The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
51
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sequence length |
146
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structure length |
146
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Chain Sequence |
VHLSGEEKAAVTGLWGKVKVDEVGGEALGRLLVVYPWTQRFFDSFGDLSSASAVMGNPKVKAHGKKVLDSFSEGLQHLDNLKGTFAKLSELHCDKLHVDPENFRLLGNVLVCVLARHFGKEFTPQVQAAYQKVVAGVANALAHKYH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Crystal structure determination of indian flying fox (Pteropus giganteus) at 1.62 A resolution
rcsb |
| molecule keywords |
Hemoglobin alpha chain
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| molecule tags |
Oxygen transport
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| total genus |
51
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| structure length |
146
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| sequence length |
146
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2008-12-09 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| B | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 4N7N A; 3GOU B; 3BJ3 A; 4UUR A; 2VHB A; 1LH1 A; 1AJ9 A; 2DHB A; 1O1I A; 5F0B A; 1IWH B; 1ABW A; 1DLY A; 4F4O B; 1DUO A; 3V2V A; 1HV4 B; 2RAO A; 4ODC A; 3S1J A; 5HY8 A; 1K1K B; 2LH3 A; 3AQ5 A; 3G4Y A; 4OOD A; 3BCQ B; 2D2M D; 1QXD B; 2W72 C; 1X46 A; 2MB5 A; 3QM7 A; 1XQ5 B; 3UHS A; 1MYJ A; 1VRF A; 3IC2 B; 3DUT B; 2VEE A; 2OHB A; 1SWM A; 1XZ5 B; 4F68 A; 3MVC A; 1HBA A; 1Y4G A; 5JDO C; 2MGI A; 4F6D A; 3BJ2 B; 3EU1 A; 3UHH A; 1YCB A; 2ZST A; 3AT6 A; 3FS4 A; 2IG3 A; 1A6M A; 4XS0 A; 3EDA A; 1DO3 A; 1YEU B; 1MTJ A; 1YGD A; 2QFK A; 4IRO A; 1XZV A; 4N7O A; 1CG8 A; 1YH9 A; 1Y0T B; 1NZ2 A; 1Y31 B; 2MGJ A; 1RQA B; 2GNV A; 4H2L A; 1FHJ A; 2D5Z A; 3RGK A; 1JF3 A; 5EQM A; 1JZK A; 1ABS A; 2R4Y A; 4MQI B; 3MJU B; 1HBS A; 2ZLV A; 2G0X A; 1BZ6 A; 2RI4 A; 3D1A B; 3S65 A; 4L7Y B; 3QJC B; 4WCH D; 4C0N A; 1Y0A B; 2MGH A; 1PBX B; 4B4Y A; 1KFR A; 5EE4 D; 2EVP A; 1CBL A; 2QU0 A; 1LFZ A; 1GDL A; 1G0B B; 2EVK A; 1NS9 B; 4AVD A; 1O16 A; 1CBM A; 3H57 A; 1MWC A; 1HBI A; 3A5A A; 4MQG B; 2YRS B; 3D17 A; 3GKV B; 1QSI A; 3UHB A; 1DXU A; 3ZJO A; 2MHB B; 3ED9 A; 1MTI A; 3UHQ A; 1EBT A; 1V07 A; 1Y0W B; 1YEV A; 102M A; 3ZJM A; 1OR4 A; 1NGK A; 1OBM A; 4MQC A; 4F69 A; 2DXM B; 1HDB B; 1QSH A; 4HRR A; 1QXE B; 1BJE A; 1GDJ A; 1S5X B; 1J7S B; 1M6M A; 3UHT A; 4TWV A; 1MBC A; 2ZLX A; 1MNI A; 1YVQ B; 1YDZ B; 3ZJN A; 2AA1 A; 3GQG B; 3AG0 A; 1J41 B; 1K0Y A; 3HRW A; 4WJG A; 1RVW A; 1TES A; 4M4B B; 2SPL A; 3NG6 B; 1J40 B; 1VXG A; 2O5S X; 1HAB B; 1JZM A; 5EU2 A; 1DWS A; 5CMV A; 3ASE A; 3WCW B; 1BZ0 A; 2HHE B; 4O2G A; 3M38 A; 1ECD A; 1UX9 A; 2VYZ A; 4HSX A; 3PT8 B; 1SPG A; 3GQR A; 3PI4 A; 3O89 A; 3HF4 B; 5JDO D; 3FH9 A; 1NZ4 A; 1O1K B; 3UHG A; 3ZOL A; 1VXF A; 2WY4 A; 1YIH B; 1J3Z A; 3GLN A; 4L2M A; 1LFY A; 2HBF B; 4YU3 A; 3QMA A; 1GCV A; 3VHB A; 1FN3 A; 1R1X A; 2NSR A; 4HRT A; 1YIE A; 5ILE A; 2HBD A; 2G10 A; 2LH7 A; 1ECO A; 3WFT A; 1Y7Z A; 2O5M X; 1Y5K B; 3RJN B; 5E29 B; 3ODQ B; 3WCW C; 2W6V A; 3KMF A; 4UIQ A; 1O1P B; 4H0B A; 1LH7 A; 1B0B A; 3UHE A; 109M A; 3S66 A; 2G0S A; 1C7B A; 1LJW A; 2QSP A; 3LB3 A; 5HU6 B; 1MKO B; 1MBS A; 3R5I B; 3OO4 B; 2MGK A; 1IBE B; 3BJ1 B; 1URY A; 2AUP A; 3WFX A; 1S0H A; 2D6C A; 1DXT B; 1Y4F A; 4FC3 A; 1Y2Z A; 3ECZ A; 1LFL B; 1DKE A; 3M3A A; 5E83 A; 3WCV B; 104M A; 1DWR A; 1Y7C A; 3OK5 A; 4ROL A; 3PIA A; 4G51 A; 1BZ1 B; 3CIU A; 3ONZ A; 2NX0 A; 4NI1 A; 2QRW A; 1A01 A; 2JHO A; 1JP6 A; 1V4X B; 1I3E A; 1MDN A; 3ORD A; 3VRF A; 2O5T X; 3D1K B; 2MGF A; 1O1J A; 1CLS A; 4MAX A; 1CH1 A; 1MLO A; 1C7C A; 3KUO A; 1HDA B; 1Y5J B; 3G4R A; 3A5B A; 3UBV A; 1TU9 A; 4MQJ B; 1YHE B; 1V75 B; 1SDK A; 1BVD A; 1V9Q A; 2VLZ A; 4C44 A; 1FDH A; 3WCV C; 1BVC A; 2GRZ A; 2HCO A; 1FSX A; 2PGH B; 2ZFB A; 1CH2 A; 1SHR A; 5JGG B; 1GZX A; 1GJN A; 1Y4R B; 4WJG 1; 3OZW A; 4O1T A; 1L2K A; 1M6C A; 2Z6N B; 4OF9 A; 1YGF B; 1MBI A; 1Y46 B; 2R4W A; 1WMU B; 3CY5 A; 2ZT2 A; 4N8T B; 1YEO A; 2V1K A; 2D2N A; 3EOK A; 3G46 A; 1J3Y B; 3PT7 B; 2E2Y A; 1YOG A; 3NML A; 2R1H A; 3UHC A; 3WHM B; 4MQK B; 3QZX A; 2VEB A; 1LFQ A; 4NZI A; 1RPS A; 5CN8 A; 1B86 B; 1LH3 A; 3UHW A; 3M3B A; 3WCT B; 2EKU A; 4HSW A; 4MBN A; 3WCW D; 1LA6 A; 5EYJ A; 2HBE A; 1YVT B; 2NSS A; 1Q1F A; 1XXT B; 1Y4Q B; 4FH7 A; 5HLX A; 1Y4P B; 3QZZ A; 3ZJJ A; 3TM3 A; 1V4U B; 1XY0 A; 1H97 A; 3WCU B; 1QPW B; 3MKB A; 1O1O B; 4M4A B; 1Y09 B; 2OIF A; 1Y22 A; 1YHR A; 2MYB A; 1SDL A; 2G12 A; 2ZLT A; 1Y8H B; 3TLD A; 1YEN A; 1CIK A; 1YMA A; 1C40 A; 4YU4 B; 1Y0C A; 1VXE A; 1RQ4 B; 1NPF A; 110M A; 1Y8W B; 2FRJ X; 3UHX A; 1LFT B; 4MU5 A; 3WCT C; 1JP9 A; 105M A; 1CPW A; 4F6F A; 1HBB B; 1EBC A; 6HBW A; 3PI3 A; 3AQ6 A; 1MLQ A; 3S1I A; 3G52 A; 3LQD A; 2D2N D; 5KDQ A; 1Y7G B; 3IA3 B; 1NS6 B; 1J7W A; 1ASH A; 3HEP A; 3WCU C; 1MYF A; 1Y0D B; 3HXN A; 3G4W A; 3WCV D; 1HDS A; 3K8B B; 2GKN A; 1MYZ A; 3DHR A; 1S5Y B; 1Y45 B; 3MOU A; 2HHB B; 1ITH A; 1OUT A; 2HBC B; 2D60 B; 2ZT4 A; 1J3F A; 3WCP B; 1F63 A; 1THB A; 108M A; 1UT0 A; 1IT3 A; 1KD2 B; 3VRE A; 1Y01 B; 2DN3 A; 2IN4 A; 1Y5F B; 4PQB A; 1MLR A; 4MPM A; 2GKM A; 3MN0 A; 1A00 A; 4N7P B; 1HLM A; 1FAW A; 1YHU B; 4AVE A; 1MNH A; 2V1F A; 4DWU A; 1VWT B; 2LH5 A; 2HZ1 A; 5C6Y A; 1ABY B; 3NMM B; 4IT8 A; 2HBS A; 1MNK A; 1T1N B; 1Y4B A; 5KER B; 106M A; 2O5L X; 1G09 A; 1LFZ B; 1Y8K B; 4FWX A; 2GTL B; 2ZLW A; 4HHB A; 2BLH A; 3A2G A; 2FRF A; 1SI4 B; 3WTG B; 6HBI A; 1HHO A; 3OGB A; 3UHZ A; 2EB9 A; 1Y83 B; 1CIO A; 5EV5 A; 1RTX A; 2D5X A; 1XZU B; 1LH5 A; 3U3E A; 111M A; 1XZ4 A; 1V5H A; 2G0R A; 2BWH A; 5C6E A; 3UHD A; 1A9W E; 1JPB A; 2H8F B; 3LHB A; 1NIH B; 3ZJQ A; 5EUI A; 3ZJH A; 3GK9 A; 3KUN A; 1MBO A; 1YOI A; 3D7O A; 4ZVB A; 2DN1 A; 1HCO A; 2MYE A; 1YMC A; 1YHU C; 2V1G A; 2M6Z B; 1MLJ A; 1HGC B; 1GBV A; 3M39 A; 1JEB B; 5AZQ A; 3ZJI A; 1MGN A; 3UGZ A; 1GBU A; 3MYM A; 2W72 A; 4LPI A; 1YOH A; 1QI8 A; 2GTL C; 3HRW B; 1WLA A; 2R80 B; 3ZJR A; 1F65 A; 1HBH B; 3WCT D; 2GDM A; 1BIN A; 1DXV A; 1MCY A; 1A3O B; 1CMY B; 2G3H A; 3GOU A; 4VHB A; 3VRG B; 3A59 B; 1A6G A; 4PQC A; 3G53 A; 1GCW B; 2MGC A; 5F2A A; 1OR6 A; 3GYS B; 2O5B X; 2GLN A; 1IWH A; 1JZL A; 1J7Y B; 3ZJL A; 1LHS A; 3WCU D; 2BMM A; 4F4O A; 3NL7 B; 1HV4 A; 2MBW A; 1VXA A; 1K1K A; 2BW9 M; 2ZSO A; 3BCQ A; 1VXC A; 1QXD A; 4MQH B; 3WI8 A; 1G9V A; 3A0G B; 3ARK A; 2HHD B; 3HYU B; 2PEG B; 1C7D B; 1XQ5 A; 2Z8A A; 3IC2 A; 2WTH A; 3DUT A; 4DWT A; 1XZ5 A; 1YMB A; 5HBI A; 1O1L B; 2MGD A; 2KSC A; 2FAM A; 3BJ2 A; 3GQP B; 1FDH G; 1OFJ A; 2ZLU B; 2DC3 A; 2ZFO B; 3HC9 A; 2NRL A; 3NFE B; 1G0A B; 1CQX A; 1BAB B; 1XCH A; 1BZZ B; 1LH2 A; 1O1M B; 3AT5 B; 1Y0T A; 1Y31 A; 1RQA A; 1XZ7 B; 1A6K A; 2VRY A; 7HBI A; 1BUW B; 1UIW B; 4ROL B; 2GL3 A; 3MJU A; 4MQI A; 1OUU B; 1YG5 B; 1MOC A; 1HLB A; 3D1A A; 4L7Y A; 1JY7 B; 4XDI A; 4H07 A; 1IRC A; 3QJC A; 5CNC A; 2ZS1 B; 3UHR A; 1R1Y B; 1VRE A; 1Y0A A; 3UHY A; 1PBX A; 1YFF B; 3W4U B; 2ZSR A; 1YHU D; 1YE0 B; 3SDH A; 1D8U A; 2H8D B; 2Z6S A; 1V4W B; 1G0B A; 2MYC A; 3ARL A; 1VXD A; 2ZFO C; 5AB8 A; 1NS9 A; 3BOM B; 2B7H B; 3R0G A; 3RJ6 A; 1BZR A; 5E6E B; 1UFP A; 2W31 A; 2GTL D; 4MQG A; 1BBB B; 2DN2 B; 1S6A A; 4NI0 B; 2YRS A; 1A4F B; 3GKV A; 1CH9 A; 3DHT B; 4KMV A; 3UI0 A; 2MHB A; 4NXC A; 2MGL A; 1N9F A; 1Y0W A; 1GZX B; 3QJD B; 4ESA A; 3OO5 B; 3G4U A; 5CND A; 5CHR A; 3ECX A; 3MJP B; 2QSS B; 2DXM A; 1HDB A; 1AJG A; 1HBR B; 3MBA A; 1A3N B; 1QXE A; 1X9F B; 1S5X A; 1J7S A; 3QJE B; 2ZS1 C; 2Z85 A; 4BJA A; 1XYE B; 5CHQ A; 1YVQ A; 1YEO B; 1YDZ A; 3GQG A; 1Y7D B; 2ZT0 A; 3PI9 B; 1J41 A; 3QJB A; 2ZSN A; 5JDO F; 1YE2 B; 4M4B A; 1LTW A; 2FRI X; 1I3D A; 3NG6 A; 1J40 A; 103M A; 1HAB A; 1CP5 A; 4QAU A; 5ILP A; 3WCW A; 1GVH A; 3LB1 A; 3E5O A; 1Y8I B; 1GLI B; 2HHE A; 3GDJ B; 3B75 B; 4O4Z A; 1F5O A; 1MWB A; 1COH B; 3WFU A; 3PT8 A; 5B84 A; 3HF4 A; 1MTK A; 1LUE A; 2ZS0 B; 3UGY A; 2H35 B; 2BLI A; 1DO7 A; 1U7R A; 1X9F C; 1O1K A; 1YIH A; 3HHB B; 1S61 A; 1MYH A; 1MOH A; 1CG5 A; 1YEQ B; 1Y35 B; 1CQ2 A; 1LFV B; 4X0L B; 1JDO A; 2V1J A; 1NAZ A; 2D2M B; 1NQP B; 2R4Z A; 1MLG A; 1XZ2 B; 1Y5K A; 2MYA A; 3WR1 B; 1DO4 A; 5E29 A; 3ODQ A; 1MLH A; 1MWD A; 4FWZ A; 1O1P A; 2W6W A; 1O1N B; 3PI8 B; 1NEJ B; 2ZT1 A; 3IC0 B; 2QMB B; 1MBN A; 5HU6 A; 1A0Z B; 3GKT A; 1MKO A; 2ZS0 C; 3SZK B; 3R5I A; 3OO4 A; 1IBE A; 1G08 B; 1IOP A; 2ZFO D; 1DXT A; 1FLP A; 2QLS B; 1HGA B; 3PEL B; 2V1I A; 2ZSQ A; 2R4X A; 1LFL A; 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1XXT A; 1Y4Q A; 2RI4 B; 3S65 B; 1JP8 A; 3H58 A; 1Y4P A; 101M A; 2ZS0 D; 2G0Z A; 1M9P A; 3QQQ A; 1MLU A; 1V4U A; 3EDB A; 3WCU A; 1QPW A; 4M4A A; 1O1O A; 2LH2 A; 2QU0 B; 1Y09 A; 4DC7 A; 2G11 A; 1MBA A; 1CO9 A; 1RTE A; 1Y8H A; 1IRD A; 3E4N A; 1DTI A; 4KMW A; 4YU4 A; 1URV A; 3VAU A; 2O5O X; 4F6J A; 1RQ4 A; 1N9X A; 3D17 B; 3V2Z A; 1QSI B; 1Y8W A; 1DXU B; 1LFT A; 1G9V B; 4O35 A; 3HEO A; 1SPE A; 1HBB A; 1YEV B; 1YCA A; 4MQC B; 4GZG A; 1PMB A; 1Y7G A; 1QSH B; 2W6Y A; 4HRR B; 1NS6 A; 2BLJ M; 1NWN A; 2BKM A; 5EET A; 2MGE A; 2ZLX B; 1CO8 A; 1Y0D A; 5CNF A; 2SPM A; 2AA1 B; 4TYX A; 1UX8 A; 2AUR A; 2EB8 A; 4UZV A; 1K0Y B; 2EF2 A; 1RVW B; 3K8B A; 1S5Y A; 1Y45 A; 2HHB A; 3QM9 A; 4ILZ A; 2HBC A; 5ILR A; 2XKG A; 2D60 A; 3WCP A; 1KD2 A; 2VYW A; 4SDH A; 1MNO A; 1Y5F A; 1BZ0 B; 1MLL A; 5MBN A; 4U8U D; 1SPG B; 3GQR B; 4N7P A; 1CH3 A; 4FWY A; 3FH9 B; 1YHU A; 3OZU A; 1VWT A; 1ABY A; 3NMM A; 2MGG A; 1T1N A; 2CMM A; 3PI1 A; 5KER A; 4F6B A; 1J3Z B; 1Y8K A; 2GTL A; 1LFY B; 1HRM A; 4YU3 B; 1GCV B; 1SI4 A; 3WTG A; 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