The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
59
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sequence length |
146
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structure length |
146
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Chain Sequence |
VHLTPEEKSAVTALWGKVNVDEVGGKALGRLLVVYPWTQRFFESFGDLSTPDAVMGNPKVKAHGKKVLGAFSDGLAHLDNLKGTFATLSELHCDKLHVDPENFRLLGNVLVCVLAHHFGKEFTPPVQAAYQKVVAGVANALAHKYH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
The high salt (phosphate) crystal structure of deoxy
hemoglobin E (GLU26LYS) at physiological pH (pH 7.35)
rcsb |
| molecule keywords |
Hemoglobin subunit alpha
|
| molecule tags |
Oxygen binding
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| source organism |
Homo sapiens
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| total genus |
59
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| structure length |
146
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| sequence length |
146
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| chains with identical sequence |
D
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2008-07-17 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| B | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2D2N A; 4FH6 A; 3BJ3 A; 1QXE B; 1MLL A; 2XKI A; 1T1N A; 4ROM A; 2HHB A; 1MWD A; 1Y22 B; 1SDL B; 3S1I A; 1XY0 B; 3WTG A; 1X46 A; 3SDH A; 3HRW B; 3QQQ A; 2SPN A; 2GTL D; 3ED9 A; 1QXE A; 1C7D B; 2AA1 A; 2MGG A; 2AUR A; 2Z6N B; 1Y22 A; 1S69 A; 1SDL A; 5ILR A; 3MYN A; 1Y45 A; 1SPG B; 2VYZ A; 2B7H B; 5CMV A; 4L7Y B; 1VXD A; 1QXD B; 1RTX A; 4ILZ A; 1K0Y B; 4MQJ A; 2HBC A; 2Z6N A; 2WTG A; 1S5X B; 1K1K B; 3E5I A; 1HAC A; 3HHB B; 1V9Q A; 3D1A A; 1JP9 A; 1OR6 A; 3UBC A; 4PNJ A; 1Y0D A; 2VRY A; 4L7Y A; 1A0U B; 6HBI A; 1JEB B; 4M4B B; 1UC3 A; 4B3W A; 4G51 A; 1Y4F B; 1HBB B; 4MQG A; 4IRO B; 1S5X A; 1K1K A; 3HXN A; 3UHG A; 1CH3 A; 2HBG A; 4NK2 A; 3UH3 A; 1XXT B; 2V1H A; 5CHQ A; 2QFN A; 3LB4 A; 4LPI A; 1Y31 B; 3P5Q B; 3QM6 A; 3DHR A; 1SWM A; 2ZLU B; 3ASE A; 3UH6 A; 2ZLW A; 1GDI A; 2OIF A; 5F2A A; 2MYC A; 2G0Z A; 1WVP A; 3UHV A; 4IRO A; 1Y5K A; 1HBH B; 1Z8U B; 5E83 B; 3G52 A; 1YEN B; 1XXT A; 1XYE A; 1CLS B; 2H35 A; 3P5Q A; 2W72 B; 1MOC A; 3A9M A; 3WCP B; 3UHH A; 5MBN A; 1YHR A; 1M9P A; 3MYM A; 2VHB A; 3HYU A; 5E6E B; 4HHB B; 2NSR A; 1DLW A; 1YEN A; 3DUT B; 1CLS A; 1DO7 A; 1DTI A; 1FHJ A; 1NQP B; 1Y01 B; 3ZJO A; 3WCP A; 3PT7 B; 3OZW A; 5EQM A; 3S48 C; 1F65 A; 1LUE A; 3A5A A; 3PT8 B; 5E6E A; 3GQR A; 1HBA B; 1A4F A; 1UFP A; 4HSW A; 3SZK A; 5EYS A; 3UBV A; 1CBM A; 1YHE A; 5HLQ A; 2DN3 A; 3ECL A; 3PT7 A; 1YDZ B; 3ONZ B; 1DWT A; 3MBA A; 3ZJS A; 1JZL A; 2O5M X; 2M6Z A; 1FSL A; 2MHB A; 3AT6 B; 2KSC A; 7HBI A; 2D2M D; 2GTL C; 3ONZ A; 1Y83 B; 2QLS B; 5EE4 D; 1XZ5 A; 4MPM A; 1A01 A; 3A59 B; 3AT6 A; 2ZSX A; 3ZJR A; 1GVH A; 2ZSR A; 1Y2Z B; 4MBN A; 1V4X A; 1J41 B; 1V4U B; 2YRS A; 4H07 A; 1UFJ A; 2NRL A; 1QSH B; 1MBA A; 1A3N B; 3WCV A; 1CO9 A; 1NAZ A; 2SPO A; 1V4U A; 3AG0 A; 3PI1 A; 1X3K A; 3OO4 B; 1RQ4 A; 2QSP B; 1FCS A; 2HZ2 A; 1BIJ A; 1QSH A; 5HY8 A; 3AQ7 A; 1RQ3 A; 1O1L B; 1A3N A; 2W31 A; 3AQ9 A; 2IG3 A; 3UHU A; 1HBR A; 3GYS B; 1O1K A; 1AZI A; 2PGH B; 3OO4 A; 2G0S A; 3UHC A; 1YOG A; 2GRH A; 1ABW B; 3M38 A; 3LR9 A; 1Y4Q B; 1YH9 A; 3QM8 A; 1KD2 A; 4XDI A; 2QFK A; 3GYS A; 1Y85 B; 1YEU A; 1THB B; 1GZX B; 1GJN A; 3OGB A; 3VRE A; 3TLD A; 1FLP A; 2ZFO A; 3VRF A; 3SDN A; 1MNH A; 3K8B B; 3PI9 B; 1YGF B; 1XZ2 B; 1YVQ A; 1A6K A; 5D1V A; 1THB A; 1GLI B; 5CN9 A; 5D5R A; 1ASH A; 2SPM A; 4H2L A; 2BMM A; 1B0B A; 2BKM A; 3PI8 B; 3GDJ A; 1GCV B; 1Y09 A; 1VXG A; 4UIQ A; 1LHT A; 2VYY A; 3PI9 A; 1Y4P A; 1YIH B; 1XZ2 A; 5EUI B; 2ZSN A; 2ZFO D; 2EKU A; 3IXF A; 4FC3 A; 2MGB A; 2R4W A; 2D2M C; 1OBM A; 4N7O B; 1XQ5 B; 5C6Y A; 1G9V A; 5CND A; 1MBD A; 1G08 A; 1YMB A; 1YIH A; 1LFV A; 1BUW A; 1UMO A; 1F5P A; 1O1I B; 1N9X A; 1VXC A; 4N7O A; 3A0G A; 1XQ5 A; 4MXL A; 3K9Z A; 1JF4 A; 1O1O A; 1A9W A; 1NS9 B; 4IT8 A; 3GKV A; 3UH7 A; 2R80 A; 1YGD B; 5JDO F; 1WLA A; 3WCT A; 1HLM A; 2V1F A; 1HHO A; 2HBE A; 1MKO B; 1LFQ B; 1Y8I B; 1HDS A; 4F6I A; 1HGB A; 1NS9 A; 1NZ3 A; 2HBF A; 2MGL A; 1MYJ A; 2ZS1 D; 1FSX A; 1DXV B; 2AV3 A; 1MKO A; 1O1J B; 1EWA A; 1UVY A; 3WCU B; 3QJE B; 1S56 A; 1DXC A; 4NI1 B; 1BAB A; 110M A; 3WCV C; 3OVU C; 2GRZ A; 1DXV A; 1OFJ A; 3QJE A; 3GKT A; 1VWT B; 2NSS A; 4HRR B; 1LFZ A; 2ZLX B; 2Z6S A; 1R1Y A; 1MYH A; 4PQB A; 1V5H A; 2H8D A; 1JWN A; 2DN2 A; 4WJG A; 3NG6 A; 1NZ2 A; 2DHB B; 5B85 A; 1DXU B; 1A00 B; 5EU2 A; 5B84 A; 3S65 A; 1YEO B; 2ZLX A; 5SW7 B; 1VRE A; 1MYG A; 2ZSO A; 1MLN A; 2GRF A; 4F6D A; 2DHB A; 3G4Y A; 2ZS0 B; 2V1G A; 3OK5 A; 1MTK A; 1Y4B B; 2O5L X; 1GBU A; 1A00 A; 3GQP B; 3EOK A; 2G10 A; 2ZFO C; 3ORD A; 4U8U B; 2HBS B; 5SW7 A; 2G0X A; 4F69 A; 1MLR A; 4TWV A; 1YHU A; 1F5O A; 3ZJP A; 1RQA B; 1AJ9 B; 1J7Y B; 1O1P A; 3BA2 A; 1QPW A; 3GLN A; 2VEE A; 3E5O A; 3WCW B; 1HV4 A; 1A6M A; 1DWS A; 1LJW A; 2MGF A; 2MGM A; 5KDQ A; 1Y0A B; 1Y8K B; 1DTM A; 1G0B B; 2MBW A; 3WHM B; 1Y0W B; 1A0Z B; 1AJ9 A; 1J3Z B; 102M A; 2GKM A; 1Y0T A; 4JAC A; 3NL7 B; 2H8F B; 3AT5 B; 2V1E A; 2MGE A; 2V1K A; 1MLU A; 2BK9 A; 4F4O A; 1BZZ B; 3M39 A; 5IKS A; 3IC2 B; 4NI0 B; 3UHN A; 1GBV B; 3BJ1 A; 1M6M A; 1YEQ B; 4AVE A; 4O4Z A; 2H8F A; 1V75 B; 5CN6 A; 4ESA B; 1IDR A; 3IC2 A; 3D1K A; 3R5I B; 1VXA A; 1FAW A; 2NRM A; 3MKB B; 3A5B A; 3WCT C; 3QZZ A; 5AB8 A; 2C0K A; 1Y35 A; 3OZU A; 1NS6 B; 1V4W A; 1Y0C B; 4XS0 B; 1V75 A; 3WR1 B; 1MYZ A; 4ESA A; 1Y7G B; 1JPB A; 1O1N A; 3NMM B; 6HBW B; 2BWH A; 1MBS A; 2FRJ X; 2W6X A; 3LB1 A; 2EB8 A; 2D2N D; 1XY0 A; 2PEG B; 3E55 A; 3VAU A; 4XS0 A; 4F6G A; 1BZ0 B; 1MYF A; 3HRW A; 3NMM A; 1MTI A; 1C7D A; 2MGJ A; 3D4X B; 1NEJ B; 4MQK B; 3UHY A; 1WMU B; 1AJH A; 1DUO A; 1HDB B; 4PQC A; 3H57 A; 3GQG B; 3QJB B; 1Y4R B; 1SPG A; 2XKH A; 2B7H A; 111M A; 3DR9 A; 1CG5 B; 1URV A; 1BZ0 A; 1LH6 A; 1YG5 B; 1OUT B; 1QXD A; 1K0Y A; 1NEJ A; 1J3Y B; 1CP0 A; 1MWB A; 3UHZ A; 2GL3 A; 1RTE A; 1DKE B; 5HU6 B; 2BLJ M; 4MQC B; 1MLQ A; 5EV5 A; 3HHB A; 4ROL B; 1BVD A; 1V07 A; 2HZ1 A; 1A0U A; 1C7B B; 1JEB A; 4M4B A; 1MOH A; 4KMV A; 1Y4F A; 2D60 B; 1HBB A; 1DUK A; 5HBI A; 5HU6 A; 4MAX A; 4G1B A; 4ROL A; 2O5S X; 3V2Z A; 1Y31 A; 1NIH B; 2OH8 A; 2ZLU A; 1C7B A; 2EVP A; 1F63 A; 3HEO A; 3IC0 B; 4DC7 A; 1HBH A; 4FWY A; 5E83 A; 1YHU C; 2E2Y A; 5CN8 A; 2AUQ A; 4HRT B; 2W72 A; 1XZV B; 3GK9 A; 3BCQ B; 1C7C B; 2ZT0 A; 5KKK A; 1HCO B; 4ODC B; 1CH2 A; 3RJN B; 3FS4 B; 1MTJ A; 2LH2 A; 1JL6 A; 3VHB A; 4HHB A; 1SDK B; 3EU1 B; 1X9F B; 1QSI B; 3DUT A; 104M A; 3WFW A; 5EET A; 4MQH B; 112M A; 1NQP A; 3BCQ A; 1HCO A; 4ODC A; 1AJG A; 1ECN A; 2ZSY A; 1MOD A; 5C6E B; 2OH9 A; 3PT8 A; 3ZJQ A; 1SDK A; 1HBA A; 3ARJ A; 2ZLV B; 1IRC A; 1QSI A; 1N9F A; 1HAB B; 1Y4G B; 1YZI B; 1YDZ A; 1RVW B; 1YCA A; 2ZT1 A; 3CIU B; 1H97 A; 5C6E A; 5JDO D; 2D2N C; 2VM0 A; 1Y8H B; 4ZVA A; 2V1I A; 2ZLV A; 2O5Q X; 1MYT A; 1MLS A; 1LHS A; 3UHT A; 1Y4G A; 1S6A A; 1ECD A; 1Y83 A; 2QLS A; 1UT0 A; 1MOB A; 3A59 A; 2MGH A; 2FAL A; 3UGZ A; 1XZ7 B; 1Y2Z A; 2LH1 A; 1J41 A; 1FDH A; 1LH2 A; 4MQI B; 1MLO A; 4TYX A; 1EMY A; 3KUO A; 1Y7D B; 1NWN A; 1NGK A; 1XZ7 A; 2LHB A; 3HF4 B; 1R1X B; 3G4R A; 1DO4 A; 1O16 A; 3KUN A; 2BLI A; 3ODQ B; 3WCV D; 1Y7D A; 2QSP A; 5HAV A; 1G0A B; 1O1L A; 2R4X A; 1LH5 A; 1LH1 A; 3G4W A; 4NXC A; 1YOH A; 2PGH A; 2HZ3 A; 1KFR A; 1TU9 A; 5E29 B; 4X0L B; 1ABW A; 2AV0 A; 1BIN A; 1Y4Q A; 4G1V A; 1C40 B; 3KMF A; 1FN3 B; 1HBI A; 3UHW A; 1Y85 A; 1G09 B; 1VXB A; 1GZX A; 5JGG B; 1UX9 A; 1OR4 A; 3MJP B; 1ECA A; 2G3H A; 2W72 C; 3K8B A; 1U7S A; 1YGF A; 1YEV B; 1FN3 A; 1BZP A; 2QMB B; 1GLI A; 1MLF A; 3UHS A; 1UX8 A; 3PI8 A; 1GCV A; 2R50 A; 3PIA B; 5JDO C; 3CY5 B; 106M A; 5EUI A; 4YU3 B; 1YFF B; 1GCW B; 1Y8W B; 2MGD A; 2SPL A; 4NXA A; 1MLM A; 1IBE B; 3G4Q A; 2ZS1 B; 3MOU A; 1Y7C B; 1N9I A; 4O1T A; 1DXT B; 3BOM B; 2FRF A; 1Y7Z B; 3CY5 A; 3GOU B; 4YU3 A; 1O1I A; 1S5Y B; 1EBC A; 4NZI A; 2XYK A; 2V1J A; 1IBE A; 1J40 B; 2QRW A; 2JHO A; 1Y7C A; 1Y46 B; 5CN4 A; 1Y7Z A; 4L2M A; 1MLG A; 5ILM A; 1YGD A; 1BBB B; 1LFQ A; 2VLY A; 1Y8I A; 1NWI A; 3QJD B; 1CBL A; 1J7S B; 4HSX A; 3WCT D; 4M4A B; 4N7N B; 4DWU A; 3LQD B; 1GDK A; 1QI8 B; 1MNO A; 3ECX A; 2BLH A; 2O5O X; 4F6J A; 1BBB A; 2DC3 A; 4MU5 A; 5HLU A; 1JZK A; 2GKN A; 3OZV A; 1O1J A; 1YMA A; 4KN3 A; 3ZJL A; 3WCU A; 1LH3 A; 4NI1 A; 1YE2 B; 1HGC B; 3LQD A; 1QI8 A; 3DHT B; 1JY7 B; 1CO8 A; 2LH7 A; 1RSE A; 1UIW B; 2OLP A; 3B75 B; 1VWT A; 2CMM A; 1OUU B; 4HRR A; 3DHT A; 2HCO B; 1MBI A; 2ZT4 A; 2R1H B; 3OJ1 A; 1ABS A; 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1Y0C A; 3WR1 A; 4O2G A; 1Y7G A; 2QU0 B; 1W92 A; 1YE0 A; 2LH5 A; 4FWX A; 4MQJ B; 2HBC B; 1COH B; 4B4Y A; 1VXH A; 6HBW A; 1B86 B; 1JF3 A; 2IN4 A; 2D5Z B; 1HAC B; 1CMY B; 3S66 A; 3D1A B; 1YCB A; 2PEG A; 2RAO B; 3WCU C; 1Y0D B; 1URY A; 3FH9 B; 2O5T X; 2QU0 A; 4MBA A; 1DM1 A; 105M A; 4G51 B; 1COH A; 3D4X A; 4MQK A; 1WMU A; 1HDB A; 3TM3 A; 1B86 A; 4MQG B; 3UHD A; 1JP6 A; 3HXN B; 2D5Z A; 2GNV A; 3ARK A; 1GDL A; 3GQG A; 3QJB A; 1Y4R A; 1CMY A; 4C44 A; 4JYQ A; 1MWC A; 2RAO A; 3DHR B; 1CG5 A; 2ZLW B; 3O7N A; 3FH9 A; 2EVK A; 5MBA A; 1YG5 A; 1OUT A; 1CG8 B; 1J3Y A; 1Y5K B; 4O4T A; 1DKE A; 4MQC A; 5HLX A; 1XYE B; 1MNJ A; 2H35 B; 1MDN A; 1LFL B; 5ILE A; 4KJT A; 1CG8 A; 1YHR B; 2D60 A; 1JDO A; 1M9P B; 1LTW A; 3AQ8 A; 3HYU B; 3H58 A; 2MYD A; 3PEL B; 3WFT A; 1EBT A; 2ZS0 C; 4F6B A; 3WI8 A; 1JL7 A; 3UI0 A; 1DLY A; 1LFL A; 1MYM A; 1XZU B; 1NIH A; 1FHJ B; 2Z8A A; 1D8U A; 1GDJ A; 4AVD A; 4U8U C; 3IC0 A; 2D2M B; 3ZOL A; 1J3F A; 1JP8 A; 3GQR B; 1A4F B; 3PEL A; 3SZK B; 1MBN A; 1Q1F A; 1LA6 B; 1YHE B; 3MJU B; 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