The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
44
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sequence length |
142
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structure length |
142
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Chain Sequence |
LTAEEKAAVTGFWGKVKVDEVGAEALGRLLVVYPWTQRFFEHFGDLSSADAVMNNAKVKAHGKKVLDSFSNGMKHLDDLKGTFAQLSELHCDKLHVDPENFKLLGNVLVVVLARHHGSEFTPLLQAEFQKVVAGVANALAHR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Crystal Structure determination of Goat Methemoglobin at 2.7 Angstrom
rcsb |
| molecule keywords |
Hemoglobin subunit alpha-1/2
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| molecule tags |
Oxygen storage, oxygen transport
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| total genus |
44
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| structure length |
142
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| sequence length |
142
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| chains with identical sequence |
D, J, L
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2007-10-10 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| B | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1QSI A; 4H0B A; 1Y5F B; 2BK9 A; 3HEP A; 1Y4F B; 1LJW A; 3QJE B; 3UBV A; 3ECZ A; 2R1H B; 5M3S A; 5CHR A; 3ZHW A; 5F0B A; 1U7S A; 1FSX B; 1GCV B; 3PI9 A; 3OZW A; 5JDO D; 1X9F C; 4O35 A; 3E5I A; 2QSP B; 1HDA B; 3KUN A; 2QMB A; 2D2N C; 3UHU A; 1N9X A; 1O1K B; 2ZFO A; 5EUI B; 1A0Z A; 1MWD A; 5E83 B; 1DXU A; 1MLJ A; 3UH6 A; 1DWR A; 1Y5K A; 1CH2 A; 4YU4 A; 1NS6 A; 3MKB B; 1BVD A; 109M A; 4MQG A; 1OUT B; 1MDN A; 1G08 B; 4WJG A; 4TYX A; 3H57 A; 1VXF A; 5C6E B; 1NWN A; 2D2M A; 3SDN A; 1HDS A; 1BZ1 B; 1SPG B; 5ILE A; 3HRW B; 1QXE A; 4F6G A; 106M A; 1MLQ A; 1QSH B; 1YCA A; 3WFX A; 5MBA A; 2W6V A; 1HBS A; 3PI1 A; 2R80 A; 2ZSN A; 2M6Z B; 3OZV A; 3WCT C; 2LH1 A; 1XYE A; 1Y4P A; 1HDB B; 1C7C B; 1Y7C A; 2DN2 A; 3TM9 A; 1BZ0 A; 1UVX A; 1DLY A; 5SW7 A; 2D60 A; 3EDB A; 2ZT0 A; 1J3Y B; 1YOH A; 2GDM A; 2HHD B; 3VRG B; 5JDO F; 1GBU B; 1BAB B; 1YVT B; 1Y22 A; 1J3Z A; 1W92 A; 3QM8 A; 3ZJS A; 3A59 A; 2QU0 B; 3GKV B; 3O89 A; 3BJ2 B; 1X9F A; 1A3O B; 5KKK A; 1GLI B; 1XZ5 B; 3BJ3 A; 3WCW B; 1B86 B; 1OR4 A; 1YEO B; 1YVQ A; 2NSR A; 3UHY A; 2BKM A; 5EQM A; 1NGK A; 5B84 A; 1XQ5 A; 2FAL A; 3AQ9 A; 3CY5 B; 1UFJ A; 1V75 A; 101M A; 1IT3 A; 4MQH B; 2MYD A; 2ZT1 A; 1VXA A; 1S69 A; 2ZSY A; 1YEV A; 1YEU A; 3DR9 A; 1FAW A; 1I3D A; 1M6C A; 2QSS B; 3D1A A; 2DN1 A; 1A6M A; 3LR9 A; 4MQC B; 2W72 C; 3PI3 A; 3GOU B; 5CN4 A; 1JL6 A; 1YGD A; 1X9F D; 5ILP A; 2VM0 A; 1MLH A; 2GLN A; 2WTH A; 1ECO A; 4M4A A; 2MGL A; 2PEG A; 1IWH A; 2D2N D; 3OVU C; 1DXT B; 3UHN A; 1VWT B; 3ZJM A; 2MGD A; 1A3N A; 4N7N A; 5CMV A; 3AT6 A; 3P5Q B; 104M A; 4LPI A; 1O1M A; 3WTG B; 3GYS B; 1GVH A; 3LQD B; 3A9M A; 2MYC A; 1Y7G B; 1FN3 A; 1HBR A; 1ABY B; 5ILM A; 1J7Y B; 2RI4 B; 1QXD B; 3FS4 B; 5CNE A; 1CG5 B; 1BBB A; 3BOM A; 1CIO A; 1MBD A; 1LFZ B; 1MYH A; 2JHO A; 2HZ3 A; 3KUO A; 4FC3 A; 4F6J A; 1Y0W B; 4MQK A; 1NEJ A; 3WCT D; 1O1J A; 1Y4Q B; 4HBI A; 1G0A B; 1Y8I A; 1V4U B; 2OHB A; 3MYM A; 1MLN A; 3LHB A; 1SHR A; 2H35 A; 3A5B A; 3HF4 B; 1CPW A; 2EB9 A; 4MBN A; 1MCY A; 1CO9 A; 1C7D B; 2XKH A; 2H8F A; 3PT8 A; 3ZJL A; 2XYK A; 1Y5J A; 1A01 B; 3QZZ A; 1I3E A; 4KMW A; 1MNH A; 4MU5 A; 1UX8 A; 3DHT A; 3MN0 A; 1PMB A; 2MBW A; 1LFQ A; 3ODQ B; 5HU6 B; 2QLS B; 2D5Z B; 3SDH A; 3D17 B; 4IRO A; 2ZT4 A; 3OGB A; 1YFF A; 4X0L A; 3ED9 A; 2GTL A; 3QJC B; 3PI4 A; 3ONZ B; 1HBG A; 3RJN B; 3UHC A; 1YG5 A; 1H97 A; 1RQA A; 2O5B X; 3OZU A; 1CP5 A; 1YIH B; 4MPM A; 2ZS1 B; 4ROM B; 1LFV B; 4N8T A; 3V2Z A; 2DXM A; 1NPF A; 1MBN A; 2HHE A; 1XY0 A; 3BCQ B; 1V4W A; 1YEN A; 3WCU A; 4F6I A; 2NRL A; 1K0Y B; 4F68 A; 5EE4 C; 2QFN A; 3HHB B; 2HBF B; 3NFE A; 1Y0C B; 2MYA A; 1Y4R A; 3MJP B; 4G1V A; 2HHB A; 4F4O A; 3QM7 A; 2EKT A; 3G4Q A; 1HBB B; 2MHB A; 110M A; 1LFY B; 2FRJ X; 3B75 B; 1T1N A; 1Y46 A; 1G09 B; 2BW9 M; 1Y45 B; 1YH9 A; 5HY8 A; 3AT5 B; 3ASE A; 1RQ4 A; 3G4V A; 3VHB A; 1CQX A; 1MNO A; 1COH B; 2ZLU B; 1A4F A; 3G52 A; 4GZG A; 4PNJ A; 1RPS B; 4ILZ A; 2Z6S A; 1O1N B; 3HYU A; 3O7N A; 2DN3 A; 3K8B B; 1Y4V A; 4G51 B; 4JYQ A; 2R4Z A; 1MTJ A; 1HAC B; 2B7H B; 1MLK A; 3S1I A; 1LHT A; 2W6Y A; 1CLS B; 1K1K B; 2G12 A; 4N7P A; 2SPN A; 1YHE A; 3VRF A; 5EYJ A; 3UGY A; 2AA1 A; 3S48 C; 2MGE A; 3WCV C; 2AV0 A; 2MGK A; 1KR7 A; 1HBH B; 3DUT A; 1HGC B; 1FCS A; 1V5H A; 1VXC A; 4C44 A; 2BLJ M; 4M4B A; 1A6K A; 3PEL A; 4N7O A; 1IBE A; 4F6D A; 1O1I B; 1UX9 A; 2ZFB B; 1O1L A; 4DWT A; 3NL7 A; 5CN6 A; 2GL3 A; 1BZR A; 1Z8U B; 1DLW A; 1EWA A; 4MQJ A; 4PQC A; 3W4U A; 4FH7 A; 2VEE A; 1IOP A; 1HHO A; 3PI9 B; 1B0B A; 2WTG A; 3OO5 A; 1J40 A; 5EE4 D; 2HBC A; 4DC8 A; 3ARJ A; 4H2L B; 1J41 A; 2ZFO B; 5CN9 A; 2AUP A; 1A0Z B; 1XZ7 A; 2DHB B; 3QQQ A; 2LHB A; 4H07 A; 3UH5 A; 1S5X B; 4YU3 A; 1Y2Z B; 3MYN A; 4YU4 B; 1MLS A; 3PIA B; 5CN5 A; 3UI0 A; 2G11 A; 3HXN A; 1A9W A; 1DO4 A; 4HRT B; 4MQG B; 2ZFO C; 1QPW B; 1PBX A; 4SDH A; 1JZM A; 1QI8 A; 1OJ6 A; 3WI8 A; 1GBV A; 4L7Y A; 2VLY A; 1XZ4 A; 1R1X A; 1N9I A; 4NS2 A; 1QXE B; 4ODC A; 2W6V B; 1YMA A; 1Y4B B; 1HBS B; 1UIW A; 4AVD A; 2V1H A; 3PT7 B; 1J7S A; 1XYE B; 3QM9 A; 2DN2 B; 4G1B A; 5EU2 A; 2D2M C; 2R4X A; 1MZ0 A; 1LA6 A; 1LTW A; 2Z6N A; 2D60 B; 1HGB A; 3EOK A; 1CH7 A; 4HHB B; 1YE0 B; 2WY4 A; 1AJ9 B; 1Y22 B; 2OHA A; 1J3Z B; 2VLZ A; 3GK9 A; 1NQP A; 1UMO A; 1X9F B; 1EBC A; 3WCV D; 2MYE A; 1FHJ B; 1WMU A; 1NZ5 A; 3UHH A; 3BJ3 B; 4U8U C; 1YEQ A; 4F6B A; 3UHB A; 2D2N B; 1BVC A; 1Y35 A; 3RGK A; 1ECN A; 1R1Y B; 5E6E A; 1HV4 A; 1O1P A; 4NXA A; 1HLM A; 1XQ5 B; 1MBS A; 1Y0D B; 1V75 B; 1LFL A; 1H1X A; 2MGC A; 3WR1 B; 1YEV B; 1YEU B; 2G10 A; 3EU1 A; 1YE2 A; 2RAO B; 3CIU A; 1Y31 A; 4FWY A; 1XZU A; 2DN1 B; 1AZI A; 1OR6 A; 3DHR A; 4DWU A; 3S66 B; 3UHK A; 2O5L X; 1MLU A; 1MBC A; 2SPO A; 1HAB B; 3WCT B; 4M4A B; 2ZLX B; 3ORD A; 1V07 A; 4FWX A; 4NI0 B; 1A00 A; 1Y8K A; 1LFT A; 4HSX A; 3ZJN A; 1Y8H A; 4AVE A; 4WCH D; 2O5O X; 1A3N B; 2ZSQ A; 3TM3 A; 1SDK B; 1A6G A; 4F6F A; 5MBN A; 4U8U A; 2ZFO D; 2XKI A; 3D7O A; 105M A; 3GQP B; 3BOM B; 1Y83 B; 1MKO B; 3NG6 A; 1XXT B; 1O1J B; 1F65 A; 2D2M D; 2HBS A; 1Y8I B; 2ZLT A; 1BUW A; 1URV A; 3FH9 A; 2H35 B; 5JGG B; 1DWT A; 1MWB A; 4C0N A; 2W72 B; 3AQ8 A; 3HEO A; 1YHU A; 1IRC A; 3G4R A; 2AUQ A; 4ESA B; 1Y0A A; 4TWV A; 1VXB A; 1Y5F A; 2HBE B; 1V4X B; 107M A; 2Z8A A; 3QJE A; 2E2Y A; 2R1H A; 4U8U D; 1FSX A; 1DWS A; 2HCO A; 1LFQ B; 5AB8 A; 1MLF A; 2QSP A; 4WJG 1; 1FDH A; 4NK2 A; 3SZK B; 1BZP A; 3VRE B; 4X0L B; 2DC3 A; 2GTL B; 1OFJ A; 1O1K A; 5EUI A; 2W31 A; 3IC2 A; 102M A; 1Y8W A; 1RQA B; 1DTI A; 1D8U A; 1JWN A; 1C7B B; 4N8T B; 2DXM B; 2ZSS A; 3U3E A; 1X46 A; 2GTL C; 1NS9 A; 1XY0 B; 1LH5 A; 1DO7 A; 5JOM A; 2QRW A; 1S61 A; 3MBA A; 1BZ1 A; 1O1O B; 5KDQ A; 3HRW A; 1HBI A; 108M A; 1J3F A; 3S65 A; 5KER B; 1NZ4 A; 1YZI B; 2M6Z A; 2OIF A; 2G3H A; 1RSE A; 1Y4R B; 3GQG A; 4F4O B; 1C7C A; 1Y09 B; 2R4W A; 3WCU C; 1Y4G A; 2MHB B; 1NZ2 A; 3E4N A; 1FSL A; 1Y46 B; 1J3Y A; 2HHD A; 3VRG A; 3PI2 A; 1GBU A; 1BAB A; 1YVT A; 2BNL A; 1MOA A; 3GKV A; 1YH9 B; 5HY8 B; 1MYG A; 1YMC A; 2ZS0 A; 3E55 A; 1VXD A; 4NI1 A; 1CH1 A; 1GLI A; 2MGF A; 3UHX A; 1XZ5 A; 3WCW A; 3G53 A; 1MBI A; 1BIJ A; 1J7W B; 3OO4 B; 3UHS A; 1A4F B; 4HRR A; 2MGA A; 1JF3 A; 5CNF A; 1MBO A; 3UGZ A; 1XZ2 B; 2DN3 B; 3IA3 B; 3AQ5 A; 1Y4V B; 3CY5 A; 1SI4 B; 1NPG A; 2V1G A; 1DKE B; 3QJB B; 2AV3 A; 1HRM A; 2ZWJ A; 2QSS A; 2EVP A; 1DUK A; 1RVW A; 1YHE B; 3R5I A; 1LHS A; 5HLQ A; 2AA1 B; 1SWM A; 1GJN A; 4FH6 A; 1CMY B; 1G9V B; 1YDZ A; 3DUT B; 3LB2 A; 3GOU A; 1HCO A; 1GZX A; 3MVC A; 3D1K A; 4ZVB A; 4M4B B; 1IBE B; 1MLR A; 2BMM A; 4NXC A; 1O1L B; 3A5A A; 3UHQ A; 3NL7 B; 103M A; 3QJD A; 5EV5 A; 1JDO A; 2GKN A; 4ROL B; 4MQJ B; 1RQ3 B; 3P5Q A; 1JY7 B; 5CND A; 3W4U B; 1NZ3 A; 112M A; 1FDH G; 3K9Z A; 1LUE A; 2GTL D; 1Y7G A; 5D5R A; 2VYY A; 1ABY A; 2RI4 A; 1M9P A; 3FS4 A; 1CG5 A; 1OUU A; 1J40 B; 2MGM A; 3OO5 B; 3RJ6 A; 4HSW A; 1LFZ A; 2HBC B; 1HGA B; 2LH3 A; 5B85 A; 1Y0W A; 3WHM B; 5E29 B; 1XZ7 B; 1GCW B; 1RTE A; 4KN3 A; 3WCU D; 1MLG A; 4PQB A; 3WCP A; 1MGN A; 3ZOM A; 3WCV B; 3HF4 A; 3PI8 A; 1ABW A; 1CG8 B; 2MGH A; 1KFR A; 2ZLW B; 1YIE B; 1GBV B; 1NIH B; 1XZ4 B; 1A01 A; 1FLP A; 2HZ1 A; 1MBA A; 3OK5 A; 2D6C A; 4ODC B; 5EET A; 1HBA A; 1UIW B; 1Y0T A; 5HU6 A; 1KD2 B; 1XZV A; 1IRD A; 4MQI B; 2D5Z A; 1SDL A; 1J7S B; 3D17 A; 3UHV A; 2H8D B; 1LA6 B; 2Z6N B; 3ONZ A; 111M A; 2HBD A; 1AJG A; 2Z85 A; 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1YVQ B; 1O1I A; 2HBS B; 2MYB A; 1BZZ A; 3WFU A; 1S0H A; 2EB8 A; 1VXH A; 1AJH A; 1VXG A; 1YHU B; 1Y01 B; 1Y0A B; 2IN4 A; 4L2M A; 2BLH A; 1C40 A; 2PGH A; 1FAW B; 1G0B A; 1HJT A; 3D1A B; 3UHD A; 3UHG A; 1MLO A; 1HLB A; 2HCO B; 1GDL A; 2HBG A; 1LH6 A; 2V1E A; 2YRS A; 1YHU C; 3KMF A; 4XDI A; 1YGD B; 3ARK A; 1URY A; 4H2L A; 2ZLV A; 2DHB A; 3IC2 B; 2PEG B; 1IWH B; 1OFK A; 1Y8W B; 1S5X A; 2GNV A; 2FRF A; 3LB4 A; 1MYI A; 1Y2Z A; 3PIA A; 4N7N B; 3AT6 B; 3G4W A; 4HRT A; 1NS9 B; 1QPW A; 1WVP A; 1X3K A; 1MYT A; 1O1M B; 3M38 A; 1LH2 A; 5KDQ B; 5D1V A; 1CO8 A; 3D4X A; 3A0G A; 1FN3 B; 3S65 B; 1S5Y A; 1HBR B; 3G4U A; 1Y4B A; 1BBB B; 6HBW A; 3PT7 A; 3GQG B; 3E5O A; 1Y7Z A; 4FC3 B; 2G0R A; 1Y4G B; 1A0U A; 4MQK B; 1NEJ B; 1JZK A; 1BZ6 A; 1JPB A; 5EYS A; 3IC0 A; 4HHB A; 1YE0 A; 2BLI A; 1AJ9 A; 3HEN A; 5CNC A; 3GQR A; 2ZS0 B; 2VYW A; 1SHR B; 1HSY A; 1FHJ A; 2BWH A; 1MTI A; 4NI1 B; 1NWI A; 1MYZ A; 2H8F B; 3PT8 B; 2D2N A; 1BIJ B; 4HRR B; 1Y4F A; 1Y5J B; 1LH7 A; 1R1Y A; 3DHT B; 1GCV A; 2OH8 A; 3UHI A; 2ZS0 C; 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