The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
62
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sequence length |
153
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structure length |
153
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Chain Sequence |
VLSEGEWQLVLHVWAKVEADVAGHGQDIHIRLFKSHPETLEKHDRFKHLKTEAEMKASEDLKKHGVTELTALGAILKKKGHHEAELKPLAQSHATKHKIPIKYLEFISEAIIHVLHSRHPGDFGADAQGAMNKALELFRKDIAAKYKELGYQG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Rational design of a structural and functional nitric oxide reductase.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Myoglobin
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| molecule tags |
Oxygen transport
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| source organism |
Physeter catodon
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| total genus |
62
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| structure length |
153
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| sequence length |
153
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2009-10-16 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1ECA A; 2G12 A; 1LFQ A; 2HHB A; 5CN7 A; 1LH1 A; 1YE0 B; 4N7P A; 1T1N B; 1S5X B; 1F63 A; 2GKM A; 1O1I B; 2ZFB B; 1RVW A; 5D1V A; 5F0B A; 1BJE A; 4MQJ B; 3WCU C; 1XZ2 B; 1PBX A; 3HHB B; 1QI8 A; 1QSI B; 1J3Z A; 3EDB A; 4KMV A; 111M A; 2QLS A; 6HBW B; 2QSP B; 3ZOL A; 5SW7 A; 2W6V A; 1J7Y A; 1HAC A; 1AJH A; 3ASE A; 1QPW B; 4F4O A; 4PQB A; 1OUU B; 3UHC A; 1Y09 A; 1HBH B; 1W92 A; 3WCT D; 1M9P B; 3SDH A; 6HBI A; 1KD2 A; 1JEB A; 3OZV A; 4NI1 A; 1O1N A; 1CBM A; 1GBV B; 3IXF A; 4HBI A; 2R4X A; 3PI9 B; 2CMM A; 1XY0 B; 1BIJ A; 1R1X A; 4XS0 A; 1A0U B; 1MYT A; 3GKV A; 5CN9 A; 5CNC A; 1RQ3 A; 2MGI A; 1G0B A; 3WCW C; 1G08 B; 4KN3 A; 3KUO A; 4DC8 A; 1DO3 A; 5E6E B; 4HRR A; 1UIW A; 4FWY A; 2FAL A; 1DWR A; 1COH A; 5CND A; 1OJ6 A; 3A9M A; 1Y5F B; 3M39 A; 2NRL A; 3EDA A; 2RI4 A; 3GDJ B; 1WMU A; 3KMF A; 1LHS A; 1WVP A; 3MN0 A; 3AQ6 A; 2Z85 A; 3R5I B; 1DXV A; 1MYZ A; 1YIE B; 2QSS A; 3OO5 A; 3WFX A; 1O1J A; 2ZS1 A; 2ZWJ A; 4N8T A; 3PEL A; 4NS2 A; 1EBC A; 1MKO B; 1ITH A; 1MWC A; 2HBD A; 1LFV B; 1CH5 A; 1CG5 A; 3QJC A; 3QM9 A; 1CH1 A; 2ZLV A; 4NZI A; 3RJ6 A; 1CLS A; 3DHT B; 5EQM A; 1MBD A; 1UC3 A; 5E29 A; 1IBE A; 4MQG B; 1R1Y B; 1GDK A; 1MLU A; 1X9F A; 3AT6 A; 2G0V A; 2W6W A; 1MYF A; 1LFQ B; 2HHB B; 2G14 A; 3GKT A; 1SWM A; 3ECL A; 4F6F A; 2ZSQ A; 4N7P B; 1YEN A; 1GLI B; 1A3O A; 1O1K A; 3O7N A; 2ZT2 A; 3WCP B; 3HF4 A; 3G53 A; 1JY7 A; 1C7D B; 4AVD A; 1PBX B; 5CN6 A; 1NS9 A; 1Y0T A; 1QI8 B; 2VEB A; 3ZHW A; 1J3Z B; 2AA1 A; 2QLS B; 5HLQ A; 3EU1 A; 1MLR A; 1Y01 B; 5SW7 B; 2D60 A; 1YVQ A; 2W6V B; 1O1L B; 1J7Y B; 2EVP A; 2YRS A; 1HAC B; 3ARJ A; 4JYQ A; 1YHE A; 3WHM A; 2R4Y A; 2O5L X; 3VHB A; 1YEQ A; 1Y09 B; 1YH9 B; 4AVE A; 1HGA A; 3UH5 A; 1KD2 B; 2ZLW A; 5M3S A; 2SPO A; 1JEB B; 3NFE A; 4NI1 B; 1DLY A; 1O1N B; 4ROM B; 2ZSO A; 1VRF A; 3V2Z A; 1MYG A; 1LH5 A; 3PI8 B; 1SHR B; 1S6A A; 4FWZ A; 3G46 A; 1BIJ B; 4XS0 B; 1LH3 A; 2LHB A; 2ZLU A; 4ODC B; 1KR7 A; 1HBA B; 1F5O A; 2VHB A; 3GKV B; 5HLX A; 3VRF B; 1G0B B; 1FN3 A; 4PNJ A; 3MOU A; 1YOI A; 2D2N B; 1AZI A; 4WCH D; 1UIW B; 2GTL A; 3UI0 A; 3MYM A; 1UT0 A; 1DXC A; 1COH B; 1VXC A; 2D2M D; 3MKB A; 1LFY A; 4MQC A; 1A00 A; 3G4W A; 1WMU B; 1V5H A; 1JPB A; 5ILM A; 1N9H A; 2ZFO A; 2HBG A; 1C7C A; 1NAZ A; 1Y4B A; 1HDA A; 5ILE A; 1DUK A; 1CH3 A; 4LPI A; 2ZS0 A; 3QM6 A; 1OUT A; 1DXV B; 1MDN A; 1NZ4 A; 1MLM A; 2W6Y A; 1YMB A; 3OO5 B; 1Y0A B; 4NXA A; 1IRC A; 1AJ9 A; 1O1J B; 3QQQ A; 2ZS1 B; 4N8T B; 3PEL B; 5C6E B; 2O58 X; 2ZSN A; 1LJW B; 1UVY A; 4O2G A; 2O5T X; 3QM7 A; 2AUO A; 1YHU A; 1CG5 B; 1SDK A; 1BBB B; 2ZLV B; 1CLS B; 5EE4 D; 2BLJ M; 3NL7 A; 2XKG A; 5E29 B; 1IBE B; 3E5O A; 3D4X B; 2AUP A; 5CNG A; 1XXT B; 2V1F A; 2GRF A; 1X9F B; 3AT6 B; 1TU9 A; 3K8B A; 1XZ4 A; 2OLP A; 3GYS A; 2LH2 A; 1Y4Q A; 1YEN B; 1HDS A; 1S56 A; 1H1X A; 1A3O B; 1O1K B; 2W6X A; 3S65 A; 4F6B A; 1YOH A; 1IWH A; 5AZR A; 4HHB A; 3HF4 B; 4UZV A; 1N9I A; 1JY7 B; 2FRF A; 3ECX A; 3IC2 A; 1NS9 B; 1Y0T B; 5KKK A; 1RPS A; 1MYI A; 2ZSR A; 3ZH0 A; 2AA1 B; 3BJ3 B; 2D5X A; 3UHQ A; 3EU1 B; 3ZJI A; 1XZ5 A; 2VRY A; 2GLN A; 4NI0 A; 3R0G A; 3UHG A; 2D60 B; 1Q1F A; 7HBI A; 3P5Q A; 3QZZ A; 3WHM B; 5ILP A; 3AQ5 A; 1HGC B; 2B7H A; 3MYN A; 2GTL C; 4L7Y A; 1HGA B; 1J7W A; 4MXK A; 2ZLW B; 1QXE A; 2EF2 A; 1I3D A; 5KER A; 5CNF A; 5JDO E; 3UHK A; 2ZFO C; 3WCU A; 1NWI A; 2ZLU B; 4KMW A; 1OFK A; 3D7O A; 2NRM A; 2ZS0 C; 1Y8K A; 3UGZ A; 2H8D A; 1A4F A; 1FN3 B; 5KDQ A; 1A0Z A; 1OFJ A; 1VXD A; 3QM8 A; 1YMC A; 4U8U D; 1CG8 A; 1DXD A; 3QJE A; 2VEE A; 1MTI A; 2G0R A; 1DKE A; 3PT8 A; 2G0Z A; 1LFY B; 1Z8U B; 5CHQ A; 1YHU C; 1SPE A; 1A00 B; 2PGH A; 3E5I A; 4G1B A; 1ECD A; 2D2M C; 1MYJ A; 1EBT A; 3HYU A; 1HDA B; 1MBS A; 3WFT A; 2H8F A; 2FRK X; 2ZS0 B; 2FRI X; 1RTE A; 2ZSS A; 3MJU A; 3LB2 A; 5JDO D; 1MLQ A; 2ZST A; 1UFJ A; 1AJ9 B; 4SDH A; 3WCW A; 3UHX A; 2KSC A; 2QU0 A; 1Y22 A; 4F6D A; 1X3K A; 1MLH A; 3H58 A; 1G9V A; 1URY A; 3AQ9 A; 1BIN A; 2M6Z A; 1SI4 A; 1MWB A; 2ZSP A; 1SDK B; 5EET A; 3ZJQ A; 1NZ2 A; 1N9F A; 1MZ0 A; 1FDH G; 1QXD A; 2EB9 A; 5EE4 C; 2LH1 A; 1BZ0 A; 4F68 A; 3K3U A; 1XZ4 B; 3K8B B; 1A9W E; 1IT3 A; 4M4A A; 4OF9 A; 5JGG A; 3PT7 A; 1HDS B; 1A6N A; 1HSY A; 1IWH B; 1HDB A; 4HHB B; 1JF4 A; 3PI4 A; 2GL3 A; 2GKN A; 1MCY A; 1Y46 A; 2VYW A; 2MHB A; 1C7B B; 1FLP A; 1GDL A; 3UHZ A; 1XZ5 B; 1YGF A; 4NI0 B; 1O16 A; 3HC9 A; 4IRO A; 4FH6 A; 3AQ7 A; 1O1P A; 3IC0 A; 1YCA A; 4O35 A; 4JAC A; 1RQA B; 1CQX A; 4L7Y B; 2NSS A; 2DN2 B; 1J7W B; 3B75 A; 2Z6T A; 2BLI A; 3OVU C; 5B85 A; 1B86 A; 1QXE B; 2BWH A; 3MJP A; 5B84 A; 5KER B; 2DN1 B; 2G0S A; 1HBB A; 1YEV A; 1V4W A; 2D2N D; 3WCU B; 2AV0 A; 2VYZ A; 1SPG B; 1LUE A; 1K0Y B; 1YG5 B; 2AUQ A; 3D7O B; 2ZT0 A; 1A4F B; 2R80 A; 5KDQ B; 1NPF A; 2W72 C; 1GDJ A; 1A0Z B; 1ECN A; 2OH9 A; 1XZ7 B; 2V1G A; 1BUW A; 3PIA A; 1Y8W A; 1IRD B; 3QJE B; 1THB A; 2MGB A; 2OHA A; 1YVT A; 1DKE B; 2QRW A; 1Y0C A; 4ROL A; 4U8U C; 1J3F A; 3ED9 A; 4HRT A; 1A01 A; 1GCV A; 4MXL A; 3NML A; 3UHW A; 3G4R A; 3U3E A; 1DM1 A; 3BOM A; 1Y31 B; 3WCT A; 1HJT A; 1NIH A; 1HBS A; 5IKS A; 1Y7Z A; 2H8F B; 3G52 A; 1BZR A; 1FSL A; 1TES A; 4UIQ A; 3OJ1 A; 1BZZ A; 3MJU B; 1VXA A; 4G51 B; 2O5S X; 2C0K A; 4MU5 A; 3WCW B; 1FDH A; 1MGN A; 1Y22 B; 1XZV A; 1CO8 A; 4DWT A; 1NEJ A; 1BZ1 A; 2G3H A; 2M6Z B; 2LH6 A; 1CH4 A; 1SI4 B; 1RQ4 B; 2HHD A; 3CY5 A; 1V75 B; 2AV3 A; 5EV5 A; 5EUI A; 2E2Y A; 1AJG A; 3NMM A; 1Y4P A; 5HBI A; 2DXM A; 2LH3 A; 4TWV A; 1DO1 A; 4H2L B; 3WCV D; 3OK5 A; 2MGM A; 3WR1 B; 5ILR A; 2HHE A; 1YEU B; 2XYK A; 3ZJL A; 3DUT A; 3UHB A; 1C40 A; 5JGG B; 4TWU A; 1LFZ A; 1Y45 B; 3TM3 A; 3PT7 B; 1ABW A; 2EKT A; 1HDB B; 1YIH A; 3DR9 A; 3GQG A; 4NXC A; 4ESA A; 1UX9 A; 5HU6 A; 3UHU A; 1Y46 B; 2MHB B; 1RVW B; 2ZT4 A; 3QJD A; 2D5Z A; 3MVC A; 3UHS A; 1HHO A; 2RAO A; 5AZQ A; 5CN5 A; 4ILZ A; 1I3E A; 1J40 A; 2MYE A; 4IRO B; 1MTJ A; 1YDZ A; 2GNW A; 2ZLX A; 4DWU A; 1O1P B; 4GZG A; 1GZX A; 3IC0 B; 2DHB A; 2W31 A; 3WFW A; 3D1A A; 1YEO A; 2MYB A; 4F4O B; 3B75 B; 4MQI A; 3O89 A; 1B86 B; 3MJP B; 2OH8 A; 3ORD A; 1Y0W A; 3S66 A; 1HBB B; 1V4W B; 1NXF A; 3WCT C; 1FCS A; 3ONZ A; 3UHI A; 3QMA A; 2R80 B; 1R1X B; 3HXN A; 3GQP A; 1DLW A; 2QMB A; 3OGB A; 1BUW B; 3PIA B; 5HY8 A; 3UHT A; 1Y8W B; 3A59 A; 1V4X A; 1RQ3 B; 1DXU A; 4O1T A; 3OZU A; 1LHT A; 4BJA A; 3ZJP A; 2MYA A; 2SPN A; 3DHR A; 4ROL B; 2VLX A; 4HRR B; 2MGF A; 1MYH A; 3S1J A; 1A01 B; 2R4W A; 4YU4 A; 3BOM B; 1NIH B; 1O1M A; 1HBS B; 2RI4 B; 2G0X A; 1EW6 A; 3HRW A; 3UGY A; 1BVD A; 2QSS B; 1J3Y A; 1LFT A; 1NEJ B; 1BZ1 B; 2OHB A; 4F6G A; 4WJG 1; 2HHD B; 4MQK A; 3UHN A; 3CY5 B; 1MOB A; 2BNL A; 2HBD B; 4ZVA A; 1D8U A; 3QJC B; 5EU2 A; 1ABS A; 3BJ1 A; 3NMM B; 2DXM B; 2BLH A; 1NGK A; 2D2M A; 2HBC A; 3EOK A; 2PEG A; 1A6K A; 1XZU A; 4HSW A; 1S5Y A; 2HHE B; 3UHE A; 1MNO A; 3DUT B; 1C40 B; 2BW9 M; 1LFZ B; 3LQD A; 3FH9 A; 1ABW B; 1CO9 A; 3LB3 A; 1YIH B; 3GQG B; 1OR6 A; 4ESA B; 1MBN A; 1Y83 A; 5HU6 B; 3QJB A; 4UUR A; 2Z6S A; 1FAW A; 2MGC A; 1DXT A; 2ZSX A; 1PMB A; 1MOC A; 2D5Z B; 1OBM A; 1HHO B; 3GQR A; 1YDZ B; 1Y5K A; 2ZLX B; 3SZK A; 2DHB B; 1YE0 A; 1V4U A; 1YVQ B; 1YE2 A; 1T1N A; 3ZJH A; 1VWT A; 2YRS B; 4PQ6 A; 1YEO B; 1CIO A; 1YHE B; 1HBI A; 1MNK A; 1DO4 A; 1NWN A; 1YEQ B; 3E55 A; 1XZ2 A; 3S66 B; 1VXF A; 2GRH A; 1CPW A; 1QSI A; 1XQ5 A; 1NZ5 A; 3NFE B; 1OR4 A; 1G09 A; 1A3N A; 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1FAW B; 1DXT B; 1Y4G A; 1HCO A; 1R1Y A; 1MLJ A; 2IN4 A; 5CNE A; 1MBA A; 3IC2 B; 1RPS B; 3G4Y A; 1QSH A; 106M A; 3WTG A; 2D5X B; 1Y5K B; 1L2K A; 1DWT A; 3SZK B; 1Y85 A; 105M A; 1MBO A; 1MLO A; 1V4U B; 1YE2 B; 1GLI A; 1VWT B; 4F6I A; 3UHV A; 3P5Q B; 1YMA A; 3LB4 A; 1DO7 A; 4IT8 A; 1LA6 A; 3CIU A; 2O5B X; 2ZLT A; 3WCP A; 1MTK A; 2B7H B; 3G4Q A; 4MPM A; 1BZP A; 1C7D A; 4FC3 A; 1CIK A; 5HLU A; 3PI3 A; 1XQ5 B; 3QQR A; 2AUR A; 1G09 B; 1MLS A; 2O5Q X; 1A3N B; 2MGK A; 1ASH A; 1O1L A; 3A0G A; 4QAU A; 4H0B A; 1Y35 A; 2HZ3 A; 1Y8K B; 1Y2Z B; 3D17 B; 2H8D B; 2Z6N B; 2HBS B; 4G1V A; 1YH9 A; 3ZOM A; 3ARL A; 2ZSZ A; 1K1K B; 4H07 A; 1CG8 B; 1XYE A; 1A6M A; 1ABY B; 3FS4 B; 4ROM A; 4X0L B; 3VRE B; 3PT8 B; 3PI8 A; 1SHR A; 1NS6 B; 3S48 C; 1J41 A; 2PGH B; 1LH7 A; 4ODC A; 1BAB A; 2VLY A; 1FHJ B; 2HZ1 A; 3HEP A; 1RTX A; 2V1K A; 1HBA A; 1Y7D B; 1A9W A; 1O1O B; 3S1I A; 3VRF A; 1CQ2 A; 4F6J A; 2ZS1 D; 1JZM A; 2R1H B; 3HYU B; 1N9X A; 4O4Z A; 1SDL B; 2D2N A; 2WY4 A; 1YFF A; 5CNB A; 4NK1 A; 2W72 B; 3UHH A; 4M4B A; 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