue script null

Jmol getValue loadInline null

Jmol getValue load null

Jmol applet jmolApplet0__4969208754499044__ ready

script 1 started

platformSpeed = 8

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Oxygen storage/transport
source organism	Homo sapiens
publication title	A new strategy for structure determination of large proteins in solution without deuteration pubmed doi rcsb
molecule keywords	Hemoglobin alpha subunit
total genus	38
structure length	146
sequence length	146
chains with identical sequence	D
ec nomenclature
pdb deposition date	2006-05-22

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
B	PF00042	Globin	Globin

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
1.10.490.10	Mainly Alpha	Orthogonal Bundle	Globin-like	Globins	2h35B00

5SW7A 1CLSB 3OO4B 2ZT1A 3IC0B 3G4UA 1MGNA 3G4WA 4IT8A 4PQBA 4NI0A 1XZ5B 1HACA 1H97A 5CN8A 3PT8B 1HBIA 4O4ZA 2QU0B 1V75B 1JF4A 3LR7A 5CNEA 1UX9A 3QJBB 3D1KB 1A3NA 2ZLUA 2W6XA 3QJDB 4HRTB 3QJCB 1LH5A 1CPWA 1XXTB 1Y4FB 1XCHA 1LHTA 1TESA 1Y09B 5JDOE 5EETA 1X9FA 4F68A 1Y35B 1RVWA 1HBHA 2G0XA 5CNCA 4L7YB 1MKOB 4FH6A 1YFFA 4NZIA 1Q1FA 1LFYB 3AQ8A 3GKVA 3MOUA 3M3AA 1CQ2A 1LFVB 4NK1A 3GQRB 1ABWB 1ABYB 2HZ3A 1S5XB 1G0BB 1XZ2A 1FHJB 2HBFB 3A2GA 1C7DA 1A9WE 1YGDA 4YU4A 1HCOA 4ZVAA 1DWRA 3WI8A 1HGBB 1YEVA 2VYYA 4ESAA 1V5HA 2D5ZB 1RQ4B 4U8UD 1J7SA 2R4ZA 1YHUC 2DN2B 1HDSA 3NFEB 1JY7B 2MGMA 1FSLA 1WMUA 3K8BA 3ARLA 3DHRA 1A0ZA 1LFQB 1LFTA 1YMCA 3WCTD 3UH5A 1HBBB 2GTLC 3NMMA 1G09B 1THBA 2LHBA 2ZLTB 1Y7ZB 1G0AA 1Y7DB 1YENB 3UHYA 1MLKA 1Y85B 1EBTA 2DHBA 1NS6B 3PI4A 3QZXA 4L2MA 3DHTA 4HHBB 1A0UB 3B75B 1I3DA 4MQKA 4LPIA 2Z6TA 1Y4VB 3U3EA 1LFZA 1QPWB 2VLZA 1MLQA 3OZVA 1NQPB 1V07A 5E29A 3HXNA 1JP6A 3VRFB 1UT0A 4PQ6A 3TM9A 4B4YA 2QSPB 3A59B 5CHRA 4H0BA 1NWIA 1HV4A 2OH8A 3UHRA 1MWDA 3CIUA 5HLUA 1DXUA 1SDKA 1A01A 3IC2B 4KMWA 1Y7GB 2VYZA 5SW7B 3UHCA 1VXEA 1YEUA 2HBDA 1R1YA 5CNFA 1DM1A 4SDHA 3UHQA 1GJNA 3UGZA 1A4FA 1CQXA 5JGGA 2BWHA 2GDMA 1HACB 3WCVA 1UVXA 1JP9A 1IWHB 3E5OA 5AB8A 1M9PB 3WCUC 3GQGA 4DWTA 4UURA 4AVEA 5KERA 1Y8KA 1ECNA 1FN3A 1YE2B 4N7OA 1QXEB 1UFPA 2VEEA 1N9IA 2EKUA 1A3OA 1CMYA 2SPMA 1X9FB 1MDNA 1HBHB 3UGYA 5EU2A 2C0KA 2QMBA 2O5BX 1LH1A 1MBDA 3WR1A 1BZRA 1DLYA 3GKVB 3EDAA 3V2VA 1Y22A 2MGAA 1K0YB 1QI8B 3DUTB 3D7OA 3ZJIA 1XZ2B 1Y4RA 3S66B 4M4BA 3QM9A 3OK5A 1J7YA 4IROA 1HCOB 103MA 4ROMA 3PI9A 3MJPA 1BZPA 2MGFA 6HBWA 1YEVB 1YHUD 1R1XB 4ESAB 1RTXA 2G3HA 104MA 1OFKA 2D2MA 1MTKA 3OVUC 2HBSA 1GDIA 4NK2A 1IBEB 1J7SB 1HBSA 1LTWA 1HDSB 1Y5JB 2AV0A 1VXFA 4MXLA 2LH7A 2W31A 1J7WA 4KJTA 2FRIX 3K8BB 1AJ9A 3W4UA 1EW6A 1YE0A 2GTLD 4N8TA 1A0ZB 2O5SX 3ZJQA 3CY5A 2R1HA 1LFTB 3UHHA 3MYNA 2W6WA 1AJGA 3NMMB 1HGAA 1THBB 1Y31A 3DR9A 3UHWA 4N7NA 5MBAA 2NRMA 111MA 4MQKB 2RI4A 4O2GA 1LFZB 2O5TX 3HYUB 3ZJSA 1CLSA 2WTHA 4ILZA 3OO4A 3IC0A 3G4QA 5E29B 3HXNB 1CIOA 2SPLA 1MBIA 1O1KB 1MYZA 2D60B 1HV4B 2H8DB 3PT8A 2W72C 2AV3A 1MOCA 4VHBA 1O1JB 2QU0A 1UC3A 3UHBA 3HC9A 5HAVA 1U7RA 3QJBA 1YEUB 2JHOA 2AA1B 2BLHA 1CP0A 1GCWB 5ILEA 4HRTA 3VAUA 1A4FB 2QLSB 4MBAA 5B84A 3WCUD 2ZSPA 3QM5A 3O89A 1Y09A 3MBAA 3WFTA 2NX0A 1C40A 1Y35A 1FDHG 4L7YA 3WCWA 1MKOA 1F5OA 1NGKA 4UZVA 3AQ5A 1QXDA 1FN3B 4N7OB 2LH6A 1YHRB 4C0NA 3G4RA 1ABYA 1S5XA 1MBCA 4MBNA 1FHJA 3A5BA 2HBFA 1A3OB 1SHRA 1CMYB 1C7BB 1JF3A 2MYEA 1DXTA 2DC3A 4JACA 2MBWA 1GDLA 1S56A 1HGBA 3ZJHA 1MLMA 1MWCA 1OR4A 1MOHA 1EWAA 1IDRA 1IRCA 3NFEA 2KSCA 1MYTA 4F6FA 4M4BB 2BLJM 5D5RA 3D4XB 1GDJA 1FCSA 1Y8HA 2VM0A 1OR6A 5EOHA 1YG5A 1V4WA 4KN3A 5CNDA 5CN9A 3ZJOA 6HBWB 2O5MX 1GLIB 5C6YA 1CG5B 1OFJA 1WLAA 2D2MB 3HEPA 1VREA 1VWTB 2HBSB 3ASEA 2LH1A 2FRFA 1G09A 3EOKA 3BOMA 3ZJNA 3PT7B 1HBSB 1F63A 3G4VA 1MNJA 2ZLTA 2V1JA 4ODCB 3WCTC 1YEOA 1Y7DA 1X46A 1YENA 2HBEA 2MGJA 3P5QA 2VLXA 1NS6A 3TM3A 2ZSYA 1S5YB 4HHBA 1YE0B 1Y45B 1Y4VA 2G0RA 3KMFC 3SZKB 1QPWA 2R1HB 2O5OX 4F6JA 4FWZA 1SPGB 1JL7A 2FAMA 3A0GB 1NQPA 1RTEA 1HGAB 1Y31B 1L2KA 2ZS0A 3VRFA 5CN7A 3LB4A 3A59A 2CMMA 1CG8A 4N7NB 3ONZB 1Y4GB 3S65B 1Y5FA 2RI4B 1PBXB 1YOGA 3IC2A 1FDHA 1BABB 1Y7GA 2ZLVB 1FLPA 2LH3A 2V1IA 1RPSB 2NSSA 1YEQA 3G53A 2QSSA 3AT6B 1ITHA 1DO7A 2DN1A 2EF2A 1N9XA 3GYSB 3UHDA 5CN6A 1IWHA 3PIAB 2OH9A 4ROLA 2R4WA 1MTIA 1M9PA 1O1LB 1VRFA 2ZFBB 1F65A 4FWXA 3UI0A 1YE2A 3OGBA 3UHSA 1QXEA 3HEOA 3ARKA 2HBGA 4OF9A 1MWBA 3WFUA 1BVCA 3K3UA 1NPFA 1YGFB 1S0HA 4XDIA 1C40B 1MLGA 2AURA 7HBIA 1HABB 1V4XA 3WCWB 1CP5A 1MOBA 2SPOA 3HF4B 1BUWA 1QXDB 3ARJA 4F6IA 1K0YA 1QI8A 1JZMA 3DUTA 2O5QX 1KR7A 2O5LX 4QAUA 3QQRA 3S66A 1Y4BB 1SHRB 2DXMA 3A9MA 1U7SA 3UHIA 1JDOA 1DXTB 1O16A 1NZ5A 1NAZA 2ZSTA 1X9FC 1G08B 1R1XA 1C7CB 1BIJA 5MBNA 1IBEA 2ZLXA 4JYQA 1Y5JA 2QFKA 1Y4QA 2MB5A 1HSYA 1SWMA 1EBCA 1Y8HB 2H35A 4FC3A 3LR9A 1YG5B 1V4WB 2AUQA 1A00A 1LH2A 2ZS1A 2YRSA 1HDBB 3EOKB 3BOMB 1LH6A 1LH7A 3WTGB 1MLUA 1YEOB 2HBEB 3AG0A 3P5QB 1KD2A 1JPBA 1J41A 5HY8B 112MA 2LH5A 3HYUA 2ZSZA 4H07A 1NZ2A 1V4UB 3D17A 4WJGA 4TYXA 2OHBA 1QSHA 2ZS0B 3FS4B 2ZSOA 1MODA 1YVQB 2VYWA 3ORDA 1O1KA 2D60A 1CG8B 1FSXB 2ZT2A 2H8DA 3ZJJA 1CO8A 101MA 1GZXB 1Y5FB 3S1IA 1O1JA 1IT3A 3UHGA 2D2NA 1CH4A 4PNJA 2OLPA 1BBBA 2AA1A 1UX8A 3AQ6A 1ASHA 1GCWA 1YEQB 2MGDA 1ECAA 3UHNA 1DKEA 3ZOLA 1A6GA 2QSSB 2VRYA 2QLSA 1CBMA 2DN1B 2ZLWB 1Y0CA 5HBIA 1MTJA 4NXCA 4ROLB 1MLRA 4TWUA 1YIEA 3R0GA 2V1KA 1O1OA 4MQIB 1YHRA 3IXFA 1MLSA 3AQ9A 4XS0B 2ZT4A 1S0HB 1X3KA 4UIQA 1Y46A 2G12A 2D6CA 1C7BA 3MJUA 3WCVC 3UHZA 1RQ3B 1V4XB 1MNOA 3ZOMA 3A5GA 2EB8A 1BUWB 3BJ3A 5AZRA 1Y0AA 1SPEA 4KMVA 1DXCA 4HBIA 2XKHA 4MAXA 1XZUA 1J3YA 3A5AA 2DXMB 1YMAA 1X9FD 3D4XA 2G10A 1YHUB 3MN0A 3ZHWA 3QJEA 1ECOA 1GLIA 1CG5A 1O1NA 4F69A 1DLWA 5EQMA 1VWTA 3G4YA 1DWSA 1BIJB 5HLQA 1BINA 1J40B 1MLHA 3PT7A 5EV5A 2ZLXB 4DC7A 4ODCA 2R4XA 1Y4QB 3EU1B 2GTLB 1AZIA 1GBVA 2V1GA 2H35B 1S5YA 4PQCA 1Y45A 4FC3B 1Y0WB 5CNBA 3SZKA 4O1TA 3ED9A 1A00B 1SPGA 2O58X 2ZS1B 2ZSSA 1ABSA 4ZVBA 2YRSB 3A0GA 3HHBA 1SI4A 2FRKX 3GLNA 2EB9A 1LA6B 108MA 1JZLA 5E6EA 2MYBA 1JP8A 2D2MC 4TWVA 1BVDA 1MLFA 3ONZA 3S48C 1Y4GA 3S65A 4X0LA 1NXFA 1KD2B 5C6EB 5EUIA 1M6CA 1PBXA 2RAOA 1J41B 3WHMB 1BABA 106MA 2ZLVA 4MQGB 1HGCA 3RJNB 1W92A 1RPSA 2EKTA 1A9WA 3D17B 1QSHB 4H2LA 3AT6A 3V2ZA 2MGBA 2DN3B 1YCBA 2MGEA 1VXDA 5CMVA 3GYSA 3FH9A 1XZ4B 3PIAA 5ILPA 2ZFOB 1GBUB 4OODA 1DO3A 2D2NB 2SPNA 1O1LA 2BKMA 3ZJRA 1BBBB 2HHDA 2XKGA 2ZFBA 1LFLB 1HLBA 3WCUB 3UH3A 1DKEB 3HRWA 4G1VA 3VRGA 3BJ1B 1YGFA 5B85A 2GL3A 1Y0CB 1YIHA 3WCPA 1CBLA 1CO9A 1HDAA 1UIWA 1XQ5B 1HABA 4HRRA 3BJ2A 2G14A 2M6ZA 1Y8IB 1MYFA 1VXAA 1YIEB 3HF4A 2EVKA 1RQAB 3LB2A 1O1OB 4MQJA 1HJTA 1VXCA 3WCVD 1Y4BA 1G9VB 1JZKA 2ZSXA 1DO4A 1Y46B 1O1PB 1B0BA 3MJUB 1MNHA 3E55A 1G08A 1NEJB 3BJ3B 1C7CA 1MNKA 1QSIB 3ZH0A 3WCWC 1Y0AB 3GQPA 1XZUB 3BCQA 1J3YB 2GRHA 1LH3A 1LUEA 2GKMA 1RSEA 5KKKA 1COHA 3D1AB 3NG6A 3E5IA 1LHSA 4F6BA 3ZJLA 1DXVA 3QJEB 3M3BA 3AT5B 1CH2A 1O1NB 3WFWA 1BZ1B 1YHEA 4MQCB 1HDBA 2R80A 2R4YA 5F0BA 1Y0DB 3WTGA 1FAWA 3HENA 3ZJPA 1UVYA 1Y4PA 3PI3A 4N7PB 1GBVB 2BMMA 5E83A 1XZVB 3ECLA 3ZJMA 5HY8A 2GLNA 2D2MD 1NS9B 3HHBB 1SI4B 4WJG1 1LJWB 1V4UA 1OBMA 2HZ1A 3FS4A 2FRJX 5E6EB 1CH1A 1YVQA 3ODQB 3UBCA 1VXHA 2VLYA 1YZIA 1FSXA 3SDNA 3VREA 4X0LB 1JWNA 1GZXA 1OJ6A 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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2H35B

Total Genus

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structure length

Chain Sequence

Structure visualization

Chord Diagram

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