The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
48
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sequence length |
146
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structure length |
146
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Chain Sequence |
VHWSAEEKQLITGLWGKVNVAECGAEALARLLIVYPWTQRFFTSFGNLSSASAVLGNPNVRAHGKKVLTSFGEAVKNLDNIKNTFAQLSELHCDKLHVDPENFRLLGDILIIVLAGHFGKDFTPDCQAAWQKLVRAVAHALARKYH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Crystal structure of parrot hemoglobin (Psittacula krameri) at pH 7.5
rcsb |
| molecule tags |
Metal binding protein
|
| molecule keywords |
Hemoglobin subunit alpha
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| total genus |
48
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| structure length |
146
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| sequence length |
146
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2007-12-28 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| B | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3WCU C; 2D2N A; 3H58 A; 1Y0C B; 1X46 A; 1RQ4 A; 1HAB B; 1YEU A; 1Y4Q B; 1LFZ A; 4C0N A; 1HBB B; 1V07 A; 1T1N A; 1HDA B; 1VWT A; 5HY8 B; 2ZS1 D; 1LFT A; 1J7W A; 1QPW B; 3AT5 B; 2V1K A; 1A6G A; 3WFT A; 107M A; 1M9P B; 3E5O A; 1V4X A; 1I3E A; 3IC0 B; 1YEN A; 2D2N D; 1HGC A; 2ZST A; 1Y35 A; 2R80 A; 3PT7 A; 1HBS B; 4U8U C; 5CNG A; 3QM6 A; 1EW6 A; 3G4W A; 4M4A B; 1VXA A; 4MQI A; 1S56 A; 2EVK A; 2RAO B; 3OO4 B; 1S5X B; 1JL6 A; 3ED9 A; 1OBM A; 1DWT A; 1LA6 A; 3DR9 A; 3KUN A; 3PI3 A; 3LB3 A; 5SW7 A; 3R5I A; 4KJT A; 2PGH B; 3UHD A; 3ZJO A; 2DN3 B; 4MQK A; 1MYT A; 4O4T A; 1G09 A; 3GLN A; 3GQP A; 3K8B B; 1MBA A; 1MBO A; 2W31 A; 1Y46 B; 4G51 B; 4F69 A; 2ZFO B; 1FSX A; 3S48 C; 1JEB A; 3RJN B; 2VYY A; 4FWZ A; 1O16 A; 3ZJH A; 1Y8H B; 3UHI A; 4NI1 B; 1CG5 B; 3LQD A; 3NFE B; 3CY5 A; 2SPM A; 2EB8 A; 1BZ6 A; 2AUP A; 1CQ2 A; 1GJN A; 5KER B; 3ZJR A; 3V2V A; 1MYM A; 1MBS A; 3GOU B; 2W72 C; 3IC2 B; 2BMM A; 1Y45 A; 1SDK B; 1O1P B; 2W6W A; 1GDK A; 1HCO B; 2G14 A; 1YEO B; 2V1J A; 4WJG A; 3AQ6 A; 1Y8K A; 4ROM B; 1X9F C; 3KMF C; 1JW8 A; 1PBX B; 1ABW B; 4F6F A; 3GQR A; 3UBC A; 1QXE B; 1KFR A; 1CG8 B; 2MGC A; 4M4B A; 1YFF B; 2ZSZ A; 1RVW A; 3UHR A; 2G0V A; 3OZV A; 1M6C A; 4O35 A; 2D6C A; 3AQ7 A; 101M A; 3A5G A; 1SWM A; 3G4V A; 1QSI A; 1MWD A; 1O1K A; 1A4F A; 2YRS B; 1J7S A; 1DKE A; 1OFJ A; 1Y7Z B; 3D17 A; 1NIH A; 2D5X A; 2C0K A; 2ZSN A; 3MKB B; 2VEE A; 2LH3 A; 1Y09 B; 3B75 B; 3SZK A; 1XY0 A; 4DWU A; 2PEG B; 1UX8 A; 1MBN A; 3UHQ A; 1YHR B; 2DN2 A; 1MLG A; 2ZS0 A; 3DUT B; 3WFU A; 3ORD A; 2V1G A; 2MHB B; 1HHO A; 1A9W E; 1UMO A; 1MZ0 A; 1HBH A; 2MGK A; 3WCV A; 1IRD B; 1V4W A; 5CN9 A; 1FSL A; 3G4Q A; 1O1I A; 2HHD A; 1QSH A; 2HHE A; 1MOC A; 2HHB B; 1EBC A; 4MQH B; 2ZLX B; 1G0B B; 3WCV D; 3PI8 B; 4B3W A; 1G08 B; 1RTX A; 1YE0 B; 2HBE B; 1VXD A; 2MYD A; 2MGL A; 2D2M D; 3LHB A; 4U8U B; 3HYU A; 2EKT A; 1MNJ A; 1F63 A; 1O1J A; 3QJB A; 1MLM A; 1AJ9 A; 3QJE B; 1NEJ B; 2BLH A; 4L7Y B; 1YHU A; 1V75 A; 1A6K A; 2DXM A; 1MYF A; 1DWS A; 1J3F A; 2HBF A; 1C40 A; 1Y4R A; 1J52 A; 5CN4 A; 2M6Z A; 4WJG 1; 2GRZ A; 4UZV A; 2OIF A; 4XS0 A; 1M6M A; 2AUR A; 1VXC A; 2MGJ A; 4ODC B; 1B86 B; 4F6B A; 1Y0C A; 3RGK A; 1HAB A; 2BKM A; 1Y4Q A; 1HBB A; 1HDA A; 1FDH G; 3ZJQ A; 5HY8 A; 5JDO D; 3A0G B; 1O1L B; 1IRC A; 1QPW A; 3AT5 A; 2AV3 A; 1Y0A B; 1M9P A; 1LJW B; 3IC0 A; 4FWX A; 2D5Z B; 1HBI A; 1HBS A; 1GVH A; 2G0R A; 1O1N B; 4M4A A; 3FS4 B; 2R4Y A; 1MLQ A; 3D7O B; 2GL3 A; 3ZOL A; 2RAO A; 3OO4 A; 3GKV B; 1R1Y B; 1S5X A; 3MN0 A; 2R1H B; 2D60 B; 3EOK B; 2MYB A; 4HBI A; 1BUW B; 1COH B; 3TM9 A; 2PGH A; 5B84 A; 5HLX A; 1DLY A; 2DN3 A; 1X9F B; 1ABS A; 4HSW A; 1RSE A; 3WCT C; 5ILR A; 1MLH A; 1Y7C B; 3K8B A; 108M A; 2G3H A; 2AUQ A; 1J3Y B; 1N9I A; 1Y46 A; 1DTI A; 2SPL A; 4G51 A; 2ZFO A; 4O4Z A; 2FRK X; 2IG3 A; 3E5I A; 3EU1 B; 1OJ6 A; 1MLO A; 1LFL B; 3RJ6 A; 1S69 A; 3TM3 A; 1IT3 A; 1Y8H A; 4NI1 A; 1GCW B; 1RQA B; 1CG5 A; 3UH3 A; 1NPF A; 3NFE A; 1XZ2 B; 1MNH A; 1HBG A; 2ZLV B; 5CNE A; 1Y7D B; 3P5Q A; 3D1K B; 1JY7 A; 2VLY A; 1MLK A; 5KER A; 1FN3 B; 5E29 A; 5EQM A; 3GOU A; 1CO8 A; 1LH6 A; 3D1A B; 2VHB A; 3UHX A; 3IC2 A; 3WCW B; 1Y4V B; 2BK9 A; 1X3K A; 1MYZ A; 3IXF A; 1Y4P B; 1SDK A; 1O1P A; 2MGD A; 3UH6 A; 1A3O B; 1HBA B; 1HCO A; 1YEO A; 2HBD B; 1HLM A; 1YG5 A; 2GTL D; 3M39 A; 2LHB A; 4O2G A; 4TYX A; 5CN8 A; 2QMB B; 1LFQ B; 4ROM A; 3UH5 A; 1PBX A; 1ABW A; 1IOP A; 1QXE A; 1CG8 A; 1YFF A; 1RQ3 B; 3W4U B; 1Y01 B; 1DO3 A; 1YHE B; 1XXT B; 105M A; 4TWV A; 2MGH A; 3ONZ B; 2NRL A; 1A9W A; 3AQ9 A; 2YRS A; 1IBE A; 1SI4 B; 1Y7Z A; 3MKB A; 1J7Y B; 1Y09 A; 3B75 A; 2QU0 B; 1HBR B; 3HF4 B; 1MWB A; 2PEG A; 5HU6 B; 4UIQ A; 2HCO B; 5CNF A; 1NS9 B; 5C6Y A; 2LH5 A; 1LHT A; 2NRM A; 1YHR A; 1L2K A; 1IT2 A; 3DUT A; 4MQJ B; 2QLS B; 1RTE A; 2MHB A; 4B4Y A; 3KUO A; 4G1B A; 3UHV A; 3GYS B; 3UHG A; 110M A; 1DXV B; 1IRD A; 1G0A A; 1YEQ B; 1DO1 A; 1J40 B; 1BAB B; 3UHK A; 1HDS A; 2B7H B; 4N8T B; 4NS2 A; 1VHB A; 1GDL A; 4HRR B; 4ZVB A; 3ZJL A; 1CBL A; 2HHB A; 4MQH A; 4HSX A; 3QM7 A; 2ZLX A; 3HHB B; 1MLU A; 1G0B A; 2H8F B; 2EF2 A; 3PI8 A; 1G08 A; 1KD2 B; 2ZFB B; 1NZ5 A; 3LR9 A; 1YE0 A; 1GBU B; 3S1I A; 2HBE A; 3NL7 A; 3S65 B; 4U8U A; 2VYZ A; 3ZJM A; 5CNC A; 1CMY B; 2ZLU B; 2FRJ X; 1CPW A; 4ESA B; 3QJE A; 1NEJ A; 2R4W A; 3MJP B; 1MOB A; 4L7Y A; 1A6M A; 2NSS A; 3QZX A; 3G4Y A; 2ZS1 C; 2ZSO A; 1O1M B; 1MYI A; 3ARK A; 1DM1 A; 1ITH A; 3WCT B; 1Y5K A; 2D2N C; 1YVT B; 3K9Z A; 2O5O X; 1Y2Z B; 2RI4 B; 2V1E A; 1DWR A; 1FAW B; 4H0B A; 4ODC A; 1A0U B; 1B86 A; 3OGB A; 4FC3 B; 3PI1 A; 3MVC A; 1JWN A; 1CH9 A; 3A0G A; 1O1L A; 3E55 A; 1Y0A A; 1LJW A; 1XZ4 B; 1FLP A; 3G4U A; 1CLS B; 5CHQ A; 2D5Z A; 4F4O B; 1A0Z B; 3WR1 A; 1MYJ A; 5EE4 D; 1DO7 A; 1NWI A; 1O1N A; 3FS4 A; 3D7O A; 1YE2 B; 1LFV B; 3GKV A; 1WMU B; 1R1Y A; 2MGE A; 2R1H A; 5CN7 A; 2D60 A; 2BLJ M; 3ZJP A; 3EOK A; 2ZWJ A; 1BUW A; 1SPG B; 4ZVA A; 2HBC B; 1COH A; 2MGM A; 3A2G A; 2O5B X; 1X9F A; 4F68 A; 2GLN A; 3KMF A; 1LTW A; 2V1I A; 3ZOM A; 1Y7C A; 1VXG A; 3ECX A; 1J3Y A; 1CH1 A; 3HEN A; 1V4U B; 4QAU A; 1FDH A; 3EU1 A; 4PQB A; 2JHO A; 1F5O A; 3ZJS A; 1LFL A; 4YU4 B; 1DTM A; 3DHR B; 4KMW A; 1GCW A; 1MDN A; 1RQA A; 2MB5 A; 3PI4 A; 2ZLT B; 1DXC A; 3EDA A; 1XZ2 A; 2ZLV A; 1URY A; 1J41 B; 1GDI A; 1Y7D A; 1LHS A; 3R0G A; 1BZR A; 102M A; 4HRT B; 1Y5F B; 1FN3 A; 1V9Q A; 3WFW A; 2QFN A; 3D1A A; 1S61 A; 1BZ0 B; 3WCW A; 2O5T X; 4G1V A; 1Y4P A; 1HGA B; 2VM0 A; 1YMB A; 1A3O A; 1HBA A; 1HLB A; 2HBD A; 1OFK A; 4N7P B; 2E2Y A; 1XZV B; 2QMB A; 5KDQ A; 1HAC B; 1LFQ A; 1UFJ A; 4DC8 A; 3MYM A; 1MTI A; 2CMM A; 1Y22 B; 1OUU B; 3IA3 B; 2XYK A; 3WCW D; 1Y31 B; 2KSC A; 1RQ3 A; 3W4U A; 1HSY A; 1GBV B; 1C7B B; 3OZU A; 1YHE A; 1XXT A; 1QI8 B; 4MBA A; 1HDB B; 3WCU B; 1S5Y B; 3ONZ A; 5EYS A; 1SI4 A; 3UHY A; 3MBA A; 1MTK A; 2Z6T A; 3PI2 A; 2ZS0 D; 1JZK A; 1J7Y A; 2OLP A; 4GZG A; 2VLX A; 2ZT1 A; 2QU0 A; 1HBR A; 3HF4 A; 5HU6 A; 2HCO A; 4MPM A; 1NS9 A; 3O7N A; 1Y83 B; 1SHR B; 1YIH B; 1F65 A; 1THB B; 3G46 A; 3AQ8 A; 4MQJ A; 1S0H B; 3BJ1 B; 2QLS A; 2ZS1 B; 2VEB A; 1CBM A; 5M3S A; 3WCV C; 1NQP B; 3CIU B; 3GYS A; 3FH9 B; 1DXV A; 1YEQ A; 3VRG B; 1J40 A; 1BAB A; 2D2M C; 2B7H A; 3OJ1 A; 4N8T A; 2OH8 A; 3VRF A; 2W6V B; 106M A; 3PT8 B; 5CHR A; 4HRR A; 1YMA A; 2DN1 B; 1YVQ B; 5JDO F; 4F6J A; 6HBI A; 2MYA A; 3UH7 A; 3HHB A; 4MQG B; 1Y4G B; 2H8F A; 3ZH0 A; 1Y0T B; 1KD2 A; 2ZFB A; 3A9M A; 3LB1 A; 3WCP B; 1GBU A; 3HXN B; 1AZI A; 1YDZ B; 1KR7 A; 1YHU D; 1OR4 A; 1JF4 A; 3S65 A; 1NAZ A; 2VYW A; 2XKG A; 1YGF B; 5CNB A; 1Y5J B; 1R1X B; 1CMY A; 2ZLU A; 3U3E A; 1LH1 A; 6HBW B; 4ESA A; 2HZ2 A; 104M A; 3MJP A; 4FH7 A; 3UHH A; 2HZ3 A; 4HHB B; 1NS6 B; 3PI9 B; 4AVE A; 5JDO C; 1O1M A; 7HBI A; 4TWU A; 1G09 B; 2Z85 A; 3NMM B; 2W72 B; 4O1T A; 3WCT A; 2G10 A; 1UX9 A; 1YVT A; 1Y2Z A; 2RI4 A; 3OZW A; 1FAW A; 1JEB B; 112M A; 2IN4 A; 3LB4 A; 2SPN A; 3A59 B; 1A0U A; 3TLD A; 2W6Y A; 4KN3 A; 4FC3 A; 5HAV A; 2QSP B; 1NZ3 A; 1LH2 A; 111M A; 1Y7G B; 4X0L B; 2ZSQ A; 2R4X A; 1VXE A; 2OH9 A; 3AG0 A; 4YU3 B; 1Q1F A; 1UT0 A; 1BJE A; 1MYG A; 1Y85 B; 1ECD A; 3G4R A; 1AJG A; 2XKH A; 1CLS A; 4F4O A; 3UHT A; 3OO5 B; 3QM8 A; 2ZSR A; 3ZHW A; 1GCV B; 1N9F A; 1CO9 A; 2MGI A; 1XCH A; 1Y8I B; 2QFK A; 1MBC A; 4C44 A; 1YE2 A; 1FHJ B; 1LFV A; 1WMU A; 1Y4B B; 3QMA A; 4BJA A; 1Y4F B; 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1YGD B; 2AA1 B; 2V1H A; 1XZU B; 3M3B A; 3WCU D; 1THB A; 1S0H A; 2Z8A A; 3BJ1 A; 3UI0 A; 2ZS1 A; 1BVC A; 1DXD A; 1RPS B; 1K0Y B; 1YEV B; 1C7D B; 1NQP A; 4XS0 B; 3CIU A; 2MGA A; 3FH9 A; 1Y8W B; 2WTG A; 3VRE B; 3VRG A; 1JDO A; 3AT6 B; 5HBI A; 2R50 A; 4LPI A; 3UGY A; 1EMY A; 3BOM B; 2W6V A; 1QXD B; 3S66 B; 3PT8 A; 5JGG B; 1ECA A; 2DN1 A; 4U8U D; 1ABY B; 1YVQ A; 2LH7 A; 5ILP A; 1DUK A; 4IRO B; 4MQG A; 1Y4G A; 5JDO E; 1Y0T A; 2OHB A; 3WCP A; 3VAU A; 1JF3 A; 1HGB B; 3UGZ A; 1LH5 A; 1GLI B; 3HXN A; 1YDZ A; 1YGF A; 3UHE A; 2VRY A; 1Y5J A; 2EKU A; 1N9X A; 3BA2 A; 1R1X A; 2LH1 A; 1Y0W B; 3M38 A; 6HBW A; 2EVP A; 2H8D B; 2Z6N B; 5CMV A; 1MOD A; 4HHB A; 5ILE A; 3NG6 B; 1XZ7 B; 1NS6 A; 3PI9 A; 3H57 A; 4NZI A; 4JYQ A; 3WTG B; 3NMM A; 1XZ5 B; 1BIJ B; 2W72 A; 3BJ3 B; 1MLN A; 2GKN A; 2GRH A; 3OVU C; 2HBS B; 2WTH A; 3A59 A; 5EE4 C; 2LH2 A; 4SDH A; 1LUE A; 2QSP A; 1IWH B; 3SDH A; 1S6A A; 1VXB A; 1MBI A; 3UHS A; 4DWT A; 1Y7G A; 4X0L A; 1O1O B; 4MBN A; 3PEL B; 4YU3 A; 2ZT4 A; 1H1X A; 2GTL B; 1J3Z B; 2ZSS A; 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