The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
53
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sequence length |
146
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structure length |
146
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Chain Sequence |
SDFTQEERQFIVNLWGRVDVEQIGAEALARLLIVYPWTQRFFSSFGNLSSPSAILHNAKVHAHGKKVLTSFGEAVKNLDQIKQTFAQLSELHSDKLHVDPENFKLLGNILIIVLAAHFGKDFTPASQAAWQKLVSAVAHALALRYH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Side-necked turtle (Pleurodira, Chelonia, reptilia) hemoglobin: cDNA-derived primary structures and X-ray crystal structures of Hb A.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
AlphaA-globin
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| molecule tags |
Oxygen transport
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| total genus |
53
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| structure length |
146
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| sequence length |
146
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2010-12-26 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| B | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1XZ4 B; 3D17 A; 2VYW A; 4FC3 A; 2G0Z A; 4F6B A; 3UHC A; 3PT7 A; 3OZU A; 4M4B A; 1Y5F A; 2QFK A; 5SW7 B; 4N7P A; 3D4X B; 1A0Z A; 2GNW A; 2OIF A; 2EVP A; 1V9Q A; 3GYS A; 3GKV B; 3WCP B; 4N7N A; 3LB4 A; 2NRL A; 3G4R A; 1X9F D; 1Y22 B; 4YU4 A; 5CNE A; 1MNI A; 3GQP A; 1BAB B; 2H8D A; 4NS2 A; 3UGY A; 1JF3 A; 1DO4 A; 2WTG A; 2HCO A; 1FHJ B; 2E2Y A; 5B85 A; 2ZS0 C; 2HBC B; 3E4N A; 5HLQ A; 2H35 A; 1QSI A; 2D5Z A; 1IT2 A; 4ILZ A; 1RQ3 B; 1HDS B; 1MTJ A; 1MLH A; 3UHX A; 1Y5J A; 3WHM B; 2FAM A; 3IC2 A; 5CN6 A; 2AA1 B; 2YRS B; 5JDO D; 1NQP B; 3UHU A; 1MZ0 A; 3PI8 A; 2QSP A; 3ECZ A; 1CH2 A; 1J3F A; 3NFE B; 1A3O B; 2PEG A; 2DN2 B; 4DC7 A; 3EOK A; 1DO7 A; 1THB A; 2MHB A; 3ODQ A; 3DR9 A; 2IN4 A; 3G4W A; 2NX0 A; 1YE2 B; 4G1V A; 3G53 A; 1DWT A; 1YHU B; 3M3A A; 2VHB A; 2MYE A; 4ODC A; 2BLI A; 1MYZ A; 3EU1 B; 1Y46 B; 1BZ6 A; 2GRF A; 1NEJ B; 2V1I A; 3PI9 A; 4QAU A; 3WCT D; 1HHO A; 1XZ7 B; 1J7Y B; 4XS0 B; 4F4O B; 1AZI A; 3BJ1 A; 1RQ4 B; 1MTI A; 1MKO A; 3WCW B; 2WY4 A; 5F0B A; 1VHB A; 2Z6N A; 1O1J B; 2MGM A; 1YDZ A; 2ZFB A; 4HRT A; 2M6Z B; 3UHS A; 3P5Q A; 1BZ0 B; 1LA6 A; 3ASE A; 1K1K B; 1S56 A; 1ECN A; 110M A; 1FSL A; 3ECX A; 2O5Q X; 1UVX A; 2PGH B; 1DXT B; 2QRW A; 4JAC A; 3MN0 A; 3MYM A; 5EE4 C; 3D1K A; 3BJ2 A; 1W92 A; 5EYJ A; 1O1M B; 1N9I A; 2LH5 A; 3R5I A; 3AT5 B; 2D2M B; 1DWR A; 3BCQ B; 2R50 A; 1DUO A; 1DXU A; 1VXD A; 1V5H A; 1HBS B; 1CQX A; 3LB3 A; 1VWT A; 1LH5 A; 1IRC A; 4U8U D; 4NI0 B; 2AV3 A; 2R80 B; 1Y8H B; 1VXB A; 1GBU A; 4FWX A; 1NS6 B; 4DWT A; 1JWN A; 3NML A; 3KUN A; 5D1V A; 5HBI A; 2DHB B; 2ZS1 C; 1HCO A; 4NK2 A; 1Y7C B; 1Y7G A; 1AJ9 B; 5HLX A; 2XKH A; 3A0G B; 3PEL B; 1G0A B; 3D17 B; 2ZS0 A; 4HRR B; 1OR4 A; 3PT7 B; 5C6E A; 1OFJ A; 1QXD B; 2ZFO C; 1C7B A; 3WCU C; 2G0X A; 4M4B B; 1Y5F B; 1NZ2 A; 3QM5 A; 4N7P B; 1BJE A; 3PI2 A; 3D1A A; 3QM8 A; 1A0Z B; 3LR9 A; 2R1H A; 3AG0 A; 3GOU A; 1YEV A; 4YU4 B; 2FRI X; 1GLI A; 2AUR A; 3WTG A; 4KJT A; 2O5T X; 3ARK A; 3ONZ A; 3GQP B; 2H8D B; 2HCO B; 1U7R A; 4L2M A; 2EVK A; 5CN5 A; 2HBF A; 2EF2 A; 2MGC A; 4X0L A; 3CY5 B; 2DN1 A; 2VEE A; 3ZJJ A; 2H35 B; 1QSI B; 3PIA A; 1YH9 A; 4UZV A; 1Y5J B; 1YOI A; 4HBI A; 3IC2 B; 3A2G A; 1Y4G A; 4FWZ A; 1MNJ A; 2QSP B; 1GDK A; 2VRY A; 1YVQ A; 1NZ3 A; 2ZLT A; 3FH9 A; 4DC8 A; 2PEG B; 1BVD A; 1XYE A; 1A6G A; 1MNO A; 2MHB B; 3M39 A; 3ODQ B; 3MKB A; 1HAB A; 1MLS A; 107M A; 1C7D B; 3IA3 B; 3A5G A; 2BW9 M; 4B3W A; 1J3Y B; 4ROM A; 1Y4V A; 3E55 A; 1NZ4 A; 1IRD B; 4ODC B; 4GZG A; 1OUT A; 1O1K A; 2G0S A; 3GDJ A; 1XZ5 B; 1HHO B; 1YMC A; 1MNH A; 1R1X A; 2GTL B; 2D6C A; 7HBI A; 1BVC A; 3BJ1 B; 3G4V A; 3AQ8 A; 3SZK A; 2Z6N B; 1GCW B; 4HRT B; 2ZFB B; 3ZJN A; 4ESA A; 2QLS A; 4H0B A; 4MQC A; 1LFZ A; 1O1O A; 1JDO A; 2ZS1 A; 1LTW A; 1DXV A; 1QI8 B; 1YEQ A; 5EOH A; 5CN4 A; 3D1K B; 4PQC A; 3QJE A; 3R5I B; 4VHB A; 1NS9 A; 2G10 A; 4NZI A; 1VWT B; 1JZK A; 1FN3 A; 1OR6 A; 4O1T A; 3AQ7 A; 112M A; 1MWD A; 1YEN A; 1JY7 A; 3QQR A; 2W72 C; 2ZSR A; 1F65 A; 2RAO A; 1HCO B; 3RJN B; 4BJA A; 2HZ2 A; 2B7H B; 1CIO A; 1XY0 A; 4MQH B; 1A4F A; 2Z8A A; 103M A; 1YE0 A; 3ZJL A; 5EE4 D; 3WCV C; 5JGG A; 1HDA A; 2ZLX A; 2JHO A; 5CHQ A; 4OOD A; 2LHB A; 5C6E B; 1C7B B; 1JP9 A; 1SDK A; 1HRM A; 1S5X B; 1Y45 A; 1Y0C B; 1ITH A; 4U8U C; 3RJ6 A; 5EUI B; 1SI4 B; 4OF9 A; 2EKT A; 3HC9 A; 2R1H B; 5E83 B; 4C0N A; 1SHR A; 5CMV A; 3GOU B; 1YEV B; 1COH A; 1GDJ A; 3D7O A; 1MLO A; 2ZS1 D; 1VXA A; 1GLI B; 3WTG B; 3HRW A; 2V1E A; 3ONZ B; 1CH7 A; 2GKN A; 1G09 A; 5MBN A; 1CBL A; 1MOC A; 2HBF B; 5MBA A; 3UHT A; 1CP0 A; 2DN1 B; 1A3N A; 3LQD B; 2ZFO D; 3WCU D; 1YH9 B; 1HAC A; 1YZI A; 3SDH A; 1LFY B; 1I3E A; 3MYN A; 4HHB A; 4O35 A; 3UHR A; 4KMV A; 2H8F A; 1HGB B; 3DUT A; 1FSX B; 1YIH B; 1YVQ B; 1Y83 B; 2ZLT B; 1RVW A; 4F6J A; 3ARJ A; 4HSW A; 1XYE B; 2ZSO A; 3G4Q A; 1CG5 A; 1V4U A; 3G46 A; 1Y8W A; 3MKB B; 1YOH A; 1HAB B; 1YIE B; 1A9W E; 1Y4F A; 1JZL A; 1RPS A; 1Y31 A; 3K8B A; 3LB2 A; 1HDB A; 4ROM B; 1Y4V B; 1Y4B A; 3OZW A; 1JEB A; 1OUT B; 1O1K B; 3GDJ B; 1YHU D; 2ZSQ A; 1VRE A; 2DXM A; 5JDO E; 4M4A A; 3OJ1 A; 2IG3 A; 3WCT A; 3FS4 A; 2V1G A; 4MQJ A; 1MLF A; 1VXF A; 2GRH A; 1MLL A; 3UI0 A; 1GZX A; 1C7C B; 4MXL A; 1J7S A; 1G0B A; 2O5M X; 1AJG A; 3SZK B; 1G08 B; 1Y0A A; 1Y0D A; 2ZSN A; 3UHB A; 2QLS B; 2QFN A; 4MQC B; 2W72 A; 1LFZ B; 2O5B X; 1ECO A; 1DXV B; 4FH7 A; 1HBB A; 1MBD A; 4N8T A; 1WMU A; 3WFX A; 3QJC A; 1GJN A; 1XXT A; 2OHA A; 1Y09 B; 1XZV A; 1KD2 B; 3QJE B; 1RQA A; 2D2N C; 1ABW A; 1YFF A; 1YHR A; 1B86 A; 1OUU A; 2MYA A; 102M A; 3PI4 A; 4U8U A; 1J41 A; 1Y01 B; 4IT8 A; 1FN3 B; 1J52 A; 1DO3 A; 1YGD A; 1EBC A; 4NI1 A; 1YEN B; 3OO4 A; 3MJU B; 2HHD B; 3NMM A; 5HY8 A; 1BUW A; 4G51 B; 2RAO B; 3GK9 A; 1YHE A; 1Y35 B; 3ZJO A; 1X3K A; 3UHD A; 3VRG A; 1XY0 B; 5KER A; 1A4F B; 4ROL A; 1URY A; 2D5X A; 1HBA A; 3M38 A; 1HDA B; 2EB8 A; 1NXF A; 5E29 A; 1LHS A; 1SDK B; 1MOA A; 1Y45 B; 2GRZ A; 3B75 A; 1HGA A; 1HBG A; 1Q1F A; 1Y85 A; 2MGF A; 4IRO B; 1MBS A; 111M A; 2BK9 A; 1A01 A; 3LHB A; 4G1B A; 3UHG A; 4F68 A; 1X9F B; 3VRF A; 2D60 B; 2VEB A; 1BZZ B; 1COH B; 3D7O B; 3EDB A; 3G4U A; 1J40 A; 1G09 B; 5CHR A; 1RTE A; 4N7O A; 1BIJ A; 3WFT A; 4PQ6 A; 1Z8U B; 4F6G A; 1Y8K B; 3R0G A; 3WCV D; 2MGI A; 1HBR A; 3VRE A; 3MBA A; 1Y5K A; 4F69 A; 3QJD A; 1FAW A; 1ECA A; 2MB5 A; 1LH2 A; 1YCB A; 1A3N B; 1MYG A; 2OHB A; 1YZI B; 2G11 A; 4MAX A; 1V4W A; 1M9P A; 2FAL A; 3MVC A; 3NL7 A; 2LH7 A; 5CN9 A; 2HHB B; 5KKK A; 2EB9 A; 3DUT B; 1NPF A; 4XDI A; 1RVW B; 1J7W A; 2QU0 A; 4MQK A; 3S65 A; 3UHQ A; 2MYC A; 1Y8W B; 1CO9 A; 2C0K A; 3ZH0 A; 2ZT2 A; 2W6V B; 3AQ9 A; 1Y31 B; 1RPS B; 1CG8 A; 1JZM A; 5KDQ A; 4FC3 B; 3NG6 A; 3K8B B; 2Z6T A; 3CIU A; 1HDB B; 1BBB A; 1Y4B B; 1VXE A; 1JEB B; 1S0H A; 4O2G A; 2CMM A; 3GKT A; 3ZOL A; 1ABY A; 2D2N A; 3OO5 A; 1O1L A; 3QMA A; 3WCT B; 1CH5 A; 3GYS B; 4MQJ B; 4N7N B; 5EET A; 1GZX B; 1Y4Q A; 2LH6 A; 1J7S B; 1G0B B; 1MYF A; 1IOP A; 2GTL D; 1Y0A B; 2R4W A; 1Y0D B; 1O1N A; 1Y0T A; 1MGN A; 3ED9 A; 2MBW A; 1MLU A; 1Y2Z A; 3LB1 A; 1DUK A; 5F2A A; 1Y4P A; 5CN8 A; 3ARL A; 1HBB B; 3HYU A; 1UX8 A; 3UHV A; 2D5Z B; 1WMU B; 2FRF A; 5ILP A; 3V2V A; 3QJC B; 1XXT B; 1S5Y A; 1YEO A; 1YHU C; 1XZV B; 1O1I A; 1IWH A; 1XZ2 A; 1Y8I A; 1LH6 A; 109M A; 2ZT4 A; 3S1J A; 1RQA B; 3A59 A; 1ABW B; 1V07 A; 1YFF B; 1YHR B; 4H07 A; 2O5S X; 2VM0 A; 3PI8 B; 1B86 B; 1HV4 A; 108M A; 1UFP A; 1MYH A; 1OUU B; 4ZVA A; 5E6E A; 5CNB A; 4U8U B; 2QMB A; 2FRK X; 3EOK B; 3GQG A; 2VLX A; 5B84 A; 4FWY A; 1FLP A; 3WCW C; 3UH7 A; 1THB B; 1HGC A; 1YGD B; 2MGB A; 1CH4 A; 6HBW A; 1NIH A; 5ILM A; 4NI1 B; 3OO4 B; 3NMM B; 1T1N A; 3A5A A; 5HY8 B; 1BUW B; 1YG5 A; 1CPW A; 1YHE B; 3UHW A; 2DN3 A; 3VRG B; 5KER B; 2HBD A; 4L7Y A; 1MBA A; 4ROL B; 1HBA B; 3ZJI A; 5EU2 A; 1LJW A; 4JYQ A; 3PI9 B; 1DWS A; 1CO8 A; 1GVH A; 2D2N D; 5E29 B; 2D2M C; 2MGD A; 3UBV A; 3B75 B; 1AJH A; 1MKO B; 1LH3 A; 1KR7 A; 2W31 A; 4FH6 A; 1IT3 A; 1A01 B; 1YDZ B; 3ZJH A; 3P5Q B; 1JPB A; 1GBV A; 1MTK A; 2AUP A; 1LA6 B; 3VRF B; 105M A; 1TU9 A; 3H57 A; 1Y22 A; 3DHT A; 1J40 B; 1LH1 A; 4N7O B; 1BAB A; 3BJ2 B; 1FHJ A; 1HBR B; 3VRE B; 2ZFO A; 3WCU A; 1DXU B; 4TWV A; 1V4W B; 1HDS A; 1O16 A; 2SPO A; 2RI4 A; 2MGG A; 3NL7 B; 1GBU B; 2ZLU A; 2O5L X; 2AA1 A; 2YRS A; 1NQP A; 1MWC A; 1DO1 A; 3W4U A; 2QU0 B; 4MQK B; 3NFE A; 2HBS A; 1MDN A; 3S65 B; 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1NZ5 A; 2OH9 A; 1Y7C A; 4O4T A; 2ZT0 A; 1MOB A; 1F63 A; 2V1J A; 1AJ9 A; 3S1I A; 1ASH A; 1LJW B; 1QSH A; 1VRF A; 1JP6 A; 4HRR A; 2Z85 A; 1QXD A; 1A00 A; 1LFL A; 2O5O X; 1R1X B; 1EWA A; 5HAV A; 4WCH D; 1MLQ A; 1LHT A; 3BOM A; 4B4Y A; 3GQR A; 4UUR A; 3QZX A; 3WCW D; 4ESA B; 3RGK A; 1GBV B; 1O1O B; 2ZS1 B; 1DKE A; 1YVT A; 2QSS A; 3DHT B; 1YEQ B; 2SPL A; 3S48 C; 2MGE A; 1FDH G; 1X46 A; 3WCV A; 3WI8 A; 2ZFO B; 1MLK A; 3WCU B; 1OBM A; 3CY5 A; 1NS9 B; 2D2M D; 1URV A; 1HBH A; 1NWN A; 1LFQ A; 2LH2 A; 2RI4 B; 1F5O A; 1JW8 A; 2ZLU B; 3AQ5 A; 1QPW A; 3QZZ A; 3VAU A; 1JY7 B; 1CIK A; 1U7S A; 3AT6 A; 2OLP A; 1RSE A; 4MBA A; 3W4U B; 1J3Z A; 1XQ5 A; 3UHY A; 1YEU A; 2HBS B; 3DHR B; 1CBM A; 1GCV A; 4SDH A; 4LPI A; 3U3E A; 1YE0 B; 3MOU A; 3UBC A; 5JGG B; 3IC0 A; 2MGL A; 1K0Y B; 1V4X A; 4UIQ A; 2ZLX B; 1MYM A; 1C7D A; 1M6M A; 4AVE A; 3A5B A; 4WJG A; 5CNC A; 1J3Y A; 1XZU A; 3BJ3 A; 1VXC A; 3HXN A; 1IRD A; 1BIN A; 1MOH A; 3TM9 A; 5CNF A; 1MLG A; 2ZLW B; 1XZ5 A; 1YMA A; 2MGK A; 106M A; 4WJG 1; 1SHR B; 1SDL A; 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