2MYA | Genus

Total Genus 67

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	67
sequence length	153
structure length	153
Chain Sequence	VLSEGEWQLVLHVWAKVEADVAGHGQDILIRLFKSHPETLEKFDRFKHLKTEAEMKASEDLKKHGVTVLTALGAILKKKGHHEAELKPLAQSHATKHKIPIKYLEFISEAIIHVLHSRHPGDFGADAQGAMNKALELFRKDIAAKYKELGYQG

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

loadScript /static/js/j2s/core/package.js

loadScript /static/js/j2s/core/corejmol.z.js

loadScript /static/js/j2s/core/corescript.z.js

JSmol exec jmolApplet0 start applet null

Jmol JavaScript applet jmolApplet0__456868489654288__ initializing

Jmol getValue debug null

Jmol getValue logLevel null

Jmol getValue allowjavascript null

AppletRegistry.checkIn(jmolApplet0__456868489654288__)

vwrOptions:

{ "name":"jmolApplet0","applet":true,"documentBase":"https://genus.fuw.edu.pl/view/2MYA/A/","platform":"J.awtjs2d.Platform","fullName":"jmolApplet0__456868489654288__","codePath":"https:/static/js/j2s/","display":"jmolApplet0_canvas2d","signedApplet":"true","appletReadyCallback":"Jmol._readyCallback","statusListener":"[J.appletjs.Jmol object]","syncId":"456868489654288","bgcolor":"white" }

setting document base to "https://genus.fuw.edu.pl/view/2MYA/A/"

Jmol Version: 14.29.13 2018-04-17 17:17

java.vendor: Java2Script (HTML5)

java.version: 2018-01-28 23:38:52 (JSmol/j2s)

os.name: Mozilla/5.0 AppleWebKit/537.36 (KHTML, like Gecko; compatible; ClaudeBot/1.0; +claudebot@anthropic.com)

Access: ALL

memory: 0.0/0.0

processors available: 1

useCommandThread: false

appletId:jmolApplet0 (signed)

Jmol getValue emulate null

defaults = "Jmol"

Jmol getValue boxbgcolor null

Jmol getValue bgcolor white

backgroundColor = "white"

Jmol getValue ANIMFRAMECallback null

Jmol getValue APPLETREADYCallback Jmol._readyCallback

APPLETREADYCallback = "Jmol._readyCallback"

callback set for APPLETREADYCallback Jmol._readyCallback APPLETREADY

Jmol getValue ATOMMOVEDCallback null

Jmol getValue AUDIOCallback null

Jmol getValue CLICKCallback null

Jmol getValue DRAGDROPCallback null

Jmol getValue ECHOCallback null

Jmol getValue ERRORCallback null

Jmol getValue EVALCallback null

Jmol getValue HOVERCallback null

Jmol getValue IMAGECallback null

Jmol getValue LOADSTRUCTCallback null

Jmol getValue MEASURECallback null

Jmol getValue MESSAGECallback null

Jmol getValue MINIMIZATIONCallback null

Jmol getValue SERVICECallback null

Jmol getValue PICKCallback null

Jmol getValue RESIZECallback null

Jmol getValue SCRIPTCallback null

Jmol getValue SYNCCallback null

Jmol getValue STRUCTUREMODIFIEDCallback null

Jmol getValue doTranslate null

language=en_US

Jmol getValue popupMenu null

Jmol getValue script null

Jmol getValue loadInline null

Jmol getValue load null

Jmol applet jmolApplet0__456868489654288__ ready

script 1 started

platformSpeed = 8

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Oxygen storage
source organism	Physeter catodon
publication title	High Resolution X-Ray Structures of Myoglobin-and Hemoglobin-Alkyl Isocyanide Complexes pubmed rcsb
molecule keywords	MYOGLOBIN (ETHYL ISOCYANIDE)
total genus	67
structure length	153
sequence length	153
ec nomenclature
pdb deposition date	1993-08-04

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00042	Globin	Globin

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
1.10.490.10	Mainly Alpha	Orthogonal Bundle	Globin-like	Globins	2myaA00

3PIAB 2HHBA 3TM3A 2ZS1A 1Y7DB 3HF4A 2MGJA 1MYHA 3A9MA 5HAVA 1RQ3B 1CLSB 3VAUA 1DUKA 2C0KA 1UX8A 5C6EB 2V1HA 2W6VB 3S65A 1MLMA 1OR4A 3SZKA 1YMAA 5EV5A 3W4UA 1UC3A 1MYTA 3HXNB 1Y4RA 4H2LA 5HU6B 5EE4D 3GQRA 1Y5KA 2DXMB 5JDOF 1YEOA 3WCPA 1S61A 1DXVA 1Y8HA 5C6YA 3S66A 3HENA 1SPEA 1HGCB 1DWSA 4HHBB 3UHKA 3QJDB 1AJGA 3VRFA 101MA 3GKVA 2EF2A 1LA6B 1LFYA 3WCTC 1SPGB 4NI1B 3LHBA 1MTIA 1XZ2B 1S0HB 1RQAA 1NIHB 2BLHA 1C7BB 1V75B 3HYUB 2GRZA 1ECDA 1Y4QB 1CP5A 3V2ZA 4FH6A 1YEUB 1NWIA 2ZLTA 2ZLUB 5HLQA 2AUOA 1A00B 1OFKA 3NG6B 1HACB 1YHUC 3ORDA 5CNEA 3HRWA 1LFZB 4BJAA 1C7CB 3E5IA 1S6AA 1MKOA 1VXAA 2W6WA 1GZXB 3PI9A 1O1NA 1J3ZA 1YMBA 105MA 1IT3A 1ABYA 1HCOB 3RJNB 1BUWA 1R1YA 1NEJA 2ZLXA 3WCWA 1G08A 1T1NB 1MZ0A 1MYZA 1SDLB 1A6GA 1MYMA 4L2MA 5E6EB 1MLFA 3OGBA 1LH7A 1QPWA 4M4BB 3PI4A 1YVTA 5CHRA 3A0GA 1GCVB 4UZVA 1Y35B 1YFFB 1GDKA 3QZXA 1NS6B 1Y31B 2M6ZB 1H1XA 1Y8KA 2D2NC 1F5PA 1K1KB 4F6BA 4MXKA 2XKIA 1W92A 1LFLA 3ZJQA 2FAMA 3AT5A 1O1OB 2O5TX 4F4OB 1HDBA 3CIUA 4MXLA 1O1KB 3VREA 3G4QA 1SI4B 1CBMA 3QJBB 3ECLA 2R1HB 1IRDB 1MLUA 3ZJSA 3BJ3A 1LH5A 4JACA 1XXTB 2HHEB 3MVCA 1LJWB 1GCWB 1O1PA 3QJCB 1VXBA 3BJ2A 3OZVA 3VHBA 3LR7A 3PIAA 1O1JA 3UHEA 2D60B 2EVKA 1Y7DA 2FRJX 1ECAA 2D5XB 3H57A 1Y8IA 3ZJNA 3ZOLA 1HBRB 2Z8AA 2ZS1D 1GDJA 4N7PB 2Z85A 1QSHA 3ARKA 1N9XA 1Y22A 2V1JA 4G51A 5JGGA 2GDMA 1KFRA 3ECZA 2GNVA 1JF3A 1UX9A 1JZMA 1MLHA 1Y01B 2HZ2A 5E83B 1A0UB 3NMLA 1MWBA 4KMVA 1COHB 5HU6A 5ILMA 4NI0B 2DXMA 2ZSSA 1GLIB 3ZJMA 2GTLA 3HHBB 1RTEA 104MA 1HV4B 2MGGA 1A0ZB 2OHBA 2QU0B 1IWHA 3QM6A 1GBVB 3CY5B 3WFXA 2ZLWB 2ZFOA 2ZT3A 4G1BA 3PELB 4MBAA 102MA 1LA6A 1HLMA 2MGAA 2H35B 1CG8B 2IN4A 1NIHA 1MWCA 1URVA 1V75A 1JEBB 1Y0DB 2NRMA 3WCUD 1YG5A 4C0NA 2ZLUA 5EE4C 1V07A 1Y4PB 1A00A 2G0ZA 1EBTA 1HACA 1VXHA 1LFZA 3WFTA 2W72C 1SDKB 1C7CA 1BZZB 3GOUA 1MNJA 4DC8A 1O1MB 2MB5A 1MCYA 3UHRA 3MKBB 5KERA 1Y09B 1DTIA 1VXFA 1M9PB 1Y4GA 2G3HA 1NXFA 3QM5A 3PI1A 4NK1A 1J7WB 3HF4B 4O4TA 2SPNA 3S48C 1GDLA 1MLKA 2O5OX 1MGNA 2G10A 1FSXA 2EVPA 2AA1A 1T1NA 5CN4A 1SDLA 5JDOD 3ZJLA 3D4XB 3S65B 1DM1A 3WCVA 3MN0A 4M4BA 1HBAB 2W31A 2IG3A 2GRHA 1JF4A 1UIWB 1GCVA 1Y4RB 2HBDB 4ODCB 1DWRA 3UBVA 3GQRB 1Y5KB 1NS6A 1Y31A 1YEOB 1DXCA 2M6ZA 3S66B 1C40A 1X9FC 1XZUA 1RQ4B 1YGDA 1B86B 2BK9A 1V9QA 1YIEA 1K1KA 4UIQA 1NPFA 3DHTB 1S5YB 4OF9A 1AZIA 2ZLVA 3GKVB 1LFYB 2H8FB 3WCUB 2HBCB 1O1OA 4F4OA 1CH2A 1ABSA 1FAWA 1Y7CA 1NZ2A 5EYJA 1YE0A 2R1HA 3A2GA 1XCHA 6HBWB 2QFKA 1FDHG 3DHRA 2HHEA 1LJWA 1GCWA 3QJCA 3OK5A 1YOHA 1CO8A 2NX0A 5IKSA 2ZT4A 3QMAA 2OIFA 2ZSOA 3PI9B 2D60A 1MOAA 5CNCA 1CMYA 3FS4A 1N9IA 1MNKA 1HBRA 1U7RA 1A9WA 4F6FA 2MGMA 1MNIA 4F6GA 1ABYB 1MTKA 1ASHA 1J3FA 1CH5A 3IC0B 3PT7B 1NEJB 2PEGB 3ZJPA 2ZLXB 3GQPB 2EB9A 2VRYA 1JL7A 2Z6SA 7HBIA 5E83A 1MLSA 1GLIA 2Z6NA 1QPWB 3HHBA 4MU5A 1VRFA 1YVTB 1EBCA 4H0BA 1YOIA 1A0ZA 2QU0A 1Y0AB 3GKTA 2VLZA 1FN3A 1DUOA 1GBVA 3CY5A 1DLYA 5AB8A 1MLJA 2GTLD 2ZS1C 1MBDA 2HHDB 1JPBA 5B84A 1HBSA 1NZ4A 1HDSA 4U8UC 1V4WA 1HBHB 2H35A 4O35A 1CG8A 2ZFOD 1JEBA 4AVDA 5E29B 1LFLB 4HRRB 1MBOA 1MYFA 3AT5B 3NMMA 1Y4PA 1HDBB 1NPGA 3OO5B 3ODQA 1SDKA 4DC7A 1HGBB 2D2MA 1QXEA 3M39A 3WI8A 1G0BB 2MGEA 4F69A 5D1VA 3BJ3B 1MDNA 3D7OB 1Y46B 5MBAA 1LHSA 4F68A 1O1PB 4MAXA 1CG5A 1DO3A 2OH8A 3P5QB 1HLBA 1O1JB 2AUPA 1DXDA 1MLQA 1Y7ZA 4NXCA 1J7WA 4PNJA 3ZJRA 4MQCA 1Y0CB 3QM8A 1Y8IB 1YDZA 1CIOA 3PT8A 2DN3A 1DO4A 2V1EA 1RTXA 1QSHB 3AQ5A 6HBIA 1QI8A 1Y22B 4G51B 3D4XA 3M3BA 5JGGB 4TYXA 2D5ZA 2HBFB 2HZ3A 5CN6A 1HBAA 2VLXA 1FHJB 1UIWA 2HBDA 4ODCA 5M3SA 2LH1A 3WCVD 2HBGA 1XZ5A 2GTLB 1JWNA 1RQ4A 1B86A 1DXTA 1IWHB 1YEVB 1Y4FB 2ZFOB 3DHTA 1S5YA 3UGYA 1Y7GB 5JDOC 2H8FA 3WCUA 2QFNA 2HBCA 4YU3A 3BJ1A 3WCWC 3D17B 2VYZA 1LFVB 3UHBA 4G1VA 3UHIA 1Y85A 1BZ1B 3QQRA 4ZVAA 3BOMA 2MGDA 1YG5B 3AG0A 1DKEA 6HBWA 1LHTA 2LHBA 3UHUA 1MBAA 1UVXA 3GLNA 1ITHA 1A6MA 3GOUB 3HEPA 4MQIB 5KERB 3G4RA 3ASEA 4NK2A 3KMFA 1ECOA 2BKMA 1Y4GB 3R5IA 3O89A 1J7YA 1M6CA 1BABA 2ZT0A 2MGHA 1BVCA 3KUNA 2R4ZA 3IC0A 3PT7A 2DHBB 2G14A 1IBEA 4DWTA 2PEGA 3MYMA 1S69A 1JY7B 3GQPA 1FSXB 3MJPA 2AA1B 4FWYA 1J41B 1LH3A 1XZ4B 2WTHA 4TWUA 3WCVB 3UHQA 1MODA 1GJNA 1Y0AA 1YZIB 2DC3A 2OLPA 3D1AB 1MLNA 1YIHB 4KN3A 2VEBA 3LB4A 3K9ZA 1GBUA 2HHDA 1HHOA 1C40B 1HBHA 1XZUB 1YGDB 1YHUA 1YIEB 1XZ7B 3TM9A 2ZSXA 1O1IA 1Y0WA 5E29A 4HRRA 2ZLVB 4ZVBA 1BINA 1F65A 1FAWB 1Y7CB 1VHBA 3OO5A 1JW8A 1HGBA 1YE0B 4ILZA 1G0BA 1NZ5A 1NWNA 2ZWJA 5CNDA 5HLXA 3D7OA 4ESAA 1Y46A 3DHRB 1F63A 2D2MD 1R1XB 4KMWA 1KD2A 5F2AA 1Y8WB 1L2KA 1Y83B 3P5QA 3S1JA 1HABA 4MQKB 3QZZA 1CMYB 1Y0CA 3FS4B 4PQBA 3MYNA 3WTGB 1CQXA 1VWTB 1CH4A 3G52A 3U3EA 3BA2A 3QJEA 106MA 3WFWA 1S56A 1EMYA 2HBFA 4OODA 1AJHA 1BZ0B 1FHJA 5CN7A 2D2NA 3ZHWA 2RAOA 3OZUA 2Z6NB 4AVEA 4YU4A 3WHMA 2BWHA 3G46A 5JDOE 3UHSA 1FN3B 1FSLA 3OVUC 1YH9B 1HSYA 1BZPA 3PI8B 1YEVA 2VHBA 1Y4FA 2ZSYA 1Y7GA 1JZLA 5ILEA 3G4VA 1HBSB 1HDSB 3D17A 1V4WB 1LTWA 1J7SA 1LFVA 2G11A 4ROMB 3H58A 1BZ1A 1VXCA 2FRKX 4WJGA 1RVWA 4L7YB 1LFQB 2ZT2A 1WVPA 3NMMB 3IC2B 1DWTA 3ODQB 1FCSA 1EWAA 1WMUA 3FH9B 1XY0A 2D2MB 1NQPB 3OJ1A 5CMVA 1QXEB 3D1KB 1MTJA 2QLSB 4MQIA 2ZSPA 1YVQA 3K8BA 1V4UB 1CG5B 3A5GA 3KUOA 1G0AB 1KR7A 4O1TA 1Y7ZB 4MQJB 2DHBA 4MQCB 1YDZB 1JY7A 3PT8B 4SDHA 2DN3B 3UH3A 1JL6A 2AV0A 1J41A 1QI8B 1XZ4A 2YRSB 2ZS0A 2D5ZB 2EKTA 4NS2A 5EUIA 3K3UA 1VXEA 1O1LB 1YGFA 1CPWA 1Y4VA 1YZIA 2AURA 2BLJM 4MBNA 3D1AA 1BBBA 4O4ZA 1YIHA 3WCTD 1XZ5B 2KSCA 1MOCA 3BCQB 1HDAA 1XZ7A 1DXTB 2AV3A 2O5MX 5CNGA 3UH7A 4XS0B 1Y5FA 4YU3B 1YHUD 2QMBB 3BJ1B 1XYEA 1Y85B 5ILRA 2G0VA 3BOMB 3WR1A 2AUQA 5KDQB 3ZJHA 1J3YA 1DKEB 5CNBA 1R1XA 3HC9A 3M3AA 4IROA 4N7OB 1Y8WA 1Y83A 3NL7A 5HBIA 1S5XB 2MGFA 1CH1A 2ZSNA 2BMMA 4MQKA 1PMBA 3ZJIA 1RSEA 1LFTA 1X46A 2MGIA 3R5IB 3LQDA 1J7YB 3WTGA 1RPSA 3AQ8A 1BABB 1VWTA 1OUUB 3G4YA 1VREA 1OJ6A 1XQ5A 1IBEB 1V4XB 1BZ0A 5HLUA 3MJPB 1UFJA 1VXDA 1X9FA 4HRTB 3GQGA 1OBMA 3WCTB 3UHGA 2D2ND 4B3WA 4MQGB 2HBEA 1YH9A 3EOKA 3PI8A 2MHBA 3UHZA 1HBBB 2LH3A 3B75A 3M38A 5CN9A 1C7DB 1GBUB 4X0LA 4M4AB 1H97A 2NSRA 1BZ6A 1A01A 1HHOB 4N8TB 1A3NA 4LPIA 1YHUB 1A3OB 4ROMA 4PQ6A 1VXGA 1BZRA 1O1IB 1Y0WB 3G4UA 2V1GA 4L7YA 1LFQA 2PGHA 2QSPA 3UHYA 1SHRB 3IC2A 2H8DA 1MLLA 3FH9A 1NQPA 1MLOA 3D1KA 112MA 5KKKA 3AQ7A 2QLSA 4FH7A 4ESAB 1NS9B 2DN1B 3GDJB 3NFEA 1G09B 1V4UA 3EU1B 2G0XA 1KD2B 3S1IA 3ZJOA 1HABB 1G0AA 3AQ9A 5CNFA 3WCUC 4MQJA 1AJ9B 5JOMA 2O58X 3UHVA 2WTGA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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2MYAA

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structure length

Chain Sequence

Structure visualization

Chord Diagram

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