2HBC | Genus

Total Genus 57

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	57
sequence length	146
structure length	146
Chain Sequence	VHLTPEEKSAVTALWGKVNVDEVGGEALGRLLVVYPWTQRFFESFGDLSTPDAVMGNPKVKAHGKKVLGAFSDGLAHLDNLKGTFATLSELHCDKLHVDPENFRLLGNVLVCVLAHHFGKEFTPPVQAAYQKVVAGVANALAHKYH

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

loadScript /static/js/j2s/core/package.js

loadScript /static/js/j2s/core/corejmol.z.js

loadScript /static/js/j2s/core/corescript.z.js

JSmol exec jmolApplet0 start applet null

Jmol JavaScript applet jmolApplet0__5402403406198846__ initializing

Jmol getValue debug null

Jmol getValue logLevel null

Jmol getValue allowjavascript null

AppletRegistry.checkIn(jmolApplet0__5402403406198846__)

vwrOptions:

{ "name":"jmolApplet0","applet":true,"documentBase":"https://genus.fuw.edu.pl/view/2HBC/B/","platform":"J.awtjs2d.Platform","fullName":"jmolApplet0__5402403406198846__","codePath":"https:/static/js/j2s/","display":"jmolApplet0_canvas2d","signedApplet":"true","appletReadyCallback":"Jmol._readyCallback","statusListener":"[J.appletjs.Jmol object]","syncId":"5402403406198846","bgcolor":"white" }

setting document base to "https://genus.fuw.edu.pl/view/2HBC/B/"

Jmol Version: 14.29.13 2018-04-17 17:17

java.vendor: Java2Script (HTML5)

java.version: 2018-01-28 23:38:52 (JSmol/j2s)

os.name: Mozilla/5.0 AppleWebKit/537.36 (KHTML, like Gecko; compatible; ClaudeBot/1.0; +claudebot@anthropic.com)

Access: ALL

memory: 0.0/0.0

processors available: 1

useCommandThread: false

appletId:jmolApplet0 (signed)

Jmol getValue emulate null

defaults = "Jmol"

Jmol getValue boxbgcolor null

Jmol getValue bgcolor white

backgroundColor = "white"

Jmol getValue ANIMFRAMECallback null

Jmol getValue APPLETREADYCallback Jmol._readyCallback

APPLETREADYCallback = "Jmol._readyCallback"

callback set for APPLETREADYCallback Jmol._readyCallback APPLETREADY

Jmol getValue ATOMMOVEDCallback null

Jmol getValue AUDIOCallback null

Jmol getValue CLICKCallback null

Jmol getValue DRAGDROPCallback null

Jmol getValue ECHOCallback null

Jmol getValue ERRORCallback null

Jmol getValue EVALCallback null

Jmol getValue HOVERCallback null

Jmol getValue IMAGECallback null

Jmol getValue LOADSTRUCTCallback null

Jmol getValue MEASURECallback null

Jmol getValue MESSAGECallback null

Jmol getValue MINIMIZATIONCallback null

Jmol getValue SERVICECallback null

Jmol getValue PICKCallback null

Jmol getValue RESIZECallback null

Jmol getValue SCRIPTCallback null

Jmol getValue SYNCCallback null

Jmol getValue STRUCTUREMODIFIEDCallback null

Jmol getValue doTranslate null

language=en_US

Jmol getValue popupMenu null

Jmol getValue script null

Jmol getValue loadInline null

Jmol getValue load null

Jmol applet jmolApplet0__5402403406198846__ ready

script 1 started

platformSpeed = 8

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Oxygen transport
source organism	Homo sapiens
publication title	High Resolution X-Ray Structures of Myoglobin-and Hemoglobin-Alkyl Isocyanide Complexes pubmed rcsb
molecule keywords	HEMOGLOBIN A (ETHYL ISOCYANIDE) (ALPHA CHAIN)
total genus	57
structure length	146
sequence length	146
ec nomenclature
pdb deposition date	1994-08-31

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
B	PF00042	Globin	Globin

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
1.10.490.10	Mainly Alpha	Orthogonal Bundle	Globin-like	Globins	2hbcB00

1LH5A 3UHXA 3D7OB 1XZ5A 3BJ1A 5CNBA 1HBBB 1MBAA 1Y2ZB 3OK5A 3NG6B 3GQPA 1XCHA 5EOHA 2MBWA 3OZVA 1YMCA 3NFEA 1DO7A 1MLQA 2MGCA 3QM9A 1G09B 1VXGA 3WHMA 1Y7CB 1DO3A 2VLXA 1JWNA 1S5XB 2ZSXA 5ILRA 1MTKA 1S6AA 3GKVB 1JP6A 2GTLB 4MQJB 2G14A 5D5RA 1NS9A 1QPWB 3QM6A 1T1NB 1SDKA 2ZLVA 1HGAB 4UURA 1KR7A 1FDHA 1J41B 2Z6NB 1YE2B 3WCVD 1URVA 2RI4A 1YVTB 2H8DB 1YDZA 2B7HA 3BCQA 1MOAA 5CHQA 1O1OA 1GBUA 3D1AA 2ZT1A 1SWMA 1YGDA 3UHCA 1MTIA 1GZXB 3K8BB 1G0BB 2ZSPA 5E29B 2GKNA 4MQGB 1X9FD 3E55A 1YEQB 2D2MD 1SHRA 2GKMA 3M38A 1Y4GB 3ODQB 1MKOA 1YHRB 2ZLWA 101MA 1M6MA 4HSWA 1R1YB 4G1VA 1HDBA 1O1IA 3U3EA 1OUTB 4F69A 2VEBA 4FH7A 4PQCA 1Y0CA 1LHSA 3UHZA 1UFPA 1C7DA 1GDIA 3DHRA 2H8FB 2HBDA 2SPNA 3GYSA 3TLDA 1J7SA 2MGFA 1VHBA 5ILPA 1Y35A 1MLLA 1RSEA 1CBLA 2D2NA 2ZWJA 3ASEA 1YG5B 4C44A 2HBCA 3SZKB 1DXVA 1GJNA 1FDHG 1HCOA 1VXAA 2ZFOB 5CHRA 5F0BA 1LFVB 3ZH0A 1SI4B 3ZOLA 2DN2A 2BKMA 2W72A 3LHBA 1YENA 2LHBA 5B85A 3HRWB 1RPSA 2R4YA 3PI8A 2ZS0B 3WCPA 1J40B 1OFKA 1UC3A 1BVDA 1FHJB 2GL3A 4NI0B 1Y4FB 1MBOA 1XZ7A 1MLFA 3GQGA 3PI3A 3CIUB 1VRFA 1V4UB 2EF2A 1Y7DA 3CY5A 1XXTA 3D17B 1Y22A 1J7YB 1Y09A 1IRCA 4L7YB 1F5PA 3ARKA 3WCTB 1YMBA 1NAZA 2BK9A 4MQIB 1MNKA 2VM0A 2DC3A 1MODA 3PIAA 1A00A 1Y0WA 1IBEB 1MLMA 2MGEA 2YRSA 4U8UA 3WR1B 3WCUA 3FH9A 3GK9A 1LFQB 1AJ9B 2ZSQA 1A3NB 1Y5JA 3HYUB 1YEUB 2MYAA 1IT3A 3OZWA 1FSLA 1SDLA 1WMUA 3LR9A 1V75B 1J52A 1UT0A 3ZJHA 1S0HA 1NZ2A 1YE2A 2MGBA 2W72C 3PI9A 1RVWB 1O1NA 1HV4B 3HEPA 3A2GA 3ZJIA 1EW6A 1XYEB 3RJ6A 1O1PA 2QSSA 1SPGA 3HF4A 1FAWB 1C7BB 2ZS1D 3S66B 3H58A 3VAUA 1CG8B 3AT6B 1GZXA 1NWNA 1F63A 3UGZA 4MQGA 3G52A 3ZJMA 3UBCA 3KUNA 4OF9A 3PT7B 3IC2B 5SW7B 2ZLXB 4MQKA 4F6IA 1ECAA 1BBBB 2NSRA 2GRZA 4O35A 1A6KA 3NMLA 1MOCA 4YU4A 1HBAB 5E83A 1GBVA 1AJGA 2ZT4A 1NZ3A 4U8UC 3WCUC 1Y4BA 3QJEB 1MNOA 2QSPA 5JDOF 4DC7A 1LFZA 1IRDB 4HHBB 3WFWA 3ECXA 1XZ2B 6HBWA 1C7CA 2DXMA 1GLIB 2PGHA 3BOMA 2VLZA 3UHYA 1VXDA 2QU0A 1A6GA 3ZJQA 5C6EB 1FCSA 1BIJB 2V1FA 1Y83B 2MYDA 2HBFA 1M6CA 4NXAA 5JDOE 3BJ2A 4MAXA 3UHEA 5AZRA 3G53A 5ILEA 5CNEA 1M9PA 2DN1A 3FS4B 2BWHA 109MA 5HY8B 4H07A 1YH9B 4HRRA 1RTXA 1MBSA 1RQAB 4ZVAA 1BZ0A 1JY7B 1J40A 3VHBA 1XZVB 4F4OA 4MXLA 2DHBB 2HBGA 2QMBA 1BJEA 1CLSA 3BJ1B 3NL7A 1MWCA 1U7RA 5EE4D 2EB9A 1DWRA 3UHQA 3PT8B 1QXEA 5HLUA 2Z8AA 3GQPB 3SDNA 1HDAA 3NFEB 3WHMB 1Y7GA 3VRGA 2FAMA 1CG5B 1HLBA 1QSHA 102MA 4DWUA 2HCOB 1NS9B 1JL7A 2O58X 2G3HA 1SDKB 2ZLVB 2MGKA 1Y45A 1V75A 1HSYA 4NK2A 5CN4A 2CMMA 1HLMA 1IWHA 1HV4A 2RI4B 1MYIA 1YDZB 2B7HB 1Y8WA 1HBGA 3BCQB 3QQRA 1A6MA 1XYEA 2VYWA 2HBSA 1O1OB 3D1AB 3B75A 3D1KA 1YGDB 2W6VA 1CIOA 2SPOA 2G0ZA 1XZ4A 2ZSSA 5KERA 1BVCA 3QZZA 3IC2A 2EVKA 1V5HA 2ZLXA 2EVPA 5EU2A 1SHRB 1LH7A 1MKOB 1DLWA 4JYQA 3OO4A 2ZT2A 1HDBB 1FSXA 1O1IB 5MBAA 1YIEA 3VREA 3VRFA 1MLJA 5E6EA 5EV5A 1LFTB 4IT8A 1Y0CB 2OHBA 2V1GA 1O1KA 2BLJM 1C7DB 3DHRB 1GLIA 2KSCA 2HBDB 1NGKA 5JGGA 1CBMA 3GYSB 1J7SB 2QFNA 2AUQA 1A0ZA 4VHBA 1Y35B 1S69A 3ORDA 3A9MA 2Z6TA 1MLNA 2FRKX 5ILMA 2VEEA 3IA3B 1CO8A 1A01B 2HBCB 1DXVB 1HBHA 3GOUA 3WCVA 1HCOB 3FS4A 4IROA 1LFYB 1NQPA 5EYSA 2DN2B 4B4YA 1URYA 2W72B 1YENB 1RQAA 3WCWD 1O1MA 1RPSB 1Q1FA 1CP0A 2G0SA 3EU1A 3PI8B 3WCPB 3PI1A 1YGFA 1Y46B 1XZ7B 3GQGB 1X9FA 2NSSA 1BZ6A 1Y7DB 4TYXA 3CY5B 1DUKA 1XXTB 1JZMA 1Y22B 2D2MA 1JW8A 1Y09B 3S65A 1NS6A 1J7WA 3ZJOA 1OR6A 1UVYA 3PT8A 2QRWA 1ABWA 1COHA 2H35A 1A6NA 2Z6SA 3PIAB 1A00B 1Y0WB 1MZ0A 4L2MA 2ZLUB 1YHUD 103MA 2YRSB 2R80A 3OJ1A 1CG5A 4U8UB 3WCUB 3FH9B 1H1XA 4OODA 1Y5JB 1A9WA 2HCOA 1PMBA 1HRMA 1I3DA 1YIHA 2MB5A 1SDLB 3EDAA 3UHNA 1WMUB 1MGNA 1O16A 1OBMA 3G4QA 1V4XA 1Y31A 2EB8A 1Y4PA 3UHTA 3WCVC 1MTJA 1S0HB 2HHEA 4KMVA 1MYZA 3WI8A 1V4WA 2PEGA 3K3UA 3PI9B 1O1NB 2ZSOA 4ESAA 1NZ4A 3S1IA 1RQ3A 3M39A 4B3WA 4ZVBA 2MGHA 1O1PB 2QSSB 1BINA 1SPGB 3HF4B 2BLHA 1X9FC 1YOIA 2MGLA 3ECLA 1WLAA 2D60A 2D2MC 3A59A 1L2KA 2C0KA 2WY4A 4X0LA 2LH5A 5JDOD 4MQKB 1CQXA 2ZSRA 5HU6A 1MYHA 1MDNA 4YU4B 1A3OA 2LH7A 1GBVB 5E83B 1NEJA 1GCWA 1Y4BB 2QSPB 1LFZB 2O5LX 2DN3A 1LFTA 1CMYA 1MLKA 1THBA 1Y8IA 6HBWB 1DWSA 1C7CB 1MNHA 2DXMB 2PGHB 3BOMB 2MGJA 4NI1A 1QI8A 2QU0B 4AVDA 3G4RA 1DWTA 5HBIA 3IXFA 3ZJPA 2HBFB 2W6WA 1MYFA 3BJ2B 4FH6A 1A01A 1VXCA 2GLNA 1Y4QA 1M9PB 2DN1B 4TWUA 2WTGA 5MBNA 1LFYA 1VWTA 1BZ1B 3UHUA 4HRRB 1EMYA 1NIHA 1BZ0B 2O5BX 2ZS1A 2O5OX 4F4OB 1GVHA 1Y46A 3KMFA 2ZLTA 1DUOA 2QMBB 4O4TA 1CLSB 1K1KA 3NL7B 1BABA 2GDMA 1QXEB 1HACA 1HDAB 3UHWA 2AV0A 3A5AA 2ZLUA 3HC9A 1HABA 1Y7GB 3VRGB 4KJTA 1QSHB 1JP9A 2AUOA 1Y45B 1UIWA 1CH4A 5B84A 4BJAA 1KD2A 3UHDA 1B0BA 3MJUA 5AB8A 1A4FA 1MLSA 1LUEA 1HGCA 2AURA 4XS0A 4F6FA 1IWHB 1Y8WB 1A0UA 3PI4A 4M4BA 2IN4A 2ZS1C 1DTMA 4PNJA 2HBSB 4YU3A 2D2ND 1R1XB 3B75B 3D1KB 3V2ZA 1JP8A 4PQ6A 1Y8KA 2W6VB 3KMFC 5CN9A 1XZ4B 2V1KA 5KERB 3V2VA 3W4UA 1BZPA 1X46A 2HBEA 1GDKA 3QMAA 2ZSZA 1ITHA 2GNWA 3QJCA 2D5XA 2RAOA 1JZKA 2XYKA 1YOHA 3OO4B 4LPIA 3UHRA 2R50A 1HHOA 4NXCA 1MLOA 1QXDA 3ZJRA 1FSXB 3QJBB 2AV3A 1IOPA 1YIEB 3VREB 3VRFB 1MWDA 3MYMA 4O2GA 5E6EB 3D4XB 3UHGA 1O1KB 4FWXA 1ABYA 1W92A 1DXTA 3LB3A 5JGGB 3AG0A 1FN3A 1A0ZB 3HHBA 1J3FA 2GTLD 4FC3A 2BLIA 3DHTA 1LA6B 2ZSNA 2R4XA 1HBHB 1LTWA 1LFLA 2HZ1A 3GOUB 3M3BA 3WCVB 2NRLA 4IROB 1NQPB 3UHHA 1BZ1A 3PELA 3S48C 4MQCA 4ODCB 3UH6A 3KUOA 1O1MB 3MJPA 3EU1B 1G08A 1MOHA 3UHVA 3ZJSA 1YGFB 1X9FB 5EE4C 1IT2A 5JOMA 1V9QA 1CPWA 2G11A 3A5GA 2D2MB 3S65B 1O1LA 2R1HA 1NS6B 2MGDA 1J7WB 1HBIA 1CO9A 1JL6A 1Y8HA 1CQ2A 1ABWB 2FRJX 1NZ5A 1COHB 2H35B 3OZUA 1JEBA 2O5QX 3BJ3A 4O1TA 106MA 1MBNA 4HRTA 2LH6A 3MKBA 1Y4VA 1K0YA 1DXDA 2R80B 1G0AA 1MOBA 4WJGA 2SPMA 1J3ZA 1GCVA 2MGGA 1YIHB 1LHTA 1AZIA 2FRIX 1V4XB 1Y31B 2FRFA 2HZ3A 1Y4PB 2MGAA 1MBCA 1C40A 1N9XA 2MHBA 2HHEB 2E2YA 1V4WB 2PEGB 1RTEA 4DC8A 2ZT3A 4ESAB 2O5MX 1YZIB 2OIFA 5CN5A 3WFTA 1RQ3B 3PI2A 2VRYA 3GQRA 3LQDA 1ECDA 4AVEA 1UVXA 1R1XA 2W6YA 2D5ZA 2MYEA 1NPFA 2D60B 3A59B 3MOUA 2QLSA 2ZFOD 4X0LB 2G0VA 1DKEA 1TU9A 1CH1A 1MBDA 1YOGA 5HU6B 4N7PA 2ZS0D 1YE0A 1A3OB 4MQHA 1NEJB 3LB1A 2G0XA 1GCWB 1YHUA 1I3EA 1DXUA 2AA1A 2O5SX 3QJBA 1YHEA 1NXFA 3WCTD 2DN3B 3D4XA 3WTGA 1S5YA 1CMYB 1THBB 3G4UA 3QJDA 1BUWA 1Y8IB 3MVCA 2Z85A 2MYBA 1CH5A 1EBCA 4ROLA 3OGBA 4NI1B 5HLXA 1QI8B 3UHIA 1Y85A 3R0GA 1Y0DA 2G0RA 2QFKA 1UX9A 1XZUA 3MN0A 1LA6A 1HGBA 5CNFA 1N9HA 1DLYA 1Y4QB 1G9VA 1S61A 3WCWC 1VWTB 4N7OA 5HAVA 4ODCA 4H2LA 3BA2A 1NIHB 3AQ6A 2ZS1B 1DM1A 2W31A 2HHDA 2V1JA 1O1JA 2ZLTB 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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2HBCB

Total Genus

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structure length

Chain Sequence

Structure visualization

Chord Diagram

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