The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
54
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sequence length |
141
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structure length |
141
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Chain Sequence |
VLSPADKTNIKTAWEKIGSHGGEYGAEAVERMFLGFPTTKTYFPHFDFTHGSEQIKAHGKKVSEALTKAVGHLDDLPGALSALSDLHAHKLRVDPVNFKLLSHCLLVTLANHHPSEFTPAVHASLDKFLANVSTVLTSKYR
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Crystal structure determination of Lepus europaeus 2.8 A resolution
rcsb |
| molecule tags |
Oxygen transport
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| molecule keywords |
Hemoglobin subunit alpha
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| total genus |
54
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| structure length |
141
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| sequence length |
141
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| chains with identical sequence |
C
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2010-02-09 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1J41 A; 1YE2 B; 2G0R A; 3E5I A; 3E4N A; 1Y45 B; 1X46 A; 1HSY A; 1HAB A; 1CG5 B; 5CN8 A; 1ABW A; 3PI1 A; 3PI4 A; 1LHT A; 3UI0 A; 1Y7Z A; 5JOM A; 1URV A; 1EW6 A; 1L2K A; 1H1X A; 1QSI A; 2QSP B; 3PT7 B; 2GTL C; 1HDB B; 1IBE A; 1K1K A; 1RQ3 B; 5C6E B; 3GOU B; 4TWV A; 4H0B A; 1Y35 B; 3H58 A; 1JL6 A; 2ZSQ A; 4YU4 B; 2G12 A; 4G1V A; 1BZ0 B; 1CH7 A; 1BAB B; 1GCV B; 1FN3 A; 4UUR A; 4M4B A; 3A5G A; 2OHA A; 2D2N C; 4OF9 A; 2GDM A; 3UHY A; 3UHQ A; 3K3U A; 1HBA B; 1A3O A; 1MBO A; 1XZ7 A; 3EU1 A; 3ECZ A; 1DXD A; 3PIA A; 2ZST A; 1SHR B; 4DWT A; 2HBF B; 4ROM A; 2B7H A; 5MBN A; 1DWT A; 3D1K A; 4FWY A; 1GDK A; 3NFE A; 2XYK A; 3AG0 A; 2HZ2 A; 1HGC B; 1V5H A; 3QZX A; 1SDL A; 1GLI B; 5CN9 A; 1O1K B; 3BJ3 A; 2GNW A; 4HSX A; 1MKO B; 1MWB A; 1KFR A; 4ILZ A; 3WR1 B; 3OJ1 A; 1Y0W B; 2RI4 A; 1HBB A; 1O1O B; 104M A; 1V4W B; 4F6G A; 2CMM A; 2O5Q X; 4L2M A; 3G4U A; 1YHU A; 1MLR A; 3LR9 A; 5MBA A; 3QM6 A; 1KD2 A; 2ZS0 D; 1Y31 B; 2M6Z A; 1BUW A; 1LH3 A; 1Y8K B; 1QXE B; 1HBH A; 1VXA A; 1YHE A; 1SWM A; 1I3D A; 1JL7 A; 3A9M A; 3LB3 A; 1Y7G B; 3AT6 B; 2VHB A; 1N9I A; 4FH6 A; 2HBC B; 1LH7 A; 1QI8 B; 4MXK A; 2MGM A; 4H2L A; 5E83 B; 3MYN A; 2MGH A; 5HLU A; 3HXN A; 3PT8 B; 1Y09 A; 1SPG B; 3D7O A; 1G9V B; 3OO5 A; 4KN3 A; 1BZ6 A; 1T1N B; 3LR7 A; 5C6Y A; 4N7N A; 1MWC A; 1Y4B A; 2BLJ M; 1MOB A; 2FRI X; 5EOH A; 1DXC A; 1DXT B; 1V4X A; 1A4F B; 5CN5 A; 112M A; 1ABS A; 2ZLX B; 1IOP A; 3MKB A; 3VRE B; 5B84 A; 1Y8I B; 1HHO A; 1BZP A; 1YOH A; 1XYE A; 2HBE B; 1JW8 A; 2V1G A; 2HBD A; 3ZJS A; 5EV5 A; 2QRW A; 5EU2 A; 4FH7 A; 1JY7 A; 1SDK B; 2LH3 A; 3WFW A; 1QXD A; 1DO7 A; 1LH2 A; 2FRK X; 4X0L A; 1K0Y B; 1YGF A; 1C7C B; 4IRO B; 1R1X A; 2ZSS A; 4O1T A; 3ODQ A; 2D5Z A; 1WMU B; 1G08 A; 5JDO D; 3D1A B; 2H35 B; 3VRG B; 1MBI A; 3QQQ A; 1MOA A; 1YVQ A; 1URY A; 4VHB A; 1YEQ B; 2ZLU B; 1MDN A; 6HBW A; 1YHU C; 1MLH A; 3A5A A; 3B75 B; 2MGC A; 2XKI A; 1NGK A; 1J3F A; 3WCT A; 4HRR B; 2R4W A; 3AQ8 A; 5E6E B; 2PGH A; 1O1I B; 1HBS B; 2MGD A; 2ZSZ A; 1MOH A; 2QSS A; 4O4Z A; 3D17 A; 4HBI A; 1UIW A; 1XZ2 A; 1JZM A; 1J3Y B; 3QJE A; 1FDH A; 3ARJ A; 1NPF A; 2FRJ X; 2HBS B; 3QJD A; 3DHR A; 1XY0 B; 1OUT B; 3G4R A; 2O5M X; 1U7S A; 1MLG A; 3ECX A; 1FCS A; 1YCA A; 1MBA A; 3G52 A; 3UH6 A; 1O1M B; 1ABY A; 1HDS A; 2BKM A; 1A0Z A; 1LH6 A; 3KUO A; 2Z6S A; 2G14 A; 4UZV A; 2H8F B; 1LFV B; 1GZX B; 2MYE A; 5EUI B; 2G0S A; 4N8T B; 2O5T X; 2ZT3 A; 1XXT B; 1XCH A; 1YG5 B; 3AQ7 A; 5D1V A; 3ECL A; 4MQJ A; 1DUO A; 3D4X B; 1Y85 A; 1NWI A; 3R5I A; 3HEO A; 1YE0 A; 1MLU A; 1YH9 A; 2RAO B; 4PNJ A; 3VRF A; 1J3Z A; 1MNI A; 5KER B; 1VRE A; 2EVP A; 4DWU A; 1YIE B; 1RQ3 A; 2R4Y A; 3HYU A; 1G09 B; 1Y8W B; 2GKM A; 2OH8 A; 2SPN A; 1RVW A; 1N9X A; 3UHN A; 5SW7 A; 1IRD B; 1LJW B; 1Y5J B; 1Y4F A; 2FAL A; 2V1E A; 3UHV A; 3ZJH A; 5ILR A; 2DN1 A; 2MGE A; 1DXV A; 1HGB B; 3WCW D; 1THB B; 3NML A; 4O2G A; 2E2Y A; 1A0U B; 3W4U B; 2D2M D; 2Z8A A; 4BJA A; 4LPI A; 2W6X A; 3E55 A; 3ZJN A; 3FH9 A; 3BOM A; 108M A; 3K8B B; 1V4U A; 2IG3 A; 1JP8 A; 1OR6 A; 5HY8 A; 3NMM B; 3A2G A; 1G0A A; 3UBC A; 1YEU A; 4FC3 A; 1IDR A; 3SDH A; 2YRS B; 1MBS A; 1BBB B; 5M3S A; 3AT5 B; 3WR1 A; 1Y0W A; 1MLK A; 1PBX B; 2D2M B; 3ARK A; 1MLN A; 3DHT A; 1HCO B; 1S0H B; 2IN4 A; 2ZS1 B; 1Y31 A; 1Y8K A; 3CIU B; 2LH2 A; 5D5R A; 1QPW A; 2GLN A; 1ITH A; 1XZV B; 1YEN A; 4GZG A; 1U7R A; 2AA1 B; 4U8U D; 2VLX A; 1RPS A; 1ECD A; 3LB2 A; 1YDZ B; 4JYQ A; 1H97 A; 2ZFB A; 3KMF A; 3UHS A; 1YHR B; 1Y7D A; 1Y8H A; 1Y83 B; 2ZLW A; 3WCV D; 2NSS A; 1C7B A; 2W6V A; 2ZT1 A; 4ROL B; 3HHB A; 3MJP A; 3LQD B; 3UHK A; 2G3H A; 2ZS0 A; 3EOK A; 2SPM A; 1DXT A; 1XZ5 B; 1S69 A; 2AV3 A; 2ZT4 A; 4C0N A; 1JDO A; 1O1P A; 1X9F D; 3MOU A; 2NX0 A; 2EKU A; 1Y46 A; 5JGG B; 3WCP B; 1C7D B; 1VXE A; 1LFL B; 5KDQ B; 2VLZ A; 1Y8I A; 1YIH A; 1B86 B; 3HF4 A; 1Y0D B; 2QMB A; 1CMY A; 3TM9 A; 3GKT A; 3VHB A; 3GQP B; 4AVD A; 1RQ4 B; 1K0Y A; 3S1J A; 1NXF A; 5HLX A; 2HHD B; 3ONZ B; 1MTI A; 3S66 B; 3TLD A; 1NZ2 A; 1UMO A; 5CNE A; 1J40 A; 2KSC A; 2VEB A; 2DHB B; 1KR7 A; 1X9F B; 1CBM A; 3PEL B; 2H35 A; 3ARL A; 110M A; 1EBT A; 2BNL A; 2DXM A; 1HBR A; 1EBC A; 5EET A; 1MOC A; 4ESA B; 3WCU B; 1MNH A; 4ZVA A; 3QM7 A; 3V2Z A; 3FS4 B; 1VXC A; 3BCQ B; 4L7Y A; 4DC7 A; 2V1J A; 3NL7 B; 1MYF A; 2ZSP A; 1JEB A; 1A3N B; 6HBI A; 4HHB A; 1RQA B; 1LFT B; 2PEG B; 2SPO A; 1MCY A; 4NI1 B; 1CO8 A; 4F6D A; 1RSE A; 1S56 A; 1Y4G B; 5EE4 D; 3QJB B; 1ASH A; 3KMF C; 1CH9 A; 1Y4R B; 1RTX A; 2HBS A; 3OO4 A; 2ZFO B; 3ZHW A; 3UHD A; 1LFQ B; 1JPB A; 3SZK B; 1O1N B; 1N9H A; 1GDL A; 3IC0 A; 3BJ2 A; 3QJC B; 2W6W A; 1Z8U B; 2ZS0 C; 1GCW B; 2R4Z A; 1MOD A; 5EYJ A; 2MYC A; 2H8F A; 1DXU A; 3GKV A; 4UIQ A; 2R1H B; 3UH5 A; 2XKG A; 1FHJ B; 4MQH B; 2WTH A; 1S5X B; 3BA2 A; 4YU3 A; 5JDO E; 1BZ1 B; 1HLM A; 1LA6 B; 1LH5 A; 4NXA A; 1Y0A B; 3MN0 A; 4KMV A; 1MWD A; 2RAO A; 2GTL D; 1Y0T B; 3EDB A; 4SDH A; 1Y4Q A; 3R0G A; 3QZZ A; 1FSX B; 3ZOM A; 1CQX A; 1HV4 B; 4F4O B; 1MNK A; 1YGD A; 1YZI A; 3QMA A; 1Y8W A; 1V07 A; 2HCO B; 2Z6N B; 1GBV B; 2DN2 A; 1Y2Z B; 1Y4P B; 2ZSN A; 1VWT A; 3ZJQ A; 1IRD A; 2EB8 A; 2D2N D; 4MPM A; 1Y5J A; 1V75 A; 1LFZ B; 102M A; 1O1J B; 1A00 A; 1HAC A; 4JAC A; 4NK2 A; 1MLO A; 2D60 B; 2ZSR A; 1HGB A; 2ZT2 A; 4MQG B; 1THB A; 3HRW A; 3S65 A; 1COH A; 3CY5 B; 1MYI A; 4MQI A; 1G0B B; 2GTL B; 3ZJR A; 2H8D A; 2ZLT B; 4MQK B; 1A01 B; 2ZLV A; 3GQG B; 1XZU B; 1HGA B; 4MQC A; 3WTG B; 5KKK A; 1CP0 A; 1Y5K B; 3ZOL A; 1YEV A; 3NMM A; 3WHM B; 5CMV A; 1PMB A; 2WY4 A; 3GLN A; 4HRT B; 1A6K A; 1XQ5 A; 2D2N B; 1QSH A; 1VXB A; 2HHB A; 1Y7C B; 4ZVB A; 1J7W B; 5CHR A; 2BK9 A; 4N7P B; 3UHC A; 5B85 A; 5CHQ A; 5HLQ A; 3WCW A; 1Y22 B; 2GL3 A; 1O1L B; 3P5Q A; 3UGY A; 1FDH G; 1OUU B; 3UHH A; 4N7O A; 2QU0 B; 2ZWJ A; 3G53 A; 1YVT B; 2V1I A; 3ASE A; 2R80 B; 1NS9 A; 1HDA A; 1FAW A; 2VYZ A; 1CH3 A; 2W31 A; 1LFY B; 1S5Y B; 1HRM A; 4G51 A; 2QLS B; 5ILM A; 1NEJ B; 1M9P A; 4NI0 A; 1CLS B; 2DN3 B; 3S1I A; 1J7Y B; 1Y5F A; 2LH7 A; 2GRF A; 2HHE A; 5AZR A; 3ZJP A; 3M3B A; 1YHR A; 3UGZ A; 5E29 B; 3A0G B; 3M38 A; 3V2V A; 1C40 B; 3UHR A; 1B0B A; 4ODC A; 1AJ9 A; 5CN7 A; 3A59 B; 2D5X B; 1R1Y A; 1J41 B; 2NRM A; 4OOD A; 3UHW A; 1YFF A; 1S61 A; 1A6N A; 1HAB B; 1CG8 A; 2D6C A; 1S6A A; 2MGB A; 2MGI A; 1ABW B; 4QAU A; 2ZT0 A; 4U8U A; 2G0Z A; 1Y7Z B; 1NIH A; 1YCB A; 3PI8 A; 1Y0C A; 1QSI B; 4H07 A; 2SPL A; 3WCV A; 3MJU A; 1OR4 A; 1JF3 A; 1FLP A; 1NS6 B; 1IBE B; 5CNG A; 1K1K B; 1J7S B; 1Y4V A; 1VXH A; 2W72 A; 1CIK A; 1FN3 B; 1SI4 B; 4M4B B; 3GK9 A; 1YE2 A; 2GKN A; 1Y45 A; 1NZ5 A; 1CG5 A; 1A3O B; 1EWA A; 1XZ7 B; 3WCW C; 3EU1 B; 3QM5 A; 3RGK A; 3PIA B; 2QSP A; 3PI9 B; 3PT7 A; 111M A; 1MNO A; 4F69 A; 3BCQ A; 1HDB A; 1SPE A; 2B7H B; 3D1K B; 1A9W A; 3UHG A; 1MBD A; 3BJ1 B; 1YMC A; 5C6E A; 3GOU A; 1Y35 A; 1VHB A; 3NFE B; 1A3N A; 2G10 A; 4YU4 A; 4WCH D; 109M A; 1BZ0 A; 1SDL B; 1ECN A; 1BAB A; 1GCV A; 2FAM A; 2LHB A; 2QFK A; 1DWR A; 3QJB A; 3BJ3 B; 2VLY A; 3UHI A; 1DO3 A; 2R4X A; 2RI4 B; 1HBB B; 1AJG A; 1HBA A; 1CO9 A; 1O16 A; 1IT2 A; 2OLP A; 1YHU B; 2Z6T A; 1DTM A; 1DWS A; 3WFX A; 1SHR A; 2M6Z B; 1BUW B; 1A9W E; 1HBH B; 1YHE B; 2HBF A; 1CH5 A; 1ECA A; 2ZS1 D; 2BMM A; 1AJH A; 3WCT C; 4U8U C; 1LA6 A; 1Y0A A; 2O5L X; 1HGC A; 3UHE A; 3HXN B; 3WCV C; 3M3A A; 1GLI A; 1O1K A; 3OO5 B; 1MKO A; 1O1O A; 1GJN A; 1V4W A; 4N7N B; 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3R5I B; 2MGF A; 1YH9 B; 3G46 A; 3VRF B; 1J3Z B; 1MYZ A; 1NS6 A; 1J3Y A; 1DO4 A; 1J7S A; 1F5O A; 1NWN A; 2MHB B; 2AUQ A; 1XY0 A; 3HYU B; 1OUT A; 2MYD A; 2HZ1 A; 2AV0 A; 3OVU C; 1RVW B; 3E5O A; 1O1M A; 5HU6 B; 1SI4 A; 5SW7 B; 1YOI A; 1IWH B; 1Y4F B; 1CPW A; 1NQP B; 3HC9 A; 1LFV A; 2DN1 B; 1GZX A; 103M A; 1DXV B; 5EUI A; 3RJN B; 2EKT A; 2ZSX A; 4N8T A; 1CH4 A; 1XXT A; 1YG5 A; 2BW9 M; 1MNJ A; 3D4X A; 105M A; 3PI9 A; 5F2A A; 3ZH0 A; 4G1B A; 3FH9 B; 1VXG A; 3BOM B; 1IRC A; 5KER A; 1V9Q A; 1V4U B; 1YIE A; 3BJ1 A; 3LB4 A; 1GBU B; 5HY8 B; 3RJ6 A; 3DUT B; 1G0A B; 1BZZ B; 2BWH A; 4M4A B; 3NG6 B; 1JP6 A; 1G09 A; 1YEU B; 4XS0 B; 4FC3 B; 1CH2 A; 1LJW A; 1MBC A; 4DC8 A; 4PQC A; 3IC2 B; 3UHT A; 3PI3 A; 3UH7 A; 3DHT B; 1A0U A; 3W4U A; 4F6B A; 4TYX A; 2ZSY A; 2NRL A; 1QPW B; 3IXF A; 3K8B A; 4XDI A; 1YEN B; 4F6F A; 4IT8 A; 107M A; 1RPS B; 4NXC A; 5CNF A; 1JZL A; 2MBW A; 2ZFB B; 5JDO C; 2Z85 A; 1Y7D B; 5EYS A; 2VYY A; 1Y8H B; 2ZLW B; 2YRS A; 1LUE A; 5AZQ A; 1C7B B; 2W6V B; 1BBB A; 3AT5 A; 2LH5 A; 2JHO A; 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