The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
55
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sequence length |
146
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structure length |
145
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Chain Sequence |
ADFDAVLKWGPVEADYTTIGGLVLTRLFKEHPETQKLFPKFAGIAQADIAGNAAVSAHGATVLKKLGELLKAKGSHAAILKPLANSHATKHKIPINNFKLISEVLVKVMQEKAGLDAGGQTALRNVMGIIIADLEANYKELGFSG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
S-nitrosylation-induced conformational change in blackfin tuna myoglobin.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Myoglobin
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| molecule tags |
Transport protein
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| total genus |
55
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| structure length |
145
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| sequence length |
146
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2006-11-02 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3MVC A; 4DWU A; 1VXD A; 5E6E B; 4HRT A; 2GKN A; 1CO9 A; 1J3F A; 3BJ3 B; 1MOA A; 1VXE A; 3QM6 A; 1CBL A; 3UHR A; 1Y4F A; 2HZ1 A; 2G0Z A; 3EU1 B; 3G46 A; 3WCU D; 1DUK A; 1O1M B; 2GKM A; 4L7Y B; 1HCO A; 1HBH A; 2D2N A; 1GCV A; 1XY0 A; 2W72 C; 1B86 B; 1IT3 A; 1HDS B; 1MBS A; 1CO8 A; 1CIK A; 2HZ3 A; 4HRR B; 1GBV A; 1MNO A; 1J40 B; 1MLJ A; 5EYJ A; 1NIH A; 3P5Q B; 3E5I A; 3WCP A; 2G10 A; 3PI8 A; 1AJ9 B; 4MXL A; 2RAO A; 1LFL A; 3G53 A; 2QSS B; 3R5I A; 3FH9 A; 1URY A; 2W6W A; 110M A; 1W92 A; 1YZI A; 1O1J B; 5EE4 C; 1EBC A; 1UFP A; 5EOH A; 2QLS A; 3OJ1 A; 1YDZ A; 4YU4 B; 3MOU A; 3ZJQ A; 4N7N A; 1NZ2 A; 3S65 A; 1FCS A; 1G9V A; 1C7D B; 1DXU A; 1RVW B; 1QXE B; 2MB5 A; 4KMV A; 4B4Y A; 5JDO C; 1YFF A; 1UX8 A; 2DN2 B; 3S66 B; 1DXV B; 3NL7 A; 4ROM B; 1CH4 A; 3OO4 A; 1EW6 A; 1NZ3 A; 1MYT A; 1O1P B; 105M A; 2GDM A; 5CNF A; 3H58 A; 1J7W B; 1FLP A; 3CY5 A; 3ECX A; 5CMV A; 1OUU A; 1MLU A; 2VRY A; 1YGF B; 4TWV A; 3HEN A; 1S6A A; 1XZ7 A; 2QFN A; 3B75 A; 3D17 A; 4NXA A; 3ZJS A; 2QMB A; 1LJW B; 4YU3 A; 4MU5 A; 2HHE A; 1A3N B; 1Y0W A; 1Y0A B; 1S69 A; 2R80 B; 4VHB A; 2MBW A; 1YGD A; 3QJE A; 4NI1 B; 2GNV A; 3DUT A; 2AV0 A; 2R50 A; 1VWT A; 4HRT B; 1YCB A; 4MQI A; 4H2L A; 4AVE A; 3QQR A; 4ODC A; 3WCT D; 1Y0C A; 1DO3 A; 1CQ2 A; 1XXT A; 3NG6 A; 3ECL A; 4KN3 A; 4G1V A; 1Y4Q A; 1HRM A; 102M A; 1YOG A; 4MQG A; 1HCO B; 2V1F A; 2D2N B; 1GCV B; 4HBI A; 2AUP A; 1JL6 A; 1XY0 B; 1YOH A; 2V1E A; 3ZOM A; 2DN3 A; 3PEL A; 1GBV B; 5F2A A; 1UVX A; 1Y5F A; 3WCP B; 3PI8 B; 1MGN A; 2EVP A; 5KER A; 2RAO B; 6HBW A; 2ZSQ A; 3R5I B; 1BZR A; 2MGC A; 1X9F D; 2RI4 A; 4MQC B; 3HXN A; 1YZI B; 2D2M A; 3MYM A; 3DR9 A; 4C0N A; 3WI8 A; 2HBF A; 1Y5K A; 1Y0D A; 109M A; 1A01 B; 1YG5 B; 2QLS B; 2ZT4 A; 1JW8 A; 1J7Y B; 4N7N B; 3QM8 A; 3S65 B; 2ZS0 D; 1G9V B; 4HSW A; 3DHT B; 4ZVA A; 1DXU B; 1MKO A; 3R0G A; 2FRF A; 1HHO A; 1MOH A; 3QMA A; 2B7H A; 1DUO A; 1MYZ A; 2VM0 A; 1YFF B; 5EV5 A; 3ARJ A; 1SDL A; 4KMW A; 1HBS A; 3UHS A; 2XKH A; 3NL7 B; 5SW7 A; 1UFJ A; 3A2G A; 3OO4 B; 3TM9 A; 2ZSP A; 2FRK X; 3FS4 A; 1BZ1 A; 1FSX A; 2MGA A; 1GDK A; 2NX0 A; 3CY5 B; 1RTX A; 4M4A A; 2EF2 A; 1YHU C; 1ABS A; 1OUU B; 4JYQ A; 1IBE A; 3ZJM A; 1RQA A; 1XZ7 B; 3B75 B; 2QMB B; 1G08 A; 3G4U A; 4YU3 B; 2LH5 A; 2HHE B; 3D7O A; 3OZW A; 1Y0W B; 1MBO A; 1YGD B; 4MQK B; 1FHJ A; 3ZOL A; 4DC8 A; 5D5R A; 3DUT B; 3PIA B; 2BLH A; 1T1N A; 1MOC A; 1VWT B; 4MQI B; 3VHB A; 1X9F A; 4H2L B; 3GYS A; 4L2M A; 4PQC A; 4LPI A; 4ODC B; 1Y0C B; 2NSR A; 2R1H A; 1XXT B; 1C40 A; 3NG6 B; 2ZLW A; 1Y4Q B; 4FC3 A; 4MQJ A; 3WCW A; 1VXF A; 1Y7G B; 3MKB A; 3GDJ A; 1XZV A; 4F6D A; 1QXD A; 1LH5 A; 2OHB A; 2DC3 A; 2FRJ X; 1O1I A; 1V4W A; 1R1Y B; 3LR9 A; 2DN3 B; 2WTG A; 2MHB A; 1S61 A; 1G09 A; 1MNH A; 6HBW B; 1NAZ A; 3E5O A; 1Y46 A; 2RI4 B; 1Y4G A; 3HXN B; 1QSH B; 2D2M B; 4DWT A; 1MWD A; 2HBF B; 1Y5K B; 3PI1 A; 1Y0D B; 3PT8 A; 3U3E A; 1COH A; 3GQG A; 1ECN A; 3AQ6 A; 1DWT A; 3BJ3 A; 2OLP A; 2OIF A; 1A4F A; 1MYG A; 3QM9 A; 2E2Y A; 4MXK A; 3EU1 A; 2D5Z A; 1O1M A; 2V1I A; 1MKO B; 2EVK A; 1HHO B; 2ZS1 C; 2B7H B; 3ZJN A; 3QJC A; 1FDH G; 1MYJ A; 1OUT A; 3UH7 A; 1SDL B; 1D8U A; 5SW7 B; 3AT6 A; 1DXT A; 2ZLT A; 2W6Y A; 1BZ1 B; 2BK9 A; 3IA3 B; 1DWS A; 2QRW A; 2DHB A; 3UH3 A; 1JWN A; 1IBE B; 1RQA B; 1FDH A; 5HY8 A; 3ECZ A; 2ZT3 A; 1DTM A; 1G08 B; 1Y8W B; 2FRI X; 5CNG A; 3D7O B; 3SZK A; 1MLG A; 2O5L X; 2ZSR A; 2LH2 A; 2D2N D; 3G4R A; 2SPN A; 3VRF A; 2MGM A; 1IWH A; 4H07 A; 1RPS A; 1MCY A; 3G4Y A; 3GYS B; 1DWR A; 1MWC A; 1DKE A; 3K3U A; 3UHI A; 2BLJ M; 2R1H B; 1Y31 B; 2ZFO C; 3WCT C; 3WR1 B; 1CP5 A; 1DLW A; 2ZLW B; 1NGK A; 6HBI A; 1M6C A; 3WCW B; 3MKB B; 3GDJ B; 1YHE A; 1XZV B; 4GZG A; 5ILP A; 3MYN A; 1QXD B; 2QU0 A; 1BUW A; 1M9P A; 2PEG A; 1O1I B; 1J7W A; 1V4W B; 1Y85 A; 2MYC A; 2G0X A; 1VRF A; 1CQX A; 1Y4P A; 1Y7C A; 2MHB B; 1CG5 A; 3QJB A; 4JAC A; 1V07 A; 1OR6 A; 1S5Y A; 1G09 B; 1A0Z A; 2R80 A; 2MYA A; 1HDB A; 4TYX A; 1Y46 B; 3OGB A; 4PNJ A; 1Y4G B; 2W6V B; 4NI1 A; 1MTK A; 1GCW B; 4U8U D; 3PT8 B; 1COH B; 3GQG B; 1F63 A; 3UHG A; 1A4F B; 2Z6S A; 3OO5 A; 1SPG A; 2IG3 A; 1JPB A; 1YEQ A; 2D5Z B; 1JDO A; 1CIO A; 1CH9 A; 4ESA A; 5EU2 A; 3QJC B; 2H8F B; 1OUT B; 1ECO A; 3AT6 B; 1DXT B; 3OK5 A; 1LFV A; 2ZLT B; 1NWI A; 3O89 A; 2ZSN A; 3UHX A; 5JGG A; 1VXB A; 1IDR A; 3HC9 A; 2DHB B; 3DHR A; 2XKI A; 3PI3 A; 4MQC A; 1MLL A; 4N7O A; 3UHB A; 1Y5J A; 5HY8 B; 1XYE A; 1QI8 A; 5CNB A; 3G4W A; 1Y09 A; 1DXD A; 1V4X A; 3SZK B; 1Y45 A; 1A01 A; 1YE2 B; 1YG5 A; 1RTE A; 1YMA A; 1J7Y A; 1MOB A; 1HJT A; 1MLH A; 3VRF B; 2AUQ A; 3DHT A; 1IWH B; 3UHT A; 1RPS B; 1YIE A; 2LH3 A; 3ZH0 A; 3QJD A; 3UHH A; 1V4U A; 2G11 A; 1DKE B; 5CNC A; 1V75 A; 3ODQ A; 1MYM A; 2XKG A; 104M A; 1O1K A; 1YVQ A; 3O7N A; 1HAC A; 4U8U A; 3SDN A; 1C7B A; 1YHE B; 1CH7 A; 4FWZ A; 1HGA A; 1H1X A; 2QU0 B; 2D2M D; 1BUW B; 2HBS A; 2VYZ A; 1M9P B; 2PEG B; 2MGK A; 5EQM A; 5HLQ A; 1Y85 B; 3LB1 A; 1N9I A; 1A6N A; 1Y4P B; 4BJA A; 1Y7C B; 1CG5 B; 1YEN A; 3QJB B; 3WTG A; 2HBC A; 1MZ0 A; 1S5Y B; 1V9Q A; 4F6F A; 3HEP A; 2SPL A; 1A0Z B; 1MLK A; 1FN3 A; 2PGH A; 1THB A; 2WY4 A; 1HBI A; 1HDB B; 1ASH A; 1QPW B; 3S1I A; 1YHR A; 4MQK A; 2SPM A; 1NS9 A; 3PIA A; 1NPF A; 1YEU A; 3KMF C; 2H8D A; 2O5B X; 5HLU A; 2C0K A; 1A0U B; 1O1N A; 1VRE A; 1MNJ A; 3OO5 B; 1Y7Z A; 1SPG B; 3UHC A; 1Y7G A; 3WFX A; 3ED9 A; 1CP0 A; 1YEQ B; 2R4W A; 3NFE A; 3RJN B; 1OFK A; 1BBB A; 3UH5 A; 1MDN A; 4ESA B; 1JF3 A; 1R1Y A; 1LA6 B; 3GQR A; 2HBG A; 2ZSS A; 4F6I A; 2O58 X; 1G0A A; 1LFV B; 3LQD B; 2D5X A; 1CBM A; 1YH9 A; 5CN7 A; 5JGG B; 2ZLV A; 2EB8 A; 4AVD A; 2VYY A; 2BWH A; 1Y22 B; 3DHR B; 2HHB A; 2AV3 A; 5B85 A; 1JL7 A; 1QSH A; 4N7O B; 1Y5J B; 3UHY A; 1GBU B; 1XYE B; 1QI8 B; 1SHR A; 5CNE A; 2VEB A; 1Y09 B; 1V4X B; 1GDL A; 3SDH A; 1Y83 A; 3WCW D; 1Y45 B; 1L2K A; 5E83 A; 3A5A A; 1J41 A; 1WVP A; 3WHM A; 3CIU B; 3A0G A; 4XS0 A; 5ILE A; 2D2N C; 3S48 C; 2Z85 A; 1YHU B; 3UGZ A; 112M A; 1BIJ A; 1YIE B; 3GQP A; 2ZSX A; 4WJG 1; 5B84 A; 5CN6 A; 3QJD B; 2GTL A; 1N9H A; 1V4U B; 3BJ2 A; 1V75 B; 3QZX A; 3ODQ B; 2FAM A; 1CMY A; 5E29 A; 1O1K B; 1YVQ B; 4HHB A; 1LFY A; 4OOD A; 5EUI A; 1JZK A; 1S56 A; 1HAC B; 2ZLU A; 4U8U B; 3UHV A; 1C7B B; 1Y35 A; 3K8B A; 2VLX A; 1HGA B; 1NWN A; 4MBN A; 2VHB A; 4UIQ A; 2ZFB B; 2ZST A; 2HBS B; 3NML A; 108M A; 2GL3 A; 4XDI A; 3WCV A; 2QSP B; 1BAB A; 5EYS A; 3OZU A; 1YEN B; 3AQ5 A; 3E55 A; 3WFU A; 3WTG B; 2HBC B; 1Y8W A; 2PGH B; 1FN3 B; 1MBN A; 1THB B; 3MJP A; 1XZU A; 1Y2Z B; 1MLQ A; 1VXH A; 3GOU B; 1ABW B; 2ZWJ A; 1YHR B; 2V1G A; 5EE4 D; 2O5T X; 1CG8 B; 2GRF A; 5IKS A; 1NS9 B; 1GDI A; 1RQ4 A; 1TES A; 1MTI A; 1XCH A; 1YEU B; 1J3Z A; 2AA1 A; 2OH9 A; 2H8D B; 3ONZ B; 2MGE A; 3ZJR A; 1O1N B; 1XZ2 A; 3M3A A; 1XZ4 A; 5CN9 A; 1Y31 A; 3WR1 A; 1DTI A; 2O5M X; 1J7S A; 5CN4 A; 2OHA A; 1Y7Z B; 1LTW A; 3TLD A; 3UHD A; 1MLM A; 1PMB A; 3NFE B; 3ZJL A; 3WCU C; 1BBB B; 1CLS A; 1HBR A; 3GKV A; 4N8T A; 5JOM A; 1DO7 A; 1MTJ A; 1MLF A; 3GQR B; 1MBC A; 3LB4 A; 1JP6 A; 1H97 A; 1G0A B; 1A3O A; 2D5X B; 2MGI A; 4FWX A; 1YH9 B; 1ITH A; 2ZLV B; 1OFJ A; 2EB9 A; 3QQQ A; 1CH5 A; 2HHB B; 2W6V A; 2DN1 A; 1LFQ A; 1RQ3 A; 2W72 A; 3ZHW A; 1Y0T B; 1SHR B; 1GCW A; 1LH1 A; 2VYW A; 1Y83 B; 1Y01 B; 2ZT0 A; 3IC0 A; 3NMM A; 1LH6 A; 5E83 B; 1J41 B; 3WHM B; 2BLI A; 3A0G B; 4XS0 B; 2JHO A; 1A9W E; 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3LB3 A; 1I3E A; 1Y8K A; 4WJG A; 1CH1 A; 3A5G A; 1CH2 A; 1UVY A; 1A00 A; 1JEB B; 3WFT A; 5ILR A; 1QSI A; 1JY7 B; 1R1X B; 2ZS0 C; 3MBA A; 1SDK A; 3HRW A; 1AJG A; 1O1O B; 2O5Q X; 1HBB A; 3MN0 A; 5CN5 A; 3UHU A; 3ZJH A; 1LA6 A; 1SI4 A; 3H57 A; 2MYB A; 1NS6 A; 3EDA A; 2O5O X; 2G3H A; 3LQD A; 2YRS B; 1BZ0 B; 3ORD A; 3UHQ A; 4M4B B; 1CH3 A; 1Y8H A; 1HLM A; 5HU6 A; 1XQ5 B; 1S0H A; 1Y22 A; 1YVT B; 3V2Z A; 5MBN A; 3BCQ A; 1FAW A; 3D4X B; 1GBU A; 5JDO F; 1KD2 B; 1UIW B; 3PT7 B; 2GLN A; 2WTH A; 1G0B B; 3UGY A; 2D60 B; 1BVC A; 2VEE A; 3CIU A; 3EOK B; 1I3D A; 4O4Z A; 1NQP A; 1YHU A; 1DLY A; 2LH6 A; 2Z6N A; 3E4N A; 1GZX B; 3GK9 A; 3PI9 B; 4F69 A; 2HBD B; 1WMU A; 1A6M A; 1Y4V B; 4FH7 A; 2AUR A; 1HDA A; 3UBV A; 4B3W A; 2G0S A; 2GRH A; 2ZS1 D; 3UHE A; 2ZFB A; 1MBD A; 4NI0 B; 1X3K A; 1K0Y A; 1S5X A; 1YOI A; 3HHB A; 2V1H A; 1LH7 A; 1K1K B; 3LB2 A; 3VAU A; 2QSP A; 3D1K A; 3IC2 A; 3OZV A; 4UZV A; 1Y2Z A; 1HGC A; 3MJU A; 3GOU A; 1ABW A; 3WCU A; 2G0R A; 3BJ1 B; 1MYF A; 1DO4 A; 2GTL D; 1CG8 A; 4NK1 A; 3QM7 A; 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