The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
61
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sequence length |
152
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structure length |
152
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Chain Sequence |
GLSDGEWQQVLNVWGKVEADIAGHGQEVLIRLFTGHPETLEKFDKFKHLKTEAEMKASEDLKKHGTVVLTALGGILKKKGHHEAELKPLAQSHATKHKIPIKYLEFISDAIIHVLHSKHPGDFGADAQGAMTKALELFRNDIAAKYKELGFQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Crystal structures of manganese- and cobalt-substituted myoglobin in complex with NO and nitrite reveal unusual ligand conformations.
pubmed doi rcsb |
| molecule tags |
Oxygen storage/transport
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| molecule keywords |
Myoglobin
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| total genus |
61
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| structure length |
152
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| sequence length |
152
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2006-12-06 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| X | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2PGH B; 3GKV B; 4MQI A; 1QXD A; 2EB8 A; 3NFE A; 2D60 A; 2XKG A; 1NS9 B; 3UHS A; 1Y4R A; 1Y8H A; 2V1J A; 1BJE A; 3GLN A; 1XQ5 B; 1I3E A; 1Y4G B; 2R4X A; 3E55 A; 1MNH A; 1YIH A; 2ZLX B; 1B86 A; 3VAU A; 4OF9 A; 1QSH B; 1K0Y A; 4WJG A; 2GTL A; 3BJ1 B; 1DTI A; 2RI4 A; 4FWX A; 1FN3 B; 1FSX A; 3ASE A; 2HBG A; 1GBU B; 2EF2 A; 1I3D A; 2QFK A; 1MLN A; 3NMM B; 1Y0A B; 3PEL A; 3PI9 B; 3AT5 B; 1GZX B; 2GKM A; 2AUQ A; 5CN7 A; 2ZFO C; 2G10 A; 3GQP A; 2ZFO D; 3OO4 A; 2HZ1 A; 4MQG A; 3OZW A; 2HBF B; 3UHT A; 3D17 B; 1S56 A; 2M6Z A; 3RJ6 A; 5B84 A; 2ZT2 A; 3DUT B; 2OHB A; 4FC3 A; 1OJ6 A; 1BBB A; 2B7H B; 3WCP B; 3P5Q A; 1JEB B; 6HBI A; 5EQM A; 2YRS B; 3BJ2 A; 1SI4 A; 2HBE A; 4G1V A; 3BJ3 A; 1LH6 A; 1J3Z A; 5CND A; 3U3E A; 1YVQ B; 1HHO A; 3GKT A; 1HV4 B; 1NAZ A; 3ONZ A; 3EDB A; 1Y4F A; 1JP6 A; 1J41 B; 1RTX A; 1XZ7 A; 1YH9 B; 1Y0D B; 1JF3 A; 1MOA A; 1S69 A; 2V1H A; 4YU4 B; 2BLI A; 3VRF A; 3GK9 A; 3PI1 A; 1R1Y A; 4NXA A; 1C40 A; 2HZ2 A; 3WTG A; 1DKE B; 1MLQ A; 4XS0 A; 3IXF A; 3WCU C; 4G51 B; 2OIF A; 2W6X A; 1HGA A; 2O5S X; 1MCY A; 103M A; 4FH7 A; 3WCU D; 4MQH A; 3OZU A; 1LFY B; 2R80 A; 5HLX A; 3IC0 A; 1O1K B; 1MLL A; 2BNL A; 1C7B A; 2GRH A; 1J40 B; 1CIO A; 1QI8 B; 1HCO B; 3GQR A; 5EUI A; 3VHB A; 1Y0T B; 1BZP A; 1IRD A; 3ZH0 A; 3AQ7 A; 1MNJ A; 4VHB A; 1CG5 B; 2ZT3 A; 4M4B B; 1O1I B; 2D6C A; 2W6V B; 3WCT A; 3LHB A; 3A5A A; 1RSE A; 2DN1 A; 1AZI A; 3A59 A; 1Y85 B; 1IT3 A; 2ZLW A; 1F5O A; 3ZHW A; 2V1K A; 1VWT B; 2MYC A; 3DHT B; 3UBV A; 1HGC B; 2MGC A; 1CG8 A; 1SPE A; 2VM0 A; 3GQG A; 2FRI X; 4DC8 A; 1HBI A; 1SDL B; 1JZM A; 2ZLT B; 108M A; 1MYZ A; 3WI8 A; 1A4F A; 4MQI B; 1NS6 A; 1QXD B; 5C6E B; 1U7R A; 3PT7 A; 3UHK A; 3NFE B; 2D60 B; 1GDI A; 2LH5 A; 3MJU B; 2ZSY A; 3IA3 B; 5HAV A; 1JP8 A; 3HHB B; 1YG5 A; 1MYF A; 5SW7 A; 4ZVB A; 1XZU B; 2G14 A; 3OO5 A; 1N9I A; 4B3W A; 1PBX A; 4ILZ A; 1M9P A; 1YFF A; 1DO1 A; 3PI8 A; 1PMB A; 1XY0 A; 3OVU C; 1XZ2 A; 1UX9 A; 1YIH B; 1K1K A; 3K8B A; 2GKN A; 1J52 A; 3ZJN A; 1TES A; 1MTI A; 1HSY A; 1A9W E; 1GCW A; 1K0Y B; 4U8U C; 4LPI A; 3QM6 A; 4U8U D; 1BZZ B; 4ROM A; 1UIW A; 2RI4 B; 3M3A A; 4GZG A; 2DHB A; 1DXU A; 3PEL B; 1A6M A; 4F4O A; 1A3O A; 3UHR A; 2C0K A; 1IBE A; 3A9M A; 2GNV A; 1YGF A; 4DC7 A; 3ARJ A; 3GQP B; 3OO4 B; 4MQG B; 2ZFO A; 1HAC A; 2NRM A; 2M6Z B; 5ILR A; 3EOK A; 2H35 A; 4FC3 B; 3HYU B; 2XYK A; 3P5Q B; 1NPF A; 1H1X A; 2DC3 A; 4N7P B; 2ZSO A; 1THB A; 1SI4 B; 1WMU A; 3WFU A; 4YU3 A; 1FHJ A; 3GKV A; 3ARK A; 3BJ3 B; 1J3Z B; 1X9F C; 1Y4P A; 1HHO B; 2O5B X; 1X9F D; 3QM5 A; 1DLW A; 3LR9 A; 3OK5 A; 3ONZ B; 1Y4F B; 4MPM A; 2D5Z A; 1N9X A; 3QJB A; 2DN3 B; 1XZ7 B; 2ZSS A; 1LTW A; 3H58 A; 1LHT A; 1Y7D A; 4O4Z A; 1XQ5 A; 2V1E A; 1Y4G A; 1EWA A; 1C40 B; 5CNB A; 1VXH A; 3HC9 A; 3WTG B; 5CN6 A; 1URY A; 4XS0 B; 3HRW A; 1H97 A; 1LH7 A; 1C7C A; 2ZLX A; 1CIK A; 1ECO A; 1HGA B; 1V5H A; 3UH6 A; 1QSH A; 4MQH B; 2R80 B; 3IC0 B; 3WCU A; 5E83 B; 2G0X A; 1C7B B; 110M A; 3BJ1 A; 1VXG A; 1A00 B; 5EUI B; 3R5I A; 4MXL A; 1IRD B; 2VLZ A; 1Y0A A; 1MTK A; 3PI9 A; 4FWZ A; 3UI0 A; 4L2M A; 1GZX A; 5JGG B; 1YDZ A; 5CNE A; 3FS4 B; 1ECN A; 2MGA A; 5D1V A; 1VXC A; 3WCT B; 2DN1 B; 2IG3 A; 3R0G A; 1Y8K B; 3A59 B; 2HBF A; 1YMA A; 3MKB B; 2ZLV A; 1A9W A; 2B7H A; 1CG8 B; 3MYN A; 1O1J B; 3GQG B; 1LHS A; 3WCP A; 2QSS A; 1JEB A; 1NZ4 A; 1A4F B; 1MOB A; 2YRS A; 1V9Q A; 1YMC A; 1J7W A; 3QJD A; 2AUP A; 1J3Y A; 2SPM A; 1YHE B; 1MBI A; 1IOP A; 2D5X B; 4N7O A; 1DUK A; 5SW7 B; 1Y8W A; 1UVX A; 4F69 A; 1MLU A; 1F63 A; 1A0Z A; 3ZJO A; 1JL6 A; 1PBX B; 1LFZ A; 1M9P B; 1YFF B; 1IWH A; 1GDL A; 1Y35 A; 2AA1 A; 2HHD A; 1K1K B; 4TWU A; 1Y0D A; 5ILM A; 3UBC A; 4HHB A; 3OZV A; 3NG6 B; 2GNW A; 5KER A; 5JDO F; 3GOU B; 1Y45 A; 3LR7 A; 1GCW B; 1YOI A; 3QMA A; 1DKE A; 2MGG A; 1MLH A; 3TM9 A; 3S66 A; 5EE4 C; 2MGK A; 1DWR A; 4ROM B; 1UIW B; 1GDK A; 5EE4 D; 4U8U A; 3M38 A; 3WR1 B; 1FDH A; 3A5G A; 3UGZ A; 1YEN B; 2LH7 A; 4QAU A; 5HU6 B; 2MGB A; 3MBA A; 2DHB B; 2O5O X; 1DXU B; 1MWB A; 1Y4V A; 3D1A B; 1QI8 A; 101M A; 4X0L A; 2ZWJ A; 1ABY B; 1LH1 A; 5CN4 A; 4ZVA A; 1XZV B; 1MWD A; 1O1I A; 2QU0 B; 3EOK B; 1X3K A; 1HDS B; 3WFW A; 1MOH A; 2HCO A; 4H07 A; 1HBR A; 2SPO A; 1WMU B; 1SDL A; 3E4N A; 2ZLT A; 4YU3 B; 3EU1 A; 112M A; 5C6E A; 2Z85 A; 1J7S A; 1Y4P B; 3UGY A; 2RAO A; 2BWH A; 1MWC A; 3MJU A; 3UH7 A; 1YZI A; 3M3B A; 1MZ0 A; 3ORD A; 2EB9 A; 3HHB A; 2MGM A; 1X9F A; 1IT2 A; 5KDQ A; 2E2Y A; 2ZSQ A; 1XZU A; 1VXE A; 2D5Z B; 3QJB B; 3UHD A; 3UHB A; 3ZOL A; 1RQA B; 3AQ8 A; 1BZ1 A; 4F6G A; 4JYQ A; 1Y7D B; 4PQC A; 4F6D A; 5EOH A; 2VYY A; 3HRW B; 1MDN A; 1YOG A; 1C7C B; 3TM3 A; 2Z8A A; 102M A; 1JL7 A; 3UHW A; 1NZ5 A; 3WCU B; 1BZZ A; 4HRT B; 1YEV A; 4MQK A; 3HXN A; 1DWS A; 3R5I B; 2VYZ A; 3KUN A; 1V4W A; 1HBS A; 2Z6S A; 1YDZ B; 1OR6 A; 1YEO B; 1MBC A; 5MBA A; 1YEU A; 1V75 A; 1VRF A; 1MOD A; 5CNG A; 1FDH G; 1Y2Z A; 3S65 A; 1MNK A; 5IKS A; 1YCA A; 2ZLV B; 2ZSZ A; 3HYU A; 2EKT A; 1XZ4 B; 5EYS A; 1Y7Z A; 2QSS B; 1M6C A; 1MYG A; 2OHA A; 3WCW C; 1HDA A; 4N7P A; 1YEQ A; 3WCW D; 4F6J A; 1J7W B; 3EDA A; 3QJD B; 1J3Y B; 3TLD A; 2SPN A; 1BZ6 A; 3ZJR A; 1GJN A; 4N7O B; 5AZQ A; 1HBG A; 1Y8W B; 4HBI A; 3QQR A; 2R4Z A; 1KD2 A; 1A0Z B; 1DO3 A; 1A0U B; 1LFZ B; 2XKH A; 1IWH B; 2GRF A; 2FAL A; 4HSW A; 2DN3 A; 3RGK A; 1JZK A; 1Y35 B; 1IDR A; 2AA1 B; 2HHD B; 3D7O A; 4HHB B; 5KER B; 2OLP A; 1YHR B; 1CP5 A; 1Y45 B; 1F65 A; 1O1L A; 1Y09 B; 3OGB A; 1MBN A; 3S66 B; 1LH2 A; 2DN2 B; 1YOH A; 3ED9 A; 1XYE A; 4U8U B; 3PIA B; 2ZLU B; 5E83 A; 1MYH A; 4JAC A; 3HF4 A; 2G3H A; 1J3F A; 1Y4V B; 1UFP A; 1HGB B; 1A00 A; 2VYW A; 1J7Y A; 4X0L B; 2FRF A; 1OUT A; 3D1K A; 5JGG A; 3UHI A; 3FS4 A; 2R50 A; 2HBC A; 1HBB A; 2BK9 A; 1GDJ A; 1RPS B; 1Y8K A; 4UZV A; 3MKB A; 2AV3 A; 2HCO B; 1O1J A; 3V2V A; 3RJN B; 3MJP B; 1HBR B; 1G0B A; 1C7D B; 2BLH A; 2ZT4 A; 3G4W A; 2QMB A; 1LA6 A; 2GL3 A; 3EU1 B; 4NS2 A; 4TYX A; 1J7S B; 3V2Z A; 2RAO B; 1O1N B; 1YZI B; 1YHE A; 2D5X A; 1X9F B; 5KDQ B; 1VXD A; 1YE2 A; 1RVW A; 2BMM A; 1BZ1 B; 4WCH D; 2HZ3 A; 1EMY A; 3AQ9 A; 4O4T A; 3DHR A; 1V4X A; 2ZSX A; 5F0B A; 2Z6N A; 3NG6 A; 4XDI A; 3GOU A; 2HHB A; 2MHB A; 2ZS1 B; 1Y01 B; 3PI4 A; 3AT6 A; 5CN9 A; 1Y83 B; 2VLX A; 1YEV B; 2MYE A; 1Y5J A; 4MQK B; 1ABS A; 1YHU B; 3HXN B; 3WR1 A; 1M6M A; 1YEN A; 1RQ3 A; 5HU6 A; 2EKU A; 1A01 A; 1GBV B; 3BCQ A; 1NXF A; 1V4W B; 1HBS B; 5E29 A; 3D1A A; 1Y7C B; 3MOU A; 1ABY A; 1YEU B; 5JOM A; 1QSI A; 1V75 B; 3UHX A; 1Y2Z B; 3H57 A; 4F6I A; 1XZV A; 1WVP A; 2WTG A; 1JZL A; 3S65 B; 2QRW A; 1VXF A; 2QU0 A; 1A6G A; 3VRE A; 1NQP A; 4NXC A; 1HDS A; 1QPW B; 3WFX A; 2G11 A; 3ECL A; 2MGF A; 1VXA A; 1Y7Z B; 3BOM A; 3SDH A; 2G0V A; 1OR4 A; 1HDA B; 1YEQ B; 4C44 A; 5HY8 A; 106M A; 4B4Y A; 1Y31 B; 3WCW A; 1O1O B; 5EYJ A; 4PQ6 A; 1W92 A; 1DO7 A; 1BIN A; 4HSX A; 1CH1 A; 2GRZ A; 1KD2 B; 2SPL A; 2VEE A; 1QXE B; 2WY4 A; 1RQA A; 4G1B A; 2VLY A; 3D7O B; 1BAB A; 1YVT B; 1O1L B; 1BVD A; 2ZS1 C; 3QM8 A; 1S0H A; 5CN8 A; 3LB4 A; 3G4Y A; 5HLQ A; 3VRG A; 2ZS1 D; 1XYE B; 1G08 A; 3MVC A; 1YHU C; 1OFJ A; 1Y5F A; 3HF4 B; 3PI2 A; 1S5X A; 4HRT A; 1MLG A; 1CO9 A; 1YHU D; 1J7Y B; 3K9Z A; 1YGD A; 2MBW A; 1EBC A; 2LH1 A; 1OUT B; 3D1K B; 1FCS A; 2H8F A; 5B85 A; 2AV0 A; 1YEO A; 3E5O A; 1UFJ A; 2HBC B; 7HBI A; 1HBB B; 1DXC A; 5EU2 A; 1GVH A; 4H2L B; 1Y4Q A; 5AB8 A; 3KMF A; 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4MQJ B; 1Z8U B; 3GYS A; 5CNC A; 4NK2 A; 4PNJ A; 1BAB B; 4HRR A; 5D5R A; 3NL7 A; 3WCV C; 5CN5 A; 4AVD A; 3S1J A; 1BUW B; 3WCV D; 1ITH A; 1S0H B; 4N7N B; 1NPG A; 3VRG B; 1DXT A; 1MLJ A; 3SDN A; 1A3N A; 1LFL B; 1EW6 A; 2ZS1 A; 1G08 B; 3K3U A; 5E6E A; 1OFK A; 2G0S A; 2ZSP A; 1Y83 A; 1Y5F B; 1S5X B; 1BZ0 A; 4N8T A; 4ROL B; 1YHU A; 2BW9 M; 2D2N C; 2O5T X; 3AQ5 A; 4KJT A; 1MGN A; 1COH A; 2D2N D; 2FRK X; 1YGD B; 1MKO A; 1GBV A; 4UUR A; 3G4Q A; 6HBW A; 4F6B A; 2DXM B; 4TWV A; 1CH2 A; 1Y7G B; 1Y7C A; 2QSP A; 2H8F B; 2R1H A; 1JDO A; 2H8D A; 3E5I A; 1LFT A; 1BVC A; 1HAB A; 1S5Y A; 5JDO C; 1BIJ A; 1Y5K B; 1Y4Q B; 3ZJM A; 5JDO D; 109M A; 3A0G B; 1QPW A; 1FAW B; 2JHO A; 1GLI B; 5CNF A; 4DWT A; 3G4U A; 4NK1 A; 2MYB A; 3HEO A; 4OOD A; 2HBS A; 2W72 B; 2AUO A; 3G53 A; 1DXV B; 4MU5 A; 3SZK A; 1Y31 A; 1O1O A; 2PEG A; 1NZ2 A; 2D2M C; 2ZS0 C; 2Z6T A; 2MGE A; 2D2M D; 3CY5 A; 2ZS0 D; 1ECD A; 1NWI A; 3LB2 A; 1SPG A; 1AJ9 A; 3WHM B; 3ZJQ A; 1NWN A; 3QJC B; 1QXE A; 3ODQ B; 3PT8 B; 1T1N B; 4L7Y A; 1HBH A; 3ZJI A; 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