2ZS1 | Genus

Total Genus 59

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	59
sequence length	147
structure length	147
Chain Sequence	SSCCSSEDRANVMHNWDAAWSAAYSDRRVALAQAVFASLFSRDAAAQGLFSGVSADNPDSADFRAHCVRVVNGLDVAINMLNDPAVLNEQLAHLSAQHQARAGVAAAHFDVMAEAFAEVMPQVSSCFSSDSWNRCFARIANGISAGL

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

loadScript /static/js/j2s/core/package.js

loadScript /static/js/j2s/core/corejmol.z.js

loadScript /static/js/j2s/core/corescript.z.js

JSmol exec jmolApplet0 start applet null

Jmol JavaScript applet jmolApplet0__439686838683589__ initializing

Jmol getValue debug null

Jmol getValue logLevel null

Jmol getValue allowjavascript null

AppletRegistry.checkIn(jmolApplet0__439686838683589__)

vwrOptions:

{ "name":"jmolApplet0","applet":true,"documentBase":"https://genus.fuw.edu.pl/view/2ZS1/C/","platform":"J.awtjs2d.Platform","fullName":"jmolApplet0__439686838683589__","codePath":"https:/static/js/j2s/","display":"jmolApplet0_canvas2d","signedApplet":"true","appletReadyCallback":"Jmol._readyCallback","statusListener":"[J.appletjs.Jmol object]","syncId":"439686838683589","bgcolor":"white" }

setting document base to "https://genus.fuw.edu.pl/view/2ZS1/C/"

Jmol Version: 14.29.13 2018-04-17 17:17

java.vendor: Java2Script (HTML5)

java.version: 2018-01-28 23:38:52 (JSmol/j2s)

os.name: Mozilla/5.0 AppleWebKit/537.36 (KHTML, like Gecko; compatible; ClaudeBot/1.0; +claudebot@anthropic.com)

Access: ALL

memory: 0.0/0.0

processors available: 1

useCommandThread: false

appletId:jmolApplet0 (signed)

Jmol getValue emulate null

defaults = "Jmol"

Jmol getValue boxbgcolor null

Jmol getValue bgcolor white

backgroundColor = "white"

Jmol getValue ANIMFRAMECallback null

Jmol getValue APPLETREADYCallback Jmol._readyCallback

APPLETREADYCallback = "Jmol._readyCallback"

callback set for APPLETREADYCallback Jmol._readyCallback APPLETREADY

Jmol getValue ATOMMOVEDCallback null

Jmol getValue AUDIOCallback null

Jmol getValue CLICKCallback null

Jmol getValue DRAGDROPCallback null

Jmol getValue ECHOCallback null

Jmol getValue ERRORCallback null

Jmol getValue EVALCallback null

Jmol getValue HOVERCallback null

Jmol getValue IMAGECallback null

Jmol getValue LOADSTRUCTCallback null

Jmol getValue MEASURECallback null

Jmol getValue MESSAGECallback null

Jmol getValue MINIMIZATIONCallback null

Jmol getValue SERVICECallback null

Jmol getValue PICKCallback null

Jmol getValue RESIZECallback null

Jmol getValue SCRIPTCallback null

Jmol getValue SYNCCallback null

Jmol getValue STRUCTUREMODIFIEDCallback null

Jmol getValue doTranslate null

language=en_US

Jmol getValue popupMenu null

Jmol getValue script null

Jmol getValue loadInline null

Jmol getValue load null

Jmol applet jmolApplet0__439686838683589__ ready

script 1 started

platformSpeed = 8

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Oxygen storage, oxygen transport
publication title	Structural Basis for the Heterotropic and Homotropic Interactions of Invertebrate Giant Hemoglobin pubmed doi rcsb
molecule keywords	Extracellular giant hemoglobin major globin subunit A1
total genus	59
structure length	147
sequence length	147
ec nomenclature
pdb deposition date	2008-09-02

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
C	PF00042	Globin	Globin

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
1.10.490.10	Mainly Alpha	Orthogonal Bundle	Globin-like	Globins	2zs1C00

1KFRA 1URYA 5HLUA 4F6BA 5B85A 1GDLA 1YE2A 1BZZB 4U8UA 110MA 2ZFOB 4H0BA 3UHTA 4WJG1 1LFLA 1AJHA 2HHBB 3LB4A 2D6CA 5JDOE 1HBHB 4IT8A 3D4XA 4ROLB 1V4WB 1GBVA 3LR9A 3ZJQA 2QRWA 1MLOA 1O1PA 3HRWB 2SPLA 1YEUA 4L7YB 2XKIA 1JPBA 2ZLUA 1Y8WA 3AQ6A 1QI8A 2BLIA 1FN3A 2PGHA 4HRTB 1YOGA 2MGFA 1CBLA 3G4WA 3VREA 1G09B 1YG5A 1HGBA 1Y35B 1DKEB 3WFTA 1IDRA 3LB1A 3MKBA 1JY7B 1SHRA 1Y4FB 1Y09A 1MYHA 3UHYA 1Z8UB 3ZJSA 1V4UA 1J41A 3WCVC 3S1IA 1MBSA 2W72A 3D7OA 1Y01B 3D17B 4ESAA 1C7CB 2AV0A 1GCWA 1BZ6A 1O1LA 1XCHA 1R1XB 3IA3B 5EV5A 4PNJA 1FSXB 1LA6A 1LFQA 1CH2A 2Z6NB 1JP8A 1J7WB 3MVCA 2O5LX 3SDHA 2ZLWA 2V1EA 3UHWA 2H8DB 1BZ1B 5EOHA 1UC3A 2DN3B 5HBIA 1HCOA 1DXTA 5CN8A 2GRHA 1B0BA 4KMWA 1HABA 1V4XA 2MYBA 3OK5A 2ZS0C 4X0LA 2G0VA 2DXMA 2SPOA 1BIJB 3PI9A 3UHNA 2XYKA 1MOBA 3GQRB 4YU4B 2LH6A 3G4QA 2VEBA 2SPMA 101MA 3OJ1A 1LFZB 1MLRA 2AV3A 3S1JA 1CG5B 1YDZA 2HHEB 2VLXA 3QZXA 1NS6B 1O1IA 2GRFA 1MYZA 4BJAA 1R1YA 1A6GA 3WCTC 3EOKB 1S5XB 4F6IA 1BUWB 4NI1A 1MLNA 3WCWB 4F6DA 4KJTA 3MOUA 5KKKA 3ZJLA 2HZ1A 1KD2B 1F65A 1PBXA 2EB9A 1MWCA 4QAUA 1EBCA 1H1XA 1LJWA 1Y5JA 5EUIB 2HBFB 4NI0A 1VXCA 1Y8IA 1LFVA 1XZ5A 1J3YB 2HCOB 2G14A 1G0BA 3AT6A 2R4XA 4O1TA 3MJUA 1Y4VB 3NFEB 4ROMA 3A2GA 1V4WA 1Y4GA 5CNDA 1NPGA 1HGAB 1Y85B 5EQMA 1XQ5B 2BWHA 3HRWA 4L7YA 4ZVBA 1A01B 2OH9A 2DN1A 1A6NA 5CN6A 2GLNA 4B4YA 1LH6A 1HBRB 3ASEA 3DR9A 1K0YA 3GKVA 3DHTB 1AJ9B 1MYIA 4JACA 1OUUB 4O4TA 2WTHA 1MBOA 4B3WA 1TESA 4FC3B 1N9XA 3G4YA 103MA 1NS9A 4JYQA 1NZ3A 2R50A 3S66B 3WCUB 4TYXA 1YEQB 3ZJIA 3S65B 1BINA 1YFFB 1HLBA 2Z6SA 1A00B 3WR1B 1YGDB 2G3HA 5JOMA 3WCPA 5E6EA 1C7CA 2HBDB 4FH6A 1FSLA 1R1XA 2W6YA 3BCQA 3B75B 1MDNA 1DUKA 1Y0CA 1S61A 3OZUA 2GKNA 1XZ4A 1JW8A 3G4UA 1DXVA 2ZFBA 3WI8A 1J7WA 2AUPA 2YRSB 3CY5A 2LH2A 1MLSA 1A4FB 3GYSA 3LQDA 1Y4BA 2FAMA 5EE4D 1JWNA 5HY8B 2ZSXA 1HBIA 4MQHA 4C0NA 4N7PB 5ILMA 4YU3A 3LR7A 4GZGA 1V07A 2MYCA 1RQ4A 1MLJA 2MGBA 1UX9A 1XXTB 4N7NB 1VXFA 5E29B 1A3OA 1Y7CB 4MQIB 1XZUB 3LHBA 1HDBB 5IKSA 2D5ZA 1DWSA 1IBEB 2ZSPA 1S0HB 4IROB 2MGAA 2GTLD 4G1VA 4MPMA 1YHUC 2D2NC 1C7BA 1Y8HA 1OFKA 1DWRA 1ECAA 4KN3A 5KERA 1QPWB 4MBAA 5D5RA 1J52A 2DHBA 3ARJA 1CG8A 1YE2B 4U8UB 5CN4A 3NMMA 1BUWA 1VRFA 3H57A 3VHBA 1O1KA 1IT3A 1HSYA 1S5YA 3UHZA 2M6ZA 3WCWA 3A5AA 3MYMA 1BZRA 1MLUA 1UFJA 1Y5FA 1YZIA 2GNWA 2R4ZA 1GBVB 2GTLA 1NEJA 1EW6A 5CHQA 1MLQA 5EUIA 1O1PB 2MGGA 1JZLA 3U3EA 2ZLUB 1Y8WB 1QI8B 3GLNA 1QSHA 1FN3B 1BZPA 2PGHB 1F5PA 1L2KA 1JL7A 4DC8A 3NFEA 2D60A 3WFXA 1OUTA 1CH3A 1A0UA 3VREB 1YG5B 1Y4RA 2QFKA 1C7DA 3MKBB 1YMBA 1SHRB 1HBSB 1UIWA 1HBRA 2O5SX 1Y09B 5HLXA 1V4UB 1J41B 5JGGB 1CO9A 3ZJPA 3KMFA 3PIAB 1OR4A 3D7OB 4HSXA 1MTIA 1GCWB 1LH3A 1YVQA 1V75A 1O1LB 2HZ2A 2NRMA 1YH9A 2H8FA 3PI4A 1LA6B 1LFQB 1G0AA 3UGYA 2V1GA 1VXBA 1KR7A 2ZLWB 1V5HA 1SPGB 2SPNA 3NG6A 3SDNA 1HCOB 2ZT1A 4AVEA 2GDMA 1HACB 1VWTA 1HABB 1MBAA 2VYWA 1V4XB 1YVTA 1MYJA 1YHEB 1WLAA 4X0LB 2DXMB 2O5MX 1LFYA 3UH5A 1HHOA 3QM6A 1SPEA 3WTGA 2D2MD 1DWTA 5HY8A 3QJEA 3PI9B 1HGCA 1ECNA 2AA1A 2HBEB 1CIKA 3UHCA 3TM3A 2W72C 1YDZB 4UURA 3GQPA 2MGEA 1O1IB 3IXFA 1R1YB 1HLMA 1YHRB 3VRGA 1DO4A 3S48C 2D2MA 4NI1B 2VYYA 1X9FD 5ILRA 1BZ0A 5E83A 1QPWA 2VYZA 1PBXB 1MOAA 1VXEA 4N7OA 1MLKA 5CN9A 2ZS1C 1O1OA 1CPWA 1LJWB 1UMOA 2O58X 2R1HA 1Y5JB 1CQXA 4NI0B 2HHDA 5AZRA 2ZSZA 1MBCA 1YIHA 3ONZA 1Y8IB 1LFVB 1XZ5B 3UHXA 4DWUA 3TLDA 2EVKA 3UHGA 1JEBB 1G0BB 3AT5B 1MKOA 3AT6B 3MJUB 1CH7A 3E5IA 4ROMB 1Y4GB 2Z85A 1YE0B 2G12A 1YOIA 2DN2A 1ABSA 2VLYA 1OFJA 2MGDA 1YOHA 2DN1B 1N9IA 3IC0A 2QU0B 1A0ZA 1LH7A 3QQQA 5EYJA 1NAZA 3WHMA 1K0YB 2HBCA 3GKVB 1B86A 2G0XA 3RJ6A 2HBGA 3PI8A 1T1NA 1I3EA 4O35A 1YIEA 4SDHA 1NZ5A 1HJTA 3MBAA 1HBSA 1NS9B 1NZ2A 1SDKA 4NZIA 5JGGA 2EF2A 1GDKA 1QSIA 3PIAA 2BLHA 1YEVA 3WCPB 4MQGA 1UVXA 1Y2ZA 5E6EB 3AG0A 3BCQB 2ZFOC 1Y0CB 106MA 3UI0A 3UHUA 1NIHA 1XZ4B 1DXVB 2ZFBB 1BABA 1MOHA 4PQCA 1LTWA 3CY5B 1AJGA 5ILPA 3GYSB 4MXLA 1SPGA 3LQDB 3AQ7A 1Y4BB 4MQHB 4TWVA 4YU3B 1HACA 3QJBA 4MBNA 6HBWA 1RQ4B 3WFWA 4MXKA 1EMYA 3P5QA 1YHEA 1A3OB 2OIFA 1DXCA 3D1KA 2D5ZB 1RPSA 2ZSOA 2EKUA 2HBEA 3AQ8A 1Y0TB 3OZWA 4F4OA 3E4NA 3ZOLA 104MA 1C7BB 1Y8HB 1Y7ZA 3WCVD 4H2LA 1VXDA 4HRRB 3QZZA 1A9WE 5KERB 1YENA 2DHBB 1CG8B 1K1KB 1YHRA 1YCBA 2QSSB 2OHAA 3NMMB 4ODCA 2QFNA 1O1KB 1S5YB 1UT0A 2M6ZB 2NSRA 1TU9A 1Y5FB 2EVPA 4FWXA 1RVWA 1YZIB 3CIUA 3QM7A 1RSEA 2GTLB 5MBNA 1NEJB 3RGKA 3O7NA 1BBBA 5CNBA 3WCVA 4M4AA 2ZWJA 1QSHB 1VXGA 1JEBA 3AT5A 1URVA 3OZVA 2G11A 3A5BA 2D60B 4HSWA 2R4YA 5JDOC 1OUTB 2FALA 1MYTA 2ZS0D 1A0UB 1YE0A 5CN5A 1LHSA 1Y22A 1QXEA 1HDAA 4F6GA 1Y4RB 1C7DB 5AZQA 2HBSA 109MA 3PI1A 1UIWB 2QU0A 1CO8A 1J7SA 1CP5A 3QMAA 1FDHG 2NRLA 2IG3A 1Y0AA 1HDSA 1Y31B 5C6YA 1Y83A 1ABYA 1Y45B 1FDHA 1YVQB 5ILEA 1V75B 5C6EA 1LHTA 1YH9B 3FS4A 2H8FB 2ZS0A 3WCTD 1DXUA 4N8TA 1G0AB 4M4BA 3GQGA 4C44A 3UH6A 3WCWC 1XZVB 2W6WA 3NMLA 1VXHA 3ZHWA 7HBIA 2MGHA 4VHBA 112MA 3NG6B 1JL6A 1VWTB 3ZJHA 1YVTB 1J3FA 4F68A 1DO1A 2QSPA 1LFYB 1JF4A 1HHOB 1LH5A 3WTGB 2GL3A 4HBIA 3QJEB 1HGCB 1MOCA 1IRDA 2AA1B 3MN0A 3UHBA 2GRZA 3UHKA 4MQKA 1CLSA 1Q1FA 3KMFC 1O1MB 3GQPB 1F5OA 5EETA 3WFUA 5KDQA 3QM9A 3OO5B 3VRGB 3WCUC 1Y0TA 2D2MB 3HYUA 3BJ3A 1OR6A 4HRRA 1BZ0B 1F63A 5E83B 2OLPA 2BNLA 1A3NA 4N7OB 1K1KA 2QSSA 5F2AA 1O1OB 3GDJA 2R1HB 3ORDA 1MNIA 3ZJOA 1QXDA 2HHDB 1GLIA 1M6MA 1ECDA 3AQ5A 1YIHB 3ONZB 4FH7A 2FRJX 2MHBA 1IT2A 1ASHA 3NL7B 1MKOB 3DHRA 3AQ9A 2BKMA 1XYEA 3EU1B 2O5OX 1HBAA 1C40A 1DTIA 3K8BA 2ZLVA 1FAWB 2DN2B 3OGBA 3W4UA 2Z6TA 3ZJRA 4G1BA 3IC0B 5SW7B 1A0ZB 1Y8KA 2QMBA 3WHMB 1RTEA 3UH7A 2HBCB 2ZT3A 1B86B 3PI8B 4ILZA 1NGKA 1ABWA 1T1NB 3M3BA 1GZXA 1YIEB 4O4ZA 1DLWA 4FWZA 3MJPA 2H35B 3M3AA 2D5XB 1A6KA 1SDKB 2AURA 1Y31A 1QSIB 5HAVA 2G10A 1YHUD 1THBA 4UZVA 2D2ND 1J3ZA 1YEVB 4MQGB 1Y2ZB 1Y45A 4DWTA 2O5TX 1MBNA 1YGFA 2BK9A 2V1JA 4U8UC 4LPIA 3SZKA 1MLGA 1U7RA 1WVPA 2W31A 4F69A 1RQAA 1FCSA 1NIHB 1XZVA 3HC9A 1YMAA 1BABB 1IRCA 3E55A 105MA 3PT7A 1CQ2A 1A9WA 1NQPA 3GOUA 1YHUA 1OJ6A 2D2NA 3QM8A 3RJNB 4PQ6A 3QJBB 6HBWB 2EB8A 1S69A 2O5BX 3P5QB 1CH4A 1LH1A 1M6CA 3G52A 3ZJJA 1Y0DA 3D1KB 2ZLTA 1RPSB 5EYSA 4MQCB 4MQJA 1AZIA 3PI2A 4NXAA 2AUOA 3IC2A 3HHBA 3LB2A 2RAOB 3HXNA 4F4OB 1Y7ZB 1VXAA 1O1MA 1XZ7A 2O5QX 3ECXA 4H2LB 5CNGA 3TM9A 1YENB 4F6FA 3OO5A 3V2ZA 111MA 1Y4QA 4ODCB 3VRFB 2MB5A 1O1NA 1OBMA 5HU6A 4XS0A 1Y4PA 1HV4B 2R80B 1RQ3B 3BJ1B 1RVWB 4NK2A 1YMCA 3CIUB 3R5IA 1JP9A 1MNHA 3QJCA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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2ZS1C

Total Genus

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structure length

Chain Sequence

Structure visualization

Chord Diagram

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pfam database annotations