2NSR | Genus

Total Genus 63

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	63
sequence length	152
structure length	152
Chain Sequence	GLSDGEWQQVLNVWGKVEADIAGHGQEVLIRLFTGHPETLEKFDKFKHLKTEAEMKASEDLKKHGTVVLTALGGILKKKGHHEAELKPLAQSHATKHKIPIKYLEFISDAIIHVLHSKHPGDFGADAQGAMTKALELFRNDIAAKYKELGFQ

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

loadScript /static/js/j2s/core/package.js

loadScript /static/js/j2s/core/corejmol.z.js

loadScript /static/js/j2s/core/corescript.z.js

JSmol exec jmolApplet0 start applet null

Jmol JavaScript applet jmolApplet0__1320358881998454__ initializing

Jmol getValue debug null

Jmol getValue logLevel null

Jmol getValue allowjavascript null

AppletRegistry.checkIn(jmolApplet0__1320358881998454__)

vwrOptions:

{ "name":"jmolApplet0","applet":true,"documentBase":"https://genus.fuw.edu.pl/view/2NSR/A/","platform":"J.awtjs2d.Platform","fullName":"jmolApplet0__1320358881998454__","codePath":"https:/static/js/j2s/","display":"jmolApplet0_canvas2d","signedApplet":"true","appletReadyCallback":"Jmol._readyCallback","statusListener":"[J.appletjs.Jmol object]","syncId":"1320358881998454","bgcolor":"white" }

setting document base to "https://genus.fuw.edu.pl/view/2NSR/A/"

Jmol Version: 14.29.13 2018-04-17 17:17

java.vendor: Java2Script (HTML5)

java.version: 2018-01-28 23:38:52 (JSmol/j2s)

os.name: Mozilla/5.0 AppleWebKit/537.36 (KHTML, like Gecko; compatible; ClaudeBot/1.0; +claudebot@anthropic.com)

Access: ALL

memory: 0.0/0.0

processors available: 1

useCommandThread: false

appletId:jmolApplet0 (signed)

Jmol getValue emulate null

defaults = "Jmol"

Jmol getValue boxbgcolor null

Jmol getValue bgcolor white

backgroundColor = "white"

Jmol getValue ANIMFRAMECallback null

Jmol getValue APPLETREADYCallback Jmol._readyCallback

APPLETREADYCallback = "Jmol._readyCallback"

callback set for APPLETREADYCallback Jmol._readyCallback APPLETREADY

Jmol getValue ATOMMOVEDCallback null

Jmol getValue AUDIOCallback null

Jmol getValue CLICKCallback null

Jmol getValue DRAGDROPCallback null

Jmol getValue ECHOCallback null

Jmol getValue ERRORCallback null

Jmol getValue EVALCallback null

Jmol getValue HOVERCallback null

Jmol getValue IMAGECallback null

Jmol getValue LOADSTRUCTCallback null

Jmol getValue MEASURECallback null

Jmol getValue MESSAGECallback null

Jmol getValue MINIMIZATIONCallback null

Jmol getValue SERVICECallback null

Jmol getValue PICKCallback null

Jmol getValue RESIZECallback null

Jmol getValue SCRIPTCallback null

Jmol getValue SYNCCallback null

Jmol getValue STRUCTUREMODIFIEDCallback null

Jmol getValue doTranslate null

language=en_US

Jmol getValue popupMenu null

Jmol getValue script null

Jmol getValue loadInline null

Jmol getValue load null

Jmol applet jmolApplet0__1320358881998454__ ready

script 1 started

platformSpeed = 8

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Oxygen storage/transport
publication title	Nitrosoalkane and Nitrosoarene Binding to Myoglobin and Heme Models rcsb
molecule keywords	Myoglobin
total genus	63
structure length	152
sequence length	152
ec nomenclature
pdb deposition date	2006-11-06

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00042	Globin	Globin

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
1.10.490.10	Mainly Alpha	Orthogonal Bundle	Globin-like	Globins	2nsrA00

1DXTB 2OH9A 4MQHB 1SHRA 4KMWA 4TWUA 3EOKA 3LB3A 1B86B 4MQIB 1MNOA 1ITHA 1ABYA 2D2NC 1NWIA 1HGCA 4O2GA 1Y85A 2V1GA 1QPWB 3KMFA 1I3DA 1OJ6A 3UH3A 1CQ2A 1YEQA 1VWTA 1CH4A 1DM1A 1RQAA 1VXEA 2HBCA 1PMBA 3WCPB 1GLIA 5JOMA 1C40B 1LFTB 1DXCA 3H58A 1AJHA 1V75A 3OGBA 1J52A 3WTGA 4DC8A 1XZ7B 5CMVA 1MWDA 3FS4B 1N9HA 3D1KB 4MU5A 4L7YA 3VRGA 2VYWA 1Y8IA 1YIEB 3A0GA 3MJPB 4TYXA 5CN6A 3TM3A 2D5XA 1GCWA 3GKVA 1Y0DB 3V2VA 4DC7A 1YE2A 3UGYA 3AT6B 1Y4BB 3QJEA 2AA1B 2QMBB 1IRCA 2NX0A 2O58X 3WCTC 1J3YB 2OHBA 2YRSA 3D17A 2HHBB 3PI9B 4NK2A 3UHCA 1MLKA 1Y2ZB 3GQGB 3OZWA 1CH3A 1Y7DB 3WFWA 3R5IA 2MBWA 4XS0B 3RJNB 1YHRA 1XZ5A 3UHNA 2FALA 1K1KA 3MJUA 1Y8WB 1N9FA 1QI8B 3M3AA 1O1MA 5E29A 1R1YA 1LFVA 1LA6A 3K9ZA 3DHRB 1GBVA 1X9FD 3ZHWA 4H07A 1A6NA 4YU3A 1HBRB 1LH2A 2ZLTA 2MGMA 2BW9M 1HABA 2LH5A 3ZJNA 5JDOF 2ZT4A 2VHBA 1F5PA 1A3NA 3OZVA 1MTKA 2HBEA 1NPGA 1SWMA 1U7SA 2VLZA 1SPEA 2Z85A 5CNGA 1L2KA 3D1AB 3DHTB 4JACA 4HRTB 2GRZA 2MGFA 3NG6A 5EOHA 3SZKA 1O1PB 1CLSA 1YHUA 4JYQA 2ZSXA 1Y0AA 1C7BB 1G9VB 1HBHA 1DXTA 4MQHA 4F6DA 4ODCA 3D4XA 1UVXA 1MBSA 1B86A 4MQIA 1RQ3A 4WJGA 2HHEB 2Z6TA 2ZFBB 1NXFA 1DO4A 2O5LX 3AQ5A 2R4WA 1JEBB 1S5XB 1Y46A 1Y5KA 2MYBA 3BOMA 3GQPA 3UHSA 1Y7ZB 4L2MA 2O5SX 3UHVA 5F0BA 5EUIA 4G51B 1YGFA 2H8DA 4M4BB 2EKUA 5IKSA 1A01A 1V07A 4B4YA 3NL7B 4MQKA 2ZSRA 1Y35A 1O1NA 1UMOA 1CBLA 1HBIA 2ZFOD 2V1JA 5EQMA 1XZ7A 3G4QA 3UGZA 1GDKA 4H2LB 3DR9A 2MYDA 1A6MA 3D7OB 3ONZB 3UHXA 2R1HA 2W6WA 3OO5B 3PT7B 1OUUB 3U3EA 1LH3A 2XKGA 1Y5JA 1W92A 1JZMA 1HLBA 106MA 3ED9A 2BNLA 3CY5B 2MHBB 2AA1A 2AV3A 4UIQA 1BUWA 2MGHA 1M6MA 1JZLA 3OO4A 1LH7A 1HGBB 3PI9A 2D60B 1Y2ZA 3UHIA 1MNIA 1LFLB 2G0SA 1MTIA 2D5ZA 1CH5A 1OUTB 1MBDA 6HBIA 1Y8WA 1XXTB 1J41A 1BZ0A 2DN2B 1HDSA 1HACA 2EKTA 2M6ZB 1G09A 1Z8UB 109MA 1URYA 3PI4A 2PGHA 4FH6A 1Y8KA 1B0BA 2W72B 2MGEA 1DKEA 3V2ZA 1K0YB 7HBIA 1RTEA 1O1OA 4PQBA 3ZJPA 4HHBA 1IRDA 3BJ1A 1YG5B 3PI3A 2DHBB 2HCOB 2BLJM 1LHTA 3W4UB 3VHBA 1Y45B 3WR1A 2AV0A 5MBNA 1VXAA 1MNKA 5CNBA 1OFJA 1S5YA 1CPWA 1HBAA 2ZS1B 1G9VA 3TLDA 4PQCA 5KDQB 1QXEB 4HSXA 1MLQA 1KFRA 2ZFBA 3OVUC 2SPNA 1FN3A 4GZGA 1BZ1B 1JEBA 3HRWB 1IOPA 1S5XA 1SHRB 5C6YA 2EVKA 3EOKB 4NK1A 1MOCA 1ABYB 1MYTA 1DLWA 3GOUA 1HGCB 1UX8A 1Y85B 1J3ZA 1CH9A 2VRYA 1YEQB 1Y4GA 1BZ6A 1C7DB 3SDHA 5JGGA 3HC9A 1Y4FA 1RQAB 2GDMA 2HBCB 1RQ4A 1GLIB 4FC3B 1V9QA 1VRFA 1U7RA 3G4VA 2W72C 1LJWA 3WFTA 5ILRA 1X9FA 3OO5A 3WTGB 1A9WA 3LQDA 4ZVAA 1EWAA 3MOUA 1YVTB 4L7YB 1Y8IB 2ZLUA 3A5BA 2OLPA 2KSCA 2HBSA 5E83A 2ZT2A 1LH5A 2D5XB 3S1IA 107MA 3GKVB 4MQCA 1HGBA 4SDHA 1YE2B 3QJEB 1YEVB 2ZS1C 1HGAA 2OHAA 3PI1A 3QZZA 1SDLA 1A6KA 3IC0B 2GKNA 2YRSB 1OUTA 2MGIA 3D17B 1JW8A 1WVPA 1CG5A 2RI4B 2ZSNA 2QLSA 2V1HA 1MNJA 1Y7GA 2DN2A 3R5IB 1MYHA 5AZQA 1CH7A 1YHRB 1XZ5B 1K1KB 1MODA 1MYMA 2ZLVA 5CN9A 1O1MB 1GZXB 5E29B 1R1YB 1LA6B 1JF3A 1GBVB 2FRFA 1YE0B 2DN1A 4YU3B 1YGDB 1CIKA 3EU1B 2ZLTB 2GTLD 5CN5A 1HABB 1Y83A 3ZJLA 1DLYA 1LFYA 3SDNA 1X46A 4F69A 2NRLA 1YMCA 1YH9B 112MA 1A3NB 1NS6B 1UFPA 1CQXA 2G0RA 2ZFOA 1YEUB 2BLHA 1MYFA 3HYUB 1IWHA 3UBVA 3NG6B 3AQ9A 3QJDA 3SZKB 3ECLA 1YHUB 1CLSB 2R50A 1Y0AB 1XZVA 3HRWA 1BABA 1HBHB 2SPMA 4B3WA 4ODCB 2XYKA 3D4XB 2QU0A 1GDIA 1RQ3B 1J7SA 2HHDA 4H0BA 3PELB 5F2AA 1Y46B 1Y5KB 2FRKX 2LH2A 3BOMB 2GRFA 3S1JA 3GQPB 3MBAA 1Y4PA 1NS9B 1C7DA 1ECOA 1MGNA 1S61A 5EUIB 1YGFB 1VHBA 2H8DB 3VREA 1YHEA 1A01B 4FC3A 4X0LA 4MQKB 3OZUA 1Y35B 1TU9A 1O1NB 4NI0A 1ECNA 103MA 2FRJX 1Y22A 1CO8A 1ECDA 4NXAA 2EB8A 3WHMB 1YVTA 2G0XA 2R1HB 2SPOA 4HRRB 3UHRA 1MOAA 3G52A 1Y5JB 2GTLB 3S66A 1LFQA 5ILPA 3M38A 1BUWB 1UIWB 1YEVA 2QSPA 1BBBA 3RGKA 1Y4QA 1IDRA 3A59A 4PQ6A 3UH7A 1YIHA 4F68A 5JDOD 3IC0A 5CN8A 4NS2A 3OO4B 3UHZA 1YHUC 1BZRA 2RI4A 3M39A 2Z6NB 5AZRA 4FH7A 3O7NA 3ECXA 2EB9A 2GNWA 3ZJHA 1YOGA 2D5ZB 1V4UA 1O1JB 3ZH0A 4MXLA 2R80A 1MCYA 1A6GA 1MBNA 1Y09A 2V1IA 1J41B 2Z6SA 1BZ0B 1GBUA 1HDSB 3OJ1A 1GZXA 1HACB 1G09B 4NXCA 2HZ2A 2PGHB 1DWRA 1YE0A 2AUOA 5HLUA 1Q1FA 3G4RA 1YGDA 3EU1A 5B84A 2R4ZA 1VXCA 2ZSZA 2GRHA 5CHQA 2HBDB 2D2MD 1Y8KB 4F6JA 1DKEB 1YH9A 1O1OB 5KKKA 3LB1A 1NS6A 2VLXA 2VLYA 4HHBB 1IRDB 2JHOA 3BJ1B 1NGKA 2VM0A 1YEUA 2G3HA 1MBOA 3E5IA 3HYUA 1MBAA 2NSRA 3AQ6A 3WR1B 1YDZB 3QMAA 2MGAA 1S5YB 2ZS0D 1SPGA 1HBAB 2GTLC 6HBWA 4FWYA 4ESAA 1FN3B 3PELA 1MYJA 2R4XA 4IROA 3WCUD 5AB8A 1JZKA 3HENA 1JF4A 4F6GA 1MLSA 4HBIA 1SI4A 3GQRA 1NS9A 3ASEA 2W31A 1YFFA 3GOUB 1WLAA 1J3ZB 5D5RA 3VAUA 2MGDA 3VRFA 1THBA 1CO9A 1Y4GB 1NIHA 2ZLXA 1V5HA 1PBXA 5JGGB 1Y4FB 1AJGA 1RQ4B 2VEEA 3LR7A 3WHMA 3ZJSA 3DUTA 1YZIA 1LJWB 4UZVA 2NSSA 1ASHA 1X9FB 4HRRA 3LQDB 3LHBA 2GTLA 3K3UA 4MBAA 1MWCA 3ZJRA 1RVWA 2D2MB 2O5OX 2ZLUB 1UIWA 2HBSB 5E83B 1DTMA 3P5QA 3ZJJA 3B75A 4MQCB 3MYNA 1NZ2A 1Y7CA 1EMYA 2Z6NA 2G0VA 1MNHA 2ZLWA 3QJBA 1KR7A 3NFEA 1HGAB 3GK9A 4WJG1 3AQ8A 1SDLB 1QXDA 1O1JA 1CP0A 5HLQA 1G08B 2WY4A 1HLMA 1CG5B 1J40A 1EW6A 2ZS0B 1FHJA 2QLSB 3EDBA 1YOIA 1Y7GB 1RSEA 5CNFA 2CMMA 1NQPB 1DO3A 1MLLA 4MAXA 3ECZA 4MQJA 5JDOC 2ZLVB 2HBDA 1CG8B 3HHBA 4F4OB 1RTXA 2MGCA 5CNEA 2HBFA 4AVDA 4HSWA 2ZT0A 2BLIA 2DN1B 3QQQA 2ZSQA 1Y4VA 1GDLA 1Y83B 4U8UD 1LFYB 5CHRA 1GVHA 3LR9A 5CNCA 3M3BA 3QJCB 1FCSA 5EETA 1SDKA 1YDZA 3QQRA 1ABWA 2ZFOB 1X9FC 4FWZA 3A2GA 4NI1A 3OK5A 1UX9A 1YVQB 1IWHB 2EVPA 1BVCA 1C7CA 1A00A 2D2MC 3QJDB 1TESA 3UHHA 2SPLA 1V4WB 4PNJA 1MZ0A 4N8TA 3LB2A 3ARKA 1IBEB 1Y5FB 3WFXA 1XZVB 1BABB 4UURA 3G4UA 2G14A 2QU0B 1X3KA 2RAOA 1HDBA 1J7SB 1Y31B 2HHDB 4MQGA 1VXHA 5MBAA 2WTHA 2ZS0C 1Y4PB 1BZPA 1FSLA 4YU4A 3S65A 1XY0B 3UBCA 3VREB 1YHEB 3AG0A 1S56A 1F63A 1QSIB 3MN0A 4X0LB 5EV5A 3TM9A 3RJ6A 4NI0B 1Y22B 5HU6B 1NZ3A 1J7YA 3WCTD 2D2MA 1T1NA 2NRMA 3E55A 1XZUA 1CH2A 1O1LA 2DC3A 5HLXA 1ABSA 1YENA 1MTJA 4ROMA 3S66B 104MA 1LFQB 2ZFOC 1DXVB 1GCVB 3E4NA 2QSPB 1BBBB 1NEJB 1Y4QB 3HXNA 3A59B 3HF4A 3ODQA 1YIHB 1F65A 3MKBB 1G08A 2ZS0A 3WCVD 3A5AA 1YMBA 2H35A 3UHTA 1NQPA 1V4UB 3E5OA 2LH6A 2R80B 1LUEA 1Y09B 5ILMA 4VHBA 110MA 2GNVA 3WCUA 3WCWA 1GBUB 5HY8B 1CG8A 1MBCA 2O5TX 4F4OA 2FRIX 1LH1A 1A3OA 3G4WA 1NPFA 2GKMA 3GYSB 2ZSYA 5KERA 2XKIA 2B7HA 1FAWA 1MOHA 3QJCA 4MBNA 1HCOB 1UFJA 1UT0A 4N7OA 1BZZA 4M4AA 1DXUA 3BCQB 1YVQA 1MLMA 1R1XA 1HSYA 2R4YA 1EBTA 2VYZA 1CIOA 1Y0TA 1O1KB 1KD2A 1V4WA 5C6EA 101MA 1IBEA 1Y5FA 2D6CA 1SPGB 2ZT1A 1MOBA 3NMLA 1A0ZA 3H57A 6HBWB 1JP9A 1Y0WA 5SW7A 4F6IA 1HJTA 1HV4A 2VYYA 3GKTA 1Y31A 4ESAB 4OODA 4IROB 1JL7A 1AJ9A 1MKOA 1SI4B 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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2NSRA

Total Genus

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structure length

Chain Sequence

Structure visualization

Chord Diagram

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