The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
44
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sequence length |
142
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structure length |
142
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Chain Sequence |
LTAEEKAAVTGFWGKVKVDEVGAEALGRLLVVYPWTQRFFEHFGDLSSADAVMNNAKVKAHGKKVLDSFSNGMKHLDDLKGTFAQLSELHCDKLHVDPENFKLLGNVLVVVLARHHGSEFTPLLQAEFQKVVAGVANALAHR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Crystal Structure determination of Goat Methemoglobin at 2.7 Angstrom
rcsb |
| molecule keywords |
Hemoglobin subunit alpha-1/2
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| molecule tags |
Oxygen storage, oxygen transport
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| total genus |
44
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| structure length |
142
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| sequence length |
142
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| chains with identical sequence |
D, J, L
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2007-10-10 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| B | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3LQD A; 3CIU B; 1MWC A; 1O16 A; 1YHU B; 5HY8 A; 112M A; 2O5B X; 5SW7 A; 7HBI A; 1MYG A; 2V1G A; 103M A; 5ILR A; 3FH9 A; 2ZLT A; 4M4A B; 109M A; 3PI2 A; 2PGH B; 1YHE A; 1Y4G B; 4NXC A; 3WCT C; 1Y09 B; 3A2G A; 5CHR A; 3QM9 A; 2AUP A; 2QRW A; 1A3O A; 1PMB A; 2HHE A; 4PQB A; 3NMM B; 1Y7C B; 5EUI A; 1SDK B; 5JDO E; 3QQQ A; 1ASH A; 2ZST A; 3QJB A; 1UC3 A; 3SZK A; 3UHD A; 4DC7 A; 3UGY A; 1A9W E; 1QXD A; 2ZS1 B; 2FRJ X; 1O1L B; 1DXT A; 1IT2 A; 1G08 A; 2MHB B; 1A00 A; 1T1N A; 3G4V A; 1CLS B; 2MGM A; 6HBI A; 1MYT A; 1C7B B; 3W4U B; 2W72 B; 2RI4 A; 3BJ1 B; 1V5H A; 5KDQ A; 5JGG B; 1S0H B; 1VHB A; 1NZ3 A; 2O5O X; 5E6E A; 1XZV A; 1NGK A; 1YGF A; 3HXN B; 3PT7 A; 1NIH B; 1X9F D; 5HY8 B; 1MYF A; 2HZ2 A; 102M A; 4G51 A; 3A0G A; 2V1K A; 1CQX A; 3QQR A; 1XZ4 A; 3B75 A; 5EYS A; 4ZVB A; 2V1I A; 2ZLT B; 4MQG A; 1IBE A; 5ILE A; 1JF3 A; 1JP6 A; 3D4X B; 3AQ5 A; 1MNJ A; 1LH6 A; 4QAU A; 1MBC A; 4NI0 A; 3R5I A; 2BKM A; 3RJN B; 3KMF C; 1LHT A; 2JHO A; 1BIJ B; 1F5O A; 2NX0 A; 5CHQ A; 4MQK B; 5AZR A; 1OUU B; 2GRH A; 2D2M B; 2VRY A; 2QMB A; 2DXM B; 1QXD B; 1BBB B; 3LR9 A; 5E83 A; 3DUT A; 1DTM A; 2H35 A; 3MVC A; 2E2Y A; 1S61 A; 1KD2 A; 1GZX A; 3UI0 A; 106M A; 1RPS B; 1FHJ A; 1Y31 A; 1MOB A; 4HHB A; 1BJE A; 5CNB A; 1LH2 A; 4O1T A; 5CNF A; 1CH3 A; 4B4Y A; 5IKS A; 2GTL D; 1MYM A; 3UHV A; 5HLX A; 2ZLW A; 1I3E A; 1CG8 B; 2QSS B; 2ZWJ A; 2OLP A; 1NWI A; 2FAM A; 1MLM A; 4ODC B; 1YVQ A; 2HCO B; 1Y4R A; 1D8U A; 3BJ3 A; 4ESA A; 1LA6 A; 1Y4V B; 3WCT B; 2AV0 A; 4YU3 A; 4MQC A; 1K1K B; 1UVX A; 3UHQ A; 1QSI A; 2BLJ M; 3DHT B; 3ORD A; 1F5P A; 1MTJ A; 1YHR B; 3ZJJ A; 4FWZ A; 2ZLV A; 1EWA A; 1O1J B; 1S5X B; 3OGB A; 4NI1 A; 1J3F A; 1IWH A; 4JYQ A; 2BK9 A; 1HBI A; 4PNJ A; 1YZI B; 1J7S A; 1Y0T B; 1O1O B; 5C6E B; 2BMM A; 1DXV B; 1V75 B; 3WCU D; 2HHB A; 1COH B; 1J41 A; 1Y01 B; 2XKG A; 1MLO A; 3QJE A; 3HF4 B; 1DLW A; 4HSX A; 1C7D B; 1MWD A; 1ABW B; 1GCV B; 2EF2 A; 3A59 B; 3MJP B; 1XZ7 B; 1LFL B; 1OFK A; 3EU1 B; 3VRG B; 1GVH A; 4GZG A; 1LTW A; 1QI8 A; 1YOH A; 1MBD A; 1Y8W A; 2MYE A; 1VRE A; 2MGH A; 1XZ2 A; 1UFJ A; 3GDJ B; 4MXK A; 3WCW D; 1RQ3 B; 3ZOM A; 3MKB A; 2DN1 A; 2NRM A; 2RAO A; 2M6Z B; 1CMY B; 1HV4 A; 1BZZ B; 1IT3 A; 2LH1 A; 1MBI A; 1A0Z B; 2V1E A; 2D2N B; 3OO4 B; 1DM1 A; 1MTI A; 3S65 B; 1N9I A; 4MQH A; 1SPG A; 108M A; 4NI1 B; 1JF4 A; 2OIF A; 3QM6 A; 1HSY A; 3HEN A; 2R80 B; 3IA3 B; 1HBG A; 3BOM A; 1HBB B; 1A01 A; 3GQG A; 2LH6 A; 1J40 A; 1A4F A; 4F6D A; 2QFN A; 3K8B A; 1MLR A; 3V2V A; 1MTK A; 3UHX A; 1C40 A; 1Y7Z A; 3OO5 B; 1LH5 A; 2ZLU A; 1FN3 A; 5EE4 D; 3ZJR A; 3GQP A; 1BIN A; 3ECL A; 3WCV D; 5CNE A; 2G3H A; 5C6Y A; 3UHR A; 1YEU B; 2B7H B; 4XS0 A; 3G4W A; 4XDI A; 1BUW B; 3R0G A; 4O4T A; 1CQ2 A; 1ECO A; 1FAW A; 1HV4 B; 2D60 B; 4NXA A; 2O5Q X; 5CN6 A; 1MLG A; 3NFE A; 2ZS0 D; 1G9V A; 3EOK B; 3MYM A; 2H8F B; 1HBH B; 3WTG B; 4NK2 A; 1GDI A; 2QLS B; 2V1J A; 4L2M A; 2MGB A; 3AQ9 A; 2W6V B; 3PI8 A; 1R1X A; 1Y4P B; 1HLB A; 1A0U A; 1RVW A; 1MBO A; 1G09 B; 1J40 B; 1A4F B; 3P5Q B; 4ILZ A; 3WR1 A; 1VWT B; 110M A; 2Z6T A; 3ZJM A; 3PT8 A; 4IRO A; 4DWT A; 1JEB A; 1Y0C B; 2EKT A; 4WCH D; 1GCW A; 3RJ6 A; 2VYW A; 1YHU C; 3WHM B; 2OHA A; 4TWU A; 3IC0 A; 3M3A A; 4F6J A; 5EV5 A; 1CH9 A; 5MBA A; 1A6N A; 3AG0 A; 1RQA B; 1FCS A; 4MQJ A; 3BA2 A; 1A6M A; 3MJU B; 4MXL A; 1CPW A; 1YH9 A; 1XZU B; 3ZOL A; 3PIA B; 2NSS A; 1NQP A; 3ZJL A; 1HDA B; 2DN2 B; 4FWX A; 2G14 A; 1PBX A; 3QM5 A; 4VHB A; 1HLM A; 2LH7 A; 2GKM A; 3HYU B; 111M A; 1JZK A; 1RVW B; 5KER B; 1NXF A; 1L2K A; 1HHO B; 1Y5F B; 4U8U D; 1Y0W A; 1NEJ B; 1YIH A; 3O89 A; 1FSX A; 1N9H A; 3CIU A; 2ZSY A; 1YHU A; 5CNC A; 3IC0 B; 2R4Z A; 3DHR B; 5F2A A; 4M4A A; 3G4Y A; 2PGH A; 1HBS B; 1Y4G A; 1V4X B; 2W6W A; 1I3D A; 1Y09 A; 4WJG A; 3GOU B; 2AA1 B; 3WI8 A; 2D5X B; 2G12 A; 1NQP B; 3NMM A; 1SDK A; 2FRF A; 1HBA B; 2HZ1 A; 4F69 A; 1MLH A; 3MYN A; 1O1M B; 3A5B A; 4TYX A; 2MB5 A; 2ZS1 A; 2ZT0 A; 4UIQ A; 2MGF A; 1O1L A; 1CBM A; 2MHB A; 1LJW B; 2G0X A; 5HLQ A; 2OH9 A; 1CLS A; 3M3B A; 4NZI A; 1YIE B; 1DXU B; 3W4U A; 2W72 A; 1NPF A; 5JGG A; 1S0H A; 3G4R A; 2BWH A; 5CNG A; 1FLP A; 2G10 A; 2HHD B; 3RGK A; 3HXN A; 1MCY A; 1VXA A; 1RQ4 B; 1Y46 B; 3UBC A; 1NIH A; 1B86 B; 1LH3 A; 3G53 A; 3ARJ A; 3HC9 A; 1EBC A; 1MLL A; 3ODQ B; 1F65 A; 4FC3 B; 1QXE B; 3K3U A; 1YEQ B; 3IXF A; 4HBI A; 3D4X A; 4ZVA A; 1MLK A; 1Y83 B; 5HLU A; 2VM0 A; 1A3N B; 4IT8 A; 3GQR B; 2QSP B; 5EQM A; 1YEN B; 1X3K A; 3E5I A; 3ZJS A; 2WY4 A; 3GYS B; 3PI9 B; 1BIJ A; 1V4W B; 1XYE A; 1YG5 B; 5CND A; 4MQK A; 1RTX A; 1ECD A; 1OUU A; 5EYJ A; 2D2M A; 1MDN A; 2HBD B; 3V2Z A; 1H97 A; 5AZQ A; 2DXM A; 4OOD A; 4N7O A; 3NL7 B; 3ONZ B; 1XY0 B; 1BBB A; 2MYC A; 1GDK A; 2O5T X; 1BZ0 B; 3QM8 A; 2LH5 A; 1RPS A; 1YCB A; 2XKI A; 1SHR B; 2R1H B; 3G4U A; 3M39 A; 2GRZ A; 1G0B B; 2D5Z B; 2DHB B; 4C0N A; 4UUR A; 1SPE A; 1CG8 A; 2QSS A; 3D1A B; 1LH7 A; 4ODC A; 1XXT B; 2HCO A; 1ITH A; 2Z6N A; 3TM9 A; 3UGZ A; 2DC3 A; 1X9F C; 3S1J A; 1Y4V A; 3WCT A; 1K1K A; 4H0B A; 1Y22 A; 1YOG A; 1UX9 A; 1VRF A; 3DHT A; 5D5R A; 4N7N B; 2D2N C; 3U3E A; 1YHR A; 1HGC B; 1CH4 A; 1A6K A; 1XYE B; 2G0V A; 4O4Z A; 1O1J A; 2DN3 B; 1Y4Q B; 1S5X A; 3FS4 B; 1LFZ B; 1MGN A; 1YZI A; 3KUN A; 1S5Y B; 1W92 A; 3PI4 A; 2AUR A; 4N7O B; 1Y0T A; 1O1O A; 1SI4 B; 5C6E A; 1V9Q A; 1DXV A; 2HBE A; 1V75 A; 1C7C B; 1COH A; 2ZFO B; 2MGG A; 5ILM A; 2ZSO A; 3HF4 A; 1C7D A; 1S56 A; 2ZSP A; 1ABW A; 1GCV A; 1LFV A; 4B3W A; 3A59 A; 3MJP A; 1XZ7 A; 1YCA A; 3S66 B; 1LFL A; 1CIO A; 3EU1 A; 3VRG A; 105M A; 3ECZ A; 1IDR A; 1DLY A; 1QPW B; 2XKH A; 1O1P B; 1HDS B; 1NZ5 A; 1BAB B; 1MYH A; 1Z8U B; 3GDJ A; 1MOH A; 2Z6N B; 2O58 X; 1WVP A; 2GTL C; 1MOC A; 1RQ3 A; 1HCO B; 2M6Z A; 1CMY A; 2Z85 A; 1BZZ A; 1Y22 B; 5D1V A; 1OBM A; 3VRE B; 1A0Z A; 3KMF A; 2D2N A; 2GLN A; 3OO4 A; 3S65 A; 4SDH A; 5MBN A; 1J3Z B; 2EVK A; 5CN8 A; 3HHB A; 1NS6 B; 4M4B B; 3QM7 A; 1EMY A; 1YE2 B; 3MBA A; 2R80 A; 3LB3 A; 2HBE B; 1HBB A; 3AT5 B; 3S1I A; 4HRR B; 3HRW B; 1Y5K A; 4DWU A; 5AB8 A; 3OO5 A; 4X0L B; 1LFV B; 1LFQ B; 2OHB A; 3WCU C; 1O1I B; 2D6C A; 1Y0A B; 5CN9 A; 1ECN A; 3UHS A; 1IRD B; 4ROL B; 2HBC B; 3VRF B; 2BNL A; 1Y0D B; 2MGL A; 3LB1 A; 1YEU A; 1RTE A; 2B7H A; 1DKE B; 2MGD A; 1J7Y B; 3TLD A; 1BUW A; 1MNK A; 2HBS B; 1UX8 A; 1O1K B; 1Y8I B; 2GTL A; 1OJ6 A; 1Y2Z A; 1X9F B; 2D60 A; 1NAZ A; 1DO7 A; 1HDB A; 3WFX A; 1HAB A; 3H58 A; 1DUK A; 3WCW C; 4FWY A; 3EOK A; 2H8F A; 2NSR A; 1HBH A; 3WTG A; 2HBG A; 3ARL A; 2QLS A; 1YEO B; 3HHB B; 3G4Q A; 2W6V A; 1Y4P A; 3GK9 A; 1CH1 A; 1G09 A; 4FH6 A; 3P5Q A; 1VWT A; 2QU0 B; 1MOD A; 1BZ6 A; 2PEG B; 1CO8 A; 1Y5K B; 2H8D A; 4O2G A; 1Y0C A; 1MLS A; 4F6G A; 4TWV A; 3M38 A; 2G0Z A; 2ZSZ A; 1YVT A; 3WHM A; 3NG6 B; 1J52 A; 2HBF B; 3OJ1 A; 1YMB A; 2MGK A; 5EOH A; 1Y35 B; 2KSC A; 1RQA A; 5EE4 C; 3MJU A; 3DR9 A; 2GTL B; 1Y2Z B; 4H07 A; 3MOU A; 2MYB A; 1BZ1 B; 1XZU A; 3PIA A; 1HDB B; 1HAB B; 3GKV B; 3WCW A; 1DWR A; 2GRF A; 1HDA A; 2DN2 A; 2WTH A; 2MYD A; 1YOI A; 1M6M A; 2ZS0 C; 3HYU A; 1BZR A; 2ZFB B; 4MAX A; 1GBU B; 5KER A; 1DO3 A; 2SPM A; 1HHO A; 1JDO A; 1XQ5 B; 1Y5F A; 2ZT4 A; 1LFT B; 1EW6 A; 1NEJ A; 2H8D B; 1QSH B; 3UH6 A; 1N9X A; 3QJD A; 3WCP B; 2ZT1 A; 4NK1 A; 3WCU B; 1LHS A; 5E29 B; 1YVT B; 2ZT3 A; 1YHU D; 4ROM B; 2MGE A; 3DHR A; 3VHB A; 1NPG A; 1YEV B; 2GNW A; 2O5S X; 1MYJ A; 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2ZS0 B; 1CH5 A; 1DO1 A; 1BZ0 A; 1JPB A; 2ZFO C; 4KMW A; 1OUT B; 4N8T B; 2R4W A; 1Y7G B; 3OZW A; 1MBS A; 2NRL A; 1Y4B A; 1SHR A; 2R1H A; 2V1F A; 1BVC A; 3WFW A; 1G0B A; 1VXD A; 1ABS A; 2D5Z A; 2DHB A; 1KR7 A; 3AQ8 A; 1UFP A; 3UHI A; 3IC2 A; 5M3S A; 3WFU A; 1MOA A; 1Y85 B; 5CN5 A; 3D1A A; 2FAL A; 1XXT A; 3OVU C; 3AQ7 A; 1AJH A; 1M9P B; 1A9W A; 1MLF A; 4MU5 A; 2EKU A; 3WCT D; 6HBW B; 4L7Y B; 4N7N A; 3BJ2 B; 2ZLX A; 2ZSR A; 4DC8 A; 1HAC B; 2MGJ A; 1HGC A; 1WLA A; 1HRM A; 2DN3 A; 1Y4Q A; 3FS4 A; 1ABY B; 1LFZ A; 1Y45 B; 2G0R A; 2VYY A; 1NZ4 A; 1BVD A; 1S5Y A; 5KKK A; 1SI4 A; 1MNH A; 3AQ6 A; 2VEE A; 1NS9 B; 1C7C A; 1OR4 A; 1Y4F B; 107M A; 2ZFO A; 1AJG A; 3GKT A; 2CMM A; 2W31 A; 2R4X A; 1JW8 A; 3OK5 A; 1CP5 A; 3UHH A; 1O1N B; 2ZSQ A; 1Y4B B; 3QJC B; 1CIK A; 4G1V A; 3S66 A; 3IC2 B; 3ZH0 A; 4U8U B; 1QPW A; 4H2L B; 1O1P A; 1HDS A; 1BAB A; 2ZSS A; 2LHB A; 1XCH A; 1MBA A; 1VXH A; 3LQD B; 1HCO A; 2FRK X; 5F0B A; 3E5O A; 3WFT A; 3SDH A; 104M A; 5SW7 B; 3VRE A; 1JL7 A; 2V1H A; 3FH9 B; 1MYZ A; 1TU9 A; 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