The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
60
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sequence length |
141
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structure length |
141
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Chain Sequence |
VLSAADKTNVKAAWSKVGGHAGEYGAEALERMFLGFPTTKTYFPHFDLSHGSAQVKAHGKKVGDALTLAVGHLDDLPGALSDLSNLHAHKLRVDPVNFKLLSHCLLSTLAVHLPNDFTPAVHASLDKFLSSVSTVLTSKYR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
The structure of horse methaemoglobin at 2-0 A resolution.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
HEMOGLOBIN (AQUO MET) (ALPHA CHAIN)
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| molecule tags |
Oxygen transport
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| source organism |
Equus caballus
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| total genus |
60
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| structure length |
141
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| sequence length |
141
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 1977-02-14 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 4XS0 A; 1Y4P A; 2MGA A; 1Y4F A; 2SPO A; 1FSX B; 1T1N A; 3WCT B; 1S5Y B; 5HY8 B; 1HBG A; 3ZOM A; 1HAB A; 1GCV B; 1J3Y B; 3UHH A; 1FHJ B; 4L7Y A; 2NRM A; 2H35 A; 2KSC A; 3M3B A; 1ECA A; 3R5I A; 3HXN B; 2FRK X; 1YVQ A; 4PQB A; 5CN8 A; 2MYC A; 2GLN A; 3H58 A; 5EE4 C; 3UHE A; 3OO4 B; 1YHU B; 2QFN A; 2R50 A; 1MKO B; 4B4Y A; 1IDR A; 5KER B; 3G4R A; 1CG5 A; 2W72 A; 3DUT B; 2GRH A; 2OHA A; 1J7Y A; 1MOB A; 3S66 A; 1G0A A; 1Y7Z A; 1Y0D B; 3WI8 A; 5AZQ A; 1GCW B; 1UC3 A; 3WR1 A; 3WTG A; 1OUU B; 2O5L X; 3GYS B; 3FS4 A; 2DN2 A; 1FCS A; 2XKI A; 3QM6 A; 3HRW B; 3QJE B; 1Y83 A; 1HDS A; 1RVW A; 1XYE A; 1SDL A; 1Y5K B; 3E5O A; 2AA1 B; 1MTK A; 2R4Z A; 3AQ9 A; 3LB3 A; 4H07 A; 4KJT A; 1Y0W B; 2G14 A; 3UHK A; 1WMU A; 2HCO B; 4F6D A; 2BW9 M; 2DHB B; 2VEB A; 4N7P A; 4NZI A; 1X9F B; 2ZT0 A; 109M A; 1LA6 B; 1DXV A; 2ZT4 A; 3D4X B; 1LFL B; 1Y0A A; 5KDQ B; 3D1A B; 2ZS1 A; 1Y8H B; 3GQP A; 1UFJ A; 3E55 A; 3B75 A; 3SDN A; 2YRS A; 1ABS A; 3PI2 A; 1MLL A; 1HBH B; 1J7S A; 4MQH B; 4KN3 A; 1COH B; 3WHM A; 1BVD A; 4KMV A; 3PT7 A; 3V2V A; 3QJC A; 4DWU A; 3P5Q B; 1SHR A; 4ESA A; 4U8U C; 3TLD A; 5F0B A; 1D8U A; 2O5T X; 1KD2 B; 1DXU B; 1CLS A; 1NPF A; 3ECL A; 3AT6 B; 1YDZ A; 3PI8 B; 3QJB B; 2HHD B; 3S48 C; 1GBU A; 1J3F A; 3WCP B; 1A9W A; 1XZ4 B; 1HBB B; 2MYD A; 1Y8W A; 2EKU A; 3H57 A; 1JWN A; 1YHR A; 1R1Y A; 2M6Z A; 2DN3 A; 1YMA A; 4WCH D; 1JEB B; 1HLB A; 3PI9 A; 1YE0 B; 4PQ6 A; 2SPN A; 1LFZ B; 2QU0 A; 1MGN A; 1V75 A; 1YCA A; 1DO7 A; 3GOU B; 1FN3 A; 1MBO A; 1MWC A; 1O1J B; 3QM8 A; 4AVD A; 2QLS A; 4WJG A; 3VRE B; 1VHB A; 4ROL A; 3UHR A; 3DHT B; 1EBC A; 3ODQ B; 1MWD A; 2JHO A; 4MAX A; 4HRR A; 1IRD A; 2RAO A; 2ZSX A; 1SWM A; 3OK5 A; 4JYQ A; 1BZ0 A; 2R80 A; 1A3O B; 1YHE B; 2QSS B; 3ZJR A; 1A3N A; 1VXD A; 1YHU C; 1Y7G A; 1AJG A; 1MLM A; 2H8F B; 1VXG A; 5CMV A; 1VWT B; 1R1X A; 1MDN A; 1MYH A; 3ZOL A; 3LB1 A; 1QSI A; 4F68 A; 4UZV A; 3ZJI A; 3PI1 A; 2V1E A; 1C7C B; 1HV4 B; 1OR4 A; 5CN4 A; 3EOK A; 2DXM A; 1JP6 A; 3ED9 A; 4ODC B; 3QZX A; 1YEU A; 1ITH A; 4QAU A; 2BLJ M; 1DKE B; 3ZJH A; 3NL7 B; 1CH5 A; 1Y85 B; 4M4A B; 1PMB A; 1BBB A; 1LTW A; 4MQC A; 3K8B B; 1ABW A; 2MGM A; 1DWR A; 1Y4P B; 4DC8 A; 1Y4F B; 3UHQ A; 1CO8 A; 3AQ8 A; 3KMF A; 4IRO A; 1T1N B; 3V2Z A; 3HEN A; 5CNE A; 2H8D B; 3D17 B; 1NQP A; 2ZLV B; 1XZ5 A; 1QPW A; 2H35 B; 1SPG B; 1EBT A; 2BMM A; 3ZJJ A; 3HEO A; 3IC0 A; 5ILE A; 3R5I B; 1YGD A; 4N8T A; 2VRY A; 3MN0 A; 1NEJ B; 1JW8 A; 1Y09 B; 3UGZ A; 4MXL A; 3PEL A; 3AQ5 A; 5JDO E; 1J7W B; 4NK1 A; 1RQ4 B; 1XY0 A; 5F2A A; 1Y46 B; 2GTL D; 5HU6 B; 1G0A B; 1Y7Z B; 4KMW A; 4UUR A; 1Z8U B; 1CH3 A; 3WR1 B; 2D2M D; 1DTI A; 1Y4Q B; 2HHB B; 1A4F A; 2DN2 B; 2FRF A; 1Y83 B; 1XYE B; 1IWH A; 1Y5F B; 1C7D A; 1HBS A; 2HBD B; 2MYE A; 1ECD A; 1HGA A; 4YU4 A; 5C6E B; 3UHN A; 1Y4V A; 104M A; 106M A; 3SDH A; 1MBN A; 3FH9 B; 102M A; 2ZT3 A; 1S5X B; 2OH8 A; 3GKV A; 1A6G A; 3PIA A; 1DXV B; 1YE2 A; 1NPG A; 1Y35 A; 2Z6S A; 1GDJ A; 1OJ6 A; 1O1P B; 1ASH A; 3B75 B; 1V4U B; 2VLZ A; 1YH9 A; 2E2Y A; 4H2L A; 1FSL A; 3MVC A; 1N9F A; 3PI4 A; 3IC2 B; 2ZLW B; 2AUR A; 3S65 A; 3QJC B; 1SDK A; 3PT8 A; 1HGB A; 1IBE A; 5JDO C; 4G51 A; 4L2M A; 3E4N A; 2Z6T A; 3GKT A; 1J40 A; 1CLS B; 1DLY A; 2G0R A; 1IT2 A; 1Y8K A; 2HBE A; 1YDZ B; 4LPI A; 1BIJ B; 1YZI A; 1YIH A; 1S0H A; 1YVT A; 1N9I A; 2VEE A; 1CIK A; 1JY7 A; 1V4W B; 4X0L B; 6HBW B; 2AV0 A; 1YHR B; 3WCV C; 3UBC A; 5EE4 D; 2M6Z B; 2DN3 B; 1Y22 B; 3G53 A; 3UHU A; 3BA2 A; 5JDO F; 3VRF A; 2ZS0 B; 1LFV A; 3WCU B; 3MJP A; 1HAC B; 1J3Z B; 1F5P A; 4NI0 B; 2QLS B; 1HDA A; 4ROL B; 3OZU A; 2MGC A; 2VHB A; 5CN7 A; 5CNB A; 1Y4G B; 2ZSS A; 1BZZ A; 1KR7 A; 2PGH A; 1Y7D A; 1IRD B; 5E29 A; 2RAO B; 2G10 A; 1XZ7 A; 1C7B A; 1BZ0 B; 4YU3 A; 3W4U A; 4MPM A; 1A0U B; 2ZLU B; 1Y7G B; 1QSH A; 5D1V A; 1XXT A; 5JGG A; 2MHB A; 1R1X B; 112M A; 2ZT1 A; 1AJ9 B; 4MQG A; 3EU1 A; 1MLF A; 1YOH A; 3LB4 A; 4FWZ A; 1J41 B; 3SZK A; 1RQA A; 2D2N C; 3WFT A; 3WCW D; 1A9W E; 1JP8 A; 4MBA A; 3QMA A; 3A9M A; 2O5Q X; 1LH3 A; 2MB5 A; 2QMB B; 1GLI B; 2RI4 A; 1BIN A; 2HBF B; 1CH2 A; 1XQ5 B; 3GK9 A; 2EB9 A; 1WVP A; 1XZV B; 1ABY B; 1NIH A; 4U8U D; 5CNF A; 3HF4 A; 1O1L B; 4O1T A; 1DTM A; 3ECX A; 4UIQ A; 1XZ5 B; 1HCO A; 3OO5 B; 5ILP A; 1MLH A; 1G08 B; 2W6Y A; 2GRF A; 1BUW B; 2W31 A; 3NG6 A; 4MQI A; 3QJD A; 4AVE A; 1U7S A; 2R1H A; 2Z85 A; 4O4Z A; 3S1I A; 1BVC A; 1SPE A; 3ONZ B; 2D60 B; 1S6A A; 3UH3 A; 2FAL A; 3PEL B; 3K9Z A; 5EUI A; 3AT5 A; 5EYJ A; 2V1K A; 3HHB B; 4XDI A; 1MOH A; 3CIU A; 1MCY A; 1PBX A; 1XY0 B; 4MQJ A; 3KUN A; 1YEO B; 1KFR A; 1UFP A; 4F6I A; 2D5Z A; 1Y0C B; 2G0S A; 3OGB A; 2ZT2 A; 4TYX A; 1YG5 B; 3ECZ A; 3PI3 A; 3UHD A; 1NZ2 A; 2DN1 B; 2MBW A; 1VXA A; 1OUT A; 3NFE A; 2NSR A; 1N9X A; 1LJW A; 3CY5 A; 1YHU D; 4HRT B; 1IWH B; 2V1I A; 1HBS B; 1K0Y A; 1NWN A; 2MYA A; 1MBA A; 1Y4V B; 2ZS0 C; 3GQR A; 3IA3 B; 1LHS A; 2ZLT A; 3WCU C; 1URV A; 3MKB A; 3UH6 A; 1YEQ A; 2CMM A; 2ZLX A; 4DC7 A; 1MBD A; 1O1N B; 1Y7C A; 1MTI A; 2V1F A; 4B3W A; 5C6Y A; 1HDB B; 1Y35 B; 2O5M X; 2G12 A; 2Z6N B; 3NML A; 1DWT A; 4N7O A; 4O35 A; 2XYK A; 3HYU B; 1A6N A; 4H2L B; 2B7H A; 4IT8 A; 1G0B B; 2G0V A; 2QFK A; 1DXT B; 1EMY A; 5B85 A; 1C40 A; 2ZFB B; 3BOM B; 3QM9 A; 1FAW A; 5HLU A; 1LHT A; 1GVH A; 1NXF A; 4FC3 A; 3S65 B; 2D2N A; 3BJ2 A; 5AZR A; 3S1J A; 2ZSZ A; 2GTL A; 1EW6 A; 3IXF A; 3A0G B; 2LH1 A; 2VLY A; 1UVX A; 2D2M A; 1J40 B; 1RPS B; 1UMO A; 4G1B A; 1G9V A; 4H0B A; 1DWS A; 3ASE A; 1YZI B; 3BCQ B; 3UH7 A; 3DHR B; 3UBV A; 4PNJ A; 3WCW C; 3M39 A; 3D1K A; 3LB2 A; 1BAB A; 3GDJ A; 1G09 B; 1GBV A; 1LFY A; 2LH2 A; 2QSP B; 2QRW A; 4JAC A; 3VRF B; 1QXD B; 1MYJ A; 3MOU A; 1LH1 A; 3ARJ A; 1GDI A; 1Y5J A; 2GRZ A; 1OFJ A; 1MLU A; 1QXE A; 1Y2Z A; 1VXH A; 4HSW A; 1H1X A; 5E29 B; 1GZX A; 1XZ7 B; 1C7B B; 4FH7 A; 1YGF A; 1HBR A; 5EV5 A; 1VXF A; 1B0B A; 1BZ1 A; 3D7O A; 1MLK A; 1O1K A; 3UHY A; 1Y4B A; 4ZVB A; 1YOG A; 1MBS A; 3UHT A; 5SW7 B; 3WCT C; 1RQA B; 2ZSQ A; 1B86 A; 1CQX A; 4M4B B; 4N7N B; 4MXK A; 1CG8 B; 1RQ3 B; 3BJ1 B; 1CH4 A; 1MLQ A; 3BJ3 B; 3U3E A; 1M9P A; 3ZH0 A; 2PEG B; 3A5A A; 1NIH B; 1JDO A; 4NI1 B; 5JDO D; 2MGL A; 1MLJ A; 1O1I B; 1LFT A; 4FWX A; 3G52 A; 2ZFO B; 5CN5 A; 1S61 A; 3NG6 B; 4MQK A; 4MQI B; 3TM9 A; 4HHB A; 3ORD A; 3ZHW A; 3WCV D; 3UHC A; 2XKG A; 2V1H A; 2SPM A; 5M3S A; 1LH5 A; 3MJU A; 3AQ6 A; 1ECN A; 1HBA B; 1O1O B; 1HHO A; 1CMY A; 4XS0 B; 4FH6 A; 5JOM A; 1Y0T A; 2W6V A; 5D5R A; 3WCW A; 2MGI A; 4MQJ B; 2BKM A; 2G11 A; 1DLW A; 2GKN A; 3AQ7 A; 4TWV A; 3MYN A; 1HAB B; 1MNJ A; 2GDM A; 2O58 X; 1X9F C; 1GDK A; 4L7Y B; 5ILR A; 3LR9 A; 1OUT B; 1CO9 A; 3CY5 B; 1OR6 A; 1MBI A; 1YVQ B; 2NSS A; 1MYM A; 2MGF A; 5CHQ A; 2WTH A; 4U8U A; 2ZLT B; 3MKB B; 1CPW A; 3VRG A; 2HBG A; 2NX0 A; 1VRE A; 4VHB A; 1CG5 B; 2W72 B; 2D2N D; 1YEN A; 1J7Y B; 2R4Y A; 1YCB A; 1YIE A; 2EB8 A; 3S66 B; 1MNI A; 1Y31 A; 2BWH A; 3WTG B; 3FS4 B; 2B7H B; 3ZJL A; 1HDS B; 1RVW B; 1FAW B; 1SDL B; 3WCT A; 1LH2 A; 1M6C A; 3M38 A; 3BJ2 B; 1GCV A; 1J3Y A; 2SPL A; 2Z8A A; 3UHB A; 1FLP A; 2O5O X; 108M A; 1WMU B; 2D2M B; 110M A; 2BNL A; 4N7P B; 1LH7 A; 1F65 A; 2MGK A; 3DR9 A; 3OO4 A; 1YHU A; 1Y0A B; 1BAB B; 5HAV A; 2ZS1 B; 4ROM A; 1JL6 A; 1MKO A; 1LFY B; 3GQP B; 4F4O A; 2YRS B; 1Y4R A; 5KER A; 1J7S B; 3EDB A; 1O16 A; 3DUT A; 3WHM B; 1JZK A; 1O1M A; 3EDA A; 5CNC A; 3PT7 B; 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3IC0 B; 1DUK A; 2HZ2 A; 1YGD B; 1VWT A; 4N8T B; 107M A; 2GL3 A; 2OLP A; 4U8U B; 2ZSY A; 3ZJQ A; 5EYS A; 4NS2 A; 1C7C A; 1NS6 A; 5EU2 A; 1HV4 A; 3UHV A; 3A59 A; 5CN6 A; 4ODC A; 3WCT D; 1DXC A; 3G46 A; 3G4U A; 3RJ6 A; 3O7N A; 1DKE A; 5CN9 A; 3NL7 A; 1IOP A; 3WCV A; 1Y85 A; 4M4A A; 1K1K A; 2HZ1 A; 3ARL A; 1A4F B; 3K8B A; 1H97 A; 1MZ0 A; 1VXE A; 4OF9 A; 3A5G A; 1C7D B; 4YU4 B; 1HGA B; 2H8D A; 3D17 A; 3WFX A; 2ZLV A; 3UHX A; 1SPG A; 2C0K A; 2VYZ A; 1VXC A; 3A5B A; 1J52 A; 3E5I A; 3OJ1 A; 1OBM A; 3GKV B; 3PIA B; 1NEJ A; 1YE2 B; 2MGE A; 4ROM B; 1Y09 A; 4F4O B; 1JZM A; 2MYB A; 1HRM A; 1Y4R B; 1YH9 B; 1J7W A; 2EVP A; 1NS9 A; 1RQ4 A; 1Y46 A; 1O1M B; 1X3K A; 2HBC A; 3QQQ A; 5HU6 A; 1WLA A; 1SDK B; 3PT8 B; 1HGB B; 1IBE B; 1YFF B; 1Y4Q A; 4G51 B; 2HHB A; 1A0Z B; 3G4W A; 1MBC A; 1X9F D; 1XZ2 A; 1Y8K B; 2HBE B; 3UHS A; 1UX8 A; 1YIH B; 1F63 A; 2HZ3 A; 1S0H B; 1YVT B; 5CHR A; 1Y5F A; 2HBD A; 5C6E A; 1JY7 B; 1HGC A; 3OZV A; 2VM0 A; 3FH9 A; 2D5X B; 1A00 B; 1S5X A; 3OVU C; 4SDH A; 5E6E A; 1XCH A; 1LFV B; 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